Heatmap: Cluster_49 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
WT,12hL12hD,Log,1h Dark
WT,12hL12hD,Log,1h Light
WT,12hL12hD,Log,1h Light d2
WT,12hL12hD,Log,3h Dark
WT,12hL12hD,Log,3h Light
WT,12hL12hD,Log,5h Dark
WT,12hL12hD,Log,5h Light
WT,12hL12hD,Log,7h Dark
WT,12hL12hD,Log,7h Light
WT,12hL12hD,Log,9h Dark
WT,12hL12hD,Log,9h Light
WT,12hL12hD,Log,11h Dark
WT,12hL12hD,Log,11h Light
0.61 0.84 0.94 0.68 0.95 0.58 0.74 0.45 0.93 0.43 1.0 0.34 0.97
0.44 0.51 0.46 0.59 0.81 0.53 0.36 0.55 0.35 1.0 0.53 0.7 0.62
1.0 0.85 0.74 0.84 0.93 0.8 0.88 0.8 0.91 0.68 0.78 0.8 0.89
0.71 0.76 0.61 0.82 0.87 0.95 0.86 0.92 1.0 0.67 0.86 0.7 0.88
0.6 0.68 0.55 0.71 0.55 0.97 0.52 1.0 0.62 0.83 0.54 0.99 0.61
1.0 0.51 0.41 0.87 0.46 0.9 0.41 0.85 0.49 0.77 0.48 0.77 0.68
1.0 0.72 0.7 0.71 0.31 0.62 0.27 0.58 0.47 0.73 0.84 0.62 0.94
0.93 0.73 0.83 1.0 0.6 0.65 0.91 0.51 0.91 0.59 0.94 0.33 0.83
0.01 0.46 1.0 0.02 0.1 0.02 0.11 0.02 0.08 0.02 0.09 0.02 0.08
0.58 0.51 0.88 0.94 0.68 0.51 0.68 0.43 0.81 1.0 0.76 0.52 0.84
1.0 0.27 0.35 0.52 0.45 0.32 0.24 0.27 0.41 0.22 0.42 0.18 0.64
0.53 0.36 0.41 0.8 0.22 0.99 0.27 1.0 0.34 0.77 0.35 0.87 0.41
0.09 0.67 0.78 0.29 0.54 0.57 0.55 0.55 0.7 0.28 0.83 0.23 1.0
0.76 0.77 0.72 0.8 0.9 0.76 0.69 0.78 0.9 0.76 0.87 0.59 1.0
1.0 0.09 0.07 0.46 0.25 0.2 0.24 0.14 0.23 0.12 0.44 0.05 0.31
0.27 0.98 0.93 0.23 1.0 0.27 0.6 0.3 0.54 0.3 0.45 0.26 0.67
0.02 0.74 1.0 0.02 0.25 0.03 0.3 0.02 0.32 0.02 0.36 0.01 0.52
0.05 0.53 0.49 0.1 0.3 0.19 0.29 0.27 0.31 0.39 0.24 1.0 0.27
0.96 0.82 0.7 0.96 0.82 1.0 0.56 0.99 0.77 0.86 0.7 0.93 0.8
0.76 0.75 0.69 0.75 0.63 0.99 0.38 1.0 0.5 0.83 0.47 0.91 0.81
0.9 0.34 0.2 0.76 0.44 0.41 0.55 0.27 0.52 1.0 0.58 0.5 0.41
0.32 0.73 1.0 0.69 0.3 0.56 0.49 0.46 0.41 0.86 0.56 0.52 0.6
0.71 0.56 0.89 0.84 0.77 1.0 0.35 0.86 0.64 0.77 0.81 0.79 0.86
0.01 0.07 0.07 0.02 1.0 0.01 0.62 0.02 0.35 0.04 0.28 0.03 0.26
0.02 0.2 0.14 0.03 1.0 0.03 0.83 0.04 0.57 0.05 0.38 0.05 0.37
0.44 0.93 0.76 0.54 0.9 0.44 0.87 0.51 0.87 0.97 0.85 0.91 1.0
0.03 0.36 0.62 0.32 0.21 1.0 0.15 0.95 0.22 0.24 0.25 0.4 0.36
0.19 0.08 0.09 0.29 0.08 0.22 0.13 0.18 0.23 0.13 0.87 0.05 1.0
0.0 0.04 0.03 0.01 1.0 0.01 0.19 0.02 0.05 0.03 0.05 0.03 0.06
0.47 0.49 0.4 0.53 0.25 0.72 0.23 0.79 0.23 0.88 0.22 1.0 0.36
0.78 0.37 0.29 0.84 0.4 0.91 0.38 1.0 0.49 0.85 0.44 0.95 0.5
0.45 0.45 0.43 0.66 0.78 0.48 0.77 0.43 0.79 0.46 1.0 0.3 0.91
1.0 0.65 0.8 0.75 0.84 0.68 0.65 0.58 0.82 0.42 0.77 0.3 0.91
1.0 0.44 0.48 0.62 0.73 0.46 0.54 0.39 0.57 0.4 0.6 0.3 0.58
0.94 0.21 0.2 0.97 0.23 0.87 0.29 0.94 0.37 0.89 0.35 1.0 0.42
0.94 0.69 0.67 1.0 0.57 0.88 0.66 0.8 0.68 0.77 0.65 0.68 0.72
0.59 0.49 0.56 0.38 0.61 0.2 0.93 0.13 1.0 0.1 0.88 0.04 0.72
0.78 0.34 0.33 0.69 0.37 0.95 0.33 1.0 0.42 0.62 0.44 0.82 0.59
0.38 0.97 0.71 0.56 0.57 0.77 0.51 0.84 0.7 0.92 0.57 1.0 0.69
0.05 0.18 0.15 0.07 1.0 0.08 0.53 0.14 0.29 0.24 0.21 0.3 0.23
0.85 1.0 0.82 0.79 0.59 0.67 0.82 0.59 0.94 0.74 0.72 0.65 0.71
0.29 1.0 0.97 0.39 0.44 0.6 0.32 0.62 0.33 0.51 0.34 0.65 0.44
0.21 0.69 1.0 0.34 0.55 0.59 0.41 0.54 0.54 0.29 0.64 0.33 0.89
0.52 0.76 0.83 0.78 0.63 0.68 0.82 0.56 1.0 0.59 0.89 0.54 0.87
0.79 0.21 0.21 0.77 0.25 0.99 0.26 1.0 0.35 0.64 0.4 0.96 0.49
0.7 0.49 0.71 0.7 0.87 0.58 1.0 0.42 0.95 0.73 0.78 0.98 0.6
1.0 0.16 0.18 0.55 0.24 0.27 0.24 0.18 0.3 0.1 0.34 0.08 0.44
0.23 0.9 1.0 0.18 0.5 0.12 0.98 0.09 0.73 0.17 0.47 0.16 0.5
1.0 0.73 0.73 0.92 0.86 0.81 0.73 0.77 0.76 0.96 0.77 0.73 0.77
1.0 0.49 0.48 0.73 0.76 0.76 0.5 0.77 0.65 0.78 0.62 0.87 0.6
0.69 0.7 0.65 0.87 0.51 0.85 0.56 0.87 0.57 0.99 0.67 1.0 0.74
0.18 0.2 0.22 0.62 0.18 1.0 0.24 0.85 0.25 0.4 0.28 0.42 0.31
1.0 0.17 0.1 0.39 0.24 0.16 0.52 0.11 0.53 0.19 0.42 0.24 0.29
0.22 0.76 0.85 0.46 0.71 0.64 0.67 0.76 0.86 0.65 0.86 0.62 1.0
0.99 0.52 0.52 0.88 0.44 1.0 0.3 0.98 0.37 0.62 0.45 0.78 0.77
0.6 0.34 0.26 0.72 0.26 0.88 0.24 0.86 0.29 0.86 0.28 1.0 0.37
0.49 0.55 0.46 0.77 0.26 0.66 0.36 0.64 0.36 1.0 0.35 0.78 0.36
0.33 0.6 0.48 0.54 1.0 0.47 0.61 0.53 0.41 0.7 0.42 0.52 0.41
0.04 0.27 0.26 0.1 1.0 0.1 0.48 0.13 0.23 0.25 0.24 0.19 0.25
0.61 0.91 0.93 0.85 0.81 0.78 0.74 0.75 0.86 0.83 0.87 0.68 1.0
1.0 0.1 0.07 0.83 0.18 0.23 0.41 0.19 0.35 0.68 0.45 0.22 0.41
0.73 0.65 0.54 0.94 0.91 0.69 1.0 0.75 0.9 0.97 0.7 0.83 0.6
0.51 0.88 0.81 0.67 0.54 0.6 0.75 0.62 0.82 0.68 0.98 0.56 1.0
0.03 0.29 0.64 0.3 0.22 1.0 0.12 0.97 0.14 0.25 0.21 0.44 0.33
0.06 0.24 0.26 0.06 1.0 0.04 0.83 0.04 0.65 0.04 0.77 0.01 0.71
1.0 0.62 0.61 0.98 0.58 0.64 0.71 0.65 0.67 0.88 0.67 0.74 0.54
0.89 0.81 1.0 0.78 0.86 0.63 0.72 0.52 0.82 0.49 0.85 0.37 0.91
0.8 0.33 0.23 0.65 1.0 0.49 0.0 0.44 0.35 0.47 0.19 0.75 0.36
0.2 0.52 0.55 0.44 0.39 0.84 0.25 0.82 0.56 0.52 0.78 0.46 1.0
0.52 1.0 0.89 0.77 0.29 0.8 0.69 0.76 0.72 0.78 0.72 0.74 0.94
0.77 0.64 0.6 0.7 0.89 0.51 0.89 0.42 0.77 0.51 0.82 0.34 1.0
0.76 0.86 1.0 0.67 0.76 0.63 0.65 0.57 0.76 0.53 0.76 0.51 0.87
0.57 0.66 0.75 0.74 0.37 0.72 0.54 0.73 0.62 0.96 0.72 1.0 0.72
0.09 0.13 0.16 0.14 0.07 0.17 0.08 0.16 0.16 0.07 0.7 0.1 1.0
0.65 0.6 0.59 0.51 0.58 0.45 0.43 0.4 0.69 0.3 0.73 0.24 1.0
0.1 0.97 1.0 0.15 0.31 0.2 0.22 0.18 0.16 0.25 0.18 0.14 0.31
0.71 0.66 0.64 0.83 0.53 0.95 0.63 0.97 0.72 0.93 0.61 1.0 0.65
0.65 0.62 0.69 0.73 0.63 0.53 0.78 0.41 0.9 0.47 1.0 0.28 0.96
0.62 0.92 0.87 0.82 0.67 1.0 0.69 1.0 0.85 0.94 0.68 0.96 0.89

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)