Heatmap: Cluster_121 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
4h after treatment
4h after treatment,No nitrate
8h after treatment
8h after treatment,No nitrate
20C
20h after treatment
20h after treatment,No nitrate
20h after treatment,Nocodazole added
36h after treatment
36h after treatment,No phosphate
Blue light,10min after light change
Blue light,60min after light change
Bohlin
CCAP1055/1,20C
CCAP1055/1,20C,High CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Low CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Normal CO2,OligoDT primed
CCMP2561
CCMP2561 Nitrase Reductase Knockout
CCMP632
CCMP632,24h
CCMP632,48h
CCMP632,72h
CCMP632,High light acclimated WT
CCMP632,Low light acclimated WT
NEPCC640,8h,1000ppmv CO2
NEPCC640,8h,390 ppmv CO2
No light,8h after treatment
Pt-1
Pt-1 8.6
Pt-1 8.6,With nitrogen
Pt-1 8.6,Without nitrogen
Red light,0min before light change
UTEX 646,Blue light
UTEX 646,No light
0.45 0.58 0.49 0.68 0.31 0.57 0.93 0.45 0.65 0.8 0.72 1.0 0.52 0.51 0.22 0.53 0.25 0.58 0.64 0.23 0.15 0.49 0.25 0.21 0.13 0.09 0.1 0.57 0.64 0.39 0.35 0.56 0.88 0.76 0.25
0.22 0.46 0.2 0.43 0.29 0.39 0.67 0.25 0.55 0.61 0.94 0.99 0.18 0.37 0.21 0.28 0.35 0.34 0.35 0.31 0.41 0.95 0.48 0.17 0.08 0.13 0.03 0.33 0.13 0.12 0.13 0.14 1.0 0.26 0.23
0.28 0.4 0.23 0.36 0.25 0.27 0.36 0.24 0.3 0.36 0.64 0.79 0.18 1.0 0.19 0.22 0.12 0.43 0.51 0.22 0.32 0.54 0.32 0.27 0.17 0.27 0.62 0.57 0.37 0.43 0.5 0.47 0.76 0.69 0.86
0.42 0.79 0.33 0.63 0.32 0.49 0.72 0.44 0.42 0.57 0.65 0.84 0.56 1.0 0.19 0.28 0.2 0.6 0.59 0.32 0.11 0.51 0.15 0.45 0.23 0.19 0.19 0.72 0.61 0.79 0.62 0.95 0.8 0.9 0.69
0.5 0.64 0.44 0.59 0.32 0.61 0.59 0.39 0.53 0.63 0.76 0.93 0.22 0.69 0.3 0.39 0.09 0.58 0.56 0.27 0.35 0.56 0.27 0.29 0.08 0.15 0.09 0.43 0.24 0.34 0.29 0.35 1.0 0.59 0.52
0.44 0.54 0.29 0.43 0.39 0.48 0.62 0.27 0.44 0.58 0.73 1.0 0.07 0.43 0.51 0.42 0.36 0.64 0.62 0.41 0.69 0.84 0.51 0.16 0.04 0.04 0.04 0.49 0.18 0.27 0.18 0.33 1.0 0.48 0.28
0.3 0.39 0.24 0.39 0.27 0.34 0.45 0.32 0.44 0.5 0.83 1.0 0.31 0.4 0.1 0.17 0.01 0.5 0.42 0.2 0.41 0.39 0.38 0.19 0.15 0.14 0.23 0.46 0.26 0.32 0.24 0.41 0.92 0.67 0.73
0.71 0.82 0.56 0.76 0.44 0.86 0.81 0.6 0.89 0.9 0.65 0.68 0.4 0.34 0.33 0.3 0.21 0.66 0.81 0.36 0.53 1.0 0.31 0.43 0.19 0.4 0.85 0.47 0.56 0.59 0.77 0.56 0.63 0.93 0.44
0.71 0.68 0.44 0.49 0.44 0.59 0.51 0.4 0.65 0.66 0.63 0.94 0.26 0.16 0.35 0.38 0.19 0.6 0.67 0.27 0.5 0.85 0.41 0.32 0.09 0.15 0.15 0.94 0.25 0.4 0.43 0.44 1.0 1.0 0.28
0.41 0.54 0.38 0.57 0.35 0.49 0.7 0.32 0.46 0.62 0.87 0.95 0.43 0.75 0.28 0.27 0.27 0.75 0.72 0.57 0.01 0.07 0.02 0.62 0.34 0.33 0.17 0.49 0.36 0.52 0.42 0.56 1.0 0.81 0.73
0.01 0.02 0.01 0.02 0.18 0.01 0.02 0.01 0.02 0.04 0.82 0.78 0.06 0.16 0.02 0.02 0.01 0.22 0.11 0.03 0.04 0.21 0.08 0.04 0.01 0.05 0.02 0.01 0.05 0.01 0.01 0.01 1.0 0.13 0.21
0.31 0.38 0.26 0.32 0.22 0.32 0.47 0.19 0.41 0.46 0.75 0.82 0.04 0.05 0.17 0.24 0.06 0.35 0.42 0.1 0.23 0.28 0.07 0.18 0.05 0.05 0.02 0.43 0.09 0.15 0.13 0.13 1.0 0.54 0.42
0.34 0.43 0.31 0.38 0.35 0.42 0.4 0.5 0.36 0.47 1.0 0.86 0.24 0.79 0.39 0.32 0.24 0.55 0.47 0.21 0.14 0.45 0.13 0.13 0.09 0.28 0.32 0.3 0.27 0.47 0.54 0.42 0.87 0.86 0.37
0.26 0.62 0.29 0.6 0.25 0.38 0.74 0.29 0.44 0.67 0.79 0.96 0.34 0.99 0.1 0.29 0.07 0.61 0.67 0.21 0.44 0.75 0.37 0.16 0.05 0.05 0.07 0.26 0.24 0.21 0.1 0.31 0.94 1.0 0.61
0.31 0.64 0.36 0.7 0.35 0.38 0.74 0.59 0.42 0.6 0.73 1.0 0.27 0.6 0.27 0.49 0.05 0.65 0.76 0.29 0.4 0.66 0.67 0.34 0.13 0.14 0.05 0.38 0.19 0.17 0.25 0.1 0.96 0.38 0.31
0.45 0.47 0.34 0.42 0.59 0.49 0.54 0.29 0.61 0.62 0.67 0.88 0.22 1.0 0.21 0.25 0.08 0.65 0.83 0.27 0.56 0.85 0.7 0.3 0.17 0.12 0.09 0.68 0.48 0.44 0.32 0.59 0.83 0.6 0.79
0.4 0.6 0.32 0.65 0.28 0.53 1.0 0.35 0.66 0.64 0.81 0.93 0.26 0.61 0.11 0.17 0.06 0.51 0.68 0.23 0.24 0.56 0.23 0.18 0.1 0.29 0.37 0.22 0.18 0.38 0.26 0.6 0.88 0.42 0.23
0.34 0.93 0.29 0.78 0.2 0.63 1.0 0.28 0.6 0.78 0.73 0.78 0.12 0.33 0.18 0.24 0.11 0.26 0.31 0.23 0.28 0.66 0.23 0.12 0.01 0.1 0.05 0.12 0.06 0.12 0.2 0.06 0.91 0.69 0.15
0.45 0.65 0.39 0.66 0.39 0.66 0.81 0.47 0.84 0.88 0.71 0.81 0.22 0.9 0.24 0.28 0.26 0.67 0.76 0.3 0.06 0.18 0.1 0.35 0.11 0.31 0.39 0.53 0.54 0.83 0.86 0.67 0.79 1.0 0.78
0.37 0.43 0.38 0.43 0.37 0.42 0.49 0.31 0.45 0.47 0.56 0.55 0.23 0.45 0.29 0.29 0.15 0.6 0.57 0.4 0.01 0.07 0.02 0.33 0.1 0.43 1.0 0.41 0.32 0.37 0.31 0.51 0.57 0.79 0.55
0.43 0.69 0.37 0.87 0.58 0.57 0.92 0.42 0.81 0.86 0.98 1.0 0.35 0.55 0.12 0.33 0.1 0.64 0.61 0.24 0.47 0.93 0.88 0.25 0.2 0.06 0.03 0.73 0.24 0.45 0.24 0.78 0.94 0.13 0.19
0.43 0.59 0.33 0.49 0.24 0.64 0.6 0.28 0.6 0.64 0.84 0.95 0.24 0.56 0.26 0.25 0.14 0.47 0.56 0.13 0.2 0.51 0.2 0.28 0.04 0.11 0.06 0.1 0.08 0.17 0.15 0.23 1.0 0.26 0.03
0.4 0.34 0.32 0.41 0.32 0.45 0.47 0.28 0.63 0.6 0.64 0.77 0.37 0.21 0.5 0.35 0.43 0.75 0.69 0.1 0.6 0.79 0.52 0.19 0.05 0.09 0.05 0.31 0.08 0.25 0.13 0.34 0.75 1.0 0.38
0.37 0.76 0.38 0.58 0.25 0.45 0.65 0.37 0.31 0.57 0.63 0.85 0.32 1.0 0.28 0.36 0.24 0.56 0.76 0.17 0.3 0.88 0.2 0.24 0.06 0.19 0.12 0.2 0.37 0.44 0.4 0.64 0.78 0.82 0.29
0.3 0.71 0.24 0.59 0.24 0.67 0.72 0.3 0.78 0.82 0.87 0.89 0.16 0.26 0.24 0.35 0.09 0.41 0.4 0.25 0.17 0.35 0.17 0.16 0.05 0.13 0.06 0.07 0.15 0.25 0.37 0.15 1.0 0.42 0.12
0.25 0.37 0.14 0.3 0.25 0.24 0.4 0.14 0.26 0.29 0.59 0.55 0.18 1.0 0.13 0.13 0.09 0.39 0.42 0.13 0.19 0.44 0.26 0.17 0.12 0.09 0.06 0.7 0.35 0.38 0.21 0.63 0.48 0.52 0.49
0.3 0.38 0.14 0.32 0.12 0.26 0.48 0.16 0.38 0.37 0.75 1.0 0.14 0.33 0.06 0.06 0.03 0.39 0.45 0.02 0.18 0.31 0.07 0.04 0.0 0.15 0.2 0.13 0.04 0.17 0.09 0.26 0.9 0.44 0.09
0.21 0.42 0.17 0.43 0.25 0.29 0.68 0.21 0.33 0.33 0.31 0.34 0.4 1.0 0.15 0.16 0.09 0.49 0.44 0.29 0.23 0.33 0.26 0.25 0.17 0.1 0.08 0.36 0.39 0.39 0.25 0.55 0.32 0.68 0.69
0.22 0.36 0.21 0.38 0.39 0.23 0.36 0.34 0.22 0.3 0.67 0.82 0.16 1.0 0.19 0.22 0.23 0.42 0.49 0.2 0.13 0.51 0.1 0.17 0.09 0.28 0.17 0.41 0.22 0.39 0.38 0.56 0.82 0.79 0.45
0.42 0.5 0.33 0.43 0.32 0.45 0.57 0.28 0.44 0.53 0.69 1.0 0.27 0.75 0.3 0.23 0.25 0.58 0.67 0.18 0.43 0.62 0.32 0.57 0.61 0.4 0.55 0.62 0.21 0.65 0.71 0.6 0.91 0.7 0.3
0.45 0.43 0.21 0.37 0.5 0.49 0.52 0.19 0.51 0.49 0.66 0.88 0.18 0.67 0.16 0.16 0.06 0.36 0.28 0.38 0.51 1.0 0.59 0.19 0.08 0.05 0.04 0.1 0.19 0.15 0.16 0.17 0.93 0.52 0.07
0.3 0.46 0.36 0.59 0.27 0.25 0.53 0.28 0.3 0.45 0.75 0.88 0.47 0.98 0.14 0.38 0.08 0.58 0.68 0.23 0.48 1.0 0.56 0.24 0.14 0.25 0.15 0.48 0.47 0.43 0.38 0.65 0.78 0.6 0.62
0.69 1.0 0.51 0.59 0.37 0.76 0.58 0.44 0.39 0.64 0.49 0.53 0.1 0.09 0.18 0.11 0.18 0.34 0.61 0.09 0.07 0.31 0.03 0.25 0.04 0.24 0.3 0.06 0.12 0.42 0.42 0.25 0.64 0.3 0.05
0.32 0.44 0.3 0.5 0.38 0.35 0.56 0.24 0.56 0.56 0.69 0.62 0.25 0.98 0.22 0.21 0.16 0.54 0.43 0.44 0.26 0.47 0.35 0.46 0.32 0.38 0.33 1.0 0.34 0.33 0.27 0.48 0.57 0.67 0.65
0.5 0.79 0.19 0.66 0.35 0.47 0.9 0.25 0.53 0.65 0.56 0.82 0.56 1.0 0.22 0.24 0.14 0.66 0.76 0.29 0.34 0.51 0.28 0.28 0.08 0.34 0.22 0.36 0.33 0.37 0.28 0.55 0.77 0.98 0.56
0.39 0.54 0.42 0.75 0.42 0.45 0.86 0.31 0.56 0.7 0.68 0.81 0.35 0.73 0.21 0.27 0.17 0.57 0.72 0.34 0.62 1.0 0.59 0.4 0.14 0.15 0.11 0.44 0.39 0.3 0.21 0.4 0.91 0.42 0.39
0.19 0.35 0.15 0.36 0.19 0.25 0.49 0.21 0.25 0.35 0.71 1.0 0.19 0.62 0.07 0.14 0.09 0.34 0.45 0.15 0.07 0.32 0.09 0.18 0.07 0.09 0.09 0.18 0.27 0.47 0.29 0.74 0.93 0.54 0.27
0.33 0.66 0.32 0.59 0.22 0.46 0.7 0.32 0.57 0.64 0.87 1.0 0.25 0.67 0.22 0.25 0.15 0.37 0.4 0.22 0.52 0.84 0.3 0.2 0.07 0.07 0.03 0.2 0.08 0.09 0.12 0.09 0.96 0.28 0.11
0.17 0.3 0.23 0.3 0.18 0.17 0.2 0.46 0.14 0.2 0.64 0.99 0.63 1.0 0.08 0.14 0.07 0.24 0.35 0.13 0.41 0.55 0.35 0.15 0.08 0.12 0.02 0.07 0.19 0.16 0.13 0.26 0.82 0.62 0.24
0.17 0.31 0.23 0.57 0.54 0.24 0.41 0.61 0.32 0.4 0.55 0.68 0.65 0.67 0.11 0.23 0.03 0.57 0.67 0.29 0.39 1.0 0.39 0.12 0.04 0.13 0.12 0.28 0.37 0.11 0.17 0.09 0.75 0.04 0.14
0.49 0.97 0.52 0.73 0.31 0.85 0.86 0.42 0.85 1.0 0.48 0.56 0.23 0.14 0.27 0.15 0.19 0.4 0.67 0.09 0.29 0.79 0.2 0.22 0.02 0.23 0.19 0.15 0.12 0.36 0.3 0.09 0.67 0.42 0.05
0.25 0.34 0.23 0.35 0.16 0.29 0.34 0.27 0.24 0.33 0.62 0.76 0.24 0.46 0.21 0.35 0.16 0.52 0.66 0.22 0.31 0.78 0.22 0.26 0.09 0.11 0.12 0.18 0.25 0.36 0.45 0.48 0.71 1.0 0.38
0.5 0.71 0.47 0.72 0.23 0.49 0.89 0.4 0.54 0.6 0.55 0.79 0.22 0.94 0.32 0.36 0.34 0.69 0.98 0.15 0.21 0.46 0.19 0.44 0.11 0.15 0.09 0.85 0.3 0.61 0.33 0.94 0.76 1.0 0.64
0.39 0.35 0.89 0.74 0.43 0.75 0.72 0.4 1.0 0.72 0.62 0.69 0.12 0.51 0.15 0.32 0.13 0.42 0.49 0.24 0.61 0.67 0.74 0.33 0.09 0.05 0.04 0.21 0.12 0.11 0.12 0.17 0.74 0.34 0.12
0.39 0.55 0.19 0.39 0.35 0.47 0.69 0.2 0.56 0.61 1.0 0.99 0.06 0.1 0.22 0.25 0.16 0.35 0.29 0.07 0.24 0.52 0.26 0.09 0.05 0.16 0.19 0.23 0.05 0.16 0.12 0.29 0.91 0.2 0.03
0.08 0.05 0.05 0.02 0.14 0.08 0.01 0.05 0.04 0.04 0.51 1.0 0.1 0.92 0.11 0.07 0.06 0.08 0.19 0.06 0.05 0.19 0.02 0.06 0.01 0.05 0.05 0.04 0.03 0.06 0.07 0.04 0.69 0.46 0.17
0.36 0.61 0.29 0.56 0.42 0.4 0.69 0.28 0.32 0.5 0.67 0.69 0.42 0.51 0.23 0.36 0.15 0.59 0.71 0.51 0.13 0.33 0.12 0.21 0.08 0.64 0.6 0.38 0.56 0.51 0.55 0.56 0.69 1.0 0.29
0.35 0.57 0.28 0.56 0.37 0.47 0.57 0.3 0.51 0.61 0.92 1.0 0.23 0.23 0.14 0.32 0.03 0.59 0.59 0.25 0.44 0.53 0.37 0.12 0.13 0.24 0.16 0.45 0.41 0.18 0.16 0.28 1.0 0.22 0.21
0.72 0.8 0.67 0.81 0.41 0.73 0.76 0.53 0.77 0.86 0.64 0.92 0.27 0.58 0.36 0.37 0.15 0.82 0.81 0.27 0.71 1.0 0.53 0.46 0.16 0.71 0.7 0.71 0.39 0.58 0.57 0.62 0.91 0.7 0.49
0.47 0.84 0.52 1.0 0.31 0.52 0.89 0.5 0.36 0.61 0.47 0.66 0.23 0.58 0.21 0.23 0.21 0.57 0.47 0.31 0.03 0.14 0.06 0.18 0.14 0.15 0.14 0.32 0.29 0.51 0.37 0.73 0.66 0.44 0.41
0.52 0.76 0.4 0.62 0.22 0.59 0.72 0.29 0.66 0.79 0.8 1.0 0.07 0.8 0.35 0.6 0.3 0.61 0.69 0.26 0.5 0.79 0.39 0.14 0.02 0.08 0.04 0.34 0.15 0.14 0.23 0.06 0.99 0.79 0.37
0.68 0.85 0.61 0.84 0.61 0.77 0.96 0.45 0.92 0.99 0.61 0.77 0.73 0.66 0.47 0.56 0.2 0.73 0.98 0.36 0.93 1.0 0.85 0.55 0.29 0.19 0.12 0.99 0.58 0.43 0.41 0.47 0.82 0.58 0.59
0.22 0.2 0.18 0.19 0.24 0.2 0.25 0.17 0.27 0.3 0.96 0.99 0.0 0.25 0.22 0.23 0.18 0.43 0.4 0.12 0.06 0.24 0.07 0.12 0.05 0.01 0.02 0.45 0.28 0.24 0.2 0.2 1.0 0.38 0.15
0.3 0.29 0.18 0.33 0.24 0.31 0.34 0.14 0.31 0.38 0.81 1.0 0.23 0.22 0.13 0.11 0.1 0.41 0.35 0.13 0.24 0.39 0.12 0.16 0.09 0.0 0.0 0.58 0.22 0.27 0.16 0.45 0.88 0.7 0.37
0.13 0.22 0.13 0.23 0.31 0.2 0.24 0.12 0.17 0.26 0.94 1.0 0.06 0.61 0.23 0.19 0.21 0.47 0.54 0.11 0.29 0.56 0.38 0.19 0.08 0.17 0.18 0.03 0.16 0.18 0.22 0.29 0.98 0.29 0.01
0.47 0.51 0.43 0.52 0.44 0.5 0.56 0.29 0.38 0.43 0.92 0.99 0.23 0.47 0.28 0.2 0.23 0.52 0.66 0.18 0.19 0.47 0.23 0.25 0.09 0.39 0.4 0.22 0.3 0.42 0.45 0.47 0.97 1.0 0.33
0.52 0.93 0.37 0.84 0.72 0.54 1.0 0.25 0.68 0.92 0.61 0.58 0.1 0.24 0.22 0.41 0.05 0.78 0.63 0.19 0.74 0.65 0.92 0.26 0.27 0.24 0.15 0.5 0.13 0.29 0.24 0.6 0.79 0.13 0.05
0.68 1.0 0.52 0.87 0.25 0.67 0.84 0.35 0.55 0.8 0.54 0.74 0.28 0.21 0.3 0.5 0.32 0.69 0.73 0.16 0.14 0.46 0.2 0.12 0.06 0.34 0.16 0.82 0.13 0.2 0.17 0.37 0.83 0.49 0.23
0.66 1.0 0.65 0.78 0.35 0.67 0.77 0.52 0.55 0.6 0.77 0.88 0.28 0.4 0.26 0.18 0.25 0.43 0.68 0.2 0.06 0.32 0.07 0.27 0.06 0.54 0.36 0.39 0.17 0.34 0.5 0.28 0.99 0.58 0.3
0.4 0.67 0.28 0.68 0.34 0.47 1.0 0.24 0.73 0.74 0.79 0.95 0.03 0.12 0.11 0.24 0.04 0.66 0.73 0.14 0.35 0.65 0.26 0.13 0.05 0.01 0.01 0.39 0.18 0.15 0.11 0.21 0.83 0.06 0.01
0.22 0.45 0.22 0.44 0.39 0.31 0.54 0.23 0.37 0.48 0.82 0.96 0.13 0.45 0.1 0.13 0.08 0.54 0.33 0.25 0.38 0.71 0.39 0.06 0.04 0.02 0.03 0.25 0.11 0.11 0.08 0.15 1.0 0.24 0.26
0.44 0.54 0.35 0.49 0.36 0.51 0.6 0.47 0.53 0.65 0.86 1.0 0.82 0.93 0.34 0.31 0.2 0.65 0.76 0.35 0.29 0.72 0.22 0.36 0.12 0.44 0.55 0.43 0.34 0.38 0.34 0.34 0.99 0.81 0.55
0.27 0.28 0.2 0.32 0.4 0.26 0.36 0.27 0.28 0.29 0.76 0.9 0.22 0.49 0.12 0.12 0.06 0.46 0.49 0.13 0.17 0.42 0.27 0.11 0.05 0.22 0.34 0.21 0.17 0.34 0.16 0.62 1.0 0.25 0.27
0.34 0.67 0.31 0.6 0.18 0.34 0.82 0.22 0.31 0.5 0.66 0.99 0.13 0.47 0.19 0.33 0.19 0.55 0.69 0.17 0.17 0.42 0.16 0.25 0.11 0.18 0.18 0.24 0.23 0.26 0.18 0.42 1.0 0.8 0.25
0.35 0.44 0.24 0.37 0.2 0.44 0.49 0.21 0.42 0.4 0.7 0.89 0.09 0.39 0.17 0.18 0.19 0.41 0.49 0.13 0.22 0.51 0.21 0.16 0.04 0.15 0.13 0.52 0.16 0.39 0.29 0.46 1.0 0.62 0.22

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)