1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_106 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
4h after treatment
4h after treatment,No nitrate
8h after treatment
8h after treatment,No nitrate
20C
20h after treatment
20h after treatment,No nitrate
20h after treatment,Nocodazole added
36h after treatment
36h after treatment,No phosphate
Blue light,10min after light change
Blue light,60min after light change
Bohlin
CCAP1055/1,20C
CCAP1055/1,20C,High CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Low CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Normal CO2,OligoDT primed
CCMP2561
CCMP2561 Nitrase Reductase Knockout
CCMP632
CCMP632,24h
CCMP632,48h
CCMP632,72h
CCMP632,High light acclimated WT
CCMP632,Low light acclimated WT
NEPCC640,8h,1000ppmv CO2
NEPCC640,8h,390 ppmv CO2
No light,8h after treatment
Pt-1
Pt-1 8.6
Pt-1 8.6,With nitrogen
Pt-1 8.6,Without nitrogen
Red light,0min before light change
UTEX 646,Blue light
UTEX 646,No light
0.4 0.36 0.41 0.35 0.29 0.39 0.31 0.47 0.39 0.42 1.0 0.65 0.16 0.24 0.3 0.16 0.49 0.23 0.37 0.23 0.15 0.45 0.16 0.41 0.08 0.33 0.41 0.3 0.25 0.49 0.41 0.46 0.64 0.64 0.61
0.47 0.34 0.33 0.27 0.29 0.43 0.29 0.25 0.43 0.42 1.0 0.47 0.03 0.39 0.28 0.1 0.19 0.41 0.41 0.16 0.46 0.8 0.38 0.25 0.07 0.2 0.14 0.24 0.11 0.31 0.2 0.46 0.4 0.58 0.02
0.06 0.07 0.05 0.03 0.05 0.05 0.03 0.13 0.02 0.04 1.0 0.84 0.06 0.15 0.09 0.03 0.06 0.11 0.12 0.09 0.18 0.54 0.09 0.3 0.11 0.21 0.61 0.37 0.06 0.78 1.0 0.31 0.24 0.24 0.21
0.62 0.38 0.31 0.24 0.2 0.59 0.24 0.53 0.28 0.36 0.68 0.77 0.05 0.42 0.31 0.17 0.06 0.38 0.46 0.04 0.49 0.66 0.22 0.4 0.11 0.13 0.21 0.49 0.13 1.0 0.8 0.93 0.4 0.86 0.05
0.4 0.37 0.29 0.27 0.18 0.37 0.26 0.34 0.29 0.38 0.6 0.37 0.04 0.09 0.24 0.24 0.1 0.34 0.37 0.1 0.23 0.42 0.17 0.46 0.14 0.1 0.14 0.42 0.15 0.69 1.0 0.28 0.29 0.53 0.14
0.71 0.84 0.6 0.84 0.46 0.79 0.85 0.64 0.72 0.81 0.9 1.0 0.39 0.76 0.22 0.28 0.11 0.6 0.67 0.23 0.43 0.73 0.4 0.5 0.2 0.39 0.4 0.92 0.52 0.89 0.97 0.77 0.88 0.52 0.48
0.83 0.39 0.42 0.23 0.23 0.65 0.31 0.42 0.36 0.4 1.0 0.47 0.18 0.06 0.48 0.34 0.53 0.25 0.51 0.22 0.08 0.26 0.08 0.64 0.19 0.36 0.44 0.49 0.15 0.76 0.95 0.39 0.62 0.83 0.43
0.05 0.32 0.07 0.34 0.09 0.09 0.58 0.09 0.13 0.09 0.39 0.37 0.07 0.4 0.08 0.15 0.04 0.4 0.38 0.04 0.2 0.48 0.18 0.03 0.03 0.01 0.0 1.0 0.04 0.23 0.02 0.52 0.36 0.08 0.16
0.35 0.18 0.23 0.11 0.19 0.34 0.1 0.3 0.19 0.21 0.58 0.18 0.16 0.03 0.58 0.39 0.23 0.29 0.46 0.07 0.31 0.3 0.16 0.73 0.14 0.49 0.44 0.15 0.11 0.65 0.63 0.39 0.15 1.0 0.45
0.44 0.26 0.35 0.23 0.18 0.42 0.18 0.41 0.24 0.23 0.53 0.68 0.07 0.41 0.13 0.06 0.05 0.33 0.46 0.05 0.3 0.57 0.04 0.47 0.06 0.17 0.13 0.05 0.09 0.38 0.29 0.51 0.63 1.0 0.82
0.38 0.6 0.29 0.45 0.23 0.37 0.65 0.4 0.35 0.46 0.86 1.0 0.28 0.8 0.15 0.2 0.1 0.32 0.31 0.28 0.32 0.83 0.41 0.69 0.2 0.24 0.2 0.63 0.3 0.65 0.62 0.41 0.85 0.75 0.44
0.33 0.77 0.29 0.79 0.12 0.42 0.94 0.3 0.59 0.63 0.83 0.33 0.1 0.22 0.07 0.2 0.02 0.5 0.5 0.17 0.59 0.62 1.0 0.18 0.13 0.11 0.07 0.72 0.23 0.33 0.25 0.59 0.27 0.15 0.08
0.3 0.25 0.26 0.24 0.22 0.33 0.23 0.33 0.3 0.29 1.0 0.55 0.08 0.1 0.21 0.13 0.12 0.22 0.37 0.15 0.62 0.73 0.5 0.59 0.47 0.42 0.6 0.28 0.15 0.64 0.62 0.46 0.51 0.57 0.53
0.33 0.13 0.14 0.07 0.12 0.21 0.09 0.18 0.16 0.14 0.24 0.42 0.2 0.08 0.29 0.14 0.35 0.17 0.13 0.07 0.28 0.42 0.09 1.0 0.26 0.15 0.17 0.12 0.17 0.61 0.63 0.47 0.37 0.73 0.38
0.28 0.4 0.19 0.36 0.35 0.34 0.54 0.19 0.41 0.38 0.68 0.37 0.38 0.49 0.22 0.2 0.09 0.58 0.54 0.26 0.58 0.57 0.79 0.27 0.37 0.25 0.18 0.74 0.31 0.34 0.23 0.5 0.37 0.57 1.0
0.44 0.36 0.33 0.33 0.28 0.45 0.4 0.34 0.49 0.47 0.84 0.65 0.35 0.38 0.22 0.2 0.06 0.41 0.62 0.16 0.7 1.0 0.51 0.57 0.19 0.33 0.34 0.71 0.25 0.63 0.67 0.39 0.58 0.52 0.34
0.61 0.19 0.47 0.15 0.1 0.4 0.09 0.75 0.16 0.16 0.52 0.22 0.25 0.04 0.26 0.18 0.11 0.21 0.34 0.05 0.17 0.27 0.04 1.0 0.21 0.6 0.51 0.09 0.13 0.78 0.72 0.53 0.19 0.9 0.69
0.15 0.34 0.12 0.34 0.19 0.18 0.43 0.26 0.19 0.26 1.0 0.33 0.21 0.53 0.19 0.28 0.33 0.52 0.54 0.14 0.08 0.31 0.19 0.15 0.1 0.13 0.18 0.12 0.09 0.44 0.44 0.33 0.24 0.39 0.15
0.13 0.17 0.12 0.13 0.23 0.19 0.15 0.19 0.15 0.19 0.91 0.58 0.39 0.52 0.41 0.36 0.37 0.41 0.44 0.4 0.21 0.42 0.19 0.58 0.45 0.06 0.19 0.11 0.17 0.84 0.59 0.62 0.53 1.0 0.62
0.44 0.64 0.32 0.35 0.4 0.54 0.31 0.35 0.47 0.41 0.88 1.0 0.22 0.42 0.3 0.24 0.34 0.3 0.33 0.21 0.41 0.65 0.26 0.41 0.13 0.59 0.72 0.27 0.27 0.7 0.96 0.19 0.99 0.57 0.16
0.51 0.42 0.41 0.34 0.42 0.61 0.35 0.41 0.67 0.62 1.0 0.45 0.11 0.14 0.33 0.39 0.05 0.46 0.44 0.31 0.71 0.83 0.47 0.49 0.2 0.32 0.65 0.53 0.21 0.48 0.6 0.28 0.45 0.96 0.38
0.45 0.41 0.52 0.5 0.45 0.49 0.43 0.31 0.7 0.63 1.0 0.39 0.24 0.21 0.5 0.4 0.23 0.51 0.45 0.54 0.7 0.98 0.59 0.59 0.36 0.12 0.08 0.57 0.17 0.24 0.29 0.23 0.39 0.53 0.27
0.09 0.18 0.06 0.2 0.06 0.02 0.21 0.1 0.02 0.01 0.52 0.27 0.2 0.16 0.34 0.25 0.15 0.42 0.88 0.05 0.34 0.4 0.03 0.46 0.07 0.4 0.49 0.05 0.03 0.85 0.82 1.0 0.07 0.15 0.04
0.48 0.52 0.4 0.54 0.33 0.56 0.64 0.41 0.51 0.55 0.86 0.46 0.29 0.28 0.57 0.37 0.38 0.57 0.66 0.35 0.64 1.0 0.57 0.76 0.4 0.26 0.26 0.74 0.21 0.81 0.75 0.81 0.38 0.5 0.48
0.29 0.35 0.21 0.31 0.22 0.3 0.41 0.52 0.34 0.33 0.42 0.33 0.63 0.13 0.23 0.19 0.06 0.42 0.51 0.44 0.51 0.61 0.3 0.75 0.33 0.63 0.48 0.43 0.26 0.95 0.77 0.78 0.27 1.0 0.86
0.48 0.17 0.31 0.1 0.34 0.45 0.09 0.29 0.23 0.24 0.8 0.54 0.27 0.1 0.32 0.07 0.18 0.29 0.42 0.18 0.36 0.39 0.2 0.45 0.17 0.18 0.28 0.2 0.28 0.61 0.32 0.89 0.48 0.88 1.0
0.04 0.08 0.1 0.19 0.15 0.13 0.24 0.17 0.17 0.21 1.0 0.43 0.25 0.12 0.07 0.14 0.01 0.5 0.59 0.29 0.3 0.71 0.32 0.11 0.06 0.03 0.01 0.12 0.16 0.14 0.1 0.16 0.25 0.31 0.7
0.02 0.04 0.04 0.08 0.07 0.02 0.07 0.07 0.04 0.05 0.84 0.48 0.46 0.12 0.13 0.11 0.06 0.32 0.44 0.13 0.25 0.45 0.17 0.15 0.1 0.04 0.05 0.51 0.15 0.12 0.13 0.1 0.28 0.29 1.0
0.03 0.07 0.09 0.19 0.08 0.01 0.08 0.19 0.01 0.02 0.83 0.18 0.41 0.05 0.11 0.27 0.11 0.28 1.0 0.07 0.04 0.29 0.02 0.09 0.03 0.23 0.11 0.35 0.16 0.2 0.14 0.31 0.24 0.13 0.15
0.22 0.24 0.18 0.2 0.15 0.27 0.23 0.21 0.24 0.25 1.0 0.63 0.03 0.18 0.24 0.19 0.18 0.23 0.4 0.09 0.33 0.69 0.26 0.3 0.11 0.2 0.18 0.39 0.06 0.56 0.89 0.26 0.37 0.84 0.13
0.12 0.04 0.09 0.02 0.08 0.11 0.03 0.11 0.03 0.04 1.0 0.62 0.01 0.04 0.26 0.14 0.15 0.07 0.14 0.08 0.21 0.65 0.12 0.4 0.09 0.41 0.3 0.2 0.07 0.47 0.6 0.24 0.74 0.58 0.2
0.64 0.56 0.46 0.42 0.56 0.58 0.44 0.41 0.66 0.65 1.0 0.77 0.25 0.13 0.38 0.32 0.38 0.37 0.48 0.42 0.67 0.79 0.72 0.58 0.42 0.47 0.6 0.92 0.34 0.69 0.67 0.62 0.61 0.66 0.32
0.18 0.12 0.18 0.08 0.06 0.19 0.05 0.23 0.13 0.19 1.0 0.39 0.01 0.04 0.06 0.02 0.08 0.08 0.1 0.06 0.04 0.22 0.01 0.19 0.02 0.15 0.13 0.01 0.12 0.59 0.43 0.68 0.22 0.28 0.0
0.22 0.3 0.2 0.33 0.32 0.34 0.43 0.24 0.4 0.31 0.73 0.64 0.07 0.2 0.17 0.2 0.16 0.25 0.38 0.3 0.25 1.0 0.26 0.3 0.14 0.15 0.18 0.19 0.16 0.72 0.43 0.82 0.53 0.91 0.43
0.43 0.6 0.29 0.43 0.42 0.55 0.4 0.34 0.55 0.65 1.0 0.83 0.45 0.57 0.45 0.46 0.26 0.72 0.84 0.43 0.45 0.96 0.37 0.66 0.1 0.1 0.08 0.93 0.35 0.89 0.67 0.83 0.86 0.95 0.25
0.1 0.17 0.14 0.26 0.21 0.15 0.35 0.18 0.19 0.22 0.65 0.27 0.04 0.33 0.16 0.11 0.04 0.55 0.5 0.09 0.45 1.0 0.36 0.16 0.05 0.07 0.04 0.83 0.1 0.52 0.25 0.87 0.19 0.31 0.11
0.07 0.16 0.13 0.31 0.1 0.1 0.35 0.17 0.21 0.22 1.0 0.33 0.65 0.16 0.04 0.2 0.01 0.36 0.31 0.1 0.19 0.28 0.16 0.1 0.03 0.02 0.03 0.16 0.13 0.1 0.06 0.15 0.28 0.29 0.31
0.56 0.31 0.4 0.26 0.34 0.59 0.23 0.36 0.48 0.28 0.32 0.47 0.3 0.34 0.42 0.14 0.27 0.44 0.68 0.11 0.64 0.93 0.33 1.0 0.22 0.18 0.29 0.12 0.22 0.49 0.37 0.56 0.36 0.65 0.36
0.37 0.41 0.32 0.34 0.44 0.44 0.32 0.21 0.36 0.38 0.6 0.52 0.16 0.37 0.32 0.41 0.2 0.38 0.35 0.28 0.76 1.0 0.68 0.35 0.2 0.08 0.08 0.31 0.27 0.39 0.32 0.48 0.27 0.4 0.08
0.27 0.26 0.18 0.22 0.15 0.22 0.24 0.51 0.19 0.2 0.38 0.18 0.28 0.07 0.19 0.19 0.21 0.17 0.33 0.06 0.08 0.14 0.06 0.37 0.09 0.19 0.25 0.43 0.25 0.39 0.42 0.3 0.14 1.0 0.3
0.12 0.5 0.09 0.45 0.07 0.07 0.45 0.16 0.05 0.02 0.62 0.14 0.05 0.21 0.21 0.22 0.08 0.37 0.73 0.06 0.3 0.49 0.08 0.43 0.15 0.19 0.22 0.24 0.04 0.82 1.0 0.61 0.06 0.32 0.27
0.18 0.28 0.21 0.4 0.15 0.15 0.37 0.17 0.25 0.28 1.0 0.43 0.27 0.67 0.22 0.25 0.11 0.6 0.65 0.11 0.57 0.47 0.59 0.25 0.31 0.23 0.19 0.86 0.29 0.38 0.24 0.56 0.31 0.47 0.36
0.54 0.39 0.48 0.3 0.53 0.54 0.3 0.3 0.68 0.61 1.0 0.64 0.04 0.14 0.56 0.3 0.75 0.19 0.44 0.42 0.61 0.91 0.55 0.67 0.34 0.55 0.6 0.64 0.17 0.48 0.57 0.23 0.75 0.71 0.15
0.23 0.26 0.23 0.29 0.37 0.35 0.46 0.19 0.29 0.32 0.92 0.23 0.06 0.55 0.27 0.23 0.06 0.76 0.46 0.08 1.0 0.88 0.94 0.25 0.26 0.06 0.04 0.32 0.11 0.43 0.15 0.86 0.32 0.66 0.28
0.04 0.12 0.05 0.08 0.09 0.04 0.05 0.27 0.03 0.04 1.0 0.5 0.04 0.09 0.05 0.07 0.05 0.1 0.16 0.02 0.02 0.14 0.01 0.11 0.08 0.4 0.82 0.14 0.04 0.37 0.49 0.07 0.21 0.49 0.01
0.41 0.53 0.3 0.48 0.21 0.46 0.51 0.28 0.42 0.56 1.0 0.37 0.26 0.17 0.13 0.19 0.03 0.53 0.59 0.13 0.36 0.47 0.25 0.15 0.06 0.06 0.04 0.41 0.24 0.37 0.17 0.64 0.34 0.57 0.53
0.01 0.02 0.03 0.03 0.03 0.01 0.02 0.09 0.03 0.05 1.0 0.2 0.17 0.12 0.04 0.03 0.03 0.63 0.51 0.04 0.12 0.28 0.05 0.06 0.01 0.03 0.0 0.0 0.02 0.16 0.17 0.17 0.09 0.03 0.01
0.39 0.54 0.32 0.59 0.49 0.33 0.8 0.36 0.3 0.41 1.0 0.8 0.56 0.44 0.21 0.33 0.2 0.56 0.68 0.21 0.11 0.3 0.11 0.26 0.06 0.31 0.37 0.19 0.12 0.56 0.38 0.64 0.71 0.94 0.43
0.62 0.64 0.78 0.66 0.43 0.56 0.45 1.0 0.4 0.6 0.73 0.78 0.18 0.85 0.36 0.12 0.43 0.36 0.39 0.17 0.33 0.47 0.37 0.72 0.32 0.22 0.16 0.36 0.45 0.54 0.41 0.61 0.91 0.69 0.37
0.3 0.4 0.32 0.4 0.19 0.31 0.5 0.69 0.36 0.36 0.91 0.9 0.27 0.4 0.18 0.21 0.09 0.38 0.5 0.08 0.18 0.77 0.15 0.27 0.06 0.16 0.18 0.54 0.15 0.74 1.0 0.42 0.75 0.79 0.34
0.59 0.58 0.47 0.48 0.38 0.51 0.43 0.35 0.58 0.52 0.63 0.51 0.54 0.72 0.55 0.49 0.32 0.56 0.87 0.43 0.51 0.68 0.39 1.0 0.23 0.41 0.28 0.22 0.15 0.84 0.92 0.5 0.55 0.77 0.61
0.38 0.39 0.37 0.37 0.39 0.51 0.36 0.34 0.58 0.52 0.94 0.57 0.2 0.16 0.43 0.31 0.15 0.4 0.5 0.35 0.78 1.0 0.52 0.56 0.2 0.46 0.36 0.79 0.24 0.63 0.67 0.35 0.64 0.85 0.48
0.57 0.36 0.32 0.26 0.29 0.49 0.25 0.37 0.38 0.35 0.63 0.46 0.32 0.24 0.57 0.42 0.27 0.47 0.7 0.14 0.58 0.85 0.37 1.0 0.14 0.31 0.25 0.46 0.27 0.98 0.66 0.89 0.35 0.98 0.71
0.3 0.42 0.27 0.4 0.34 0.43 0.26 0.39 0.38 0.4 0.63 1.0 0.15 0.52 0.23 0.22 0.48 0.27 0.37 0.06 0.01 0.14 0.03 0.3 0.03 0.2 0.22 0.16 0.17 0.47 0.3 0.27 0.92 0.37 0.04
0.51 0.4 0.4 0.39 0.28 0.49 0.34 0.33 0.51 0.46 0.43 0.34 0.26 0.28 0.48 0.47 0.36 0.38 0.49 0.21 0.5 0.45 0.35 1.0 0.45 0.4 0.35 0.59 0.21 0.67 0.7 0.49 0.21 0.5 0.33
0.44 0.3 0.37 0.24 0.3 0.52 0.25 0.42 0.38 0.44 1.0 0.74 0.16 0.16 0.39 0.19 0.3 0.36 0.53 0.15 0.38 0.82 0.25 0.44 0.07 0.21 0.19 0.34 0.27 0.63 0.53 0.53 0.7 0.94 0.5
0.38 0.35 0.33 0.37 0.49 0.43 0.39 0.27 0.61 0.46 1.0 0.73 0.41 0.4 0.42 0.27 0.55 0.29 0.29 0.55 0.89 0.74 0.93 0.92 0.82 0.55 0.38 0.66 0.3 0.31 0.45 0.2 0.73 0.65 0.5
0.38 0.38 0.34 0.24 0.2 0.31 0.16 0.55 0.16 0.1 0.95 0.81 0.26 0.23 0.42 0.23 0.26 0.21 0.36 0.19 0.14 0.43 0.09 0.23 0.07 0.17 0.22 0.23 0.22 0.42 0.51 0.19 0.57 1.0 0.34
0.3 0.54 0.24 0.73 0.14 0.32 0.9 0.19 0.3 0.34 1.0 0.39 0.07 0.37 0.22 0.15 0.21 0.69 0.69 0.1 0.08 0.26 0.07 0.17 0.05 0.05 0.04 0.11 0.01 0.45 0.24 0.87 0.19 0.12 0.01
0.36 0.19 0.24 0.13 0.25 0.38 0.16 0.4 0.26 0.27 0.41 0.45 0.18 0.08 0.17 0.1 0.13 0.16 0.17 0.2 0.13 0.2 0.16 0.79 0.24 0.14 0.27 0.18 0.24 0.8 1.0 0.36 0.17 0.92 0.01
1.0 0.88 0.69 0.72 0.47 0.96 0.8 0.85 0.92 0.96 0.67 0.82 0.18 0.67 0.49 0.28 0.45 0.37 0.39 0.13 0.24 0.44 0.29 0.8 0.26 0.26 0.25 0.73 0.34 0.59 0.72 0.37 0.79 0.41 0.04
0.32 0.27 0.18 0.17 0.18 0.36 0.19 0.34 0.19 0.18 1.0 0.51 0.14 0.09 0.18 0.07 0.08 0.28 0.37 0.04 0.17 0.72 0.21 0.23 0.04 0.14 0.11 0.06 0.1 0.55 0.31 0.7 0.32 0.61 0.03
0.67 0.51 0.51 0.3 0.46 0.73 0.2 0.87 0.45 0.49 0.85 0.53 0.3 0.08 0.71 0.57 0.51 0.4 0.41 0.33 0.35 0.36 0.32 0.43 0.19 0.6 0.58 1.0 0.41 0.58 0.62 0.52 0.6 0.88 0.89
0.22 0.17 0.24 0.22 0.16 0.38 0.23 0.14 0.4 0.44 0.63 0.52 0.21 1.0 0.12 0.12 0.08 0.71 0.31 0.14 0.18 0.26 0.34 0.14 0.03 0.13 0.3 0.1 0.36 0.24 0.23 0.22 0.4 0.36 0.07
0.19 0.35 0.19 0.34 0.33 0.25 0.44 0.26 0.4 0.28 0.75 1.0 0.32 0.57 0.09 0.1 0.09 0.16 0.24 0.21 0.11 0.32 0.09 0.24 0.05 0.26 0.5 0.69 0.19 0.52 0.49 0.14 0.93 0.39 0.18
0.32 0.41 0.28 0.36 0.26 0.33 0.4 0.34 0.38 0.42 0.68 0.66 0.24 0.34 0.19 0.18 0.06 0.5 0.73 0.24 0.76 1.0 0.51 0.52 0.2 0.17 0.14 0.24 0.35 0.73 0.69 0.49 0.65 0.83 0.55
0.35 0.45 0.29 0.38 0.35 0.4 0.42 0.37 0.45 0.47 0.97 1.0 0.3 0.51 0.1 0.2 0.02 0.52 0.65 0.16 0.48 0.85 0.48 0.38 0.15 0.08 0.06 0.68 0.45 0.89 0.78 0.85 0.89 0.75 0.66
0.36 0.43 0.27 0.41 0.19 0.31 0.57 0.17 0.34 0.47 0.8 0.95 0.34 0.68 0.29 0.36 0.17 0.75 0.54 0.5 0.34 0.49 0.25 0.22 0.15 0.19 0.18 0.47 0.31 0.4 0.21 0.7 1.0 0.57 0.79

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)