Heatmap: Cluster_48 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4h after treatment
4h after treatment,No nitrate
8h after treatment
8h after treatment,No nitrate
20C
20h after treatment
20h after treatment,No nitrate
20h after treatment,Nocodazole added
36h after treatment
36h after treatment,No phosphate
Blue light,10min after light change
Blue light,60min after light change
Bohlin
CCAP1055/1,20C
CCAP1055/1,20C,High CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Low CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Normal CO2,OligoDT primed
CCMP2561
CCMP2561 Nitrase Reductase Knockout
CCMP632
CCMP632,24h
CCMP632,48h
CCMP632,72h
CCMP632,High light acclimated WT
CCMP632,Low light acclimated WT
NEPCC640,8h,1000ppmv CO2
NEPCC640,8h,390 ppmv CO2
No light,8h after treatment
Pt-1
Pt-1 8.6
Pt-1 8.6,With nitrogen
Pt-1 8.6,Without nitrogen
Red light,0min before light change
UTEX 646,Blue light
UTEX 646,No light
-0.13 0.34 -0.23 0.54 -0.55 -0.03 0.7 -0.15 0.2 0.33 -0.88 -0.77 -0.8 -1.49 -0.73 -0.73 -0.62 -0.08 0.28 0.07 -0.43 0.09 -0.4 0.81 -0.13 -2.04 -2.45 0.56 0.17 0.71 0.72 0.51 -0.63 0.3 0.97
- - - - 0.42 - - 1.16 - - - - 4.56 - 0.19 - - -3.37 -6.48 - 0.14 0.7 - - - - - - - -0.48 - 1.52 -2.02 - -
-1.03 -1.4 -0.73 -0.43 -0.4 -0.92 -0.79 -1.1 -0.72 -0.44 0.46 -1.91 1.9 0.26 -0.74 -0.51 -2.25 0.28 -0.35 1.56 -5.34 -4.31 -4.63 -1.38 0.03 1.34 1.07 0.11 1.5 -0.47 -0.09 -0.68 -1.33 -0.01 1.25
-0.79 -1.15 -0.53 -0.29 -0.39 -0.8 -0.4 -0.68 -0.59 -0.05 -5.76 -11.08 1.02 -8.06 0.51 0.49 -0.7 0.91 0.19 2.07 -2.41 -1.84 -1.73 -0.39 0.92 0.33 -0.05 0.29 1.78 0.51 0.9 0.29 -8.38 -2.4 -1.49
-1.17 -0.33 -0.85 0.36 -0.12 -0.7 0.41 -1.59 0.12 -0.19 1.07 0.96 1.52 -0.07 -0.73 -0.49 -1.45 0.06 -0.08 -0.34 -0.4 -0.49 0.68 -0.14 0.56 -2.29 -4.15 -0.96 -0.41 -0.28 -1.3 0.28 1.29 0.81 -0.31
-1.86 -1.03 -1.74 -0.51 -0.27 -0.97 0.15 -0.54 -0.73 -0.83 -2.46 -2.72 0.2 -0.98 -1.17 -1.3 -1.73 0.16 0.2 0.84 -0.02 0.15 -1.15 0.28 0.25 1.07 2.19 -1.43 0.02 1.16 0.72 1.34 -2.64 -0.3 0.43
-2.15 -1.98 -1.58 -1.6 0.12 -1.33 -1.35 -1.05 -1.2 -1.41 -0.6 -1.04 0.57 0.21 -0.97 -1.24 -1.9 -0.4 -0.3 0.4 -0.1 -0.46 -0.37 0.74 1.71 0.56 1.1 -1.73 0.94 0.42 0.26 0.3 -1.31 0.18 2.1
-0.51 0.33 -0.6 0.56 0.33 0.61 1.14 -0.33 0.91 0.67 -2.14 -2.06 -0.85 -1.21 -0.56 -0.34 -0.74 0.07 0.55 0.32 -1.48 -1.12 -1.22 0.33 0.64 -0.29 -0.98 -1.61 0.21 0.81 0.45 0.94 -1.96 -1.58 0.9
-0.25 0.49 -0.2 0.6 0.71 0.64 0.93 0.18 0.73 0.62 -2.71 -2.94 1.05 -1.28 -0.63 -1.14 -0.96 -0.11 -0.06 0.66 -1.74 -1.28 -0.89 0.61 0.29 0.21 -0.67 -0.07 0.75 0.37 0.59 -0.2 -2.61 -1.94 -0.78
-0.89 0.06 -0.52 0.18 0.71 0.3 0.09 -0.25 0.39 0.63 -0.79 -0.75 0.87 0.14 -0.1 -1.09 0.9 -0.34 0.18 1.48 -1.37 -0.91 -1.04 -0.38 -0.37 0.59 -0.58 -0.47 0.62 -0.31 0.48 -2.14 -0.45 0.01 -1.54
-1.84 0.05 -2.59 0.49 0.07 -0.42 1.31 -1.63 0.42 0.12 -3.39 -3.69 1.37 -1.3 -2.13 -2.12 -2.58 -0.36 -0.64 -0.01 -2.51 -2.97 -2.62 -1.71 1.44 1.07 0.98 -0.25 1.03 0.11 -0.5 0.75 -3.23 -1.89 2.2
-2.1 -1.57 -1.4 -0.8 -0.81 -0.55 -0.78 -1.02 -0.22 -0.36 -0.4 -1.23 1.48 0.16 -1.38 1.68 -3.19 0.29 0.42 1.5 -5.05 -2.99 -3.58 -0.75 0.06 0.8 1.89 -1.01 1.14 0.21 0.71 -0.74 -1.17 -0.94 -0.06
-0.7 -0.4 -0.72 -0.22 0.01 -0.04 0.13 -0.71 0.24 0.19 -0.15 -0.51 -0.29 1.27 -1.33 -1.91 -1.61 0.19 0.15 -0.14 -1.59 -0.7 -0.11 0.61 1.2 -0.94 -0.67 -2.32 0.45 1.21 0.4 1.6 -0.69 0.07 -1.23
0.27 0.44 -0.23 -0.0 0.06 -0.15 -0.18 0.07 -0.35 -2.01 -2.24 -1.94 -0.9 -3.49 0.56 -0.88 -2.46 0.1 1.27 -2.08 -0.57 -0.09 -1.13 0.77 -0.17 -0.42 -0.9 -0.01 -2.81 0.79 0.26 0.59 -1.57 0.95 2.29
-1.7 -1.66 -1.06 -1.35 -0.45 -0.65 -1.26 -0.29 -0.52 -0.66 -1.03 -1.16 1.26 -1.06 0.18 -0.52 1.17 -1.35 -0.78 0.58 -2.54 -1.69 -2.17 1.62 0.74 1.01 0.48 -0.84 1.38 0.35 0.56 -0.66 -0.89 -0.59 1.37
-0.24 0.33 -0.55 0.27 0.34 0.05 0.66 -0.15 0.4 0.24 -1.08 -0.35 0.7 0.25 -1.35 -1.88 -1.62 -0.73 -0.81 0.13 0.39 0.22 0.41 -0.21 -1.39 -0.72 -0.79 1.03 -0.07 0.32 -0.76 0.83 -0.48 0.11 0.81
-0.62 0.22 0.06 0.35 -0.13 0.23 0.37 0.53 0.6 0.45 -0.68 -0.57 0.49 -0.82 -1.63 -0.87 -0.78 -1.34 -0.55 0.23 -0.31 -0.13 -0.75 0.13 -0.71 0.01 -0.26 0.19 -0.0 0.29 0.08 -0.01 -0.39 -0.92 1.86
-0.38 -0.52 -0.84 -0.67 -0.01 -0.1 -0.8 -0.95 0.29 0.07 -0.7 -0.78 0.2 -0.79 -0.08 -0.43 0.59 -0.58 -0.16 -0.16 0.53 -0.71 0.79 0.98 1.75 -0.6 -0.53 -0.08 -0.71 -0.08 -0.06 -0.4 -0.44 -1.09 1.38
0.4 0.33 0.14 0.16 -0.89 0.19 0.13 -0.88 0.36 0.36 -0.81 -0.71 -0.2 -2.58 0.16 -0.46 -0.13 -0.35 -0.54 0.24 -0.19 -1.15 -0.2 0.97 0.63 0.21 -0.61 -0.72 -0.82 0.11 0.27 0.07 -0.42 -1.02 1.77
-1.0 -1.24 -0.91 -0.72 0.3 -0.03 -0.49 -0.75 0.81 0.39 -0.77 -0.83 0.34 -1.07 -1.35 -1.12 -1.93 -0.54 -0.37 -0.55 0.97 -0.03 1.02 0.18 1.1 -0.42 -0.21 0.43 0.91 -0.16 0.16 -0.42 -0.71 -0.71 1.65
-1.21 -0.98 -1.07 -0.33 -0.33 -0.71 -0.07 -0.78 0.25 0.06 -0.79 -1.08 0.7 -0.88 -1.47 -0.99 -1.65 -0.42 0.05 0.39 1.33 0.63 0.51 0.13 -0.59 -0.77 -0.4 0.37 0.42 -0.27 -0.03 0.03 -1.1 -0.08 2.22
-1.21 -0.98 -1.07 -0.33 -0.33 -0.71 -0.07 -0.78 0.25 0.06 -0.79 -1.08 0.7 -0.88 -1.47 -0.99 -1.65 -0.42 0.05 0.39 1.33 0.63 0.51 0.13 -0.59 -0.77 -0.4 0.37 0.42 -0.27 -0.03 0.03 -1.1 -0.08 2.22
-0.24 -0.59 -0.44 -0.36 -0.37 -0.0 -0.18 -0.71 0.48 0.14 -0.81 -1.13 -0.34 -1.12 -0.14 0.01 -0.71 0.38 0.58 -0.54 -0.8 -0.49 -0.27 1.36 0.58 -0.39 -0.1 -1.41 -0.32 0.32 1.2 -0.44 -0.88 0.14 1.56
-0.85 -2.48 -1.05 -2.26 -0.23 -0.07 -1.66 -1.04 0.15 -0.25 -1.51 -1.87 -0.47 -1.66 -0.14 -0.91 -0.35 -1.21 -0.2 -0.54 1.0 -0.0 0.4 1.4 0.63 0.56 0.82 -1.52 0.14 0.51 0.96 -0.72 -1.71 0.01 2.22
-2.07 -1.81 -2.59 -1.5 1.19 -1.1 -2.1 -1.68 -0.38 -1.32 0.03 -0.4 1.13 0.61 -0.85 -0.81 -1.11 -0.7 -1.15 1.53 0.38 -0.01 0.63 -0.26 1.52 -0.95 -1.37 0.78 1.83 -0.9 -1.04 -0.62 -0.61 0.04 0.49
-2.06 0.17 -1.1 0.47 -0.08 -0.19 0.59 0.07 0.42 -0.15 -2.4 -2.57 0.98 0.71 -0.74 0.39 -0.69 -0.26 0.27 1.04 -1.93 -1.74 -1.77 -0.01 0.31 0.78 0.5 0.05 0.91 -0.23 -0.02 -0.4 -2.35 -0.92 1.1
0.36 0.47 0.08 0.51 -0.16 0.72 0.31 0.12 0.29 0.32 -0.81 -0.55 0.34 -0.54 -1.82 -2.75 -1.92 -0.33 -0.88 0.65 -5.42 -2.63 -5.59 -0.11 0.31 0.3 -0.49 0.86 1.12 0.35 0.02 0.74 -0.2 -0.18 0.74
-0.44 -0.49 -0.66 -0.64 -0.06 -0.47 -0.47 -0.77 -0.46 -0.41 -0.6 -0.44 0.32 -0.49 -0.37 -0.86 -0.33 0.21 0.23 0.72 -1.79 -0.81 -1.22 0.69 1.15 -0.47 -0.74 0.09 0.66 1.09 0.47 1.55 -0.13 -0.24 0.09
-0.83 -0.3 -0.61 0.26 -0.08 -0.96 0.45 -1.6 0.42 -0.46 -0.76 -1.48 1.04 -1.33 -0.95 -0.08 -2.12 0.02 -0.15 0.12 -0.66 -0.97 -0.64 0.12 0.66 0.72 -0.02 1.2 0.48 -0.15 -0.21 0.09 -1.47 0.11 1.77
0.02 -1.26 -1.0 -1.7 0.99 0.05 -1.25 -1.53 0.46 -0.05 -1.52 -1.31 -0.29 -1.18 -0.75 -1.59 -1.72 -0.67 -0.56 -0.72 0.7 -0.3 2.25 -0.56 0.89 -1.19 -0.7 1.19 -0.11 -0.91 -1.39 -0.53 -1.24 -1.56 2.35
-0.68 0.04 -0.16 0.63 -0.46 -0.27 0.69 0.49 0.46 0.5 -0.92 -0.59 0.56 -0.39 -1.52 -0.52 -2.29 -0.05 -0.25 0.93 -0.76 -0.46 -0.19 0.38 0.5 0.11 -0.64 0.22 0.81 0.23 0.48 -0.04 -0.46 -0.93 -0.36
-1.26 -2.13 -1.36 -1.01 -0.04 -0.09 -0.15 -0.95 0.29 0.19 -2.55 -2.61 0.98 0.26 -0.08 -0.45 -0.73 -0.11 -0.88 1.47 -0.38 -1.34 -0.12 0.14 0.82 0.71 0.32 -0.12 1.7 0.08 0.34 0.14 -2.59 -1.85 0.91
-1.34 -0.38 -0.78 0.2 -0.11 -0.85 0.34 -0.22 -0.24 -0.1 -0.87 -0.79 1.04 -0.15 -1.68 -1.1 -1.38 0.01 -0.06 1.04 -2.43 -1.45 -1.72 0.4 0.6 -0.22 1.19 -0.61 0.82 1.08 0.95 0.99 -0.59 -1.37 0.14
-1.18 -1.09 -1.29 -0.89 -0.67 -0.85 -0.73 0.71 -0.55 -0.54 -1.29 -1.28 0.77 -0.21 -0.48 -1.02 0.54 -0.75 -0.01 0.15 -1.19 -1.42 -1.51 1.65 1.19 -0.43 -0.91 -0.13 0.35 1.06 1.28 0.17 -1.07 -1.29 1.6
0.32 0.67 0.13 0.68 -0.09 0.31 0.68 0.61 1.0 0.62 -0.82 -1.06 -0.84 -0.58 -0.32 -0.97 0.42 -0.23 -1.09 1.61 -1.84 -1.54 -2.18 -1.16 -0.04 -0.08 -1.07 1.22 0.38 -1.12 -1.38 -0.69 -0.39 -1.65 0.54
-2.53 -0.9 -1.63 -0.61 -0.11 -0.72 -0.65 -1.68 0.51 0.16 -1.62 -1.47 1.49 -1.24 -1.16 -0.34 -0.53 -0.71 -0.83 1.0 -0.56 -1.58 0.82 0.48 1.84 -0.07 -0.55 -1.94 1.39 -1.13 -0.58 -2.58 -1.59 -0.39 2.2
-4.99 -3.05 -4.99 -2.19 0.46 -4.06 -1.38 -3.22 -2.0 -3.22 -1.13 -0.08 1.49 0.84 -1.95 -2.09 -1.3 -0.79 -0.67 0.48 -1.17 -1.43 1.29 -1.3 1.64 -0.54 -1.64 -3.31 1.08 -0.81 -1.66 -0.31 -1.49 -1.64 3.38
-3.84 -2.88 -2.72 -2.31 -0.49 -2.8 -2.15 -2.59 -2.48 -2.46 -0.67 -0.38 1.75 -1.03 -3.06 -2.76 -4.65 -2.54 -2.47 -0.16 -0.77 -1.38 -0.57 -1.73 1.93 -1.16 -2.99 -1.73 1.12 -3.01 -2.89 -2.79 -0.36 -0.86 3.95
-1.13 -1.29 -1.14 -1.02 0.89 -0.11 -0.81 -1.29 0.53 0.06 -0.36 -0.58 -0.39 -2.36 -0.53 -0.51 -1.73 -1.53 -1.56 1.03 1.55 0.44 1.96 -0.68 0.66 -0.06 -1.17 -0.47 0.27 -1.66 -1.05 -2.26 -0.52 -0.86 2.06
-0.53 -0.55 -0.81 -0.59 0.15 -0.46 -0.38 -1.23 -0.39 -0.23 0.32 0.41 -1.01 -0.62 0.12 -0.39 -1.77 0.08 -0.3 -0.04 0.5 0.47 1.4 0.64 0.91 -1.5 -1.69 1.09 -1.14 -0.04 0.88 -0.4 0.55 0.16 -0.41
-3.86 0.29 -4.2 0.53 -0.12 -0.74 0.63 -1.46 0.55 -0.05 -0.21 0.13 1.18 -0.64 -1.83 -0.42 -1.06 0.28 0.78 -0.46 -2.09 -2.18 -0.8 -0.76 1.71 -0.7 -2.13 0.2 -0.05 -1.48 -1.68 -1.22 0.21 -0.93 2.51
-1.59 -1.94 -0.59 -0.9 -1.2 -1.82 -1.42 -0.91 -0.82 -1.38 -3.16 -3.25 -0.87 -2.06 -2.26 -2.08 -2.21 -1.38 -0.95 -0.65 0.84 0.05 -0.18 1.96 0.73 -0.23 0.59 -0.62 0.85 0.9 1.12 -0.06 -2.98 -0.39 2.91
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-0.26 0.41 -0.55 0.41 -0.3 0.05 0.99 -0.63 0.5 0.6 -0.47 -0.29 0.08 0.11 -1.86 -1.02 -1.76 -0.38 -0.5 0.33 -4.47 -2.43 -3.08 0.18 0.64 -0.62 -0.38 1.49 0.81 -0.12 -0.1 -0.09 -0.13 -0.11 1.2
-3.58 0.08 -2.92 0.64 -3.22 -2.34 2.84 -0.13 0.54 0.49 -2.02 -2.8 3.36 -1.13 -5.94 -2.88 -5.63 -0.15 1.15 -0.45 -3.21 -1.81 -3.13 -0.38 -3.68 -2.07 -1.78 -2.03 -1.93 -0.62 -2.3 -0.15 -3.48 0.52 -2.75
-0.69 0.02 -0.82 -0.08 -0.28 -0.13 0.36 -0.14 0.07 0.24 0.25 0.43 1.94 0.69 -2.64 -1.81 -2.66 -0.58 -0.63 -0.37 -2.13 -1.56 -0.86 -0.64 -0.71 -2.69 -3.27 2.03 1.19 -0.18 -1.07 0.03 0.3 -0.85 0.9
-0.78 -0.15 -0.86 -0.34 0.8 -0.26 0.32 -1.22 0.38 0.06 -1.4 -1.2 0.45 -0.7 -0.35 -0.37 -0.23 0.09 0.26 -0.32 -1.01 -1.2 -0.1 -0.55 0.39 -1.03 -0.83 0.86 0.62 -0.56 -1.14 -0.27 -1.02 0.96 2.22
-4.25 -3.62 -4.28 -3.24 1.05 -3.02 -2.43 -3.87 -1.65 -2.41 0.48 0.73 1.22 2.03 -4.01 -4.39 -3.84 -1.61 -2.06 0.64 0.18 -1.19 2.46 -1.8 1.04 -4.68 -6.0 -1.98 0.55 -2.79 -3.51 -2.08 0.24 -0.61 2.7
-0.72 -0.72 -0.71 -0.71 0.08 -0.09 -0.91 -1.71 1.21 0.53 -0.89 -0.84 0.36 -2.34 -0.75 0.3 -1.75 0.59 -0.01 0.64 0.47 -0.58 0.41 -0.31 1.18 0.6 0.15 0.34 1.58 -1.45 -0.52 -2.18 -0.73 0.01 -0.03
-0.76 -0.28 -0.76 0.01 -0.08 -0.22 0.36 -0.75 0.28 0.04 -0.68 -0.93 0.09 -1.51 -0.39 -0.56 -0.78 0.16 0.51 -0.12 -0.38 -0.11 0.09 0.31 0.42 -1.88 -1.43 0.39 0.65 0.86 0.53 1.03 -0.79 0.68 0.75
-0.24 -0.95 -0.14 -0.54 -1.12 -0.59 -0.89 -1.02 -0.48 -0.62 0.08 -0.31 -0.21 -0.89 -1.65 -2.77 -1.2 -1.88 -1.01 1.33 -4.83 -3.75 -5.45 0.27 0.07 2.26 1.68 0.31 1.42 -0.42 -0.47 -0.93 -0.0 0.06 1.45
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-2.63 -4.31 -2.28 -2.75 -0.41 -0.4 -1.41 -1.1 0.28 -0.45 -1.26 -1.29 0.39 -0.71 -0.48 -1.68 -0.06 -0.81 -1.07 0.81 -2.84 -2.62 -1.79 1.3 2.12 0.51 0.76 -1.48 1.8 0.75 1.02 0.12 -1.46 -0.11 1.1
-0.38 -0.05 -0.34 -0.01 -0.22 -0.24 0.24 -0.6 -0.28 -0.13 -0.87 -0.75 0.58 0.42 -0.98 -1.44 -0.69 -0.78 -0.57 0.36 -1.63 -0.61 -2.02 0.72 0.12 0.11 0.11 0.14 0.61 0.66 0.31 0.74 -1.04 0.65 1.53

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.