Heatmap: Cluster_69 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4h after treatment
4h after treatment,No nitrate
8h after treatment
8h after treatment,No nitrate
20C
20h after treatment
20h after treatment,No nitrate
20h after treatment,Nocodazole added
36h after treatment
36h after treatment,No phosphate
Blue light,10min after light change
Blue light,60min after light change
Bohlin
CCAP1055/1,20C
CCAP1055/1,20C,High CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Low CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Normal CO2,OligoDT primed
CCMP2561
CCMP2561 Nitrase Reductase Knockout
CCMP632
CCMP632,24h
CCMP632,48h
CCMP632,72h
CCMP632,High light acclimated WT
CCMP632,Low light acclimated WT
NEPCC640,8h,1000ppmv CO2
NEPCC640,8h,390 ppmv CO2
No light,8h after treatment
Pt-1
Pt-1 8.6
Pt-1 8.6,With nitrogen
Pt-1 8.6,Without nitrogen
Red light,0min before light change
UTEX 646,Blue light
UTEX 646,No light
-0.18 0.93 -0.56 0.73 -0.71 0.09 1.16 -0.37 0.48 0.55 0.62 0.89 -0.36 0.7 -0.57 0.47 -2.24 0.95 1.12 -1.52 -0.77 0.64 -1.35 -1.95 -4.84 -1.12 -2.04 -0.05 -2.47 -2.73 -2.13 -3.23 1.06 0.69 -0.05
0.01 0.57 -0.32 0.49 -0.03 0.12 0.75 -0.78 0.46 0.4 -0.91 -0.65 -1.53 0.47 -0.31 -0.51 -0.78 1.26 1.55 -0.55 0.86 0.58 0.65 -0.9 -2.9 -1.59 -2.13 0.01 -1.59 -1.22 -1.85 -0.66 -0.7 0.85 0.13
-0.18 0.93 -0.56 0.73 -0.71 0.09 1.16 -0.37 0.48 0.55 0.62 0.89 -0.36 0.7 -0.57 0.47 -2.24 0.95 1.12 -1.52 -0.77 0.64 -1.35 -1.95 -4.84 -1.12 -2.04 -0.05 -2.47 -2.73 -2.13 -3.23 1.06 0.69 -0.05
0.49 1.39 0.02 0.78 -0.1 0.7 1.28 0.17 0.22 0.52 -0.0 0.68 -2.49 -0.54 -0.9 -0.34 -0.97 0.28 1.3 -2.18 -0.33 1.36 -0.59 -1.82 -2.62 -0.74 -1.59 -1.49 -2.59 -0.5 -0.22 -0.48 0.3 -0.16 -5.48
0.46 1.05 0.12 1.09 -0.54 0.82 1.25 0.17 0.93 0.95 -1.51 -0.85 -1.4 -1.88 -0.5 -0.03 -2.26 0.69 1.15 -1.79 -0.1 0.51 -1.01 -0.95 -4.01 -1.39 -2.2 0.97 -1.32 0.26 0.26 -0.12 -1.08 -0.63 -2.72
0.41 0.79 0.15 0.86 -0.43 0.8 1.01 0.45 0.69 0.77 -0.18 0.04 -1.2 -1.29 -0.03 -0.4 -0.07 0.05 0.75 -2.29 0.3 0.89 -0.73 -0.41 -2.7 -0.8 -1.54 -0.38 -2.43 -0.48 -0.99 -0.01 0.1 0.55 -1.89
0.32 0.64 0.1 0.63 -0.1 0.41 0.75 -0.0 0.62 0.66 -0.99 -0.59 -1.32 -0.85 0.13 -0.45 -0.53 0.62 0.93 -0.95 0.11 0.7 -0.47 -0.04 -1.45 -0.49 -0.74 0.14 -1.49 -0.03 -0.06 0.18 -0.62 0.4 -1.6
0.34 0.91 0.14 1.02 -0.5 0.19 1.29 -0.52 0.44 0.61 -0.32 0.21 0.13 0.14 -0.66 -0.38 -1.24 1.05 0.88 -0.57 -0.12 1.06 -0.69 -0.96 -4.12 -2.55 -4.01 -0.24 -1.82 -1.19 -1.44 -0.91 0.34 0.51 -0.49
-0.11 0.79 -0.86 0.54 -0.06 0.26 1.1 -0.76 0.83 0.73 -1.17 -1.21 -1.38 -0.82 0.21 0.48 -1.3 1.43 1.4 -0.8 0.75 0.52 0.66 -0.68 -1.0 -1.83 -2.7 0.64 -1.77 -1.1 -1.25 -0.77 -1.07 -1.02 -0.36
-0.04 0.34 -0.12 0.31 -0.04 0.17 0.3 -0.26 0.4 0.59 -0.17 0.24 -0.9 -0.49 0.33 -0.31 0.61 0.47 0.78 -1.07 0.81 0.99 0.12 -0.61 -1.86 -1.15 -2.14 0.31 -1.27 -0.8 -0.88 -0.7 0.23 0.34 -0.25
-0.15 0.38 -0.49 0.43 -0.79 0.14 0.65 -0.33 0.02 0.13 0.14 0.21 -0.65 -0.22 -0.07 -0.02 -2.02 0.98 1.12 -1.29 -0.09 0.54 0.03 0.02 -1.11 -1.3 -1.94 0.23 -1.5 -0.09 -0.51 0.38 0.15 0.42 0.68
0.11 0.67 -0.12 0.51 -0.1 0.42 0.74 -0.08 0.28 0.52 -0.09 0.34 -1.17 -0.63 0.19 0.45 -0.58 0.72 0.87 -1.1 0.25 1.17 -0.03 -0.75 -2.63 -2.23 -2.75 -0.04 -1.2 -0.87 -1.24 -0.78 0.28 0.94 -1.24
0.05 0.74 -0.21 0.83 -0.43 0.12 1.1 0.12 0.38 0.66 -0.22 -0.08 -0.64 -0.92 -0.86 -0.77 -1.37 0.51 0.84 -0.63 0.34 0.76 -0.32 -0.16 -2.51 -1.94 -2.4 -0.16 -1.34 0.17 -0.48 0.51 -0.2 0.53 0.28
0.59 0.6 0.31 0.23 -0.56 0.12 0.09 -0.05 -0.37 -0.06 0.1 0.47 -0.3 0.64 -0.61 -0.92 -1.38 0.44 0.52 -0.89 0.28 0.61 -0.88 0.28 -1.64 -1.5 -1.38 0.08 -0.3 0.27 0.15 0.43 0.04 0.7 -0.76
0.67 0.99 -0.01 0.72 -0.33 0.83 1.1 -0.21 0.6 0.78 -0.71 -0.21 -2.52 -0.69 -0.05 -0.49 -0.95 1.16 1.77 -1.71 -1.46 -0.55 -1.47 -1.19 -2.11 -1.33 -0.2 -1.25 -0.79 -0.16 -0.27 0.02 -0.44 0.36 -1.18
0.09 0.46 -0.17 0.67 -0.58 0.14 1.04 -0.4 0.44 0.56 -0.09 0.12 -0.88 -0.53 0.09 -0.18 0.06 0.78 1.43 -1.84 -0.53 0.04 -0.9 -0.41 -2.44 -2.45 -3.72 -0.11 -1.28 0.26 -0.68 0.86 0.09 0.6 -0.53
0.02 0.42 -0.41 0.18 -0.35 0.35 0.57 -0.47 0.28 0.25 0.33 0.6 0.21 0.29 -0.34 -0.72 -0.69 0.53 0.84 -0.71 0.14 1.02 -0.42 -0.84 -2.4 -1.96 -2.71 0.42 -1.16 -0.43 -1.11 0.23 0.49 0.47 0.11
0.45 0.44 0.08 0.06 -0.2 0.24 0.09 -0.27 0.17 0.37 -0.49 -0.4 -0.81 0.32 -0.16 -1.05 -0.35 0.56 0.82 -1.48 0.76 0.95 0.47 0.12 -1.39 -1.14 -1.01 -0.2 -0.98 -0.01 -0.48 0.23 -0.34 0.08 0.28
0.11 0.99 -0.11 0.57 -1.15 0.28 0.91 -0.39 -0.14 0.53 0.25 0.59 -1.69 0.17 0.36 0.37 0.96 0.92 1.08 -1.19 -0.66 1.17 -0.57 -1.2 -4.09 -2.38 -3.65 -1.9 -2.27 -1.42 -0.81 -1.59 0.8 0.8 -2.43
0.15 0.47 -0.12 0.44 -0.49 0.27 0.55 -0.52 0.28 0.47 -0.44 0.04 -0.65 -0.71 0.61 0.37 -0.48 0.8 1.09 -1.12 0.2 0.41 -0.57 0.13 -1.69 -1.6 -2.16 0.45 -1.3 -0.39 -0.85 -0.3 -0.05 0.44 0.42
-0.3 0.65 -0.25 0.53 -0.52 0.2 0.97 -0.5 0.65 0.78 -0.62 -0.35 -1.32 -2.14 -0.38 -0.09 -1.26 0.96 1.39 -0.92 0.44 1.98 0.4 -0.71 -2.77 -3.93 -3.55 -0.65 -1.11 -0.22 -1.76 0.62 -0.14 -0.12 -3.05
0.42 0.83 0.1 0.74 -0.43 0.24 0.79 -0.12 0.55 0.69 -0.28 -0.12 -1.79 -0.63 0.04 -0.1 -0.95 0.94 1.12 -1.43 -0.47 0.48 -1.65 0.52 -1.33 -0.98 -0.6 -0.66 -0.93 0.27 0.23 -0.3 -0.21 0.13 -2.95
0.14 0.55 0.09 0.41 -0.74 0.23 0.45 -0.05 0.32 0.42 -0.4 0.07 -0.19 -0.47 -0.15 -0.37 -2.01 0.61 0.92 -0.95 -0.05 0.63 -0.46 -0.19 -2.13 -1.35 -2.38 0.04 -1.03 -0.18 -0.49 0.01 -0.03 0.99 1.06
-0.88 -0.01 -2.6 -1.23 -0.16 -3.43 -0.95 -0.99 -3.24 -1.75 1.14 1.12 -2.2 -0.76 -0.65 -1.2 -3.23 1.31 2.56 -2.28 0.32 0.99 -0.97 -0.77 -0.99 -0.42 -0.33 0.78 -1.86 -0.86 -0.61 -0.97 0.98 1.4 -0.37
0.05 0.3 0.0 0.47 -0.23 0.35 0.28 0.46 0.33 0.15 -1.56 -1.08 0.39 -1.22 0.31 0.48 0.16 0.61 1.04 -0.39 -0.2 -0.72 -0.82 0.53 -0.55 -0.73 -1.37 0.34 0.06 0.04 0.22 -0.4 -0.94 -0.49 -0.06
-0.19 0.47 0.02 0.93 -0.48 0.36 0.91 1.0 0.13 0.39 -0.31 -0.07 -2.03 -0.28 -0.96 -0.67 -2.08 0.8 1.48 -1.43 0.63 1.16 -0.54 -0.74 -2.71 -2.13 -3.49 -1.73 -1.28 -0.05 -0.59 0.73 -0.03 0.63 -1.47
0.07 0.54 -0.09 0.46 -0.08 0.44 1.08 -0.59 0.62 0.47 0.03 -0.12 -0.86 0.69 -0.18 -0.7 -0.24 0.77 1.48 -1.73 -0.67 0.04 -0.96 0.01 -2.23 -1.3 -1.85 -0.22 -1.8 -0.22 -0.35 -0.09 -0.12 0.39 -0.17
0.14 0.77 -0.18 0.83 -0.58 0.46 1.08 -0.42 0.3 0.54 -0.38 -0.12 -1.59 -0.96 0.32 0.17 -1.53 0.94 1.02 -1.21 0.23 0.64 -0.11 0.12 -1.74 -1.59 -2.02 -0.78 -2.11 0.03 -0.42 0.45 -0.24 0.39 -0.8
0.04 0.33 0.06 0.17 -0.37 0.36 0.22 -0.19 0.28 0.41 -0.42 -0.12 -0.89 -0.54 0.34 -0.53 -0.06 0.59 0.91 -1.16 -0.24 0.77 -0.64 0.11 -2.05 -1.47 -1.59 -0.79 -0.79 -0.03 -0.28 0.48 0.07 0.84 0.91
0.12 0.51 -0.12 0.62 -0.6 0.32 0.94 0.1 0.52 0.58 -0.28 -0.08 -0.85 -1.08 -0.12 -0.04 -1.39 0.66 0.71 -0.98 0.5 0.44 -0.34 -0.36 -1.86 -1.62 -1.87 0.74 -1.35 -0.78 -0.58 -0.27 0.04 0.68 0.51
0.0 1.45 -0.74 1.47 -0.37 0.33 1.76 -0.52 1.02 0.68 0.13 0.46 -0.98 -0.98 -1.17 -0.12 -1.17 0.46 0.91 -2.14 -0.12 0.55 -1.13 -1.82 -3.18 -4.05 -5.06 0.48 -2.15 -0.66 -2.26 -0.29 0.57 -0.33 -1.04
-0.76 1.45 -0.99 1.41 -1.43 -0.1 1.62 -1.1 0.08 -0.03 0.96 0.97 -0.61 0.45 -1.55 -0.74 -1.06 0.45 1.1 -1.71 -2.45 -0.31 -2.71 -2.08 -2.91 0.5 0.55 -2.74 -3.59 -0.81 -0.84 -1.74 1.07 -0.76 0.79
0.26 0.89 -0.08 0.93 -0.63 0.47 1.54 -0.13 0.62 0.84 -0.59 0.08 -2.28 -0.73 -0.14 0.03 -0.94 1.2 1.43 -1.48 -1.02 0.02 -1.21 -0.82 -4.22 -1.61 -2.33 -0.56 -1.24 -0.26 -1.22 0.23 0.16 0.39 -0.91
0.32 0.64 -0.17 0.57 -0.33 0.31 1.04 -0.79 0.47 0.53 -0.55 -0.11 -1.04 -1.82 0.4 -0.66 -0.67 0.59 1.22 -1.28 -0.2 0.15 -0.79 -1.23 -3.01 -0.48 -1.52 1.63 -1.54 -0.74 -0.59 -0.82 -0.57 0.83 0.28
0.23 0.51 -0.15 0.56 0.1 0.45 1.12 -0.44 0.88 0.75 -1.14 -1.3 -2.89 -1.73 -0.28 -0.19 -0.83 0.48 1.22 -1.08 0.07 0.79 0.01 -0.24 -2.22 -1.28 -1.84 0.25 -0.59 -0.24 -0.46 0.21 -0.72 0.9 -0.28
0.17 0.74 -0.1 1.0 -0.21 1.01 1.47 -0.32 1.15 0.96 -0.13 -0.26 -1.76 -0.93 -0.43 -0.33 -1.07 0.37 0.71 -0.9 0.04 0.45 -0.05 -0.68 -0.61 -1.22 -1.87 -1.12 -1.35 -0.76 -0.76 -0.39 -0.36 0.45 -1.57
-0.13 0.6 0.28 0.67 0.11 0.34 0.93 -0.23 0.5 0.53 -0.21 0.11 -1.26 -1.73 0.5 -0.02 0.19 1.18 1.73 -1.24 0.01 0.9 -0.45 -1.39 -3.01 -5.34 -6.49 -0.07 -1.21 -1.37 -1.28 -1.13 0.13 0.15 -0.72
0.39 1.01 -0.22 0.98 -0.31 0.46 1.38 -0.36 0.67 0.64 -0.78 -0.12 -1.1 0.39 -0.98 -0.22 -5.16 0.96 1.0 -1.3 -0.09 -0.2 -0.96 -0.67 -3.22 -3.18 -3.65 -0.76 -1.48 -0.41 -1.11 -0.0 -0.17 1.01 0.83
-0.34 0.49 -0.42 0.67 -0.94 0.02 0.93 -0.02 0.33 0.35 -0.08 0.15 -3.21 -0.55 -0.3 -0.46 -0.67 0.71 1.49 -1.74 -1.76 0.03 -1.69 -1.3 -3.56 -0.2 0.3 -0.84 -1.27 0.53 0.2 0.25 0.34 1.44 -0.32
0.3 0.34 -0.2 0.47 -0.26 0.55 0.62 -0.23 0.26 0.27 -0.1 0.16 -0.79 -1.22 0.35 -0.71 0.05 0.91 1.49 -1.35 -0.38 0.09 -0.76 -0.43 -2.83 -2.51 -2.57 -0.11 -1.33 0.03 -0.69 0.43 0.07 1.24 -0.44
0.38 0.22 -0.1 0.25 -0.11 0.29 0.41 -0.14 0.28 0.41 0.17 0.16 -1.87 -0.3 0.46 -0.4 0.47 0.73 0.96 -2.1 0.61 0.77 -0.46 -0.04 -2.44 -0.54 -0.83 -0.08 -1.72 -0.76 -0.99 -0.93 0.08 0.24 0.41
0.58 0.76 0.13 0.82 -0.67 0.65 1.19 -0.39 0.61 0.75 0.24 0.66 -1.66 -0.85 -0.82 -0.34 -2.38 0.53 1.4 -1.42 0.12 1.22 -0.39 -1.17 -2.89 -3.33 -4.19 -0.85 -1.64 -0.94 -1.56 -0.42 0.62 0.7 -1.72
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0.28 0.9 0.01 0.96 -0.21 0.59 1.18 -0.57 0.99 0.97 -0.2 0.08 -1.14 -0.02 -0.35 -0.03 -0.34 0.54 1.02 -0.24 0.29 0.42 0.3 -0.84 -2.64 -2.29 -3.12 -0.07 -1.59 -1.5 -1.4 -1.79 0.15 -0.26 -1.45
-0.46 0.26 -0.7 0.03 -0.39 -0.09 0.63 -0.74 0.07 0.24 0.15 0.6 0.25 0.48 0.39 0.3 -0.32 1.62 1.83 -0.98 -0.0 0.68 -0.04 -1.62 -3.6 -1.5 -2.06 -0.91 -1.21 -1.35 -1.7 -0.71 0.55 0.33 -3.45
0.56 0.56 0.45 0.67 -0.74 0.65 0.65 -0.35 0.56 0.49 0.13 0.38 -1.58 -1.08 0.17 -0.06 -1.95 0.97 1.41 -0.83 -0.31 0.62 -0.33 -0.56 -2.26 -0.88 -1.23 -1.69 -2.27 -0.18 -0.55 0.07 0.48 0.44 -4.07
0.46 0.53 -0.09 0.22 -0.63 0.62 0.36 -0.33 0.72 0.7 0.48 0.76 -1.26 -0.21 -0.97 -0.98 -2.85 0.37 1.15 -2.41 0.4 1.01 0.13 -1.13 -3.03 -1.42 -1.49 0.22 -1.24 -0.27 -0.49 -0.43 0.7 0.61 -0.87
0.2 0.26 -0.17 0.1 -0.66 0.17 0.5 -0.31 0.29 0.48 0.42 0.42 0.2 -0.27 -0.15 -0.22 -0.9 0.45 0.93 -0.74 -0.03 0.24 -0.53 -0.14 -2.26 -1.63 -1.61 0.39 -0.29 0.23 -0.63 0.51 0.24 0.49 -0.47
0.19 0.89 -0.18 0.73 0.04 0.38 0.84 0.66 0.28 0.52 0.36 0.28 -0.5 -0.97 -0.66 -0.62 -0.48 0.73 1.53 -1.48 -0.55 0.69 -1.01 -1.11 -3.19 -1.13 -2.08 -0.54 -1.31 -0.28 -0.8 -0.17 0.16 0.61 -1.31
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0.22 0.33 -0.2 0.24 -0.14 0.47 0.44 -0.59 0.31 0.41 -0.07 0.3 -1.16 -0.85 -0.01 0.44 0.51 0.92 1.28 -0.92 0.89 1.49 0.46 -1.41 -4.3 -2.74 -3.8 0.12 -1.75 -1.26 -1.51 -0.71 0.18 -0.25 -1.34
0.21 0.37 -0.2 0.35 0.09 0.32 0.66 -0.24 0.69 0.74 -0.75 -0.19 -1.15 -0.4 -0.11 -0.62 -0.98 0.62 0.98 -1.44 -0.72 -0.16 -2.17 0.23 -1.74 -1.5 -1.33 -0.4 -1.18 0.11 -0.73 0.4 -0.18 1.44 1.01
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0.08 0.16 -0.05 0.23 -0.39 0.54 0.27 0.2 0.47 0.6 -0.77 -0.64 -1.88 -1.19 0.47 -0.05 -0.26 0.77 1.58 -1.53 0.54 0.44 -0.51 0.99 -0.6 -2.95 -2.69 -0.69 -0.93 -0.3 -0.81 -0.27 -0.59 0.1 0.61
-0.2 0.27 -0.16 0.47 -0.64 0.29 0.72 -0.55 0.61 0.62 0.16 0.06 -0.64 -1.04 -0.63 0.43 -1.1 0.84 1.15 -0.86 0.17 0.38 -0.11 -0.49 -1.19 -1.57 -2.01 -0.05 -0.47 -0.42 -0.72 0.02 0.12 0.56 0.46
-0.01 0.97 -0.86 0.57 -0.67 0.13 1.06 -1.09 0.31 0.39 0.18 0.63 -1.94 0.69 -1.21 -1.03 -1.5 0.03 -0.43 -1.31 -0.7 0.63 -1.03 -0.73 -2.4 1.31 1.04 0.44 -1.53 -0.19 0.11 -0.35 0.62 -0.51 -0.98
-0.15 0.34 -0.13 0.27 -0.02 0.35 0.58 -0.2 0.53 0.57 -1.25 -1.18 -0.85 -1.23 1.01 0.42 -0.27 1.12 1.76 -1.68 0.77 0.78 1.03 0.16 -1.8 -1.5 -2.43 -0.21 -1.38 -1.25 -1.18 -1.49 -1.15 -0.77 -1.43
1.62 1.22 0.81 0.65 -0.52 1.53 0.72 0.35 0.46 0.86 -0.49 0.46 -3.61 -1.58 -0.31 -1.97 -2.12 0.4 1.51 -2.16 -0.39 0.83 -1.05 -1.78 -3.95 -1.59 -0.93 -2.4 -2.64 -0.82 -1.11 -0.15 -0.32 0.01 -3.95
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0.36 0.43 0.1 0.24 -0.17 0.5 0.29 -0.42 0.42 0.45 0.4 0.24 -1.15 -0.13 -0.06 -0.21 -1.8 0.39 1.13 -1.45 0.33 0.92 0.1 -0.26 -2.14 -2.14 -2.52 0.17 -1.14 -0.39 -0.87 0.06 0.47 0.82 -0.95
0.06 0.29 -0.18 0.09 -0.53 0.16 0.29 -0.9 0.23 0.39 0.32 0.6 -0.56 0.18 0.16 -0.09 -1.41 0.7 0.83 -0.84 -0.13 -0.22 -0.56 0.14 -1.62 -1.66 -1.88 0.28 -0.77 -0.21 -0.76 0.12 0.51 1.12 0.44
0.48 0.62 0.27 0.61 -1.44 0.4 0.87 0.27 0.54 0.36 -0.81 -0.69 -0.74 -0.49 0.02 -0.6 0.09 0.78 0.96 -0.65 -0.26 -0.07 -0.45 0.04 -2.34 -0.8 -0.76 0.61 -1.39 -0.6 -0.91 -0.22 -0.8 0.59 0.46
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-0.59 0.45 -0.48 0.51 -0.07 -0.11 0.78 -0.57 0.4 0.46 0.12 0.22 -0.63 0.67 -0.64 -0.26 -0.92 0.86 1.18 -0.66 0.5 1.32 0.69 -0.55 -1.32 -3.19 -3.67 -0.02 -1.52 -0.8 -1.48 -0.15 -0.12 -0.29 -0.05
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-1.07 -1.19 -2.24 -1.04 -0.82 -1.28 -1.33 -1.45 -0.61 -0.56 0.74 0.62 -0.66 -2.49 0.55 -0.52 0.11 1.17 2.17 -1.2 0.24 1.45 0.19 -1.13 -1.89 -2.26 -1.99 -0.73 -0.27 0.04 0.04 -0.88 0.77 1.68 -0.57
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.