1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_78 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
4h after treatment
4h after treatment,No nitrate
8h after treatment
8h after treatment,No nitrate
20C
20h after treatment
20h after treatment,No nitrate
20h after treatment,Nocodazole added
36h after treatment
36h after treatment,No phosphate
Blue light,10min after light change
Blue light,60min after light change
Bohlin
CCAP1055/1,20C
CCAP1055/1,20C,High CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Low CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Normal CO2,OligoDT primed
CCMP2561
CCMP2561 Nitrase Reductase Knockout
CCMP632
CCMP632,24h
CCMP632,48h
CCMP632,72h
CCMP632,High light acclimated WT
CCMP632,Low light acclimated WT
NEPCC640,8h,1000ppmv CO2
NEPCC640,8h,390 ppmv CO2
No light,8h after treatment
Pt-1
Pt-1 8.6
Pt-1 8.6,With nitrogen
Pt-1 8.6,Without nitrogen
Red light,0min before light change
UTEX 646,Blue light
UTEX 646,No light
0.77 0.33 0.56 0.2 0.33 0.92 0.24 0.38 0.99 0.65 0.25 0.1 0.19 0.02 0.54 0.18 0.3 0.31 0.37 0.32 0.49 0.37 0.33 1.0 0.31 0.29 0.16 0.31 0.29 0.24 0.42 0.15 0.18 0.39 0.19
1.0 0.7 0.55 0.5 0.77 1.0 0.52 0.59 0.9 0.72 0.34 0.32 0.35 0.18 0.57 0.41 0.24 0.62 0.69 0.28 0.41 0.4 0.45 0.78 0.58 0.3 0.46 0.55 0.45 0.57 0.61 0.58 0.4 0.73 0.86
1.0 0.47 0.6 0.38 0.63 0.81 0.54 0.81 0.66 0.58 0.52 0.47 0.4 0.24 0.34 0.2 0.27 0.31 0.24 0.48 0.23 0.27 0.29 0.99 0.63 0.48 0.7 0.65 0.8 0.53 0.65 0.72 0.46 0.47 0.44
0.81 0.34 0.45 0.29 0.72 0.9 0.63 0.37 0.59 0.82 0.45 0.4 0.15 0.24 0.51 0.08 0.38 0.49 0.69 0.15 0.42 0.98 0.33 0.24 0.12 0.22 0.23 0.31 0.35 0.31 0.29 0.25 0.52 1.0 0.2
0.8 0.14 0.44 0.2 0.45 1.0 0.43 0.58 0.93 0.96 0.19 0.14 0.61 0.3 0.4 0.22 0.16 0.6 0.41 0.27 0.98 0.41 0.5 0.45 0.39 0.25 0.25 0.35 0.46 0.47 0.41 0.57 0.16 0.39 0.85
0.59 0.7 0.64 0.85 0.85 0.7 0.87 0.53 1.0 0.88 0.33 0.37 0.29 0.17 0.54 0.44 0.3 0.39 0.54 0.46 0.79 0.66 0.7 0.74 0.7 0.66 0.56 0.78 0.72 0.47 0.52 0.44 0.45 0.44 0.56
0.34 0.35 0.25 0.33 0.58 0.47 0.41 0.16 0.6 0.54 0.34 0.3 0.44 0.35 1.0 0.53 0.76 0.57 0.42 0.43 0.35 0.24 0.45 0.48 0.49 0.41 0.34 0.12 0.37 0.23 0.28 0.24 0.39 0.24 0.79
0.44 0.51 0.47 0.65 0.48 0.56 1.0 0.29 0.82 0.75 0.35 0.37 0.2 0.24 0.22 0.09 0.31 0.26 0.29 0.35 0.04 0.11 0.04 0.3 0.07 0.13 0.06 0.58 0.2 0.36 0.25 0.51 0.47 0.43 0.19
0.55 0.36 0.35 0.3 0.25 0.53 0.33 0.27 0.5 0.47 0.22 0.21 0.3 0.07 0.29 0.09 0.4 0.23 0.44 0.14 0.47 0.29 0.25 0.42 0.29 0.44 0.63 0.43 0.15 0.23 0.18 0.28 0.2 0.54 1.0
0.31 0.47 0.31 0.48 0.32 0.61 0.8 0.19 1.0 0.96 0.24 0.26 0.35 0.31 0.22 0.25 0.11 0.43 0.43 0.57 0.4 0.45 0.31 0.1 0.03 0.08 0.05 0.02 0.26 0.09 0.15 0.1 0.29 0.36 0.25
0.57 0.31 0.46 0.32 0.54 0.73 0.28 0.31 1.0 0.76 0.23 0.19 0.62 0.1 0.35 0.34 0.04 0.49 0.44 0.19 0.6 0.23 0.71 0.46 0.83 0.53 0.71 0.66 0.7 0.39 0.53 0.38 0.26 0.53 0.95
0.35 0.36 0.24 0.36 0.64 0.51 0.37 0.31 0.63 0.55 0.31 0.21 0.43 0.11 0.51 0.3 0.35 0.39 0.38 0.42 0.66 0.34 0.7 0.56 1.0 0.4 0.23 0.35 0.67 0.47 0.57 0.32 0.23 0.46 0.83
0.37 0.34 0.26 0.49 0.75 0.59 0.7 0.28 0.93 0.41 0.08 0.06 0.27 0.07 0.26 0.14 0.35 0.32 0.34 0.25 0.08 0.1 0.1 0.61 0.65 0.14 0.12 0.33 0.4 0.32 0.4 0.3 0.08 0.22 1.0
0.5 0.5 0.41 0.57 0.61 0.58 0.71 0.47 0.72 0.71 0.43 0.32 0.68 0.4 0.39 0.27 0.26 0.72 0.53 0.39 0.3 0.31 0.28 0.58 0.56 0.55 0.67 0.74 0.81 0.9 0.88 1.0 0.37 0.68 0.95
0.29 0.11 0.21 0.12 0.46 0.65 0.15 0.16 1.0 0.6 0.26 0.06 0.05 0.01 0.23 0.18 0.15 0.14 0.1 0.2 0.36 0.15 0.37 0.41 0.56 0.3 0.38 0.15 0.22 0.13 0.28 0.03 0.07 0.29 0.29
0.87 0.52 0.57 0.71 0.54 0.79 1.0 0.59 0.82 0.98 0.91 0.53 0.27 0.52 0.87 0.26 0.48 0.78 0.79 0.31 0.68 0.84 0.46 0.7 0.07 0.37 0.36 0.27 0.32 0.69 0.68 0.72 0.65 0.23 0.41
0.67 0.28 0.31 0.21 0.5 1.0 0.56 0.41 0.7 0.58 0.05 0.03 0.01 0.09 0.26 0.02 0.15 0.34 0.44 0.08 0.62 0.35 0.67 0.57 0.21 0.03 0.06 0.13 0.23 0.49 0.23 0.89 0.04 0.07 0.0
0.63 0.28 0.4 0.16 0.23 0.63 0.19 0.29 1.0 0.63 0.19 0.15 0.08 0.06 0.15 0.14 0.13 0.22 0.23 0.06 0.12 0.25 0.07 0.3 0.03 0.25 0.28 0.24 0.26 0.17 0.21 0.12 0.2 0.4 0.09
0.73 0.3 0.37 0.3 0.62 1.0 0.64 0.41 0.82 0.68 0.37 0.33 0.43 0.23 0.78 0.33 0.68 0.42 0.44 0.36 0.27 0.26 0.33 0.7 0.29 0.2 0.22 0.36 0.58 0.37 0.46 0.35 0.43 0.11 0.97
0.46 0.25 0.22 0.24 0.6 0.65 0.44 0.41 0.48 0.5 0.6 0.5 0.64 0.65 0.13 0.05 0.03 0.32 0.39 0.25 0.68 1.0 0.99 0.46 0.19 0.1 0.2 0.71 0.91 0.49 0.3 0.63 0.51 0.17 0.96
0.17 0.07 0.1 0.04 0.16 0.23 0.06 0.15 0.09 0.11 0.14 0.08 0.02 0.19 0.03 0.0 0.01 0.15 0.24 0.02 0.74 1.0 0.28 0.35 0.07 0.08 0.15 0.04 0.07 0.4 0.11 0.77 0.1 0.18 0.11
0.82 0.31 0.43 0.23 0.46 0.82 0.31 0.45 0.56 0.56 0.46 0.25 0.2 0.22 0.37 0.12 0.26 0.33 0.35 0.16 1.0 0.61 0.98 0.67 0.47 0.16 0.21 0.22 0.38 0.62 0.38 0.91 0.37 0.34 0.32
0.49 0.66 0.34 0.64 0.75 0.7 0.6 0.38 1.0 0.86 0.49 0.52 0.27 0.22 0.41 0.41 0.17 0.44 0.45 0.29 0.39 0.38 0.31 0.15 0.06 0.08 0.03 0.89 0.45 0.23 0.28 0.21 0.68 0.89 0.93
0.36 0.43 0.3 0.43 0.56 0.57 0.53 0.17 0.91 0.73 0.44 0.42 0.39 0.36 0.33 0.29 0.39 0.47 0.43 0.72 0.21 0.16 0.26 0.5 0.51 0.3 0.22 0.48 0.57 0.28 0.34 0.24 0.54 0.46 1.0
0.29 0.26 0.22 0.24 0.63 0.48 0.3 0.25 0.59 0.59 0.33 0.34 0.98 0.18 0.49 0.29 0.29 0.33 0.27 0.69 0.66 0.44 1.0 0.71 0.45 0.38 0.19 0.29 0.54 0.75 0.58 0.66 0.36 0.07 0.26
0.72 0.6 0.93 0.85 0.52 0.76 0.61 0.36 0.75 0.92 0.3 0.36 0.29 0.16 0.16 0.22 0.02 0.41 0.37 0.21 0.47 0.27 1.0 0.18 0.35 0.3 0.35 0.55 0.38 0.3 0.33 0.27 0.4 0.55 0.59
0.88 0.4 0.62 0.28 0.63 1.0 0.28 0.52 0.62 0.62 0.28 0.2 0.22 0.09 0.72 0.22 0.76 0.4 0.46 0.35 0.13 0.17 0.1 0.7 0.14 0.32 0.35 0.31 0.4 0.42 0.59 0.21 0.33 0.32 0.14
0.17 0.42 0.16 0.5 0.41 0.73 1.0 0.29 0.81 0.75 0.24 0.23 0.48 0.47 0.18 0.11 0.2 0.38 0.44 0.42 0.4 0.27 0.55 0.41 0.21 0.13 0.02 0.23 0.33 0.3 0.22 0.43 0.26 0.12 0.37
0.7 0.87 0.69 0.82 0.97 0.82 0.92 0.59 0.95 1.0 0.49 0.63 0.64 0.88 0.59 0.55 0.74 0.71 0.61 0.75 0.6 0.92 0.62 0.51 0.22 0.59 0.39 0.64 0.75 0.53 0.61 0.44 0.68 0.98 0.41
0.68 0.52 0.51 0.43 0.58 0.84 0.5 0.35 0.78 0.74 0.32 0.26 0.39 0.11 1.0 0.44 0.32 0.53 0.41 0.67 0.68 0.57 0.6 0.96 0.57 0.63 0.39 0.65 0.43 0.43 0.56 0.28 0.36 0.06 0.83
0.46 0.34 0.43 0.37 0.54 0.58 0.39 0.4 0.7 0.62 0.22 0.16 0.35 0.16 0.23 0.25 0.23 0.46 0.34 0.55 0.42 0.26 0.49 0.49 0.5 0.24 0.53 0.16 0.86 0.34 0.29 0.37 0.26 0.65 1.0
0.59 0.7 0.5 0.67 0.67 0.86 0.8 0.36 1.0 0.88 0.52 0.5 0.13 0.54 0.3 0.24 0.31 0.32 0.41 0.87 0.24 0.37 0.27 0.49 0.1 0.36 0.32 0.54 0.4 0.33 0.29 0.35 0.59 0.66 0.54
0.74 0.87 0.69 0.77 0.71 0.84 1.0 0.54 1.0 0.9 0.43 0.31 0.4 0.62 0.42 0.31 0.77 0.62 0.62 0.7 0.08 0.3 0.13 0.5 0.26 0.53 0.32 0.61 0.51 0.71 0.5 0.78 0.51 0.6 0.44
0.55 0.86 0.45 0.95 0.52 0.61 1.0 0.48 0.61 0.65 0.27 0.27 0.43 0.37 0.36 0.34 0.5 0.48 0.4 0.31 0.22 0.27 0.21 0.24 0.14 0.4 0.31 0.6 0.24 0.2 0.24 0.18 0.32 0.42 0.31
0.37 0.24 0.41 0.21 0.23 0.36 0.13 0.16 0.49 0.58 0.17 0.15 1.0 0.05 0.11 0.09 0.05 0.21 0.1 0.36 0.29 0.11 0.25 0.41 0.23 0.25 0.12 0.07 0.18 0.19 0.26 0.15 0.28 0.03 0.01
0.17 0.16 0.19 0.19 0.32 0.2 0.19 0.09 0.36 0.38 0.08 0.06 1.0 0.08 0.16 0.1 0.18 0.41 0.22 0.38 0.27 0.06 0.31 0.29 0.23 0.13 0.06 0.26 0.15 0.13 0.14 0.14 0.13 0.03 0.11
0.69 0.48 0.48 0.43 0.56 0.83 0.45 0.38 1.0 0.85 0.37 0.49 0.59 0.22 0.85 0.5 0.89 0.56 0.53 0.42 0.24 0.37 0.26 0.59 0.25 0.35 0.32 0.55 0.39 0.26 0.37 0.18 0.49 0.68 0.76
0.51 0.48 0.34 0.44 0.46 0.78 0.69 0.66 1.0 0.87 0.29 0.25 0.29 0.18 0.26 0.31 0.11 0.37 0.39 0.18 0.48 0.51 0.47 0.86 0.25 0.14 0.12 0.4 0.42 0.56 0.22 0.83 0.28 0.49 0.49
0.07 0.25 0.16 0.4 0.47 0.69 1.0 0.43 0.87 0.65 0.05 0.04 0.63 0.67 0.14 0.11 0.14 0.51 0.31 0.68 0.29 0.31 0.31 0.88 0.82 0.2 0.05 0.13 0.83 0.49 0.18 0.88 0.05 0.1 0.37
0.69 0.54 0.54 0.48 0.62 0.73 0.54 0.3 0.89 0.73 0.31 0.3 0.39 0.26 0.45 0.37 0.21 0.4 0.5 0.48 0.48 0.45 0.58 0.73 0.49 0.41 0.35 0.7 0.55 0.35 0.49 0.29 0.37 0.62 1.0
0.47 0.36 0.32 0.27 0.42 0.89 0.37 0.4 0.92 0.65 0.48 0.17 0.24 0.04 0.43 0.52 0.33 0.27 0.35 0.56 0.3 0.28 0.54 0.29 0.17 0.4 0.38 1.0 0.72 0.24 0.49 0.08 0.21 0.21 0.12
0.78 0.59 0.54 0.49 0.47 0.68 0.48 0.34 0.64 0.58 0.51 0.54 0.35 0.28 0.49 0.43 0.18 0.66 0.66 0.25 0.3 0.31 0.29 0.89 0.81 0.29 0.41 0.76 0.34 0.49 0.45 0.53 0.54 0.7 1.0
0.42 0.5 0.35 0.54 0.48 0.67 0.64 0.27 1.0 0.92 0.28 0.28 0.2 0.23 0.31 0.36 0.07 0.65 0.56 0.29 0.56 0.27 0.48 0.6 0.43 0.08 0.04 0.37 0.32 0.21 0.14 0.31 0.34 0.59 0.46
1.0 0.31 0.61 0.21 0.67 1.0 0.35 0.52 0.84 0.8 0.61 0.37 0.2 0.11 0.78 0.49 0.37 0.51 0.68 0.17 0.33 0.63 0.28 0.73 0.3 0.4 0.6 0.95 0.37 0.67 0.68 0.48 0.4 0.72 0.91
0.51 0.48 0.5 0.42 0.26 0.46 0.38 0.34 0.5 0.49 0.52 0.51 0.1 0.18 0.31 0.14 0.43 0.3 0.53 0.17 0.07 0.22 0.05 1.0 0.33 0.22 0.26 0.75 0.3 0.56 0.36 0.54 0.5 0.68 0.41
0.36 0.37 0.28 0.31 0.28 0.33 0.35 0.24 0.35 0.41 0.31 0.34 0.53 0.18 0.58 0.44 1.0 0.38 0.37 0.29 0.04 0.11 0.06 0.28 0.09 0.31 0.33 0.29 0.27 0.23 0.31 0.16 0.34 0.36 0.2
0.57 0.5 0.61 0.57 0.65 0.71 0.56 0.41 0.83 0.86 0.32 0.29 0.26 0.15 0.29 0.3 0.31 0.31 0.27 0.63 0.49 0.54 0.43 0.58 0.4 0.31 0.36 0.36 0.46 0.44 0.48 0.36 0.36 0.59 1.0
0.03 0.1 0.08 0.16 0.09 1.0 0.29 0.32 0.32 0.5 0.04 0.02 0.01 0.16 0.02 0.23 0.02 0.2 0.23 0.03 0.1 0.14 0.14 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.1 0.11 0.08 0.03 0.0 0.0
0.61 0.7 0.6 0.94 0.42 0.73 1.0 0.63 0.67 0.67 0.28 0.35 0.72 0.47 0.46 0.42 0.23 0.79 0.6 0.41 0.43 0.63 0.47 0.62 0.16 0.54 0.16 0.48 0.4 0.49 0.35 0.64 0.34 0.8 0.2
1.0 0.29 0.51 0.1 0.48 0.91 0.12 0.46 0.82 0.72 0.16 0.21 0.12 0.04 0.99 0.31 0.64 0.39 0.41 0.12 0.33 0.28 0.26 0.51 0.26 0.39 0.72 0.44 0.22 0.4 0.54 0.3 0.16 0.57 0.03
0.48 0.6 0.53 0.87 0.49 0.57 1.0 0.29 0.94 0.92 0.42 0.52 0.51 0.41 0.27 0.3 0.42 0.32 0.36 0.64 0.22 0.32 0.16 0.61 0.11 0.41 0.27 0.61 0.68 0.33 0.29 0.4 0.56 0.76 0.57
0.76 0.87 0.71 0.64 0.37 0.87 0.79 0.55 0.71 0.67 0.32 0.29 0.41 0.06 0.36 0.28 0.08 0.4 0.32 0.13 0.57 0.71 0.43 0.46 0.13 1.0 0.75 0.36 0.34 0.13 0.16 0.17 0.39 0.55 0.29
0.82 0.43 0.53 0.27 0.72 1.0 0.33 0.5 0.79 0.71 0.37 0.31 0.19 0.11 0.36 0.26 0.15 0.45 0.45 0.22 0.39 0.31 0.49 0.71 0.37 0.26 0.25 0.36 0.52 0.34 0.48 0.26 0.44 0.19 0.71
0.78 0.39 0.53 0.36 0.5 0.74 0.36 0.65 0.62 0.64 0.13 0.1 0.53 0.24 0.41 0.27 0.67 0.37 0.55 0.47 0.28 0.37 0.2 0.56 0.23 0.55 0.53 0.39 0.56 0.68 0.44 0.66 0.14 0.39 1.0
0.46 0.26 0.31 0.16 0.29 0.46 0.15 0.25 0.33 0.34 0.29 0.21 0.03 0.15 1.0 0.08 0.32 0.23 0.37 0.09 0.23 0.38 0.1 0.8 0.06 0.18 0.13 0.13 0.1 0.46 0.26 0.45 0.31 0.29 0.24
0.37 0.26 0.29 0.26 0.51 0.36 0.23 0.21 0.45 0.38 0.1 0.08 0.22 0.04 0.26 0.19 0.24 0.32 0.43 0.22 0.38 0.18 0.3 0.37 1.0 0.15 0.41 0.37 0.45 0.28 0.32 0.31 0.1 0.18 0.27
0.3 0.49 0.23 0.46 0.75 0.76 0.58 0.25 1.0 0.74 0.16 0.14 0.27 0.12 0.22 0.17 0.1 0.29 0.3 0.31 0.24 0.25 0.4 0.26 0.51 0.14 0.07 0.56 0.24 0.16 0.12 0.26 0.19 0.41 0.25
1.0 0.72 0.82 0.61 0.58 0.93 0.56 0.43 0.82 0.78 0.58 0.58 0.31 0.29 0.8 0.68 0.25 0.69 0.6 0.71 0.77 0.71 0.55 0.81 0.39 0.33 0.34 0.62 0.56 0.45 0.54 0.43 0.74 0.55 0.35
0.85 0.24 0.55 0.15 0.24 0.55 0.07 0.64 0.27 0.3 0.46 0.37 0.08 0.03 1.0 0.62 0.26 0.52 0.41 0.22 0.61 0.3 0.4 0.77 0.48 0.55 0.62 0.26 0.37 0.76 0.81 0.62 0.7 0.39 0.38

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)