Heatmap: Cluster_104 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4h after treatment
4h after treatment,No nitrate
8h after treatment
8h after treatment,No nitrate
20C
20h after treatment
20h after treatment,No nitrate
20h after treatment,Nocodazole added
36h after treatment
36h after treatment,No phosphate
Blue light,10min after light change
Blue light,60min after light change
Bohlin
CCAP1055/1,20C
CCAP1055/1,20C,High CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Low CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Normal CO2,OligoDT primed
CCMP2561
CCMP2561 Nitrase Reductase Knockout
CCMP632
CCMP632,24h
CCMP632,48h
CCMP632,72h
CCMP632,High light acclimated WT
CCMP632,Low light acclimated WT
NEPCC640,8h,1000ppmv CO2
NEPCC640,8h,390 ppmv CO2
No light,8h after treatment
Pt-1
Pt-1 8.6
Pt-1 8.6,With nitrogen
Pt-1 8.6,Without nitrogen
Red light,0min before light change
UTEX 646,Blue light
UTEX 646,No light
-0.24 0.72 -0.94 0.38 -0.62 0.03 1.45 -0.62 0.12 -0.19 0.38 0.41 0.09 1.35 -1.14 -1.75 -1.37 -0.42 -0.97 -0.15 -1.11 -0.77 -1.19 -0.04 -0.14 -1.57 -2.08 -0.63 -1.18 0.31 -0.14 0.34 0.81 -1.53 1.84
-0.54 -0.85 -0.91 -1.73 0.48 -0.53 -0.62 -0.7 -0.65 -0.63 1.63 1.49 0.58 0.73 -1.01 -1.13 -0.44 -1.02 -0.94 -1.33 -0.46 0.29 -0.01 -1.94 -2.36 -0.39 -0.03 0.65 0.68 -3.07 -9.6 -2.6 1.35 1.58 0.99
0.29 -0.29 -0.26 -0.44 -0.34 -0.12 -0.61 -0.39 -0.35 -0.47 -0.24 0.43 0.34 0.68 0.32 -1.23 0.41 -0.53 -0.5 -1.24 -0.1 0.48 -0.54 0.73 -1.06 -1.02 -1.16 -0.14 -0.41 0.5 0.31 0.49 0.08 1.55 0.12
-1.14 -0.98 -1.29 -0.78 -1.19 -1.05 -0.41 -0.11 -0.97 -0.7 -0.61 -0.26 0.88 0.77 -3.56 -2.48 -5.53 -1.04 -1.63 -0.7 0.09 0.9 -0.22 -0.84 -1.42 0.45 1.87 -0.37 1.19 1.25 0.57 1.63 -0.56 0.43 -0.41
-0.6 -0.8 -0.72 -0.36 -0.52 -0.23 0.19 -0.32 0.12 0.13 -0.24 -0.58 0.93 1.02 -0.34 -0.48 -0.07 -0.26 0.37 -1.29 -1.35 -0.01 -1.52 0.99 -1.99 -1.39 -1.12 0.61 0.48 0.69 0.73 0.02 -0.58 0.4 1.18
-0.54 0.16 -0.42 0.27 -0.76 -0.38 0.27 0.04 -0.22 -0.11 -2.15 -1.75 -0.54 -0.32 -1.16 -0.65 -1.49 -0.17 0.56 0.91 -2.33 -1.12 -2.17 0.58 -0.76 0.72 0.95 -0.54 0.81 1.35 1.31 0.86 -1.75 -0.01 0.05
-0.31 -0.03 -0.31 0.08 -0.45 0.14 0.11 0.13 0.05 0.15 0.06 0.42 -0.67 0.67 -0.86 -0.3 -2.27 -0.22 0.01 -0.12 -0.33 0.68 -0.59 0.4 -1.65 -0.82 -0.09 -1.37 -0.58 0.9 1.09 0.3 0.31 1.03 -1.13
-0.51 0.26 -0.07 0.22 0.08 -0.29 0.15 0.05 -0.18 0.22 -0.25 0.17 -0.03 0.11 -1.54 -0.93 -1.86 -0.27 -0.21 0.42 -0.61 0.26 -0.81 0.27 -0.88 -1.39 -1.31 0.35 0.58 0.47 0.33 0.6 0.1 0.28 1.34
-0.6 -0.36 0.73 0.75 -1.25 -1.31 -1.12 0.21 -1.56 -0.75 -0.6 -0.18 - 2.14 -2.18 -1.57 -2.21 -1.29 -0.26 -0.92 -0.5 0.66 -1.65 1.39 -1.99 -1.09 -1.56 -2.18 0.0 0.97 1.06 0.14 -0.01 1.82 0.23
-0.07 0.06 -0.08 0.21 -0.26 0.32 0.44 -0.13 0.28 0.37 0.79 0.23 -0.95 -0.17 -1.1 -0.62 -2.02 -0.21 0.07 0.54 -0.12 0.38 -0.51 0.14 -1.67 -1.12 -1.44 0.23 -0.28 -0.71 -0.29 -0.51 0.24 0.43 1.68
-0.97 -0.27 -0.35 0.31 -0.45 -0.2 0.67 -0.26 0.32 0.35 0.44 0.35 -0.55 1.17 -1.33 -0.73 -0.75 -0.87 -0.45 0.49 -0.77 -0.38 -0.95 0.51 -0.65 -1.36 -0.9 -0.43 -0.1 -0.14 -0.28 0.46 0.34 -0.01 1.73
-0.14 0.08 -0.18 0.21 -0.21 0.25 0.54 -0.05 0.42 0.38 0.12 0.2 -0.36 0.76 -0.56 -0.88 -0.28 -0.18 0.03 -0.28 -2.39 -0.88 -1.9 0.34 -0.51 -0.33 -0.35 -0.53 0.08 0.39 0.23 0.3 0.22 0.54 0.83
-0.91 -0.52 -0.99 -0.43 -0.51 -0.46 0.01 -0.68 -0.38 -0.22 0.43 0.67 0.13 1.51 -1.25 -1.32 -0.87 -0.17 0.07 -0.22 -2.11 -0.93 -1.25 0.19 -0.7 -1.36 -0.62 -0.45 0.67 0.57 -0.16 0.95 0.57 0.57 1.69
-1.51 -0.32 -1.09 -0.0 -0.45 -0.84 0.17 -0.46 -0.44 -0.23 -1.57 -1.69 0.88 0.27 -1.15 -0.26 -1.2 -0.12 0.06 1.23 -0.21 0.07 -0.89 0.26 0.12 -0.37 0.89 -0.6 1.08 0.97 0.33 1.19 -1.76 -0.55 0.39
-0.59 -0.51 -0.23 -0.6 -0.36 -0.13 -0.27 -0.13 0.21 0.05 0.13 0.59 -0.42 0.15 -0.27 -1.22 -0.34 -0.3 -0.22 0.0 -0.39 -0.18 -1.12 1.02 -0.42 -0.25 -0.11 -0.85 0.6 0.24 0.13 -0.2 0.55 1.04 0.94
0.07 -0.05 -0.07 -0.03 -0.41 0.03 -0.18 -0.81 0.44 0.06 0.31 0.49 -0.05 -0.16 -0.43 -0.42 -1.33 0.1 -0.1 -0.65 0.58 0.45 0.14 0.72 0.18 -0.63 -0.58 0.25 -0.14 -0.46 -0.71 -0.04 0.43 0.55 0.14
-0.36 -0.45 -0.36 -0.5 0.2 -0.25 -0.19 -0.57 -0.31 -0.14 0.8 1.27 0.43 1.38 -0.63 -1.77 -0.8 -0.46 -0.59 0.58 -3.09 -1.01 -3.12 0.27 -1.27 -0.11 -0.11 -0.82 0.3 -0.27 -0.85 0.22 1.18 1.36 -0.21
-0.3 1.0 -0.05 0.19 -0.5 0.13 0.56 0.15 0.12 0.38 0.31 0.57 1.19 1.04 -1.49 -2.1 -1.33 -1.02 -0.18 -0.78 -2.25 -0.6 -2.26 0.01 -1.67 -0.18 0.32 -1.14 0.5 0.18 -0.22 0.39 0.57 0.56 -0.65
-0.74 -0.42 -0.86 -0.27 -0.33 -0.07 0.21 -0.25 0.38 0.19 0.08 -0.13 0.48 0.02 -1.37 -1.23 -2.04 0.01 0.43 -0.53 -1.77 -0.76 -0.85 0.3 0.29 -0.85 -0.57 -0.72 0.22 1.25 1.28 1.17 -0.43 0.18 0.83
-0.65 -0.23 -0.46 -0.15 -0.26 -0.08 0.07 -0.05 0.99 0.29 0.48 0.81 -0.03 1.18 -0.34 -0.23 -0.23 -0.35 -0.15 0.03 -1.7 0.08 -1.63 0.53 -1.3 -1.1 -1.67 -0.86 0.81 -0.24 -0.37 0.03 0.68 0.89 -0.76
-0.72 -0.47 -0.73 -0.38 -0.19 -0.51 -0.16 -0.55 -0.13 -0.15 -0.05 0.29 0.45 1.48 -0.49 -1.22 -0.55 -0.3 0.24 -0.12 -1.08 -0.04 -1.25 0.37 -1.13 -0.2 -0.24 -0.53 0.34 0.1 -0.22 0.35 0.22 1.24 1.16
-0.38 0.36 -0.28 0.54 -0.02 -0.2 0.54 -0.05 -0.05 0.36 0.39 0.24 -0.44 0.08 -1.1 -0.46 -1.16 -0.09 -0.21 -0.57 -1.18 -0.58 -1.39 -0.41 -0.82 -0.31 -0.8 0.02 0.25 0.54 0.37 0.75 0.11 0.94 0.94
-1.12 -0.04 0.07 0.43 -0.89 -0.34 0.54 0.21 -0.27 -0.05 -0.1 -0.73 0.95 0.21 -1.12 -0.25 -0.2 -0.21 0.07 1.09 -5.4 -3.07 -4.48 0.31 -1.08 0.01 0.06 -1.37 1.18 0.82 0.63 0.77 -0.57 -0.05 0.42
-0.48 0.37 -0.46 0.15 -0.26 -0.38 0.54 -0.18 0.01 0.3 -0.5 -0.5 0.35 -0.46 -1.84 -1.83 -1.25 -0.95 -0.6 0.59 0.52 0.38 -0.54 0.25 -0.68 -1.38 -1.68 1.02 1.2 0.31 -0.42 0.9 -0.5 0.43 0.8
-0.66 -0.14 -0.35 0.17 -0.39 -0.07 0.47 0.13 0.14 0.13 -0.37 -0.11 0.3 0.48 -1.44 -1.5 -0.95 -0.22 0.21 -1.1 -1.07 -0.41 -1.15 0.59 -0.55 -1.03 -0.33 -0.47 0.37 1.09 0.79 1.12 -0.18 0.27 0.86
-0.15 0.27 -0.17 0.17 0.11 -0.04 0.31 -0.51 -0.0 0.24 0.45 0.57 -0.05 -0.61 -0.95 -0.68 -1.22 -0.43 -0.7 0.25 -1.42 -0.27 -1.2 -0.09 -0.95 -0.37 -0.6 0.59 0.2 0.36 0.21 0.48 0.43 0.82 1.0
-0.49 -0.65 -0.19 -0.14 0.46 0.04 -0.09 -0.1 0.37 0.01 -0.5 -0.86 -0.28 1.53 -1.37 -1.68 -1.25 -0.98 -0.44 -0.28 -0.37 -0.59 -0.13 0.34 0.83 -0.78 0.76 -1.5 1.0 0.13 -0.2 0.27 -0.57 1.27 -0.23
-0.51 0.1 -0.75 0.18 -0.37 -0.09 0.37 -0.55 0.11 0.22 0.3 0.57 0.31 1.59 -0.8 -0.8 -1.65 0.19 0.34 -0.47 -1.27 -0.69 -0.37 -0.87 -1.26 -2.14 -1.92 0.41 0.09 -0.28 -0.81 0.27 0.72 -0.16 1.68
-1.24 -0.43 -1.12 -0.78 -1.02 -1.27 -1.13 -0.42 -1.17 -1.0 0.65 1.06 1.13 2.06 -4.03 -2.6 -5.23 -0.99 -0.62 -0.57 0.42 0.65 -0.65 -0.32 -0.31 -0.56 -0.87 -0.71 1.16 0.2 -0.22 0.75 0.92 0.77 0.17
0.19 0.24 0.2 0.05 -0.07 0.11 -0.03 0.66 -0.17 0.16 -0.77 -0.44 -0.25 -1.49 -1.53 -1.06 -1.59 -0.27 -0.3 0.74 -0.37 0.34 -0.82 0.94 -1.8 -0.95 -1.15 -0.35 0.68 0.84 0.54 0.79 -0.5 1.27 -0.63
0.19 0.5 0.06 0.38 -0.26 0.31 0.69 -0.41 0.4 0.47 0.33 0.52 -0.61 1.2 -1.53 -1.33 -0.81 -0.44 0.06 0.29 -1.89 -0.61 -2.02 0.36 -1.83 -0.9 -0.82 -0.58 0.07 0.28 -0.46 0.62 0.34 0.94 -0.39
0.05 0.5 -0.27 0.43 -0.38 0.05 0.66 -0.39 0.22 0.36 -0.19 0.06 0.37 -0.86 -0.71 -0.73 -0.47 0.24 0.13 0.11 -1.7 -0.46 -1.52 -0.03 -0.96 -0.47 -0.45 0.32 -0.16 0.41 0.32 0.42 0.14 0.74 0.63
-0.37 0.21 -0.46 0.28 -0.27 -0.05 0.22 -0.36 0.08 0.3 0.43 0.65 0.09 1.74 -1.21 -1.18 -0.7 -1.21 -1.14 0.15 -3.53 -1.93 -2.4 -0.24 -1.38 -0.31 -1.05 -0.83 0.19 -0.42 -0.48 -0.22 0.78 1.81 0.99
0.08 -0.39 -0.43 -0.75 0.35 0.32 -0.86 -0.93 0.34 -0.17 0.68 0.3 -2.09 0.77 -0.13 -1.38 0.5 -1.08 -1.01 -1.56 -0.25 0.19 0.12 0.95 0.71 -0.31 -0.22 -0.46 -0.65 0.51 0.74 0.2 0.19 0.42 -0.11
-0.41 0.21 -0.6 0.13 0.37 0.15 0.63 -1.09 0.51 0.47 0.33 0.48 0.84 1.71 -0.42 -0.96 0.21 -0.45 0.08 0.49 -2.16 -1.1 -1.8 -0.55 -1.6 -0.6 -1.12 0.04 -0.33 -0.43 -0.36 -0.36 0.47 0.27 -0.06
-0.32 0.02 -0.51 0.2 -0.01 -0.07 0.6 -0.9 0.3 0.33 0.36 0.67 0.29 2.06 -1.45 -1.12 -1.9 0.1 -0.2 -0.67 -1.53 -0.5 -0.88 -0.08 -0.29 -2.06 -2.07 -0.02 -0.55 -0.34 -1.05 0.09 0.53 0.77 0.95
-0.87 0.35 -0.11 0.17 -0.72 0.23 0.2 0.47 -0.06 0.23 0.22 1.15 -1.44 0.78 -0.94 -0.71 -1.11 -0.26 0.13 0.49 -0.44 0.96 -0.75 0.09 -1.48 -0.69 -1.27 -0.52 -0.73 0.4 0.84 -1.81 -0.16 1.29 -0.95
0.48 0.02 0.07 -0.69 -0.99 0.34 -0.83 -0.25 0.15 0.54 0.4 0.95 -3.3 1.17 -1.42 -1.76 -1.33 -1.9 -1.11 -1.73 -0.65 -0.02 -1.67 0.71 -1.2 -0.66 0.99 0.75 -0.44 0.5 0.51 -1.03 0.93 0.63 0.71
-0.57 0.06 -0.89 0.23 -0.15 0.03 0.83 -0.44 0.36 0.24 0.09 0.59 0.13 0.19 -1.16 -1.15 -1.85 -0.17 0.14 -0.58 -1.77 -0.83 -1.59 -0.73 -2.61 -0.83 0.18 0.9 -0.36 0.3 -0.51 0.42 0.6 1.13 1.45
-0.48 -0.14 -0.81 -0.2 -0.81 -0.1 -0.16 -0.85 0.11 0.01 1.25 1.65 -2.01 2.23 -1.66 -1.35 -2.62 -0.68 -0.7 -1.76 -0.48 0.62 -0.67 -1.09 -3.57 -2.51 -2.62 -0.48 -1.54 -0.75 -1.21 -0.29 1.6 0.93 1.27
-0.61 -0.29 -0.88 -0.59 -0.03 -0.59 -0.34 0.03 -0.47 -0.31 1.72 1.68 -0.96 1.64 -0.66 -0.99 -0.22 -1.02 -0.81 -1.34 -2.7 -0.8 -2.03 -1.07 -1.71 0.1 -0.02 0.78 0.31 -1.31 -1.06 -1.39 1.5 1.2 -0.75
-0.97 -0.35 -0.42 -0.01 -0.9 -0.57 0.09 -0.03 -0.47 -0.15 -0.35 -0.01 0.27 0.4 -1.39 -0.66 -2.03 -0.19 0.12 1.08 0.13 0.97 -1.0 0.45 -0.78 -1.43 -1.66 -0.81 -0.0 1.22 0.83 0.89 -0.02 0.39 0.54
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-0.72 -0.46 -0.09 -0.17 0.31 -0.06 -0.01 -0.2 0.36 0.39 -0.78 -0.36 -0.09 0.56 -3.4 -3.17 -2.0 -1.75 -3.02 0.41 -1.82 -0.96 -2.38 0.8 0.03 -1.85 -1.9 -0.17 1.42 1.36 0.68 1.63 -0.38 0.35 1.02
-0.09 0.17 -0.04 0.23 -0.17 0.16 0.37 -0.2 0.17 0.27 -0.26 -0.07 -0.49 -0.48 0.23 -0.25 0.22 -0.33 -0.07 -0.26 -0.82 -0.12 -1.12 0.21 -0.8 -1.01 -1.54 -0.15 0.01 0.69 0.71 0.32 0.09 0.89 0.54
-0.87 0.09 -1.69 0.04 -0.35 -0.81 0.99 -0.31 -0.45 -0.39 0.77 0.69 0.8 0.29 -1.31 -1.32 -1.4 -0.4 0.08 -0.8 -5.35 -1.87 -4.91 -0.52 -2.04 -0.27 0.63 1.37 0.17 0.16 -0.84 0.58 0.58 0.76 1.5
-0.2 0.23 -0.57 0.05 1.06 -0.28 0.38 -0.14 -0.19 0.17 -7.3 -7.88 -2.53 - -0.92 -1.63 -1.24 0.29 0.31 0.41 -0.94 0.02 -1.02 0.52 1.35 -1.38 -1.89 1.63 2.05 0.75 -0.22 1.26 -8.48 -5.43 -6.51
-0.73 -0.56 -0.62 -0.33 -0.07 -0.22 0.06 0.1 0.04 -0.06 -0.98 -0.71 0.11 0.28 -2.15 -2.02 -2.36 -0.95 -0.14 -0.15 -0.19 0.76 -1.22 1.47 -1.13 -1.86 -1.11 -0.5 1.25 1.47 0.82 1.52 -0.81 0.11 -0.24
-0.17 -0.58 -0.37 -0.78 0.06 -0.17 -0.66 -0.01 0.11 -0.04 0.51 0.57 -0.96 0.87 -1.33 -1.98 -0.91 -1.28 -1.1 -0.67 -0.87 0.06 -0.42 0.1 -0.31 -0.9 1.01 0.38 -0.11 0.59 0.65 0.23 0.39 0.59 1.31
-0.96 -1.31 1.85 1.74 -2.28 -0.11 0.27 -1.1 0.44 1.13 1.14 1.58 -1.34 2.82 -5.35 -3.21 -2.62 -0.51 -1.65 -0.61 -1.52 -0.04 -0.85 -2.03 -6.73 -8.64 -10.03 -2.6 -0.51 -4.87 -5.72 -4.18 1.48 -2.38 -4.45
-0.03 0.51 0.08 0.66 -0.46 0.11 0.8 0.19 0.57 0.58 0.12 0.26 -0.1 0.11 -0.83 -0.83 -0.76 -0.02 0.52 -1.0 -2.88 -0.64 -2.44 -0.01 -2.62 -0.29 -0.67 -0.74 -0.17 0.22 -0.3 0.28 0.35 1.21 0.62
-0.27 0.12 -0.55 0.26 -0.44 -0.11 0.47 -0.36 0.24 0.13 0.75 1.08 -0.05 1.81 -1.48 -1.18 -1.35 -0.36 -0.18 -0.64 -0.71 0.2 -0.74 -0.42 -1.18 -0.38 -0.7 -1.14 -0.3 -0.06 -0.4 0.15 0.97 0.2 0.27
-0.19 0.4 -0.14 0.5 -0.81 -0.28 0.31 -0.07 -0.3 -0.0 -0.1 0.16 -0.82 0.24 -1.59 -1.36 -2.18 -0.33 -0.07 -0.75 -0.83 -0.01 -0.91 0.28 -0.27 0.77 0.76 0.34 -0.57 0.7 0.64 0.54 0.2 0.51 0.43
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-0.64 -0.53 -0.54 -0.31 -0.53 -0.41 -0.14 -0.54 -0.13 -0.15 0.6 1.03 -1.64 -0.21 -0.77 -0.63 -0.6 -0.42 -0.03 -0.74 -1.64 -0.16 -1.08 0.61 -0.45 -0.61 -0.62 0.21 0.56 0.59 0.27 0.7 1.03 0.68 1.33
-2.51 -1.45 -2.27 -0.88 -1.18 -2.21 0.21 -2.29 -1.21 -0.77 1.26 1.47 1.84 2.08 -3.31 -2.6 -3.27 -1.19 -1.99 -0.06 -3.43 -2.21 -1.99 -2.05 -4.21 -0.24 -0.95 0.4 1.28 -1.67 -2.14 -1.29 1.52 0.91 2.0

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.