1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_109 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
4h after treatment
4h after treatment,No nitrate
8h after treatment
8h after treatment,No nitrate
20C
20h after treatment
20h after treatment,No nitrate
20h after treatment,Nocodazole added
36h after treatment
36h after treatment,No phosphate
Blue light,10min after light change
Blue light,60min after light change
Bohlin
CCAP1055/1,20C
CCAP1055/1,20C,High CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Low CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Normal CO2,OligoDT primed
CCMP2561
CCMP2561 Nitrase Reductase Knockout
CCMP632
CCMP632,24h
CCMP632,48h
CCMP632,72h
CCMP632,High light acclimated WT
CCMP632,Low light acclimated WT
NEPCC640,8h,1000ppmv CO2
NEPCC640,8h,390 ppmv CO2
No light,8h after treatment
Pt-1
Pt-1 8.6
Pt-1 8.6,With nitrogen
Pt-1 8.6,Without nitrogen
Red light,0min before light change
UTEX 646,Blue light
UTEX 646,No light
0.19 0.27 0.42 0.49 0.19 0.27 0.45 0.36 0.27 0.31 0.01 0.01 0.02 0.02 0.22 0.27 0.13 0.5 0.51 0.52 0.97 1.0 0.46 0.42 0.06 0.01 0.0 0.07 0.62 0.4 0.27 0.56 0.01 0.04 0.01
0.28 0.34 0.24 0.33 0.25 0.34 0.35 0.25 0.34 0.39 0.2 0.25 0.08 1.0 0.18 0.32 0.09 0.47 0.39 0.24 0.15 0.23 0.17 0.25 0.12 0.13 0.08 0.17 0.26 0.29 0.23 0.41 0.28 0.25 0.12
0.15 0.19 0.15 0.15 0.11 0.16 0.12 0.29 0.14 0.14 0.34 0.48 0.23 1.0 0.08 0.14 0.1 0.2 0.31 0.1 0.2 0.52 0.1 0.16 0.03 0.05 0.01 0.3 0.08 0.09 0.13 0.08 0.43 0.65 0.45
0.09 0.14 0.14 0.17 0.08 0.13 0.2 0.21 0.14 0.15 0.21 0.24 0.17 1.0 0.04 0.1 0.02 0.13 0.35 0.16 0.37 0.47 0.14 0.15 0.05 0.06 0.05 0.22 0.58 0.22 0.2 0.22 0.23 0.18 0.31
0.22 0.39 0.21 0.38 0.21 0.34 0.44 0.19 0.37 0.33 0.59 0.71 0.1 0.97 0.11 0.21 0.07 0.34 1.0 0.19 0.29 0.44 0.28 0.22 0.06 0.04 0.01 0.21 0.25 0.3 0.21 0.5 0.73 0.72 0.4
0.08 0.16 0.05 0.11 0.11 0.09 0.16 0.07 0.08 0.11 0.27 0.4 0.2 1.0 0.05 0.14 0.06 0.24 0.48 0.08 0.07 0.27 0.09 0.07 0.03 0.11 0.24 0.19 0.11 0.09 0.1 0.14 0.39 0.34 0.36
0.36 0.5 0.37 0.49 0.42 0.45 0.56 0.3 0.55 0.58 0.28 0.37 0.25 0.26 0.22 0.2 0.19 0.3 0.71 0.22 1.0 0.75 0.63 0.81 0.53 0.31 0.78 0.48 0.24 0.74 0.69 0.77 0.34 0.51 0.99
0.51 0.85 0.48 0.75 0.31 0.69 0.8 0.58 0.6 0.7 0.47 0.61 0.29 0.68 0.22 0.34 0.06 0.63 0.87 0.25 0.65 1.0 0.35 0.39 0.09 0.1 0.07 0.42 0.48 0.46 0.29 0.77 0.58 0.75 0.3
0.27 0.42 0.2 0.39 0.16 0.3 0.45 0.23 0.27 0.36 0.43 0.51 0.11 1.0 0.04 0.09 0.0 0.37 0.49 0.07 0.17 0.38 0.11 0.08 0.01 0.04 0.02 0.04 0.26 0.25 0.15 0.33 0.39 0.49 0.32
0.22 0.34 0.16 0.38 0.36 0.27 0.57 0.22 0.47 0.34 0.29 0.32 0.52 0.16 0.16 0.13 0.03 0.36 0.81 0.2 0.62 0.39 0.47 0.26 0.07 0.23 0.13 0.34 0.36 0.16 0.13 0.21 0.43 1.0 0.91
0.08 0.15 0.16 0.19 0.12 0.12 0.19 0.22 0.12 0.15 0.1 0.12 0.2 1.0 0.09 0.09 0.09 0.16 0.52 0.25 0.52 0.52 0.2 0.34 0.14 0.21 0.45 0.08 0.38 0.28 0.25 0.28 0.1 0.15 0.11
0.28 0.61 0.29 0.5 0.3 0.36 0.49 0.54 0.32 0.39 0.39 0.31 0.35 0.39 0.12 0.11 0.05 0.27 0.57 0.35 0.42 0.49 0.53 0.37 0.17 0.38 0.34 0.58 0.16 0.68 1.0 0.42 0.31 0.33 0.5
0.7 0.77 0.55 0.69 0.41 0.79 0.72 0.39 0.79 0.74 0.3 0.43 0.68 0.21 0.4 0.35 0.31 0.69 0.96 0.44 0.35 0.5 0.27 0.31 0.08 0.24 0.24 0.59 0.33 0.33 0.37 0.28 0.39 1.0 0.56
0.09 0.2 0.11 0.18 0.05 0.17 0.25 0.15 0.17 0.18 0.39 0.19 0.05 1.0 0.03 0.08 0.03 0.16 0.45 0.04 0.39 0.42 0.23 0.08 0.01 0.02 0.02 0.64 0.46 0.07 0.06 0.11 0.17 0.18 0.73
0.29 0.62 0.4 0.55 0.21 0.33 0.54 0.57 0.2 0.39 1.0 0.65 0.11 0.34 0.15 0.23 0.12 0.39 0.71 0.3 0.36 0.7 0.14 0.37 0.06 0.19 0.17 0.27 0.81 0.67 0.68 0.71 0.47 0.5 0.45
0.33 0.43 0.39 0.5 0.29 0.42 0.45 0.94 0.32 0.4 0.25 0.28 0.11 0.62 0.32 0.29 0.2 0.52 0.6 0.25 1.0 0.93 0.32 0.33 0.13 0.19 0.1 0.23 0.24 0.29 0.31 0.35 0.28 0.24 0.17
0.12 0.22 0.23 0.36 0.16 0.19 0.4 0.27 0.24 0.23 0.22 0.21 1.0 0.88 0.11 0.13 0.1 0.41 0.59 0.22 0.67 0.57 0.5 0.29 0.11 0.1 0.05 0.14 0.36 0.3 0.17 0.43 0.23 0.56 0.18
0.29 0.41 0.33 0.64 0.29 0.3 0.42 0.68 0.24 0.28 0.39 0.62 0.54 1.0 0.21 0.35 0.31 0.37 0.39 0.19 0.06 0.37 0.06 0.27 0.08 0.2 0.08 0.22 0.33 0.23 0.46 0.16 0.58 0.9 0.28
0.4 0.41 0.39 0.35 0.16 0.41 0.3 0.55 0.28 0.64 0.36 0.29 0.17 1.0 0.14 0.33 0.05 0.3 0.55 0.17 0.23 0.35 0.11 0.42 0.1 0.18 0.66 0.38 0.88 0.49 0.4 0.64 0.27 0.39 0.14
0.09 0.12 0.12 0.12 0.14 0.09 0.21 0.24 0.17 0.17 0.16 0.17 0.3 0.17 0.07 0.08 0.03 0.21 0.63 0.11 0.63 1.0 0.41 0.2 0.04 0.06 0.23 0.11 0.17 0.31 0.17 0.4 0.17 0.35 0.45
0.03 0.08 0.06 0.12 0.05 0.08 0.15 0.13 0.08 0.1 0.08 0.09 0.11 1.0 0.04 0.06 0.09 0.11 0.32 0.09 0.08 0.14 0.04 0.06 0.01 0.04 0.05 0.02 0.11 0.13 0.09 0.18 0.07 0.25 0.2
0.31 0.38 0.36 0.38 0.34 0.39 0.42 0.53 0.36 0.47 0.6 0.74 0.1 0.58 0.18 0.22 0.11 0.49 0.62 0.25 0.39 1.0 0.29 0.19 0.11 0.07 0.04 0.6 0.3 0.38 0.23 0.6 0.69 0.55 0.49
0.23 0.21 0.23 0.21 0.24 0.23 0.21 0.39 0.23 0.19 0.59 0.48 0.12 0.2 0.61 0.65 0.38 0.4 1.0 0.1 0.91 0.94 0.42 0.45 0.44 0.18 0.26 0.87 0.22 0.3 0.29 0.28 0.23 0.78 0.37
0.37 0.49 0.28 0.47 0.33 0.36 0.65 0.26 0.44 0.43 0.79 0.67 0.41 1.0 0.21 0.16 0.16 0.57 0.91 0.26 0.29 0.48 0.28 0.31 0.17 0.13 0.13 0.62 0.34 0.52 0.28 0.78 0.54 0.77 0.46
0.5 0.49 0.43 0.48 0.4 0.54 0.5 0.69 0.43 0.52 0.56 0.63 0.18 0.68 0.35 0.23 0.07 0.66 0.45 0.48 0.94 1.0 0.39 0.41 0.18 0.17 0.18 0.22 0.41 0.59 0.49 0.86 0.57 0.68 0.1
0.08 0.11 0.07 0.09 0.12 0.07 0.11 0.13 0.06 0.11 0.24 0.33 0.02 1.0 0.04 0.08 0.01 0.23 0.2 0.07 0.07 0.12 0.13 0.13 0.03 0.02 0.01 0.03 0.17 0.09 0.07 0.12 0.29 0.23 0.26
0.07 0.26 0.13 0.43 0.11 0.11 0.46 0.24 0.19 0.19 0.48 0.52 0.06 1.0 0.04 0.12 0.02 0.14 0.45 0.06 0.02 0.08 0.04 0.06 0.0 0.01 0.0 0.05 0.05 0.02 0.04 0.01 0.6 0.58 0.28
0.1 0.14 0.16 0.18 0.13 0.17 0.22 0.25 0.12 0.15 0.1 0.14 0.13 0.93 0.08 0.09 0.06 0.17 0.86 0.29 0.51 0.75 0.42 0.22 0.08 0.12 0.24 0.22 1.0 0.39 0.32 0.37 0.14 0.17 0.49
0.27 0.36 0.45 0.58 0.17 0.22 0.48 0.24 0.2 0.24 0.37 0.43 0.11 1.0 0.09 0.15 0.09 0.15 0.27 0.14 0.11 0.47 0.09 0.09 0.02 0.12 0.1 0.24 0.06 0.17 0.11 0.26 0.43 0.51 0.33
0.36 0.58 0.35 0.49 0.32 0.43 0.58 0.36 0.39 0.48 0.12 0.12 0.08 0.19 0.31 0.27 0.3 0.45 0.51 0.32 1.0 0.94 0.36 0.28 0.09 0.18 0.13 0.2 0.37 0.42 0.33 0.62 0.14 0.38 0.09
0.25 0.31 0.23 0.35 0.23 0.3 0.45 0.24 0.29 0.36 0.55 0.68 0.18 1.0 0.22 0.23 0.07 0.46 0.53 0.63 0.15 0.27 0.16 0.31 0.15 0.33 0.37 0.41 0.25 0.36 0.35 0.38 0.62 0.22 0.37
0.36 0.42 0.29 0.41 0.23 0.32 0.49 0.28 0.3 0.36 0.24 0.32 1.0 0.93 0.17 0.1 0.12 0.47 0.33 0.29 0.18 0.2 0.17 0.52 0.3 0.13 0.12 0.33 0.44 0.34 0.18 0.53 0.29 0.2 0.31
0.11 0.14 0.14 0.19 0.15 0.13 0.26 0.18 0.18 0.22 0.11 0.09 0.23 1.0 0.13 0.15 0.17 0.3 0.37 0.43 0.3 0.43 0.34 0.34 0.13 0.04 0.03 0.07 0.4 0.22 0.14 0.31 0.09 0.03 0.01
0.18 0.26 0.21 0.4 0.12 0.16 0.55 0.4 0.27 0.36 0.92 0.39 0.3 1.0 0.1 0.14 0.16 0.42 0.61 0.27 0.22 0.47 0.17 0.33 0.11 0.13 0.35 0.54 0.71 0.38 0.32 0.44 0.3 0.47 0.6
0.06 0.29 0.13 0.51 0.1 0.07 0.63 0.53 0.15 0.2 0.23 0.28 0.18 0.31 0.03 0.16 0.01 0.21 0.58 0.06 0.08 0.18 0.07 0.03 0.0 0.01 0.0 0.12 0.12 0.08 0.03 0.19 0.29 0.2 1.0
0.33 0.69 0.51 0.86 0.34 0.45 0.64 0.61 0.46 0.63 0.22 0.28 0.76 1.0 0.34 0.26 0.31 0.67 0.53 0.33 0.35 0.4 0.5 0.73 0.46 0.26 0.14 0.43 0.52 0.6 0.54 0.74 0.28 0.26 0.59
0.59 0.72 0.57 0.76 0.25 0.59 0.91 0.61 0.57 0.64 0.63 0.77 0.55 0.73 0.17 0.18 0.04 0.51 1.0 0.28 0.75 0.67 0.33 0.32 0.09 0.15 0.21 0.36 0.4 0.44 0.38 0.51 0.79 0.98 0.69
0.52 0.62 0.39 0.55 0.25 0.6 0.63 0.45 0.62 0.64 0.29 0.42 0.55 0.29 0.17 0.24 0.06 0.63 0.69 0.2 0.48 0.55 0.32 0.33 0.12 0.1 0.1 0.06 0.35 0.28 0.33 0.4 0.4 1.0 0.35
0.1 0.34 0.15 0.52 0.32 0.29 0.73 0.37 0.61 0.52 1.0 0.59 0.43 0.82 0.07 0.21 0.06 0.51 0.66 0.25 0.15 0.29 0.22 0.58 0.16 0.04 0.01 0.23 0.31 0.24 0.12 0.56 0.51 0.7 0.72
0.19 0.32 0.27 0.35 0.18 0.27 0.4 0.31 0.28 0.3 0.15 0.17 0.27 0.67 0.26 0.19 0.2 0.41 0.65 0.3 1.0 0.84 0.42 0.67 0.28 0.15 0.18 0.23 0.37 0.4 0.37 0.39 0.16 0.29 0.44
0.37 0.39 0.47 0.43 0.19 0.43 0.38 0.49 0.34 0.47 0.24 0.28 0.49 0.71 0.23 0.59 0.24 0.24 0.46 0.8 0.31 0.58 0.18 0.61 0.16 0.22 0.21 0.45 1.0 0.44 0.53 0.23 0.27 0.5 0.27
0.17 0.31 0.19 0.35 0.2 0.23 0.45 0.29 0.27 0.35 0.43 0.54 0.19 1.0 0.26 0.34 0.37 0.33 0.48 0.11 0.02 0.13 0.03 0.36 0.27 0.11 0.07 0.38 0.25 0.32 0.19 0.45 0.52 0.33 0.29
0.13 0.22 0.19 0.2 0.15 0.13 0.1 0.18 0.1 0.05 0.24 0.24 0.04 0.04 0.34 0.34 0.21 0.13 0.43 0.02 0.23 1.0 0.28 0.11 0.13 0.47 0.52 0.1 0.01 0.3 0.44 0.08 0.06 0.4 0.02
0.6 0.76 0.51 0.6 0.2 0.45 0.55 0.45 0.32 0.43 0.52 0.72 0.33 0.82 0.28 0.52 0.27 0.41 0.44 0.15 0.12 0.62 0.14 0.08 0.01 0.08 0.03 0.2 0.12 0.12 0.13 0.16 0.72 1.0 0.23
0.1 0.16 0.08 0.2 0.05 0.08 0.26 0.08 0.12 0.16 0.26 0.37 0.31 1.0 0.04 0.08 0.01 0.26 0.19 0.06 0.03 0.03 0.02 0.03 0.01 0.01 0.0 0.05 0.08 0.02 0.02 0.02 0.36 0.58 0.28
0.25 0.64 0.25 0.74 0.31 0.43 1.0 0.23 0.79 0.73 0.3 0.34 0.4 0.22 0.07 0.13 0.06 0.29 0.66 0.29 0.12 0.17 0.14 0.19 0.01 0.02 0.0 0.2 0.13 0.1 0.09 0.06 0.29 0.34 0.65
0.02 0.01 0.01 0.01 0.05 0.03 0.02 0.03 0.04 0.03 0.29 0.44 0.6 1.0 0.03 0.01 0.01 0.2 0.06 0.05 0.02 0.02 0.01 0.21 0.02 0.03 0.02 0.04 0.1 0.03 0.05 0.0 0.37 0.13 0.33
0.34 0.41 0.24 0.43 0.28 0.52 0.59 0.4 0.58 0.63 1.0 0.57 0.83 0.52 0.16 0.61 0.05 0.46 0.5 0.38 0.27 0.59 0.26 0.18 0.05 0.12 0.08 0.53 0.67 0.51 0.16 0.76 0.58 0.45 0.37
0.3 0.48 0.25 0.4 0.25 0.31 0.46 0.3 0.37 0.44 0.42 0.52 0.27 1.0 0.07 0.2 0.03 0.33 0.43 0.2 0.27 0.36 0.31 0.22 0.07 0.07 0.04 0.51 0.42 0.19 0.17 0.24 0.56 0.6 0.39
0.25 0.4 0.65 0.75 0.3 0.29 0.45 0.57 0.34 0.35 0.22 0.22 0.21 0.95 0.38 0.49 0.15 0.54 0.82 0.39 0.47 0.36 0.37 0.72 0.54 0.25 0.14 0.57 1.0 0.34 0.23 0.46 0.24 0.17 0.39
0.32 0.36 0.22 0.21 0.27 0.35 0.18 0.32 0.29 0.34 0.21 0.21 0.24 0.35 0.1 0.2 0.13 0.23 0.39 0.23 0.26 0.46 0.18 0.09 0.01 0.06 0.02 0.23 0.28 0.05 0.1 0.04 0.29 1.0 0.35
0.13 0.32 0.13 0.49 0.25 0.18 0.68 0.24 0.22 0.25 0.55 0.66 0.38 1.0 0.13 0.23 0.12 0.36 0.5 0.28 0.07 0.27 0.09 0.19 0.14 0.24 0.17 0.18 0.16 0.2 0.16 0.26 0.6 0.47 0.22
0.44 0.52 0.18 0.32 0.29 0.37 0.44 0.16 0.38 0.36 0.68 0.51 0.29 0.3 0.18 0.17 0.19 0.42 0.68 0.15 0.38 0.57 0.32 0.24 0.11 0.19 0.22 0.36 0.25 0.58 0.21 1.0 0.37 0.68 0.18
0.17 0.16 0.12 0.15 0.11 0.18 0.19 0.09 0.17 0.17 0.35 0.32 0.17 1.0 0.17 0.09 0.16 0.16 0.23 0.07 0.12 0.18 0.1 0.2 0.06 0.05 0.05 0.17 0.07 0.13 0.1 0.14 0.24 0.2 0.3
0.12 0.12 0.11 0.1 0.12 0.11 0.12 0.08 0.08 0.14 0.12 0.15 0.07 1.0 0.09 0.29 0.02 0.24 0.28 0.06 0.04 0.06 0.03 0.15 0.06 0.22 0.1 0.02 0.26 0.19 0.23 0.24 0.15 0.05 0.01
0.08 0.15 0.14 0.16 0.1 0.09 0.13 0.43 0.07 0.1 0.08 0.1 0.16 0.24 0.08 0.1 0.14 0.16 0.5 0.14 0.29 0.4 0.09 0.11 0.02 0.08 0.03 0.08 0.08 0.14 0.22 0.11 0.09 0.32 1.0
0.31 0.38 0.36 0.38 0.34 0.39 0.42 0.53 0.36 0.47 0.6 0.74 0.1 0.58 0.18 0.22 0.11 0.49 0.62 0.25 0.39 1.0 0.29 0.19 0.11 0.07 0.04 0.6 0.3 0.38 0.23 0.6 0.69 0.55 0.49
0.13 0.18 0.1 0.19 0.12 0.13 0.2 0.15 0.16 0.17 0.34 0.47 0.74 1.0 0.07 0.18 0.01 0.47 0.9 0.19 0.28 0.47 0.17 0.14 0.07 0.04 0.03 0.33 0.4 0.26 0.17 0.41 0.47 0.69 0.97
0.11 0.21 0.22 0.28 0.13 0.21 0.29 0.36 0.17 0.22 0.19 0.21 0.25 0.94 0.11 0.1 0.11 0.22 0.81 0.21 1.0 0.79 0.25 0.48 0.22 0.2 0.33 0.16 0.4 0.39 0.31 0.42 0.21 0.39 0.27
0.39 0.51 0.32 0.46 0.38 0.42 0.55 0.34 0.46 0.46 0.42 0.54 0.37 1.0 0.18 0.19 0.18 0.51 0.7 0.19 0.52 0.74 0.5 0.44 0.15 0.12 0.09 0.6 0.37 0.51 0.34 0.6 0.5 0.44 0.51

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)