1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_108 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
4h after treatment
4h after treatment,No nitrate
8h after treatment
8h after treatment,No nitrate
20C
20h after treatment
20h after treatment,No nitrate
20h after treatment,Nocodazole added
36h after treatment
36h after treatment,No phosphate
Blue light,10min after light change
Blue light,60min after light change
Bohlin
CCAP1055/1,20C
CCAP1055/1,20C,High CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Low CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Normal CO2,OligoDT primed
CCMP2561
CCMP2561 Nitrase Reductase Knockout
CCMP632
CCMP632,24h
CCMP632,48h
CCMP632,72h
CCMP632,High light acclimated WT
CCMP632,Low light acclimated WT
NEPCC640,8h,1000ppmv CO2
NEPCC640,8h,390 ppmv CO2
No light,8h after treatment
Pt-1
Pt-1 8.6
Pt-1 8.6,With nitrogen
Pt-1 8.6,Without nitrogen
Red light,0min before light change
UTEX 646,Blue light
UTEX 646,No light
0.22 0.35 0.22 0.37 0.22 0.22 0.43 0.16 0.27 0.31 0.04 0.05 0.61 0.03 0.17 0.23 0.11 0.38 0.5 0.41 0.67 0.88 0.5 0.64 0.44 0.1 0.09 0.3 0.23 0.72 0.42 1.0 0.05 0.06 0.06
0.73 0.62 0.85 0.72 0.52 0.76 0.65 0.53 1.0 0.86 0.28 0.36 0.19 0.15 0.49 0.42 0.38 0.43 0.56 0.52 0.53 0.42 0.33 0.43 0.22 0.23 0.18 0.34 0.38 0.25 0.29 0.2 0.38 0.51 0.51
0.11 0.44 0.08 0.56 0.27 0.19 0.97 0.08 0.47 0.34 0.1 0.11 0.38 0.55 0.04 0.1 0.04 0.27 0.22 0.48 0.19 0.17 0.25 0.06 0.25 0.16 0.11 1.0 0.25 0.13 0.06 0.27 0.08 0.21 0.52
0.4 0.57 0.53 0.68 0.16 0.49 0.73 0.24 0.72 1.0 0.01 0.01 0.64 0.02 0.05 0.14 0.1 0.33 0.67 0.81 0.4 0.42 0.32 0.2 0.06 0.13 0.1 0.39 0.58 0.2 0.16 0.27 0.01 0.0 0.0
0.54 0.69 0.58 0.73 0.45 0.9 0.95 0.5 1.0 0.95 0.16 0.21 0.25 0.21 0.35 0.3 0.36 0.32 0.43 0.46 0.98 0.67 0.7 0.41 0.23 0.32 0.24 0.46 0.34 0.33 0.27 0.48 0.23 0.35 0.29
0.55 0.72 0.63 0.79 0.26 0.6 1.0 0.29 0.6 0.73 0.37 0.39 0.22 0.13 0.26 0.19 0.33 0.25 0.24 0.27 0.14 0.23 0.15 0.33 0.08 0.26 0.13 0.16 0.2 0.31 0.52 0.15 0.61 0.32 0.03
0.81 0.95 0.7 0.74 0.58 0.96 0.69 1.0 0.85 0.71 0.24 0.31 0.24 0.39 0.31 0.15 0.23 0.29 0.32 0.21 0.73 0.75 0.54 0.51 0.31 0.57 0.45 0.72 0.28 0.35 0.43 0.26 0.31 0.45 0.41
0.26 0.12 0.17 0.09 0.28 0.2 0.14 0.15 0.23 0.17 0.57 0.55 0.21 0.51 0.25 0.11 0.29 0.09 0.08 0.83 0.96 1.0 0.75 0.48 0.19 0.35 0.29 0.2 0.29 0.04 0.03 0.03 0.73 0.38 0.59
0.5 0.56 0.47 0.52 0.37 0.59 0.54 1.0 0.55 0.57 0.18 0.22 0.17 0.15 0.29 0.28 0.07 0.3 0.35 0.19 0.58 0.5 0.32 0.52 0.25 0.42 0.2 0.51 0.25 0.26 0.44 0.2 0.21 0.33 0.41
0.73 1.0 0.61 0.79 0.91 0.81 0.91 0.69 0.88 0.94 0.59 0.72 0.55 0.32 0.28 0.32 0.26 0.37 0.4 0.54 0.38 0.76 0.44 0.46 0.25 0.58 0.5 0.83 0.42 0.44 0.65 0.38 0.58 0.62 0.23
0.32 0.34 0.31 0.27 0.42 0.38 0.35 0.35 0.42 0.42 0.3 0.37 0.21 0.21 0.21 0.13 0.26 0.19 0.15 0.59 1.0 0.96 0.87 0.48 0.2 0.59 0.83 0.23 0.19 0.44 0.4 0.42 0.35 0.37 0.29
0.66 0.66 0.51 0.59 0.64 0.73 0.71 0.36 0.76 0.64 0.24 0.27 0.19 0.18 0.38 0.19 0.54 0.23 0.28 0.26 0.39 0.48 0.26 0.88 0.68 0.36 1.0 0.76 0.19 0.49 0.53 0.41 0.27 0.31 0.25
0.6 0.66 0.49 0.71 0.32 0.72 0.72 0.39 0.79 0.72 0.26 0.35 0.17 0.07 0.2 0.19 0.09 0.32 0.42 0.16 0.42 0.37 0.22 0.26 0.16 0.46 1.0 0.79 0.26 0.31 0.36 0.21 0.33 0.3 0.34
0.44 1.0 0.33 0.74 0.37 0.43 1.0 0.2 0.4 0.56 0.34 0.4 0.34 0.17 0.09 0.08 0.1 0.21 0.2 0.31 0.24 0.25 0.17 0.22 0.1 0.18 0.14 0.14 0.25 0.3 0.28 0.39 0.35 0.57 0.3
0.38 0.42 0.39 0.4 0.51 0.73 0.48 0.64 1.0 0.76 0.19 0.16 0.16 0.08 0.23 0.34 0.07 0.34 0.43 0.29 0.49 0.32 0.41 0.5 0.36 0.6 0.78 0.24 0.29 0.46 0.72 0.12 0.19 0.2 0.13
0.27 0.14 0.2 0.14 0.16 0.25 0.13 0.13 0.22 0.21 0.06 0.06 0.12 0.03 0.71 0.27 1.0 0.19 0.14 0.18 0.21 0.26 0.21 0.15 0.03 0.32 0.25 0.05 0.11 0.1 0.13 0.03 0.08 0.17 0.03
0.77 0.95 0.73 0.8 0.72 0.91 0.64 0.54 1.0 0.98 0.84 0.85 0.43 0.36 0.61 0.41 0.4 0.56 0.53 0.39 0.36 0.75 0.42 0.77 0.32 0.78 0.41 0.48 0.47 0.55 0.57 0.46 0.85 0.96 0.6
0.39 0.32 0.41 0.32 0.49 0.38 0.16 0.22 0.41 0.34 0.42 0.51 0.51 0.19 0.24 0.12 0.27 0.18 0.21 0.34 0.36 0.56 0.29 0.44 0.19 0.29 0.21 0.44 0.22 0.34 0.39 0.24 0.46 1.0 0.72
0.25 0.39 0.34 0.43 0.34 0.4 0.41 1.0 0.48 0.54 0.3 0.29 0.18 0.28 0.22 0.29 0.29 0.24 0.23 0.47 0.73 0.83 0.46 0.21 0.11 0.37 0.22 0.48 0.2 0.3 0.31 0.31 0.32 0.23 0.6
1.0 0.92 0.84 0.83 0.16 0.72 0.54 0.38 0.6 0.7 0.3 0.45 0.04 0.23 0.79 0.43 0.24 0.44 0.38 0.08 0.2 0.37 0.19 0.2 0.05 0.18 0.1 0.96 0.06 0.22 0.3 0.09 0.48 0.42 0.68
0.93 0.96 0.76 0.73 0.83 1.0 0.57 0.59 0.87 0.91 0.52 0.56 0.12 0.18 0.77 0.64 0.54 0.5 0.45 0.14 0.82 0.87 0.85 0.27 0.16 0.15 0.18 0.77 0.08 0.34 0.27 0.47 0.51 0.52 0.07
0.8 0.74 0.77 0.53 0.68 1.0 0.45 0.53 0.82 0.78 0.34 0.51 0.05 0.17 0.7 0.39 0.87 0.51 0.46 0.1 0.61 0.67 0.42 0.51 0.19 0.19 0.15 0.49 0.09 0.57 0.67 0.45 0.47 0.29 0.12
0.66 0.64 0.59 0.63 0.53 0.68 0.61 0.4 0.58 0.68 0.31 0.3 0.24 0.52 0.45 0.24 0.24 0.39 0.28 0.84 0.9 0.87 1.0 0.7 0.64 0.32 0.22 0.7 0.31 0.44 0.4 0.57 0.29 0.51 0.73
0.4 0.12 0.33 0.1 0.49 1.0 0.24 0.24 0.78 0.68 0.25 0.15 0.09 0.07 0.34 0.11 0.1 0.25 0.41 0.28 0.14 0.22 0.08 0.39 0.29 0.27 0.37 0.02 0.28 0.33 0.5 0.18 0.1 0.33 0.01
0.31 0.35 0.25 0.39 0.42 0.39 0.49 0.27 0.58 0.47 0.35 0.38 0.49 0.42 0.1 0.15 0.04 0.28 0.23 0.41 0.66 0.53 0.73 0.74 0.9 0.34 0.32 0.39 0.4 0.7 0.54 1.0 0.46 0.74 0.36
0.23 0.51 0.28 0.66 0.29 0.43 1.0 0.28 0.6 0.54 0.19 0.18 0.26 0.32 0.07 0.14 0.02 0.29 0.3 0.26 0.35 0.26 0.35 0.39 0.39 0.26 0.2 0.41 0.33 0.32 0.28 0.38 0.2 0.32 0.63
0.24 0.27 0.15 0.21 0.46 0.22 0.26 0.16 0.23 0.22 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.33 0.4 0.46 0.43 0.26 0.1 0.28 0.19 0.18 0.13 0.46 0.27 0.75 0.0 0.0 0.0
0.31 0.65 0.49 0.86 0.34 0.72 0.86 0.95 0.89 0.84 0.18 0.14 0.62 0.19 0.41 0.8 0.35 0.53 0.64 0.53 0.65 0.52 0.33 1.0 0.42 0.35 0.21 0.13 0.6 0.56 0.6 0.52 0.15 0.5 0.73
0.44 0.19 0.28 0.13 0.32 0.34 0.14 0.19 0.28 0.22 0.32 0.34 0.2 0.08 0.32 0.11 0.5 0.11 0.09 0.19 0.92 0.42 0.7 0.2 0.29 0.29 0.2 0.81 0.23 0.14 0.1 0.19 0.38 0.25 1.0
0.27 0.99 0.36 0.5 0.36 0.41 0.79 0.14 0.56 0.98 0.27 0.49 0.03 0.21 0.03 0.0 0.0 0.06 0.03 0.13 0.57 1.0 0.2 0.05 0.0 0.04 0.04 0.31 0.07 0.03 0.04 0.0 0.48 0.0 0.0
0.76 0.9 0.7 0.81 0.86 0.88 0.8 0.7 0.79 0.97 0.55 0.57 0.27 0.46 0.79 0.54 0.64 0.61 0.43 1.0 0.47 0.79 0.45 0.46 0.26 0.56 0.44 0.64 0.39 0.63 0.54 0.75 0.49 0.73 0.43
0.57 0.94 0.61 0.85 0.45 0.8 0.96 0.46 0.84 0.9 0.07 0.09 0.27 0.19 0.22 0.18 0.2 0.29 0.32 0.35 0.2 0.13 0.11 0.32 0.16 0.93 0.5 0.79 0.33 0.44 0.48 0.41 0.09 0.28 1.0
0.11 0.27 0.1 0.32 0.09 0.25 0.59 0.11 0.35 0.45 0.1 0.12 1.0 0.07 0.06 0.1 0.09 0.19 0.24 0.47 0.19 0.15 0.14 0.04 0.01 0.06 0.02 0.1 0.1 0.14 0.05 0.19 0.13 0.04 0.08
0.75 0.77 0.52 0.68 0.6 0.89 0.7 0.34 1.0 0.89 0.24 0.29 0.23 0.1 0.36 0.2 0.15 0.32 0.32 0.18 0.43 0.58 0.32 0.37 0.07 0.24 0.15 0.79 0.19 0.28 0.28 0.2 0.32 0.68 0.51
0.55 0.81 0.68 0.74 0.59 0.67 0.64 0.4 0.76 0.78 0.21 0.24 0.28 0.44 0.3 0.25 0.73 0.33 0.28 0.27 0.67 0.48 0.57 1.0 0.75 0.42 0.27 0.34 0.24 0.52 0.7 0.46 0.25 0.47 0.54
0.74 0.61 0.51 0.49 0.53 0.75 0.44 0.38 0.79 0.77 0.29 0.44 0.28 0.21 0.53 0.35 0.24 0.51 0.42 0.21 0.61 0.57 0.43 0.46 0.16 0.34 0.32 0.9 0.41 0.41 0.39 0.38 0.33 1.0 0.81
0.08 0.1 0.11 0.13 0.41 0.09 0.19 0.11 0.22 0.2 0.0 0.0 0.87 0.0 0.03 0.04 0.02 0.17 0.11 0.5 0.82 0.39 1.0 0.16 0.15 0.3 0.12 0.11 0.43 0.14 0.07 0.25 0.0 0.0 0.0
0.23 0.39 0.24 0.47 0.28 0.27 0.88 0.25 0.38 0.39 0.1 0.13 0.38 0.37 0.1 0.09 0.08 0.31 0.24 0.47 0.4 0.47 0.24 0.39 0.22 0.15 0.08 0.26 0.51 0.51 0.24 1.0 0.13 0.16 0.07
0.97 0.94 0.99 0.81 0.56 0.79 0.71 0.53 0.88 0.87 0.29 0.27 0.17 0.24 0.49 0.43 0.52 0.48 0.36 0.27 0.54 0.92 0.43 0.55 0.13 0.21 0.17 1.0 0.29 0.35 0.49 0.26 0.4 0.57 0.16
0.64 0.61 0.66 0.53 0.65 0.77 0.46 0.41 0.66 0.65 0.45 0.54 0.25 0.39 0.69 0.29 1.0 0.34 0.23 0.48 0.22 0.38 0.18 0.55 0.41 0.37 0.29 0.77 0.22 0.23 0.21 0.3 0.5 0.43 0.5
0.75 0.76 0.49 0.62 0.41 0.78 0.88 0.43 0.74 0.76 0.15 0.15 0.25 0.18 0.22 0.12 0.26 0.37 0.39 0.45 0.4 0.4 0.33 0.58 0.38 0.44 0.61 0.73 0.37 0.45 0.33 0.65 0.11 0.63 1.0
0.5 0.68 0.55 0.64 0.74 0.87 0.76 0.41 1.0 0.92 0.32 0.33 0.38 0.65 0.25 0.25 0.3 0.43 0.27 0.18 0.89 0.74 0.71 0.65 0.31 0.29 0.19 0.51 0.36 0.45 0.39 0.59 0.3 0.12 0.14
0.36 0.5 0.3 0.48 0.37 0.44 0.63 0.31 0.42 0.49 0.01 0.01 0.7 0.01 0.16 0.17 0.07 0.35 0.44 0.24 0.42 0.71 0.41 0.33 0.23 0.31 0.34 0.4 0.33 0.72 0.41 1.0 0.01 0.03 0.03
0.36 0.79 0.33 0.5 0.49 0.62 0.58 0.3 0.52 0.52 0.39 0.37 0.18 0.4 0.45 0.24 1.0 0.18 0.19 0.28 0.49 0.76 0.26 0.21 0.03 0.42 0.34 0.25 0.13 0.2 0.28 0.07 0.45 0.11 0.11
0.38 0.33 0.48 0.4 0.12 0.27 0.2 0.3 0.54 0.38 0.64 0.19 0.19 0.13 0.15 0.16 0.17 0.32 0.35 0.5 0.04 0.11 0.02 0.5 0.3 0.18 0.16 0.56 0.23 0.25 0.41 0.2 0.19 1.0 0.78
0.14 0.07 0.15 0.09 0.17 0.26 0.13 0.11 0.31 0.36 0.04 0.04 0.22 0.03 0.05 0.1 0.06 0.08 0.05 0.58 0.43 0.3 1.0 0.18 0.2 0.07 0.05 0.21 0.78 0.02 0.03 0.01 0.05 0.03 0.07
0.58 0.5 0.5 0.52 0.41 0.57 0.54 1.0 0.62 0.56 0.2 0.22 0.38 0.35 0.26 0.17 0.45 0.17 0.2 0.34 0.27 0.51 0.24 0.4 0.17 0.29 0.29 0.57 0.15 0.4 0.34 0.41 0.24 0.25 0.35
0.72 0.53 0.45 0.4 1.0 0.7 0.43 0.43 0.59 0.58 0.7 0.65 0.8 0.1 0.42 0.19 0.39 0.44 0.49 0.43 0.23 0.29 0.18 0.5 0.24 0.37 0.28 0.78 0.45 0.49 0.59 0.37 0.69 0.74 0.39
0.61 0.67 0.59 0.63 0.63 0.67 0.64 0.46 0.69 0.75 0.55 0.63 0.29 0.46 0.54 0.37 1.0 0.5 0.46 0.73 0.35 0.53 0.33 0.42 0.33 0.56 0.34 0.55 0.23 0.51 0.48 0.58 0.55 0.48 0.3
0.36 0.42 0.28 0.36 0.37 0.42 0.39 0.29 0.43 0.47 0.53 0.57 0.31 0.5 0.26 0.11 0.18 0.22 0.17 0.31 0.68 1.0 0.51 0.38 0.13 0.28 0.2 0.46 0.28 0.19 0.2 0.11 0.67 0.35 0.65
0.76 0.57 0.6 0.34 0.28 0.51 0.33 0.33 0.37 0.44 0.37 0.49 0.13 0.11 0.78 0.23 1.0 0.42 0.36 0.19 0.41 0.41 0.27 0.31 0.33 0.23 0.3 0.75 0.13 0.18 0.23 0.18 0.43 0.46 0.01
0.42 0.94 0.5 0.88 0.4 0.59 0.98 1.0 0.57 0.77 0.26 0.29 0.62 0.64 0.2 0.27 0.22 0.41 0.38 0.73 0.46 0.43 0.24 0.44 0.24 0.6 0.34 0.43 0.49 0.74 0.63 0.93 0.3 0.46 0.56
0.43 0.55 0.4 0.53 0.34 0.55 0.65 0.3 0.66 0.64 0.21 0.22 0.41 0.14 0.09 0.13 0.01 0.35 0.4 0.18 0.46 0.32 0.25 0.42 0.23 0.22 0.2 0.33 0.37 0.49 0.35 0.57 0.27 0.28 1.0
0.68 0.62 0.76 0.52 0.45 0.95 0.63 0.79 1.0 0.86 0.22 0.18 0.07 0.09 0.46 0.31 0.17 0.35 0.29 0.2 0.67 0.72 0.31 0.37 0.07 0.27 0.16 0.18 0.16 0.17 0.26 0.08 0.26 0.06 0.02
0.8 0.99 0.76 0.85 0.55 0.87 0.87 0.45 0.84 1.0 0.62 0.65 0.17 0.88 0.27 0.15 0.32 0.33 0.31 0.66 0.31 0.74 0.34 0.37 0.19 0.38 0.3 0.69 0.2 0.66 0.58 0.81 0.65 0.47 0.23
0.6 0.61 0.59 0.56 0.65 0.59 0.55 0.76 0.53 0.62 0.51 0.53 0.19 0.66 0.47 0.31 0.54 0.38 0.33 0.42 0.6 0.72 0.62 0.59 0.43 0.37 0.29 0.49 0.32 0.85 0.67 1.0 0.49 0.44 0.16
0.28 0.36 0.38 0.32 0.64 0.78 0.32 0.48 0.65 0.53 0.3 0.2 0.29 0.16 0.44 0.25 0.41 0.18 0.17 0.57 1.0 0.76 1.0 0.24 0.2 0.51 0.21 0.39 0.28 0.1 0.24 0.03 0.38 0.09 0.19
0.58 0.75 0.54 0.58 0.6 0.59 0.58 0.27 0.58 0.55 0.4 0.57 0.35 0.37 0.16 0.1 0.31 0.23 0.21 0.25 0.17 0.54 0.15 0.28 0.09 0.21 0.13 0.46 0.2 0.34 0.36 0.46 0.54 1.0 0.6
0.55 0.6 0.66 0.64 0.52 0.77 0.76 0.58 0.85 0.77 0.66 0.59 0.18 0.54 0.27 0.1 0.28 0.19 0.18 0.16 0.85 1.0 0.85 0.34 0.19 0.38 0.33 0.43 0.21 0.25 0.26 0.28 0.67 0.28 0.1
0.28 0.6 0.46 0.85 0.24 0.57 1.0 0.47 0.69 0.76 0.13 0.14 0.35 0.18 0.25 0.29 0.28 0.38 0.43 0.81 0.48 0.31 0.25 0.55 0.26 0.21 0.14 0.23 0.62 0.45 0.42 0.46 0.15 0.48 0.72
1.0 0.59 0.46 0.2 0.4 0.77 0.19 0.42 0.52 0.53 0.37 0.24 0.07 0.01 0.36 0.17 0.21 0.19 0.18 0.06 0.21 0.34 0.14 0.26 0.12 0.11 0.12 0.58 0.08 0.16 0.26 0.04 0.24 0.13 0.15
0.58 0.41 0.4 0.37 0.36 0.69 0.47 0.3 1.0 0.86 0.21 0.23 0.12 0.12 0.28 0.29 0.07 0.29 0.19 0.22 0.39 0.36 0.49 0.35 0.1 0.1 0.08 0.34 0.16 0.08 0.1 0.07 0.28 0.2 0.03
0.65 0.89 0.56 0.61 0.67 0.86 0.82 0.4 0.89 0.64 0.58 0.44 0.43 0.45 0.4 0.27 0.56 0.47 0.36 0.29 0.09 0.18 0.13 0.76 0.57 0.29 0.46 0.44 0.57 0.26 0.49 0.13 0.33 1.0 0.27

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)