Heatmap: Cluster_101 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	4h after treatment	4h after treatment,No nitrate	8h after treatment	8h after treatment,No nitrate	20C	20h after treatment	20h after treatment,No nitrate	20h after treatment,Nocodazole added	36h after treatment	36h after treatment,No phosphate	Blue light,10min after light change	Blue light,60min after light change	Bohlin	CCAP1055/1,20C	CCAP1055/1,20C,High CO2,OligoDT primed	CCAP1055/1,20C,Low CO2,OligoDT primed	CCAP1055/1,20C,Normal CO2,OligoDT primed	CCMP2561	CCMP2561 Nitrase Reductase Knockout	CCMP632	CCMP632,24h	CCMP632,48h	CCMP632,72h	CCMP632,High light acclimated WT	CCMP632,Low light acclimated WT	NEPCC640,8h,1000ppmv CO2	NEPCC640,8h,390 ppmv CO2	No light,8h after treatment	Pt-1	Pt-1 8.6	Pt-1 8.6,With nitrogen	Pt-1 8.6,Without nitrogen	Red light,0min before light change	UTEX 646,Blue light	UTEX 646,No light
PTI_00G01180.1	0.3	0.62	0.32	0.7	0.25	0.4	1.0	0.43	0.58	0.62	0.24	0.28	0.46	0.44	0.14	0.28	0.1	0.57	0.86	0.36	0.81	0.75	0.42	0.36	0.22	0.18	0.16	0.57	0.59	0.57	0.42	0.73	0.26	0.38	0.73
PTI_00G01350.1	0.28	0.28	0.19	0.24	0.18	0.32	0.36	0.2	0.32	0.32	0.24	0.24	0.08	0.51	0.2	0.14	0.05	0.43	0.4	0.17	0.27	0.24	0.28	0.35	0.22	0.03	0.12	0.1	0.13	0.25	0.22	0.25	0.3	0.41	1.0
PTI_01G03950.1	0.31	0.42	0.33	0.49	0.16	0.24	0.4	0.37	0.33	0.44	0.48	0.52	0.24	0.55	0.33	0.45	0.23	0.81	1.0	0.23	0.82	0.65	0.36	0.33	0.13	0.16	0.13	0.38	0.5	0.56	0.24	0.89	0.4	0.5	0.43
PTI_01G06080.1	0.63	0.63	0.48	0.6	0.44	0.64	0.69	0.57	0.72	0.73	0.39	0.37	0.5	0.32	0.38	0.41	0.09	0.74	0.93	0.44	0.86	0.55	0.57	0.54	0.25	0.3	0.22	1.0	0.44	0.48	0.37	0.59	0.37	0.67	0.86
PTI_01G07060.1	0.6	0.69	0.46	0.73	0.55	0.62	0.74	0.51	0.64	0.68	0.41	0.53	0.43	0.55	0.48	0.39	0.31	0.74	1.0	0.5	0.97	0.72	0.98	0.78	0.73	0.23	0.47	0.63	0.51	0.72	0.46	0.87	0.49	0.62	0.99
PTI_01G09080.1	0.42	0.54	0.31	0.47	0.29	0.45	0.56	0.33	0.44	0.55	0.38	0.36	0.15	0.17	0.2	0.21	0.13	0.53	0.59	0.09	0.59	0.52	0.36	0.21	0.1	0.18	0.85	0.98	0.16	0.27	0.13	0.35	0.36	0.51	1.0
PTI_01G09690.1	0.18	0.24	0.15	0.22	0.2	0.2	0.22	0.21	0.25	0.29	0.39	0.26	0.12	0.33	0.17	0.21	0.07	0.54	0.71	0.1	0.2	0.3	0.12	0.2	0.05	0.07	0.1	0.41	0.22	0.27	0.13	0.3	0.25	0.56	1.0
PTI_02G00880.1	0.37	0.38	0.33	0.44	0.13	0.42	0.29	0.66	0.52	0.65	0.0	0.0	0.0	0.08	0.08	0.26	0.02	0.44	0.7	0.15	0.01	0.03	0.0	0.34	0.2	0.0	0.0	0.49	0.64	0.6	1.0	0.16	0.0	0.0	0.0
PTI_02G01240.1	0.35	0.42	0.39	0.39	0.19	0.64	0.38	0.94	1.0	0.7	0.09	0.07	0.44	0.1	0.13	0.45	0.05	0.38	0.67	0.51	0.08	0.2	0.1	0.45	0.15	0.34	0.18	0.18	0.8	0.5	0.82	0.1	0.07	0.29	0.04
PTI_02G01250.1	0.45	0.51	0.5	0.44	0.75	0.36	0.31	0.39	0.42	0.48	0.68	0.45	0.58	0.22	0.19	0.31	0.16	0.47	1.0	0.63	0.46	0.93	0.73	0.33	0.18	0.26	0.25	0.85	0.6	0.54	0.52	0.17	0.56	0.77	0.58
PTI_02G06560.1	0.44	0.55	0.32	0.53	0.47	0.44	0.61	0.42	0.5	0.54	0.23	0.31	0.59	0.28	0.42	0.4	0.15	0.73	0.95	0.36	1.0	0.71	0.68	0.32	0.27	0.26	0.17	0.76	0.3	0.48	0.34	0.68	0.27	0.58	0.83
PTI_02G06890.1	0.16	0.33	0.16	0.38	0.23	0.23	0.55	0.2	0.29	0.33	0.11	0.17	0.22	0.39	0.22	0.33	0.16	0.56	1.0	0.45	0.82	0.53	0.51	0.42	0.24	0.1	0.13	0.51	0.33	0.57	0.31	0.87	0.14	0.27	0.56
PTI_03G00730.1	0.26	0.29	0.21	0.3	0.29	0.37	0.33	0.28	0.34	0.41	0.46	0.47	0.6	0.25	0.65	0.62	0.34	0.86	0.79	0.37	0.58	0.64	0.51	0.36	0.24	0.17	0.05	0.59	0.51	0.43	0.27	0.66	0.46	1.0	0.61
PTI_03G01950.1	0.3	0.42	0.24	0.48	0.22	0.4	0.64	0.28	0.43	0.44	0.26	0.33	0.84	0.46	0.16	0.15	0.09	0.62	0.87	0.22	0.25	0.3	0.23	0.46	0.22	0.14	0.15	0.14	0.24	0.65	0.34	1.0	0.34	0.36	0.21
PTI_03G03050.1	0.34	0.3	0.24	0.27	0.36	0.44	0.35	0.21	0.46	0.39	0.1	0.11	0.28	0.18	0.69	0.34	0.47	0.63	0.86	0.27	0.99	0.59	1.0	0.52	0.58	0.28	0.18	0.32	0.29	0.28	0.2	0.41	0.12	0.4	0.55
PTI_03G03220.1	0.23	0.48	0.27	0.59	0.19	0.4	1.0	0.34	0.57	0.61	0.21	0.24	0.47	0.45	0.11	0.22	0.07	0.69	0.94	0.3	0.66	0.54	0.38	0.39	0.12	0.08	0.04	0.31	0.37	0.45	0.21	0.7	0.24	0.34	0.58
PTI_04G01090.1	0.31	0.45	0.24	0.41	0.26	0.43	0.63	0.25	0.46	0.5	0.49	0.42	0.19	0.37	0.22	0.2	0.08	0.46	0.57	0.19	0.5	0.56	0.46	0.2	0.1	0.09	0.07	1.0	0.2	0.3	0.15	0.48	0.42	0.46	0.7
PTI_04G02710.1	0.26	0.33	0.13	0.29	0.33	0.26	0.47	0.16	0.31	0.3	0.2	0.28	0.3	0.57	0.16	0.16	0.16	0.64	0.67	0.17	0.49	0.33	0.35	0.22	0.15	0.08	0.05	0.36	0.19	0.54	0.14	1.0	0.24	0.36	0.52
PTI_04G03560.1	0.37	0.35	0.25	0.31	0.19	0.37	0.32	0.22	0.37	0.38	0.22	0.24	0.17	0.12	0.39	0.41	0.09	0.48	0.72	0.2	0.31	0.34	0.19	0.39	0.22	0.17	0.2	0.38	0.22	0.43	0.38	0.45	0.23	0.46	1.0
PTI_04G04410.1	0.33	0.45	0.27	0.42	0.23	0.3	0.52	0.27	0.32	0.27	0.14	0.19	0.32	0.2	0.26	0.28	0.12	0.57	0.67	0.16	0.5	0.41	0.38	0.3	0.19	0.09	0.08	0.56	0.26	0.45	0.22	0.67	0.19	0.43	1.0
PTI_04G04920.1	0.36	0.41	0.31	0.43	0.49	0.37	0.42	0.32	0.37	0.38	0.34	0.37	0.22	0.32	0.22	0.25	0.13	0.59	0.77	0.41	0.39	0.56	0.46	0.57	0.34	0.3	0.35	0.71	0.36	0.71	0.46	0.96	0.39	0.36	1.0
PTI_06G00060.1	0.41	0.48	0.39	0.42	0.28	0.49	0.41	0.39	0.49	0.48	0.42	0.45	0.35	0.66	0.79	0.64	0.43	0.57	0.92	0.24	0.39	0.42	0.27	0.76	0.27	0.37	0.19	0.68	0.26	0.47	0.48	0.34	0.47	1.0	0.99
PTI_06G02130.1	0.45	0.66	0.4	0.75	0.37	0.56	1.0	0.31	0.61	0.6	0.24	0.32	0.32	0.35	0.22	0.28	0.09	0.62	0.7	0.27	0.62	0.5	0.39	0.73	0.21	0.23	0.15	0.38	0.18	0.51	0.34	0.72	0.28	0.65	0.82
PTI_06G03070.1	0.27	0.35	0.24	0.29	0.19	0.28	0.33	0.19	0.3	0.37	0.44	0.48	0.14	0.18	0.18	0.21	0.07	0.43	0.45	0.12	0.26	0.4	0.17	0.31	0.16	0.1	0.1	0.39	0.14	0.28	0.17	0.29	0.42	0.54	1.0
PTI_07G03340.1	0.73	0.75	0.62	0.79	0.48	1.0	0.93	0.54	0.98	0.7	0.58	0.62	0.42	0.28	0.4	0.55	0.13	0.7	0.86	0.43	0.65	0.77	0.54	0.48	0.23	0.39	0.34	0.68	0.46	0.69	0.84	0.45	0.6	0.59	0.41
PTI_08G01060.1	0.21	0.45	0.36	0.57	0.18	0.41	0.59	0.55	0.46	0.49	0.13	0.15	0.55	0.32	0.11	0.13	0.19	0.37	1.0	0.11	0.22	0.19	0.13	0.43	0.35	0.32	0.3	0.4	0.28	0.7	0.61	0.8	0.14	0.16	0.51
PTI_08G02180.1	0.27	0.34	0.3	0.48	0.19	0.34	0.55	0.39	0.43	0.44	0.21	0.3	0.19	0.62	0.21	0.25	0.08	0.5	0.6	0.21	0.33	0.35	0.21	0.35	0.1	0.09	0.09	0.3	0.23	0.24	0.13	0.3	0.3	0.54	1.0
PTI_08G02570.1	0.45	0.57	0.38	0.66	0.29	0.5	0.75	0.32	0.46	0.49	0.34	0.45	0.11	0.86	0.35	0.33	0.05	0.6	0.56	0.26	0.49	0.68	0.34	0.2	0.03	0.1	0.05	0.31	0.14	0.32	0.14	0.5	0.45	0.73	1.0
PTI_10G01500.1	0.34	0.46	0.34	0.55	0.34	0.41	0.67	0.38	0.49	0.55	0.25	0.35	0.58	0.44	0.23	0.18	0.22	0.62	0.9	0.25	0.73	0.53	0.5	0.52	0.16	0.11	0.11	0.52	0.28	0.63	0.28	1.0	0.33	0.64	0.75
PTI_11G02820.1	0.16	0.27	0.23	0.49	0.22	0.25	0.41	0.52	0.21	0.3	0.3	0.31	0.24	0.17	0.18	0.15	0.02	0.6	0.39	0.17	0.26	0.4	0.24	0.18	0.08	0.08	0.02	0.26	0.15	0.26	0.15	0.45	0.34	0.91	1.0
PTI_12G00520.1	0.33	0.42	0.29	0.4	0.22	0.32	0.38	0.32	0.3	0.35	0.23	0.27	0.36	0.17	0.42	0.44	0.41	0.7	0.76	0.17	0.78	0.64	0.44	0.44	0.34	0.11	0.06	0.61	0.24	0.44	0.34	0.48	0.24	0.46	1.0
PTI_12G00530.1	0.69	0.51	0.49	0.49	0.58	0.69	0.45	0.52	0.82	0.6	0.28	0.29	0.53	0.48	0.6	0.46	0.1	0.81	0.94	0.24	0.92	0.6	0.91	1.0	0.43	0.23	0.19	0.37	0.27	0.53	0.38	0.56	0.3	0.7	0.64
PTI_12G01640.1	0.35	0.48	0.52	0.67	0.18	0.54	0.67	0.86	0.66	0.69	0.03	0.02	0.09	0.04	0.4	0.37	0.36	0.3	0.75	0.04	0.06	0.04	0.03	0.64	0.51	1.0	0.55	0.29	0.21	0.48	0.62	0.43	0.03	0.11	0.31
PTI_12G02610.1	0.45	0.79	0.36	0.77	0.35	0.51	1.0	0.33	0.62	0.63	0.42	0.53	0.53	0.6	0.25	0.28	0.13	0.62	0.89	0.31	0.73	0.71	0.46	0.61	0.32	0.15	0.11	0.82	0.38	0.66	0.53	0.64	0.53	0.46	0.5
PTI_12G02620.1	0.3	0.63	0.24	0.64	0.25	0.37	0.89	0.32	0.48	0.57	0.23	0.3	0.49	0.27	0.2	0.18	0.13	0.68	0.87	0.23	0.71	0.66	0.37	0.53	0.23	0.04	0.03	0.42	0.23	0.7	0.37	1.0	0.29	0.57	0.82
PTI_13G00390.1	0.58	0.88	0.49	0.86	0.55	0.76	1.0	0.46	0.88	0.89	0.58	0.73	0.72	0.45	0.37	0.47	0.12	0.83	0.95	0.54	0.84	0.91	0.6	0.61	0.29	0.28	0.3	0.93	0.66	0.71	0.54	0.81	0.79	0.26	0.27
PTI_13G01590.1	0.2	0.31	0.19	0.33	0.2	0.24	0.37	0.22	0.26	0.31	0.34	0.26	0.21	0.17	0.16	0.19	0.04	0.48	0.54	0.09	0.46	0.44	0.41	0.24	0.1	0.09	0.03	0.43	0.16	0.28	0.17	0.46	0.29	0.54	1.0
PTI_14G02220.1	0.3	0.46	0.3	0.48	0.3	0.34	0.59	0.34	0.37	0.43	0.34	0.43	0.42	0.88	0.24	0.33	0.26	0.78	0.93	0.24	0.52	0.8	0.36	0.37	0.13	0.15	0.12	0.45	0.26	0.49	0.31	0.58	0.41	0.53	1.0
PTI_15G01990.1	0.49	0.76	0.53	0.82	0.34	0.74	0.86	0.62	0.99	1.0	0.35	0.36	0.37	0.27	0.28	0.51	0.11	0.69	0.86	0.25	0.49	0.59	0.36	0.48	0.21	0.4	0.78	0.6	0.62	0.64	0.73	0.5	0.39	0.57	0.47
PTI_18G02100.1	0.41	0.52	0.33	0.56	0.33	0.51	0.64	0.31	0.53	0.64	0.37	0.47	0.26	0.16	0.4	0.44	0.11	0.68	0.88	0.18	0.46	0.61	0.28	0.34	0.19	0.5	0.6	1.0	0.34	0.32	0.18	0.52	0.47	0.73	0.71
PTI_19G03000.1	0.67	0.76	0.49	0.66	0.64	0.7	0.74	0.33	0.81	0.76	0.26	0.32	0.42	0.28	0.85	0.66	0.66	0.73	0.96	0.49	0.81	0.52	0.6	0.65	0.59	0.76	0.75	1.0	0.4	0.66	0.74	0.71	0.31	0.63	0.69
PTI_20G01830.1	0.42	0.4	0.35	0.38	0.32	0.53	0.51	0.34	0.67	0.65	0.24	0.28	0.42	0.35	0.56	0.41	0.33	0.64	0.88	0.4	1.0	0.65	0.77	0.43	0.21	0.08	0.03	0.53	0.18	0.32	0.2	0.39	0.28	0.3	0.44
PTI_22G00110.1	0.21	0.48	0.34	0.69	0.18	0.34	0.78	0.37	0.38	0.42	0.11	0.11	0.0	0.14	0.15	0.39	0.07	0.53	0.86	0.52	0.34	0.28	0.17	0.32	0.28	0.0	0.0	0.58	1.0	0.59	0.39	0.86	0.11	0.21	0.3
PTI_22G02620.1	0.43	0.67	0.4	0.63	0.42	0.52	0.82	0.39	0.58	0.65	0.32	0.42	0.16	0.39	0.35	0.53	0.12	0.79	0.88	0.32	0.78	0.78	0.63	0.55	0.25	0.21	0.3	0.54	0.41	0.84	0.72	0.73	0.41	0.7	1.0
PTI_25G00820.1	0.23	0.33	0.17	0.38	0.2	0.29	0.51	0.2	0.43	0.41	0.74	0.37	0.31	0.39	0.26	0.36	0.06	0.59	0.94	0.31	0.21	0.17	0.16	0.14	0.1	0.25	0.26	0.95	0.26	0.29	0.21	0.34	0.41	0.68	1.0
PTI_28G01800.1	0.29	0.6	0.4	0.81	0.22	0.41	0.94	0.5	0.54	0.58	0.16	0.16	0.69	0.25	0.19	0.37	0.05	0.61	1.0	0.5	0.3	0.26	0.15	0.34	0.4	0.38	0.56	0.87	0.94	0.59	0.48	0.76	0.17	0.29	0.34
PTI_29G01190.1	0.44	0.44	0.36	0.35	0.39	0.39	0.31	0.26	0.43	0.35	0.05	0.08	0.21	0.07	0.59	0.26	0.55	0.54	1.0	0.08	0.02	0.08	0.02	0.46	0.25	0.95	0.85	0.14	0.1	0.43	0.7	0.32	0.08	0.44	0.84
PTI_30G01250.1	0.33	0.51	0.41	0.66	0.46	0.58	0.86	0.6	0.7	0.71	0.3	0.37	0.06	0.25	0.25	0.44	0.14	0.63	1.0	0.44	0.72	0.85	0.36	0.39	0.12	0.05	0.07	0.58	0.75	0.6	0.64	0.52	0.42	0.13	0.3

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)