Heatmap: Cluster_115 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	4h after treatment	4h after treatment,No nitrate	8h after treatment	8h after treatment,No nitrate	20C	20h after treatment	20h after treatment,No nitrate	20h after treatment,Nocodazole added	36h after treatment	36h after treatment,No phosphate	Blue light,10min after light change	Blue light,60min after light change	Bohlin	CCAP1055/1,20C	CCAP1055/1,20C,High CO2,OligoDT primed	CCAP1055/1,20C,Low CO2,OligoDT primed	CCAP1055/1,20C,Normal CO2,OligoDT primed	CCMP2561	CCMP2561 Nitrase Reductase Knockout	CCMP632	CCMP632,24h	CCMP632,48h	CCMP632,72h	CCMP632,High light acclimated WT	CCMP632,Low light acclimated WT	NEPCC640,8h,1000ppmv CO2	NEPCC640,8h,390 ppmv CO2	No light,8h after treatment	Pt-1	Pt-1 8.6	Pt-1 8.6,With nitrogen	Pt-1 8.6,Without nitrogen	Red light,0min before light change	UTEX 646,Blue light	UTEX 646,No light
PTI_00G01140.1	0.65	0.87	0.45	0.73	0.52	0.69	1.0	0.46	0.61	0.71	0.43	0.48	0.59	0.51	0.32	0.34	0.14	0.68	0.73	0.18	0.43	0.98	0.43	0.5	0.3	0.44	0.57	0.27	0.24	0.84	0.73	0.82	0.46	0.38	0.14
PTI_00G02070.1	0.56	0.86	0.51	0.95	0.56	0.74	1.0	0.46	0.93	0.94	0.49	0.58	0.6	0.23	0.31	0.39	0.26	0.58	0.92	0.39	0.42	0.88	0.47	0.62	0.17	0.28	0.2	0.49	0.21	0.51	0.43	0.59	0.59	0.35	0.24
PTI_00G02320.1	0.37	0.94	0.39	0.88	0.48	0.51	0.75	0.73	0.39	0.65	0.0	0.0	0.04	0.0	0.23	0.64	0.27	0.38	0.43	0.14	0.76	1.0	0.55	0.2	0.09	0.38	0.1	0.31	0.12	0.32	0.37	0.34	0.0	0.0	0.0
PTI_01G01920.1	0.08	0.22	0.08	0.22	0.08	0.16	0.37	0.11	0.17	0.22	0.1	0.17	1.0	0.21	0.07	0.13	0.04	0.33	0.3	0.2	0.07	0.1	0.11	0.16	0.04	0.02	0.01	0.01	0.04	0.21	0.05	0.3	0.15	0.23	0.05
PTI_01G03650.1	0.68	0.78	0.62	0.73	0.43	0.97	0.79	0.57	0.94	1.0	0.57	0.56	0.23	0.34	0.32	0.3	0.12	0.66	0.73	0.23	0.64	0.9	0.47	0.27	0.08	0.24	0.15	0.25	0.19	0.44	0.64	0.19	0.7	0.56	0.48
PTI_01G04100.1	0.73	0.88	0.54	0.85	0.46	1.0	0.88	0.43	0.92	0.94	0.27	0.34	0.17	0.46	0.5	0.4	0.25	0.65	0.77	0.22	0.47	0.53	0.48	0.3	0.06	0.19	0.22	0.21	0.14	0.19	0.18	0.19	0.32	0.61	0.01
PTI_01G07380.1	0.39	0.68	0.4	0.64	0.42	0.63	0.65	0.41	0.67	0.72	0.28	0.32	0.13	0.33	0.36	0.4	0.24	0.52	0.55	0.34	0.8	1.0	0.71	0.25	0.11	0.18	0.1	0.26	0.06	0.19	0.25	0.23	0.34	0.19	0.13
PTI_01G09160.1	0.69	0.62	0.52	0.57	0.7	0.86	0.56	0.4	1.0	0.89	0.32	0.44	0.17	0.09	0.47	0.35	0.12	0.54	0.54	0.2	0.82	0.64	0.56	0.22	0.14	0.15	0.18	0.62	0.2	0.25	0.23	0.31	0.44	0.87	0.39
PTI_02G01450.1	0.31	0.56	0.24	0.45	0.12	0.59	0.6	0.4	0.48	0.64	0.57	0.66	0.31	0.25	0.21	0.21	0.12	0.69	0.83	0.12	0.22	0.59	0.23	0.08	0.03	0.03	0.03	0.09	0.11	0.3	0.1	0.56	0.76	1.0	0.06
PTI_02G06470.1	0.68	0.56	0.45	0.46	0.7	1.0	0.72	0.55	0.93	0.81	0.39	0.28	0.24	0.33	0.73	0.28	0.84	0.5	0.66	0.28	0.57	0.62	0.47	0.58	0.33	0.52	0.4	0.32	0.29	0.38	0.52	0.25	0.4	0.14	0.12
PTI_02G06630.1	0.25	0.53	0.25	0.51	0.63	0.33	0.57	0.49	0.31	0.42	0.5	0.56	0.34	0.5	0.19	0.33	0.06	0.57	0.36	0.36	0.8	1.0	0.78	0.34	0.22	0.18	0.11	0.22	0.27	0.59	0.4	0.87	0.49	0.48	0.3
PTI_03G01820.1	0.49	0.43	0.31	0.28	0.29	1.0	0.56	0.5	0.5	0.64	0.22	0.14	0.19	0.2	0.28	0.04	0.3	0.41	0.53	0.1	0.18	0.32	0.17	0.2	0.06	0.07	0.06	0.02	0.11	0.28	0.26	0.31	0.2	0.09	0.01
PTI_03G02930.1	0.32	0.4	0.27	0.43	0.52	0.39	0.5	0.2	0.49	0.43	0.43	0.51	1.0	0.31	0.4	0.36	0.24	0.85	0.74	0.48	0.53	0.46	0.7	0.62	0.61	0.19	0.08	0.3	0.3	0.25	0.22	0.24	0.57	0.35	0.95
PTI_03G04740.1	0.39	0.6	0.33	0.55	0.41	0.4	1.0	0.34	0.48	0.5	0.33	0.42	0.86	0.23	0.23	0.24	0.22	0.62	0.76	0.54	0.64	0.78	0.81	0.42	0.15	0.14	0.1	0.39	0.21	0.28	0.23	0.28	0.37	0.23	0.44
PTI_03G05190.1	0.35	0.4	0.29	0.46	0.62	0.5	0.63	0.33	0.68	0.64	0.37	0.48	0.93	0.28	0.2	0.29	0.08	0.7	0.72	0.46	0.82	0.72	0.82	0.35	0.18	0.1	0.07	0.69	0.41	0.64	0.26	1.0	0.5	0.75	0.77
PTI_03G06540.1	0.68	0.9	0.57	0.91	0.53	0.85	1.0	0.57	0.81	0.8	0.43	0.59	0.3	0.17	0.38	0.42	0.11	0.47	0.8	0.22	0.38	0.68	0.29	0.25	0.13	0.38	0.62	0.61	0.2	0.59	0.5	0.61	0.54	0.97	0.24
PTI_04G00720.1	0.66	0.85	0.51	0.78	0.75	0.83	0.82	0.35	0.86	0.8	0.38	0.41	0.48	0.19	0.53	0.62	0.09	0.87	0.94	0.69	0.81	0.99	0.8	0.68	0.42	0.5	0.89	0.28	0.17	0.53	0.53	0.43	0.47	0.48	1.0
PTI_04G00860.1	0.33	0.66	0.38	0.98	0.5	0.44	0.85	0.52	0.44	0.56	0.28	0.37	0.16	0.24	0.2	0.28	0.07	0.61	0.55	0.23	0.86	1.0	0.92	0.39	0.21	0.13	0.07	0.38	0.43	0.44	0.41	0.62	0.38	0.24	0.09
PTI_04G01040.1	0.47	0.53	0.35	0.45	0.45	0.81	0.61	0.25	1.0	0.83	0.19	0.18	0.11	0.03	0.28	0.25	0.16	0.28	0.31	0.39	0.08	0.2	0.15	0.12	0.05	0.12	0.05	0.19	0.15	0.12	0.2	0.05	0.25	0.18	0.05
PTI_04G01710.1	0.59	0.59	0.38	0.5	0.44	0.65	0.63	0.48	0.6	0.6	0.75	0.58	0.61	0.43	0.44	0.29	0.22	0.71	0.83	0.32	0.67	1.0	0.62	0.44	0.3	0.59	0.51	0.54	0.34	0.61	0.41	0.8	0.53	0.96	0.71
PTI_04G02670.1	0.69	0.64	0.49	0.55	0.63	0.67	0.47	0.37	0.7	0.64	0.45	0.51	0.49	0.48	0.46	0.42	0.37	0.69	0.69	0.28	0.81	0.42	0.79	0.54	0.35	0.12	0.1	0.4	0.36	0.34	0.33	0.41	0.48	1.0	0.36
PTI_05G00380.1	0.61	0.42	0.35	0.2	0.32	1.0	0.26	0.25	0.74	0.7	0.56	0.23	0.03	0.07	0.41	0.1	0.4	0.2	0.46	0.1	0.28	0.77	0.24	0.14	0.03	0.11	0.11	0.02	0.11	0.21	0.43	0.05	0.42	0.27	0.01
PTI_05G04490.1	0.39	0.83	0.54	0.86	0.24	0.74	1.0	0.5	0.49	0.73	0.36	0.29	0.26	0.32	0.2	0.24	0.22	0.68	0.72	0.37	0.23	0.33	0.19	0.3	0.06	0.06	0.02	0.02	0.25	0.44	0.42	0.54	0.42	0.39	0.16
PTI_07G03510.1	0.63	0.55	0.56	0.48	0.66	0.92	0.57	0.83	1.0	0.92	0.77	0.76	0.25	0.61	0.85	0.61	0.37	0.86	0.92	0.24	0.71	0.82	0.43	0.62	0.09	0.22	0.1	0.18	0.21	0.48	0.42	0.46	0.93	0.93	0.44
PTI_08G04520.1	0.49	0.9	0.66	0.96	0.26	0.66	0.81	0.84	0.47	0.74	0.32	0.41	0.07	0.22	0.27	0.39	0.12	0.55	0.58	0.08	0.71	1.0	0.41	0.28	0.11	0.18	0.16	0.12	0.12	0.37	0.34	0.55	0.29	0.13	0.01
PTI_09G00470.1	0.53	0.63	0.39	0.44	0.43	0.85	0.64	0.27	1.0	0.82	0.14	0.13	0.1	0.06	0.41	0.3	0.2	0.33	0.28	0.24	0.31	0.38	0.27	0.14	0.03	0.16	0.12	0.18	0.07	0.18	0.3	0.05	0.2	0.19	0.04
PTI_09G01260.1	0.25	0.26	0.26	0.29	0.32	0.51	0.4	0.3	0.47	0.42	0.26	0.17	0.02	0.18	0.1	0.06	0.07	0.37	0.45	0.13	0.38	1.0	0.27	0.17	0.01	0.02	0.01	0.02	0.06	0.24	0.13	0.37	0.26	0.23	0.01
PTI_09G01300.1	0.32	0.5	0.27	0.57	0.52	0.43	0.7	0.29	0.5	0.6	0.39	0.44	0.31	0.19	0.22	0.3	0.11	0.68	0.61	0.53	0.84	1.0	0.8	0.44	0.29	0.1	0.05	0.48	0.32	0.44	0.23	0.64	0.48	0.28	0.44
PTI_09G01970.1	0.37	0.65	0.3	0.54	0.49	0.51	0.65	0.28	0.49	0.5	0.44	0.6	0.48	0.3	0.28	0.31	0.09	0.76	0.66	0.51	1.0	1.0	0.96	0.44	0.35	0.07	0.04	0.37	0.27	0.51	0.24	0.78	0.61	0.53	0.35
PTI_10G01000.1	0.75	0.54	0.81	0.39	0.52	1.0	0.24	0.5	0.67	0.72	0.57	0.34	0.15	0.23	0.42	0.17	0.75	0.4	0.73	0.22	0.02	0.17	0.01	0.3	0.08	0.38	0.23	0.11	0.13	0.37	0.42	0.38	0.61	0.31	0.06
PTI_10G01760.1	0.63	0.64	0.45	0.63	0.43	0.76	0.78	0.33	1.0	0.84	0.21	0.21	0.3	0.44	0.47	0.48	0.32	0.64	0.72	0.36	0.5	0.42	0.55	0.5	0.21	0.18	0.12	0.43	0.21	0.2	0.16	0.28	0.24	0.35	0.21
PTI_10G02980.1	0.55	0.71	1.0	0.91	0.3	0.78	0.78	0.59	0.85	0.57	0.32	0.2	0.56	0.2	0.32	0.61	0.15	0.61	0.78	0.46	0.56	0.39	0.43	0.64	0.23	0.17	0.11	0.7	0.35	0.31	0.36	0.26	0.2	0.44	0.44
PTI_11G03120.1	0.42	0.62	0.43	0.54	0.34	0.53	0.54	0.51	0.35	0.48	0.6	0.59	0.34	0.31	0.2	0.18	0.08	0.46	0.46	0.17	0.75	0.97	0.52	0.37	0.2	0.2	0.17	0.41	0.32	0.61	0.33	1.0	0.5	0.46	0.63
PTI_11G03610.1	0.64	0.67	0.63	0.72	0.48	0.87	0.77	0.49	0.79	0.82	0.44	0.56	0.09	0.34	0.54	0.4	0.52	0.8	1.0	0.19	0.3	0.46	0.29	0.39	0.11	0.2	0.15	0.32	0.16	0.56	0.36	0.79	0.44	0.66	0.3
PTI_12G00140.1	0.68	0.62	0.49	0.54	0.45	0.92	0.84	0.35	1.0	1.0	0.31	0.27	0.1	0.14	0.59	0.45	0.2	0.57	0.54	0.28	0.63	0.67	0.44	0.26	0.06	0.12	0.08	0.29	0.15	0.21	0.27	0.24	0.34	0.33	0.1
PTI_13G02960.1	0.36	0.57	0.26	0.48	0.39	0.63	0.59	0.31	0.73	0.63	0.3	0.35	0.2	0.21	0.28	0.21	0.11	0.56	0.54	0.13	0.54	0.43	0.25	0.18	0.06	0.05	0.03	0.11	0.17	0.15	0.08	0.29	0.42	1.0	0.48
PTI_13G03580.1	0.87	0.67	0.64	0.69	0.52	0.73	0.82	0.65	0.62	0.62	0.67	0.72	0.88	0.19	0.33	0.27	0.11	1.0	0.75	0.11	0.54	0.74	0.39	0.41	0.12	0.36	0.27	0.9	0.19	0.17	0.15	0.14	0.9	0.78	0.65
PTI_15G02270.1	0.68	0.87	0.66	0.77	0.71	0.87	0.84	0.47	0.94	1.0	0.52	0.47	0.15	0.13	0.66	0.46	0.44	0.58	0.56	0.2	0.51	0.86	0.63	0.39	0.08	0.27	0.16	0.73	0.26	0.2	0.21	0.25	0.54	0.49	0.28
PTI_17G00170.1	0.62	0.85	0.48	0.74	0.23	1.0	0.7	0.43	0.7	0.58	0.3	0.24	0.09	0.22	0.14	0.11	0.05	0.37	0.44	0.13	0.23	0.59	0.15	0.13	0.04	0.13	0.3	0.03	0.02	0.17	0.21	0.12	0.34	0.18	0.0
PTI_17G01920.1	0.37	0.43	0.35	0.45	0.44	0.44	0.53	0.32	0.44	0.46	0.21	0.28	0.58	0.35	0.36	0.36	0.16	0.63	0.54	0.59	0.6	0.42	0.57	0.54	0.35	0.14	0.11	0.53	0.39	0.62	0.34	1.0	0.3	0.67	0.48
PTI_18G01000.1	0.92	0.9	0.63	0.8	0.49	1.0	0.78	0.41	0.8	0.95	0.31	0.39	0.18	0.22	0.4	0.39	0.05	0.64	0.47	0.35	0.5	0.46	0.28	0.17	0.05	0.15	0.12	0.37	0.17	0.2	0.24	0.22	0.42	0.53	0.22
PTI_19G01260.1	0.28	0.74	0.41	0.79	0.43	0.92	0.89	0.31	1.0	0.91	0.31	0.31	0.16	0.04	0.33	0.45	0.17	0.78	0.53	0.42	0.32	0.48	0.43	0.16	0.05	0.35	0.04	0.04	0.03	0.13	0.24	0.04	0.44	0.15	0.02
PTI_19G02640.1	0.36	0.55	0.34	0.68	0.52	0.49	1.0	0.27	0.76	0.97	0.39	0.53	0.35	0.27	0.36	0.56	0.19	0.76	0.73	0.92	0.82	0.71	0.81	0.39	0.63	0.11	0.09	0.78	0.55	0.48	0.21	0.83	0.47	0.16	0.13
PTI_20G00540.1	0.5	0.56	0.55	1.0	0.52	0.56	0.78	0.67	0.65	0.61	0.27	0.4	0.22	0.26	0.26	0.25	0.08	0.6	0.36	0.19	0.39	0.58	0.33	0.42	0.13	0.43	0.25	0.39	0.27	0.72	0.83	0.65	0.35	0.62	0.16
PTI_20G02120.1	0.38	0.53	0.35	0.54	0.57	0.53	0.64	0.36	0.67	0.61	0.3	0.31	1.0	0.44	0.38	0.4	0.2	0.8	0.7	0.61	0.92	0.38	0.89	0.4	0.46	0.51	0.46	0.16	0.3	0.62	0.35	0.62	0.32	0.49	0.34
PTI_20G02260.1	0.56	0.74	0.79	0.74	0.26	0.73	0.79	1.0	0.56	0.68	0.36	0.47	0.55	0.56	0.28	0.32	0.19	0.56	0.66	0.13	0.61	0.67	0.21	0.31	0.03	0.08	0.04	0.27	0.16	0.48	0.23	0.66	0.51	0.52	0.19
PTI_21G02750.1	0.38	0.54	0.31	0.61	0.47	0.5	0.79	0.31	0.63	0.63	0.5	0.58	0.64	0.34	0.27	0.25	0.12	0.78	0.66	0.22	0.37	0.46	0.28	0.23	0.12	0.1	0.09	0.25	0.32	0.23	0.17	0.31	0.62	1.0	0.28
PTI_22G00020.1	0.54	0.73	0.67	0.54	0.52	0.69	0.56	0.4	0.53	0.73	0.24	0.37	0.0	0.17	0.23	0.16	0.13	0.62	0.55	0.36	0.61	1.0	0.36	0.36	0.11	0.0	0.0	0.33	0.23	0.5	0.43	0.47	0.3	0.51	0.17
PTI_22G01840.1	0.82	0.9	0.7	0.7	0.37	0.92	0.99	0.82	0.8	1.0	0.28	0.35	0.14	0.13	0.37	0.27	0.24	0.51	0.89	0.1	0.27	0.59	0.21	0.35	0.06	0.21	0.25	0.51	0.34	0.61	0.31	0.89	0.4	0.33	0.3
PTI_25G00110.1	0.64	0.95	0.57	0.93	0.42	0.82	0.98	0.41	0.79	0.81	0.82	0.75	0.44	0.32	0.65	0.63	0.36	0.53	1.0	0.32	0.53	0.82	0.38	0.29	0.13	0.41	0.26	0.99	0.3	0.38	0.48	0.31	0.79	0.74	0.52
PTI_25G00170.1	0.74	0.84	0.65	0.77	0.67	0.95	0.79	0.58	0.99	0.95	0.55	0.64	0.25	0.28	0.61	0.59	0.34	0.69	1.0	0.52	0.53	0.69	0.38	0.41	0.28	0.13	0.08	0.64	0.33	0.35	0.3	0.43	0.75	0.66	0.92
PTI_25G00430.1	0.24	0.26	0.25	0.28	0.51	0.61	0.31	0.17	0.68	0.56	0.37	0.27	0.28	0.13	0.86	0.69	1.0	0.56	0.69	0.53	0.05	0.17	0.1	0.55	0.32	0.04	0.03	0.1	0.17	0.29	0.56	0.03	0.43	0.13	0.04
PTI_25G01710.1	0.72	0.74	0.55	0.67	0.78	1.0	0.72	0.46	0.89	0.88	0.58	0.53	0.46	0.75	0.35	0.37	0.11	0.76	0.79	0.29	0.46	0.67	0.61	0.54	0.25	0.14	0.06	0.61	0.36	0.37	0.37	0.41	0.64	0.34	0.42
PTI_26G00130.1	0.59	1.0	0.39	0.75	0.42	0.78	0.83	0.37	0.76	0.78	0.14	0.15	0.31	0.06	0.28	0.2	0.38	0.24	0.26	0.12	0.33	0.46	0.29	0.52	0.2	0.12	0.07	0.31	0.13	0.18	0.29	0.09	0.14	0.11	0.18
PTI_26G01300.1	0.51	1.0	0.58	0.84	0.28	0.67	0.86	0.36	0.6	0.85	0.22	0.24	0.09	0.05	0.19	0.15	0.38	0.27	0.33	0.32	0.11	0.49	0.09	0.33	0.09	0.17	0.13	0.12	0.05	0.24	0.32	0.09	0.34	0.39	0.02
PTI_28G01310.1	0.72	0.5	0.42	0.35	0.37	1.0	0.48	0.44	0.73	0.64	0.16	0.12	0.1	0.1	0.54	0.23	0.36	0.57	0.84	0.13	0.27	0.36	0.18	0.39	0.11	0.08	0.07	0.29	0.15	0.5	0.45	0.5	0.17	0.06	0.07
PTI_29G00950.1	0.69	0.66	0.47	0.57	0.58	0.98	0.79	0.58	1.0	0.88	0.52	0.44	0.65	0.29	0.47	0.3	0.48	0.65	0.78	0.46	0.54	0.43	0.46	0.7	0.4	0.23	0.83	0.47	0.58	0.58	0.47	0.68	0.59	0.74	0.81

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)