Heatmap: Cluster_10 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	4h after treatment	4h after treatment,No nitrate	8h after treatment	8h after treatment,No nitrate	20C	20h after treatment	20h after treatment,No nitrate	20h after treatment,Nocodazole added	36h after treatment	36h after treatment,No phosphate	Blue light,10min after light change	Blue light,60min after light change	Bohlin	CCAP1055/1,20C	CCAP1055/1,20C,High CO2,OligoDT primed	CCAP1055/1,20C,Low CO2,OligoDT primed	CCAP1055/1,20C,Normal CO2,OligoDT primed	CCMP2561	CCMP2561 Nitrase Reductase Knockout	CCMP632	CCMP632,24h	CCMP632,48h	CCMP632,72h	CCMP632,High light acclimated WT	CCMP632,Low light acclimated WT	NEPCC640,8h,1000ppmv CO2	NEPCC640,8h,390 ppmv CO2	No light,8h after treatment	Pt-1	Pt-1 8.6	Pt-1 8.6,With nitrogen	Pt-1 8.6,Without nitrogen	Red light,0min before light change	UTEX 646,Blue light	UTEX 646,No light
PTI_00G01110.1	0.0	0.0	0.71	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
PTI_00G01200.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.8	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.34	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.84	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
PTI_00G01930.1	0.0	0.0	0.0	0.29	1.0	0.0	0.15	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.01	0.0	0.03	0.05	0.0	0.0	0.19	0.0	0.11	0.0	0.0	0.29	0.2	0.17	0.0	0.0	0.06
PTI_00G03340.1	0.98	0.29	0.26	0.33	0.56	0.0	0.0	0.29	0.55	0.6	0.02	0.73	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.13	0.14	0.0	0.0	0.0	0.17	0.18	0.0	0.0	1.0	0.16	0.34	0.38	0.0	0.21	0.12	0.3
PTI_01G01640.1	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.0	0.0
PTI_01G04570.1	0.0	0.0	0.28	0.0	0.0	0.0	0.0	0.33	0.0	0.0	0.18	0.08	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.11	0.0	0.44	0.37	0.49	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.46	1.0	0.0	0.09	0.0	0.0
PTI_01G05400.1	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.94	0.0	0.0	0.14	0.81	0.37	0.55	0.0	0.0	0.0	0.09	0.19	0.0	0.35	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.79	0.03	0.0	0.24	0.27	0.37
PTI_01G05530.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	1.0	0.03	0.18	0.0
PTI_01G05730.1	0.0	0.0	0.7	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.16	0.36	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.79	0.0	0.0
PTI_01G08070.1	0.56	0.0	0.15	0.0	0.7	0.45	0.0	0.17	0.48	0.0	0.08	0.0	0.0	0.24	0.0	0.0	0.0	0.11	0.05	0.04	0.08	0.4	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	1.0	0.05	0.0	0.0
PTI_01G08460.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
PTI_01G08470.1	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.99	0.27	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.38	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.32	0.0	0.0
PTI_02G00010.1	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.04
PTI_02G00490.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.02	0.14	0.04	0.03	0.04	0.06	0.63	0.41	1.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0
PTI_02G01920.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
PTI_02G02390.1	0.04	0.13	0.11	0.14	1.0	0.08	0.19	0.05	0.04	0.09	0.29	0.25	0.0	0.79	0.0	0.0	0.04	0.02	0.01	0.03	0.49	0.66	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.05	0.09	0.12	0.23	0.04	0.0
PTI_03G03540.1	1.0	0.55	0.0	0.39	0.01	0.05	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.07	0.13	0.11	0.26	0.38	0.06	0.07	0.26	0.03	0.02	0.02	0.0	0.0	0.22	0.03	0.03	0.0	0.07	0.09	0.0	0.2	0.0	0.0	0.08
PTI_03G04560.1	0.0	0.0	0.62	0.0	0.93	0.0	0.0	0.75	0.0	0.0	0.0	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
PTI_03G05480.1	0.53	0.33	0.49	0.31	0.78	0.65	0.4	0.43	0.86	0.77	0.37	0.27	0.33	0.2	0.77	0.28	0.5	0.47	0.51	0.48	0.8	0.67	1.0	0.77	0.64	0.73	0.94	0.21	0.31	0.8	0.68	0.86	0.3	0.8	0.27
PTI_04G00290.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.92	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.48	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.48	0.0	0.0	0.03	0.22	0.0	0.0	0.0	0.19	0.37
PTI_04G01440.1	0.11	0.18	0.08	0.19	0.27	0.09	0.14	0.21	0.11	0.16	0.15	0.2	0.32	1.0	0.06	0.02	0.03	0.1	0.23	0.26	0.17	0.28	0.32	0.25	0.06	0.28	0.11	0.05	0.04	0.22	0.25	0.15	0.21	0.04	0.17
PTI_05G02090.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.84	0.01	1.0	0.0	0.0	0.0
PTI_05G03150.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	1.0	0.08	0.0	0.36	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
PTI_05G03170.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
PTI_05G03610.1	0.22	0.13	0.19	0.11	0.13	0.2	0.06	0.09	0.15	0.15	0.04	0.06	0.02	0.07	0.56	0.21	0.56	0.24	0.43	0.08	0.07	0.19	0.03	0.32	1.0	0.25	0.24	0.04	0.06	0.63	0.26	0.52	0.05	0.08	0.0
PTI_05G04500.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
PTI_06G03200.1	0.0	0.63	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.43	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
PTI_06G03570.1	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.3	0.0	0.0	0.13
PTI_06G04000.1	0.38	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.08	0.19	0.0	0.0	0.17	0.26	0.21	0.39	0.06	0.62	0.0	0.65	0.0	0.01	0.0	0.0	0.45	0.0	0.8	0.6	1.0	0.0	0.0	0.0
PTI_07G01100.1	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.35	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.31
PTI_07G01110.1	0.0	0.35	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.72	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.35	0.0	0.48	0.0	1.0	0.0	0.03	0.0
PTI_07G02680.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.54	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
PTI_07G04530.1	0.8	0.58	1.0	0.1	0.26	0.64	0.18	0.37	0.52	0.15	0.14	0.17	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.41	0.02	0.33	0.1	0.63	0.11	0.48	0.37
PTI_08G00940.1	0.0	0.0	0.0	0.31	0.72	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.49	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	1.0	0.0	0.1	0.28
PTI_08G04580.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.29	0.24	0.0	0.51	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.03	0.12	0.15	0.5	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23	0.16	1.0	0.48	0.0	0.0	0.0	0.0
PTI_08G04590.1	0.09	0.0	0.09	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.03	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.4	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.04	0.04	0.11
PTI_09G02760.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.01	0.0	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13
PTI_10G00300.1	0.32	0.33	0.4	0.58	0.17	0.27	0.2	0.78	0.3	0.1	0.37	0.52	0.48	0.16	0.3	0.22	0.36	0.38	0.33	0.81	0.15	0.12	0.15	0.31	0.99	0.72	1.0	0.3	0.65	0.18	0.21	0.24	0.33	0.7	0.16
PTI_10G00400.1	0.09	0.81	0.14	0.87	0.09	0.27	1.0	0.24	0.23	0.17	0.09	0.09	0.03	0.26	0.03	0.06	0.02	0.27	0.15	0.01	0.0	0.0	0.0	0.04	0.01	0.28	0.07	0.25	0.03	0.07	0.09	0.09	0.07	0.01	0.0
PTI_11G00100.1	0.21	0.0	0.0	0.0	0.86	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
PTI_11G04030.1	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.84	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.39	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
PTI_11G04040.1	0.0	0.0	1.0	0.0	0.65	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.32	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.46	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.73	0.0	0.0
PTI_13G00100.1	1.0	0.0	0.0	0.0	0.8	0.67	0.38	0.55	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.26	0.0	0.0	0.28	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
PTI_13G00110.1	0.0	0.8	0.68	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
PTI_13G00290.1	0.04	0.05	0.39	0.36	0.46	0.06	0.36	0.07	0.04	0.03	0.07	0.12	0.18	0.06	0.03	0.04	0.04	0.02	0.03	0.01	0.08	0.06	0.05	0.06	1.0	0.18	0.26	0.05	0.03	0.03	0.03	0.02	0.22	0.01	0.02
PTI_13G00550.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
PTI_14G02460.1	0.1	0.17	0.17	0.12	0.67	0.14	0.18	0.62	0.16	0.06	0.05	0.15	0.39	0.06	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.05	1.0	0.55	0.26	0.36	0.27	0.2	0.37	0.12	0.01	0.02	0.0	0.07	0.13	0.01	0.01
PTI_16G00070.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.85	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
PTI_16G00730.1	0.24	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.0	0.0	0.0	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.07	0.0	0.34	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.52	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
PTI_16G02200.1	0.0	0.0	0.72	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.5	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.05	0.43	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
PTI_19G00280.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.35	0.0	0.0	0.0	0.93	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.0	0.0	0.07	0.61	0.61	0.26	0.0	0.0	0.0
PTI_19G00460.1	0.0	0.0	0.85	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
PTI_19G01680.1	0.0	0.0	0.05	0.0	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.11	0.0	0.07	0.04	0.0	0.02	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.35	0.4	1.0	0.01	0.0	0.05
PTI_19G03130.1	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.13
PTI_20G02170.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.38	0.0	0.0	0.61	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.68	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.38	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
PTI_21G02780.1	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.55	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
PTI_23G01160.1	0.11	0.05	0.3	0.28	0.54	0.24	0.0	0.19	0.18	0.1	0.53	0.66	0.05	0.07	0.0	0.58	0.09	0.18	0.46	0.95	0.36	0.0	0.0	0.22	0.25	0.37	0.23	0.59	0.31	0.24	0.28	0.2	1.0	0.44	0.45
PTI_23G01790.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.06	0.17	1.0	0.59	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23	0.05	0.49	0.0	0.0	0.0
PTI_24G00370.1	0.0	0.0	0.71	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
PTI_26G00310.1	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.0
PTI_28G00010.1	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.35	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.31
PTI_31G00160.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.88	0.0	0.0	0.0	0.28	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.22	0.0	0.0	0.0	0.5	0.0	0.0	0.27	0.0	0.37	0.48	1.0	0.1	0.0	0.14
PTI_31G00170.1	0.27	0.31	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.03	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.53	0.0	0.0	0.32	0.0	0.21	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0
PTI_31G00930.1	0.31	0.0	0.15	0.0	1.0	0.17	0.0	0.28	0.0	0.0	0.02	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.17	0.09	0.67	0.07	0.33	0.17	0.0	0.12	0.0	0.0	0.05	0.48	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)