Heatmap: Cluster_32 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
4h after treatment
4h after treatment,No nitrate
8h after treatment
8h after treatment,No nitrate
20C
20h after treatment
20h after treatment,No nitrate
20h after treatment,Nocodazole added
36h after treatment
36h after treatment,No phosphate
Blue light,10min after light change
Blue light,60min after light change
Bohlin
CCAP1055/1,20C
CCAP1055/1,20C,High CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Low CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Normal CO2,OligoDT primed
CCMP2561
CCMP2561 Nitrase Reductase Knockout
CCMP632
CCMP632,24h
CCMP632,48h
CCMP632,72h
CCMP632,High light acclimated WT
CCMP632,Low light acclimated WT
NEPCC640,8h,1000ppmv CO2
NEPCC640,8h,390 ppmv CO2
No light,8h after treatment
Pt-1
Pt-1 8.6
Pt-1 8.6,With nitrogen
Pt-1 8.6,Without nitrogen
Red light,0min before light change
UTEX 646,Blue light
UTEX 646,No light
0.12 0.09 0.09 0.08 0.07 0.11 0.08 0.11 0.07 0.08 0.06 0.08 0.1 0.14 0.07 0.04 0.03 0.13 0.14 0.05 0.08 0.07 0.04 0.13 0.11 0.27 1.0 0.09 0.1 0.31 0.31 0.24 0.07 0.26 0.32
0.0 0.0 0.03 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 1.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0
0.12 0.09 0.09 0.08 0.05 0.2 0.1 0.19 0.12 0.13 0.04 0.04 0.04 0.05 0.03 0.01 0.02 0.08 0.07 0.02 0.01 0.03 0.01 0.05 0.03 0.58 1.0 0.01 0.04 0.21 0.12 0.29 0.05 0.14 0.01
0.06 0.05 0.06 0.05 0.04 0.06 0.05 0.08 0.06 0.06 0.14 0.1 0.02 0.05 0.03 0.04 0.01 0.06 0.07 0.04 0.08 0.11 0.08 0.11 0.06 0.28 1.0 0.07 0.09 0.21 0.27 0.1 0.07 0.09 0.03
0.03 0.03 0.02 0.03 0.04 0.05 0.03 0.06 0.06 0.04 0.01 0.02 0.05 0.03 0.03 0.02 0.01 0.07 0.07 0.05 0.14 0.07 0.07 0.13 0.15 0.36 1.0 0.01 0.11 0.29 0.38 0.1 0.02 0.13 0.07
0.07 0.05 0.09 0.08 0.03 0.09 0.02 0.11 0.05 0.04 0.08 0.1 0.01 0.02 0.04 0.02 0.02 0.04 0.02 0.01 0.07 0.07 0.03 0.09 0.09 0.55 1.0 0.01 0.03 0.15 0.24 0.02 0.08 0.03 0.01
0.05 0.03 0.04 0.04 0.07 0.09 0.07 0.08 0.09 0.08 0.05 0.03 0.07 0.04 0.08 0.05 0.04 0.06 0.09 0.09 0.23 0.09 0.16 0.15 0.11 0.32 1.0 0.15 0.18 0.16 0.26 0.07 0.04 0.11 0.38
0.02 0.03 0.02 0.03 0.02 0.05 0.06 0.06 0.04 0.06 0.02 0.03 0.03 0.04 0.02 0.03 0.03 0.03 0.03 0.09 0.06 0.05 0.06 0.05 0.04 0.22 1.0 0.02 0.04 0.06 0.06 0.04 0.03 0.03 0.04
0.24 0.22 0.16 0.16 0.11 0.25 0.19 0.13 0.22 0.22 0.09 0.14 0.05 0.06 0.14 0.11 0.01 0.36 0.34 0.04 0.11 0.12 0.09 0.07 0.02 0.22 1.0 0.08 0.09 0.18 0.09 0.32 0.13 0.27 0.02
0.11 0.09 0.07 0.07 0.03 0.12 0.09 0.08 0.11 0.12 0.04 0.09 0.07 0.04 0.05 0.01 0.0 0.19 0.16 0.01 0.09 0.14 0.04 0.01 0.01 0.28 1.0 0.01 0.04 0.11 0.03 0.22 0.04 0.31 0.0
0.07 0.06 0.06 0.07 0.06 0.08 0.07 0.09 0.1 0.1 0.08 0.09 0.14 0.04 0.04 0.04 0.02 0.05 0.07 0.1 0.13 0.08 0.07 0.16 0.08 0.49 1.0 0.04 0.08 0.24 0.33 0.09 0.09 0.11 0.15
0.06 0.06 0.07 0.06 0.07 0.06 0.08 0.08 0.1 0.1 0.07 0.1 0.13 0.11 0.03 0.03 0.02 0.12 0.15 0.04 0.13 0.16 0.05 0.09 0.01 0.37 1.0 0.11 0.1 0.11 0.11 0.08 0.09 0.13 0.09
0.09 0.1 0.05 0.06 0.04 0.09 0.05 0.12 0.06 0.08 0.04 0.05 0.02 0.14 0.02 0.01 0.0 0.06 0.05 0.01 0.08 0.05 0.03 0.03 0.03 0.25 1.0 0.03 0.03 0.09 0.12 0.04 0.05 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.02 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.36 1.0 0.0 0.16 0.05 0.09 0.01 0.01 0.01 0.01
0.16 0.04 0.07 0.03 0.11 0.24 0.05 0.17 0.1 0.07 0.02 0.02 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.05 0.06 0.01 0.01 0.01 0.0 0.07 0.02 0.28 1.0 0.0 0.08 0.23 0.22 0.11 0.01 0.01 0.01
0.07 0.04 0.03 0.04 0.19 0.03 0.06 0.06 0.03 0.05 0.01 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.07 1.0 0.06 0.0 0.06 0.07 0.04 0.0 0.03 0.02
0.13 0.06 0.08 0.04 0.07 0.11 0.04 0.18 0.07 0.06 0.04 0.04 0.06 0.01 0.14 0.04 0.12 0.08 0.09 0.03 0.03 0.03 0.02 0.14 0.03 0.24 1.0 0.06 0.05 0.24 0.24 0.14 0.03 0.2 0.04
0.02 0.03 0.02 0.02 0.04 0.03 0.03 0.03 0.02 0.03 0.03 0.03 0.06 0.03 0.01 0.01 0.02 0.02 0.03 0.07 0.01 0.03 0.01 0.04 0.13 0.37 1.0 0.01 0.14 0.14 0.21 0.03 0.03 0.05 0.03
0.14 0.19 0.1 0.17 0.09 0.16 0.23 0.12 0.17 0.18 0.12 0.14 0.06 0.18 0.05 0.05 0.01 0.14 0.15 0.06 0.25 0.32 0.18 0.12 0.06 0.28 1.0 0.12 0.08 0.22 0.2 0.21 0.12 0.21 0.13
0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.03 0.03 0.01 0.02 0.01 0.27 1.0 0.0 0.0 0.07 0.07 0.01 0.01 0.01 0.02
0.15 0.17 0.12 0.15 0.07 0.16 0.17 0.14 0.14 0.17 0.12 0.18 0.05 0.14 0.07 0.07 0.03 0.15 0.15 0.05 0.19 0.29 0.14 0.2 0.03 0.34 1.0 0.1 0.07 0.45 0.39 0.38 0.14 0.35 0.24
0.07 0.09 0.04 0.08 0.06 0.08 0.13 0.06 0.11 0.1 0.01 0.02 0.05 0.02 0.03 0.03 0.02 0.08 0.12 0.03 0.02 0.04 0.02 0.06 0.05 0.35 1.0 0.11 0.1 0.16 0.17 0.11 0.02 0.05 0.01
0.08 0.11 0.07 0.1 0.07 0.09 0.14 0.1 0.09 0.1 0.07 0.09 0.06 0.07 0.05 0.05 0.04 0.08 0.12 0.05 0.05 0.1 0.04 0.07 0.05 0.21 1.0 0.13 0.11 0.13 0.08 0.18 0.09 0.18 0.21
0.08 0.04 0.07 0.04 0.09 0.11 0.03 0.05 0.05 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 1.0 0.05 0.0 0.08 0.08 0.19 0.01 0.13 0.13
0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.11 0.09 0.1 0.1 0.12 0.0 0.01 0.24 0.0 0.03 0.04 0.01 0.13 0.12 0.07 0.17 0.24 0.16 0.11 0.06 0.21 1.0 0.07 0.04 0.17 0.14 0.21 0.0 0.02 0.01
0.12 0.09 0.09 0.08 0.07 0.11 0.08 0.11 0.07 0.08 0.06 0.08 0.1 0.14 0.07 0.04 0.03 0.13 0.14 0.05 0.08 0.07 0.04 0.13 0.11 0.27 1.0 0.09 0.1 0.31 0.31 0.24 0.07 0.26 0.32
0.07 0.09 0.08 0.08 0.11 0.12 0.09 0.09 0.15 0.12 0.06 0.08 0.16 0.15 0.09 0.05 0.06 0.06 0.07 0.11 0.19 0.11 0.13 0.24 0.19 0.48 1.0 0.04 0.1 0.25 0.35 0.09 0.08 0.24 0.11
0.02 0.03 0.02 0.03 0.03 0.04 0.03 0.09 0.04 0.04 0.05 0.05 0.07 0.05 0.01 0.01 0.0 0.05 0.07 0.04 0.11 0.07 0.05 0.13 0.05 0.23 1.0 0.01 0.14 0.24 0.32 0.08 0.05 0.09 0.14
0.09 0.07 0.08 0.07 0.06 0.09 0.06 0.08 0.1 0.1 0.07 0.08 0.01 0.05 0.1 0.05 0.07 0.07 0.08 0.07 0.03 0.09 0.03 0.06 0.02 0.25 1.0 0.07 0.03 0.14 0.12 0.04 0.13 0.15 0.05
0.05 0.07 0.04 0.06 0.05 0.1 0.08 0.08 0.13 0.12 0.02 0.02 0.03 0.02 0.04 0.04 0.02 0.04 0.1 0.03 0.09 0.05 0.06 0.09 0.08 0.32 1.0 0.05 0.06 0.19 0.27 0.1 0.02 0.04 0.09
0.02 0.02 0.02 0.02 0.03 0.03 0.02 0.03 0.04 0.03 0.03 0.01 0.01 0.01 0.04 0.03 0.04 0.02 0.04 0.02 0.04 0.04 0.02 0.04 0.04 0.21 1.0 0.04 0.01 0.06 0.1 0.02 0.01 0.01 0.04
0.1 0.13 0.09 0.14 0.08 0.1 0.2 0.11 0.15 0.14 0.15 0.09 0.08 0.16 0.04 0.08 0.01 0.23 0.16 0.07 0.25 0.21 0.28 0.08 0.1 0.65 1.0 0.33 0.12 0.21 0.17 0.25 0.08 0.05 0.05
0.2 0.12 0.13 0.11 0.1 0.15 0.11 0.14 0.13 0.13 0.07 0.1 0.05 0.07 0.09 0.09 0.06 0.2 0.1 0.17 0.16 0.11 0.11 0.12 0.04 0.22 1.0 0.1 0.19 0.31 0.3 0.19 0.1 0.27 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.09 0.04 0.28 1.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.03 0.05 0.02 0.03 0.03 0.01 0.04 0.04 0.02 0.05 0.02 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.03 0.01 0.01 0.03 0.0 0.05 0.01 0.13 1.0 0.01 0.01 0.08 0.09 0.01 0.02 0.07 0.04
0.13 0.11 0.09 0.09 0.14 0.18 0.12 0.09 0.19 0.15 0.04 0.02 0.05 0.03 0.13 0.09 0.08 0.14 0.13 0.06 0.09 0.08 0.08 0.32 0.23 0.49 1.0 0.05 0.06 0.24 0.31 0.12 0.03 0.13 0.05
0.04 0.03 0.03 0.02 0.04 0.04 0.03 0.04 0.04 0.04 0.05 0.07 0.02 0.08 0.04 0.03 0.02 0.05 0.05 0.04 0.14 0.15 0.06 0.08 0.11 0.26 1.0 0.02 0.04 0.18 0.21 0.06 0.06 0.11 0.06
0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.05 0.02 0.02 0.02 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.0 0.02 0.02 0.04 0.07 0.04 0.06 0.08 0.12 0.32 1.0 0.01 0.17 0.22 0.38 0.03 0.01 0.05 0.02
0.01 0.01 0.01 0.01 0.03 0.02 0.01 0.03 0.03 0.02 0.04 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.03 0.08 0.06 0.05 0.07 0.12 0.47 1.0 0.02 0.06 0.16 0.27 0.02 0.02 0.03 0.04
0.08 0.09 0.06 0.07 0.06 0.08 0.08 0.07 0.11 0.1 0.08 0.1 0.03 0.03 0.02 0.03 0.01 0.06 0.08 0.03 0.11 0.14 0.04 0.08 0.13 0.31 1.0 0.09 0.04 0.16 0.25 0.03 0.1 0.08 0.15
0.1 0.1 0.06 0.1 0.05 0.09 0.11 0.1 0.11 0.11 0.05 0.07 0.07 0.04 0.03 0.05 0.01 0.17 0.16 0.03 0.14 0.12 0.07 0.06 0.01 0.31 1.0 0.15 0.06 0.11 0.07 0.13 0.07 0.15 0.21
0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.02 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.05 0.03 0.05 0.06 0.08 0.35 1.0 0.01 0.06 0.16 0.29 0.01 0.02 0.02 0.03
0.02 0.04 0.02 0.03 0.02 0.03 0.03 0.03 0.02 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.03 0.02 0.02 0.05 0.04 0.02 0.04 0.07 0.29 1.0 0.01 0.02 0.12 0.2 0.01 0.01 0.0 0.01
0.07 0.09 0.05 0.07 0.06 0.08 0.09 0.05 0.09 0.09 0.07 0.1 0.07 0.08 0.06 0.05 0.01 0.12 0.12 0.03 0.1 0.11 0.08 0.08 0.03 0.25 1.0 0.08 0.04 0.11 0.08 0.08 0.09 0.1 0.11
0.08 0.19 0.08 0.12 0.07 0.11 0.07 0.09 0.05 0.12 0.06 0.06 0.01 0.01 0.04 0.04 0.02 0.05 0.03 0.02 0.08 0.13 0.02 0.04 0.03 0.27 1.0 0.01 0.01 0.16 0.24 0.05 0.07 0.02 0.01
0.04 0.04 0.03 0.04 0.03 0.04 0.04 0.07 0.05 0.05 0.12 0.08 0.01 0.04 0.03 0.01 0.03 0.03 0.04 0.02 0.0 0.01 0.0 0.05 0.04 0.26 1.0 0.04 0.09 0.1 0.12 0.05 0.06 0.08 0.05
0.07 0.08 0.06 0.07 0.04 0.07 0.08 0.1 0.08 0.08 0.06 0.07 0.05 0.03 0.04 0.04 0.02 0.06 0.07 0.04 0.02 0.04 0.02 0.05 0.04 0.3 1.0 0.1 0.05 0.09 0.08 0.05 0.08 0.15 0.13
0.08 0.08 0.07 0.06 0.11 0.11 0.05 0.05 0.14 0.11 0.08 0.05 0.09 0.02 0.07 0.09 0.01 0.07 0.06 0.05 0.14 0.1 0.15 0.17 0.15 0.24 1.0 0.08 0.07 0.11 0.2 0.03 0.06 0.12 0.21
0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 0.06 0.03 0.02 0.01 0.01 0.03 0.03 0.01 0.01 0.0 0.05 0.06 0.03 0.08 0.06 0.02 0.09 0.04 0.16 1.0 0.01 0.1 0.14 0.17 0.06 0.01 0.06 0.08
0.05 0.04 0.03 0.03 0.04 0.04 0.03 0.05 0.05 0.04 0.03 0.03 0.03 0.02 0.05 0.04 0.03 0.05 0.05 0.04 0.11 0.13 0.03 0.27 0.16 0.18 1.0 0.04 0.05 0.15 0.19 0.06 0.04 0.05 0.15
0.04 0.04 0.05 0.03 0.06 0.06 0.04 0.05 0.06 0.05 0.07 0.07 0.01 0.05 0.03 0.02 0.03 0.03 0.04 0.02 0.03 0.08 0.02 0.04 0.01 0.12 1.0 0.02 0.02 0.09 0.06 0.07 0.07 0.07 0.04
0.09 0.14 0.09 0.11 0.09 0.11 0.09 0.12 0.09 0.1 0.06 0.07 0.05 0.04 0.04 0.05 0.03 0.08 0.08 0.04 0.09 0.11 0.05 0.13 0.04 0.21 1.0 0.04 0.05 0.24 0.29 0.08 0.07 0.16 0.12
0.02 0.01 0.02 0.03 0.06 0.01 0.0 0.02 0.01 0.01 0.05 0.06 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.07 0.02 0.03 0.08 0.66 1.0 0.01 0.02 0.1 0.21 0.01 0.06 0.0 0.01
0.02 0.03 0.02 0.03 0.02 0.03 0.05 0.02 0.03 0.04 0.03 0.04 0.01 0.02 0.02 0.03 0.01 0.04 0.07 0.05 0.01 0.03 0.01 0.04 0.02 0.26 1.0 0.05 0.02 0.04 0.02 0.06 0.05 0.08 0.08
0.02 0.03 0.03 0.03 0.02 0.03 0.04 0.03 0.03 0.03 0.03 0.04 0.02 0.05 0.01 0.01 0.02 0.02 0.03 0.03 0.0 0.01 0.0 0.03 0.01 0.26 1.0 0.01 0.02 0.04 0.03 0.03 0.04 0.05 0.03
0.02 0.01 0.01 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.32 1.0 0.0 0.01 0.02 0.03 0.01 0.02 0.01 0.0
0.14 0.19 0.14 0.17 0.11 0.21 0.19 0.18 0.18 0.18 0.14 0.19 0.09 0.18 0.11 0.07 0.1 0.14 0.19 0.09 0.12 0.22 0.08 0.17 0.05 0.42 1.0 0.15 0.13 0.32 0.21 0.34 0.2 0.28 0.27
0.07 0.06 0.09 0.05 0.04 0.08 0.03 0.11 0.07 0.07 0.04 0.06 0.03 0.03 0.11 0.08 0.09 0.08 0.12 0.02 0.16 0.23 0.04 0.07 0.02 0.45 1.0 0.04 0.04 0.1 0.1 0.07 0.05 0.08 0.04
0.04 0.05 0.02 0.04 0.02 0.06 0.07 0.08 0.08 0.08 0.02 0.04 0.04 0.01 0.01 0.01 0.0 0.15 0.07 0.01 0.03 0.02 0.02 0.01 0.01 0.29 1.0 0.01 0.03 0.09 0.06 0.12 0.03 0.15 0.01
0.03 0.09 0.02 0.07 0.02 0.03 0.05 0.08 0.03 0.01 0.02 0.03 0.01 0.0 0.01 0.03 0.0 0.03 0.07 0.0 0.01 0.01 0.0 0.02 0.0 0.26 1.0 0.03 0.01 0.1 0.17 0.03 0.01 0.14 0.01
0.06 0.06 0.06 0.05 0.07 0.05 0.04 0.1 0.04 0.04 0.07 0.08 0.07 0.04 0.03 0.04 0.03 0.06 0.05 0.07 0.04 0.08 0.03 0.07 0.03 0.44 1.0 0.06 0.06 0.11 0.16 0.04 0.07 0.1 0.07
0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.02 0.02 0.01 0.03 0.02 0.05 0.01 0.02 0.03 0.01 0.02 0.04 0.04 0.04 0.04 0.03 0.07 0.09 0.49 1.0 0.04 0.06 0.13 0.2 0.02 0.02 0.02 0.03
0.04 0.06 0.04 0.06 0.04 0.04 0.05 0.08 0.03 0.04 0.13 0.14 0.01 0.1 0.06 0.03 0.04 0.09 0.13 0.02 0.06 0.13 0.04 0.08 0.01 0.29 1.0 0.03 0.02 0.12 0.15 0.09 0.13 0.15 0.02
0.03 0.05 0.04 0.06 0.06 0.06 0.08 0.04 0.06 0.06 0.01 0.01 0.03 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.05 0.05 0.06 0.06 0.03 0.01 0.0 0.38 1.0 0.09 0.01 0.13 0.12 0.02 0.01 0.0 0.0
0.01 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.0 0.02 0.09 0.62 1.0 0.0 0.01 0.08 0.18 0.01 0.04 0.0 0.01
0.03 0.02 0.01 0.01 0.26 0.03 0.02 0.11 0.01 0.01 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.04 0.12 0.09 0.0 0.0 0.33 1.0 0.01 0.0 0.03 0.04 0.0 0.01 0.0 0.01
0.13 0.16 0.11 0.15 0.11 0.15 0.16 0.09 0.16 0.19 0.15 0.17 0.06 0.11 0.07 0.1 0.03 0.22 0.2 0.06 0.17 0.23 0.16 0.1 0.03 0.56 1.0 0.18 0.1 0.15 0.11 0.19 0.15 0.16 0.12

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)