Heatmap: Cluster_99 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4h after treatment
4h after treatment,No nitrate
8h after treatment
8h after treatment,No nitrate
20C
20h after treatment
20h after treatment,No nitrate
20h after treatment,Nocodazole added
36h after treatment
36h after treatment,No phosphate
Blue light,10min after light change
Blue light,60min after light change
Bohlin
CCAP1055/1,20C
CCAP1055/1,20C,High CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Low CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Normal CO2,OligoDT primed
CCMP2561
CCMP2561 Nitrase Reductase Knockout
CCMP632
CCMP632,24h
CCMP632,48h
CCMP632,72h
CCMP632,High light acclimated WT
CCMP632,Low light acclimated WT
NEPCC640,8h,1000ppmv CO2
NEPCC640,8h,390 ppmv CO2
No light,8h after treatment
Pt-1
Pt-1 8.6
Pt-1 8.6,With nitrogen
Pt-1 8.6,Without nitrogen
Red light,0min before light change
UTEX 646,Blue light
UTEX 646,No light
-0.44 -0.55 -0.55 -0.44 -0.07 -0.44 -0.41 -1.24 0.46 0.23 0.58 0.63 -1.89 0.15 -0.58 -0.56 -1.87 0.53 -0.23 0.19 0.9 0.41 1.45 0.2 -0.2 -0.6 -1.22 0.99 0.08 -1.26 -1.36 -0.86 0.78 -0.15 0.26
0.18 0.36 -0.17 0.29 0.34 0.49 0.61 -0.33 0.7 0.63 -0.52 -0.44 -0.94 -1.12 -0.06 -0.24 0.39 0.07 0.01 -0.48 0.94 0.8 0.65 -0.1 -0.96 -1.15 -1.61 0.72 -1.22 -0.5 -0.99 0.14 -0.46 -0.52 -0.43
0.23 0.14 -0.25 -0.6 -1.42 -0.06 -1.3 -0.63 -0.18 -0.58 1.32 1.48 -2.42 -2.28 0.07 -1.06 -0.51 -1.11 -0.77 -1.87 0.45 1.47 -1.21 -1.14 -1.69 0.29 0.12 -0.35 -3.03 0.39 0.74 -2.24 1.1 1.48 0.46
-0.2 -0.12 -0.54 -0.47 -0.22 -0.07 -0.13 -0.89 -0.01 0.07 -0.79 -0.45 0.33 0.89 0.76 0.48 0.08 -0.22 0.1 0.46 0.99 1.04 0.98 0.32 -0.59 -1.24 -1.81 -1.09 -1.02 -0.43 -0.73 -0.23 -0.59 0.33 -0.15
-0.26 -0.27 -0.48 -0.47 0.08 -0.31 -0.38 -0.83 -0.13 -0.07 0.45 0.41 -0.19 -0.14 0.19 -0.5 -0.6 0.08 -0.2 -1.22 1.07 0.88 1.04 -0.14 -0.14 -0.87 -0.89 0.32 -0.78 -0.2 -0.36 -0.03 0.23 0.23 0.84
-0.09 0.01 -0.18 -0.14 -0.89 -0.14 -0.19 -0.47 -0.17 0.07 0.04 0.42 -0.03 -0.37 -0.75 -1.02 -1.31 -0.3 -0.01 -0.31 0.94 1.1 0.25 0.03 -1.09 -0.4 -0.87 0.58 -1.06 0.19 0.15 0.1 0.56 0.02 1.16
-0.39 0.09 -0.59 0.05 -0.27 -0.03 0.33 -0.68 0.16 0.34 0.15 0.58 -0.76 0.09 -1.06 -0.79 -2.8 -0.07 0.03 -0.67 1.05 0.65 1.0 0.19 -0.61 -1.48 -2.14 -0.25 -0.64 0.28 -0.4 0.81 0.46 0.16 0.68
0.01 0.1 -0.55 0.07 0.06 0.04 0.28 -0.18 0.09 0.09 -0.03 -0.02 -1.12 -1.27 0.11 -0.58 0.03 -0.07 0.33 -0.57 0.89 0.6 0.4 -0.19 -1.16 0.15 -0.74 0.05 -0.79 -0.05 0.07 0.06 -0.2 1.05 0.07
-1.09 -0.63 -1.02 -0.63 -0.83 -1.08 -0.67 -0.46 -0.78 -0.33 1.33 1.05 -0.34 0.54 -1.96 -1.05 -5.71 -0.02 -0.26 -1.57 1.43 1.21 1.2 -1.1 -1.82 -2.56 -2.86 0.43 0.11 -0.76 -1.49 0.14 0.99 0.99 1.27
-1.56 -0.37 -0.73 0.31 -0.35 0.23 1.53 0.04 -1.0 -0.39 -0.37 -0.84 -0.65 0.57 -3.37 -4.16 -4.71 0.53 1.0 -2.05 1.07 1.33 1.11 0.71 -1.41 -4.39 -5.05 -3.13 -1.22 1.18 -0.2 1.86 -0.47 -3.72 -0.71
-0.48 -0.17 -0.72 -0.21 0.19 -0.23 -0.18 -0.71 -0.02 -0.02 0.55 0.63 -1.63 0.37 -0.65 -0.79 -1.35 -0.16 0.33 -0.87 1.14 1.23 0.95 0.19 -0.43 -1.69 -1.85 0.16 -1.33 -0.24 -0.56 -0.17 0.66 -0.58 1.25
0.43 0.03 -0.15 -0.2 -0.51 0.17 -0.09 -0.25 0.23 0.06 0.07 0.11 -1.44 -0.66 -0.33 -0.84 -0.5 -0.63 -0.3 -1.28 0.66 1.05 -0.2 0.84 -0.64 -0.97 -1.1 0.18 -0.64 0.13 0.79 -0.12 0.44 -0.22 1.2
-0.17 0.14 -0.32 0.18 0.02 0.12 0.47 -0.2 0.06 0.16 -0.95 -0.69 -0.45 -0.55 -0.8 -0.36 -2.05 0.09 0.53 -0.62 0.73 0.69 0.34 0.64 -0.23 -0.48 -1.46 -0.04 -1.03 0.79 0.54 0.94 -0.8 0.09 0.03
-0.23 -0.08 -0.61 -0.33 -0.18 0.21 0.11 -0.89 0.42 0.45 0.4 0.27 -0.75 0.4 -0.53 -1.42 0.14 -0.69 -0.31 0.13 0.95 0.81 0.92 -0.07 -1.22 -1.2 -1.49 0.67 -0.89 -1.11 -1.3 -1.08 0.37 0.12 1.41
0.25 -0.03 -0.23 -0.5 0.22 0.37 -0.67 -0.57 0.52 0.29 0.42 0.25 -2.02 -1.2 0.5 -0.73 0.13 -0.45 -0.26 -1.52 1.03 1.32 0.64 0.27 -1.59 -1.71 -1.75 1.03 -2.38 -0.54 -0.43 -1.72 0.46 0.46 0.74
-0.32 -0.13 -0.56 -0.19 -0.29 0.07 0.07 -0.57 0.06 0.38 0.88 0.76 -1.33 -0.21 -0.92 -0.67 -3.28 0.07 0.14 -1.14 0.8 1.16 0.48 -0.2 -0.6 -1.14 -0.54 -0.83 -2.24 -0.25 -0.51 -0.5 1.02 -0.3 1.69
0.07 0.14 -0.08 -0.02 -0.35 0.11 -0.03 -0.15 0.04 0.19 0.19 0.34 -1.41 0.18 -0.31 -0.79 -0.83 -0.49 0.21 -1.52 0.94 1.57 0.16 0.58 -1.17 -1.64 -1.92 -0.4 -1.17 -0.28 -0.26 -0.67 0.43 0.66 0.98
-0.72 -0.18 -0.39 -0.17 -0.35 -0.36 0.02 -0.37 -0.07 -0.06 0.03 0.35 -0.99 -0.21 -0.97 -0.89 -1.23 -0.38 -0.06 -0.81 1.45 1.56 0.19 0.08 -1.07 -1.58 -0.27 0.19 -1.1 0.51 -0.08 0.51 0.16 0.61 0.7
-0.23 0.2 -0.27 0.08 -0.63 0.27 0.67 -0.7 1.06 0.68 -1.06 -0.79 -1.15 -0.11 -0.13 0.12 -1.15 0.47 0.67 -1.4 0.64 0.56 -0.02 0.3 -2.18 -1.89 -1.51 -0.18 -0.53 -0.51 -1.23 -0.17 -0.79 0.97 1.55
0.08 -0.0 0.01 -0.11 -0.23 0.35 0.06 -0.37 0.56 0.42 0.29 0.4 -0.48 -0.96 -0.41 -0.77 -0.85 -0.58 -0.27 -1.32 1.58 1.51 0.98 0.25 -2.01 -2.85 -3.45 -0.12 -1.71 -0.81 -0.96 -0.89 0.44 0.31 0.82
-1.49 0.12 -0.83 0.26 -0.91 -0.58 0.74 -1.11 0.0 0.03 0.39 0.58 0.66 0.31 -1.2 -1.21 -2.15 0.21 0.39 0.09 1.25 1.03 1.21 -0.51 -1.6 -1.53 -1.6 0.51 -0.33 -0.9 -2.28 -0.19 0.3 -0.02 0.76
-0.04 0.25 -0.09 0.36 0.14 0.44 0.39 0.26 0.84 0.6 0.01 0.05 -0.41 -1.1 -0.8 -0.63 -1.45 -0.5 -0.06 -0.53 0.9 0.9 0.5 -0.39 -1.56 -0.61 -0.8 0.73 -0.74 -0.43 -0.32 -0.56 -0.19 -0.13 0.47
-0.18 -0.11 -0.32 -0.08 0.08 -0.01 0.08 -0.44 0.1 0.2 -0.11 -0.02 0.13 -0.12 -0.31 -0.69 -1.16 0.2 0.24 -1.17 1.02 0.77 0.33 0.5 -1.07 -0.87 -1.06 0.26 -0.79 0.15 -0.08 0.32 -0.18 0.3 0.77
-0.67 -0.32 -0.87 -0.54 -0.33 -0.29 -0.29 -1.15 -0.05 -0.07 0.77 0.61 -0.41 0.59 -0.18 -0.48 -1.16 0.24 -0.1 -0.47 1.5 1.69 1.41 -0.46 -1.05 -1.48 -1.72 -0.41 -1.82 -0.95 -1.14 -0.78 0.24 0.29 0.67
-1.3 -0.6 -1.17 -0.27 -0.8 -0.58 0.12 -0.48 -0.1 -0.3 0.43 0.35 -0.25 -0.05 -1.24 -1.2 -2.52 -0.52 0.15 -0.15 1.55 0.88 0.5 0.38 -0.41 -1.78 -0.75 -0.13 -1.18 0.77 0.7 0.07 -0.13 0.46 1.34
0.37 0.56 0.11 0.48 -0.09 0.42 0.49 -0.18 0.43 0.41 -0.47 -0.06 -0.77 -0.14 -0.01 -0.31 -1.59 0.42 0.6 -0.74 0.39 0.93 0.09 -0.21 -2.72 -1.58 -1.98 -0.12 -1.47 -0.09 -0.46 0.17 -0.08 1.01 -0.23
-0.0 0.49 -0.16 0.49 0.46 0.29 0.81 0.3 0.33 0.48 -0.38 -0.31 0.09 -0.69 -1.15 -1.14 -0.48 -0.27 0.11 -1.66 0.7 0.88 0.12 -0.4 -0.97 -1.27 -1.92 1.03 -0.75 -0.02 -0.65 0.61 -0.37 -0.76 0.39
0.32 0.43 -0.19 0.12 0.24 0.43 -0.14 -0.4 0.1 0.19 -0.17 -0.05 -1.27 -1.76 -0.39 -0.79 -0.78 0.03 0.49 -1.02 1.58 0.8 0.79 -0.31 -0.88 -2.06 -3.25 0.45 -1.28 -0.32 -0.52 0.03 -0.14 0.83 0.59
-0.1 0.38 -0.08 0.47 -0.56 0.04 0.5 -0.09 0.23 0.29 -0.17 -0.36 -0.85 -1.0 -0.43 -0.89 -0.38 0.25 0.63 -1.01 1.31 0.79 0.63 -0.34 -1.21 -1.5 -1.41 0.68 -0.43 -0.47 -0.89 -0.14 -0.38 0.22 0.87
0.22 0.8 -0.17 0.54 0.14 0.66 0.77 -0.46 0.87 0.89 -0.46 -0.19 -1.34 -1.93 -0.14 -1.13 -0.68 0.06 0.11 -0.97 0.69 0.57 0.4 -0.98 -2.25 -0.17 -1.22 0.4 -1.47 0.05 -0.91 0.71 -0.14 0.3 -0.78
-0.45 -0.02 -0.27 0.18 -0.55 -0.31 0.6 -0.73 0.54 0.32 -0.51 -0.38 0.44 -1.22 0.01 0.34 -0.26 0.1 0.81 0.5 1.72 1.01 0.78 -1.23 -2.42 -2.43 -3.16 1.36 -0.89 -1.17 -1.75 -0.56 -0.04 -1.41 -0.77
-0.82 0.14 -1.0 0.46 0.32 -0.19 0.72 -0.02 0.08 0.27 -0.88 -0.44 -0.14 -1.3 -2.24 -1.15 -4.38 -0.08 0.25 -0.36 0.35 0.8 1.34 -0.12 -0.09 -0.37 -0.2 -0.46 -0.68 0.91 0.46 0.83 -0.55 0.27 -0.17
-0.18 0.17 -0.37 -0.11 -0.21 0.32 0.09 -0.81 0.42 0.23 0.15 0.46 -0.79 0.32 -0.1 0.02 -0.55 -0.17 0.22 -1.2 0.83 1.52 0.66 0.15 -1.61 -3.42 -3.51 0.22 -1.41 -0.58 -1.16 -0.45 0.31 -0.08 1.12
-0.04 0.14 -0.15 0.14 -0.15 0.29 0.39 -0.16 0.57 0.58 -0.3 -0.02 0.05 -0.36 -0.14 -0.34 -0.31 -0.51 -0.13 -0.8 1.05 1.33 0.71 -0.13 -1.34 -0.6 -1.2 0.34 -1.0 -0.47 -1.11 -0.25 -0.16 0.06 -0.07
0.27 0.19 -0.07 0.02 0.01 0.69 0.28 1.01 0.65 0.4 -1.1 -0.71 -0.89 -0.76 -0.12 -0.22 -1.11 -0.01 0.17 -0.75 1.29 1.23 0.7 0.14 -1.57 -2.85 -2.83 -0.21 -1.36 -0.29 -0.93 0.22 -0.86 0.48 -0.09
-0.18 0.02 -0.32 0.11 -0.11 -0.2 0.39 0.06 0.01 0.2 -0.56 -0.23 -0.46 -0.7 -0.75 -0.96 -1.87 0.08 0.4 -0.93 1.15 0.53 0.52 0.22 -0.62 -1.1 -1.84 0.14 -0.63 0.28 -0.51 0.94 -0.42 0.95 0.89
0.1 0.56 -0.1 0.51 0.03 0.28 0.75 -0.3 0.42 0.48 -0.39 -0.24 -0.4 -0.21 -0.98 -1.64 -0.99 -0.56 -0.21 -0.48 1.09 0.85 0.84 0.8 -0.88 -1.98 -2.77 0.41 -1.3 0.04 -0.31 0.49 -0.24 -0.32 -0.33
0.34 0.44 0.04 0.14 -0.57 0.39 0.32 0.2 0.1 0.21 -0.11 -0.44 0.11 -0.83 -0.3 -0.89 0.22 -0.04 0.38 -1.09 0.66 0.42 -0.06 0.12 -0.95 -1.08 -1.4 0.17 -1.1 0.59 0.21 0.76 -0.8 0.22 0.11
-2.33 -1.24 -2.11 -0.5 0.42 -1.65 0.12 -2.34 -0.52 -0.75 0.5 0.45 0.51 -0.26 -0.7 -1.28 -1.98 0.29 0.12 -0.1 1.12 1.1 1.52 -1.09 0.99 -0.95 -1.0 0.48 -0.06 -0.87 -0.95 -0.15 0.63 0.01 1.07
-0.78 -0.54 -0.68 -0.3 -0.45 -0.52 -0.13 -0.74 -0.19 -0.22 0.07 -0.05 -0.05 -0.3 -0.81 -0.97 -0.82 0.26 0.31 -1.21 1.31 0.35 1.07 -0.04 0.3 -1.1 -0.54 0.88 -0.47 -0.12 -0.77 0.18 -0.32 0.22 1.56
0.03 0.39 0.08 0.51 -0.28 0.29 0.42 0.14 0.52 0.67 -0.06 -0.12 -0.86 -0.36 -1.74 -1.56 -3.56 0.1 0.14 -0.29 1.24 0.37 0.62 -0.4 -3.2 -3.32 -3.89 0.96 -0.03 -0.63 -1.79 -0.23 -0.13 0.45 1.33
-0.11 0.25 -0.39 0.38 0.02 0.1 1.03 -0.41 0.78 0.61 -0.24 -0.41 -1.45 -0.58 -1.1 -1.29 -2.11 0.09 0.76 0.53 0.83 0.82 0.78 -0.35 -1.72 -2.5 -2.83 0.82 -0.1 -1.02 -1.94 -0.38 -0.28 -0.19 1.12
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0.06 0.27 -0.24 0.04 0.25 0.19 -0.16 -0.23 0.16 0.17 -0.11 -0.7 -0.72 -1.87 0.32 0.06 0.61 0.08 0.78 -0.39 0.74 1.17 0.75 -0.12 -0.4 -1.51 -2.15 1.15 -0.36 -0.54 -0.46 -0.43 -0.73 -1.04 -0.59
-0.13 0.05 0.02 0.28 -0.21 0.25 0.27 -0.13 0.86 0.71 0.38 0.48 -0.87 -1.16 -1.28 -1.15 -1.59 -0.21 -0.2 -0.6 0.59 0.95 0.25 -0.14 -1.6 -0.6 -1.06 0.6 -1.48 0.09 -0.15 0.49 0.53 0.46 -0.23
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0.33 0.43 -0.1 0.13 0.27 0.55 0.24 -0.46 0.62 0.39 -0.62 -0.44 -0.33 -1.39 0.24 -0.26 -0.17 0.04 0.65 -0.6 1.13 0.93 0.72 0.12 -0.9 -1.3 -1.79 0.69 -1.33 -0.14 -0.01 -0.55 -0.29 -1.3 -1.58
0.14 0.21 -0.13 -0.02 -0.07 0.34 0.3 -0.04 0.18 0.18 -0.04 -0.09 -0.92 0.16 -0.46 -1.06 0.11 0.04 -0.44 -0.4 1.35 1.51 0.85 -0.14 -1.37 -1.23 -2.2 -0.07 -1.4 -0.42 -0.43 -0.13 -0.18 0.42 -0.51
0.03 0.02 -0.84 -0.25 -1.01 -0.56 0.42 -0.56 -0.0 0.0 0.46 -0.84 0.23 -3.09 0.01 0.42 0.14 0.13 0.72 -2.4 0.04 2.27 0.73 -1.13 -1.58 -2.19 -2.25 2.42 -0.99 -0.8 -1.4 -0.59 -1.7 -2.58 -3.55
-0.24 0.27 -0.35 0.18 -0.43 0.41 0.7 0.18 0.75 0.77 -1.08 -0.88 -1.31 -0.93 -0.7 -0.61 -0.68 -0.01 0.69 -0.74 0.82 0.56 -0.31 -0.24 -1.87 -1.28 -1.97 1.55 -0.49 -0.12 0.11 -0.28 -0.26 -0.61 0.98
-0.14 -0.03 -0.36 0.04 0.1 0.17 0.3 -0.74 0.44 0.51 -0.0 0.28 -0.43 0.23 -0.85 -1.05 -0.83 -0.2 -0.15 -1.04 0.97 0.7 1.04 -0.35 -0.58 -1.92 -2.24 0.87 -0.95 -0.4 -1.04 0.08 0.19 -0.01 1.1
0.34 0.47 0.08 0.3 -0.06 0.46 0.43 -0.22 0.45 0.5 -0.13 0.12 -0.81 -1.26 0.11 -0.36 -1.48 0.2 0.49 -0.19 0.72 0.81 0.15 0.42 -1.17 -1.61 -2.12 0.46 -1.16 -0.3 -0.56 -0.1 0.09 0.2 -0.31
-0.86 -0.39 -0.79 -0.25 -0.05 -0.46 0.25 -0.81 -0.05 0.11 -1.0 -1.08 0.53 1.04 -0.32 -0.38 0.55 0.09 0.55 0.04 0.53 0.37 1.12 0.56 -0.08 -1.63 -2.18 -1.45 -0.92 0.75 -0.4 1.32 -1.32 -0.18 -0.48
-0.55 -0.12 -0.7 0.06 -0.08 -0.12 0.49 -0.56 0.02 0.2 -0.54 -0.28 -0.04 -0.42 -0.39 -0.94 -0.32 -0.09 -0.08 -0.75 0.93 0.74 0.9 0.0 -0.02 -0.74 -0.34 -0.66 -0.69 0.68 0.02 1.0 -0.37 0.1 0.38
0.15 -0.09 -0.12 0.08 -0.62 0.37 0.25 -0.17 0.27 0.43 -0.1 -0.02 -0.25 -1.35 0.83 -0.15 0.68 0.4 0.57 -0.85 0.85 0.72 0.23 -0.05 -1.45 -2.08 -2.15 0.22 -1.14 -0.72 -1.21 -0.41 -0.09 0.75 0.21
-0.13 -0.09 -0.2 0.03 -0.54 -0.09 0.42 -0.65 0.19 0.32 0.24 0.69 -1.25 0.23 -0.98 -0.79 -1.86 -0.25 -0.21 -0.72 1.25 0.49 1.14 0.06 -0.59 -2.74 -4.55 -0.02 -0.08 -0.15 -1.19 0.48 0.59 0.5 0.78
-0.3 0.51 -0.03 0.28 -0.63 -0.28 0.2 0.28 -0.49 -0.06 -1.06 -0.82 0.59 -0.81 -0.94 -0.87 -1.74 0.14 0.4 -0.02 0.68 0.53 -0.68 0.14 -0.83 -0.56 -1.16 -1.08 0.25 0.97 0.1 1.39 -1.01 0.78 0.25
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-0.26 1.12 -0.19 1.19 -0.23 0.47 1.64 0.5 0.44 0.72 -1.16 -1.0 -0.87 -0.31 -1.78 -2.24 -1.48 -0.21 -0.34 -0.09 1.01 0.95 0.46 0.08 -1.27 -1.59 -2.15 -0.78 -2.29 0.16 -0.51 0.94 -1.07 -0.93 -1.26
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.