Heatmap: Cluster_25 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4h after treatment
4h after treatment,No nitrate
8h after treatment
8h after treatment,No nitrate
20C
20h after treatment
20h after treatment,No nitrate
20h after treatment,Nocodazole added
36h after treatment
36h after treatment,No phosphate
Blue light,10min after light change
Blue light,60min after light change
Bohlin
CCAP1055/1,20C
CCAP1055/1,20C,High CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Low CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Normal CO2,OligoDT primed
CCMP2561
CCMP2561 Nitrase Reductase Knockout
CCMP632
CCMP632,24h
CCMP632,48h
CCMP632,72h
CCMP632,High light acclimated WT
CCMP632,Low light acclimated WT
NEPCC640,8h,1000ppmv CO2
NEPCC640,8h,390 ppmv CO2
No light,8h after treatment
Pt-1
Pt-1 8.6
Pt-1 8.6,With nitrogen
Pt-1 8.6,Without nitrogen
Red light,0min before light change
UTEX 646,Blue light
UTEX 646,No light
-0.37 -0.69 -0.77 0.33 -0.3 0.1 1.24 -0.5 -0.43 -0.44 -11.01 - -3.42 -10.47 -3.03 -2.25 -4.22 -0.5 4.14 -1.7 -1.56 -0.36 -1.41 -1.92 -2.79 -2.06 -3.22 0.23 -0.27 -0.67 -1.02 -0.23 - -10.82 -
-1.17 0.21 -0.87 -0.35 -0.02 -0.41 0.22 -0.75 0.23 0.02 -7.55 -6.57 - -1.45 0.24 0.24 -1.17 -0.13 0.6 0.96 0.43 1.87 0.36 1.24 0.72 - - 0.65 1.33 0.79 1.37 -2.88 -7.41 - -
1.04 1.32 0.28 0.85 -1.14 0.78 1.22 -0.35 0.95 1.87 -3.86 -3.29 -2.58 -4.37 -2.01 -0.89 -3.86 0.74 1.19 -1.1 -1.24 -0.96 -1.58 -1.46 -2.72 -3.92 -3.76 1.92 -0.43 0.46 -0.71 1.0 -3.52 -2.15 -2.91
0.81 1.19 0.28 0.94 -0.04 0.74 0.99 -0.04 1.14 1.39 -2.36 -2.26 -3.76 -5.3 0.33 -0.14 -3.48 0.86 1.06 -0.6 -0.41 0.36 -1.78 -0.54 -3.57 -1.23 -2.2 1.09 -0.62 -0.29 -1.06 0.32 -2.59 -1.32 -1.11
-0.05 0.2 -0.03 0.94 -1.2 -0.09 1.14 -0.42 0.93 0.78 -3.31 -3.24 - -4.26 -0.07 -0.48 -0.66 1.14 1.76 -0.91 0.74 0.18 -1.4 -0.75 -2.24 -1.58 -1.94 1.98 0.19 0.01 -2.14 1.04 -3.34 -1.97 -3.94
0.79 1.01 -0.02 0.69 -1.16 0.66 1.07 -0.73 0.69 1.48 -0.22 0.37 0.8 -0.4 -2.54 -1.63 -4.28 -0.01 0.65 -1.47 -1.36 -1.01 -1.52 -1.71 -3.16 -1.92 -1.74 1.19 -1.04 -0.08 -1.61 0.67 0.16 0.7 -0.3
0.76 1.12 0.46 0.85 -0.38 0.81 1.11 0.35 1.04 1.22 -10.01 -9.27 -8.29 - -0.93 -0.26 -3.33 0.77 0.95 -0.17 -0.42 0.64 -0.73 -0.37 -2.31 -6.8 -5.59 1.67 0.28 0.25 -0.1 0.17 -9.99 -5.18 -5.78
0.06 0.34 -0.09 0.11 -0.69 0.04 0.39 0.03 0.37 0.55 -9.59 -9.46 -8.83 - 0.57 0.84 -0.6 0.78 0.91 -0.7 1.53 2.05 1.09 0.19 -1.82 - -10.33 0.87 -0.42 -0.12 -0.82 0.06 -8.84 -3.79 -4.84
0.47 0.12 -0.11 0.13 0.09 0.71 0.28 -0.29 0.92 0.74 -0.39 -0.64 -1.96 -2.17 0.58 -0.3 0.17 0.11 1.11 -1.11 -0.74 -0.51 -1.5 0.29 -0.84 -0.66 0.06 0.15 -1.2 0.02 0.41 -1.11 -0.55 1.02 0.03
-0.96 -0.47 -0.45 -0.12 -1.03 -0.73 -0.34 0.06 -0.76 -0.39 0.33 0.62 0.07 1.04 -2.43 -0.96 -2.73 -0.7 1.81 -0.16 0.79 1.32 0.56 -0.42 -1.75 -1.65 -1.59 -0.43 -0.34 -0.21 -0.45 0.24 0.54 0.56 0.52
-0.41 0.19 -0.01 0.52 -0.74 -0.17 0.09 0.41 -0.45 0.04 -0.74 -0.42 -0.09 1.24 -3.38 -1.5 -3.85 -0.68 2.88 -0.81 -2.07 -0.96 -2.54 -0.71 -1.66 -1.19 -1.32 0.07 0.41 -0.08 -0.06 0.14 -0.21 -0.3 0.63
-0.21 0.08 0.48 0.41 -0.85 0.35 0.36 0.31 0.37 0.61 -0.9 -0.62 -1.31 -0.14 -0.08 -0.0 -0.17 0.06 1.26 -1.46 -0.31 -0.24 -1.58 0.46 -1.27 -0.31 -0.07 0.39 -0.38 0.2 -0.03 -0.23 -0.59 0.43 0.5
-0.15 0.67 0.08 0.99 -0.24 0.13 1.12 0.74 0.35 0.65 -0.51 -0.35 -0.09 -0.31 -0.51 0.16 -0.34 0.31 1.15 -1.24 0.16 0.38 -0.28 -0.7 -2.05 -0.73 -2.26 -0.11 -0.92 -0.55 -0.62 -0.2 -0.49 0.32 -0.73
-0.7 -0.35 -0.76 -0.14 -0.77 -0.43 0.41 0.0 -0.59 -0.42 0.11 -0.58 -0.7 0.77 0.08 -0.81 -0.44 0.23 1.51 -0.39 0.13 0.51 -0.16 0.07 -0.81 -0.64 -1.19 0.45 -1.16 0.31 -0.52 1.01 -0.53 0.75 0.65
-0.05 0.26 -0.39 -0.01 -0.21 0.47 0.21 -0.42 0.34 0.22 -0.3 -0.19 -1.43 1.81 -0.36 -0.74 -2.98 0.42 1.81 -1.0 0.83 0.41 0.49 -1.07 -2.84 -0.51 0.72 -0.17 -1.38 -1.24 -0.97 -1.35 -0.11 -0.45 -1.46
0.27 0.48 -0.39 0.21 -0.28 0.22 0.54 -0.29 0.11 0.15 -0.47 0.29 -1.26 0.18 -0.48 -1.29 -0.57 0.03 1.81 -1.7 0.42 0.94 -0.16 0.33 -1.6 -1.24 -1.84 -0.21 -1.59 0.12 -0.2 0.24 -0.21 0.75 -0.75
1.16 0.38 0.2 -0.24 -0.81 1.0 0.65 -0.24 -0.68 -1.18 -1.95 -1.42 -2.62 -2.99 0.57 -1.79 -0.16 0.87 1.58 -2.38 -0.69 -0.05 -1.63 0.04 -1.21 -0.82 -0.41 -2.61 -2.24 1.28 -0.26 2.09 -1.82 0.92 -3.92
-1.78 -0.7 -5.31 -0.54 -0.84 -0.38 0.64 -4.7 -1.87 -2.19 -2.72 -2.6 -2.99 2.06 0.42 -0.69 -2.24 -0.59 2.53 1.28 -2.9 0.59 -2.33 1.06 -1.07 - -4.58 0.07 -2.21 0.84 -2.44 1.55 -2.52 -0.87 1.59
-0.16 0.17 -0.15 0.28 -0.83 0.01 0.54 -0.26 0.16 0.43 0.54 0.25 -1.17 -0.81 -0.32 -0.48 0.1 0.14 0.95 -0.9 0.18 0.63 -0.45 0.39 -1.92 -1.15 -1.1 -0.86 -1.06 0.16 -0.37 0.15 0.08 0.65 1.12
0.05 0.36 0.59 0.71 -0.91 0.2 0.04 0.39 -0.55 -0.2 -1.02 -0.58 -2.05 0.38 -0.11 -0.62 -1.13 0.51 1.86 -1.51 0.62 1.06 -1.04 -0.27 -2.72 -0.09 -1.68 -1.8 0.63 -0.07 0.4 -0.4 -0.79 0.96 -3.51
0.13 0.34 0.01 0.32 -0.27 0.36 0.34 -0.01 0.44 0.12 0.54 0.07 -0.69 -1.09 -0.62 -0.27 -1.01 0.24 1.22 -1.0 0.07 0.41 -0.02 -0.11 -1.64 -1.2 -1.08 0.04 -0.36 -0.0 -0.08 -0.36 -0.08 0.72 0.42
0.22 0.36 0.15 0.5 -0.32 0.66 0.79 -0.49 0.75 0.68 -0.75 -0.56 -1.89 -0.91 -0.17 -0.41 -1.45 0.57 2.72 -0.56 -0.27 0.13 -1.0 -1.15 -2.26 -1.89 -2.65 -0.67 -0.86 -1.05 -1.03 -1.0 -0.52 0.78 -0.96
-1.78 -0.66 0.69 1.02 -1.6 -0.23 1.54 -0.36 -1.31 -0.78 -1.63 -1.47 -1.17 2.51 -3.51 -2.89 -3.52 -1.07 3.39 -2.09 0.25 -0.64 -2.66 -2.83 -5.13 -2.92 -4.26 -2.56 0.95 -1.69 -4.55 -0.55 -1.29 -2.21 -2.95
0.18 -0.6 -0.32 -1.2 -0.87 -0.3 -1.36 -0.28 -0.9 -0.83 0.88 -0.53 -1.45 -2.96 1.21 0.29 0.38 0.49 2.03 -1.28 0.11 0.41 0.01 0.19 -0.8 -0.57 -0.48 0.24 -1.71 -0.22 -0.15 -0.45 -0.64 1.43 -0.51
-0.45 0.78 -0.59 0.42 -0.0 0.12 0.66 -0.53 0.3 0.31 -1.4 -0.94 0.52 -0.64 -0.66 -0.29 -1.02 0.82 1.63 -0.02 0.75 -0.09 0.15 -0.27 -1.64 -1.92 -2.66 -0.27 -1.17 0.15 -0.49 0.46 -0.9 0.23 0.55
0.02 0.28 -0.33 0.22 -0.6 -0.04 0.66 -0.32 0.09 0.2 -1.27 -0.48 -0.03 -1.57 -0.26 -0.11 0.28 0.67 1.37 0.12 0.38 0.26 -0.07 0.19 -0.78 -0.68 -0.76 -0.18 0.01 0.22 -0.33 0.44 -0.73 0.35 -1.17
0.27 0.85 0.19 0.97 -0.66 0.55 1.13 -0.34 0.56 0.89 -0.19 -0.11 -0.45 -0.7 -0.25 -0.23 -0.35 -0.03 1.23 -0.81 -1.35 -0.38 -1.95 -0.99 -2.18 -0.93 0.28 -0.25 -0.41 -0.4 -0.97 -0.01 0.19 0.87 -2.0
-0.49 0.08 -0.72 0.15 -0.15 -0.09 0.73 -0.68 0.2 0.05 -0.84 -1.48 0.8 1.0 -0.45 -0.9 -0.12 0.4 1.2 0.34 -0.03 -0.23 -0.58 0.26 -0.29 -0.2 -0.82 -0.2 -0.76 0.18 -0.12 0.58 -1.38 0.07 0.12
0.04 0.33 -0.1 0.12 -0.47 0.3 0.32 -0.12 0.27 0.37 -0.47 -0.16 0.1 -0.53 -0.13 -0.8 -0.3 0.24 0.85 -1.15 0.47 0.98 -0.22 -0.11 -2.5 -1.06 -1.57 0.12 -1.04 0.65 0.07 0.75 -0.43 0.42 -0.24
0.31 0.59 0.0 0.23 -0.54 0.25 0.51 0.12 0.58 0.7 -11.45 -11.48 -7.77 - 0.09 0.49 -0.98 1.11 1.44 -1.19 0.48 1.58 0.11 0.64 -1.43 -7.12 -5.89 1.23 -0.4 0.5 -0.18 0.54 -11.24 -6.43 -7.29
-0.58 -0.12 -0.91 -0.17 -0.51 -0.13 0.46 -1.33 0.51 0.27 -0.02 0.36 -1.34 -0.35 0.21 0.39 0.15 0.56 1.65 -0.87 0.58 0.75 0.35 -0.55 -1.63 -3.86 -5.35 0.61 -0.65 -0.85 -1.51 -0.17 0.07 0.56 0.81
-0.64 0.54 -0.35 0.78 -0.8 -0.02 1.2 -0.09 0.13 0.3 -0.87 -0.15 -1.1 0.47 -0.54 -0.29 -0.89 0.46 1.32 0.8 0.67 0.63 -0.76 0.69 -1.31 -1.25 -1.42 -0.43 -1.06 0.37 0.41 -0.87 -0.32 -1.16 -2.94
0.05 0.18 -0.35 0.14 -0.49 0.03 0.45 -0.85 0.07 0.16 -0.53 -0.71 0.02 -0.94 0.22 -0.18 -0.52 1.12 1.67 0.06 -0.62 -0.1 -0.75 0.21 -1.04 -1.21 -1.35 0.39 -0.13 0.25 -0.32 0.67 -1.04 0.36 -0.12
0.25 0.31 -0.14 0.31 -1.18 0.02 0.36 -0.48 0.15 0.01 -1.1 -0.96 -1.1 -1.22 -0.31 -0.68 -1.87 0.14 1.69 -2.59 -0.12 -0.07 -1.35 0.88 -1.24 -0.6 -1.04 1.11 -1.5 0.37 0.49 -0.19 -0.59 -0.03 1.75
0.12 0.55 -0.21 0.38 -0.62 0.24 0.65 -0.15 0.36 0.33 -0.33 -0.38 0.24 -0.94 -0.2 -0.3 0.57 0.22 1.02 -0.12 -0.46 -0.0 -0.51 -0.03 -1.25 0.02 -0.79 0.14 -0.67 -0.22 0.07 -0.67 -0.31 0.25 0.25
0.25 0.78 0.03 0.72 0.04 0.76 0.88 -0.45 0.71 0.73 -0.83 -0.74 -0.13 -0.82 -0.04 -0.33 -0.41 0.16 1.23 -0.99 0.37 0.12 -0.37 -0.76 -1.65 -1.16 -2.22 0.34 -0.15 -0.62 -0.22 -0.65 -0.69 0.25 -0.24
-0.52 0.92 -0.7 0.93 -0.74 -0.06 1.66 -0.5 0.4 0.5 -1.06 -1.22 -1.08 -0.75 -0.42 -0.18 0.48 0.63 1.83 -0.41 -0.86 -1.12 -1.33 -0.98 -1.36 -1.2 -2.2 -0.6 -0.78 -0.19 -0.47 0.29 -0.93 0.69 0.78
-0.05 0.84 0.4 1.0 -0.65 0.32 0.63 0.95 0.02 0.24 -0.69 -0.78 -0.55 -0.46 -0.72 -0.62 -1.01 0.03 1.37 -1.11 0.46 -0.09 -0.72 -0.12 -1.59 -1.42 -2.29 0.16 -0.17 -0.16 0.01 -0.27 -0.7 0.12 0.81
-0.39 0.34 -0.21 0.28 -0.12 -0.13 0.18 -0.54 0.26 0.17 0.65 -0.73 -0.35 -1.73 0.18 0.38 0.01 0.37 1.29 -1.06 -0.51 0.11 -0.06 0.38 -0.66 -0.26 -0.62 0.15 -0.64 -0.25 0.24 -0.95 -0.87 0.54 0.63
0.41 0.49 0.55 0.37 -0.52 0.15 0.35 -0.62 0.4 0.13 -3.7 -3.94 -6.48 -9.16 0.99 0.65 0.89 0.5 0.74 -1.27 1.26 2.15 0.35 -0.22 -2.3 -7.63 -7.37 1.42 -2.51 -0.45 -0.95 -0.16 -4.61 -3.63 -6.57
-0.45 0.24 -0.34 0.63 -0.57 -0.01 0.89 0.61 0.26 0.41 0.13 0.37 -0.85 0.63 -2.12 -0.83 -3.57 0.31 1.35 -0.82 0.78 0.71 -0.3 -0.46 -1.92 -0.96 -1.35 -0.65 0.0 -0.15 -0.61 0.28 0.45 0.09 -0.81
-0.48 0.2 -0.1 0.36 -0.63 -0.05 0.54 -0.56 0.31 0.48 -0.28 -0.39 -1.68 -0.07 -0.41 -0.4 0.05 0.55 1.34 -1.5 0.22 0.49 -0.76 0.25 -1.56 -1.58 -2.84 0.24 -0.75 0.28 -0.27 0.68 -0.15 0.91 0.51
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0.16 0.77 0.0 0.98 -0.45 0.71 1.15 0.0 0.47 0.56 0.14 -0.43 -3.62 -0.6 0.48 -0.41 0.6 0.32 1.98 -2.49 -0.83 0.92 -1.63 -1.24 -3.18 -2.03 -2.74 -1.39 -1.73 -0.53 -0.52 -0.32 -0.94 0.93 -3.06
-1.64 -1.13 1.36 0.32 -1.75 0.03 0.41 1.07 -1.42 -0.66 -3.1 -3.15 -1.61 2.68 -2.7 -1.38 -2.41 -1.67 2.45 -1.79 0.7 0.88 -1.76 0.8 -3.57 -2.71 -3.92 -1.92 1.67 -1.53 -1.12 -1.38 -2.96 -2.09 -4.21
-0.05 0.14 -0.46 0.04 -0.55 0.28 0.33 -0.17 0.08 0.21 -0.61 -0.12 -0.43 -0.46 0.2 -0.2 -0.32 0.24 0.76 -0.35 0.53 0.42 0.42 0.55 -0.89 -1.43 -1.4 0.24 -1.41 0.39 0.13 0.31 -0.39 0.44 0.27
0.19 -0.18 -0.28 -0.44 -0.85 0.01 -0.02 -0.66 -0.29 -0.08 -0.93 -0.76 -0.74 -2.58 0.62 0.21 1.63 0.16 1.6 -0.72 -1.14 -0.6 -1.59 1.0 -1.11 -1.37 -1.2 -0.2 -0.91 0.41 0.19 0.5 -0.77 0.52 0.99
-0.15 0.54 -0.3 0.91 -0.1 0.13 1.56 -0.49 0.44 0.38 -1.16 -1.1 -0.49 -1.37 -0.57 -0.37 -1.0 1.01 1.19 0.41 0.15 0.87 0.15 -0.64 -2.16 -0.55 -1.31 -0.15 -1.12 -0.37 -1.89 0.67 -0.78 -0.47 -0.45
-0.63 -0.29 -0.78 0.14 -1.94 -0.94 0.93 0.77 -0.05 -0.06 -0.46 -0.09 0.17 1.65 -3.73 -3.17 -4.3 -1.21 1.77 -2.41 -1.21 -1.04 -3.4 -1.14 -1.5 -0.78 0.46 0.01 0.84 -1.9 -1.76 -1.88 -0.73 2.14 1.53
-0.47 0.12 -0.3 0.17 -0.3 -0.24 0.46 -0.58 0.04 0.14 0.14 0.15 -0.19 -1.88 -0.04 -0.12 0.27 0.42 1.05 0.02 -0.01 1.11 -0.12 0.57 -0.68 -0.76 -1.26 -0.5 -1.36 0.66 0.62 0.54 -0.03 -1.02 -2.31
-2.7 -2.08 -2.38 -2.18 -1.34 -2.54 -2.81 -1.36 -3.78 -3.79 1.44 2.09 -1.08 2.5 -3.11 -1.9 -4.14 -1.26 1.79 -0.66 -4.31 -1.32 -6.14 -3.23 -4.67 -7.65 -9.37 -1.46 -0.48 -2.03 -3.36 -1.53 2.0 1.99 2.19
0.31 0.95 0.22 0.97 0.18 0.3 1.04 -0.27 0.86 1.09 -1.04 -1.0 -0.28 -2.19 -1.22 -0.46 -1.58 0.56 0.75 -1.08 0.55 0.62 1.04 -0.87 -1.27 -1.48 -2.3 0.79 -0.95 -0.33 -0.81 0.22 -0.87 -2.06 -2.11
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0.0 0.5 -0.25 0.64 0.32 0.21 0.9 -0.26 0.67 0.43 - - - - -0.67 -0.87 -1.46 1.02 0.96 -0.68 1.69 1.03 1.58 0.35 -0.01 - - 1.18 -1.48 -0.17 -0.77 0.45 - - -
-0.04 0.31 -0.09 0.45 1.0 0.2 0.79 -0.23 0.88 0.36 -0.54 -1.63 -3.82 -2.44 -0.16 0.03 -0.28 0.93 1.21 -0.98 -0.43 -0.68 -1.05 -0.13 -0.03 -2.94 -3.48 1.77 0.38 -0.18 -0.66 0.19 -1.48 -1.11 -0.44

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.