Heatmap: Cluster_76 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	4h after treatment	4h after treatment,No nitrate	8h after treatment	8h after treatment,No nitrate	20C	20h after treatment	20h after treatment,No nitrate	20h after treatment,Nocodazole added	36h after treatment	36h after treatment,No phosphate	Blue light,10min after light change	Blue light,60min after light change	Bohlin	CCAP1055/1,20C	CCAP1055/1,20C,High CO2,OligoDT primed	CCAP1055/1,20C,Low CO2,OligoDT primed	CCAP1055/1,20C,Normal CO2,OligoDT primed	CCMP2561	CCMP2561 Nitrase Reductase Knockout	CCMP632	CCMP632,24h	CCMP632,48h	CCMP632,72h	CCMP632,High light acclimated WT	CCMP632,Low light acclimated WT	NEPCC640,8h,1000ppmv CO2	NEPCC640,8h,390 ppmv CO2	No light,8h after treatment	Pt-1	Pt-1 8.6	Pt-1 8.6,With nitrogen	Pt-1 8.6,Without nitrogen	Red light,0min before light change	UTEX 646,Blue light	UTEX 646,No light
PTI_00G00110.1	0.34	0.38	0.23	0.42	0.21	0.39	0.37	0.15	0.36	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.43	0.18	0.65	0.53	1.0	0.04	0.04	0.1	0.04	0.22	0.08	0.0	0.0	0.3	0.14	0.37	0.4	0.28	0.0	0.0	0.0
PTI_00G04340.1	0.51	0.63	0.46	0.6	0.47	0.58	0.52	0.41	0.64	0.55	0.26	0.28	0.46	0.23	1.0	0.64	0.87	0.67	0.82	0.53	0.39	0.51	0.42	0.54	0.5	0.37	0.25	1.0	0.31	0.64	0.54	0.66	0.26	0.49	0.39
PTI_01G00440.1	0.63	0.7	0.53	0.62	0.24	0.66	0.64	1.0	0.46	0.59	0.32	0.23	0.11	0.14	0.48	0.32	0.51	0.47	0.61	0.39	0.54	0.57	0.42	0.44	0.12	0.59	0.39	0.28	0.22	0.38	0.34	0.45	0.2	0.59	0.12
PTI_01G02380.1	0.63	0.55	0.47	0.45	0.27	0.55	0.39	0.26	0.4	0.35	0.3	0.46	0.12	0.18	1.0	0.57	0.86	0.45	0.63	0.19	0.33	0.54	0.18	0.47	0.16	0.57	0.36	0.1	0.02	0.36	0.45	0.16	0.41	0.66	0.07
PTI_01G04770.1	0.39	0.49	0.41	0.43	0.28	0.67	0.46	0.84	0.62	0.47	0.91	0.44	0.15	0.1	0.62	0.78	0.8	0.55	0.81	0.21	0.17	0.35	0.26	0.95	0.16	0.39	0.26	0.29	0.15	0.67	1.0	0.09	0.34	0.85	0.34
PTI_01G04910.1	0.35	0.52	0.37	0.49	0.3	0.41	0.55	0.65	0.5	0.39	0.88	0.38	0.32	0.14	0.2	0.4	0.17	0.41	0.5	0.21	0.33	0.54	0.27	0.36	0.26	0.4	1.0	0.72	0.33	0.4	0.43	0.27	0.25	0.59	0.59
PTI_01G05010.1	0.41	0.36	0.35	0.33	0.27	0.36	0.24	0.29	0.39	0.36	0.19	0.22	0.26	0.09	1.0	0.53	0.44	0.44	0.51	0.35	0.23	0.24	0.26	0.42	0.18	0.29	0.27	0.42	0.2	0.26	0.32	0.17	0.24	0.56	0.25
PTI_01G06190.1	0.68	0.76	0.67	0.59	0.51	0.75	0.54	0.54	0.56	0.63	0.44	0.47	0.14	0.34	0.6	0.27	1.0	0.46	0.66	0.18	0.27	0.46	0.19	0.52	0.29	0.45	0.36	0.34	0.16	0.42	0.54	0.31	0.43	0.67	0.25
PTI_01G10080.1	0.55	0.46	0.43	0.32	0.42	0.78	0.39	0.31	0.64	0.42	0.12	0.15	0.09	0.12	1.0	0.36	0.77	0.5	0.6	0.27	0.61	0.37	0.38	0.58	0.33	0.31	0.23	0.2	0.1	0.31	0.59	0.15	0.14	0.45	0.1
PTI_01G10200.1	0.44	0.31	0.32	0.22	0.56	0.5	0.25	0.22	0.47	0.48	0.25	0.24	0.07	0.16	1.0	0.59	0.7	0.48	0.49	0.37	0.66	0.59	0.51	0.91	0.45	0.33	0.29	0.33	0.23	0.41	0.58	0.31	0.2	0.34	0.14
PTI_02G03330.1	1.0	0.79	0.72	0.43	0.15	0.38	0.27	0.72	0.2	0.34	0.3	0.23	0.0	0.01	0.14	0.06	0.13	0.32	0.24	0.05	0.08	0.16	0.01	0.11	0.05	0.26	0.26	0.03	0.05	0.17	0.31	0.03	0.03	0.52	0.0
PTI_02G03340.1	1.0	0.95	0.76	0.61	0.03	0.23	0.42	0.55	0.11	0.31	0.22	0.16	0.0	0.03	0.05	0.01	0.06	0.18	0.18	0.03	0.01	0.02	0.0	0.11	0.01	0.3	0.28	0.01	0.03	0.13	0.2	0.06	0.03	0.9	0.0
PTI_02G04090.1	0.8	0.67	0.67	0.56	0.16	0.63	0.3	0.53	0.57	0.38	0.87	0.32	0.18	0.13	0.07	0.34	0.1	0.31	0.44	0.11	0.28	0.27	0.3	0.38	0.05	0.08	0.03	1.0	0.18	0.21	0.15	0.31	0.27	0.89	0.33
PTI_02G05800.1	0.78	0.6	0.68	0.47	0.14	0.48	0.21	0.45	0.23	0.41	0.26	0.4	0.02	0.04	0.84	0.57	0.84	0.48	0.74	0.24	0.03	0.13	0.02	0.22	0.07	0.28	0.23	0.36	0.17	0.39	0.42	0.4	0.42	1.0	0.2
PTI_02G06160.1	0.51	0.48	0.37	0.46	0.18	0.42	0.49	0.18	0.49	0.48	0.18	0.19	0.14	0.03	0.82	0.48	1.0	0.37	0.4	0.12	0.16	0.21	0.13	0.47	0.1	0.21	0.17	0.34	0.06	0.31	0.47	0.09	0.27	0.25	0.1
PTI_03G00470.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.39	1.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.05	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01
PTI_03G00870.1	0.48	0.63	0.49	0.55	0.27	0.47	0.44	0.47	0.43	0.5	0.34	0.32	0.15	0.32	0.53	0.36	1.0	0.45	0.6	0.37	0.28	0.33	0.19	0.53	0.23	0.26	0.21	0.41	0.24	0.25	0.34	0.24	0.36	0.24	0.37
PTI_03G00940.1	0.79	0.91	0.7	0.81	0.74	0.9	0.77	0.65	0.92	0.92	0.72	0.7	0.51	0.57	0.77	0.72	0.41	0.81	0.73	0.41	0.33	0.52	0.33	0.66	0.45	0.6	0.45	0.78	0.34	0.91	1.0	0.97	0.63	0.56	0.16
PTI_03G02260.1	0.47	0.55	0.39	0.36	0.37	0.46	0.21	0.43	0.36	0.41	0.38	0.45	0.29	0.08	0.59	0.44	1.0	0.38	0.56	0.22	0.17	0.22	0.14	0.35	0.32	0.33	0.29	0.44	0.18	0.26	0.43	0.14	0.31	0.7	0.23
PTI_03G05580.1	0.74	0.62	0.59	0.33	0.2	0.63	0.25	1.0	0.29	0.45	0.63	0.46	0.03	0.11	0.26	0.22	0.23	0.41	0.68	0.1	0.42	0.71	0.19	0.23	0.06	0.14	0.16	0.07	0.22	0.49	0.5	0.69	0.2	0.66	0.06
PTI_03G05810.1	0.13	0.22	0.09	0.2	0.2	0.15	0.28	0.08	0.22	0.27	0.21	0.24	0.05	0.18	0.14	0.18	0.14	0.35	0.71	0.11	0.54	0.42	1.0	0.17	0.28	0.12	0.06	0.29	0.29	0.2	0.06	0.4	0.29	0.27	0.02
PTI_04G01840.1	0.53	0.58	0.44	0.56	0.45	0.6	0.5	0.4	0.76	0.72	0.43	0.45	0.48	0.21	0.94	0.84	0.47	0.67	1.0	0.44	0.68	0.83	0.52	0.65	0.25	0.39	0.29	0.77	0.28	0.49	0.56	0.24	0.32	0.82	0.59
PTI_04G02580.1	0.71	0.81	0.56	0.67	0.64	0.87	0.81	0.41	0.93	0.89	0.51	0.58	0.78	0.19	0.49	0.46	0.1	0.61	0.75	0.45	0.39	0.46	0.34	0.49	0.17	0.55	0.44	1.0	0.2	0.29	0.43	0.18	0.61	0.85	0.6
PTI_04G04290.1	0.78	1.0	0.88	0.95	0.53	0.72	0.81	0.64	0.53	0.67	0.39	0.46	0.28	0.26	0.54	0.38	0.7	0.61	0.88	0.28	0.4	0.63	0.23	0.57	0.27	0.45	0.31	0.57	0.23	0.79	0.94	0.72	0.44	0.56	0.32
PTI_05G00760.1	0.9	0.58	0.56	0.16	0.22	0.57	0.03	0.27	0.24	0.3	0.3	0.2	0.01	0.01	0.27	0.07	0.38	0.14	0.24	0.03	0.02	0.07	0.03	0.2	0.07	0.71	0.45	0.91	0.09	0.35	0.64	0.16	0.22	1.0	0.01
PTI_05G02330.1	0.36	0.38	0.25	0.29	0.2	0.28	0.32	0.21	0.26	0.3	0.24	0.17	0.1	0.07	0.31	0.37	0.25	0.28	0.51	0.19	0.17	0.31	0.17	0.33	0.14	0.21	0.22	1.0	0.18	0.43	0.57	0.14	0.18	0.29	0.03
PTI_05G03600.1	0.52	0.32	0.42	0.26	0.25	0.48	0.2	0.21	0.38	0.36	0.09	0.14	0.04	0.08	0.81	0.27	1.0	0.41	0.81	0.11	0.08	0.26	0.04	0.4	0.59	0.09	0.13	0.05	0.1	0.43	0.34	0.38	0.09	0.16	0.0
PTI_06G00460.1	0.68	0.8	0.58	0.72	0.47	0.74	0.77	0.5	0.63	0.6	0.65	0.49	0.46	0.1	0.44	0.46	0.45	0.55	1.0	0.45	0.29	0.67	0.28	0.64	0.18	0.92	0.81	0.76	0.36	0.5	0.63	0.23	0.48	0.78	0.76
PTI_06G03310.1	0.37	0.66	0.48	0.51	0.35	0.4	0.33	0.27	0.53	0.54	1.0	0.35	0.16	0.08	0.47	0.78	0.32	0.38	0.42	0.48	0.45	0.65	0.38	0.6	0.2	0.57	0.13	0.94	0.15	0.71	0.77	0.27	0.48	0.67	0.27
PTI_08G00100.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.12	0.0	0.0	0.04	0.0	0.47	1.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
PTI_08G01780.1	0.55	0.81	0.48	0.7	0.4	0.65	0.62	0.3	0.82	0.83	0.44	0.61	0.24	0.76	0.62	0.49	0.74	0.62	0.86	0.23	0.33	0.79	0.39	0.29	0.1	0.16	0.14	0.15	0.26	0.26	0.4	0.11	0.51	1.0	0.28
PTI_08G02550.1	0.75	0.76	0.56	0.6	0.39	0.57	0.48	0.6	0.49	0.27	0.4	0.42	0.37	0.25	0.8	0.52	0.17	0.7	1.0	0.24	0.7	0.78	0.36	0.66	0.3	0.33	0.41	0.79	0.26	0.73	0.82	0.5	0.48	0.76	0.69
PTI_09G00100.1	0.46	0.45	0.44	0.44	0.78	0.64	0.36	0.34	0.73	0.56	0.31	0.33	0.22	0.14	0.97	0.66	0.49	0.65	0.92	0.39	1.0	0.65	0.88	0.39	0.46	0.3	0.24	0.34	0.19	0.5	0.42	0.43	0.42	0.54	0.57
PTI_09G01120.1	0.69	0.77	0.71	0.59	0.26	0.81	0.49	0.35	0.46	0.6	0.34	0.3	0.08	0.03	0.76	0.48	1.0	0.51	0.63	0.39	0.08	0.24	0.1	0.34	0.1	0.42	0.25	0.14	0.11	0.33	0.62	0.06	0.42	0.44	0.01
PTI_09G01890.1	0.4	0.2	0.3	0.1	0.16	0.33	0.05	0.72	0.15	0.11	0.28	0.19	0.04	0.01	0.71	0.51	1.0	0.2	0.53	0.05	0.21	0.29	0.18	0.12	0.04	0.3	0.15	0.56	0.06	0.13	0.2	0.04	0.16	0.42	0.06
PTI_09G02070.1	0.62	0.96	0.62	0.82	0.56	0.9	1.0	0.48	0.83	0.88	0.4	0.39	0.31	0.28	0.53	0.28	0.95	0.54	0.94	0.44	0.39	0.7	0.44	0.7	0.25	0.35	0.25	0.18	0.21	0.62	0.86	0.16	0.37	0.42	0.15
PTI_09G03490.1	0.45	0.47	0.44	0.32	0.26	0.24	0.23	0.15	0.18	0.24	0.29	0.45	0.05	0.48	1.0	0.49	0.55	0.57	0.93	0.4	0.07	0.27	0.07	0.32	0.06	0.17	0.16	0.17	0.06	0.26	0.38	0.17	0.55	0.51	0.02
PTI_10G00050.1	0.6	0.76	0.61	0.73	0.58	0.55	0.67	0.47	0.8	0.79	0.47	0.51	1.0	0.41	0.73	0.72	0.62	0.58	1.0	0.53	0.58	0.56	0.54	0.35	0.2	0.48	0.33	0.52	0.3	0.2	0.39	0.05	0.38	0.87	0.13
PTI_10G02010.1	0.47	0.52	0.4	0.46	0.59	0.48	0.48	0.44	0.46	0.52	0.66	0.78	0.37	0.7	0.44	0.42	0.6	0.4	1.0	0.26	0.28	0.8	0.24	0.47	0.11	0.15	0.11	0.46	0.41	0.29	0.32	0.25	0.7	0.78	0.33
PTI_10G03960.1	0.63	0.73	0.6	0.52	0.63	0.66	0.41	0.92	0.6	0.55	1.0	0.44	0.29	0.09	0.37	0.34	0.47	0.3	0.52	0.12	0.23	0.75	0.13	0.4	0.13	0.63	0.34	0.3	0.07	0.26	0.29	0.16	0.16	0.92	0.05
PTI_11G00990.1	0.48	0.27	0.32	0.23	0.5	0.54	0.23	0.31	0.41	0.39	0.4	0.31	0.33	0.11	0.94	0.25	1.0	0.44	0.64	0.16	0.25	0.32	0.19	0.28	0.12	0.49	0.42	0.59	0.18	0.38	0.38	0.33	0.35	0.53	0.28
PTI_12G01450.1	0.92	0.94	0.59	0.67	0.47	0.75	0.75	0.47	0.74	0.81	0.78	0.45	0.59	0.19	0.78	0.88	0.96	0.74	0.87	0.37	0.54	1.0	0.29	0.7	0.39	0.52	0.39	0.67	0.33	0.57	0.58	0.56	0.49	0.76	0.74
PTI_12G03400.1	0.64	0.71	0.63	0.58	0.3	0.6	0.5	0.4	0.51	0.56	0.28	0.3	0.13	0.18	0.75	0.49	1.0	0.68	0.66	0.5	0.67	0.7	0.51	0.55	0.3	0.62	0.44	0.23	0.2	0.48	0.55	0.52	0.34	0.54	0.01
PTI_13G01340.1	0.35	0.21	0.23	0.17	0.09	0.17	0.19	0.16	0.11	0.08	0.17	0.2	0.07	0.04	0.11	0.13	0.09	0.36	1.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.09	0.03	0.03	0.06	0.11	0.04	0.0	0.02	0.0	0.31	0.36	0.08
PTI_14G02920.1	0.37	0.47	0.34	0.33	0.14	0.28	0.24	0.27	0.2	0.23	0.32	0.38	0.49	0.06	0.32	0.18	0.47	0.38	0.41	0.15	0.04	0.12	0.03	0.29	0.19	0.4	0.41	0.24	0.15	0.47	0.63	0.48	0.17	1.0	0.08
PTI_14G02930.1	0.15	0.45	0.15	0.54	0.2	0.2	1.0	0.23	0.24	0.21	0.36	0.28	0.44	0.15	0.13	0.13	0.16	0.35	0.42	0.24	0.04	0.16	0.04	0.25	0.17	0.22	0.22	0.13	0.1	0.26	0.32	0.29	0.26	0.46	0.25
PTI_16G00840.1	0.21	0.43	0.23	0.37	0.15	0.28	0.27	0.44	0.24	0.15	0.22	0.21	0.17	0.1	0.39	0.29	0.32	0.47	0.65	0.14	0.11	0.19	0.09	0.38	0.06	0.17	0.14	0.06	0.05	0.24	0.31	0.12	0.19	1.0	0.16
PTI_18G00770.1	0.67	1.0	0.47	0.67	0.21	0.62	0.68	0.8	0.41	0.51	0.19	0.16	0.11	0.05	0.38	0.35	0.33	0.49	0.9	0.14	0.18	0.27	0.14	0.32	0.28	0.21	0.1	0.53	0.12	0.25	0.44	0.11	0.07	0.61	0.04
PTI_20G01080.1	0.61	0.44	0.52	0.31	0.15	0.42	0.19	1.0	0.25	0.33	0.28	0.14	0.05	0.05	0.35	0.19	0.48	0.3	0.54	0.05	0.06	0.12	0.04	0.4	0.04	0.42	0.33	0.02	0.08	0.3	0.41	0.1	0.04	0.34	0.01
PTI_22G00050.1	0.94	0.9	0.52	0.78	0.48	0.77	0.81	0.56	0.62	0.7	0.16	0.28	0.03	0.25	0.82	0.35	0.73	0.63	0.95	0.2	0.42	1.0	0.32	0.73	0.1	0.29	0.25	0.34	0.34	0.76	0.68	0.54	0.21	0.87	0.19
PTI_22G01260.1	0.7	0.56	0.56	0.44	0.72	0.75	0.5	0.38	0.95	0.79	0.36	0.5	0.3	0.14	0.93	0.8	0.52	0.81	0.9	0.48	0.6	0.6	0.52	0.73	0.23	0.44	0.34	1.0	0.33	0.44	0.51	0.25	0.51	0.72	0.75
PTI_23G00740.1	0.11	0.33	0.18	0.48	0.2	0.2	0.68	0.23	0.36	0.29	1.0	0.46	0.41	0.3	0.13	0.42	0.14	0.51	0.69	0.36	0.11	0.3	0.21	0.25	0.14	0.35	0.17	0.31	0.3	0.19	0.16	0.24	0.42	0.81	0.68
PTI_25G00590.1	0.49	0.42	0.32	0.31	0.16	0.28	0.21	0.69	0.15	0.14	0.78	0.63	0.23	0.07	0.46	0.26	0.2	0.45	1.0	0.32	0.04	0.23	0.0	0.16	0.05	0.29	0.44	0.35	0.28	0.41	0.47	0.24	0.56	0.57	0.3
PTI_25G00750.1	0.4	0.27	0.28	0.18	0.3	0.46	0.21	0.25	0.33	0.28	0.17	0.26	0.07	0.18	0.75	0.24	1.0	0.3	0.59	0.11	0.11	0.33	0.06	0.23	0.04	0.17	0.17	0.22	0.1	0.24	0.21	0.25	0.21	0.51	0.09
PTI_27G01380.1	0.33	0.33	0.28	0.23	0.3	0.36	0.18	0.25	0.29	0.34	0.19	0.21	0.08	0.12	0.7	0.5	1.0	0.48	0.69	0.08	0.3	0.3	0.26	0.22	0.11	0.17	0.12	0.28	0.1	0.27	0.37	0.23	0.2	0.25	0.08
PTI_28G00440.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.65	0.0	0.62	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
PTI_29G00730.1	0.67	0.71	0.68	0.6	0.29	0.35	0.49	0.44	0.32	0.38	0.31	0.28	0.1	0.18	0.46	0.27	0.54	0.45	0.45	0.13	0.06	0.14	0.04	0.43	0.22	0.3	0.26	0.49	0.16	0.51	0.47	0.47	0.22	1.0	0.24
PTI_29G01240.1	0.69	0.86	0.62	0.83	0.64	0.75	0.88	0.37	0.78	0.79	0.16	0.21	0.43	0.22	1.0	0.69	0.85	0.68	0.57	0.56	0.32	0.43	0.34	0.47	0.31	0.5	0.39	0.52	0.27	0.73	0.81	0.72	0.2	0.3	0.18

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)