Heatmap: Cluster_68 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
4h after treatment
4h after treatment,No nitrate
8h after treatment
8h after treatment,No nitrate
20C
20h after treatment
20h after treatment,No nitrate
20h after treatment,Nocodazole added
36h after treatment
36h after treatment,No phosphate
Blue light,10min after light change
Blue light,60min after light change
Bohlin
CCAP1055/1,20C
CCAP1055/1,20C,High CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Low CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Normal CO2,OligoDT primed
CCMP2561
CCMP2561 Nitrase Reductase Knockout
CCMP632
CCMP632,24h
CCMP632,48h
CCMP632,72h
CCMP632,High light acclimated WT
CCMP632,Low light acclimated WT
NEPCC640,8h,1000ppmv CO2
NEPCC640,8h,390 ppmv CO2
No light,8h after treatment
Pt-1
Pt-1 8.6
Pt-1 8.6,With nitrogen
Pt-1 8.6,Without nitrogen
Red light,0min before light change
UTEX 646,Blue light
UTEX 646,No light
0.29 0.34 0.25 0.38 0.35 0.44 0.5 0.6 0.57 0.49 0.21 0.17 0.57 0.21 0.17 0.16 0.13 0.64 0.62 0.28 0.27 0.35 0.25 0.31 0.25 0.14 0.11 0.54 0.5 0.85 0.47 1.0 0.21 0.86 0.94
0.53 0.6 0.45 0.59 0.29 0.67 0.75 0.49 0.57 0.56 0.19 0.25 0.27 0.2 0.18 0.1 0.16 0.56 0.78 0.09 0.03 0.09 0.04 0.16 0.04 0.13 0.21 0.13 0.36 0.67 0.34 1.0 0.28 0.97 0.14
0.22 0.2 0.16 0.2 0.27 0.31 0.26 0.2 0.39 0.35 0.21 0.28 0.24 0.1 0.14 0.12 0.04 0.31 0.42 0.15 0.12 0.24 0.18 0.08 0.04 0.05 0.05 0.16 0.19 0.36 0.12 0.62 0.23 1.0 0.14
0.17 0.41 0.09 0.53 0.13 0.33 0.87 0.23 0.45 0.48 0.11 0.23 0.18 0.32 0.03 0.09 0.02 0.85 0.77 0.04 0.09 0.12 0.1 0.08 0.02 0.04 0.02 0.06 0.17 0.46 0.04 1.0 0.11 0.97 0.06
0.29 0.38 0.21 0.44 0.29 0.32 0.57 0.35 0.41 0.43 0.3 0.49 0.64 0.66 0.07 0.16 0.01 0.76 0.7 0.26 0.48 0.42 0.37 0.2 0.07 0.05 0.04 0.58 0.42 0.56 0.18 1.0 0.41 0.75 0.47
0.37 0.54 0.24 0.55 0.39 0.31 0.7 0.28 0.48 0.52 0.25 0.33 0.35 0.33 0.23 0.21 0.21 0.46 0.66 0.13 0.41 0.43 0.36 0.2 0.05 0.07 0.05 1.0 0.14 0.31 0.11 0.51 0.31 0.98 0.24
0.24 0.34 0.21 0.29 0.18 0.27 0.35 0.24 0.26 0.25 0.17 0.26 0.3 0.22 0.25 0.12 0.28 0.65 0.56 0.29 0.02 0.1 0.02 0.28 0.06 0.07 0.08 0.25 0.23 0.66 0.32 1.0 0.26 0.63 0.2
0.49 0.52 0.32 0.43 0.3 0.44 0.53 0.37 0.42 0.43 0.38 0.55 0.51 0.24 0.3 0.25 0.22 0.75 0.76 0.22 0.44 0.6 0.35 0.52 0.17 0.21 0.19 0.59 0.29 0.69 0.35 0.99 0.48 1.0 0.52
0.42 0.35 0.28 0.25 0.35 0.43 0.36 0.2 0.41 0.36 0.26 0.41 0.45 0.42 0.1 0.05 0.06 0.43 0.61 0.18 0.37 0.54 0.27 0.18 0.04 0.07 0.1 0.14 0.21 0.58 0.13 1.0 0.33 0.96 0.14
0.39 0.22 0.17 0.14 0.15 0.3 0.19 0.24 0.18 0.21 0.35 0.6 0.07 0.25 0.05 0.02 0.01 0.47 0.19 0.06 0.33 0.46 0.18 0.05 0.04 0.02 0.03 0.06 0.13 0.25 0.11 0.45 0.44 1.0 0.15
0.1 0.16 0.07 0.14 0.07 0.1 0.18 0.12 0.17 0.19 0.15 0.3 0.11 0.2 0.06 0.04 0.0 0.42 0.33 0.05 0.19 0.25 0.12 0.05 0.02 0.04 0.03 0.12 0.1 0.12 0.04 0.21 0.23 1.0 0.13
0.37 0.54 0.29 0.49 0.41 0.44 0.61 0.35 0.49 0.44 0.55 0.54 0.5 0.4 0.24 0.22 0.11 0.78 0.65 0.23 0.25 0.49 0.27 0.34 0.11 0.12 0.11 0.76 0.35 0.68 0.4 1.0 0.5 1.0 0.76
0.15 0.19 0.1 0.15 0.18 0.2 0.24 0.3 0.31 0.29 0.19 0.35 0.52 0.38 0.05 0.08 0.03 0.52 0.56 0.09 0.15 0.21 0.11 0.17 0.05 0.03 0.08 0.15 0.38 0.44 0.18 0.68 0.27 1.0 0.26
0.47 0.46 0.28 0.4 0.38 0.61 0.58 0.32 0.59 0.59 0.39 0.48 0.32 0.26 0.35 0.25 0.3 0.64 0.69 0.2 0.28 0.5 0.35 0.54 0.24 0.22 0.34 0.3 0.3 0.89 0.56 1.0 0.43 0.67 0.75
0.12 0.13 0.13 0.12 0.1 0.14 0.22 0.16 0.16 0.15 0.06 0.14 0.18 0.14 0.01 0.01 0.01 0.39 0.34 0.05 0.17 0.16 0.2 0.07 0.02 0.07 0.12 0.03 0.17 0.37 0.12 0.6 0.07 1.0 0.06
0.28 0.35 0.12 0.32 0.16 0.25 0.55 0.22 0.31 0.31 0.17 0.36 0.51 0.22 0.11 0.07 0.02 0.56 0.57 0.1 0.15 0.15 0.15 0.1 0.03 0.06 0.1 0.24 0.26 0.46 0.12 0.79 0.24 1.0 0.2
0.18 0.24 0.08 0.2 0.12 0.18 0.37 0.18 0.16 0.16 0.24 0.35 0.2 0.61 0.02 0.02 0.0 0.63 0.68 0.09 0.26 0.32 0.21 0.04 0.02 0.03 0.05 0.06 0.26 0.5 0.09 1.0 0.3 0.71 0.05
0.39 0.33 0.24 0.27 0.26 0.42 0.37 0.22 0.35 0.3 0.26 0.37 0.21 0.18 0.39 0.15 0.21 0.7 0.47 0.21 0.41 0.45 0.36 0.31 0.11 0.11 0.14 0.1 0.29 0.41 0.23 0.51 0.31 1.0 0.36
0.42 0.54 0.31 0.51 0.19 0.47 0.59 0.39 0.42 0.49 0.14 0.26 0.17 0.12 0.16 0.17 0.04 0.91 0.76 0.11 0.28 0.32 0.21 0.19 0.03 0.05 0.06 0.06 0.2 0.38 0.18 0.64 0.19 1.0 0.03
0.42 0.61 0.43 0.76 0.26 0.6 1.0 0.4 0.78 0.8 0.22 0.29 0.44 0.15 0.06 0.26 0.01 0.76 0.54 0.13 0.26 0.2 0.24 0.17 0.05 0.03 0.05 0.36 0.32 0.43 0.23 0.67 0.31 0.51 0.24
0.34 0.38 0.22 0.37 0.41 0.39 0.52 0.28 0.46 0.42 0.23 0.33 0.79 0.24 0.21 0.25 0.12 0.61 0.59 0.2 0.3 0.35 0.29 0.36 0.13 0.13 0.15 0.35 0.36 0.65 0.26 1.0 0.27 0.8 0.61
0.37 0.45 0.25 0.51 0.32 0.38 0.64 0.32 0.49 0.56 0.52 0.64 0.45 0.18 0.03 0.09 0.0 1.0 0.74 0.19 0.16 0.17 0.27 0.06 0.02 0.08 0.13 0.36 0.57 0.47 0.11 0.79 0.76 0.49 0.41
0.5 0.45 0.36 0.48 0.25 0.53 0.6 0.47 0.55 0.52 0.21 0.44 0.27 0.37 0.09 0.14 0.02 1.0 0.72 0.12 0.63 0.65 0.48 0.14 0.03 0.06 0.11 0.06 0.4 0.5 0.21 0.85 0.24 0.89 0.02
0.54 0.61 0.32 0.56 0.33 0.59 0.85 0.43 0.62 0.68 0.37 0.44 0.51 0.38 0.2 0.18 0.08 0.66 0.7 0.31 0.6 0.57 0.33 0.23 0.07 0.07 0.06 0.3 0.35 0.61 0.18 1.0 0.55 0.96 0.38
0.49 0.43 0.4 0.48 0.22 0.45 0.61 0.33 0.58 0.56 0.16 0.12 0.52 0.24 0.15 0.13 0.18 0.67 0.61 0.3 0.31 0.3 0.26 0.48 0.05 0.15 0.19 0.02 0.41 0.63 0.29 1.0 0.17 0.94 0.24
0.21 0.15 0.09 0.1 0.1 0.22 0.14 0.15 0.1 0.15 0.12 0.44 0.07 0.14 0.09 0.03 0.03 0.36 0.16 0.03 0.18 0.3 0.1 0.03 0.02 0.22 0.17 0.02 0.07 0.25 0.07 0.43 0.15 1.0 0.01
0.2 0.31 0.18 0.34 0.15 0.32 0.48 0.23 0.38 0.34 0.69 0.78 0.41 0.17 0.07 0.1 0.03 0.66 0.5 0.13 0.24 0.26 0.22 0.17 0.04 0.04 0.1 0.08 0.26 0.44 0.13 0.81 0.63 1.0 0.05
0.31 0.31 0.24 0.25 0.12 0.29 0.26 0.31 0.25 0.3 0.13 0.21 0.12 0.13 0.17 0.06 0.16 0.34 0.62 0.07 0.09 0.18 0.05 0.25 0.03 0.07 0.07 0.08 0.12 0.59 0.15 1.0 0.14 0.92 0.18
0.23 0.14 0.14 0.1 0.06 0.22 0.12 0.19 0.14 0.16 0.12 0.23 0.1 0.06 0.07 0.05 0.03 0.35 0.25 0.02 0.01 0.03 0.01 0.08 0.07 0.11 0.12 0.02 0.18 0.26 0.09 0.44 0.15 1.0 0.03
0.39 0.58 0.3 0.57 0.35 0.53 0.66 0.33 0.81 0.64 0.27 0.29 0.48 0.34 0.34 0.18 0.21 0.79 0.62 0.15 0.48 0.28 0.39 0.37 0.22 0.09 0.11 0.2 0.16 0.54 0.33 0.72 0.31 1.0 0.38
0.71 0.63 0.29 0.47 0.34 0.73 0.64 0.35 0.67 0.64 0.39 0.42 0.19 0.14 0.19 0.17 0.07 0.8 0.71 0.12 0.16 0.28 0.09 0.22 0.06 0.17 0.16 0.91 0.3 0.65 0.3 1.0 0.4 0.92 0.18
0.18 0.33 0.11 0.39 0.22 0.28 0.65 0.24 0.33 0.34 0.2 0.35 0.5 0.26 0.12 0.13 0.04 1.0 0.83 0.27 0.02 0.04 0.02 0.18 0.09 0.08 0.06 0.3 0.28 0.4 0.15 0.68 0.33 0.95 0.4
0.29 0.31 0.2 0.28 0.13 0.33 0.33 0.35 0.31 0.32 0.59 0.71 0.24 0.83 0.04 0.04 0.01 0.6 0.44 0.07 0.43 0.38 0.22 0.1 0.02 0.02 0.02 0.06 0.27 0.43 0.1 0.76 0.7 1.0 0.11
0.13 0.09 0.05 0.06 0.06 0.09 0.08 0.13 0.08 0.08 0.15 0.27 0.14 0.14 0.02 0.02 0.0 0.28 0.14 0.02 0.1 0.13 0.08 0.06 0.0 0.03 0.04 0.02 0.15 0.22 0.09 0.29 0.15 1.0 0.01
0.31 0.35 0.26 0.3 0.15 0.3 0.38 0.69 0.22 0.24 0.15 0.26 0.34 0.12 0.06 0.09 0.04 0.47 0.61 0.11 0.04 0.12 0.05 0.11 0.02 0.08 0.08 0.07 0.25 0.44 0.15 0.68 0.18 1.0 0.08
0.14 0.17 0.1 0.14 0.16 0.12 0.23 0.48 0.14 0.2 0.2 0.35 0.25 0.19 0.04 0.07 0.01 0.62 0.77 0.05 0.31 0.42 0.27 0.24 0.05 0.02 0.04 0.54 0.4 0.57 0.09 1.0 0.23 0.9 0.95
0.34 0.18 0.21 0.19 0.26 0.36 0.26 0.23 0.47 0.4 0.27 0.27 0.29 0.14 0.22 0.11 0.13 0.56 0.51 0.11 0.18 0.16 0.24 0.21 0.11 0.09 0.13 0.39 0.36 0.29 0.2 0.37 0.24 1.0 0.62
0.23 0.23 0.15 0.21 0.18 0.27 0.28 0.15 0.32 0.3 0.18 0.23 0.25 0.17 0.19 0.15 0.1 0.57 0.44 0.07 0.12 0.14 0.1 0.21 0.06 0.03 0.03 0.23 0.19 0.23 0.1 0.37 0.19 1.0 0.42
0.09 0.13 0.07 0.13 0.09 0.12 0.18 0.13 0.17 0.18 0.1 0.21 0.2 0.25 0.06 0.06 0.02 0.32 0.27 0.07 0.11 0.13 0.1 0.08 0.02 0.02 0.02 0.09 0.08 0.21 0.05 0.36 0.14 1.0 0.25
0.39 0.41 0.25 0.35 0.26 0.39 0.42 0.25 0.45 0.47 0.17 0.27 0.44 0.16 0.16 0.19 0.08 0.41 0.44 0.19 0.15 0.16 0.21 0.23 0.11 0.1 0.12 0.61 0.31 0.36 0.17 0.57 0.21 1.0 0.36
0.18 0.28 0.13 0.34 0.1 0.17 0.45 0.21 0.25 0.32 0.16 0.35 0.48 0.35 0.08 0.17 0.02 0.85 0.72 0.12 0.15 0.2 0.1 0.08 0.03 0.18 0.14 0.16 0.24 0.43 0.11 0.78 0.24 1.0 0.1
0.17 0.18 0.12 0.15 0.14 0.19 0.14 0.18 0.23 0.25 0.39 0.5 0.22 0.22 0.09 0.06 0.03 0.42 0.24 0.07 0.29 0.47 0.18 0.08 0.03 0.05 0.07 0.15 0.16 0.21 0.13 0.3 0.42 1.0 0.26
0.37 0.44 0.24 0.38 0.16 0.38 0.57 0.28 0.33 0.38 0.25 0.33 0.37 0.17 0.13 0.15 0.03 0.51 0.49 0.14 0.24 0.35 0.18 0.24 0.07 0.05 0.06 0.32 0.19 0.63 0.21 1.0 0.25 1.0 0.25
0.14 0.2 0.12 0.21 0.15 0.19 0.26 0.3 0.22 0.19 0.21 0.45 0.34 0.05 0.17 0.12 0.08 0.52 0.67 0.1 0.16 0.27 0.18 0.16 0.02 0.11 0.21 0.13 0.19 0.32 0.12 0.51 0.24 1.0 0.0
0.34 0.36 0.24 0.31 0.36 0.35 0.42 0.28 0.4 0.41 0.35 0.58 0.39 0.25 0.23 0.25 0.02 0.92 0.63 0.17 0.47 0.56 0.52 0.18 0.05 0.08 0.09 0.47 0.36 0.5 0.19 0.79 0.52 1.0 0.32
0.3 0.33 0.24 0.3 0.28 0.32 0.38 0.31 0.37 0.38 0.4 0.53 0.44 0.34 0.15 0.12 0.1 0.61 0.52 0.11 0.12 0.26 0.12 0.29 0.5 0.29 0.32 0.22 0.28 0.71 0.34 1.0 0.5 0.95 0.59
0.13 0.09 0.07 0.07 0.06 0.12 0.12 0.11 0.11 0.1 0.07 0.19 0.19 0.09 0.01 0.01 0.0 0.28 0.11 0.02 0.16 0.11 0.1 0.02 0.01 0.03 0.03 0.03 0.09 0.26 0.04 0.45 0.09 1.0 0.05
0.48 0.35 0.29 0.33 0.2 0.34 0.42 0.27 0.27 0.32 0.24 0.43 0.41 0.19 0.18 0.11 0.05 0.54 0.44 0.12 0.41 0.41 0.25 0.45 0.06 0.14 0.16 0.18 0.23 0.59 0.3 0.79 0.34 1.0 0.1
0.27 0.22 0.15 0.17 0.24 0.32 0.34 0.26 0.33 0.33 0.29 0.34 0.35 0.5 0.13 0.04 0.01 0.56 0.46 0.25 0.23 0.4 0.21 0.22 0.07 0.25 0.11 0.11 0.33 0.56 0.26 1.0 0.36 0.74 0.38
0.35 0.35 0.25 0.33 0.14 0.41 0.32 0.29 0.29 0.3 0.1 0.21 0.15 0.15 0.07 0.04 0.04 0.73 0.89 0.08 0.0 0.03 0.01 0.04 0.04 0.18 0.24 0.07 0.41 0.42 0.17 0.6 0.09 1.0 0.02
0.61 0.46 0.4 0.41 0.27 0.45 0.46 0.54 0.37 0.38 0.25 0.4 0.35 0.26 0.28 0.24 0.16 0.58 0.57 0.26 0.45 0.43 0.32 0.44 0.19 0.19 0.19 0.42 0.36 0.6 0.38 0.71 0.35 1.0 0.67
0.05 0.07 0.03 0.06 0.03 0.05 0.07 0.14 0.06 0.08 0.04 0.12 0.18 0.07 0.01 0.01 0.0 0.28 0.12 0.06 0.17 0.13 0.06 0.06 0.01 0.02 0.03 0.02 0.14 0.19 0.09 0.25 0.05 1.0 0.02
0.11 0.18 0.09 0.18 0.13 0.16 0.25 0.17 0.23 0.26 0.29 0.46 0.26 0.25 0.07 0.07 0.05 0.4 0.45 0.08 0.15 0.27 0.13 0.29 0.03 0.06 0.21 0.03 0.18 0.53 0.25 0.69 0.37 1.0 0.54
0.33 0.33 0.2 0.32 0.22 0.34 0.4 0.23 0.39 0.34 0.37 0.54 0.26 0.21 0.09 0.1 0.03 0.47 0.46 0.12 0.25 0.45 0.2 0.25 0.08 0.03 0.05 0.25 0.25 0.42 0.14 0.73 0.51 1.0 0.37
0.14 0.19 0.1 0.21 0.08 0.14 0.28 0.16 0.14 0.15 0.06 0.2 0.19 0.13 0.04 0.06 0.05 0.36 0.33 0.02 0.07 0.14 0.07 0.08 0.02 0.01 0.01 0.03 0.09 0.29 0.05 0.59 0.08 1.0 0.01
0.24 0.24 0.19 0.25 0.14 0.26 0.31 0.25 0.24 0.25 0.26 0.38 0.21 0.26 0.08 0.08 0.02 0.52 0.47 0.09 0.17 0.21 0.14 0.19 0.06 0.03 0.06 0.14 0.16 0.32 0.14 0.46 0.32 1.0 0.45
0.31 0.36 0.19 0.31 0.25 0.36 0.42 0.37 0.3 0.32 0.21 0.34 0.33 0.27 0.1 0.04 0.02 0.71 0.66 0.18 0.13 0.18 0.13 0.17 0.1 0.05 0.06 0.07 0.47 0.57 0.16 1.0 0.3 0.82 0.08
0.33 0.45 0.36 0.47 0.29 0.38 0.59 0.38 0.45 0.51 0.33 0.48 0.47 0.27 0.23 0.21 0.06 0.66 0.68 0.25 0.19 0.51 0.16 0.47 0.1 0.21 0.2 0.51 0.36 0.67 0.39 0.86 0.52 1.0 0.82
0.49 0.57 0.3 0.49 0.38 0.48 0.62 0.47 0.54 0.6 0.32 0.49 0.39 0.18 0.21 0.17 0.13 0.59 0.66 0.12 0.35 0.42 0.3 0.22 0.09 0.17 0.17 0.53 0.23 0.57 0.33 0.78 0.44 1.0 0.53
0.17 0.13 0.06 0.09 0.1 0.15 0.12 0.13 0.14 0.15 0.18 0.37 0.49 0.1 0.05 0.01 0.02 0.31 0.21 0.03 0.06 0.11 0.05 0.06 0.01 0.13 0.17 0.06 0.21 0.33 0.1 0.55 0.27 1.0 0.06
0.12 0.09 0.08 0.08 0.15 0.21 0.12 0.17 0.24 0.2 0.06 0.12 0.36 0.08 0.03 0.03 0.01 0.4 0.15 0.07 0.05 0.06 0.04 0.04 0.02 0.15 0.35 0.02 0.2 0.4 0.38 0.32 0.09 1.0 0.02
0.08 0.07 0.08 0.08 0.06 0.14 0.11 0.16 0.11 0.14 0.04 0.13 0.15 0.24 0.01 0.0 0.01 0.43 0.14 0.03 0.05 0.09 0.06 0.01 0.03 0.25 0.77 0.0 0.1 0.39 0.08 0.49 0.05 1.0 0.01
0.3 0.39 0.22 0.4 0.21 0.33 0.45 0.37 0.42 0.36 0.23 0.42 0.47 0.27 0.11 0.08 0.08 0.62 0.45 0.18 0.1 0.21 0.07 0.28 0.17 0.07 0.1 0.13 0.25 0.72 0.27 1.0 0.38 0.81 0.22
0.33 0.5 0.29 0.57 0.18 0.34 0.49 0.35 0.42 0.46 0.41 0.53 0.36 0.33 0.08 0.22 0.01 0.74 0.71 0.12 0.25 0.4 0.17 0.18 0.05 0.08 0.08 0.21 0.35 0.6 0.19 1.0 0.37 0.72 0.07
0.34 0.54 0.22 0.45 0.22 0.31 0.69 0.26 0.42 0.48 0.33 0.42 0.24 0.09 0.19 0.22 0.09 1.0 0.83 0.09 0.33 0.37 0.21 0.15 0.02 0.03 0.03 0.65 0.31 0.3 0.09 0.54 0.49 0.73 0.45
0.3 0.42 0.3 0.51 0.27 0.32 0.63 0.24 0.46 0.46 0.42 0.44 0.9 0.31 0.15 0.18 0.12 1.0 0.76 0.34 0.24 0.41 0.21 0.26 0.1 0.16 0.1 0.67 0.24 0.45 0.21 0.7 0.5 0.92 0.84
0.15 0.12 0.06 0.1 0.07 0.08 0.13 0.11 0.08 0.1 0.17 0.34 0.12 0.14 0.02 0.02 0.01 0.34 0.2 0.06 0.26 0.39 0.21 0.03 0.03 0.02 0.03 0.04 0.11 0.22 0.04 0.43 0.19 1.0 0.05
0.21 0.32 0.21 0.35 0.21 0.32 0.44 0.43 0.42 0.38 0.16 0.26 0.33 0.31 0.07 0.15 0.01 0.79 0.84 0.12 0.17 0.27 0.15 0.2 0.04 0.05 0.08 0.12 0.22 0.36 0.15 0.58 0.19 1.0 0.19
0.22 0.25 0.23 0.32 0.24 0.23 0.4 0.15 0.39 0.28 0.29 0.42 0.21 0.19 0.28 0.24 0.31 0.45 0.66 0.14 0.1 0.15 0.1 0.38 0.14 0.19 0.22 0.37 0.28 0.52 0.26 0.69 0.32 1.0 0.27

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)