1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_88 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
4h after treatment
4h after treatment,No nitrate
8h after treatment
8h after treatment,No nitrate
20C
20h after treatment
20h after treatment,No nitrate
20h after treatment,Nocodazole added
36h after treatment
36h after treatment,No phosphate
Blue light,10min after light change
Blue light,60min after light change
Bohlin
CCAP1055/1,20C
CCAP1055/1,20C,High CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Low CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Normal CO2,OligoDT primed
CCMP2561
CCMP2561 Nitrase Reductase Knockout
CCMP632
CCMP632,24h
CCMP632,48h
CCMP632,72h
CCMP632,High light acclimated WT
CCMP632,Low light acclimated WT
NEPCC640,8h,1000ppmv CO2
NEPCC640,8h,390 ppmv CO2
No light,8h after treatment
Pt-1
Pt-1 8.6
Pt-1 8.6,With nitrogen
Pt-1 8.6,Without nitrogen
Red light,0min before light change
UTEX 646,Blue light
UTEX 646,No light
0.3 0.31 0.35 0.36 0.23 0.36 0.39 0.38 0.46 0.52 0.38 0.47 0.33 1.0 0.18 0.18 0.16 0.17 0.22 0.37 0.41 0.43 0.33 0.57 0.4 0.6 0.53 0.26 0.49 0.91 0.65 0.96 0.41 0.2 0.26
0.23 0.4 0.23 0.35 0.28 0.25 0.47 0.33 0.35 0.36 0.64 0.57 0.22 0.59 0.24 0.2 0.11 0.38 0.94 0.12 0.7 1.0 0.32 0.56 0.35 0.79 0.86 0.92 0.7 0.65 0.42 0.92 0.77 0.68 0.42
0.07 0.08 0.07 0.07 0.05 0.08 0.08 0.09 0.07 0.07 0.06 0.09 0.08 0.06 0.03 0.02 0.03 0.06 0.06 0.05 0.02 0.04 0.02 0.15 0.05 0.34 1.0 0.04 0.12 0.25 0.38 0.28 0.09 0.29 0.23
0.13 0.23 0.14 0.27 0.14 0.19 0.33 0.22 0.21 0.23 0.13 0.14 0.17 0.16 0.05 0.1 0.01 0.23 0.3 0.21 0.03 0.09 0.03 0.2 0.13 0.47 1.0 0.29 0.46 0.63 0.61 0.63 0.14 0.15 0.31
0.1 0.11 0.1 0.1 0.12 0.17 0.1 0.13 0.17 0.14 0.07 0.07 0.16 0.09 0.14 0.13 0.05 0.15 0.15 0.41 0.05 0.07 0.07 0.18 0.24 0.69 1.0 0.15 0.26 0.3 0.51 0.13 0.08 0.18 0.43
0.05 0.05 0.06 0.04 0.04 0.06 0.02 0.16 0.05 0.04 0.17 0.07 0.3 0.07 0.03 0.03 0.01 0.05 0.12 0.04 0.42 0.31 0.18 0.1 0.05 0.26 1.0 0.07 0.16 0.19 0.27 0.05 0.05 0.16 0.12
0.39 0.48 0.44 0.54 0.43 0.56 0.72 0.67 0.57 0.57 0.46 0.51 0.74 0.92 0.18 0.16 0.1 0.23 0.64 0.17 0.42 0.48 0.26 0.6 0.47 0.64 1.0 0.6 0.68 0.56 0.49 0.44 0.47 0.6 0.76
0.57 0.41 0.67 0.43 0.54 0.55 0.34 0.52 0.46 0.5 0.81 0.57 0.04 0.34 0.24 0.14 0.28 0.26 0.45 0.58 0.08 0.35 0.06 0.52 0.12 0.11 0.18 0.54 0.61 0.54 0.47 0.63 0.39 1.0 0.64
0.08 0.11 0.06 0.12 0.05 0.12 0.13 0.1 0.12 0.1 0.01 0.02 0.05 0.04 0.02 0.02 0.03 0.13 0.18 0.2 0.14 0.08 0.02 0.13 0.07 0.31 1.0 0.08 0.07 0.37 0.38 0.14 0.02 0.04 0.06
0.05 0.08 0.05 0.07 0.06 0.07 0.09 0.06 0.08 0.08 0.07 0.07 0.11 0.09 0.06 0.03 0.07 0.09 0.13 0.17 0.02 0.03 0.03 0.09 0.07 0.29 1.0 0.04 0.12 0.24 0.21 0.15 0.07 0.1 0.13
0.14 0.16 0.13 0.16 0.21 0.21 0.19 0.15 0.25 0.23 0.24 0.26 0.12 0.31 0.1 0.13 0.01 0.2 0.22 0.18 0.5 0.38 0.67 0.24 0.35 0.23 1.0 0.31 0.19 0.22 0.27 0.13 0.25 0.19 0.75
0.21 0.34 0.22 0.36 0.36 0.29 0.51 0.2 0.45 0.43 0.96 0.63 1.0 0.96 0.34 0.22 0.47 0.27 0.33 0.49 0.1 0.26 0.15 0.59 0.77 0.22 0.35 0.5 0.51 0.91 0.68 0.75 0.54 0.65 0.94
0.08 0.14 0.09 0.1 0.11 0.1 0.12 0.15 0.09 0.12 0.4 0.47 0.12 0.72 0.02 0.07 0.01 0.13 0.3 0.55 0.35 0.66 0.19 0.35 0.13 0.43 1.0 0.05 0.31 0.45 0.57 0.32 0.47 0.36 0.58
0.13 0.15 0.14 0.16 0.17 0.13 0.21 0.34 0.16 0.17 0.42 0.26 0.17 0.31 0.1 0.1 0.05 0.16 0.23 0.31 0.08 0.25 0.04 0.28 0.11 0.28 1.0 0.41 0.41 0.62 0.67 0.49 0.23 0.39 0.81
0.09 0.13 0.09 0.14 0.16 0.11 0.19 0.11 0.15 0.16 0.43 0.26 0.24 0.45 0.06 0.09 0.12 0.14 0.2 0.16 0.41 0.37 0.37 0.36 0.45 0.36 1.0 0.29 0.48 0.53 0.57 0.39 0.26 0.23 0.6
0.09 0.13 0.04 0.24 0.11 0.19 0.0 0.21 0.17 0.08 0.08 0.09 0.0 0.03 0.03 0.15 0.02 0.03 0.05 0.62 0.07 0.1 0.09 0.64 0.24 0.12 0.26 0.27 0.34 0.41 0.28 0.07 0.11 0.14 1.0
0.05 0.08 0.2 0.13 0.09 0.1 0.13 0.36 0.08 0.11 0.07 0.08 0.12 0.41 0.02 0.04 0.01 0.05 0.22 0.16 0.48 0.38 0.1 0.26 0.05 0.28 1.0 0.09 0.34 0.36 0.45 0.19 0.08 0.11 0.16
0.13 0.13 0.13 0.15 0.2 0.17 0.19 0.17 0.17 0.17 0.31 0.23 0.29 1.0 0.09 0.07 0.15 0.13 0.39 0.32 0.2 0.15 0.12 0.46 0.47 0.26 0.88 0.22 0.45 0.45 0.47 0.34 0.18 0.44 0.37
0.72 0.66 0.69 0.57 0.52 0.76 0.58 0.83 0.66 0.82 0.45 0.57 0.27 0.81 0.18 0.38 0.13 0.47 0.59 0.46 0.62 0.7 0.91 0.59 0.42 0.14 0.22 1.0 0.84 0.68 0.56 0.92 0.51 0.61 0.16
0.21 0.11 0.18 0.07 0.16 0.14 0.04 0.14 0.15 0.14 0.46 0.44 0.1 0.03 0.16 0.16 0.11 0.05 0.07 0.16 0.35 0.25 0.3 0.36 0.44 0.2 0.12 1.0 0.41 0.62 0.88 0.04 0.26 0.46 0.2
0.19 0.25 0.19 0.23 0.16 0.24 0.25 0.28 0.25 0.28 0.82 0.55 0.29 0.28 0.13 0.2 0.09 0.29 0.46 0.28 0.04 0.17 0.04 0.44 0.18 0.26 0.58 0.43 0.46 0.95 1.0 0.53 0.4 0.5 0.68
0.24 0.28 0.29 0.32 0.23 0.28 0.3 0.5 0.36 0.4 0.35 0.45 0.5 1.0 0.21 0.21 0.24 0.34 0.61 0.54 0.29 0.41 0.22 0.54 0.37 0.93 0.67 0.29 0.46 0.55 0.59 0.44 0.46 0.3 0.45
0.16 0.22 0.23 0.34 0.25 0.2 0.37 0.2 0.35 0.32 0.34 0.3 0.37 0.22 0.15 0.16 0.21 0.21 0.28 0.48 0.11 0.16 0.15 0.41 0.44 0.46 1.0 0.39 0.63 0.79 0.79 0.45 0.3 0.23 0.39
0.17 0.21 0.2 0.28 0.41 0.28 0.36 0.29 0.44 0.39 0.36 0.26 0.21 0.25 0.27 0.2 0.18 0.31 0.35 0.75 0.2 0.24 0.25 0.58 0.26 0.39 0.78 0.52 0.31 1.0 0.81 0.62 0.22 0.48 0.31
0.14 0.17 0.15 0.18 0.12 0.14 0.15 0.21 0.17 0.15 1.0 0.41 0.22 0.07 0.11 0.14 0.14 0.12 0.14 0.19 0.07 0.14 0.07 0.14 0.16 0.35 0.63 0.41 0.37 0.3 0.34 0.12 0.34 0.37 0.58
0.28 0.41 0.36 0.44 0.11 0.56 0.44 0.72 0.77 0.5 0.2 0.16 0.08 0.27 0.06 0.07 0.04 0.2 0.39 0.71 0.18 0.26 0.09 0.56 0.11 0.15 0.15 0.77 0.87 1.0 0.62 0.52 0.16 0.19 0.98
0.18 0.31 0.2 0.35 0.21 0.27 0.42 0.35 0.34 0.37 0.59 0.33 0.24 0.33 0.08 0.1 0.08 0.2 0.24 0.56 0.08 0.22 0.1 0.53 0.11 0.1 0.08 0.43 0.45 1.0 0.5 0.71 0.28 0.19 0.49
0.17 0.21 0.14 0.2 0.13 0.2 0.25 0.14 0.24 0.23 0.23 0.2 0.36 0.09 0.11 0.12 0.05 0.15 0.17 0.2 0.29 0.19 0.3 0.24 0.39 0.27 1.0 0.22 0.21 0.3 0.23 0.28 0.2 0.16 0.45
0.09 0.11 0.14 0.16 0.09 0.1 0.17 0.26 0.13 0.15 0.17 0.19 0.07 0.56 0.06 0.09 0.06 0.1 0.18 0.12 0.24 0.23 0.1 0.21 0.07 0.29 1.0 0.13 0.19 0.32 0.41 0.16 0.17 0.15 0.55
0.06 0.1 0.11 0.14 0.13 0.14 0.14 0.2 0.17 0.18 0.12 0.15 0.15 0.36 0.07 0.09 0.14 0.12 0.22 0.15 0.27 0.22 0.14 0.25 0.13 0.3 1.0 0.11 0.41 0.29 0.3 0.13 0.15 0.18 0.35
0.25 0.35 0.29 0.42 0.27 0.32 0.42 0.43 0.41 0.45 0.81 0.5 0.37 0.24 0.18 0.14 0.18 0.25 0.23 0.31 0.17 0.41 0.26 0.5 0.31 0.53 1.0 0.6 0.47 0.63 0.54 0.55 0.45 0.52 0.58
0.21 0.14 0.18 0.13 0.18 0.21 0.12 0.24 0.19 0.17 0.34 0.36 0.2 0.19 0.18 0.08 0.16 0.15 0.19 0.1 0.2 0.28 0.11 0.55 0.16 0.2 1.0 0.11 0.16 0.4 0.43 0.27 0.4 0.29 0.57
0.04 0.09 0.06 0.12 0.16 0.1 0.17 0.08 0.15 0.14 0.4 0.38 0.19 0.52 0.06 0.09 0.04 0.11 0.15 0.16 0.11 0.27 0.18 0.25 0.38 0.45 1.0 0.13 0.32 0.21 0.19 0.24 0.35 0.27 0.63
0.1 0.08 0.09 0.1 0.12 0.1 0.07 0.16 0.08 0.09 0.26 0.24 0.05 0.07 0.06 0.03 0.08 0.04 0.05 0.16 0.02 0.06 0.02 0.15 0.07 0.33 1.0 0.12 0.17 0.32 0.31 0.21 0.25 0.22 0.35
0.29 0.31 0.32 0.29 0.4 0.31 0.28 0.23 0.32 0.32 0.57 0.5 0.63 0.83 0.25 0.14 0.36 0.22 0.27 0.35 0.02 0.06 0.04 0.55 0.54 0.42 0.42 0.47 0.5 0.39 0.6 0.28 0.43 0.41 1.0
0.07 0.13 0.08 0.12 0.15 0.11 0.17 0.34 0.07 0.08 0.66 0.35 0.03 0.35 0.05 0.04 0.03 0.08 0.09 0.16 0.17 0.4 0.03 1.0 0.76 0.06 0.04 0.02 0.04 0.74 0.57 0.62 0.27 0.18 0.24
0.03 0.04 0.03 0.06 0.11 0.07 0.06 0.08 0.1 0.07 0.09 0.07 0.13 0.12 0.06 0.04 0.07 0.04 0.05 0.13 0.19 0.14 0.36 0.21 0.43 0.23 1.0 0.11 0.13 0.17 0.25 0.07 0.06 0.03 0.49
0.13 0.19 0.12 0.2 0.15 0.2 0.23 0.22 0.25 0.23 0.08 0.1 0.24 0.08 0.05 0.08 0.01 0.21 0.22 0.11 0.22 0.18 0.2 0.2 0.19 0.38 1.0 0.2 0.45 0.55 0.78 0.31 0.1 0.21 0.29
0.02 0.03 0.06 0.05 0.04 0.05 0.06 0.23 0.03 0.02 0.01 0.01 0.03 0.06 0.01 0.02 0.0 0.03 0.22 0.05 0.34 0.21 0.05 0.14 0.09 0.43 1.0 0.03 0.21 0.39 0.66 0.1 0.01 0.08 0.05
0.1 0.13 0.09 0.13 0.1 0.12 0.15 0.13 0.15 0.15 0.07 0.09 0.26 0.1 0.09 0.07 0.1 0.14 0.2 0.17 0.05 0.09 0.06 0.13 0.09 0.39 1.0 0.2 0.26 0.34 0.42 0.25 0.1 0.17 0.29
0.16 0.26 0.13 0.21 0.14 0.25 0.29 0.16 0.28 0.29 0.16 0.21 0.12 0.21 0.18 0.15 0.26 0.21 0.22 0.18 0.02 0.06 0.03 0.29 0.2 0.44 1.0 0.42 0.49 0.6 0.99 0.32 0.23 0.2 0.27
0.06 0.09 0.08 0.11 0.09 0.08 0.12 0.29 0.09 0.1 0.11 0.09 0.18 0.1 0.05 0.04 0.07 0.07 0.08 0.18 0.02 0.05 0.01 0.25 0.14 0.36 1.0 0.05 0.26 0.4 0.44 0.19 0.09 0.25 0.49
0.15 0.2 0.12 0.18 0.19 0.16 0.21 0.29 0.15 0.16 1.0 0.45 0.33 0.57 0.13 0.17 0.1 0.36 0.57 0.24 0.03 0.13 0.03 0.24 0.23 0.17 0.48 0.57 0.25 0.56 0.56 0.42 0.31 0.6 0.55
0.37 0.31 0.29 0.28 0.34 0.35 0.32 0.33 0.37 0.41 1.0 0.71 0.14 0.35 0.26 0.23 0.13 0.37 0.51 0.35 0.11 0.26 0.12 0.46 0.36 0.41 0.52 0.61 0.43 0.61 0.45 0.78 0.65 0.72 0.34
0.11 0.2 0.09 0.2 0.06 0.09 0.26 0.17 0.1 0.18 0.81 0.29 0.23 0.37 0.06 0.12 0.01 0.3 0.36 0.52 0.07 0.15 0.06 0.15 0.12 0.21 0.28 1.0 0.37 0.37 0.34 0.3 0.25 0.21 0.5
0.14 0.21 0.21 0.22 0.22 0.19 0.31 0.37 0.2 0.22 0.25 0.24 0.36 1.0 0.14 0.2 0.14 0.27 0.64 0.23 0.44 0.44 0.2 0.66 0.4 0.36 1.0 0.3 0.7 0.78 0.67 0.72 0.19 0.37 0.7
0.05 0.08 0.1 0.09 0.13 0.08 0.12 0.15 0.12 0.16 0.39 0.5 0.41 0.81 0.09 0.12 0.03 0.19 0.14 0.26 0.22 0.31 0.13 0.52 0.31 0.02 0.01 0.08 0.21 0.74 0.39 1.0 0.54 0.42 0.33
0.51 0.47 0.21 0.27 0.5 0.56 0.3 0.27 0.52 0.3 0.83 0.7 0.22 0.22 0.36 0.17 0.2 0.27 0.48 0.68 0.3 0.48 0.34 0.7 0.45 0.39 0.82 0.68 0.35 0.89 1.0 0.61 0.57 0.82 0.6
0.1 0.11 0.09 0.13 0.14 0.16 0.13 0.11 0.2 0.14 0.12 0.12 0.13 0.11 0.06 0.07 0.06 0.09 0.13 0.11 0.1 0.08 0.08 0.18 0.21 0.36 1.0 0.15 0.15 0.21 0.28 0.12 0.15 0.12 0.31
0.07 0.08 0.07 0.07 0.06 0.09 0.09 0.09 0.11 0.25 0.15 0.25 0.07 0.2 0.05 0.04 0.04 0.1 0.12 0.39 0.05 0.1 0.03 0.11 0.03 0.33 1.0 0.03 0.13 0.09 0.09 0.09 0.2 0.24 0.3
0.12 0.18 0.26 0.24 0.11 0.19 0.25 0.57 0.19 0.25 0.22 0.28 0.13 1.0 0.02 0.02 0.02 0.04 0.1 0.17 0.61 0.39 0.11 0.41 0.23 0.19 0.55 0.09 0.45 0.24 0.19 0.28 0.21 0.32 0.35
0.07 0.09 0.11 0.13 0.12 0.09 0.13 0.1 0.11 0.11 0.13 0.06 0.17 0.13 0.08 0.13 0.06 0.16 0.13 0.11 0.03 0.06 0.02 0.23 0.12 0.42 1.0 0.14 0.3 0.32 0.41 0.17 0.09 0.15 0.67
0.22 0.3 0.16 0.27 0.26 0.22 0.3 0.13 0.32 0.33 1.0 0.35 0.44 0.47 0.25 0.28 0.21 0.27 0.69 0.31 0.2 0.37 0.28 0.25 0.13 0.22 0.2 0.48 0.3 0.14 0.12 0.17 0.27 0.54 0.55
0.06 0.07 0.13 0.11 0.11 0.12 0.08 0.32 0.13 0.15 0.33 0.33 0.19 1.0 0.09 0.08 0.08 0.11 0.2 0.36 0.49 0.45 0.31 0.36 0.12 0.19 0.51 0.08 0.42 0.33 0.36 0.18 0.34 0.17 0.18
0.14 0.12 0.13 0.12 0.07 0.12 0.07 0.13 0.11 0.14 0.16 0.07 0.07 0.02 0.12 0.11 0.03 0.1 0.11 0.17 0.03 0.08 0.01 0.16 0.09 0.33 1.0 0.15 0.1 0.24 0.33 0.11 0.08 0.18 0.08
0.16 0.18 0.19 0.22 0.11 0.18 0.22 0.37 0.18 0.22 0.72 0.56 0.15 0.21 0.26 0.2 0.47 0.22 0.37 0.15 0.01 0.09 0.01 0.2 0.05 0.3 1.0 0.21 0.45 0.57 0.68 0.31 0.56 0.75 0.56
0.14 0.16 0.16 0.14 0.17 0.16 0.15 0.22 0.18 0.2 1.0 0.58 0.07 0.16 0.14 0.09 0.22 0.08 0.13 0.16 0.01 0.05 0.01 0.65 0.18 0.22 0.32 0.16 0.32 0.59 0.61 0.23 0.67 0.56 0.49
0.23 0.32 0.25 0.38 0.27 0.35 0.46 0.36 0.42 0.41 1.0 0.7 0.4 0.54 0.12 0.18 0.04 0.32 0.38 0.63 0.58 0.62 0.54 0.37 0.22 0.23 0.19 0.38 0.32 0.88 0.59 0.98 0.72 0.62 0.56
0.05 0.06 0.04 0.05 0.06 0.06 0.04 0.11 0.08 0.06 0.29 0.12 0.07 0.05 0.12 0.13 0.1 0.06 0.06 0.16 0.1 0.09 0.06 0.25 0.25 0.36 0.49 0.12 0.4 0.47 1.0 0.07 0.16 0.54 0.32

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)