Heatmap: Cluster_34 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4h after treatment
4h after treatment,No nitrate
8h after treatment
8h after treatment,No nitrate
20C
20h after treatment
20h after treatment,No nitrate
20h after treatment,Nocodazole added
36h after treatment
36h after treatment,No phosphate
Blue light,10min after light change
Blue light,60min after light change
Bohlin
CCAP1055/1,20C
CCAP1055/1,20C,High CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Low CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Normal CO2,OligoDT primed
CCMP2561
CCMP2561 Nitrase Reductase Knockout
CCMP632
CCMP632,24h
CCMP632,48h
CCMP632,72h
CCMP632,High light acclimated WT
CCMP632,Low light acclimated WT
NEPCC640,8h,1000ppmv CO2
NEPCC640,8h,390 ppmv CO2
No light,8h after treatment
Pt-1
Pt-1 8.6
Pt-1 8.6,With nitrogen
Pt-1 8.6,Without nitrogen
Red light,0min before light change
UTEX 646,Blue light
UTEX 646,No light
0.55 -0.31 0.04 -0.89 0.1 0.66 -0.58 -0.81 0.52 0.47 -0.0 0.07 -0.65 -1.38 1.11 -0.32 1.21 -0.44 -0.38 -0.06 -0.63 -0.77 -1.32 -0.09 -0.74 -0.37 -0.55 0.25 -0.57 -0.25 -0.37 -1.69 0.68 -0.21 1.47
0.46 0.31 0.18 0.23 0.45 0.52 0.12 -0.03 0.58 0.36 0.23 0.48 0.65 -0.22 -0.63 -0.79 -0.67 -0.05 0.23 -0.84 -0.51 0.2 -0.84 -0.01 -1.68 -0.47 -0.85 0.66 -0.76 -1.15 -1.33 -1.54 0.55 0.64 0.59
0.46 0.31 0.18 0.23 0.45 0.52 0.12 -0.03 0.58 0.36 0.23 0.48 0.65 -0.22 -0.63 -0.79 -0.67 -0.05 0.23 -0.84 -0.51 0.2 -0.84 -0.01 -1.68 -0.47 -0.85 0.66 -0.76 -1.15 -1.33 -1.54 0.55 0.64 0.59
1.47 -0.05 1.0 -0.8 0.54 1.87 -1.58 -0.07 1.5 1.07 -1.26 -1.62 -3.6 -5.9 0.58 -0.45 0.51 -0.32 -1.23 -0.97 -0.7 -0.92 -1.41 0.71 -0.17 0.07 -0.55 -1.02 -0.93 -0.22 0.97 -3.52 -0.83 -0.51 -2.76
-0.84 -0.32 -1.12 -0.26 0.85 0.45 0.14 -1.17 0.85 0.09 -0.08 0.0 -0.06 0.73 -0.17 -0.79 0.06 -0.77 -0.55 -0.1 0.05 -0.13 1.19 0.38 1.06 -0.77 -1.87 0.37 -0.85 -0.62 -0.33 -0.53 -0.01 -1.16 0.67
-0.42 -0.01 -0.55 -0.22 0.17 0.21 0.17 -0.94 1.1 0.5 0.07 0.02 -0.26 -0.33 -0.78 -0.87 -1.06 -0.45 -0.18 0.24 0.66 1.35 0.99 0.52 -1.41 -0.63 -1.41 0.37 -0.52 -0.33 -0.23 -0.45 0.15 -0.55 0.02
-0.43 -0.49 -0.51 -0.76 1.55 0.41 -1.19 -1.21 0.26 0.27 0.0 -0.18 -4.96 -0.34 1.23 0.47 0.3 -0.94 -1.15 1.19 1.09 2.32 1.02 -0.04 -0.92 -3.75 -5.15 -0.13 -1.57 -1.97 -1.62 -3.71 -0.09 -3.02 -3.44
-0.32 -0.11 -0.26 -0.58 0.82 0.69 -0.59 -0.68 0.77 0.47 0.59 0.52 -3.49 0.47 0.57 -0.08 -0.14 -0.15 -0.17 1.16 0.8 1.32 0.3 0.68 -0.31 -2.6 -2.8 -0.9 -1.59 -1.32 -1.15 -2.24 0.84 -2.19 -2.9
0.69 0.17 0.13 -0.14 0.37 1.13 0.28 -0.08 1.03 0.91 -1.01 -1.05 -0.38 -2.84 0.43 -0.45 0.27 -0.44 -0.29 -0.12 0.96 1.19 0.5 -0.13 -2.57 0.04 -1.08 0.23 -1.94 -1.07 -0.58 -1.54 -0.76 -0.41 -0.87
0.79 0.35 0.46 0.29 0.16 1.13 0.42 0.35 1.05 0.98 -1.31 -1.72 -1.54 -3.66 -0.37 -1.14 -0.96 0.55 0.09 0.05 -0.29 0.16 0.54 -0.22 -0.51 -1.31 -2.01 -0.28 0.15 0.32 0.19 0.56 -1.59 -0.55 -0.82
0.41 0.6 0.01 0.21 0.72 0.86 -0.18 -1.09 1.01 0.62 -0.33 -0.3 -3.38 -2.2 0.24 -0.45 0.44 -0.68 -0.7 -0.4 -0.61 -0.7 -0.71 -0.01 0.88 -0.85 -2.37 0.6 -0.93 -0.89 0.23 -2.27 0.14 0.2 1.46
0.83 0.05 0.74 -0.74 0.38 1.51 -1.42 1.22 1.01 0.62 -0.36 -0.68 -2.63 -3.69 0.28 -0.06 -0.73 -0.5 -1.6 -0.2 0.06 -0.03 0.45 0.49 0.2 0.58 -0.26 -1.28 -1.57 -0.1 0.78 -1.5 -0.33 -1.66 -4.01
0.15 0.23 -0.36 0.09 0.6 0.58 0.47 -0.81 0.93 0.63 -0.07 -0.28 -0.88 -0.33 0.02 -0.52 -0.38 -0.31 0.15 0.33 0.17 0.71 0.29 -0.61 -1.65 -0.47 -0.99 -0.37 -1.51 -0.93 -0.74 -1.37 -0.16 0.3 1.46
-0.81 -0.68 -1.07 -0.61 0.53 -0.07 -0.47 -0.84 0.46 0.18 0.48 0.3 0.59 0.5 -0.05 -0.56 -0.34 -0.28 -0.39 0.1 0.06 -0.05 0.79 -0.03 0.47 0.31 -0.34 -0.33 -0.6 -1.03 -0.53 -2.62 0.27 -0.1 1.47
0.49 0.53 0.04 0.18 0.42 0.65 0.62 -0.48 0.75 0.65 0.01 0.09 -0.61 -0.64 -0.41 -0.62 -0.4 -0.13 0.2 -1.57 -0.18 1.16 -0.26 0.12 -1.84 -0.57 -0.75 0.3 -0.91 0.08 0.49 -0.71 0.04 -0.62 -0.85
0.46 0.46 0.31 0.64 -0.02 1.18 0.9 -0.12 1.36 1.13 0.23 0.17 -1.42 -2.34 0.0 -0.09 -0.47 -0.07 0.26 -0.4 -1.0 -0.65 -0.96 -0.11 -1.94 -0.87 -1.71 -0.23 -0.82 -1.04 -0.28 -2.45 0.58 0.09 0.06
0.4 0.31 0.48 0.11 0.46 0.88 0.25 0.47 0.8 0.61 0.76 0.56 -1.14 -1.38 -0.27 -1.36 0.12 -0.56 -0.23 -0.41 -1.8 -0.02 -2.12 0.31 -1.33 -1.17 -1.14 -0.44 -0.22 -0.35 -0.4 -1.12 0.82 1.28 -0.99
-0.71 -0.48 -0.92 -0.7 1.19 0.47 -0.32 -1.29 0.88 0.41 -0.08 -0.28 -0.07 -0.3 -0.02 -0.76 -0.81 -0.52 -0.11 0.04 0.63 0.52 1.46 -0.73 -0.71 -1.33 -1.6 0.27 -0.66 -0.59 -0.45 -1.15 -0.05 0.26 1.41
0.49 -0.75 0.65 -1.36 0.02 0.43 -2.13 0.71 -0.49 0.04 0.82 1.1 -0.92 -0.97 0.79 -0.25 1.0 -0.18 -0.54 0.32 -2.68 -0.68 -2.18 -0.99 -2.52 0.28 -0.11 -1.79 0.15 -0.23 0.23 -1.17 1.24 1.21 -1.36
-0.25 0.13 -0.17 0.15 -0.15 0.58 0.45 -0.5 0.85 0.64 0.73 -0.27 -0.45 -0.53 -0.9 -1.26 -0.48 -0.56 -0.23 -0.36 0.6 0.18 0.49 0.3 -0.18 -0.09 -1.4 -3.42 -1.16 -0.36 -0.44 -0.1 -0.15 0.48 1.36
0.07 0.89 0.06 0.44 0.81 0.62 0.41 -0.77 0.63 0.6 0.66 0.54 -0.73 -0.55 0.19 -0.3 -0.41 -0.51 -0.09 -1.19 -0.25 0.42 -0.01 -0.8 -1.84 0.03 -0.74 -0.65 -2.06 -1.03 -0.47 -1.31 0.93 0.56 -0.33
-0.16 0.29 -1.03 0.11 -1.47 -0.08 0.28 -0.53 -0.2 -0.32 0.6 0.89 -0.22 0.78 -1.41 -1.54 -0.42 -0.1 0.47 -0.71 0.69 0.4 0.04 -0.95 -2.36 -0.77 -1.26 -0.13 -0.63 -0.72 -1.54 -0.29 0.94 1.44 1.29
-0.34 -0.0 -0.14 0.18 -0.01 -0.27 0.32 -0.97 0.04 0.12 0.35 0.64 1.15 0.44 -0.57 -0.95 -0.38 -0.62 -0.53 -0.16 -0.42 0.62 -0.39 -0.12 -0.97 -0.04 -0.89 -0.28 -0.36 0.17 -0.16 0.48 0.59 0.0 0.43
0.14 0.2 0.16 -0.06 0.06 0.91 0.05 -0.05 0.62 0.49 -0.14 -0.16 -4.74 -0.74 0.12 -0.8 0.13 -0.54 0.18 -0.52 0.55 0.61 -0.21 0.86 -1.34 -2.78 -1.08 -0.9 -1.6 0.48 0.7 -0.32 0.22 0.7 -0.1
0.34 0.33 0.07 0.4 0.19 0.47 0.38 -0.38 0.76 0.58 -0.29 0.07 0.18 -0.69 -0.66 -0.47 -2.16 -0.31 -0.12 -1.32 0.69 0.76 0.52 -0.11 -0.89 -0.85 -1.58 0.68 -0.89 -0.76 -0.48 -1.07 -0.05 0.58 0.6
0.34 -0.99 0.56 -1.09 -0.2 -0.07 -2.14 -0.43 -0.16 -0.39 0.25 0.16 -1.44 -3.05 0.96 0.16 0.06 0.52 0.2 -0.52 -0.45 0.03 -1.45 0.55 -0.15 0.42 -0.06 -0.4 -0.55 0.33 0.0 0.57 0.64 0.68 0.62
0.11 0.26 -0.28 -0.06 0.33 0.9 0.39 -0.63 1.1 0.59 0.46 0.3 -0.8 -0.3 0.7 -0.11 0.41 0.35 -0.05 0.1 -0.19 -0.23 -0.06 -0.21 -1.27 -0.92 -1.17 -0.41 -1.2 -1.27 -0.47 -2.9 0.67 0.6 -0.92
0.5 0.04 -0.08 -0.35 0.25 0.39 -0.44 -0.63 0.14 -0.07 0.38 0.75 -0.29 -0.01 0.62 -0.23 0.54 -0.37 0.25 -0.89 -0.0 0.17 -0.36 0.12 -1.02 -0.77 -0.6 0.2 -1.56 -0.86 -0.78 -1.27 0.44 1.21 0.39
0.53 0.18 -0.05 -0.25 0.67 1.07 0.44 -0.42 0.94 0.63 -1.81 -1.9 -0.71 -1.72 1.0 0.05 0.44 0.16 -0.26 0.45 1.36 0.24 1.03 -0.34 -1.29 -1.34 -1.26 0.3 -0.57 -1.24 -0.61 -1.59 -1.48 -1.6 -1.49
0.48 -0.38 0.2 -0.88 0.63 1.16 -1.55 0.49 0.74 0.56 0.61 0.14 -0.82 -3.67 0.78 0.07 0.73 -0.7 -1.09 -0.03 -0.51 -0.31 -0.53 -0.43 -1.76 1.1 0.51 -1.72 -1.38 -0.42 0.48 -1.97 0.79 0.07 -4.42
-0.25 0.46 -0.36 0.43 0.04 0.62 0.85 -0.76 0.94 0.66 0.31 0.25 -1.41 -0.22 0.82 0.33 1.58 0.2 0.73 -1.04 -3.38 -1.32 -2.6 -0.35 -1.4 0.19 -0.6 -1.47 -1.33 -0.25 -0.08 -1.82 0.58 0.09 -2.11
0.3 0.07 -0.01 -0.14 0.71 0.86 0.11 -0.33 0.99 0.84 0.92 0.87 -1.94 -0.32 -0.22 -0.31 -0.21 -0.11 -0.62 0.58 -2.3 -0.99 -2.06 -0.74 -0.76 -0.3 -0.69 0.11 -0.47 -0.74 -0.16 -1.38 1.25 0.16 -0.77
0.23 0.71 -0.0 0.72 0.12 0.67 0.89 0.07 0.77 0.91 -0.49 -0.3 0.55 -2.42 -0.27 -0.01 -1.87 0.01 0.17 -0.19 -0.23 -0.64 -0.38 -0.31 -0.51 -0.32 -1.36 0.16 -0.36 0.1 0.21 -0.33 -0.19 -1.01 -0.27
-0.44 0.05 -0.11 0.68 0.6 0.65 0.71 -0.27 0.88 0.78 -0.14 -0.37 0.84 -1.34 -1.24 -0.85 -4.0 -0.29 0.08 0.24 0.22 -0.19 -0.31 -0.11 0.09 -1.24 -1.48 0.21 -0.04 -0.11 0.12 -0.41 -0.04 -1.82 0.91
-0.04 0.01 0.01 -0.14 -0.11 0.27 -0.11 -0.11 -0.1 0.09 0.72 0.97 -0.48 -0.15 0.09 -0.26 0.25 0.19 0.29 0.85 -2.1 -0.26 -2.15 0.17 -0.95 -0.93 -0.74 -0.71 -0.23 0.04 -0.09 -0.06 0.9 0.75 -0.58
0.15 0.57 0.01 0.66 0.6 0.85 0.58 -0.69 1.23 0.91 -0.38 -0.08 -0.49 -1.67 -0.45 -0.13 -0.1 -0.48 -0.41 0.02 -0.65 0.31 -0.15 -0.66 -0.98 -0.46 -0.06 -0.05 -0.84 -0.11 0.48 -1.11 -0.04 -0.03 -1.0
0.27 0.84 0.55 0.7 0.03 0.67 0.36 0.25 0.76 0.88 0.44 0.48 -1.55 -1.34 -0.76 -0.28 -0.44 -0.25 -0.27 0.09 -1.49 -0.06 -1.47 -0.5 -1.31 -0.8 -1.44 0.5 -0.36 -0.39 -0.21 -0.53 0.66 0.1 0.08
0.03 0.05 -0.39 -0.21 0.31 0.52 -0.08 -0.24 0.7 0.59 0.26 0.08 -0.42 -0.81 -0.49 -1.07 -1.1 -0.38 -0.18 0.07 0.08 0.5 0.04 0.27 -0.75 -0.22 0.51 -0.34 -0.49 0.38 0.38 0.06 0.27 -0.46 0.19
0.96 1.09 0.46 0.53 -0.53 1.47 0.85 0.05 0.56 0.87 0.79 0.21 -3.19 -2.15 -0.06 -1.01 0.14 -0.19 0.24 -1.99 -0.44 1.23 -0.27 -0.91 -2.53 -1.32 -1.72 -3.29 -2.32 -0.52 0.41 -1.82 0.78 -0.41 -5.99
0.46 0.4 0.35 0.37 0.41 1.11 0.7 -0.15 1.18 1.3 0.07 -0.24 -1.51 -1.41 0.21 -0.66 -1.67 -0.04 -0.11 -0.31 0.38 0.66 -0.04 -0.8 -2.26 -2.05 -2.61 -1.33 -1.24 -1.25 -1.03 -0.99 0.23 1.24 -0.38
0.65 0.11 0.45 -0.28 0.96 0.99 -0.6 -0.12 0.91 0.56 0.02 -0.09 -0.49 -2.7 0.71 -0.67 0.91 -0.98 -0.89 -0.02 -1.2 -0.13 -0.78 -0.66 -2.3 0.76 -0.01 0.15 -1.54 -0.87 -0.33 -2.16 0.45 1.05 -1.32
-0.7 -0.79 -0.84 -0.98 -0.28 -0.45 -0.83 -0.65 -0.47 -0.5 0.74 0.86 0.1 0.33 0.13 -0.74 -0.2 -0.29 0.04 0.22 0.21 0.92 0.24 0.3 -1.02 -0.5 -0.44 -1.02 -1.22 0.4 0.21 0.25 0.87 0.79 0.7
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-0.26 0.07 -0.35 -0.17 0.49 0.83 -0.07 -0.48 0.95 0.64 0.24 0.03 -0.72 -1.0 -0.02 -0.34 0.06 -0.47 -0.46 -0.58 0.18 0.72 1.2 0.19 -0.16 -0.01 -0.29 -0.49 -0.48 -0.16 0.73 -2.43 0.41 -1.94 -2.6
0.05 -0.26 -0.15 -0.64 0.28 0.48 -0.59 0.09 0.0 -0.31 0.64 0.69 -0.31 -0.15 0.66 -0.64 0.62 -0.66 -0.01 -0.77 -0.1 0.68 -0.76 -0.22 -1.79 -0.34 -0.69 0.08 -1.8 -0.73 -0.26 -1.69 1.04 1.24 0.49
-0.16 0.11 -0.22 -0.23 0.27 0.26 -0.29 -0.14 0.16 0.29 0.97 0.96 -0.07 -0.95 -0.61 -0.47 -1.03 0.01 0.6 -0.18 -0.75 0.35 -0.05 -0.22 -1.29 -0.74 -0.88 -0.09 -0.27 0.21 0.0 0.42 0.96 0.22 -0.76
0.04 0.38 -0.18 0.27 0.24 0.69 0.36 -0.14 0.67 0.66 0.37 0.66 0.18 -0.21 0.51 -0.37 1.22 -0.01 0.51 -1.01 -1.54 -0.49 -1.64 0.17 -1.19 -0.97 -1.56 -1.39 -1.23 -0.65 -0.35 -1.28 0.64 0.31 -0.21
0.24 0.12 0.5 0.17 -0.29 0.64 -0.12 -0.06 0.94 0.92 0.35 0.31 -0.52 0.24 -0.12 -0.16 -1.1 -0.16 -0.39 0.33 0.11 -0.38 1.21 0.12 -0.29 -1.54 -1.19 -1.1 -0.77 -0.53 -0.17 -2.04 0.46 -0.27 -0.72
0.39 -0.31 0.08 -0.16 0.83 1.44 0.02 0.43 1.84 1.04 -0.83 -1.6 -0.42 -2.36 0.46 0.12 0.53 -0.46 -0.51 0.37 -1.49 -1.18 -0.89 0.26 0.33 -0.16 -0.56 0.51 -1.77 -0.93 0.04 -2.06 -1.03 -1.31 -2.2
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-1.74 -1.22 -1.78 -1.08 1.1 -0.49 -0.82 0.76 -0.45 -0.85 0.57 0.49 0.58 0.48 -0.3 -1.09 -2.98 -0.33 -0.33 -0.06 0.44 0.59 1.72 -1.33 1.08 -0.68 -1.19 0.37 -0.63 -1.58 -2.11 -1.15 0.51 0.31 1.0
-0.19 0.12 -0.31 0.19 0.49 0.41 0.26 -0.63 0.8 0.75 0.73 0.64 0.35 -0.01 -1.81 -1.47 -2.7 -1.03 -0.74 -0.05 -0.85 -0.31 0.18 -0.67 -0.5 -0.98 -1.03 0.69 0.01 -0.22 -0.38 -0.42 0.51 0.39 1.11
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-0.32 0.1 -0.54 0.02 0.49 0.13 0.31 -0.57 0.13 0.27 0.28 0.4 0.34 -0.79 -0.23 -0.13 -0.45 -0.18 -0.21 -0.66 -0.64 0.72 0.63 0.06 0.04 -1.73 -1.19 0.37 -0.39 -0.53 -0.53 -0.48 0.47 0.23 1.07
-0.9 -0.39 -0.79 -0.4 0.57 0.79 0.09 -1.16 1.02 1.03 0.48 0.95 -0.54 -0.45 -0.2 -0.38 0.1 -0.42 -0.47 0.97 -0.76 0.15 0.06 -0.23 -0.57 -0.73 -1.78 -0.96 -0.1 -0.79 0.18 -2.92 1.1 -0.12 0.22

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.