Heatmap: Cluster_60 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4h after treatment
4h after treatment,No nitrate
8h after treatment
8h after treatment,No nitrate
20C
20h after treatment
20h after treatment,No nitrate
20h after treatment,Nocodazole added
36h after treatment
36h after treatment,No phosphate
Blue light,10min after light change
Blue light,60min after light change
Bohlin
CCAP1055/1,20C
CCAP1055/1,20C,High CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Low CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Normal CO2,OligoDT primed
CCMP2561
CCMP2561 Nitrase Reductase Knockout
CCMP632
CCMP632,24h
CCMP632,48h
CCMP632,72h
CCMP632,High light acclimated WT
CCMP632,Low light acclimated WT
NEPCC640,8h,1000ppmv CO2
NEPCC640,8h,390 ppmv CO2
No light,8h after treatment
Pt-1
Pt-1 8.6
Pt-1 8.6,With nitrogen
Pt-1 8.6,Without nitrogen
Red light,0min before light change
UTEX 646,Blue light
UTEX 646,No light
-0.63 0.35 -0.6 0.27 0.53 -0.18 0.54 -0.6 -0.23 0.11 0.46 0.73 -0.36 1.32 -0.79 -0.16 -0.81 0.24 0.66 -1.68 0.38 1.06 0.33 -0.81 -1.71 -0.41 -1.51 -0.78 -0.69 -0.82 -1.21 -0.12 0.52 -0.04 0.31
-0.63 0.35 -0.6 0.27 0.53 -0.18 0.54 -0.6 -0.23 0.11 0.46 0.73 -0.36 1.32 -0.79 -0.16 -0.81 0.24 0.66 -1.68 0.38 1.06 0.33 -0.81 -1.71 -0.41 -1.51 -0.78 -0.69 -0.82 -1.21 -0.12 0.52 -0.04 0.31
-1.37 -0.92 -1.24 -0.74 -1.17 -0.91 -0.34 -1.14 -0.72 -0.33 0.83 1.01 -1.39 -0.7 -1.92 -1.45 -3.34 -0.62 -0.5 -0.75 1.59 1.72 1.8 0.42 0.27 -2.28 -3.04 -0.41 -0.35 0.24 -0.84 0.87 0.83 -0.63 0.85
0.04 -0.14 -0.19 0.37 -0.17 0.35 0.55 -0.22 0.76 0.69 0.66 0.74 -0.2 0.48 -2.06 -1.8 -2.41 -0.46 -0.54 -0.31 -0.28 0.29 -0.48 -0.22 -1.29 -1.21 -1.55 0.14 -0.19 -0.32 -0.79 0.11 0.77 0.49 1.21
0.08 0.45 -0.2 0.44 0.11 0.58 0.59 -0.23 0.63 0.62 0.46 0.69 -0.95 1.53 -1.47 -1.72 -2.42 -0.32 -0.08 -1.75 0.13 0.64 -0.52 -1.19 -2.76 -1.69 -1.82 -0.13 -0.6 -0.47 -0.92 0.13 0.67 0.88 0.22
-0.68 -0.02 -0.5 -0.15 -0.14 -0.57 -0.41 -0.07 -0.41 -0.09 0.46 0.42 -1.19 1.21 -0.84 -0.6 -2.7 -0.14 -0.31 0.17 0.91 0.64 1.53 -0.1 0.16 -0.52 -0.5 0.25 -0.88 -0.48 -0.54 -0.4 0.5 -0.31 0.3
-0.31 0.17 -0.35 0.3 -0.31 -0.11 0.51 -0.33 0.27 0.3 -0.13 -0.18 0.16 -0.8 -0.44 -0.16 -1.4 0.51 0.38 -0.11 0.42 0.15 -0.06 0.05 -0.88 -0.34 -0.51 0.32 -0.25 0.26 0.03 0.4 -0.21 0.31 0.38
-0.46 -0.06 -0.72 -0.14 -0.65 -0.19 0.1 -1.02 -0.1 0.2 1.27 1.51 -0.43 1.61 -0.96 -0.96 -3.1 0.42 0.26 -0.74 0.51 0.7 0.66 -0.92 -1.28 -2.58 -2.99 -0.33 -0.51 -1.08 -1.62 -0.52 1.41 -0.09 -0.28
-0.31 0.06 -0.32 -0.0 -0.02 0.06 0.25 -0.19 0.21 0.39 0.3 0.54 0.69 0.32 -1.6 -1.87 -1.92 -0.59 -0.78 -1.86 1.33 1.9 0.98 -0.24 -1.19 -1.47 -1.46 0.62 -1.35 -0.43 -0.74 -0.12 0.48 -2.03 -0.33
0.71 -0.75 0.62 -1.01 -0.65 -0.11 -1.64 -1.12 0.26 0.28 0.98 1.07 -2.44 -1.26 0.11 -0.53 -0.19 -0.29 -0.46 -2.04 0.7 1.23 -0.46 0.75 -2.51 -0.23 -1.14 0.6 -2.0 -0.22 -0.56 -0.57 1.68 0.45 -1.07
-0.05 0.17 -0.03 -0.06 -0.54 0.29 0.21 0.06 0.24 0.61 0.12 0.4 -1.63 1.17 0.41 0.0 -1.55 0.61 0.81 -1.09 0.1 1.28 -0.3 -0.38 -2.44 -1.88 -2.51 -0.74 -0.56 -0.49 -0.77 -0.11 0.14 0.81 -0.56
0.25 0.93 -0.6 0.4 -0.45 0.42 0.74 -0.82 0.14 0.72 0.94 1.15 -2.03 1.49 -1.32 -2.08 -1.52 -0.65 -0.13 -1.67 -0.03 1.31 -0.58 -0.52 -2.72 -1.73 -1.21 -0.95 -1.83 -0.85 -0.74 -1.16 1.04 0.75 -0.05
-1.13 -0.56 -2.36 -0.57 -1.64 -1.03 0.35 -0.76 -1.15 -0.82 -0.5 0.64 0.16 2.77 -3.53 -3.92 -4.9 0.06 0.19 -3.85 -1.35 0.35 -1.72 -1.27 -3.87 -3.07 -1.45 -5.69 -1.19 1.38 0.1 2.09 -0.54 2.2 -3.86
0.31 -0.48 -0.24 -0.51 -0.22 0.29 -0.5 -0.89 0.18 0.14 1.12 1.32 -1.29 -0.1 0.24 -0.79 -0.97 0.36 -0.03 -0.94 1.0 0.95 0.27 -0.11 -1.4 -1.97 -2.25 -1.27 -0.79 -0.32 -0.69 0.05 1.37 0.52 -0.99
-0.15 -0.22 -0.76 -0.48 -0.15 -0.38 -0.07 -0.74 -0.23 -0.07 0.74 1.22 -0.37 0.81 -0.75 -0.86 -2.36 0.48 0.14 -0.96 1.21 1.49 0.73 -0.85 -2.65 -2.65 -2.85 -0.29 -1.28 -0.24 -1.82 0.58 1.08 0.27 0.1
-0.19 -0.28 -0.24 -0.12 0.09 0.15 0.01 -0.77 0.43 0.35 0.91 0.91 -0.95 0.75 -0.41 -0.96 -0.83 -0.4 -0.03 -0.24 0.5 1.04 0.3 -0.38 -1.39 -0.53 -1.12 -0.1 -0.48 -0.88 -0.4 -1.31 0.81 0.45 0.39
-0.36 -0.23 -0.67 -0.13 -0.74 -0.42 -0.01 -0.41 -0.19 0.04 0.24 0.93 0.14 1.97 -1.58 -1.77 -2.0 0.21 0.18 -1.24 0.88 1.12 0.37 -1.86 -3.63 -2.72 -3.11 -0.57 -1.15 -0.04 -2.08 0.8 0.6 1.64 -0.93
-0.06 0.18 -0.19 0.28 -0.48 -0.13 0.31 -0.65 0.05 0.16 -0.39 -0.03 -0.54 0.86 0.19 0.07 0.02 0.64 0.45 -0.27 0.38 -0.02 0.55 0.08 -0.63 -0.89 -1.36 -0.09 -0.36 -0.2 -0.45 0.05 -0.07 0.13 0.23
-0.15 -0.17 -0.26 -0.28 -0.17 0.09 0.14 -0.75 0.4 0.31 0.0 0.22 0.15 2.27 -0.07 -0.72 -0.1 0.83 0.51 -1.24 -0.23 0.31 -0.64 -0.04 -1.83 -1.37 -1.9 -0.73 -0.69 -0.81 -1.1 -0.39 0.08 0.74 -0.47
-0.43 0.18 -0.88 -0.17 -0.54 -0.34 0.11 -1.12 0.0 0.1 0.83 0.97 -0.77 1.26 -1.26 -1.18 -1.88 -0.21 0.07 -1.06 1.57 1.37 1.67 -0.95 -1.5 -1.89 -2.14 -0.3 -1.32 -0.55 -1.66 0.21 0.78 -0.92 -0.65
0.09 0.12 -0.31 -0.11 -0.2 0.06 0.26 -0.67 0.15 0.13 1.21 1.32 -1.54 1.1 -0.78 -1.09 -3.05 0.44 0.45 -1.12 -0.17 0.93 -0.35 -0.44 -2.18 -1.09 -0.82 -0.0 -1.45 -0.46 -1.06 0.22 1.25 0.31 -0.79
0.3 -0.2 -0.11 -0.6 -0.09 0.17 -0.05 -0.71 0.18 0.08 1.01 1.21 -0.59 0.45 -1.14 -1.97 -1.49 -0.48 -0.66 -1.27 0.35 1.07 0.19 -0.21 -1.47 -0.99 -0.28 -0.62 -0.76 -0.36 -0.15 -0.55 1.16 1.35 -0.23
0.1 -0.28 -0.05 -0.67 0.25 0.14 -0.8 -0.75 0.27 0.01 0.84 1.11 -2.37 -0.56 0.31 -0.04 -1.41 -0.06 -0.4 -0.7 1.0 1.07 0.77 -0.45 -0.71 -0.2 -0.84 -0.02 -1.53 -0.87 -0.26 -1.94 1.12 0.48 -0.04
0.13 -0.12 -0.61 -0.45 -0.01 -0.15 -0.07 -0.45 -0.3 0.0 1.15 1.22 -0.31 0.52 -1.55 -1.81 -2.04 -0.42 -0.4 -1.46 -0.24 1.07 0.61 -1.1 -2.34 -1.06 -0.2 -1.29 -0.37 0.37 -0.5 1.33 1.06 1.18 -2.75
-1.41 -0.5 -0.35 -0.75 -1.59 -1.01 0.24 -0.29 -0.09 -0.08 0.96 0.81 -1.1 1.78 -2.07 -2.83 -2.7 -0.37 -0.65 -0.65 2.16 2.19 0.79 -0.37 -3.62 - -5.28 -5.1 -2.74 -1.08 -4.02 -0.31 0.65 1.11 -0.44
-0.38 0.45 -0.16 0.56 -0.35 -0.15 0.39 0.72 -0.04 0.26 0.73 1.01 -0.8 1.23 -1.72 -1.94 -1.21 -1.36 -0.73 -0.74 -0.5 0.3 -0.7 1.25 -0.05 -0.4 0.85 -0.37 -1.45 -1.36 -0.88 -1.65 1.1 0.06 -1.15
-1.12 -0.74 -1.34 -0.87 -0.45 -0.82 -0.45 -1.17 -0.72 -0.29 1.22 1.18 -1.11 1.73 -1.59 -1.38 -2.78 -0.37 -0.59 -0.47 0.89 1.48 2.13 -0.51 -0.55 -1.42 -0.84 -1.08 -1.09 -0.72 0.24 -1.03 0.92 -0.4 -1.05
-0.42 -0.56 -1.74 -1.08 -0.13 -0.13 -0.34 -1.56 0.13 -0.31 1.62 1.76 -1.18 0.1 -0.1 -0.4 -2.5 0.41 0.31 -0.85 0.26 0.6 0.35 -0.62 -0.39 -0.45 -0.84 -0.12 -1.72 -0.88 -0.54 -0.31 1.71 0.1 -0.51
-0.21 -0.23 -0.62 -0.38 0.01 0.37 0.1 -0.48 0.45 0.36 0.61 0.45 -1.46 1.64 -0.11 -0.46 -0.12 -0.35 -0.43 -0.98 -0.08 0.3 -0.48 0.33 -0.87 -0.49 -1.06 -1.06 -1.12 -0.57 0.17 -1.4 0.31 0.15 1.47
0.45 0.49 -0.05 0.04 -0.8 0.12 -0.1 -0.82 -0.07 0.06 0.84 1.02 -2.43 1.87 -0.8 -0.79 -2.43 -0.11 0.08 -2.43 -0.6 0.32 -1.31 -0.98 -2.16 0.17 1.18 0.54 -1.61 -1.12 -0.47 -2.78 0.87 0.87 -0.5
-0.23 -0.18 -0.98 -0.38 0.01 0.08 0.01 -0.82 0.03 0.15 0.1 0.4 -0.18 0.76 -1.03 -1.76 -1.84 -0.04 0.36 -0.48 0.37 0.71 0.04 -0.08 -1.82 -1.61 -2.06 0.24 -0.08 0.43 -0.47 1.06 0.42 0.98 0.9
-0.55 -0.03 -0.64 -0.04 -0.27 -0.1 0.38 -0.64 0.35 0.39 0.47 0.63 -0.52 0.99 -1.34 -0.64 -2.71 0.48 1.11 -0.88 0.68 1.04 0.67 -0.37 -1.4 -1.97 -2.48 -0.15 -0.63 -0.49 -0.78 -0.24 0.47 -0.32 0.86
-0.63 -0.11 -0.62 0.03 -0.1 -0.08 0.31 -0.99 0.02 -0.07 -0.34 -0.26 1.22 0.43 -0.27 0.13 -1.83 0.78 0.87 -0.15 0.47 0.18 0.71 0.31 -0.03 -1.13 -2.21 -0.26 0.07 -0.26 -0.78 0.12 -0.18 -0.01 -0.12
-0.4 0.04 -0.57 -0.17 -1.34 -0.21 0.16 -0.89 -0.14 0.19 1.34 1.39 -2.03 1.53 -0.65 -0.21 -1.23 0.61 0.5 -1.96 0.31 1.32 0.27 -0.87 -3.01 -2.42 -2.23 -0.28 -1.75 -1.25 -1.35 -0.54 1.38 0.6 -0.94
-0.53 -0.25 -0.7 -0.45 -0.06 -0.24 -0.02 -1.01 0.17 0.17 0.72 0.92 -0.58 0.67 -0.72 -1.02 -0.91 -0.58 -0.54 -0.83 0.95 1.5 0.51 0.63 -1.64 -1.24 -1.34 0.53 -1.33 0.05 -0.45 -0.28 0.85 -0.42 0.44
0.12 0.18 -0.12 0.18 -0.31 0.25 0.19 -0.59 0.3 0.25 0.68 0.91 -0.19 0.01 -0.7 -0.66 -1.76 -0.3 -0.06 -0.64 1.06 1.02 0.69 0.04 -1.53 -1.05 -1.36 0.09 -0.76 -0.29 -0.12 -0.61 0.83 -0.47 -0.6
0.26 0.32 0.01 0.14 -0.71 0.08 0.46 0.2 0.28 0.17 1.27 1.29 -0.73 0.87 -1.96 -1.96 -1.3 -0.38 -0.25 0.13 -2.15 -0.37 -1.18 0.04 -2.74 -1.14 -0.8 -0.83 -0.82 -0.16 -0.54 0.21 0.96 1.59 -0.88
0.19 -0.16 -0.06 -0.42 -0.49 0.05 -0.47 -0.79 0.43 0.35 0.9 1.29 -2.1 1.09 -0.23 -0.57 -0.39 0.26 0.06 -1.37 0.46 1.22 0.21 -0.79 -2.62 -0.89 -1.25 0.75 -1.57 -0.94 -0.18 -1.84 1.13 0.35 -1.93
-0.6 -0.45 -0.99 -0.53 -0.57 -0.57 -0.41 -1.24 -0.44 -0.22 1.15 1.22 -1.05 0.39 -0.95 -0.97 -1.89 -0.75 -0.35 -0.82 1.27 1.41 1.53 -0.41 -0.44 -0.76 -0.54 -0.31 -1.47 -0.51 -0.77 -0.16 0.95 -0.17 0.85
0.6 -0.4 0.24 -0.74 0.31 0.09 -0.63 -0.35 -0.24 -0.49 0.05 0.33 -0.55 0.77 -0.25 -1.25 -1.44 0.15 -0.53 0.19 0.36 0.43 0.6 -0.16 -0.85 -0.91 -0.55 -0.15 -0.07 0.34 0.03 0.74 0.24 0.57 0.15
-0.5 0.09 -1.15 0.13 -0.9 -0.1 0.53 -0.41 -0.23 -0.05 -0.33 0.64 0.53 2.62 -1.66 -1.78 -2.16 0.08 -0.34 -0.7 -0.62 0.23 -0.33 -0.97 -1.43 -3.03 -2.4 -0.84 -0.62 0.6 -1.12 1.48 -0.32 1.22 -4.21
0.63 -0.09 0.12 -0.58 0.14 0.88 -0.44 -0.0 0.61 0.49 0.53 0.45 -1.09 -0.96 -0.92 -2.02 -1.98 0.01 -0.37 -1.76 0.21 0.66 0.14 -0.75 0.19 0.11 0.87 -1.42 -1.09 -0.31 -0.22 -0.04 0.6 -1.16 1.2
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-0.5 -0.95 -0.78 -2.0 -0.45 -0.89 -2.22 -0.55 -1.37 0.1 1.65 1.81 -1.18 1.92 -0.12 0.31 -0.39 -1.02 -1.33 -1.62 -0.15 1.04 -0.63 -0.51 -2.83 -1.64 -1.28 -1.62 -0.97 -0.62 -0.26 -0.71 1.49 1.72 -3.17
-1.29 -0.37 -1.53 0.14 -0.52 -1.14 0.15 -1.29 -1.15 -0.49 1.22 1.71 -1.14 1.63 -1.95 -0.76 -2.5 0.41 0.51 -1.24 0.75 1.19 0.89 -1.28 -1.74 -2.24 -2.73 -1.36 -1.39 -0.68 -1.03 0.27 1.47 0.91 -0.9
-0.81 -0.43 -0.83 -0.57 -0.04 -0.19 -0.44 -0.28 -0.07 -0.01 -0.06 0.44 0.49 1.08 -1.42 -1.73 -3.51 0.66 -0.43 -0.43 0.27 0.32 -0.14 -0.67 -2.14 -3.84 -4.05 -0.34 0.15 0.67 -1.11 1.33 0.19 1.56 1.33
-0.4 -0.15 -0.28 -0.14 -0.29 -0.01 0.17 -0.52 0.3 0.34 0.75 0.56 -1.32 0.95 -0.29 -0.5 -0.78 0.22 0.42 -0.9 0.51 1.01 0.03 -0.06 -1.32 -1.48 -2.27 -0.19 -1.11 -0.53 -1.06 -0.07 0.51 0.32 1.21
0.3 0.46 0.34 0.73 -0.88 -0.1 0.12 -0.29 0.54 0.98 0.27 0.84 -1.79 -2.59 -0.19 -0.5 -2.78 -0.24 -0.33 -1.2 0.75 1.36 0.35 0.36 -0.02 -2.97 -2.85 1.47 -1.46 -0.62 -1.05 -0.6 0.92 -1.0 -4.69
0.23 -0.6 -0.53 -1.04 -0.06 -0.06 -0.97 -0.32 -0.23 -0.48 1.15 1.57 -1.15 0.66 -0.84 -1.98 -1.95 -0.33 -1.25 -1.14 1.18 1.26 0.68 -0.22 -2.47 -1.51 -1.24 -0.62 -0.55 -0.19 -0.65 0.27 1.22 1.17 -0.92
-0.36 0.02 -0.37 0.14 -0.08 -0.1 0.39 -0.89 0.31 0.37 0.39 0.66 -0.16 1.06 -0.77 -0.77 -2.05 0.19 0.73 -0.62 0.67 1.29 0.31 -0.94 -2.48 -2.11 -2.34 -0.28 -0.6 -0.92 -0.98 -1.01 0.52 0.36 1.13
-0.94 -0.55 -1.02 -0.41 -0.29 -0.73 -0.05 -0.35 -0.44 -0.27 0.58 0.7 0.23 1.31 -1.89 -1.56 -3.37 -0.17 0.11 -0.67 0.62 0.73 1.8 -0.13 -0.54 -0.98 -0.88 -0.22 -0.41 -0.08 -0.25 0.15 0.66 0.36 0.04
-0.83 -0.57 -1.37 -0.59 -0.07 -0.61 0.2 -0.99 -0.41 -0.13 0.42 0.58 0.54 1.73 -1.32 -1.12 -2.46 0.41 0.7 -1.65 0.76 1.12 1.01 -0.78 -2.25 -2.81 -3.16 -0.07 -0.12 0.03 -1.62 0.85 0.44 0.13 0.56
-0.51 0.06 -0.72 0.06 -0.04 -0.03 0.31 -0.46 0.25 0.27 0.15 0.35 -0.39 1.03 -0.95 -0.81 -2.27 0.19 1.01 -0.99 0.45 0.86 0.42 0.31 -1.24 -2.54 -2.76 0.16 -0.42 0.27 -0.28 0.21 0.11 -0.0 0.61
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-0.28 0.13 -0.58 -0.01 -0.32 -0.12 0.13 -1.04 0.23 0.41 1.2 1.5 -1.08 0.85 -1.35 -0.95 -3.13 0.26 0.09 -0.7 0.68 1.13 0.69 -1.02 -1.91 -0.94 -1.59 0.46 -1.43 -1.55 -1.65 -0.97 1.51 -0.6 -0.19
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-0.47 -0.02 -0.69 -0.1 -0.42 -0.07 0.37 -0.2 0.05 0.08 -0.07 0.05 1.23 1.67 0.02 -0.57 0.6 0.32 0.3 0.14 -1.25 -0.38 -1.22 -0.22 -1.43 -0.32 -1.21 -0.88 -1.09 -0.24 -0.42 -0.19 0.0 0.14 0.85
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.