Heatmap: Cluster_35 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4h after treatment
4h after treatment,No nitrate
8h after treatment
8h after treatment,No nitrate
20C
20h after treatment
20h after treatment,No nitrate
20h after treatment,Nocodazole added
36h after treatment
36h after treatment,No phosphate
Blue light,10min after light change
Blue light,60min after light change
Bohlin
CCAP1055/1,20C
CCAP1055/1,20C,High CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Low CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Normal CO2,OligoDT primed
CCMP2561
CCMP2561 Nitrase Reductase Knockout
CCMP632
CCMP632,24h
CCMP632,48h
CCMP632,72h
CCMP632,High light acclimated WT
CCMP632,Low light acclimated WT
NEPCC640,8h,1000ppmv CO2
NEPCC640,8h,390 ppmv CO2
No light,8h after treatment
Pt-1
Pt-1 8.6
Pt-1 8.6,With nitrogen
Pt-1 8.6,Without nitrogen
Red light,0min before light change
UTEX 646,Blue light
UTEX 646,No light
-1.98 -1.64 -1.52 -1.61 -1.93 -1.51 -1.45 -0.08 -1.22 -1.08 -0.05 -0.13 -1.98 1.3 -1.78 -1.68 -2.34 -0.6 0.2 -0.53 2.33 1.58 1.61 0.32 -0.11 -3.85 -2.47 -1.43 0.99 0.29 0.04 0.25 -0.42 0.08 0.95
-0.68 -0.64 -1.0 -1.44 0.08 -0.62 -0.32 -0.29 -0.39 -0.59 - - - - -4.12 -4.67 -3.13 -3.61 -4.33 1.1 2.72 2.34 3.13 0.28 0.62 - - -1.98 0.92 -2.54 -3.7 -3.9 - - -
0.32 0.31 -0.04 -0.02 0.7 0.5 0.12 -0.59 0.72 0.69 - - -5.39 - -1.04 -1.85 -1.56 -0.65 -0.52 -0.32 2.44 1.9 2.6 -0.53 -1.54 -7.54 - 0.66 -1.65 -1.48 -1.82 -1.21 - - -
-0.69 -0.77 -0.59 -0.53 -0.73 -0.74 -0.49 -1.04 -0.4 0.02 0.44 0.61 -1.57 -0.46 -1.42 -1.09 -3.04 -0.92 -0.78 -0.9 2.51 2.56 1.27 -0.39 -1.95 -2.63 -2.69 -0.17 -2.08 -1.6 -2.17 -1.47 0.56 -0.09 0.9
-0.13 -0.15 -0.33 -0.27 -0.09 0.22 -0.27 -0.4 0.34 0.35 -0.25 0.04 0.02 -0.89 -0.25 -0.2 -0.5 -0.09 0.22 -1.14 0.79 0.18 0.11 0.74 0.2 -0.2 -0.12 -0.06 -0.36 0.13 0.12 -0.16 -0.25 0.36 0.54
-1.18 -1.44 -1.62 -1.82 -0.45 -1.26 -1.44 -0.79 -0.7 -1.09 -7.15 -7.24 -5.59 -6.85 -3.09 -5.18 -3.35 -6.21 -7.79 -1.71 2.43 1.36 4.14 -3.67 -2.95 -1.78 -0.71 1.25 -3.09 -1.66 -6.82 -1.78 -8.0 -6.39 -7.03
-1.06 -0.85 -1.12 -0.68 0.18 -0.74 -0.38 -1.35 -0.21 -0.32 -0.46 -0.67 -3.17 -1.86 0.72 0.68 0.36 -0.11 0.02 0.05 2.01 0.95 2.28 -0.89 -0.96 -2.67 -2.63 0.48 -1.31 -0.26 -0.64 -0.58 -0.69 0.0 0.4
-0.48 -0.71 -1.24 -0.98 -1.12 -1.61 -0.1 -1.99 -0.09 -0.18 - - - - - -1.51 -2.08 -2.89 -2.98 -1.73 3.34 2.99 2.65 -2.04 -1.27 - -3.34 -0.04 0.63 -3.63 - - -3.33 - -
-6.07 -1.1 -4.98 -0.77 -0.44 -2.69 -0.07 -2.52 -1.18 -1.04 - - 1.2 - -2.62 -2.03 -6.19 -0.23 -1.59 0.03 2.56 1.43 2.56 -2.08 1.61 -0.14 -1.26 0.08 -1.99 0.73 -3.16 1.94 - - -
-4.56 -2.42 -2.1 -1.55 -0.48 -1.74 -1.38 -0.59 -1.16 -0.95 -1.38 -0.96 1.46 1.1 -2.48 -1.89 -2.45 -0.77 -0.28 1.58 2.19 -0.04 1.12 0.88 1.89 -3.07 -5.56 -1.26 1.93 -1.26 -2.22 -0.9 -1.25 -3.22 0.07
-0.28 0.11 -0.06 0.4 -0.32 0.21 0.32 0.48 0.52 0.54 -0.79 -0.51 -1.03 -0.69 -0.66 -0.46 -2.28 -0.03 -0.02 -0.78 1.12 0.55 0.71 0.49 0.5 -0.68 -1.19 -0.11 -0.23 -0.34 -0.67 -0.05 -0.5 0.14 0.75
-0.38 0.28 -0.34 0.3 -0.39 -0.32 0.19 -0.06 -0.02 0.18 -0.06 -0.12 -0.16 -0.0 -1.69 -1.23 -3.47 -0.08 0.19 -0.69 1.37 0.91 1.51 -0.24 -0.47 -1.47 -1.81 0.31 -0.26 -0.11 -0.4 0.3 -0.27 0.2 0.5
0.07 -0.23 0.13 -0.35 -0.77 -0.23 -0.86 -0.13 -0.18 -0.02 0.43 0.57 -1.04 -0.6 -0.78 -1.11 -2.36 -0.3 -0.02 -1.44 2.07 1.06 1.31 -0.23 -1.01 -1.58 -1.5 0.09 0.37 -0.34 -0.21 -0.51 0.48 0.35 -0.19
-0.56 -0.24 -0.79 -0.41 -0.17 -0.36 -0.36 -0.91 -0.02 0.09 0.42 0.53 -0.49 0.24 -0.71 -1.11 -0.62 -0.04 0.31 -0.49 1.69 1.18 1.07 0.01 -0.26 -1.37 -1.9 0.01 -0.84 -0.3 -0.5 -0.15 0.27 0.09 0.56
-9.56 - -2.0 - -0.66 - - -2.21 -6.8 -17.67 0.66 0.66 -0.55 0.95 0.91 0.76 -0.98 -0.96 -0.14 -0.04 2.04 2.12 1.93 0.5 -0.15 -5.15 -3.07 - -1.15 -0.49 -1.46 -0.16 0.84 0.75 -0.01
-1.12 -0.3 -0.46 0.05 -1.06 -0.55 0.16 -0.44 -0.19 0.07 -1.46 -1.18 0.4 -0.66 -1.37 -1.02 -2.96 -0.2 0.24 1.19 1.31 0.57 -0.27 0.6 -0.17 -0.34 -0.35 0.02 0.95 0.65 0.67 0.46 -1.17 -0.36 0.55
-1.21 -0.42 -0.67 -0.36 -1.21 -1.05 -0.3 -0.35 -0.83 -0.54 -1.6 -1.18 -0.8 -1.34 -0.66 -0.19 -1.13 -0.01 0.76 -0.08 1.71 1.21 -0.09 0.96 -0.18 -0.38 -0.04 -0.47 -0.27 0.96 1.18 0.34 -1.21 0.02 0.81
-1.02 -0.45 -0.09 -0.01 -0.82 -0.08 0.27 -0.15 0.18 0.37 -1.36 -0.99 -0.21 -0.73 -2.62 -1.56 -3.9 -1.03 -0.22 -0.23 1.09 0.61 0.26 0.25 -0.24 0.69 1.19 0.15 0.62 0.55 0.61 0.46 -1.04 -0.91 0.89
-0.94 -0.58 -0.22 -0.32 0.01 -0.78 -1.27 -0.07 -1.82 -0.32 0.29 0.18 0.96 0.62 -1.31 -1.51 -4.65 -1.25 -1.63 -1.17 2.67 2.45 1.71 -0.9 -0.96 -4.02 -3.69 -3.51 -0.29 -1.58 -2.14 -0.57 0.45 -2.32 -1.81
-1.01 -0.49 -0.58 -0.22 -1.09 -0.14 -0.46 0.12 0.4 0.62 -0.08 -0.2 -1.27 -0.22 -1.31 -0.63 -2.23 -0.81 0.11 0.12 2.02 0.75 0.87 -0.34 -0.39 -1.15 -0.7 1.21 0.65 -0.26 -0.45 -0.21 -0.24 -0.89 0.32
-0.41 0.08 0.53 0.48 -0.62 -0.22 -0.32 1.11 -0.7 -0.33 0.15 0.24 -1.45 -0.77 -2.24 -1.37 -3.28 -1.11 -0.3 -1.63 1.25 1.51 -0.9 0.49 -2.39 -0.47 0.54 -1.94 -0.91 0.81 1.16 -0.28 0.32 0.65 -0.04
-1.05 -0.81 -0.24 -0.33 -0.38 -0.35 -0.22 0.04 -1.01 -1.1 0.83 0.92 -0.95 1.34 -1.48 -0.88 -1.58 -0.45 0.41 -0.08 1.84 1.62 -0.92 -0.04 -2.62 -1.41 -2.35 -0.16 -1.4 -1.41 -2.29 -1.23 0.99 0.4 1.3
-0.63 -2.07 -0.11 -1.4 -0.98 -0.32 -1.65 -0.48 0.03 -0.05 -0.26 0.04 -2.99 1.47 0.03 -0.53 -1.75 -1.1 -0.24 -0.68 1.86 0.97 1.3 1.22 0.39 -0.37 -0.51 -1.35 0.44 -0.26 0.31 -0.29 0.2 -0.99 -1.75
-2.66 - -2.46 -5.44 -0.49 -2.75 -2.55 -2.38 -2.05 -1.31 0.98 1.42 0.78 1.63 -0.68 -0.25 -1.32 -0.13 0.12 0.23 1.07 1.41 0.96 1.34 -0.12 -32.77 -3.57 - -1.66 -0.08 -0.33 0.52 1.22 0.71 -0.81
-0.98 -0.49 -0.92 -1.1 0.25 -1.04 -1.21 2.56 -1.89 -0.9 -0.3 -0.63 -2.89 -0.83 -1.54 -1.22 -2.38 -1.71 -1.19 -2.26 1.65 1.96 -0.84 0.64 -1.98 -3.3 -2.37 -1.45 -0.33 0.43 0.84 0.25 -0.46 1.02 0.99
-2.35 -0.98 -0.74 -0.23 0.53 0.6 -0.34 -0.48 1.27 1.12 -0.35 -0.36 0.64 -0.72 -1.19 -0.44 -1.65 -1.35 -0.47 0.69 1.81 0.93 1.03 -2.61 -1.24 0.49 0.73 -0.86 -0.02 -1.03 -1.38 -0.99 -0.24 -1.92 -0.48
-0.16 -0.27 -0.47 -0.26 -0.12 0.17 0.09 -0.55 0.25 0.26 -0.71 -0.66 -0.98 -0.33 -1.08 -1.17 -2.72 -0.46 -0.33 -0.23 1.26 1.0 1.34 0.06 -0.16 -0.59 1.06 0.61 -0.26 -0.06 -0.06 -0.28 -0.53 -0.79 0.61
-0.59 0.47 -0.32 0.16 -0.98 -0.43 0.23 0.04 -0.12 0.28 0.01 0.29 0.05 -0.38 -2.99 -0.65 -4.93 0.29 0.81 -0.28 1.42 1.11 0.98 -0.36 -1.71 -2.17 -3.22 0.17 0.92 -1.04 -1.06 -0.67 0.26 0.31 0.63
-0.45 0.04 -0.25 0.31 0.4 0.4 0.53 0.02 0.41 0.71 - - - - -1.08 -1.24 -4.25 -0.35 -0.3 -0.64 1.99 1.81 1.49 0.49 -1.37 - - 0.67 1.11 0.33 0.18 0.76 - - -
-0.48 -0.15 -0.67 -0.02 0.33 0.07 0.26 -0.98 0.48 0.29 -0.2 -0.16 -0.28 -1.05 -0.86 -0.57 -2.44 0.14 -0.03 -0.22 0.68 0.11 1.1 -0.17 1.57 -0.83 -1.28 0.29 -1.02 -0.28 -0.49 0.04 -0.12 -0.71 1.17
-1.03 -0.66 -0.79 -0.44 -0.1 -0.52 -0.18 -0.07 -0.07 -0.33 -1.18 -0.94 0.3 -0.8 -0.5 -0.37 -0.76 -0.91 -0.17 0.92 1.75 1.0 1.94 1.46 -1.16 -2.29 -2.8 -0.2 0.32 -1.24 -1.68 -0.76 -0.97 -0.59 0.86
-0.52 -0.75 -0.58 -1.12 -0.21 -0.16 -1.06 -0.4 0.08 -0.01 0.55 0.26 -0.49 -0.24 -1.39 -2.36 -1.87 -1.7 -1.33 -0.01 1.64 1.64 0.56 0.22 -0.3 0.28 0.46 -0.25 0.02 -1.03 -0.71 -1.24 0.36 -0.13 1.55
-0.49 -0.31 -0.88 -0.44 0.33 0.25 -0.06 -0.92 0.62 0.31 0.38 0.33 -1.05 0.7 0.17 -0.13 0.01 -0.63 -0.83 -0.57 0.9 1.09 1.23 0.62 -0.2 -0.95 -1.26 0.97 -0.67 -1.27 -0.94 -1.38 -0.16 -0.87 -0.24
-0.65 -0.99 -1.19 -1.42 0.09 -1.18 -1.38 -1.77 -1.08 -0.89 0.59 -0.91 -3.39 -4.53 -0.2 -1.14 -0.39 -0.13 -0.19 0.02 1.89 1.69 2.66 0.25 1.2 -2.09 -2.03 0.17 -0.38 -0.43 -0.37 -0.38 -1.2 -0.56 -1.86
-1.14 -0.33 0.64 0.59 -0.35 -1.04 0.56 0.68 -1.26 -0.22 -0.35 -0.39 -0.83 -0.87 -2.15 -0.57 -3.86 -0.11 0.54 0.53 1.49 1.06 -0.03 -0.25 -0.68 -0.45 -2.04 0.08 1.24 -0.16 -0.32 0.65 -0.2 -0.64 0.11
-0.59 -0.24 -0.79 -0.39 -0.41 -0.28 -0.17 -0.9 0.0 -0.11 -0.59 -0.0 0.84 -0.82 -0.19 -0.53 -0.73 0.34 0.46 -0.25 0.85 0.56 0.91 0.03 -0.48 -1.15 -1.22 0.5 -0.16 0.4 -0.03 0.53 -0.2 -0.03 0.91
-0.8 -0.54 -0.94 -0.51 0.19 -0.43 -0.06 -0.82 0.12 0.04 -0.42 -0.24 0.36 1.22 -1.25 -1.13 -1.41 -0.41 0.12 0.14 0.49 0.98 1.87 -0.75 -1.19 -0.62 -0.75 0.19 -0.37 -0.73 -0.16 -1.2 -0.42 0.45 1.21
-0.04 0.23 -0.11 -0.09 -0.29 0.09 0.02 0.12 0.06 0.08 0.33 -0.44 -0.79 -0.65 -0.53 -1.45 0.11 -0.12 0.45 -0.41 1.55 1.36 0.64 -0.34 -1.16 -0.67 -1.15 1.08 -1.91 -0.65 -0.45 -0.95 -0.53 -0.46 0.55
0.15 0.03 -0.0 0.09 0.1 0.16 0.13 -0.4 0.49 0.56 -0.72 -0.66 -0.1 -0.76 0.18 -0.53 -0.44 0.08 -0.03 0.25 1.34 0.43 1.43 -0.49 -0.27 -0.88 -1.38 0.27 -0.35 -1.23 -1.24 -1.1 -0.35 0.1 0.17
0.07 0.15 0.15 0.02 -0.54 0.22 -0.15 0.26 0.29 0.28 -1.24 -1.15 -0.23 -2.13 -0.8 -1.04 -0.86 -0.2 0.21 -0.47 0.79 -0.14 -0.54 0.47 0.06 -0.1 0.33 -0.24 -0.02 0.78 0.92 -0.05 -0.91 0.04 1.08
-0.44 -0.44 -1.04 -0.17 0.26 -0.81 -1.95 0.91 -0.7 -0.99 0.15 -0.72 0.86 -3.31 0.17 -0.1 0.61 -0.52 0.31 0.42 1.1 1.9 -1.68 -0.07 -1.51 -0.78 -0.56 1.22 -0.79 -0.16 -0.15 -0.38 -2.26 0.25 0.02
-1.05 -0.64 -1.86 -0.69 0.01 -0.85 -0.31 -1.12 -1.13 -0.64 -1.35 -1.24 0.69 -1.45 -1.41 -2.22 -1.99 -0.16 -0.4 -0.07 1.98 2.4 2.24 -0.0 -0.12 -1.75 -0.93 -0.11 -0.73 -0.12 -0.88 0.39 -1.2 -1.79 0.12
-0.01 0.15 0.06 0.2 -0.52 0.43 0.04 0.85 0.32 0.33 -0.22 -0.14 -0.75 -0.38 -0.54 -0.26 -3.64 0.3 0.87 -0.81 1.61 1.44 0.28 -0.29 -1.64 -2.45 -3.14 -0.49 -0.65 -0.34 -0.48 -0.4 0.01 0.24 -0.41
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-1.72 -1.09 -1.1 -0.5 0.33 -1.56 -0.55 -0.14 -1.29 -0.93 0.2 0.32 -0.41 -0.01 -1.61 -0.95 -2.08 -0.62 -0.09 0.33 0.48 0.83 -0.66 -0.99 -3.14 -0.73 0.15 -1.16 1.68 0.62 -0.06 1.29 0.39 0.58 1.74
-1.33 -0.63 -1.21 -0.5 -1.1 -0.73 -0.02 -0.42 -0.26 -0.2 -1.18 -0.91 0.08 0.06 -1.05 -0.89 -1.24 0.61 0.69 0.42 1.44 0.55 0.39 0.24 -0.34 -1.79 0.01 0.09 -0.19 0.58 0.46 0.58 -0.97 -0.05 1.47
-1.68 0.04 -0.27 0.49 -0.13 -0.53 -1.45 0.48 0.66 0.8 0.85 0.36 -0.56 -0.95 -2.91 0.1 -3.21 -1.86 -0.75 0.83 1.77 1.37 1.31 -1.88 0.59 -2.42 -2.75 0.66 -0.29 -2.03 -2.28 -2.5 0.31 0.55 -2.55
-0.76 -0.53 -0.91 -0.48 -0.66 -0.77 -0.23 -1.02 -0.2 0.01 -0.72 -0.86 0.02 -0.98 -0.68 -0.54 -0.33 0.05 0.32 -0.13 0.93 0.63 0.25 0.61 0.21 -0.37 -0.5 0.83 -0.05 0.72 0.29 0.87 -1.07 -0.13 1.27
-0.18 0.18 -0.1 0.31 -0.23 0.04 0.5 -0.52 0.31 0.41 0.16 0.63 -0.84 -1.35 -0.38 -0.63 -1.12 0.52 -0.22 -0.6 0.7 1.72 -0.03 -0.32 -1.63 -2.42 -2.22 0.32 -0.75 -0.51 -0.82 -0.26 0.63 0.48 0.57
-1.39 -0.26 -1.35 -0.19 -0.87 -0.36 0.07 -0.57 -0.01 -0.32 -1.92 -1.68 -1.05 0.79 -0.37 -0.68 -0.04 0.2 0.47 1.03 1.63 0.69 1.37 0.68 0.39 -0.85 -0.94 -0.87 -0.17 -0.12 -0.66 0.29 -1.88 -0.8 0.68
-0.07 -0.44 -0.66 -0.56 0.52 0.24 -0.28 -1.0 0.52 0.29 -0.27 -0.39 0.11 -0.33 -0.86 -0.75 -3.75 -0.23 -0.29 -0.38 1.61 -0.01 2.07 -0.21 0.91 -1.42 -1.45 0.41 0.4 -1.07 -0.79 -0.89 -0.34 -1.46 0.22
-2.09 -1.17 -3.27 -1.77 0.93 -2.23 -1.18 -2.83 -2.46 -1.43 0.52 0.89 -9.48 -5.26 -1.11 -0.85 -1.9 0.99 -0.28 -1.53 2.6 3.15 2.38 -5.8 -6.51 -10.09 - -2.62 -3.2 -1.39 -2.41 -1.8 0.52 -2.72 -8.02
-1.16 -0.13 0.22 0.35 -1.59 -0.19 -0.27 -0.08 0.08 -0.15 -0.2 -0.9 0.19 0.08 -1.59 -0.09 -1.42 -0.65 0.01 0.94 2.25 1.12 1.19 0.08 -1.43 -2.58 -4.04 0.05 0.9 -1.44 -1.84 -0.88 -0.89 0.13 -0.24
-1.48 0.32 -0.7 -0.42 0.08 -1.36 1.77 -0.76 0.45 0.17 -6.14 -3.64 - - -4.07 -2.25 -4.43 -3.15 -1.12 1.24 2.9 2.66 2.24 -4.35 -2.6 -3.97 -3.13 0.06 -1.41 -2.32 - -3.13 -3.25 - -
-0.93 -0.76 -1.3 -0.96 1.36 -1.48 -1.06 2.78 -3.82 -0.8 -3.57 -2.82 -2.67 -3.92 - - - -4.9 -5.62 -0.71 3.43 1.75 1.09 -0.67 -0.58 - - 1.03 - -0.44 -2.34 - -3.28 - -1.94
-0.6 -2.1 -0.47 -0.32 2.05 - - -0.35 - - 0.27 - 2.51 - - - 0.44 0.19 -1.4 - 2.91 2.2 - 0.9 -0.18 -1.49 - - - 0.7 - - -0.87 - -1.13
-0.14 -0.78 -0.95 -1.75 -0.33 -0.87 -1.78 -0.0 0.15 0.24 1.02 0.54 0.4 -0.23 0.01 -0.89 0.43 -1.01 0.46 0.76 -0.16 0.59 -0.61 -0.83 -1.24 0.1 -0.1 1.47 -0.28 -0.52 -0.45 -1.14 0.11 0.9 0.24
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0.15 -0.14 -0.48 -0.38 -1.21 -0.04 -0.18 -0.32 0.3 0.21 -0.44 -0.27 -0.76 -1.7 -0.54 -0.79 -1.45 -0.23 0.12 -0.8 0.83 0.32 0.13 1.68 0.65 -0.44 0.12 0.22 -0.86 0.45 0.7 0.09 -0.14 0.2 -0.2
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.