1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_7 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
4h after treatment
4h after treatment,No nitrate
8h after treatment
8h after treatment,No nitrate
20C
20h after treatment
20h after treatment,No nitrate
20h after treatment,Nocodazole added
36h after treatment
36h after treatment,No phosphate
Blue light,10min after light change
Blue light,60min after light change
Bohlin
CCAP1055/1,20C
CCAP1055/1,20C,High CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Low CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Normal CO2,OligoDT primed
CCMP2561
CCMP2561 Nitrase Reductase Knockout
CCMP632
CCMP632,24h
CCMP632,48h
CCMP632,72h
CCMP632,High light acclimated WT
CCMP632,Low light acclimated WT
NEPCC640,8h,1000ppmv CO2
NEPCC640,8h,390 ppmv CO2
No light,8h after treatment
Pt-1
Pt-1 8.6
Pt-1 8.6,With nitrogen
Pt-1 8.6,Without nitrogen
Red light,0min before light change
UTEX 646,Blue light
UTEX 646,No light
0.24 0.39 0.49 1.0 0.29 0.41 0.64 0.74 0.21 0.15 0.02 0.03 0.07 0.06 0.31 0.29 0.39 0.37 0.37 0.3 0.2 0.29 0.17 0.55 0.16 0.64 0.06 0.08 0.07 0.39 0.65 0.39 0.02 0.08 0.0
0.36 0.93 0.84 1.0 0.21 0.59 0.59 0.51 0.28 0.52 0.04 0.06 0.06 0.0 0.09 0.46 0.14 0.34 0.22 0.23 0.0 0.04 0.0 0.43 0.12 0.2 0.14 0.07 0.04 0.37 0.49 0.17 0.05 0.21 0.46
0.51 1.0 0.33 0.6 0.24 0.57 0.55 0.19 0.31 0.59 0.27 0.28 0.06 0.09 0.07 0.12 0.02 0.3 0.3 0.09 0.11 0.33 0.07 0.1 0.03 0.22 0.24 0.07 0.09 0.23 0.41 0.1 0.39 0.34 0.13
0.49 0.8 0.51 0.72 0.46 0.66 0.54 1.0 0.55 0.63 0.2 0.2 0.14 0.05 0.32 0.44 0.63 0.4 0.29 0.31 0.03 0.17 0.05 0.25 0.18 0.27 0.38 0.19 0.14 0.43 0.7 0.3 0.28 0.31 0.16
0.34 0.68 0.25 0.38 0.31 0.32 0.26 0.14 0.16 0.31 0.66 0.75 0.08 0.25 0.07 0.2 0.01 0.47 0.22 0.22 0.16 1.0 0.07 0.16 0.04 0.12 0.12 0.03 0.02 0.28 0.43 0.21 0.67 0.72 0.31
0.44 1.0 0.4 0.67 0.22 0.51 0.43 0.3 0.18 0.54 0.37 0.34 0.05 0.16 0.15 0.39 0.05 0.57 0.32 0.14 0.41 0.93 0.16 0.12 0.04 0.2 0.16 0.06 0.02 0.24 0.29 0.23 0.4 0.48 0.22
0.45 1.0 0.26 0.54 0.15 0.39 0.39 0.13 0.13 0.37 0.19 0.17 0.02 0.02 0.05 0.06 0.04 0.21 0.12 0.1 0.06 0.24 0.02 0.16 0.1 0.12 0.16 0.02 0.01 0.11 0.19 0.03 0.21 0.22 0.04
0.5 1.0 0.31 0.5 0.18 0.49 0.42 0.28 0.14 0.43 0.14 0.16 0.01 0.05 0.08 0.07 0.11 0.26 0.1 0.09 0.09 0.36 0.03 0.08 0.01 0.13 0.09 0.01 0.0 0.17 0.24 0.14 0.16 0.35 0.0
0.51 1.0 0.31 0.54 0.34 0.47 0.46 0.21 0.25 0.46 0.34 0.34 0.04 0.14 0.19 0.26 0.05 0.36 0.29 0.2 0.32 0.74 0.27 0.21 0.2 0.28 0.25 0.35 0.08 0.27 0.44 0.18 0.38 0.34 0.15
0.36 1.0 0.27 0.52 0.21 0.38 0.34 0.13 0.14 0.38 0.18 0.22 0.07 0.05 0.12 0.25 0.04 0.44 0.26 0.09 0.16 0.47 0.06 0.07 0.03 0.13 0.08 0.04 0.02 0.18 0.31 0.12 0.25 0.19 0.29
0.61 1.0 0.49 0.63 0.45 0.54 0.43 0.37 0.28 0.41 0.27 0.44 0.05 0.07 0.27 0.33 0.17 0.47 0.32 0.24 0.24 0.72 0.17 0.17 0.06 0.25 0.21 0.19 0.09 0.37 0.55 0.22 0.38 0.5 0.02
0.54 1.0 0.39 0.63 0.25 0.55 0.59 0.27 0.29 0.58 0.51 0.57 0.21 0.09 0.15 0.26 0.09 0.55 0.35 0.25 0.16 0.68 0.07 0.11 0.03 0.18 0.2 0.06 0.1 0.19 0.28 0.08 0.62 1.0 0.23
0.44 1.0 0.41 0.68 0.23 0.47 0.43 0.28 0.21 0.47 0.33 0.42 0.04 0.14 0.22 0.38 0.15 0.46 0.26 0.12 0.1 0.45 0.06 0.09 0.03 0.19 0.13 0.07 0.04 0.37 0.52 0.18 0.41 0.26 0.04
0.33 1.0 0.34 0.64 0.16 0.43 0.42 0.18 0.16 0.4 0.11 0.13 0.05 0.03 0.08 0.21 0.02 0.28 0.11 0.05 0.06 0.15 0.03 0.04 0.03 0.14 0.08 0.02 0.01 0.11 0.17 0.08 0.15 0.04 0.01
0.39 0.88 0.25 0.49 0.2 0.42 0.37 0.18 0.14 0.42 0.43 0.46 0.14 0.22 0.06 0.08 0.04 0.2 0.16 0.17 0.25 1.0 0.09 0.21 0.04 0.26 0.27 0.01 0.01 0.42 0.65 0.18 0.52 0.79 0.04
0.32 1.0 0.33 0.66 0.24 0.42 0.41 0.21 0.17 0.46 0.19 0.19 0.11 0.21 0.07 0.15 0.08 0.21 0.09 0.08 0.07 0.22 0.06 0.14 0.12 0.2 0.1 0.04 0.05 0.24 0.32 0.21 0.2 0.1 0.14
0.28 0.56 0.38 0.42 0.27 0.28 0.23 1.0 0.12 0.24 0.15 0.18 0.09 0.14 0.23 0.28 0.09 0.3 0.12 0.19 0.43 0.56 0.19 0.3 0.17 0.32 0.09 0.06 0.02 0.4 0.66 0.21 0.19 0.59 0.35
0.31 0.73 0.27 0.42 0.18 0.34 0.34 0.4 0.16 0.37 0.49 0.25 0.14 0.07 0.08 0.14 0.04 0.27 0.26 0.07 0.22 0.44 0.08 0.14 0.04 0.16 0.11 0.04 0.01 0.19 0.29 0.14 0.24 1.0 0.37
0.28 0.48 0.3 0.34 0.25 0.34 0.22 0.55 0.19 0.29 0.27 0.16 0.03 0.18 0.56 0.39 1.0 0.23 0.15 0.25 0.05 0.22 0.03 0.31 0.12 0.37 0.23 0.12 0.03 0.36 0.65 0.16 0.21 0.26 0.27
0.41 1.0 0.33 0.64 0.16 0.43 0.39 0.21 0.18 0.42 0.18 0.19 0.01 0.08 0.02 0.09 0.0 0.22 0.18 0.04 0.02 0.07 0.0 0.03 0.03 0.16 0.09 0.04 0.04 0.15 0.27 0.05 0.22 0.08 0.16
0.56 1.0 0.33 0.65 0.34 0.65 0.7 0.26 0.35 0.65 0.55 0.53 0.11 0.16 0.16 0.18 0.08 0.49 0.31 0.21 0.28 0.85 0.15 0.13 0.05 0.21 0.21 0.05 0.06 0.33 0.56 0.14 0.58 0.66 0.02
0.52 1.0 0.37 0.67 0.22 0.67 0.57 0.2 0.38 0.71 0.28 0.36 0.02 0.14 0.09 0.1 0.06 0.24 0.29 0.1 0.05 0.23 0.04 0.06 0.02 0.16 0.19 0.04 0.06 0.23 0.38 0.08 0.43 0.41 0.01
0.32 0.61 0.34 0.47 0.13 0.4 0.23 0.39 0.19 0.32 0.36 0.41 0.03 0.51 0.09 0.13 0.03 0.21 0.12 0.13 0.03 0.07 0.05 0.29 0.45 0.51 0.47 0.09 0.15 0.5 0.82 0.14 0.45 0.27 1.0
0.36 0.85 0.49 0.86 0.45 0.54 0.73 0.6 0.47 0.73 0.31 0.41 0.26 0.14 0.3 0.44 0.44 0.56 0.33 0.37 0.1 0.25 0.06 0.36 0.2 1.0 0.81 0.36 0.47 0.71 0.87 0.69 0.46 0.29 0.4
0.32 1.0 0.33 0.63 0.25 0.39 0.47 0.31 0.17 0.4 0.12 0.12 0.12 0.08 0.29 0.33 0.22 0.62 0.27 0.18 0.13 0.27 0.06 0.17 0.08 0.31 0.18 0.03 0.02 0.49 0.56 0.36 0.15 0.24 0.09
0.34 1.0 0.34 0.69 0.15 0.43 0.48 0.2 0.16 0.43 0.14 0.15 0.03 0.03 0.11 0.23 0.15 0.27 0.09 0.09 0.03 0.16 0.02 0.05 0.02 0.1 0.05 0.02 0.01 0.11 0.19 0.1 0.15 0.03 0.0
0.39 1.0 0.35 0.63 0.26 0.43 0.4 0.22 0.2 0.34 0.16 0.17 0.05 0.1 0.19 0.22 0.34 0.56 0.29 0.43 0.01 0.12 0.0 0.1 0.01 0.43 0.99 0.01 0.06 0.3 0.37 0.15 0.26 0.51 0.1
0.37 1.0 0.32 0.54 0.15 0.39 0.39 0.2 0.13 0.4 0.16 0.24 0.01 0.06 0.13 0.33 0.06 0.34 0.2 0.09 0.05 0.33 0.04 0.03 0.02 0.07 0.04 0.02 0.01 0.1 0.12 0.14 0.26 0.08 0.0
0.38 1.0 0.36 0.59 0.26 0.42 0.41 0.35 0.26 0.45 0.17 0.17 0.12 0.09 0.15 0.23 0.07 0.38 0.22 0.13 0.12 0.2 0.06 0.23 0.11 0.14 0.1 0.07 0.02 0.4 0.55 0.29 0.19 0.47 0.4
0.56 0.78 0.6 0.53 0.49 0.7 0.47 0.63 0.47 0.68 0.59 0.68 0.08 0.22 0.28 0.26 0.14 0.41 0.25 0.2 0.63 1.0 0.4 0.34 0.15 0.23 0.24 0.05 0.12 0.51 0.67 0.43 0.65 0.74 0.02
0.36 1.0 0.32 0.6 0.25 0.4 0.46 0.21 0.17 0.49 0.44 0.5 0.09 0.41 0.17 0.28 0.03 0.61 0.26 0.1 0.39 0.66 0.15 0.14 0.06 0.22 0.09 0.11 0.03 0.23 0.35 0.2 0.47 0.4 0.43
0.39 1.0 0.25 0.52 0.14 0.47 0.37 0.19 0.19 0.47 0.25 0.29 0.04 0.19 0.11 0.15 0.02 0.32 0.11 0.06 0.06 0.17 0.03 0.08 0.04 0.12 0.09 0.03 0.01 0.13 0.26 0.07 0.33 0.21 0.2
0.4 1.0 0.42 0.58 0.26 0.42 0.38 0.23 0.19 0.38 0.39 0.53 0.12 0.23 0.31 0.45 0.5 0.23 0.16 0.19 0.1 0.31 0.08 0.15 0.08 0.41 0.1 0.05 0.07 0.32 0.54 0.23 0.51 0.26 0.05
0.41 1.0 0.28 0.58 0.16 0.43 0.41 0.17 0.16 0.42 0.13 0.17 0.04 0.02 0.06 0.16 0.04 0.21 0.14 0.06 0.12 0.23 0.06 0.04 0.03 0.1 0.07 0.05 0.02 0.08 0.11 0.06 0.19 0.06 0.04
0.42 1.0 0.37 0.65 0.28 0.47 0.45 0.4 0.27 0.48 0.45 0.56 0.21 0.23 0.19 0.29 0.13 0.34 0.25 0.19 0.72 0.7 0.44 0.53 0.31 0.18 0.23 0.06 0.31 0.47 0.31 0.63 0.51 0.62 0.12
0.31 1.0 0.46 0.78 0.22 0.51 0.5 0.36 0.28 0.59 0.2 0.28 0.1 0.09 0.26 0.4 0.45 0.19 0.08 0.16 0.08 0.33 0.04 0.14 0.08 0.21 0.1 0.04 0.05 0.29 0.39 0.4 0.26 0.02 0.03
0.44 1.0 0.48 0.62 0.22 0.51 0.44 0.56 0.21 0.44 0.33 0.34 0.19 0.18 0.18 0.25 0.04 0.42 0.19 0.11 0.17 0.39 0.08 0.17 0.06 0.28 0.15 0.13 0.03 0.38 0.64 0.2 0.37 0.84 0.41
0.62 1.0 0.44 0.55 0.3 0.72 0.41 0.32 0.35 0.81 0.52 0.43 0.75 0.18 0.21 0.3 0.07 0.4 0.28 0.13 0.32 0.62 0.15 0.62 0.1 0.3 0.39 0.05 0.06 0.41 0.65 0.31 0.48 0.76 0.66
0.38 0.96 0.54 1.0 0.3 0.45 0.6 0.43 0.28 0.37 0.73 0.22 0.19 0.13 0.18 0.24 0.25 0.23 0.25 0.19 0.23 0.37 0.17 0.28 0.18 0.39 0.31 0.09 0.12 0.38 0.65 0.29 0.21 0.87 0.28
0.29 1.0 0.21 0.71 0.31 0.28 0.51 0.15 0.1 0.36 0.16 0.23 0.06 0.04 0.25 0.29 0.15 0.5 0.18 0.07 0.22 0.43 0.05 0.06 0.09 0.39 0.67 0.03 0.01 0.26 0.39 0.18 0.23 0.02 0.03
0.22 0.45 0.23 0.32 0.13 0.29 0.3 0.23 0.19 0.31 0.24 0.22 0.1 0.12 0.15 0.16 0.05 0.34 0.27 0.06 0.15 0.3 0.13 0.18 0.05 0.26 0.21 0.05 0.03 0.29 0.37 0.23 0.23 1.0 0.35
0.43 1.0 0.41 0.67 0.39 0.6 0.61 0.24 0.51 0.68 0.48 0.41 0.16 0.23 0.35 0.37 0.2 0.7 0.44 0.2 0.54 0.89 0.43 0.26 0.09 0.23 0.1 0.16 0.1 0.24 0.31 0.25 0.41 0.5 0.39
0.44 1.0 0.46 0.62 0.19 0.53 0.37 0.41 0.21 0.52 0.28 0.37 0.08 0.56 0.19 0.42 0.13 0.42 0.18 0.14 0.11 0.43 0.06 0.18 0.04 0.14 0.07 0.04 0.04 0.34 0.48 0.26 0.39 0.75 0.29
0.35 1.0 0.28 0.57 0.12 0.35 0.4 0.15 0.12 0.36 0.07 0.1 0.02 0.01 0.07 0.21 0.02 0.28 0.09 0.05 0.07 0.23 0.02 0.01 0.01 0.1 0.07 0.02 0.0 0.05 0.09 0.04 0.11 0.03 0.01
0.46 1.0 0.38 0.62 0.58 0.56 0.51 0.24 0.32 0.63 0.41 0.45 0.2 0.67 0.1 0.13 0.18 0.33 0.2 0.36 0.04 0.14 0.07 0.29 0.43 0.17 0.15 0.26 0.22 0.47 0.77 0.33 0.52 0.26 0.54
0.65 1.0 0.62 0.54 0.28 0.56 0.21 0.24 0.21 0.39 0.26 0.22 0.05 0.01 0.31 0.32 0.19 0.25 0.21 0.12 0.01 0.09 0.01 0.14 0.04 0.38 0.36 0.15 0.02 0.2 0.42 0.08 0.29 0.27 0.31
0.42 0.76 0.61 0.49 0.33 0.51 0.22 0.38 0.22 0.36 0.21 0.25 0.04 0.02 0.42 0.35 0.73 0.23 0.16 0.18 0.04 0.22 0.03 0.31 0.08 0.45 0.17 0.08 0.05 0.6 1.0 0.19 0.37 0.66 0.2
0.64 1.0 0.51 0.66 0.17 0.51 0.39 0.26 0.15 0.48 0.4 0.36 0.02 0.03 0.12 0.1 0.05 0.29 0.16 0.08 0.07 0.39 0.03 0.26 0.08 0.69 0.74 0.04 0.02 0.4 0.56 0.06 0.46 0.53 0.14
0.41 0.99 0.43 0.65 0.38 0.56 0.43 0.38 0.34 0.55 0.29 0.27 0.19 0.7 0.29 0.33 0.19 0.45 0.25 0.27 0.28 0.69 0.24 0.41 0.33 0.39 0.72 0.23 0.04 0.77 1.0 0.54 0.29 0.55 0.8
0.34 0.8 0.6 0.72 0.31 0.5 0.33 0.72 0.29 0.51 0.09 0.14 0.1 0.13 0.34 0.51 0.28 0.36 0.41 0.46 0.12 0.34 0.05 0.6 0.15 0.34 0.41 0.09 0.17 1.0 0.96 0.52 0.15 0.44 0.58
0.51 0.96 0.48 0.91 0.37 0.66 0.73 0.85 0.44 0.68 0.26 0.38 0.21 0.1 0.59 0.59 1.0 0.47 0.36 0.18 0.1 0.32 0.04 0.33 0.28 0.45 0.2 0.26 0.2 0.48 0.5 0.58 0.44 0.32 0.31
0.52 1.0 0.46 0.61 0.44 0.58 0.55 0.38 0.52 0.64 0.49 0.46 0.09 0.41 0.19 0.13 0.1 0.29 0.22 0.25 0.34 0.69 0.38 0.55 0.23 0.31 0.26 0.13 0.14 0.62 0.92 0.5 0.51 0.74 0.42
0.35 1.0 0.32 0.59 0.17 0.43 0.37 0.18 0.18 0.43 0.17 0.2 0.06 0.03 0.05 0.17 0.02 0.22 0.09 0.06 0.17 0.35 0.06 0.05 0.04 0.18 0.14 0.05 0.02 0.11 0.18 0.05 0.23 0.04 0.07
0.46 1.0 0.35 0.58 0.17 0.6 0.48 0.21 0.25 0.49 0.31 0.29 0.06 0.06 0.14 0.13 0.15 0.29 0.21 0.11 0.04 0.24 0.03 0.13 0.04 0.33 0.33 0.03 0.02 0.16 0.28 0.07 0.34 0.35 0.03
0.51 1.0 0.33 0.6 0.2 0.56 0.54 0.19 0.25 0.54 0.24 0.27 0.03 0.02 0.19 0.14 0.17 0.34 0.29 0.11 0.06 0.24 0.03 0.2 0.05 0.0 0.0 0.08 0.03 0.16 0.27 0.05 0.33 0.42 0.03
0.42 1.0 0.33 0.48 0.11 0.43 0.33 0.18 0.15 0.43 0.07 0.1 0.01 0.02 0.15 0.19 0.04 0.22 0.09 0.06 0.08 0.23 0.04 0.05 0.01 0.12 0.06 0.02 0.01 0.12 0.2 0.11 0.12 0.14 0.13
0.34 0.57 0.35 1.0 0.35 0.46 0.8 0.52 0.36 0.41 0.15 0.19 0.46 0.18 0.26 0.29 0.27 0.39 0.32 0.22 0.09 0.16 0.1 0.25 0.2 0.4 0.09 0.25 0.22 0.37 0.45 0.55 0.18 0.15 0.08
0.36 1.0 0.5 0.71 0.66 0.54 0.39 0.29 0.26 0.53 0.21 0.32 0.05 0.2 0.28 0.5 0.37 0.27 0.12 0.15 0.22 0.68 0.14 0.17 0.14 0.37 0.13 0.04 0.06 0.34 0.51 0.34 0.35 0.24 0.1
0.31 0.76 0.22 0.39 0.19 0.31 0.35 0.16 0.14 0.32 0.14 0.17 0.13 0.23 0.08 0.12 0.06 0.38 0.13 0.16 0.03 0.16 0.02 0.34 0.19 0.35 0.48 0.11 0.04 0.53 1.0 0.27 0.21 0.36 0.65

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)