1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_30 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
4h after treatment
4h after treatment,No nitrate
8h after treatment
8h after treatment,No nitrate
20C
20h after treatment
20h after treatment,No nitrate
20h after treatment,Nocodazole added
36h after treatment
36h after treatment,No phosphate
Blue light,10min after light change
Blue light,60min after light change
Bohlin
CCAP1055/1,20C
CCAP1055/1,20C,High CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Low CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Normal CO2,OligoDT primed
CCMP2561
CCMP2561 Nitrase Reductase Knockout
CCMP632
CCMP632,24h
CCMP632,48h
CCMP632,72h
CCMP632,High light acclimated WT
CCMP632,Low light acclimated WT
NEPCC640,8h,1000ppmv CO2
NEPCC640,8h,390 ppmv CO2
No light,8h after treatment
Pt-1
Pt-1 8.6
Pt-1 8.6,With nitrogen
Pt-1 8.6,Without nitrogen
Red light,0min before light change
UTEX 646,Blue light
UTEX 646,No light
0.1 0.11 0.1 0.17 0.28 0.14 0.15 0.13 0.18 0.27 0.42 0.59 0.06 1.0 0.26 0.13 0.49 0.38 0.34 0.02 0.14 0.13 0.25 0.1 0.05 0.1 0.01 0.28 0.05 0.05 0.07 0.03 0.58 0.06 0.2
0.15 0.24 0.14 0.26 0.86 0.19 0.32 0.17 0.25 0.3 0.06 0.08 0.27 0.08 0.2 0.09 0.08 0.74 0.32 0.23 0.78 1.0 0.85 0.53 0.27 0.09 0.05 0.18 0.56 0.15 0.15 0.2 0.06 0.04 0.05
0.07 0.08 0.09 0.08 0.23 0.24 0.21 0.07 0.3 0.21 0.0 0.0 0.01 0.0 0.24 0.11 0.09 1.0 0.44 0.1 0.4 0.37 0.62 0.66 0.4 0.02 0.01 0.13 0.28 0.03 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0
0.07 0.13 0.11 0.11 0.2 0.12 0.13 0.15 0.1 0.15 0.37 0.52 0.05 0.84 0.19 0.06 0.09 1.0 0.46 0.09 0.37 0.45 0.28 0.42 0.17 0.03 0.02 0.1 0.33 0.24 0.55 0.19 0.5 0.06 0.06
0.1 0.22 0.1 0.22 0.21 0.22 0.26 0.21 0.18 0.23 0.27 0.37 0.04 0.8 0.17 0.06 0.03 0.73 0.31 0.1 0.35 0.46 0.32 0.21 0.06 0.19 1.0 0.08 0.29 0.2 0.14 0.19 0.36 0.12 0.05
0.06 0.09 0.04 0.08 0.26 0.11 0.11 0.11 0.12 0.11 0.24 0.3 0.19 1.0 0.18 0.08 0.03 0.53 0.24 0.08 0.2 0.27 0.18 0.21 0.12 0.07 0.04 0.24 0.19 0.06 0.06 0.05 0.3 0.07 0.15
0.08 0.06 0.07 0.04 0.11 0.17 0.13 0.24 0.23 0.26 0.51 0.72 0.04 0.2 0.36 0.08 0.09 1.0 0.24 0.04 0.41 0.44 0.72 0.51 0.06 0.02 0.07 0.49 0.2 0.09 0.15 0.04 0.64 0.0 0.01
0.1 0.21 0.07 0.33 0.53 0.63 0.56 0.6 0.59 0.42 0.19 0.19 0.23 0.4 0.84 0.32 0.04 0.82 0.87 0.07 0.55 0.33 0.47 0.55 0.28 0.04 0.01 1.0 0.08 0.14 0.06 0.26 0.28 0.05 0.13
0.19 0.31 0.25 0.45 0.38 0.5 0.23 0.17 0.38 0.36 0.95 1.0 0.05 0.63 0.35 0.16 0.31 0.95 0.29 0.07 0.73 0.7 0.69 0.27 0.12 0.64 0.41 0.11 0.18 0.67 0.95 0.0 0.89 0.69 0.52
0.12 0.17 0.08 0.18 0.33 0.23 0.31 0.1 0.33 0.31 0.29 0.36 0.08 0.38 0.26 0.19 0.25 1.0 0.71 0.12 0.74 0.41 0.89 0.27 0.17 0.06 0.05 0.38 0.29 0.2 0.11 0.37 0.3 0.22 0.03
0.06 0.12 0.07 0.06 0.34 0.15 0.1 0.11 0.22 0.22 0.66 1.0 0.03 0.63 0.21 0.04 0.1 0.68 0.34 0.09 0.26 0.21 0.22 0.19 0.05 0.02 0.03 0.12 0.3 0.05 0.03 0.03 0.92 0.16 0.09
0.12 0.11 0.09 0.11 0.29 0.2 0.16 0.18 0.24 0.19 0.52 0.62 0.06 0.45 0.4 0.12 0.48 0.84 0.29 0.12 0.64 0.37 0.99 1.0 0.2 0.19 0.09 0.12 0.37 0.25 0.18 0.24 0.53 0.03 0.08
0.02 0.02 0.03 0.02 0.17 0.06 0.04 0.01 0.06 0.06 0.33 0.49 0.01 0.23 0.22 0.05 0.08 1.0 0.16 0.03 0.08 0.05 0.06 0.12 0.02 0.01 0.0 0.01 0.24 0.01 0.0 0.01 0.52 0.08 0.03
0.02 0.1 0.04 0.15 0.23 0.11 0.22 0.13 0.12 0.17 0.18 0.25 0.14 0.39 0.45 0.21 0.05 0.78 0.4 0.09 0.38 0.16 1.0 0.21 0.12 0.02 0.01 0.03 0.27 0.03 0.01 0.05 0.23 0.06 0.06
0.03 0.06 0.05 0.07 0.13 0.13 0.19 0.29 0.17 0.2 0.31 0.41 0.03 0.54 0.24 0.07 0.07 0.87 0.27 0.14 0.61 0.44 1.0 0.65 0.33 0.03 0.03 0.03 0.26 0.1 0.06 0.15 0.4 0.0 0.02
0.02 0.02 0.03 0.03 0.12 0.08 0.07 0.01 0.1 0.11 0.61 1.0 0.0 0.3 0.11 0.03 0.16 0.35 0.08 0.01 0.04 0.05 0.08 0.26 0.01 0.0 0.0 0.0 0.17 0.01 0.0 0.02 0.89 0.03 0.02
0.14 0.29 0.14 0.29 0.41 0.21 0.32 0.15 0.31 0.33 0.79 1.0 0.23 0.72 0.14 0.1 0.13 0.8 0.34 0.16 0.13 0.25 0.26 0.39 0.15 0.07 0.04 0.32 0.74 0.16 0.13 0.2 0.83 0.21 0.08
0.54 0.57 0.45 0.51 0.8 0.64 0.6 0.49 0.72 0.77 0.37 0.4 0.47 0.7 0.17 0.16 0.16 0.9 0.49 0.24 0.23 0.4 0.62 0.65 0.41 0.21 0.15 0.41 1.0 0.56 0.86 0.45 0.43 0.22 0.08
0.35 0.38 0.34 0.64 0.44 0.59 0.77 0.36 0.43 0.45 0.51 0.61 0.2 0.38 0.32 0.22 0.16 0.86 1.0 0.13 0.61 1.0 0.55 0.4 0.07 0.05 0.06 0.15 0.3 0.28 0.17 0.09 0.68 0.29 0.33
0.05 0.04 0.18 0.11 0.3 0.41 0.5 1.0 0.31 0.48 0.31 0.39 0.01 0.34 0.21 0.09 0.08 0.47 0.19 0.14 0.73 0.8 0.24 0.67 0.04 0.1 0.01 0.03 0.24 0.31 0.04 0.31 0.34 0.16 0.13
0.07 0.2 0.07 0.25 0.36 0.14 0.41 0.08 0.17 0.19 0.22 0.27 0.11 0.58 0.31 0.25 0.16 1.0 0.57 0.18 0.41 0.19 0.45 0.35 0.21 0.07 0.01 0.06 0.42 0.14 0.05 0.34 0.26 0.47 0.09
0.13 0.23 0.19 0.32 0.19 0.25 0.43 0.1 0.32 0.38 0.5 0.6 0.02 0.42 0.37 0.05 0.96 1.0 0.22 0.04 0.18 0.2 0.25 0.34 0.04 0.05 0.0 0.06 0.21 0.02 0.02 0.03 0.67 0.0 0.02
0.03 0.02 0.02 0.02 0.18 0.08 0.12 0.21 0.12 0.13 0.4 0.58 0.0 0.92 0.12 0.01 0.01 1.0 0.24 0.06 0.34 0.24 0.13 0.53 0.07 0.07 0.01 0.03 0.23 0.05 0.02 0.07 0.48 0.0 0.03
0.02 0.04 0.01 0.04 0.19 0.06 0.11 0.06 0.08 0.12 0.52 0.54 0.19 1.0 0.19 0.04 0.06 0.54 0.19 0.1 0.48 0.3 0.6 0.32 0.23 0.09 0.05 0.04 0.17 0.05 0.07 0.04 0.53 0.03 0.11
0.05 0.12 0.08 0.11 0.41 0.19 0.14 0.27 0.22 0.25 0.81 0.92 0.0 1.0 0.27 0.06 0.1 0.78 0.23 0.18 0.46 0.45 0.3 0.87 0.21 0.1 0.09 0.07 0.61 0.17 0.11 0.04 0.8 0.01 0.04
0.04 0.05 0.02 0.05 0.27 0.12 0.06 0.18 0.07 0.11 0.05 0.15 0.05 0.07 0.27 0.06 0.15 1.0 0.2 0.15 0.46 0.1 0.4 0.09 0.05 0.12 0.2 0.01 0.07 0.03 0.02 0.03 0.14 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.02 0.12 0.03 0.01 0.0 0.03 0.08 0.56 0.82 0.02 0.83 0.12 0.02 0.06 1.0 0.15 0.03 0.18 0.04 0.16 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.01 0.0 0.04 0.64 0.0 0.0
0.0 0.01 0.0 0.01 0.11 0.02 0.03 0.0 0.04 0.05 0.13 0.23 0.08 0.41 0.15 0.03 0.03 1.0 0.26 0.04 0.12 0.06 0.23 0.08 0.02 0.0 0.0 0.0 0.11 0.01 0.0 0.02 0.17 0.0 0.0
0.01 0.02 0.02 0.03 0.1 0.09 0.1 0.02 0.15 0.12 0.48 0.72 0.0 0.6 0.43 0.05 0.25 1.0 0.24 0.02 0.51 0.34 0.35 0.2 0.02 0.12 0.17 0.01 0.12 0.02 0.01 0.03 0.55 0.0 0.0
0.06 0.11 0.08 0.07 0.21 0.15 0.18 0.18 0.13 0.18 0.76 1.0 0.99 0.92 0.2 0.09 0.17 0.85 0.28 0.2 0.68 0.49 0.46 0.46 0.09 0.05 0.06 0.08 0.2 0.11 0.1 0.15 0.86 0.18 0.31
0.02 0.04 0.02 0.06 0.25 0.1 0.12 0.07 0.18 0.16 0.65 0.79 0.0 1.0 0.09 0.04 0.06 0.47 0.1 0.1 0.52 0.3 0.79 0.63 0.06 0.13 0.11 0.05 0.31 0.05 0.1 0.05 0.78 0.0 0.02
0.03 0.05 0.07 0.08 0.21 0.15 0.2 0.11 0.2 0.24 0.76 0.94 0.02 0.82 0.33 0.04 0.52 1.0 0.19 0.05 0.41 0.32 0.47 0.55 0.04 0.03 0.03 0.02 0.29 0.04 0.05 0.03 0.72 0.0 0.0
0.0 0.01 0.01 0.01 0.03 0.01 0.03 0.01 0.05 0.05 0.24 0.34 0.01 0.08 0.15 0.04 0.12 1.0 0.11 0.06 0.09 0.08 0.08 0.04 0.03 0.0 0.0 0.01 0.18 0.01 0.01 0.02 0.24 0.0 0.0
0.01 0.05 0.01 0.02 0.12 0.04 0.05 0.02 0.17 0.06 0.34 0.58 0.02 0.3 0.2 0.06 0.17 1.0 0.26 0.04 0.19 0.08 0.27 0.15 0.01 0.0 0.0 0.02 0.14 0.01 0.0 0.02 0.54 0.15 0.45
0.02 0.16 0.11 0.29 0.53 0.49 0.39 0.42 0.36 0.46 0.47 0.59 0.97 0.94 0.42 0.04 0.33 1.0 0.34 0.17 0.61 0.47 0.78 0.48 0.11 0.12 0.05 0.39 0.54 0.11 0.16 0.13 0.42 0.13 0.43
0.01 0.04 0.02 0.01 0.23 0.1 0.08 0.02 0.18 0.14 0.56 0.66 1.0 0.96 0.24 0.02 0.18 0.67 0.13 0.01 0.15 0.05 0.06 0.0 0.0 0.15 0.03 0.01 0.34 0.0 0.0 0.0 0.58 0.0 0.02
0.01 0.0 0.01 0.02 0.14 0.06 0.07 0.0 0.09 0.07 0.57 1.0 0.0 0.74 0.28 0.16 0.06 0.9 0.16 0.11 0.31 0.09 0.4 0.18 0.06 0.04 0.01 0.0 0.32 0.01 0.0 0.02 0.71 0.0 0.0
0.09 0.18 0.21 0.29 0.14 0.13 0.21 0.33 0.14 0.18 0.3 0.42 0.02 0.4 0.16 0.37 0.03 0.46 0.34 0.06 0.41 0.27 1.0 0.1 0.02 0.01 0.02 0.02 0.18 0.03 0.02 0.03 0.39 0.01 0.0
0.08 0.18 0.25 0.57 0.34 0.42 1.0 0.9 0.54 0.6 0.3 0.39 0.0 0.59 0.2 0.27 0.12 0.65 0.28 0.2 0.63 0.33 0.62 0.58 0.06 0.05 0.03 0.09 0.46 0.09 0.07 0.09 0.36 0.02 0.14
0.06 0.11 0.07 0.06 0.57 0.2 0.17 0.08 0.24 0.26 0.11 0.14 0.01 0.02 0.6 0.09 1.0 0.93 0.37 0.3 0.45 0.2 0.3 0.46 0.13 0.18 0.04 0.03 1.0 0.03 0.01 0.06 0.11 0.0 0.0
0.01 0.03 0.03 0.04 0.2 0.08 0.12 0.1 0.12 0.14 0.46 0.62 0.01 1.0 0.13 0.05 0.08 0.4 0.11 0.09 0.4 0.23 0.47 0.47 0.08 0.04 0.06 0.03 0.3 0.06 0.04 0.05 0.49 0.02 0.11
0.03 0.14 0.13 0.1 0.09 0.14 0.08 0.47 0.07 0.04 0.23 0.23 0.0 0.13 0.19 0.4 0.13 1.0 0.27 0.06 0.66 0.13 0.73 0.08 0.03 0.0 0.0 0.0 0.15 0.03 0.07 0.07 0.19 0.01 0.01
0.02 0.04 0.04 0.03 0.3 0.12 0.12 0.03 0.15 0.15 0.98 1.0 0.35 0.43 0.15 0.05 0.02 0.53 0.18 0.07 0.33 0.54 0.26 0.15 0.02 0.12 0.07 0.02 0.21 0.03 0.01 0.05 0.92 0.14 0.73
0.02 0.04 0.02 0.04 0.19 0.08 0.05 0.02 0.05 0.06 0.11 0.13 0.0 0.08 0.31 0.04 0.55 1.0 0.21 0.03 0.12 0.11 0.07 0.03 0.0 0.04 0.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0
0.02 0.02 0.02 0.01 0.14 0.05 0.06 0.03 0.1 0.09 0.37 0.57 0.0 0.1 0.21 0.03 0.1 1.0 0.24 0.08 0.2 0.11 0.44 0.24 0.02 0.02 0.03 0.0 0.32 0.04 0.01 0.04 0.59 0.0 0.0
0.27 0.38 0.29 0.36 0.4 0.51 0.26 0.23 0.54 0.5 0.17 0.27 0.08 0.12 0.34 0.19 0.41 1.0 0.25 0.08 0.6 0.6 0.67 0.15 0.04 0.02 0.02 0.74 0.11 0.07 0.08 0.07 0.27 0.02 0.06
0.01 0.03 0.01 0.02 0.1 0.02 0.04 0.01 0.04 0.03 0.7 1.0 0.01 0.92 0.15 0.04 0.08 0.53 0.09 0.07 0.13 0.16 0.17 0.57 0.06 0.0 0.0 0.01 0.2 0.02 0.0 0.04 0.76 0.03 0.17
0.03 0.02 0.02 0.02 0.26 0.02 0.02 0.08 0.03 0.05 0.64 0.96 0.16 1.0 0.24 0.07 0.08 0.65 0.12 0.07 0.39 0.22 0.2 0.34 0.04 0.02 0.03 0.01 0.25 0.1 0.19 0.07 0.69 0.02 0.04
0.01 0.04 0.05 0.07 0.05 0.08 0.14 0.01 0.13 0.13 0.78 0.98 0.0 0.52 0.15 0.01 0.19 0.41 0.08 0.03 0.1 0.15 0.08 0.44 0.02 0.02 0.02 0.01 0.19 0.02 0.01 0.03 0.85 0.06 1.0
0.06 0.5 0.19 0.26 0.4 0.19 0.98 0.7 0.33 0.43 1.0 0.93 0.62 0.98 0.21 0.08 0.18 0.64 0.47 0.22 0.64 0.9 0.67 0.67 0.13 0.09 0.33 0.07 0.19 0.19 0.18 0.39 1.0 0.06 0.19
0.02 0.06 0.06 0.08 0.23 0.08 0.15 0.31 0.18 0.17 0.79 1.0 0.03 0.83 0.16 0.04 0.46 0.53 0.18 0.04 0.47 0.35 0.27 0.5 0.04 0.01 0.01 0.0 0.25 0.09 0.08 0.13 0.89 0.07 0.27
0.08 0.09 0.11 0.09 0.38 0.09 0.21 0.42 0.08 0.07 0.52 0.71 0.25 1.0 0.33 0.2 0.49 0.76 0.4 0.15 0.76 0.72 0.19 0.64 0.43 0.26 0.77 0.04 0.42 0.27 0.37 0.16 0.51 0.22 0.87
0.03 0.07 0.1 0.1 0.12 0.15 0.2 0.27 0.14 0.2 0.31 0.44 0.31 1.0 0.21 0.12 0.25 0.44 0.15 0.27 0.24 0.12 0.26 0.35 0.03 0.04 0.01 0.02 0.39 0.03 0.01 0.05 0.38 0.04 0.14
0.08 0.12 0.13 0.04 0.72 0.13 0.09 0.42 0.02 0.1 0.52 0.42 0.02 0.86 0.47 0.09 0.38 0.59 0.19 0.15 0.6 0.34 1.0 0.66 0.09 0.9 0.61 0.06 0.34 0.27 0.47 0.05 0.51 0.18 0.25
0.02 0.03 0.02 0.02 0.09 0.06 0.09 0.02 0.08 0.08 0.87 1.0 0.0 0.7 0.23 0.03 0.14 0.64 0.12 0.04 0.39 0.25 0.45 0.27 0.02 0.0 0.01 0.06 0.13 0.02 0.02 0.02 0.91 0.16 0.19
0.02 0.03 0.04 0.02 0.19 0.13 0.15 0.06 0.17 0.15 0.3 0.44 0.01 0.47 0.34 0.06 0.16 1.0 0.25 0.05 0.3 0.23 0.37 0.31 0.03 0.06 0.05 0.02 0.18 0.02 0.0 0.03 0.38 0.01 0.03
0.07 0.15 0.05 0.08 0.1 0.25 0.35 0.04 0.39 0.3 0.06 0.05 0.0 0.02 0.29 0.05 0.16 1.0 0.28 0.07 0.12 0.12 0.07 0.22 0.02 0.07 0.19 0.18 0.2 0.03 0.03 0.04 0.06 0.0 0.0
0.05 0.07 0.11 0.04 0.04 0.04 0.19 0.17 0.12 0.11 0.41 0.51 0.17 0.78 0.12 0.05 0.07 0.61 0.18 0.08 1.0 0.34 0.92 0.46 0.1 0.01 0.0 0.0 0.14 0.05 0.02 0.06 0.37 0.11 0.22
0.08 0.07 0.1 0.05 0.27 0.17 0.2 0.15 0.27 0.33 0.54 0.74 0.04 0.64 0.38 0.08 0.11 1.0 0.26 0.09 0.7 0.49 0.66 0.37 0.05 0.05 0.06 0.19 0.24 0.04 0.01 0.03 0.68 0.0 0.01
0.07 0.16 0.09 0.16 0.17 0.12 0.12 0.13 0.1 0.09 0.22 0.29 0.02 0.26 0.39 0.22 0.15 0.64 0.49 0.06 1.0 0.23 0.97 0.22 0.08 0.03 0.01 0.06 0.11 0.08 0.14 0.05 0.25 0.0 0.03
0.02 0.02 0.02 0.03 0.18 0.06 0.05 0.08 0.09 0.17 0.48 0.49 0.28 0.5 0.15 0.08 0.06 0.46 0.33 0.13 0.8 0.52 1.0 0.38 0.34 0.11 0.03 0.01 0.36 0.1 0.13 0.04 0.5 0.54 0.18
0.26 0.39 0.36 0.43 0.12 0.29 0.36 0.22 0.4 0.45 0.84 1.0 0.0 0.46 0.19 0.08 0.08 0.73 0.27 0.06 0.06 0.08 0.17 0.08 0.03 0.0 0.0 0.18 0.2 0.01 0.01 0.04 0.97 0.01 0.05

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)