Heatmap: Cluster_62 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
4h after treatment
4h after treatment,No nitrate
8h after treatment
8h after treatment,No nitrate
20C
20h after treatment
20h after treatment,No nitrate
20h after treatment,Nocodazole added
36h after treatment
36h after treatment,No phosphate
Blue light,10min after light change
Blue light,60min after light change
Bohlin
CCAP1055/1,20C
CCAP1055/1,20C,High CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Low CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Normal CO2,OligoDT primed
CCMP2561
CCMP2561 Nitrase Reductase Knockout
CCMP632
CCMP632,24h
CCMP632,48h
CCMP632,72h
CCMP632,High light acclimated WT
CCMP632,Low light acclimated WT
NEPCC640,8h,1000ppmv CO2
NEPCC640,8h,390 ppmv CO2
No light,8h after treatment
Pt-1
Pt-1 8.6
Pt-1 8.6,With nitrogen
Pt-1 8.6,Without nitrogen
Red light,0min before light change
UTEX 646,Blue light
UTEX 646,No light
0.48 0.58 0.2 0.58 0.22 0.47 0.79 0.34 0.39 0.54 0.14 0.23 0.15 0.22 0.05 0.12 0.0 0.95 0.68 0.05 0.03 0.11 0.05 0.05 0.09 0.09 0.1 0.27 0.56 0.7 0.16 1.0 0.21 0.83 0.09
0.66 0.31 0.39 0.28 0.59 0.72 0.38 0.35 0.55 0.5 0.62 0.66 0.61 0.62 0.35 0.14 0.21 0.49 0.22 0.42 0.21 0.25 0.3 0.49 0.47 0.16 0.28 0.25 0.52 0.7 0.47 0.94 0.76 1.0 0.24
0.66 0.24 0.24 0.2 0.22 0.74 0.27 0.44 0.32 0.41 0.36 0.46 0.2 0.33 0.06 0.02 0.02 0.41 0.22 0.01 0.39 0.45 0.25 0.08 0.02 0.22 0.34 0.04 0.17 0.6 0.18 1.0 0.42 0.82 0.07
0.46 0.28 0.43 0.25 0.39 0.6 0.26 0.45 0.52 0.36 0.22 0.19 0.28 0.12 0.35 0.21 0.21 0.52 0.35 0.4 0.19 0.25 0.19 0.51 0.23 0.22 0.15 0.06 0.29 0.76 0.55 1.0 0.28 0.9 0.09
0.42 0.61 0.3 0.65 0.19 0.48 1.0 0.65 0.42 0.45 0.19 0.19 0.4 0.13 0.1 0.07 0.05 0.57 0.58 0.17 0.13 0.26 0.12 0.22 0.06 0.12 0.09 0.11 0.15 0.4 0.19 0.67 0.2 0.63 0.47
0.73 0.45 0.56 0.37 0.37 0.99 0.4 0.69 0.95 0.97 0.53 0.67 0.26 0.22 0.52 0.93 0.22 0.58 0.53 0.3 0.51 0.66 0.36 0.48 0.06 0.21 0.25 0.32 0.57 0.41 0.3 0.7 0.93 1.0 0.67
0.24 0.39 0.15 0.28 0.24 0.32 0.48 0.39 0.42 0.48 0.4 0.73 0.93 0.52 0.11 0.09 0.08 0.64 0.52 0.16 0.4 0.43 0.23 0.2 0.05 0.06 0.12 0.36 0.45 0.57 0.29 0.81 0.6 1.0 0.47
0.61 0.87 0.6 0.7 0.13 0.74 0.93 1.0 0.31 0.72 0.2 0.16 0.21 0.28 0.09 0.04 0.13 0.59 0.38 0.13 0.14 0.27 0.08 0.12 0.03 0.07 0.05 0.01 0.05 0.4 0.38 0.54 0.26 0.7 0.0
0.09 0.22 0.05 0.14 0.09 0.12 0.13 0.09 0.1 0.15 0.09 0.26 0.87 0.12 0.05 0.07 0.05 0.35 0.16 0.05 0.09 0.23 0.05 0.01 0.01 0.02 0.03 0.01 0.29 0.36 0.07 0.64 0.13 1.0 0.01
0.57 0.36 0.59 0.4 0.51 0.69 0.36 0.46 0.61 0.48 0.23 0.22 0.19 0.32 0.36 0.32 0.13 0.68 0.48 0.31 0.06 0.17 0.06 0.43 0.22 0.28 0.27 0.15 0.24 0.44 0.39 0.49 0.24 1.0 0.12
0.32 0.2 0.19 0.17 0.28 0.41 0.19 0.33 0.47 0.37 0.2 0.24 0.62 0.17 0.14 0.15 0.05 0.46 0.39 0.25 0.34 0.21 0.23 0.31 0.31 0.23 0.4 0.15 0.33 0.42 0.25 0.52 0.21 1.0 0.84
1.0 0.47 0.75 0.41 0.26 0.97 0.45 0.96 0.43 0.53 0.29 0.28 0.12 0.13 0.23 0.12 0.13 0.75 0.36 0.33 0.13 0.25 0.14 0.15 0.12 0.37 0.32 0.03 0.49 0.72 0.55 1.0 0.31 0.72 0.01
0.17 0.38 0.23 0.61 0.24 0.29 0.83 0.2 0.44 0.54 0.45 0.53 0.21 0.51 0.11 0.22 0.03 0.91 1.0 0.35 0.33 0.71 0.23 0.14 0.02 0.03 0.01 0.08 0.05 0.2 0.06 0.38 0.61 0.49 0.29
0.21 0.46 0.25 0.75 0.21 0.38 1.0 0.25 0.55 0.54 0.16 0.17 0.33 0.17 0.04 0.11 0.02 0.57 0.51 0.2 0.08 0.21 0.06 0.12 0.01 0.04 0.02 0.06 0.07 0.26 0.11 0.43 0.24 0.33 0.15
0.24 0.79 0.16 0.57 0.42 0.72 1.0 0.24 0.61 0.5 0.16 0.14 0.47 0.39 0.45 0.38 0.19 0.6 0.71 0.43 0.34 0.28 0.24 0.11 0.1 0.31 0.24 0.03 0.19 0.38 0.39 0.43 0.2 0.11 0.01
0.34 0.28 0.41 0.52 0.67 0.94 0.62 0.39 1.0 0.68 0.29 0.27 0.68 0.11 0.23 0.22 0.06 0.67 0.99 0.56 0.29 0.3 0.29 0.37 0.26 0.47 0.26 0.1 0.21 0.3 0.35 0.3 0.39 0.29 0.83
0.37 0.55 0.34 0.64 0.29 0.42 1.0 0.25 0.58 0.65 0.45 0.51 0.43 0.65 0.08 0.17 0.01 0.73 0.63 0.1 0.24 0.47 0.16 0.13 0.02 0.02 0.03 0.56 0.11 0.13 0.1 0.18 0.67 0.46 0.23
0.25 0.2 0.17 0.2 0.31 0.36 0.3 0.19 0.38 0.34 0.22 0.24 0.47 0.22 0.14 0.06 0.09 0.39 0.28 0.18 0.15 0.14 0.16 0.22 0.14 0.11 0.22 0.07 0.27 0.45 0.22 0.65 0.26 1.0 0.27
0.51 0.38 0.35 0.39 0.74 0.83 0.81 0.21 0.86 0.73 0.14 0.11 0.19 0.35 0.41 0.14 0.14 0.58 1.0 0.4 0.83 0.32 0.74 0.72 0.36 0.18 0.13 0.04 0.06 0.51 0.37 0.82 0.14 0.22 0.05
0.34 0.27 0.36 0.42 0.4 0.5 0.44 0.54 0.49 0.54 0.21 0.23 0.28 0.47 0.25 0.17 0.07 0.95 0.84 0.42 0.73 0.58 0.5 0.52 0.35 0.34 0.29 0.21 0.36 0.72 0.56 1.0 0.23 0.4 0.36
0.26 0.28 0.18 0.3 0.24 0.34 0.4 0.28 0.35 0.3 0.2 0.28 0.36 0.2 0.11 0.1 0.07 0.32 0.36 0.15 0.11 0.19 0.12 0.23 0.04 0.07 0.14 0.14 0.22 0.5 0.25 0.62 0.27 1.0 0.72
0.73 0.58 0.81 0.59 0.47 0.71 0.5 0.89 0.87 0.9 0.8 0.63 0.27 0.5 0.53 0.49 0.3 0.76 0.67 0.47 0.89 1.0 0.67 0.56 0.13 0.39 0.23 0.13 0.3 0.67 0.49 0.74 0.91 0.42 0.16
0.5 0.25 0.32 0.11 0.27 0.41 0.08 0.59 0.28 0.28 0.23 0.38 0.21 0.2 0.83 0.32 0.29 0.81 0.5 0.44 0.04 0.1 0.03 0.26 0.11 0.11 0.17 0.47 0.4 0.39 0.3 0.43 0.39 1.0 0.64
0.39 0.45 0.44 0.64 0.24 0.68 0.96 0.5 0.65 0.58 0.11 0.3 0.57 0.31 0.11 0.08 0.03 0.49 0.29 0.2 0.25 0.16 0.14 0.34 0.1 0.19 0.87 0.07 0.5 0.89 0.69 1.0 0.16 0.65 0.05
0.64 0.61 0.52 0.66 0.46 0.82 0.76 0.53 0.81 0.79 0.38 0.35 0.41 0.38 0.33 0.26 0.26 0.79 0.91 0.29 0.92 1.0 0.47 0.4 0.09 0.26 0.13 0.49 0.21 0.42 0.36 0.46 0.45 0.58 0.69
0.26 0.37 0.35 0.7 0.49 0.42 0.81 0.31 0.76 0.64 0.51 0.41 1.0 0.09 0.13 0.14 0.04 0.77 0.67 0.36 0.42 0.73 0.55 0.43 0.44 0.21 0.08 0.16 0.26 0.28 0.28 0.3 0.45 0.14 0.11
0.86 0.41 0.47 0.26 0.14 0.53 0.21 0.68 0.17 0.3 0.06 0.11 0.41 0.11 0.23 0.08 0.09 0.62 0.28 0.09 0.01 0.04 0.02 0.12 0.05 0.24 0.34 0.09 0.26 0.67 0.23 1.0 0.09 0.69 0.03
0.15 0.19 0.14 0.2 0.19 0.25 0.23 0.28 0.36 0.3 0.08 0.15 0.43 0.21 0.11 0.07 0.04 0.49 0.37 0.36 0.18 0.21 0.15 0.26 0.14 0.08 0.08 0.02 0.27 0.35 0.16 0.52 0.12 1.0 0.44
0.31 0.33 0.23 0.39 0.21 0.33 0.46 0.36 0.35 0.38 0.15 0.25 0.43 0.24 0.18 0.12 0.23 0.56 0.6 0.1 0.0 0.03 0.0 0.15 0.03 0.09 0.12 0.34 0.61 0.27 0.14 0.38 0.24 1.0 0.61
0.41 0.57 0.24 0.44 0.23 0.58 0.59 0.35 0.53 0.61 0.34 0.52 0.31 0.45 0.14 0.14 0.07 0.59 0.5 0.1 0.31 0.47 0.28 0.13 0.02 0.03 0.03 0.14 0.21 0.4 0.23 0.6 0.46 1.0 0.12
0.81 0.36 0.5 0.15 0.57 1.0 0.14 0.39 0.78 0.54 0.17 0.1 0.16 0.04 0.09 0.02 0.01 0.35 0.2 0.07 0.16 0.2 0.07 0.14 0.02 0.06 0.07 0.1 0.28 0.29 0.29 0.42 0.23 0.52 0.01
0.12 0.25 0.05 0.23 0.14 0.28 0.46 0.16 0.34 0.3 0.13 0.19 0.19 0.13 0.02 0.02 0.0 0.32 0.27 0.05 0.04 0.09 0.05 0.02 0.01 0.01 0.03 0.04 0.17 0.29 0.11 0.44 0.18 1.0 0.06
0.32 0.47 0.33 0.51 0.44 0.54 0.57 0.38 0.73 0.65 0.34 0.38 0.3 0.29 0.24 0.24 0.25 0.45 0.41 0.37 0.12 0.27 0.14 0.42 0.22 0.07 0.05 0.36 0.34 0.4 0.21 0.57 0.48 1.0 0.55
0.22 0.21 0.17 0.18 0.26 0.25 0.28 0.24 0.31 0.27 0.22 0.31 0.17 0.18 0.12 0.06 0.06 0.27 0.33 0.08 0.04 0.11 0.04 0.12 0.05 0.09 0.11 0.12 0.21 0.3 0.14 0.55 0.33 1.0 0.47
0.51 0.79 0.31 0.81 0.29 0.69 1.0 0.48 0.89 0.96 0.28 0.33 0.29 0.29 0.04 0.11 0.01 0.94 0.59 0.11 0.19 0.38 0.12 0.09 0.02 0.07 0.07 0.3 0.33 0.4 0.12 0.71 0.38 0.59 0.08
0.34 0.33 0.4 0.43 0.34 0.69 0.57 0.42 0.72 0.82 0.3 0.23 0.41 0.5 0.11 0.25 0.06 0.65 0.39 0.38 0.12 0.23 0.15 0.5 0.11 0.1 0.1 0.03 0.31 0.62 0.29 1.0 0.36 0.44 0.24
0.08 0.12 0.18 0.24 0.33 0.32 0.23 0.31 0.58 0.42 0.12 0.08 0.26 0.11 0.18 0.17 0.08 0.79 0.45 0.33 0.4 0.31 0.55 0.11 0.05 0.04 0.0 0.15 0.05 0.08 0.07 0.05 0.11 0.45 1.0
0.78 0.85 0.62 0.87 0.46 0.87 0.93 0.43 0.8 0.9 0.55 0.79 0.2 0.9 0.16 0.25 0.02 0.7 0.62 0.11 0.45 0.73 0.21 0.12 0.02 0.42 0.85 1.0 0.15 0.23 0.11 0.43 0.82 0.33 0.38
0.23 0.25 0.15 0.19 0.22 0.31 0.25 0.16 0.29 0.31 0.25 0.32 0.42 0.21 0.08 0.05 0.09 0.52 0.52 0.07 0.17 0.28 0.17 0.09 0.02 0.03 0.03 0.04 0.22 0.38 0.11 0.64 0.29 1.0 0.01
0.3 0.36 0.29 0.48 0.3 0.38 0.51 0.2 0.66 0.57 0.44 0.37 0.41 0.22 0.1 0.12 0.04 0.64 0.59 0.15 0.42 0.9 0.25 0.07 0.01 0.05 0.07 0.2 0.08 0.08 0.06 0.06 0.43 1.0 0.37
0.22 0.12 0.1 0.06 0.14 0.28 0.09 0.13 0.17 0.17 0.13 0.2 0.22 0.08 0.06 0.01 0.04 0.38 0.27 0.06 0.05 0.08 0.03 0.09 0.02 0.14 0.21 0.05 0.18 0.39 0.12 0.64 0.18 1.0 0.39
0.22 0.49 0.15 0.47 0.27 0.32 0.8 0.24 0.37 0.42 0.2 0.33 0.49 0.17 0.06 0.08 0.03 0.48 0.39 0.15 0.14 0.15 0.15 0.06 0.02 0.04 0.04 0.14 0.31 0.32 0.1 0.62 0.28 1.0 0.1
0.18 0.1 0.18 0.08 0.77 0.4 0.19 0.14 0.38 0.36 0.19 0.16 0.21 0.19 0.46 0.16 0.55 0.42 0.38 0.33 0.66 0.33 1.0 0.41 0.61 0.39 0.16 0.13 0.19 0.22 0.32 0.21 0.19 0.23 0.76
0.67 0.43 0.56 0.51 0.12 0.76 0.58 0.47 0.88 1.0 0.19 0.2 0.95 0.16 0.02 0.03 0.0 0.73 0.2 0.43 0.12 0.13 0.15 0.08 0.02 0.06 0.09 0.02 0.3 0.53 0.13 0.84 0.24 0.83 0.04
0.19 0.43 0.2 0.59 0.17 0.61 0.96 0.44 0.83 0.78 0.22 0.28 0.76 0.62 0.04 0.05 0.03 0.63 0.46 0.2 0.06 0.13 0.08 0.07 0.01 0.06 0.08 0.03 0.3 0.49 0.14 0.7 0.33 1.0 0.03
0.82 0.2 0.43 0.1 0.3 0.66 0.08 0.55 0.36 0.32 0.32 0.4 0.19 0.11 0.17 0.02 0.2 0.28 0.23 0.16 0.17 0.25 0.12 0.18 0.02 0.08 0.11 0.09 0.3 0.67 0.2 1.0 0.4 0.72 0.38
0.85 0.51 0.44 0.32 0.26 0.44 0.37 0.32 0.3 0.33 0.45 0.81 0.14 0.22 0.14 0.05 0.07 0.53 0.35 0.22 0.14 0.4 0.1 0.13 0.08 0.07 0.09 0.06 0.23 0.63 0.35 1.0 0.85 0.88 0.1
0.41 0.26 0.22 0.16 0.23 0.33 0.09 0.17 0.21 0.19 0.18 0.18 0.11 0.07 0.19 0.05 0.27 0.23 0.23 0.09 0.02 0.06 0.01 0.16 0.04 0.22 0.26 0.17 0.15 0.61 0.25 1.0 0.27 0.43 0.08
0.29 0.28 0.16 0.25 0.18 0.24 0.36 0.22 0.26 0.23 0.28 0.58 0.36 0.23 0.06 0.02 0.02 0.44 0.22 0.11 0.02 0.11 0.02 0.06 0.01 0.03 0.04 0.11 0.25 0.45 0.1 0.76 0.49 1.0 0.06
0.54 0.2 0.33 0.13 0.16 0.58 0.19 0.44 0.36 0.3 0.07 0.04 0.38 0.19 0.3 0.05 0.22 0.33 0.26 0.09 0.16 0.14 0.07 0.72 0.13 0.42 0.5 0.04 0.32 0.73 0.45 1.0 0.09 0.86 0.26
0.07 0.21 0.14 0.37 0.18 0.26 0.6 0.39 0.24 0.31 0.09 0.07 1.0 0.4 0.07 0.04 0.06 0.54 0.57 0.34 0.06 0.13 0.06 0.45 0.06 0.08 0.04 0.01 0.06 0.57 0.33 0.65 0.1 0.1 0.16
0.47 0.48 0.43 0.49 0.37 0.61 0.51 0.49 0.54 0.54 0.18 0.28 0.16 0.1 0.28 0.19 0.16 0.36 0.41 0.11 0.07 0.2 0.04 0.16 0.08 0.26 0.22 0.16 0.17 0.4 0.26 0.55 0.3 1.0 0.23
0.51 0.97 0.39 0.69 0.29 0.79 0.77 0.46 0.62 0.77 0.39 0.42 0.34 0.16 0.37 0.45 0.1 0.71 0.56 0.37 0.38 0.49 0.4 0.17 0.13 0.16 0.08 0.14 0.14 0.3 0.41 0.19 0.45 1.0 0.07
0.26 0.19 0.33 0.27 0.3 0.52 0.42 0.47 0.67 0.57 0.27 0.21 0.83 0.2 0.56 0.36 0.33 0.89 0.65 1.0 0.25 0.23 0.22 0.87 0.19 0.56 0.15 0.03 0.35 0.49 0.68 0.4 0.32 0.2 0.14
0.37 0.32 0.46 0.48 0.26 0.45 0.48 0.28 0.63 0.53 0.3 0.3 0.39 0.14 0.34 0.22 0.33 0.65 0.66 0.33 0.15 0.26 0.17 0.48 0.1 0.19 0.16 0.11 0.14 0.39 0.41 0.34 0.39 1.0 0.18
0.24 0.43 0.35 0.71 0.3 0.51 0.91 0.43 0.82 0.75 0.34 0.37 1.0 0.42 0.13 0.35 0.03 0.97 0.78 0.76 0.42 0.38 0.36 0.35 0.23 0.16 0.1 0.33 0.7 0.37 0.24 0.54 0.36 0.15 0.34

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)