Heatmap: Cluster_84 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4h after treatment
4h after treatment,No nitrate
8h after treatment
8h after treatment,No nitrate
20C
20h after treatment
20h after treatment,No nitrate
20h after treatment,Nocodazole added
36h after treatment
36h after treatment,No phosphate
Blue light,10min after light change
Blue light,60min after light change
Bohlin
CCAP1055/1,20C
CCAP1055/1,20C,High CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Low CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Normal CO2,OligoDT primed
CCMP2561
CCMP2561 Nitrase Reductase Knockout
CCMP632
CCMP632,24h
CCMP632,48h
CCMP632,72h
CCMP632,High light acclimated WT
CCMP632,Low light acclimated WT
NEPCC640,8h,1000ppmv CO2
NEPCC640,8h,390 ppmv CO2
No light,8h after treatment
Pt-1
Pt-1 8.6
Pt-1 8.6,With nitrogen
Pt-1 8.6,Without nitrogen
Red light,0min before light change
UTEX 646,Blue light
UTEX 646,No light
-0.13 0.07 -0.22 0.12 -0.2 0.26 0.28 -0.39 0.29 0.26 0.27 0.46 -0.05 0.17 0.31 0.04 -0.68 0.9 0.81 -2.16 0.7 1.01 0.03 -0.5 -2.51 -0.82 -1.16 -0.22 -2.45 -2.11 -1.13 -1.31 0.41 0.89 0.4
0.47 0.38 0.12 0.11 -0.78 0.48 0.42 -0.03 0.41 0.53 -0.13 0.35 -1.46 -1.03 -0.13 -0.54 -2.9 0.16 0.18 -1.48 0.55 0.88 -0.06 -0.34 -2.18 -0.45 0.6 -0.14 -1.37 0.31 -0.31 0.7 0.2 0.44 -0.5
-0.1 0.05 -0.29 0.15 -0.14 0.36 0.06 0.18 0.07 0.14 -0.17 0.23 - 0.34 -0.21 -0.43 -2.07 -0.04 0.41 -0.82 1.45 1.83 1.14 -0.13 -1.54 -8.4 - -1.2 -1.86 0.08 -0.21 0.27 0.07 0.72 -1.85
0.17 0.85 -0.21 0.73 -0.38 0.64 0.89 0.13 0.63 0.81 -0.74 -0.16 -3.03 0.01 -0.28 -0.14 -1.1 0.29 0.59 -1.51 0.6 1.0 -0.08 -0.23 -2.49 -1.82 -1.95 0.69 -1.22 -0.01 -0.31 -0.13 -0.24 0.28 -1.98
0.44 0.66 0.35 0.58 -0.34 0.72 0.51 0.88 0.73 0.81 -0.32 -0.03 -0.88 -0.63 -0.17 -0.15 -0.92 0.25 0.52 -1.08 0.63 0.89 -0.04 -0.18 -1.61 -0.84 -1.26 -0.45 -1.0 -0.97 -0.76 -1.14 -0.04 0.02 -1.11
0.12 0.38 0.17 0.93 -0.58 0.35 0.52 0.5 -0.26 0.33 0.59 0.94 -2.87 0.78 -0.41 -1.43 -1.72 1.03 0.6 -3.1 0.2 1.28 -0.09 -0.97 -3.14 -0.73 -1.66 -2.12 -1.76 -0.58 -1.15 0.04 0.88 0.68 -2.74
0.77 0.44 0.49 0.2 0.29 1.06 0.04 -0.11 0.75 0.75 0.26 0.58 -2.09 -1.9 -0.19 -0.43 -2.11 0.13 0.31 -1.8 0.47 1.06 -0.15 0.06 -2.03 -1.27 -1.72 -0.59 -1.63 -0.21 -0.26 -0.08 0.44 0.52 -1.75
0.05 0.61 -0.2 0.64 -0.26 0.27 0.54 0.46 0.13 0.42 0.39 0.66 -1.69 0.25 -0.93 0.12 -2.65 0.4 0.56 -1.12 -0.05 1.28 0.22 -0.66 -1.56 -1.84 -2.66 -0.09 -1.45 -1.36 -0.91 -1.18 0.6 0.93 0.3
-0.29 0.35 -0.22 0.79 -0.62 -0.15 0.58 -0.37 -0.31 0.0 -0.15 0.22 -1.16 -0.12 0.02 -0.16 -1.42 0.86 0.76 0.26 0.41 1.23 -0.03 -0.6 -2.21 -0.8 -2.22 -1.23 -1.54 -0.31 -0.06 -0.16 0.17 0.52 0.96
0.89 1.35 0.68 1.08 -0.57 0.79 1.01 -0.36 0.84 0.88 0.55 0.46 -2.99 -3.31 -0.57 0.01 -2.63 0.67 0.77 -2.05 -0.13 0.94 -0.98 -2.44 -3.98 -2.0 -3.1 0.07 -1.96 -1.68 -1.0 -3.29 0.34 0.94 -1.97
0.16 0.66 -0.01 0.38 -0.73 0.33 0.33 0.38 0.32 0.57 0.34 0.58 -1.27 -0.68 -1.07 -0.42 -3.06 0.63 0.76 -2.03 0.28 1.01 -0.53 -0.28 -2.51 -1.69 -1.26 -0.41 -0.54 0.13 0.12 -0.03 0.27 1.31 -1.81
0.83 0.5 0.5 0.01 -0.24 0.89 0.19 -0.07 0.39 0.56 0.51 0.78 -2.02 -0.22 -0.38 -1.25 -0.28 0.05 -0.06 -2.05 -0.05 0.6 -0.34 -0.19 -2.05 -0.93 -0.84 -1.95 -1.33 0.16 -0.35 0.68 0.54 1.11 -3.54
0.57 0.17 0.15 0.08 0.14 0.46 0.31 -0.15 -0.09 0.06 0.85 0.56 -0.19 -0.79 -0.63 -0.51 -1.36 0.57 0.29 -1.61 -0.01 1.02 0.1 -1.33 -2.04 -1.91 -2.18 0.92 -1.58 -0.66 -0.93 -0.29 0.24 0.87 0.75
0.46 0.4 -0.02 0.16 0.04 0.68 0.42 -0.11 0.64 0.72 0.0 0.21 -0.55 0.42 -0.74 -0.93 -3.13 0.48 0.33 -1.59 0.74 0.72 0.24 -0.6 -2.41 -2.03 -2.43 0.13 -0.87 -0.1 -0.66 0.4 0.12 0.39 -0.0
0.37 0.72 -0.0 0.53 -0.77 0.57 0.79 0.45 0.36 0.61 -0.41 -0.23 -1.9 -1.11 -0.72 -0.53 -3.04 0.76 0.71 -0.93 0.65 0.69 -0.16 0.06 -2.46 -0.5 -1.24 -3.28 -1.53 0.13 0.06 0.08 -0.3 1.11 -0.0
0.32 0.35 -0.18 0.07 -0.66 0.29 0.04 0.35 0.24 0.37 0.64 0.94 -1.03 -0.14 -0.48 -0.71 -1.97 0.12 0.06 -1.77 0.81 1.21 0.15 -1.13 -3.6 -2.93 -3.28 0.93 -1.49 -0.04 -0.41 -0.28 0.7 0.79 -0.14
-0.04 0.87 -0.48 0.44 -0.02 0.14 0.61 -0.56 0.14 0.64 0.48 0.66 0.09 -0.02 -0.33 -0.25 -1.91 0.62 0.35 -0.45 0.01 0.66 -0.29 -0.42 -2.27 -0.5 -0.78 0.01 -0.29 -0.68 -0.39 -1.1 0.64 -0.01 -0.28
0.45 0.44 -0.05 0.17 -0.08 0.48 0.33 -0.45 0.47 0.4 -0.11 -0.27 -0.42 -0.81 -0.79 -0.48 -2.42 0.64 0.61 -1.68 0.86 0.47 0.75 -0.6 -0.01 -1.2 -0.83 0.44 -0.88 -0.88 -0.8 -0.99 -0.08 0.38 0.93
0.63 0.49 0.06 0.31 -0.35 0.65 0.47 -0.14 0.51 0.65 -0.38 0.04 -1.76 -0.18 -0.52 -0.43 -1.77 0.64 0.51 -0.89 0.16 0.79 -0.43 -0.27 -1.1 -0.92 -0.46 -0.38 -0.77 -0.53 -0.19 -0.56 0.02 -0.35 1.24
0.07 1.2 0.06 1.26 -0.02 -0.2 0.68 -0.19 -0.82 0.15 -0.35 -0.24 -1.46 0.63 -0.37 0.14 -0.38 0.46 0.5 -1.59 -0.26 0.49 -0.68 -0.8 -1.11 0.19 0.67 -1.92 -1.11 -0.14 0.26 -1.9 -0.1 0.01 0.31
-0.41 0.14 -0.32 0.27 -0.06 -0.13 0.54 -0.64 -0.15 0.3 0.18 0.23 -0.97 -0.5 -0.49 -0.55 -1.32 0.41 0.4 -0.68 1.24 1.85 1.07 -0.1 -1.45 -2.42 -2.66 0.24 -1.23 -0.31 -0.96 0.18 0.29 -0.71 -0.25
0.27 0.25 -0.1 0.12 0.18 0.67 0.31 -0.24 0.82 0.66 0.15 0.13 -1.2 -0.72 0.2 -0.39 -1.22 0.3 0.78 -0.77 0.86 0.83 0.49 -0.44 -1.76 -0.36 -0.34 -1.24 -1.49 -0.77 -0.55 -1.21 0.21 0.75 -1.4
0.86 0.71 0.5 0.36 -0.34 0.9 0.25 0.06 0.49 0.63 0.75 0.86 -1.69 -0.22 -0.56 -0.89 -1.78 0.34 0.38 -1.16 -0.81 0.5 -1.21 -0.67 -2.44 -1.28 -1.51 -0.14 -1.07 -0.7 -0.28 -0.79 0.93 0.8 -0.36
0.57 0.44 -0.01 0.31 0.06 0.5 0.31 0.19 0.11 0.45 0.25 0.78 -1.74 0.31 -0.3 -0.7 -1.79 0.54 0.04 -1.91 0.53 1.15 -0.18 -0.91 -3.3 -1.39 -1.97 0.68 -0.9 -0.69 -0.89 -0.34 0.71 1.0 -2.45
-0.54 -0.2 -0.8 -0.26 0.18 -0.17 0.01 -0.92 -0.01 -0.11 -0.1 0.05 -0.77 -0.22 -0.55 -0.24 -1.33 0.53 0.8 -1.04 1.24 1.4 1.78 -1.41 -2.08 -2.21 -0.49 0.12 -1.4 -0.55 -1.27 -0.0 -0.02 0.15 0.93
0.05 0.08 -0.27 -0.13 -0.07 0.18 0.23 -0.69 0.33 0.45 0.2 0.48 -0.18 -0.28 -0.56 -0.85 -0.93 0.29 0.7 -0.88 1.01 1.28 0.35 -0.15 -2.27 -1.53 -1.73 -0.51 -1.08 -0.26 -0.83 0.08 0.48 0.73 0.13
0.09 0.42 -0.11 0.16 -0.46 0.68 0.17 -0.14 0.33 0.58 0.79 0.85 -1.37 0.25 -0.81 -0.83 -3.32 0.45 0.68 -1.79 0.59 1.22 -0.24 -1.14 -3.96 -0.74 -1.01 -1.04 -2.43 -0.96 -1.14 -0.78 0.89 1.4 -0.22
-0.4 0.12 -0.46 0.11 -0.26 -0.09 0.32 -0.45 -0.01 0.22 -0.34 -0.13 0.16 -0.1 -0.29 -0.11 -1.3 0.71 0.44 -0.46 0.96 0.92 0.87 0.36 -0.52 -1.4 -2.19 0.02 -0.88 0.06 -0.47 0.39 -0.25 -0.16 0.26
-0.05 0.62 -0.19 0.43 -0.26 0.49 0.58 -0.23 0.37 0.79 0.2 0.37 -1.82 -0.29 -0.16 -0.15 -2.08 0.9 0.26 -0.93 0.71 0.88 0.62 -0.59 -1.77 -1.28 -2.13 -0.1 -1.2 -0.48 -0.92 0.11 0.36 -0.22 0.04
0.63 1.23 0.06 0.65 -0.12 0.91 0.52 -0.06 0.69 0.89 0.01 0.32 -1.44 -1.3 -0.49 -0.11 -2.08 0.45 0.75 -1.75 -0.06 0.66 -0.34 -1.55 -2.71 -1.67 -2.2 0.29 -1.34 -1.23 -0.82 -1.11 0.39 0.88 0.02
0.35 0.02 -0.1 -0.03 0.65 0.44 0.08 -0.39 0.65 0.37 -0.75 -0.44 -1.28 -1.05 0.18 -1.06 -1.09 0.48 0.42 -1.22 0.65 0.26 0.79 -0.09 -0.37 -1.03 -0.83 0.31 -0.85 -0.33 0.73 -0.73 -0.42 0.68 0.34
0.67 0.51 0.33 0.1 -0.57 0.64 0.41 0.18 0.66 0.82 0.34 0.37 -1.31 0.18 -0.21 -0.54 -2.39 0.51 0.33 -1.83 0.4 1.37 -0.3 -0.34 -3.73 -1.04 -0.71 -0.79 -0.98 -0.82 -0.77 -0.84 0.38 0.69 -1.29
0.24 0.23 0.18 0.12 -0.16 0.46 -0.16 0.0 0.4 0.5 -0.06 0.28 -1.49 -0.22 0.55 -0.45 -0.39 0.59 0.81 -1.09 -1.34 0.07 -1.12 -0.17 -3.23 -0.76 -0.84 -0.27 -0.6 -0.83 -1.52 -0.25 0.48 1.69 0.61
0.85 0.71 0.54 0.19 -0.33 1.12 0.22 0.27 0.56 0.83 0.06 0.6 -1.66 -0.95 -0.43 -1.4 -1.86 0.22 0.37 -2.41 0.16 1.18 -0.5 -0.53 -3.4 -2.67 -2.78 -1.9 -1.42 0.52 -0.72 1.35 0.18 0.39 -3.47
0.42 0.43 0.28 0.12 0.01 0.85 0.11 -0.47 0.66 0.75 0.37 0.72 -1.67 -0.86 -0.03 -0.81 -0.53 0.07 0.45 -1.1 0.17 1.2 -0.51 -0.93 -2.91 -1.62 -1.49 -0.25 -1.01 -0.66 -0.9 -0.71 0.67 1.02 0.04
0.57 0.43 0.1 0.39 -0.64 0.51 0.43 -0.25 0.46 0.75 -0.06 0.28 -1.71 -0.97 -1.69 -1.83 -3.19 0.02 0.18 -2.25 1.54 1.39 1.26 -0.97 -1.49 -1.53 -1.31 -0.06 -1.25 -0.31 -1.25 0.19 0.1 0.55 -0.75
0.03 0.32 0.08 0.11 -0.56 0.23 0.13 -0.16 0.15 0.4 0.48 0.58 -2.1 -0.04 -0.27 -0.32 -1.09 -0.2 0.37 -1.44 1.2 1.86 0.29 0.12 -2.81 -1.65 -1.67 -1.5 -1.32 -0.31 -0.57 -0.25 0.52 0.57 -0.79
0.21 0.35 -0.03 0.25 -0.79 0.41 0.23 -0.05 0.19 0.48 0.28 0.28 -2.34 -0.84 -0.7 -0.88 -3.31 0.11 0.02 -0.23 0.91 1.0 0.18 -0.21 -0.45 -0.15 0.02 -0.32 -0.93 0.25 0.16 0.2 0.29 0.58 -1.34
-0.19 0.23 -0.53 0.5 -0.16 0.3 1.02 -0.72 0.53 0.64 -0.7 -0.31 -1.09 -0.4 -0.5 -0.27 -3.19 0.78 0.5 -0.23 1.04 1.26 0.53 -0.44 -0.82 -1.44 -2.13 -0.18 -1.25 -0.56 -1.49 0.15 -0.41 0.56 0.4
0.35 0.79 0.1 0.61 -0.1 0.5 0.58 -0.43 0.36 0.62 0.4 0.65 -1.34 0.0 -0.81 -0.44 -1.67 0.57 0.59 -1.31 0.4 0.95 0.14 -0.59 -1.61 -1.33 -1.05 0.1 -0.57 -0.39 0.1 -0.94 0.55 -0.54 -2.33
0.85 1.05 0.35 0.64 -1.05 1.18 0.95 -0.04 1.15 1.35 -0.02 0.25 -3.89 -1.76 -0.36 -0.24 -2.14 0.14 0.42 -2.1 0.65 1.56 -0.07 -1.0 -4.05 -4.22 -3.48 -0.83 -2.47 -1.31 -1.1 -1.42 0.23 0.36 -2.52
0.38 0.38 -0.09 -0.03 -0.41 0.51 0.16 -0.4 0.31 0.45 0.66 0.94 -0.53 0.29 -0.89 -0.94 -3.48 0.53 0.52 -0.8 -0.15 0.55 -0.78 -0.63 -2.34 -1.15 -0.59 -0.58 -0.57 0.01 -0.44 0.25 0.81 1.09 -0.43
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0.48 0.48 -0.06 0.1 -0.41 0.66 0.29 0.1 0.33 0.53 0.47 0.66 -0.69 -0.51 -1.01 -0.96 -4.12 0.38 0.39 -1.7 -0.52 0.3 -1.35 -0.03 -1.59 -0.82 -1.0 -1.12 -0.72 0.52 0.21 0.79 0.71 1.01 -0.29
-0.45 0.65 -1.02 0.59 -0.44 0.16 1.02 -0.52 0.41 0.56 -0.17 0.14 -0.6 0.42 -0.82 -0.73 -1.68 0.41 0.66 -1.19 0.64 0.77 0.32 -0.46 -1.88 -1.9 -2.74 0.38 -0.79 -0.13 -0.92 0.61 0.18 0.75 -0.16
-0.21 0.29 -0.44 0.07 -0.06 0.43 0.43 -0.64 0.35 0.32 0.59 0.73 -0.28 0.86 -0.26 -0.8 0.09 0.31 0.59 -0.43 0.25 0.99 0.35 -0.04 -2.3 -1.86 -2.19 -1.98 -2.08 -0.67 -0.44 -1.31 0.67 1.27 -2.73
0.04 0.33 -0.17 0.29 -0.63 0.18 0.26 -0.13 -0.1 0.08 0.16 0.48 -0.73 -0.19 -0.31 -0.55 -1.64 0.35 0.33 -0.56 0.35 0.73 -0.07 -0.38 -1.77 -0.77 -0.66 -0.61 -0.79 0.49 0.19 0.71 0.4 0.93 -0.11
0.04 0.12 0.05 0.09 -0.17 0.35 -0.07 -0.71 0.39 0.34 0.38 0.57 -0.45 -0.11 0.24 -0.71 -1.46 0.25 0.46 -0.95 0.91 0.83 0.41 -0.16 -1.88 -0.5 -0.8 0.05 -1.87 -0.95 -0.87 -0.71 0.64 0.53 0.48
0.27 0.62 -0.07 0.55 -0.21 0.67 0.92 -0.14 0.74 0.69 -0.42 0.01 0.29 -1.15 -0.51 -0.74 -1.39 0.05 0.45 -0.66 0.73 0.72 0.03 -0.45 -1.48 -1.4 -1.52 -0.21 -1.23 -0.66 -0.72 -0.98 0.12 0.82 0.14
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0.2 0.36 -0.12 0.45 0.16 0.28 0.65 -0.16 0.48 0.47 -0.37 -0.13 -0.56 -1.12 -0.75 -1.03 -1.95 0.5 0.77 -0.5 0.8 1.05 0.58 -0.25 -2.07 -3.15 -3.12 0.67 -0.88 -0.16 -1.31 0.4 -0.1 0.33 0.2
0.26 0.56 -0.1 0.37 0.03 0.49 0.52 -0.39 0.43 0.32 0.36 0.81 -0.72 -0.88 -0.4 -0.31 -0.98 0.34 0.38 0.09 -0.19 0.55 -0.37 -0.58 -2.11 -1.04 -1.0 0.22 -0.92 -0.73 -0.28 -2.24 0.77 1.19 -0.54
-0.16 1.02 -1.23 0.46 -0.16 0.09 0.69 -0.48 -0.02 0.25 0.08 0.57 -0.92 -0.7 -0.45 -0.3 -1.35 0.21 0.45 -1.41 0.51 1.4 0.1 -0.57 -2.24 -0.44 -1.03 0.07 -1.9 0.01 -0.07 0.08 0.09 1.16 -1.26
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0.24 0.59 0.04 0.43 0.05 0.58 0.28 0.29 0.37 0.27 0.29 0.51 -0.4 0.15 -0.09 -0.43 -0.8 0.33 0.46 -1.43 -0.95 -0.25 -0.99 -0.16 -1.41 -1.19 -1.65 0.28 -1.19 -0.19 -0.15 -0.44 0.46 0.8 0.62
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0.41 0.6 0.2 0.61 -0.84 0.89 1.12 0.17 0.88 1.07 -0.27 -0.0 -0.75 0.24 -0.79 -1.3 -2.43 0.52 0.75 -1.21 0.44 1.38 -0.23 -0.99 -3.16 -2.48 -1.57 -1.21 -1.76 -0.61 -1.53 -0.14 0.04 0.48 -1.1
0.2 0.7 0.03 0.66 -0.57 0.25 0.71 -0.05 0.02 0.56 0.07 0.38 -2.6 -0.67 -0.34 -0.44 -1.6 0.32 0.76 -1.68 1.16 1.49 -0.07 -0.69 -2.44 -2.89 -3.95 0.15 -1.77 -0.66 -1.35 -0.21 0.38 0.33 0.66
0.27 0.62 -0.07 0.55 -0.21 0.67 0.92 -0.14 0.74 0.69 -0.42 0.01 0.29 -1.15 -0.51 -0.74 -1.39 0.05 0.45 -0.66 0.73 0.72 0.03 -0.45 -1.48 -1.4 -1.52 -0.21 -1.23 -0.66 -0.72 -0.98 0.12 0.82 0.14
0.17 0.4 -0.39 0.26 -0.32 0.11 0.33 -0.72 0.09 0.18 0.06 0.38 0.12 0.29 -0.13 -0.48 -1.54 0.69 0.6 -0.64 0.59 0.54 0.12 0.02 -1.2 -1.59 -1.64 -0.05 -0.75 0.3 -0.27 0.65 0.34 -0.0 -0.59
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-0.08 -0.2 -0.19 -0.22 0.24 0.3 -0.03 -0.57 0.32 0.39 0.08 0.19 -1.3 -0.81 -0.8 -1.12 -1.72 0.17 0.67 -2.02 1.79 1.54 1.1 -1.16 -2.12 -3.34 -4.14 -0.74 -0.88 -0.39 -1.91 0.64 0.27 1.09 -0.11
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.