Heatmap: Cluster_38 (HCCA)

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	4h after treatment	4h after treatment,No nitrate	8h after treatment	8h after treatment,No nitrate	20C	20h after treatment	20h after treatment,No nitrate	20h after treatment,Nocodazole added	36h after treatment	36h after treatment,No phosphate	Blue light,10min after light change	Blue light,60min after light change	Bohlin	CCAP1055/1,20C	CCAP1055/1,20C,High CO2,OligoDT primed	CCAP1055/1,20C,Low CO2,OligoDT primed	CCAP1055/1,20C,Normal CO2,OligoDT primed	CCMP2561	CCMP2561 Nitrase Reductase Knockout	CCMP632	CCMP632,24h	CCMP632,48h	CCMP632,72h	CCMP632,High light acclimated WT	CCMP632,Low light acclimated WT	NEPCC640,8h,1000ppmv CO2	NEPCC640,8h,390 ppmv CO2	No light,8h after treatment	Pt-1	Pt-1 8.6	Pt-1 8.6,With nitrogen	Pt-1 8.6,Without nitrogen	Red light,0min before light change	UTEX 646,Blue light	UTEX 646,No light
PTI_00G02310.1	0.31	1.08	0.33	0.96	0.34	0.6	1.42	-0.03	1.0	0.92	-0.02	0.28	-2.31	-1.02	-2.35	-1.11	-3.24	0.28	0.38	-1.82	-1.45	-0.79	-2.79	-1.76	-3.68	-1.29	-1.89	0.68	0.21	-0.56	-0.75	-0.4	0.44	0.8	0.71
PTI_00G02420.1	0.54	1.09	0.24	0.77	0.91	0.98	1.31	0.06	0.91	0.77	-8.8	-7.96	-0.77	-9.48	-0.69	-0.79	-1.12	0.26	0.67	-0.67	-0.89	0.2	-0.73	0.13	-1.19	-0.08	-0.23	-0.11	-0.05	0.52	0.21	0.84	-	-	-
PTI_00G02610.1	0.59	0.45	0.46	0.07	0.64	0.92	-0.22	-0.19	0.91	0.8	-	-	0.99	-	0.64	0.45	1.23	0.52	0.77	0.27	-0.36	0.01	-0.69	0.08	-1.25	-0.89	-1.48	-0.14	0.31	-0.27	-0.33	-0.48	-	-	-8.48
PTI_00G03010.1	0.15	0.58	0.25	0.86	-0.86	0.39	0.96	0.47	0.28	0.63	0.41	0.23	-1.44	-0.06	-0.29	-0.3	0.35	0.29	0.32	-0.6	-2.62	-1.03	-2.59	-0.14	-1.62	-0.41	-1.01	0.08	-0.47	0.17	-0.01	0.61	0.35	0.19	-1.16
PTI_00G03390.1	0.07	0.21	-0.42	-0.02	-0.01	0.22	0.39	-0.29	0.52	0.4	-1.17	-0.99	-0.16	-0.69	-1.15	-1.35	-3.42	0.35	0.4	-0.84	0.93	0.55	0.46	0.15	-1.37	-1.79	-1.43	-0.37	-0.19	0.96	0.15	1.1	-0.86	0.83	0.49
PTI_00G04530.1	0.17	0.38	-0.11	0.36	0.31	0.75	0.63	-0.3	0.89	0.62	-0.68	-0.58	-0.13	-1.54	-0.18	-0.37	0.03	0.21	0.32	-0.04	-0.85	-0.63	-0.77	0.69	-0.2	-0.84	-1.46	-0.01	-0.74	0.31	0.19	0.09	-0.27	-0.18	0.21
PTI_01G00060.1	0.13	0.17	-0.2	0.32	0.06	0.45	0.69	-0.18	0.77	0.59	-0.37	-0.02	0.02	-1.05	-0.73	-0.63	-1.67	0.22	0.44	-0.83	-2.02	-1.34	-1.74	0.28	-1.69	-0.2	-0.24	0.52	-0.02	0.74	0.67	0.38	-0.01	0.3	0.33
PTI_01G00290.1	0.53	0.53	-0.45	0.16	-0.85	0.65	0.73	-0.16	0.43	0.45	-0.27	0.69	-1.59	-1.71	1.08	0.3	1.11	0.07	0.68	-0.75	-2.63	-0.76	-1.98	-0.77	-2.43	-0.24	-0.7	0.13	-0.92	-0.64	-1.41	-0.53	0.58	0.99	-0.0
PTI_01G00890.1	0.41	0.54	0.41	0.52	0.45	0.58	0.52	-0.08	0.79	0.72	0.03	0.24	-0.82	-2.8	0.09	0.56	0.23	-0.21	-0.03	-0.45	-4.1	-2.19	-3.39	-0.12	-1.63	-0.3	-1.05	0.66	0.17	-0.63	-0.4	-2.35	0.47	1.03	-0.0
PTI_01G00990.1	0.1	0.47	-0.1	0.4	0.34	0.34	0.77	-0.06	0.43	0.58	0.21	0.38	-0.19	-0.59	-0.8	-0.99	-0.47	-0.09	0.15	-0.15	-3.81	-1.41	-3.13	-0.1	-1.53	-0.94	-1.37	0.41	0.55	-0.28	-0.41	0.04	0.48	1.21	0.73
PTI_01G01390.1	0.22	0.84	0.22	1.26	0.16	0.79	1.31	-0.17	0.98	1.23	-0.38	0.03	-0.44	-0.58	-2.04	-1.68	-4.3	-0.14	-0.11	-1.39	-0.75	-0.2	-1.25	-0.94	-3.69	-1.92	-3.14	0.96	-0.51	-0.18	-0.73	0.16	0.25	0.48	0.31
PTI_01G01570.1	0.49	1.15	0.28	1.17	-0.15	1.0	1.56	0.03	0.87	0.98	-0.58	-0.38	-0.8	-0.88	-2.21	-2.2	-2.89	-0.54	-0.42	-0.92	-3.36	-1.41	-2.95	-1.54	-3.34	-0.07	-0.25	0.25	-0.29	0.22	-0.01	0.49	-0.51	0.86	0.29
PTI_01G04710.1	0.11	0.34	-0.13	0.34	-0.1	0.28	0.71	-0.47	0.18	0.1	-1.19	-0.82	-0.9	-0.56	0.79	-0.08	-0.07	0.37	0.21	1.33	-2.5	-1.59	-2.52	-0.46	-2.24	-0.14	-0.86	-0.33	0.2	-0.0	-0.26	0.54	-0.77	1.08	0.96
PTI_01G07540.1	0.23	0.8	0.04	0.85	-0.23	0.39	1.24	-0.48	0.8	0.77	-1.08	-0.93	0.59	-1.32	-0.48	-0.58	-0.38	0.31	0.44	0.04	-0.65	-0.08	-0.86	0.05	-1.2	-0.89	-1.47	0.44	-0.04	-0.13	-0.27	0.03	-0.68	0.4	-1.54
PTI_01G07790.1	0.14	0.01	-0.53	-0.02	0.12	0.69	0.28	-0.67	1.05	0.67	0.58	0.39	-1.22	-2.47	-0.54	-0.44	-0.54	-0.17	0.0	-1.0	-0.72	-0.17	-1.11	0.69	0.36	-0.54	-0.77	1.06	-1.7	-0.63	-0.09	-2.46	0.72	0.68	0.62
PTI_01G09320.1	-0.03	0.59	-0.14	0.65	-0.05	0.14	0.84	-0.27	0.31	0.39	-0.76	-0.25	-0.18	-0.97	-0.68	-0.13	-2.25	0.4	0.35	-0.29	-0.57	-0.06	-0.9	0.53	-0.94	-0.79	-1.12	0.45	-0.86	0.69	0.5	0.62	-0.24	0.08	0.34
PTI_01G11120.1	0.47	1.28	0.44	1.07	-0.1	0.37	1.23	0.11	0.59	0.94	-0.2	-0.36	-1.23	-0.91	-1.1	-1.61	-1.25	-0.35	0.13	0.08	-4.72	-1.98	-4.32	0.9	-1.45	-0.66	-0.29	-1.08	-0.33	0.12	0.68	-0.07	0.27	0.51	-1.61
PTI_01G11140.1	-0.07	0.01	-0.45	-0.13	-0.12	0.01	-0.11	-0.13	-0.4	-0.15	-1.47	-0.88	-0.6	-0.5	0.92	-0.14	1.04	0.5	0.25	0.15	-1.0	-0.38	-1.34	-0.0	-0.73	0.41	0.14	0.19	-0.45	-0.03	0.29	0.12	-0.94	1.14	0.61
PTI_01G11760.1	0.13	0.64	0.13	0.6	-0.84	0.27	0.67	0.27	0.28	0.74	0.14	-0.01	-0.74	0.15	-0.37	0.26	-1.91	0.39	0.17	0.15	-0.08	-0.07	-0.46	-0.57	-1.68	-0.85	-0.99	0.79	-0.1	-0.45	0.13	-0.54	-0.11	0.19	-0.33
PTI_02G01630.1	-0.06	0.81	-0.28	0.84	0.18	0.62	1.16	-0.5	0.71	0.65	-1.22	-1.22	-0.03	-1.08	-0.07	-0.49	-0.09	0.29	0.53	-0.06	0.1	-0.25	0.12	-0.39	-0.85	-0.43	-1.4	0.16	-0.78	-0.01	-0.06	0.33	-0.9	-0.17	-0.89
PTI_02G02050.1	0.15	0.51	-0.01	0.54	-0.06	0.53	0.73	-0.57	0.74	0.46	-0.11	-0.06	-0.69	-1.5	0.29	-0.22	0.29	0.25	0.8	-0.31	-0.71	-0.19	-0.72	0.19	0.01	-0.85	-1.68	-0.25	-1.29	-0.53	-0.47	-0.54	0.28	0.25	0.56
PTI_02G02200.1	0.23	0.44	-0.1	0.33	-0.31	0.22	0.99	-0.15	0.41	0.42	-0.19	0.24	0.32	-0.39	-0.36	-0.97	-0.62	-0.03	0.09	-0.83	-0.6	-0.25	-1.03	-0.5	-2.33	-0.1	-0.51	0.57	-0.92	-0.1	-0.62	0.37	0.29	1.04	0.51
PTI_02G02350.1	0.32	0.38	0.24	0.3	-0.34	0.52	0.54	-0.18	0.45	0.74	0.19	0.78	-1.76	-1.04	-0.79	-1.06	-0.54	0.18	0.53	-0.92	-5.02	-2.01	-5.56	-0.88	-3.03	-0.25	-1.13	0.41	-0.09	0.16	-0.63	0.51	0.7	1.7	0.44
PTI_02G03010.1	0.4	0.59	0.23	0.54	0.02	0.47	0.73	0.02	0.15	0.41	-0.4	0.11	-1.57	-0.63	0.31	-0.35	0.52	0.3	0.2	-0.25	-2.77	-1.06	-2.72	-0.08	-1.99	-0.42	-0.66	0.08	0.2	-0.17	0.01	-0.26	0.16	1.2	-0.29
PTI_02G03410.1	0.24	1.33	-0.02	0.57	0.57	0.44	0.52	-0.55	0.05	0.88	-0.78	-0.8	-0.42	-0.87	-1.11	-1.09	-0.71	-0.76	-0.56	-0.58	-2.87	-1.09	-3.03	-0.16	-1.11	0.16	0.86	-1.14	-0.43	0.11	0.74	-0.45	-0.63	0.71	1.63
PTI_02G04000.1	-0.23	-0.04	-0.72	0.07	0.62	0.29	0.6	-1.09	0.82	0.43	0.61	0.64	0.14	-1.05	-0.08	-0.52	-0.39	-0.22	0.28	-0.39	-1.48	-0.91	-1.21	-0.02	0.14	-0.5	-1.3	0.41	-1.6	0.12	-0.3	0.34	0.91	0.23	0.43
PTI_02G04170.1	-0.48	-0.18	-0.59	-0.21	0.27	-0.05	-0.01	-0.93	0.49	0.27	-0.57	-0.12	-0.82	-0.17	-0.51	-0.39	-0.53	0.22	0.42	-0.26	0.35	0.43	0.18	0.35	-0.22	-0.72	0.21	0.16	-0.64	0.12	-0.06	0.25	-0.23	0.95	0.68
PTI_02G05200.1	0.26	0.5	-0.15	0.49	-0.05	0.32	0.69	-0.31	0.73	0.66	0.02	-0.04	-0.17	-1.36	-1.51	-0.96	-2.36	0.06	0.56	-0.65	0.42	0.52	-0.15	-0.67	-2.56	-1.59	-1.51	1.35	-0.26	-0.15	-0.92	0.35	-0.15	0.54	0.17
PTI_02G06190.1	0.46	1.18	0.41	1.14	1.07	1.21	1.3	-0.02	1.5	1.6	-6.64	-6.21	-1.21	-	-0.22	-0.21	-0.73	0.19	0.08	-0.5	-1.09	0.1	-0.81	-0.93	-0.59	0.43	-1.36	-0.77	-1.07	-0.41	-0.42	-0.42	-6.9	-5.35	-4.97
PTI_03G00210.1	-0.42	0.47	-0.94	0.0	0.2	0.14	0.2	-0.8	0.51	0.59	0.65	1.04	0.88	0.04	-0.64	-0.81	-1.53	-0.01	-0.28	0.65	-3.27	-0.82	-2.12	-0.26	-1.04	-0.09	-0.55	0.52	-0.47	-0.55	-0.63	-0.92	1.23	0.89	-0.06
PTI_03G00430.1	-0.05	0.65	0.15	1.04	-0.49	0.22	1.05	-0.05	0.64	0.84	0.14	-0.34	0.23	0.12	-1.51	-0.35	-0.74	0.18	0.49	-0.16	-1.72	-0.59	-1.17	-0.07	-1.03	-1.86	-2.7	-0.19	-0.3	0.25	-0.57	0.78	-0.35	0.63	-0.25
PTI_03G00680.1	0.05	0.4	0.03	0.35	0.32	0.5	0.59	-0.38	0.59	0.42	-0.16	0.12	-	-0.24	-0.13	-0.04	0.79	-0.37	0.3	-0.19	-2.33	-1.1	-2.05	0.23	-1.69	0.41	-0.39	-0.28	-0.16	0.19	-0.03	0.3	0.14	0.4	0.35
PTI_03G00760.1	-0.09	0.51	-0.06	0.95	-0.11	0.67	1.62	-0.17	1.15	0.94	-0.45	-0.52	0.4	-0.01	-0.73	-1.17	-0.19	-0.34	-0.37	0.08	-3.45	-1.66	-2.55	0.45	-0.69	-0.48	-1.17	-0.73	-0.67	0.25	-0.17	0.58	-0.16	-0.75	-0.27
PTI_03G00900.1	0.04	0.11	0.15	0.12	0.23	0.01	0.1	-0.23	-0.01	0.16	0.25	0.34	0.61	-0.18	-0.61	-1.58	-0.12	-0.27	0.03	-0.73	-4.04	-1.84	-3.6	0.0	-1.58	0.17	0.12	0.07	0.13	0.18	-0.03	0.08	0.21	1.26	1.28
PTI_03G00950.1	0.36	0.37	0.13	0.13	-0.5	0.46	0.39	0.06	0.25	0.43	0.14	-0.09	-0.12	0.09	-0.42	-1.12	0.0	-0.11	0.38	-1.25	-1.8	-0.66	-1.93	0.44	-1.17	0.08	-0.29	-0.25	-0.05	0.13	0.29	0.06	0.12	0.85	0.56
PTI_03G02320.1	0.22	0.8	-0.06	0.7	-0.35	0.49	1.01	0.16	0.47	0.51	-1.43	-1.16	0.67	-1.48	-0.15	-0.32	0.35	0.36	0.39	-0.49	-1.83	-0.87	-1.91	0.16	-0.54	-0.19	-0.63	-0.07	0.05	0.42	0.11	0.83	-1.16	-0.45	-0.8
PTI_03G03350.1	0.32	1.36	0.35	1.02	-0.41	0.36	0.93	0.43	0.13	0.63	-0.39	-0.25	-0.63	0.03	-1.04	0.36	-1.04	0.36	0.04	-0.23	-0.74	0.01	-0.65	-0.99	-2.11	-1.15	-2.16	0.16	0.46	-0.51	-0.46	-0.13	-0.27	0.18	-0.31
PTI_03G05050.1	0.11	-0.12	-0.63	-0.2	0.73	0.28	0.4	-0.76	0.51	0.3	-0.22	-0.1	0.93	-0.86	-0.32	-1.23	-0.3	0.06	0.2	-0.35	-0.38	0.06	-0.32	0.12	-0.9	-0.56	-0.45	0.26	0.25	0.02	-0.34	-0.01	0.03	0.22	0.83
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PTI_16G03190.1	-0.26	0.21	-0.14	0.15	0.54	0.35	0.56	-0.45	0.99	0.57	-1.13	-0.94	-5.16	-1.37	-1.41	-0.41	-2.32	0.29	0.36	0.12	0.55	0.6	0.67	-0.0	-0.49	-0.6	-0.91	-0.11	-0.29	0.2	-0.26	0.71	-0.84	0.28	0.75
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PTI_18G01770.1	-0.95	1.0	-0.46	0.92	-0.74	1.63	1.3	0.0	1.87	1.62	-0.55	-1.58	-0.21	-0.96	0.04	0.95	0.54	0.13	0.01	-0.78	-1.97	-1.85	-1.13	-0.53	-2.96	0.03	-1.59	-3.08	-1.39	-0.84	0.16	-3.21	-0.91	-1.04	-4.96
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PTI_19G00200.1	0.63	1.22	0.76	1.1	-0.69	1.01	0.71	-0.04	0.72	1.13	0.05	0.48	-0.61	0.02	-0.66	0.93	-1.05	0.08	0.74	-1.42	-2.2	-1.03	-2.28	-2.63	-3.52	-0.86	-1.26	-0.53	-1.31	-1.65	-0.77	-2.56	0.54	0.15	0.2
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PTI_28G01040.1	0.11	-0.12	-0.24	-0.07	-0.1	0.25	0.5	-0.21	0.49	0.45	-0.31	0.06	-0.22	-1.05	-0.67	-1.3	-0.28	-0.02	0.03	0.31	-0.81	-0.42	-0.57	-0.22	-0.9	-0.6	-0.52	0.67	0.56	0.42	-0.43	0.88	0.08	0.53	0.58
PTI_29G00750.1	-0.19	0.29	-0.28	0.35	-0.12	0.22	0.66	-0.52	0.29	0.34	-0.56	-0.36	0.2	-0.17	-0.69	-1.12	-0.16	-0.01	-0.18	-0.3	-2.41	-1.44	-1.68	-0.29	-0.11	0.24	0.24	-0.46	-0.28	0.45	0.29	0.61	-0.36	1.18	1.07
PTI_29G00980.1	0.78	1.21	0.24	1.12	-0.31	1.06	1.58	0.08	0.96	0.95	-1.88	-1.8	0.22	-2.02	-0.1	-0.1	-1.83	0.7	0.82	-0.03	-2.04	-1.93	-1.89	-0.29	-2.11	-1.16	-1.57	-0.46	-1.21	-0.26	-0.97	0.29	-1.27	0.26	-1.44
PTI_30G01190.1	0.37	0.71	0.08	0.81	-0.33	0.56	0.93	0.36	0.5	0.52	0.01	0.12	-1.24	-2.57	-3.39	-2.7	-	0.09	0.48	-2.14	-6.2	-3.23	-5.53	-1.91	-3.19	-1.01	-1.98	1.53	0.69	0.93	1.18	-0.05	0.59	0.32	0.73
PTI_32G00300.1	0.69	0.86	0.39	0.73	0.28	1.04	0.86	0.13	1.03	1.16	-0.62	-0.47	-1.65	-2.29	-1.44	-0.9	-1.93	0.05	0.04	-0.63	-1.41	-0.22	-1.46	-0.96	-1.59	-0.85	-1.25	1.01	-0.25	0.42	0.17	0.48	-0.48	0.41	-2.4

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.