Heatmap: Cluster_74 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
4h after treatment
4h after treatment,No nitrate
8h after treatment
8h after treatment,No nitrate
20C
20h after treatment
20h after treatment,No nitrate
20h after treatment,Nocodazole added
36h after treatment
36h after treatment,No phosphate
Blue light,10min after light change
Blue light,60min after light change
Bohlin
CCAP1055/1,20C
CCAP1055/1,20C,High CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Low CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Normal CO2,OligoDT primed
CCMP2561
CCMP2561 Nitrase Reductase Knockout
CCMP632
CCMP632,24h
CCMP632,48h
CCMP632,72h
CCMP632,High light acclimated WT
CCMP632,Low light acclimated WT
NEPCC640,8h,1000ppmv CO2
NEPCC640,8h,390 ppmv CO2
No light,8h after treatment
Pt-1
Pt-1 8.6
Pt-1 8.6,With nitrogen
Pt-1 8.6,Without nitrogen
Red light,0min before light change
UTEX 646,Blue light
UTEX 646,No light
0.34 0.17 0.19 0.05 0.19 0.26 0.02 0.18 0.22 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.1 0.15 0.03 0.04 0.03 0.0 0.01 0.0 0.07 0.1 0.0 0.0 1.0 0.11 0.09 0.16 0.04 0.01 0.03 0.04
0.51 0.39 0.42 0.5 0.55 0.45 0.73 0.49 0.8 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.1 0.11 0.17 0.24 0.2 0.53 0.56 0.34 0.15 0.19 0.09 0.07 1.0 0.37 0.45 0.27 0.59 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.04 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0
0.19 0.31 0.25 0.35 0.26 0.28 0.24 0.43 0.23 0.11 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.02 0.0 0.09 0.0 0.01 0.01 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.28 0.34 0.2 0.61 0.7 0.34 0.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0
0.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.21 0.21 0.12 0.07 0.12 0.08 0.03 0.05 0.14 0.13 0.04 0.05 0.06 0.06 0.15 0.23 0.17 0.08 0.1 0.03 0.08 0.11 0.1 0.06 0.08 0.22 0.14 1.0 0.15 0.12 0.15 0.11 0.05 0.04 0.05
0.07 0.09 0.07 0.1 0.42 0.16 0.13 0.09 0.22 0.19 0.18 0.22 0.27 0.25 0.06 0.05 0.03 0.14 0.09 0.31 0.72 0.39 1.0 0.23 0.81 0.02 0.01 0.17 0.36 0.18 0.09 0.24 0.17 0.11 0.35
0.21 0.18 0.12 0.15 0.3 0.39 0.23 0.14 0.4 0.28 0.35 0.14 0.07 0.21 0.19 0.16 0.16 0.19 0.18 0.11 0.25 0.14 0.54 0.24 0.56 0.13 0.15 1.0 0.49 0.2 0.24 0.21 0.13 0.25 0.45
0.28 0.24 0.28 0.24 0.29 0.31 0.22 0.19 0.35 0.3 0.15 0.17 0.13 0.1 0.3 0.26 0.04 0.4 0.43 0.14 0.77 0.31 0.72 0.58 1.0 0.12 0.17 0.24 0.41 0.35 0.36 0.34 0.19 0.3 0.7
0.05 0.02 0.02 0.01 0.17 0.08 0.02 0.03 0.09 0.05 0.41 0.19 0.07 0.06 0.04 0.03 0.02 0.04 0.03 0.05 0.3 0.16 1.0 0.09 0.25 0.05 0.09 0.25 0.11 0.07 0.12 0.03 0.14 0.06 0.2
0.45 0.34 0.56 0.42 0.17 0.21 0.22 0.23 0.26 0.24 0.11 0.17 0.34 0.14 0.55 0.43 0.15 0.43 0.42 0.33 1.0 0.32 0.35 0.37 0.24 0.89 0.43 0.49 0.52 0.32 0.28 0.44 0.23 0.62 0.56
0.03 0.03 0.04 0.05 0.15 0.03 0.06 0.03 0.1 0.06 0.03 0.03 0.14 0.14 0.02 0.02 0.01 0.09 0.06 0.13 0.19 0.03 1.0 0.03 0.17 0.16 0.15 0.08 0.23 0.03 0.03 0.05 0.04 0.07 0.28
0.03 0.04 0.09 0.11 0.23 0.11 0.13 0.09 0.27 0.14 0.08 0.07 0.21 0.1 0.02 0.04 0.05 0.17 0.09 0.17 1.0 0.1 1.0 0.14 0.87 0.18 0.18 0.31 0.25 0.1 0.05 0.15 0.08 0.1 0.55
0.17 0.52 0.35 0.65 0.16 0.36 0.36 0.69 0.19 0.03 0.0 0.06 0.0 0.0 0.04 0.11 0.0 0.03 0.01 0.0 0.03 0.08 0.0 0.1 0.0 0.0 0.05 1.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0
0.01 0.02 0.02 0.04 0.2 0.06 0.06 0.04 0.12 0.1 0.11 0.1 0.29 0.2 0.03 0.05 0.03 0.08 0.06 0.28 0.27 0.18 1.0 0.1 0.24 0.03 0.03 0.13 0.25 0.07 0.07 0.12 0.11 0.01 0.09
0.18 0.14 0.11 0.12 0.29 0.14 0.13 0.08 0.16 0.15 0.15 0.17 0.07 0.18 0.1 0.09 0.1 0.15 0.17 0.18 0.25 0.33 1.0 0.15 0.12 0.14 0.09 0.58 0.11 0.08 0.08 0.09 0.15 0.04 0.1
0.36 0.3 0.36 0.26 0.32 0.29 0.2 0.14 0.38 0.28 0.09 0.12 0.57 0.15 0.65 0.32 0.09 0.62 0.46 0.22 1.0 0.13 0.76 0.38 0.52 0.68 0.38 0.4 0.53 0.18 0.16 0.21 0.16 0.48 0.95
0.38 0.0 0.05 0.07 0.56 0.13 0.0 0.0 0.25 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.1 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0
0.4 0.37 0.33 0.4 0.57 0.3 0.3 0.23 0.7 0.52 0.32 0.4 0.67 0.31 0.51 0.65 0.49 0.47 0.58 0.3 0.86 0.35 0.81 0.42 0.28 0.43 0.15 0.55 0.76 0.27 0.5 0.11 0.5 0.7 1.0
0.17 0.34 0.14 0.22 0.15 0.26 0.22 0.18 0.4 0.28 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.26 0.23 0.21 0.24 0.35 0.29 0.31 0.17 0.52 0.37 0.18 0.21 0.34 0.12 0.09 0.09 0.05 0.15 0.17 0.18 0.22 0.35 0.6 0.16 0.21 0.14 0.07 1.0 0.31 0.19 0.18 0.21 0.24 0.18 0.19
0.57 0.7 0.33 0.55 0.43 0.55 0.9 0.32 0.52 0.56 0.02 0.01 0.2 0.0 0.01 0.01 0.01 0.1 0.02 0.3 0.25 0.64 0.31 0.1 0.05 0.0 0.06 0.43 0.18 0.54 0.19 1.0 0.01 0.06 0.02
0.32 0.35 0.16 0.43 0.3 0.4 0.82 0.22 0.72 0.55 0.03 0.03 1.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.55 0.35 0.24 0.38 0.37 0.11 0.15 0.16 0.54 0.58 0.55 0.17 0.91 0.02 0.14 0.05
0.27 0.33 0.25 0.5 0.14 0.18 0.41 0.1 0.24 0.31 0.07 0.08 0.36 0.05 0.15 0.37 0.14 0.34 0.39 0.87 0.45 0.13 0.37 0.3 0.76 0.09 0.03 0.37 1.0 0.31 0.17 0.66 0.1 0.16 0.31
0.41 0.4 0.48 0.45 0.26 0.35 0.38 0.2 0.71 0.51 0.26 0.32 0.51 0.17 0.31 0.46 0.1 0.25 0.21 0.26 0.38 0.19 0.38 0.33 0.25 0.39 0.25 1.0 0.56 0.18 0.19 0.18 0.38 0.61 0.5
0.2 0.11 0.14 0.08 0.3 0.25 0.06 0.09 0.19 0.18 0.37 0.3 0.14 0.06 0.16 0.07 0.15 0.16 0.1 0.14 0.29 0.15 1.0 0.24 0.85 0.08 0.06 0.2 0.13 0.1 0.12 0.11 0.22 0.19 0.16
0.38 0.32 0.33 0.29 0.32 0.38 0.24 0.21 0.46 0.4 0.22 0.22 0.2 0.18 0.29 0.3 0.07 0.42 0.39 0.21 0.81 0.51 1.0 0.4 0.65 0.35 0.68 0.33 0.55 0.3 0.29 0.29 0.24 0.46 0.43
0.26 0.19 0.16 0.13 0.27 0.36 0.18 0.1 0.49 0.33 0.08 0.08 0.12 0.03 0.47 0.47 0.35 0.21 0.22 0.09 0.25 0.11 0.26 0.17 0.24 0.19 0.17 1.0 0.22 0.09 0.17 0.05 0.11 0.13 0.26
0.13 0.14 0.12 0.15 0.17 0.13 0.23 0.19 0.2 0.2 0.77 0.61 0.1 0.19 0.07 0.1 0.03 0.14 0.14 0.18 0.6 0.36 1.0 0.13 0.2 0.13 0.1 0.55 0.2 0.08 0.06 0.09 0.23 0.34 0.17
0.16 0.17 0.15 0.15 0.1 0.09 0.04 0.12 0.12 0.1 0.34 0.23 0.34 0.12 0.22 0.46 0.12 0.35 0.38 0.1 0.24 0.38 0.14 0.16 0.09 0.22 0.32 1.0 0.55 0.26 0.3 0.16 0.2 0.53 0.42
0.07 0.07 0.06 0.06 0.2 0.09 0.06 0.07 0.08 0.06 0.07 0.07 0.11 0.18 0.06 0.05 0.02 0.07 0.09 0.1 0.33 0.11 1.0 0.18 0.76 0.06 0.07 0.04 0.21 0.11 0.14 0.06 0.07 0.06 0.53
0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.19 0.17 0.11 0.13 0.11 0.19 0.14 0.19 0.23 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.03 0.01 0.03 0.01 0.03 0.01 0.01 0.08 0.13 1.0 0.01 0.13 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.05 0.23 1.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.01 0.01 0.01 0.2 0.04 0.01 0.03 0.05 0.05 0.03 0.03 0.13 0.12 0.01 0.02 0.02 0.04 0.04 0.13 0.31 0.08 0.37 0.36 1.0 0.02 0.01 0.02 0.29 0.09 0.08 0.11 0.03 0.03 0.09
0.08 0.0 0.11 0.32 0.0 0.09 0.0 0.1 0.23 0.0 0.06 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0
0.32 0.28 0.25 0.24 0.35 0.42 0.29 0.25 0.55 0.5 0.98 0.55 0.27 0.18 0.35 0.39 0.21 0.34 0.32 0.25 0.6 0.7 0.77 0.47 0.65 0.23 0.18 1.0 0.34 0.19 0.29 0.12 0.48 0.36 0.26
0.04 0.09 0.03 0.09 0.17 0.11 0.11 0.02 0.14 0.08 0.06 0.05 0.08 0.01 0.08 0.08 0.06 0.09 0.12 0.04 0.01 0.02 0.05 0.02 0.18 0.17 0.08 1.0 0.15 0.02 0.04 0.03 0.07 0.03 0.27
0.29 0.31 0.19 0.24 0.24 0.27 0.21 0.25 0.38 0.3 0.69 0.98 0.17 0.32 0.08 0.14 0.01 0.44 0.47 0.14 0.57 0.54 0.3 0.28 0.28 0.26 0.4 0.55 0.88 0.46 0.55 0.31 0.91 1.0 0.79
0.51 0.32 0.5 0.24 0.61 0.71 0.23 0.37 0.66 0.66 0.24 0.18 0.13 0.12 0.3 0.18 0.13 0.47 0.45 0.15 1.0 0.25 0.93 0.36 0.55 0.39 0.35 0.25 0.69 0.52 0.39 0.62 0.22 0.24 0.22
0.32 0.18 0.27 0.17 0.18 0.3 0.11 0.14 0.36 0.38 0.65 0.79 0.33 0.52 0.19 0.19 0.03 0.38 0.22 0.36 0.5 0.33 1.0 0.4 0.6 0.32 0.17 0.08 0.47 0.18 0.27 0.15 0.83 0.39 0.33
0.1 0.07 0.14 0.12 0.55 0.11 0.05 0.24 0.02 0.07 0.08 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.11 0.02 0.42 0.0 0.0 0.02 0.0 1.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0
0.08 0.1 0.09 0.12 0.34 0.14 0.13 0.07 0.24 0.16 0.09 0.09 0.19 0.12 0.09 0.1 0.04 0.12 0.12 0.13 0.46 0.12 1.0 0.16 0.53 0.1 0.08 0.08 0.21 0.12 0.1 0.13 0.09 0.16 0.28
0.3 0.16 0.12 0.06 0.21 0.12 0.06 0.24 0.15 0.12 0.19 0.17 0.23 0.01 0.18 0.16 0.12 0.14 0.12 0.14 0.05 0.12 0.07 0.05 0.12 0.11 0.15 1.0 0.18 0.14 0.16 0.09 0.17 0.3 0.31
0.18 0.12 0.16 0.1 0.1 0.11 0.08 0.05 0.19 0.14 0.04 0.05 0.11 0.01 0.11 0.15 0.06 0.08 0.12 0.04 0.03 0.07 0.04 0.05 0.08 0.37 0.3 1.0 0.11 0.05 0.08 0.03 0.04 0.15 0.02
0.26 0.17 0.21 0.16 0.04 0.49 0.12 0.1 1.0 0.59 0.15 0.11 0.2 0.02 0.07 0.23 0.13 0.16 0.07 0.5 0.09 0.02 0.09 0.08 0.15 0.29 0.22 0.49 0.7 0.03 0.08 0.01 0.09 0.25 0.07
0.2 0.25 0.14 0.26 0.27 0.19 0.29 0.13 0.3 0.29 0.04 0.04 0.5 0.01 0.12 0.17 0.09 0.39 0.34 0.72 1.0 0.61 0.97 0.13 0.14 0.16 0.06 0.45 0.34 0.22 0.08 0.52 0.04 0.06 0.09
0.35 0.46 0.35 0.51 0.37 0.3 0.47 0.25 0.51 0.48 0.26 0.25 0.82 0.45 0.1 0.22 0.05 0.35 0.23 0.79 0.85 0.46 1.0 0.3 0.24 0.57 0.27 0.57 0.9 0.28 0.16 0.47 0.26 0.38 0.57
0.18 0.23 0.18 0.27 0.32 0.17 0.32 0.12 0.36 0.29 0.12 0.1 0.6 0.13 0.08 0.2 0.07 0.39 0.4 0.6 1.0 0.33 0.99 0.16 0.14 0.51 0.23 0.38 0.74 0.17 0.1 0.38 0.12 0.22 0.31
0.3 0.42 0.35 0.47 0.4 0.29 0.38 0.27 0.35 0.34 0.14 0.12 1.0 0.16 0.16 0.35 0.1 0.53 0.64 0.05 0.05 0.03 0.03 0.02 0.01 0.75 0.44 0.62 0.92 0.01 0.01 0.02 0.14 0.26 0.24
0.04 0.07 0.04 0.06 0.14 0.05 0.04 0.03 0.03 0.05 0.13 0.08 0.11 0.03 0.02 0.02 0.03 0.02 0.01 0.2 0.21 0.13 1.0 0.07 0.11 0.09 0.07 0.03 0.09 0.02 0.02 0.03 0.07 0.01 0.01
0.07 0.06 0.08 0.09 0.25 0.08 0.07 0.06 0.19 0.15 0.11 0.09 0.08 0.11 0.15 0.19 0.04 0.14 0.1 0.16 0.09 0.09 0.2 0.13 0.43 0.21 0.12 1.0 0.31 0.14 0.22 0.12 0.12 0.08 0.44
0.03 0.04 0.02 0.03 0.32 0.05 0.03 0.03 0.04 0.05 0.12 0.17 0.0 0.11 0.04 0.03 0.0 0.08 0.05 0.07 0.29 0.31 1.0 0.04 0.09 0.02 0.01 0.14 0.06 0.04 0.06 0.02 0.21 0.01 0.03
0.0 0.0 0.01 0.01 0.11 0.02 0.0 0.01 0.05 0.03 0.3 0.14 0.11 0.05 0.09 0.04 0.09 0.02 0.03 0.23 0.36 0.07 1.0 0.07 0.35 0.04 0.02 0.19 0.22 0.03 0.05 0.01 0.07 0.07 0.13
0.11 0.07 0.08 0.09 0.06 0.07 0.08 0.08 0.09 0.09 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.06 0.07 0.08 0.04 0.14 0.07 0.05 0.38 0.25 0.02 0.01 0.08 0.02 0.08 0.23 0.1 0.05 0.06 0.21 0.16 0.14 1.0 0.2 0.39 0.17 0.1 0.76 0.42 0.04 0.07 0.02 0.02 0.03 0.07
0.06 0.07 0.06 0.08 0.06 0.16 0.06 0.03 0.34 0.21 0.02 0.02 0.07 0.01 0.06 0.12 0.03 0.03 0.03 0.16 0.1 0.04 0.16 0.03 0.09 0.02 0.01 1.0 0.12 0.01 0.02 0.0 0.02 0.1 0.24
0.01 0.01 0.01 0.01 0.08 0.01 0.01 0.01 0.03 0.02 0.08 0.07 0.02 0.08 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.06 0.12 0.03 1.0 0.01 0.22 0.02 0.04 0.08 0.06 0.01 0.01 0.01 0.06 0.03 0.05
0.07 0.1 0.06 0.09 0.24 0.13 0.13 0.08 0.19 0.15 0.0 0.0 0.09 0.0 0.09 0.09 0.09 0.11 0.09 0.13 0.67 0.3 1.0 0.17 0.71 0.03 0.03 0.19 0.34 0.07 0.05 0.08 0.0 0.0 0.0
0.12 0.12 0.14 0.18 0.22 0.11 0.09 0.85 0.1 0.12 1.0 0.73 0.07 0.08 0.06 0.09 0.02 0.08 0.09 0.17 0.49 0.74 0.13 0.13 0.06 0.05 0.06 0.49 0.26 0.14 0.22 0.11 0.42 0.23 0.3
0.18 0.19 0.22 0.23 0.23 0.23 0.32 0.12 0.5 0.36 0.0 0.0 1.0 0.0 0.15 0.17 0.07 0.3 0.27 0.32 0.45 0.28 0.48 0.25 0.19 0.25 0.17 0.23 0.5 0.26 0.12 0.5 0.0 0.0 0.0
0.01 0.01 0.01 0.01 0.13 0.04 0.02 0.02 0.09 0.06 0.18 0.15 0.12 0.07 0.02 0.04 0.01 0.02 0.01 0.2 0.23 0.1 1.0 0.09 0.34 0.03 0.05 0.16 0.2 0.06 0.07 0.05 0.13 0.06 0.47
0.15 0.03 0.1 0.03 0.2 0.09 0.01 0.07 0.31 0.07 0.0 0.01 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.07 0.02 0.14 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.02

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)