Heatmap: Cluster_20 (HCCA)

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	4h after treatment	4h after treatment,No nitrate	8h after treatment	8h after treatment,No nitrate	20C	20h after treatment	20h after treatment,No nitrate	20h after treatment,Nocodazole added	36h after treatment	36h after treatment,No phosphate	Blue light,10min after light change	Blue light,60min after light change	Bohlin	CCAP1055/1,20C	CCAP1055/1,20C,High CO2,OligoDT primed	CCAP1055/1,20C,Low CO2,OligoDT primed	CCAP1055/1,20C,Normal CO2,OligoDT primed	CCMP2561	CCMP2561 Nitrase Reductase Knockout	CCMP632	CCMP632,24h	CCMP632,48h	CCMP632,72h	CCMP632,High light acclimated WT	CCMP632,Low light acclimated WT	NEPCC640,8h,1000ppmv CO2	NEPCC640,8h,390 ppmv CO2	No light,8h after treatment	Pt-1	Pt-1 8.6	Pt-1 8.6,With nitrogen	Pt-1 8.6,Without nitrogen	Red light,0min before light change	UTEX 646,Blue light	UTEX 646,No light
PTI_00G01260.1	0.11	0.76	-0.07	0.84	-0.82	0.32	0.78	-0.28	0.45	0.7	0.02	0.27	0.01	-0.92	-2.8	-1.38	-5.79	0.77	1.02	-1.56	-2.13	-1.83	-1.22	-1.15	-1.69	0.79	0.71	0.47	-0.31	0.19	0.61	-0.14	0.29	-0.61	0.07
PTI_01G02650.1	-0.07	0.22	-0.37	-0.03	0.19	0.13	0.17	-0.59	0.37	0.4	0.3	0.45	-1.42	0.39	-1.94	-1.24	-3.7	0.32	0.06	-1.0	1.12	1.19	1.85	-0.81	-1.32	-1.09	-0.82	0.21	-0.28	-0.48	-0.05	-0.53	0.38	-0.68	-1.78
PTI_01G03660.1	-1.21	-0.3	-0.36	0.96	-0.21	-0.68	0.45	0.7	-0.78	-0.07	0.21	0.53	-1.04	0.69	-1.59	-0.09	-4.23	1.27	0.72	-0.39	-0.0	0.64	0.46	-0.92	-1.77	-0.71	-3.85	-0.8	0.1	0.11	0.43	0.53	0.54	0.46	-1.38
PTI_01G05130.1	-0.06	0.44	-0.23	0.42	-0.25	0.57	0.95	-0.36	0.91	0.9	0.3	0.43	-0.97	0.23	-2.44	-1.54	-5.47	0.9	0.64	-0.62	0.43	1.18	0.37	-0.44	-1.85	-1.2	-1.23	-0.74	-0.51	-0.5	-0.18	-0.31	0.55	-0.37	-3.01
PTI_01G06740.1	-0.5	-0.05	-0.75	-0.06	-0.13	-0.25	-0.11	-0.59	0.06	-0.01	0.56	0.69	-0.54	0.55	-2.39	-1.38	-4.25	0.47	0.05	-0.25	-0.21	-0.12	1.44	-0.93	-0.18	-0.9	-0.79	1.31	0.08	-0.39	0.1	-0.6	0.7	-0.65	0.97
PTI_01G07050.1	-0.77	-0.5	-0.89	-0.54	-0.45	-0.39	-0.22	-0.32	-0.2	-0.28	0.45	0.72	-1.09	-0.04	-1.43	-0.92	-3.55	0.49	0.54	-0.33	0.54	0.63	1.14	-0.01	-0.37	-1.58	-0.96	0.13	-0.69	0.91	0.7	1.02	0.63	-0.27	0.13
PTI_01G07410.1	-0.07	0.56	-0.21	0.52	-0.59	0.47	0.7	0.28	0.65	0.62	-0.6	-0.23	-1.07	-1.19	-2.23	-0.81	-5.52	0.9	0.91	-1.41	-0.87	-0.85	-0.83	-0.27	-1.74	-0.62	1.06	-0.17	0.17	0.73	1.13	-0.11	-0.11	0.15	-0.82
PTI_01G08300.1	-0.22	0.32	0.01	0.74	-0.42	-0.37	0.17	0.82	-0.29	-0.02	0.29	0.65	-0.14	0.31	-2.19	-0.38	-3.36	0.45	0.65	-0.25	0.45	0.74	0.64	-0.85	-1.86	-1.09	-1.87	-0.01	0.29	-0.37	0.31	-0.73	0.52	-0.09	-0.28
PTI_01G09420.1	-0.9	-0.64	-1.41	-0.59	0.08	-0.18	-0.24	-0.1	0.2	0.2	0.38	0.52	-0.92	-0.49	-1.49	-0.73	-3.94	0.61	1.08	-0.23	0.56	0.53	1.23	0.1	-0.18	-0.54	-0.98	0.93	-0.35	-0.18	-0.23	-0.38	0.58	-0.43	0.5
PTI_01G10310.1	-0.22	0.08	-0.38	0.12	-0.43	-0.01	0.21	0.14	0.14	0.12	0.09	0.34	-1.72	-0.46	-1.81	-0.69	-3.85	0.75	0.5	-0.3	-0.87	-0.27	-0.1	-0.17	-0.55	-0.83	0.82	0.49	0.35	0.34	0.8	0.12	0.35	0.12	0.55
PTI_01G10960.1	-0.0	0.16	-0.29	0.22	-0.43	0.17	0.53	-0.43	0.41	0.43	-0.63	-0.13	-0.92	-0.94	-1.43	-0.84	-5.43	0.88	0.89	-1.78	-1.7	-0.97	-1.88	1.38	-0.01	0.1	1.67	0.05	-0.61	-0.41	-0.21	0.03	0.05	0.28	0.15
PTI_01G10980.1	0.31	0.19	0.09	0.04	-0.52	-0.14	-0.26	0.05	-0.33	-0.57	-0.08	0.74	-2.13	-0.31	-0.73	-0.52	-2.46	0.24	0.06	-0.8	-0.47	0.13	-0.42	0.16	-1.11	-0.22	0.14	0.31	-0.27	0.45	1.22	0.44	1.07	0.33	0.11
PTI_01G11070.1	0.33	0.85	-0.03	0.83	0.21	0.87	0.86	0.06	0.72	1.02	0.18	0.32	-1.99	-0.7	-3.05	-1.48	-6.34	1.05	0.84	-1.05	-1.54	-0.83	-0.11	-1.61	-1.95	-0.44	-0.3	0.59	-0.38	-0.55	0.72	-1.41	0.5	-0.66	-0.75
PTI_02G01420.1	-0.7	0.16	-1.03	0.17	-0.35	-0.2	0.64	-0.43	0.15	0.41	0.39	0.76	-0.1	0.54	-2.16	-1.52	-5.08	0.87	0.97	-1.09	0.24	0.23	0.87	-0.58	-0.87	-0.93	-1.13	-0.36	-0.24	0.35	-0.66	0.89	0.58	-0.03	-0.41
PTI_02G01910.1	-0.23	0.24	-0.09	0.51	0.01	-0.18	0.23	0.82	0.04	0.25	0.44	0.49	-0.88	0.88	-2.36	-1.12	-3.8	0.3	0.32	-0.5	0.12	0.58	1.66	-1.0	-1.6	-0.97	-0.99	0.29	-0.47	-0.47	0.09	-0.87	0.45	-0.02	-1.83
PTI_02G03240.1	0.01	-0.24	-0.57	-0.54	0.76	0.34	-0.34	-0.56	0.37	0.3	-0.53	-0.35	-1.3	-2.4	-1.89	-1.24	-4.38	0.27	0.19	-0.57	0.74	0.91	1.96	-0.75	-0.65	-1.22	-1.06	1.68	0.03	-0.22	0.27	-0.44	-0.28	-1.2	0.14
PTI_02G05740.1	-0.06	0.24	-0.62	0.1	-0.06	0.24	0.17	-0.6	0.45	0.46	0.36	0.63	-0.55	-1.98	-2.65	-1.46	-4.69	0.52	0.45	-0.58	-0.34	-0.24	0.25	-1.08	-0.48	-0.07	0.05	1.29	-0.27	-0.45	0.2	-1.31	0.81	-0.41	1.38
PTI_02G05960.1	0.04	0.97	-0.29	0.99	0.19	0.6	1.2	0.0	1.07	1.09	-0.54	-0.18	-1.23	-1.58	-4.1	-1.57	-7.89	1.24	0.76	-1.18	-2.0	-2.29	-1.05	-1.98	-1.81	0.05	-0.43	1.64	-0.03	-0.96	0.04	-2.26	-0.03	-1.36	0.41
PTI_02G05970.1	-1.1	-0.25	-1.34	-0.29	-0.13	-0.65	0.14	-1.01	-0.06	0.05	0.85	0.92	0.44	0.74	-1.24	-0.82	-1.81	0.19	-0.24	0.37	0.29	0.31	1.53	0.05	0.43	-0.88	-0.8	0.35	-0.42	-0.66	-0.23	-1.33	0.75	-1.15	0.22
PTI_03G00630.1	-0.07	0.46	-0.33	0.55	-0.23	0.21	0.85	-0.47	0.6	0.65	0.28	0.39	-	0.67	-1.57	-0.97	-3.29	0.8	0.81	-1.08	-1.87	-1.37	-1.5	-0.51	-0.28	-1.0	-1.24	0.3	0.06	0.16	-0.07	0.43	0.62	-0.45	1.22
PTI_03G01110.1	-0.27	0.98	-0.21	1.03	-0.49	0.07	1.21	0.03	-0.14	0.43	-0.45	-0.22	-0.67	0.39	-1.86	-0.51	-2.07	0.64	0.44	0.32	0.29	0.65	-0.24	-0.75	-1.22	-2.42	-2.79	-0.64	0.76	0.01	-0.63	1.09	-0.18	-0.65	-1.32
PTI_03G04320.1	-0.67	-0.3	-0.8	-0.21	-0.18	-0.23	0.04	-0.54	0.14	0.29	0.93	1.05	0.18	1.13	-2.78	-1.37	-3.94	0.41	0.06	0.46	-0.92	-0.17	1.16	-0.6	-0.27	-1.02	-0.9	0.26	0.15	-0.25	0.04	-0.3	0.98	-0.97	0.11
PTI_03G05220.1	-1.01	0.13	-0.5	0.46	-0.15	-0.3	0.27	0.45	-0.22	0.04	-0.84	-0.44	0.8	0.02	-1.35	-0.09	-4.7	0.65	0.39	0.0	0.84	-0.14	0.71	-0.31	-0.09	-1.08	-1.61	0.23	0.45	-0.15	-0.24	0.16	-0.45	-1.85	1.36
PTI_03G05380.1	-0.05	0.35	-0.19	0.37	-0.43	0.19	0.51	0.01	0.2	0.31	0.3	0.32	-0.77	0.29	-2.28	-1.09	-4.79	0.41	0.23	-1.19	0.32	0.56	0.79	-0.52	-1.3	-1.02	-1.11	0.38	-0.13	0.22	0.05	0.6	0.27	-0.43	0.65
PTI_03G05770.1	0.09	0.08	-0.41	-0.14	0.43	0.05	-0.5	-0.61	-0.08	0.06	0.15	0.57	-0.14	-0.45	-1.81	-0.44	-5.39	0.36	0.16	-0.56	0.43	0.49	1.02	0.07	-0.13	-0.21	-0.2	0.99	-0.01	-0.0	0.19	0.06	0.43	-0.75	-0.86
PTI_03G06330.1	-0.44	-0.04	-0.47	-0.16	-0.6	-0.51	0.05	-0.17	-0.49	-0.3	-0.46	-0.14	0.19	0.47	-0.54	-0.23	-1.86	0.35	0.7	-0.3	-0.58	0.44	-0.98	0.77	0.01	-0.4	-0.2	-0.02	0.28	0.61	0.14	0.79	-0.22	0.25	0.75
PTI_03G06440.1	-0.93	0.1	-0.53	0.44	-0.66	-0.52	0.57	0.14	0.1	0.05	-0.32	-0.11	0.36	-0.11	-1.62	-0.55	-3.3	0.5	0.82	-0.6	0.11	0.29	0.06	-0.03	-0.93	-1.15	-1.45	-0.26	-0.72	0.95	0.54	0.94	-0.02	0.22	0.94
PTI_04G00340.1	-0.48	0.23	-0.4	0.66	-0.02	0.04	1.16	-0.75	0.55	0.69	-0.02	0.31	0.47	-0.27	-1.29	-0.45	-1.96	0.58	0.59	0.13	-0.09	-0.33	0.65	-0.62	-0.23	-1.95	-2.73	0.26	0.05	-0.4	-0.96	-0.01	0.3	-0.62	0.43
PTI_04G00870.1	-0.37	0.11	-0.91	0.0	-0.62	-0.01	0.38	-0.13	-0.07	0.1	0.61	0.59	-0.72	0.18	-0.84	-0.67	-1.25	0.54	0.98	0.19	-0.35	0.42	-0.55	-0.23	-1.5	-1.53	-1.21	-0.17	0.86	-0.05	-0.11	0.63	0.55	0.59	-0.19
PTI_04G01380.1	-0.58	0.22	-0.42	0.54	-0.64	-0.13	0.67	0.28	0.45	0.38	1.07	0.29	0.02	-0.41	-1.29	-0.03	-3.0	0.56	0.49	-0.88	-0.53	-0.54	-0.03	-0.71	-0.62	-0.14	-0.68	0.61	-0.41	-0.35	-0.52	-0.01	0.24	-0.19	0.95
PTI_04G02200.1	-0.37	0.14	-0.39	0.18	-0.28	0.13	0.28	0.0	0.32	0.4	0.36	0.52	-0.54	0.18	-1.69	-0.9	-2.45	0.24	0.2	-0.52	-0.21	0.1	0.45	-0.3	-0.35	-0.74	-0.93	0.52	-0.01	0.08	0.38	-0.27	0.57	-1.22	1.26
PTI_04G02600.1	-1.49	-0.46	-1.95	-0.29	0.02	-0.74	0.15	-1.21	-0.4	-0.22	0.13	0.32	-0.66	0.66	-2.78	-1.97	-3.83	0.57	0.3	-0.43	-0.54	-0.23	1.32	-0.73	0.5	-1.33	-0.82	0.86	0.65	-0.37	0.06	-0.68	0.25	-1.52	2.38
PTI_04G02940.1	-0.29	0.2	-0.59	0.1	-0.18	0.04	0.18	-0.22	0.07	0.39	0.14	0.37	-0.59	0.16	-2.05	-1.08	-4.28	0.35	0.24	-0.88	-0.37	-0.4	1.36	-0.25	-0.02	-0.86	-1.2	0.85	-0.03	-0.16	-0.41	0.22	0.36	-0.17	1.26
PTI_04G04000.1	-0.46	-0.22	-0.96	-0.27	-0.5	-0.49	-0.17	-0.93	-0.22	-0.07	0.7	0.85	-0.39	0.79	-1.89	-1.12	-3.05	0.35	0.01	0.17	0.18	0.35	1.57	-0.84	-0.15	-0.75	-0.24	1.08	0.01	-0.67	-0.0	-1.08	0.82	-1.06	0.59
PTI_04G04910.1	0.11	0.46	-0.29	0.56	-0.41	0.48	0.91	0.02	0.72	0.77	-0.44	-0.53	-1.8	-1.1	-1.38	-1.17	-3.02	0.73	0.8	-1.1	0.87	0.85	0.87	-0.22	-1.83	-2.18	-2.02	-0.63	-0.28	0.45	-0.16	0.99	-0.38	-0.1	-1.4
PTI_04G05350.1	-1.29	-0.52	-1.42	0.17	-1.28	-1.12	0.41	-0.81	-0.48	-0.46	-0.16	0.14	-0.07	-0.07	-1.1	-0.56	-2.66	0.3	0.8	0.18	0.3	0.51	0.04	0.11	-0.42	-1.38	-0.4	0.39	-0.24	1.07	0.36	1.29	-0.0	-0.57	1.36
PTI_04G05470.1	-0.38	0.44	-0.48	0.45	-0.94	-0.26	0.67	-0.53	-0.15	0.23	0.38	0.73	-0.5	1.33	-2.17	-0.76	-4.39	0.28	0.38	0.2	-0.2	0.27	0.08	-0.59	-2.05	-1.91	-2.37	-1.08	0.72	0.33	-0.17	1.0	0.73	0.07	-0.14
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PTI_11G03770.1	-0.37	-0.02	-0.92	0.01	0.16	-0.04	0.57	-0.73	0.54	0.55	-0.11	0.18	-0.8	0.11	-1.88	-1.01	-3.03	0.2	0.4	-0.25	0.43	-0.18	1.19	-0.53	-0.45	-1.69	-1.61	0.88	0.33	-0.09	-0.7	0.56	0.17	-0.22	1.0
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PTI_24G00800.1	-0.84	-0.54	-0.8	-0.24	-0.1	-0.29	0.12	-0.62	0.34	0.23	0.12	0.3	-0.17	0.62	-1.3	-0.07	-2.24	0.38	0.31	-0.87	0.01	-0.16	1.44	0.08	0.53	-1.84	-1.77	-0.48	0.18	0.36	0.38	0.42	0.19	-0.17	0.62
PTI_24G00810.1	-0.83	-0.44	-1.06	-0.31	-0.3	-0.34	-0.18	-0.54	0.07	0.04	0.42	0.48	-0.45	0.52	-2.19	-1.15	-3.84	0.06	0.12	-0.23	0.41	0.39	1.73	-0.27	-0.08	-2.35	-1.97	1.43	-0.04	-0.19	0.11	-0.7	0.47	-0.13	0.85
PTI_24G01200.1	0.06	0.64	0.13	0.87	-0.66	0.35	1.01	0.15	0.61	0.85	0.18	0.19	-0.15	-0.84	-1.84	-0.76	-4.0	0.89	0.97	-0.34	-1.0	-0.57	-0.61	-0.89	-2.1	-0.82	-0.75	-1.62	-0.11	0.28	0.67	0.04	0.29	-0.29	-0.04
PTI_24G01280.1	-0.21	-0.22	-0.7	-0.08	-0.39	-0.09	0.11	-0.21	-0.05	0.05	1.01	1.01	-0.44	0.41	-1.64	-0.64	-4.04	0.4	0.14	-0.31	-0.61	0.12	0.14	-1.01	-0.61	-0.77	1.07	-0.8	-0.73	0.47	0.37	0.82	0.94	-0.09	-0.86
PTI_24G01570.1	0.55	1.03	0.23	0.95	0.08	0.71	0.61	0.76	0.88	0.92	-1.01	-0.65	-0.92	-1.94	-3.85	-1.68	-7.18	0.88	0.73	-1.76	-2.58	-1.77	-1.52	-1.56	-2.73	1.08	0.64	0.86	-0.23	-0.35	0.5	-1.11	-0.29	-0.39	-0.4
PTI_24G01580.1	-0.75	-0.55	-0.86	-0.7	-0.44	-0.62	-0.56	-0.43	-0.19	-0.19	1.02	1.17	0.22	0.66	-0.58	0.03	-1.97	0.26	0.28	-0.25	0.4	0.95	1.15	-0.31	-0.64	-2.53	-1.23	-0.67	-1.02	-0.21	0.19	-0.44	1.16	0.13	0.08
PTI_25G00490.1	-0.63	0.2	-0.5	0.28	-0.48	-0.02	0.21	-0.24	0.09	0.35	0.69	0.91	-0.29	0.6	-1.74	-0.49	-2.82	0.45	1.04	0.16	-0.71	0.19	0.34	-0.61	-1.01	-1.33	-1.27	-0.9	-0.12	0.1	0.1	-0.18	0.88	-0.3	0.68
PTI_25G01280.1	-0.03	0.16	-0.38	0.15	-0.11	0.1	0.47	-0.46	0.49	0.65	0.0	0.09	-3.15	0.33	-1.65	-0.61	-4.56	1.25	0.95	-0.49	0.55	0.51	1.49	-1.0	-2.08	-2.08	-1.49	-0.64	-0.51	-0.05	-1.24	0.7	0.11	0.52	-0.76
PTI_25G01290.1	0.69	0.99	0.19	1.08	-0.53	0.88	1.15	0.05	1.2	1.23	-1.22	-0.93	0.57	-1.36	-3.6	-1.46	-6.9	1.96	1.53	-2.22	-3.06	-2.87	-2.6	-1.97	-3.97	-1.49	-1.27	0.05	-0.16	-0.49	-0.96	-0.24	-0.53	-0.26	-1.22
PTI_26G00170.1	-0.32	0.1	-1.16	-0.05	0.1	0.11	0.49	-0.35	0.37	0.1	0.12	0.42	-0.49	-0.17	-2.49	-0.9	-4.21	0.24	0.44	-1.14	0.56	0.62	1.61	-0.53	-0.35	-1.34	-1.75	1.63	-0.19	-0.5	-0.95	0.16	0.39	-0.49	-0.61
PTI_26G01620.1	0.22	-0.2	-0.2	-0.44	0.13	0.17	-0.31	-0.09	-0.04	0.2	0.79	0.81	-1.29	0.15	-1.79	-1.73	-3.65	0.14	-0.26	-1.61	0.05	0.41	1.94	-0.31	0.1	-0.19	0.47	-1.11	-0.94	0.12	0.86	-0.87	0.7	-0.28	-3.21
PTI_29G00850.1	0.45	0.86	-0.0	0.78	0.25	0.66	0.76	-0.05	0.52	0.82	0.81	0.85	-1.07	-1.21	-5.81	-2.42	-9.53	1.21	0.83	-1.88	-2.6	-2.28	-1.48	-2.93	-2.9	-0.24	0.24	0.7	-0.59	-0.31	0.56	-1.14	1.13	-0.72	-0.74
PTI_29G00920.1	-0.22	0.16	-0.81	0.01	0.02	-0.29	0.36	-0.75	0.29	0.37	0.71	0.91	-1.09	0.67	-1.91	-0.93	-4.61	-0.12	-0.09	-1.32	0.55	0.13	1.34	-1.14	-1.49	-1.61	-1.89	1.84	-0.77	-0.22	-0.97	0.46	0.77	0.03	-1.25
PTI_31G00530.1	-1.29	-0.71	-1.39	-0.73	-0.45	-0.88	-0.79	-0.42	-0.53	-0.44	0.48	0.58	-0.89	0.96	-1.93	-0.69	-3.73	0.37	0.48	-0.17	0.22	0.4	2.17	-0.35	-0.04	-0.37	-0.33	0.99	0.44	0.04	0.59	-0.65	0.49	-1.77	-0.93

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.