Heatmap: Cluster_12 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	4h after treatment	4h after treatment,No nitrate	8h after treatment	8h after treatment,No nitrate	20C	20h after treatment	20h after treatment,No nitrate	20h after treatment,Nocodazole added	36h after treatment	36h after treatment,No phosphate	Blue light,10min after light change	Blue light,60min after light change	Bohlin	CCAP1055/1,20C	CCAP1055/1,20C,High CO2,OligoDT primed	CCAP1055/1,20C,Low CO2,OligoDT primed	CCAP1055/1,20C,Normal CO2,OligoDT primed	CCMP2561	CCMP2561 Nitrase Reductase Knockout	CCMP632	CCMP632,24h	CCMP632,48h	CCMP632,72h	CCMP632,High light acclimated WT	CCMP632,Low light acclimated WT	NEPCC640,8h,1000ppmv CO2	NEPCC640,8h,390 ppmv CO2	No light,8h after treatment	Pt-1	Pt-1 8.6	Pt-1 8.6,With nitrogen	Pt-1 8.6,Without nitrogen	Red light,0min before light change	UTEX 646,Blue light	UTEX 646,No light
PTI_00G01430.1	0.01	0.01	0.0	0.0	0.29	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.52	0.48	0.0	0.26	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.61	0.03	0.11	0.42	0.07	0.23	0.02	0.04	0.01	0.02	0.36	0.03	1.0	0.52	0.03	0.05
PTI_00G01720.1	0.01	0.01	0.0	0.0	0.29	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.52	0.48	0.0	0.26	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.61	0.03	0.11	0.42	0.07	0.23	0.02	0.04	0.01	0.02	0.36	0.03	1.0	0.52	0.03	0.05
PTI_01G01180.1	0.34	0.44	0.38	0.39	0.37	0.45	0.4	0.32	0.49	0.53	0.52	0.7	0.16	0.36	0.53	0.42	0.61	0.3	0.51	0.55	0.43	0.82	0.49	0.4	0.13	0.38	1.0	0.43	0.25	0.25	0.29	0.17	0.76	0.44	0.48
PTI_01G04740.1	0.28	0.54	0.38	0.97	0.53	0.33	0.77	0.67	0.31	0.4	0.4	0.48	0.48	1.0	0.15	0.26	0.16	0.38	0.35	0.46	0.44	0.68	0.39	0.38	0.14	0.17	0.06	0.18	0.45	0.56	0.48	0.81	0.45	0.51	0.18
PTI_01G06560.1	0.21	0.35	0.23	0.35	0.16	0.27	0.47	0.2	0.3	0.42	0.33	0.41	0.39	0.35	0.19	0.2	0.19	0.33	0.3	0.2	0.22	0.42	0.18	0.28	0.08	0.85	1.0	0.23	0.15	0.38	0.21	0.51	0.43	0.44	0.5
PTI_01G09930.1	0.25	0.38	0.32	0.57	0.26	0.3	0.62	0.36	0.28	0.35	0.4	0.59	0.05	1.0	0.1	0.17	0.13	0.32	0.35	0.13	0.43	0.54	0.32	0.18	0.11	0.11	0.05	0.15	0.2	0.28	0.24	0.45	0.41	0.55	0.12
PTI_01G11450.1	0.35	0.39	0.35	0.37	0.22	0.37	0.53	0.25	0.42	0.48	0.53	0.79	0.32	0.58	0.42	0.25	0.28	0.6	0.61	0.3	0.7	1.0	0.35	0.18	0.04	0.17	0.65	0.4	0.28	0.21	0.15	0.41	0.71	0.93	0.27
PTI_02G01870.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.07	0.0	0.18	0.0	0.0	0.0	0.04	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.05	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0
PTI_02G03040.1	0.65	0.56	0.34	0.48	0.26	0.73	0.6	0.3	0.57	0.54	0.29	0.39	0.04	0.12	0.3	0.16	0.09	0.48	1.0	0.05	0.46	0.66	0.2	0.06	0.03	0.06	0.03	0.33	0.09	0.18	0.08	0.41	0.31	0.45	0.16
PTI_03G02280.1	0.47	0.56	0.36	0.46	0.36	0.34	0.4	0.13	0.39	0.37	0.15	0.11	1.0	0.01	0.14	0.16	0.09	0.25	0.16	0.48	0.53	0.26	0.4	0.15	0.18	0.25	0.09	0.92	0.36	0.17	0.22	0.24	0.12	0.2	0.03
PTI_03G04150.1	0.29	0.35	0.23	0.43	0.27	0.32	0.48	0.2	0.49	0.39	0.34	0.32	0.24	0.69	0.12	0.12	0.07	0.3	0.26	0.17	0.19	0.22	0.21	0.14	0.41	0.77	1.0	0.41	0.66	0.31	0.27	0.38	0.33	0.78	0.52
PTI_03G04430.1	0.51	0.55	0.42	0.47	0.41	0.54	0.55	0.34	0.52	0.48	0.66	0.81	0.17	0.54	0.23	0.26	0.2	0.42	0.44	0.17	0.64	1.0	0.52	0.33	0.2	0.14	0.11	0.64	0.17	0.39	0.29	0.5	0.67	0.59	0.48
PTI_04G00310.1	0.09	0.14	0.14	0.21	0.13	0.19	0.2	0.32	0.2	0.23	0.2	0.33	0.38	1.0	0.08	0.21	0.1	0.24	0.25	0.45	0.1	0.24	0.09	0.11	0.04	0.2	0.06	0.05	0.31	0.14	0.13	0.22	0.29	0.29	0.19
PTI_04G00750.1	0.14	0.37	0.14	0.33	0.16	0.34	0.49	0.21	0.44	0.43	0.46	0.56	0.07	0.4	0.2	0.19	0.13	0.32	0.34	0.1	0.17	0.46	0.14	0.27	0.1	0.58	1.0	0.12	0.05	0.13	0.15	0.09	0.58	0.62	0.66
PTI_05G01020.1	0.41	0.4	0.3	0.34	0.61	0.55	0.54	0.28	0.6	0.6	0.46	0.58	0.16	0.91	0.19	0.12	0.28	0.37	0.43	0.31	0.51	0.66	0.52	0.38	0.17	0.23	0.24	0.55	0.35	0.58	0.38	0.77	0.58	0.73	1.0
PTI_05G01650.1	0.1	0.19	0.07	0.16	0.14	0.16	0.36	0.12	0.23	0.2	0.0	0.0	1.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.05	0.01	0.34	0.19	0.17	0.14	0.13	0.08	0.02	0.01	0.31	0.48	0.14	0.05	0.25	0.0	0.01	0.04
PTI_05G01820.1	0.22	0.51	0.18	0.47	0.15	0.24	1.0	0.15	0.41	0.37	0.45	0.34	0.46	0.99	0.1	0.12	0.08	0.22	0.27	0.17	0.52	0.44	0.29	0.14	0.06	0.04	0.02	0.63	0.23	0.24	0.16	0.34	0.36	0.4	0.76
PTI_05G04760.1	0.0	0.0	0.11	0.13	0.69	0.04	0.1	0.04	0.24	0.28	0.77	0.56	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.27	0.03	0.04	0.28	0.0	0.42	0.0	0.0	0.0	0.11	0.84	0.02	0.06	0.0	0.74	0.0	0.11
PTI_06G00360.1	0.85	0.83	0.62	0.69	0.63	1.0	0.85	0.43	1.0	0.91	0.53	0.55	0.17	0.26	0.54	0.42	0.46	0.49	0.9	0.41	0.35	0.5	0.33	0.64	0.18	0.17	0.12	0.59	0.17	0.55	0.59	0.51	0.7	0.58	0.27
PTI_06G03190.1	0.37	0.94	0.23	0.56	0.27	0.43	1.0	0.25	0.38	0.42	0.23	0.36	0.06	0.11	0.15	0.26	0.25	0.38	0.76	0.2	0.06	0.19	0.09	0.13	0.07	0.08	0.1	0.64	0.08	0.34	0.42	0.31	0.3	0.45	0.04
PTI_06G03650.1	0.45	0.6	0.38	0.58	0.38	0.49	0.62	0.36	0.5	0.58	0.44	0.57	0.38	0.69	0.15	0.26	0.02	0.45	0.6	0.34	0.43	0.65	0.27	0.35	0.12	0.13	0.11	0.34	0.32	0.43	0.28	0.58	0.53	1.0	0.91
PTI_07G00100.1	0.19	0.38	0.13	0.33	0.27	0.15	0.48	0.19	0.2	0.24	0.44	0.57	0.37	1.0	0.04	0.14	0.02	0.15	0.11	0.62	0.67	0.95	0.33	0.21	0.06	0.04	0.08	0.41	0.18	0.41	0.26	0.79	0.65	0.34	0.71
PTI_07G03280.1	0.22	0.3	0.14	0.24	0.14	0.29	0.38	0.14	0.27	0.29	0.44	0.61	0.09	1.0	0.09	0.11	0.06	0.26	0.36	0.08	0.28	0.73	0.2	0.05	0.02	0.03	0.02	0.15	0.06	0.13	0.1	0.18	0.44	0.5	0.1
PTI_08G01130.1	0.19	0.17	0.03	0.23	1.0	0.4	0.25	0.28	0.45	0.41	0.76	0.81	0.27	1.0	0.19	0.15	0.15	0.49	0.47	0.09	0.22	0.51	0.05	0.05	0.01	0.28	0.36	0.02	0.01	0.19	0.36	0.14	0.94	0.15	0.01
PTI_09G00450.1	0.44	0.4	0.37	0.28	0.51	0.45	0.29	0.2	0.35	0.48	0.25	0.32	0.22	0.42	0.43	0.31	0.3	0.42	0.83	0.52	0.43	0.74	0.21	0.27	0.03	0.3	0.33	0.26	0.27	0.4	0.25	0.34	0.31	1.0	0.68
PTI_09G04350.1	0.13	0.38	0.14	0.53	0.23	0.22	0.55	0.34	0.25	0.25	0.47	0.51	0.55	0.3	0.17	0.16	0.1	0.29	0.42	0.13	0.38	0.77	0.11	0.19	0.1	0.9	1.0	0.06	0.07	0.24	0.41	0.22	0.67	0.63	0.85
PTI_10G00010.1	0.0	0.04	0.06	0.15	0.34	0.16	0.12	0.0	0.0	0.04	0.44	1.0	0.14	0.0	0.05	0.0	0.07	0.21	0.19	0.15	0.27	0.08	0.76	0.07	0.06	0.0	0.0	0.03	0.4	0.06	0.06	0.0	0.75	0.84	0.81
PTI_11G04450.1	0.44	0.96	0.29	0.65	0.17	0.42	1.0	0.17	0.27	0.56	0.12	0.11	0.25	0.49	0.04	0.03	0.03	0.1	0.17	0.01	0.02	0.1	0.03	0.01	0.0	0.03	0.02	0.13	0.01	0.45	0.13	0.25	0.16	0.02	0.03
PTI_12G03390.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.4	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.35	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
PTI_13G03490.1	0.1	0.21	0.16	0.22	0.33	0.15	0.18	0.13	0.21	0.28	0.5	0.83	0.6	1.0	0.1	0.13	0.14	0.11	0.18	0.63	0.08	0.23	0.11	0.22	0.19	0.19	0.06	0.26	0.58	0.11	0.08	0.15	0.69	0.3	0.51
PTI_14G01220.1	0.34	0.45	0.34	0.41	0.24	0.35	0.54	0.63	0.47	0.52	0.61	0.76	0.16	1.0	0.07	0.1	0.07	0.29	0.35	0.15	0.31	1.0	0.35	0.14	0.02	0.03	0.01	0.24	0.14	0.19	0.2	0.22	0.79	0.72	0.34
PTI_14G01570.1	0.49	0.45	0.38	0.42	0.36	0.44	0.44	0.37	0.48	0.78	0.63	0.83	0.13	0.86	0.12	0.11	0.11	0.12	0.38	0.07	0.44	1.0	0.27	0.12	0.01	0.04	0.06	0.22	0.08	0.21	0.07	0.12	0.77	0.87	0.43
PTI_14G02240.1	0.78	0.87	0.79	1.0	0.39	0.88	0.9	0.68	0.89	0.93	0.42	0.46	0.17	0.21	0.35	0.35	0.37	0.54	0.75	0.26	0.55	0.83	0.45	0.4	0.06	0.32	0.32	0.27	0.18	0.37	0.37	0.35	0.52	0.93	0.17
PTI_14G03080.1	0.21	0.57	0.27	0.54	0.29	0.32	0.61	0.42	0.35	0.38	0.24	0.28	0.26	1.0	0.15	0.2	0.28	0.29	0.26	0.21	0.24	0.34	0.21	0.3	0.12	0.17	0.13	0.14	0.24	0.2	0.25	0.26	0.25	0.54	0.25
PTI_15G00050.1	0.88	0.81	0.38	0.52	0.16	0.93	0.85	0.33	0.68	1.0	0.56	0.92	0.14	0.77	0.07	0.11	0.06	0.22	0.52	0.08	0.23	0.58	0.24	0.04	0.04	0.01	0.01	0.34	0.06	0.05	0.05	0.07	0.6	0.45	0.1
PTI_15G00110.1	0.66	0.74	0.27	0.44	0.11	0.86	0.72	0.32	0.69	0.95	0.18	0.21	0.06	0.16	0.07	0.1	0.08	0.25	1.0	0.04	0.13	0.26	0.2	0.01	0.01	0.02	0.02	0.44	0.03	0.02	0.03	0.02	0.23	0.06	0.07
PTI_15G02140.1	0.07	0.06	0.02	0.23	0.0	0.08	0.14	0.08	0.11	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.28	0.0	0.18	0.07	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
PTI_17G00920.1	0.3	0.35	0.26	0.29	0.43	0.34	0.29	0.36	0.35	0.33	0.4	0.5	0.49	1.0	0.18	0.13	0.21	0.34	0.46	0.68	0.63	0.77	0.49	0.27	0.05	0.16	0.13	0.39	0.29	0.34	0.17	0.44	0.44	0.69	0.64
PTI_18G01480.1	0.17	0.38	0.11	0.48	0.23	0.17	0.83	0.2	0.33	0.48	0.57	0.92	0.26	0.59	0.15	0.15	0.03	0.82	1.0	0.57	0.29	0.48	0.23	0.15	0.09	0.09	0.24	0.54	0.55	0.3	0.13	0.45	0.82	0.6	0.46
PTI_18G02190.1	0.2	0.53	0.26	0.55	0.33	0.32	0.67	0.41	0.33	0.41	0.22	0.27	0.1	1.0	0.13	0.17	0.25	0.25	0.33	0.23	0.22	0.36	0.21	0.22	0.09	0.17	0.11	0.16	0.33	0.34	0.25	0.48	0.23	0.32	0.16
PTI_19G00250.1	0.23	0.35	0.73	0.55	0.18	0.31	0.21	0.61	0.16	0.23	0.67	1.0	0.21	0.91	0.38	0.42	0.35	0.24	0.16	0.08	0.04	0.1	0.02	0.15	0.1	0.08	0.01	0.03	0.04	0.09	0.11	0.02	1.0	0.07	0.05
PTI_19G02580.1	0.3	0.5	0.39	0.37	0.16	0.56	0.39	0.27	0.51	0.5	0.54	0.61	0.59	0.27	0.2	0.18	0.21	0.3	0.3	0.07	0.05	0.15	0.03	0.09	0.04	0.84	1.0	0.21	0.03	0.13	0.2	0.0	0.69	0.49	0.7
PTI_21G00160.1	0.22	0.32	0.26	0.37	0.53	0.28	0.33	0.37	0.26	0.3	0.35	0.35	0.35	0.67	0.3	0.4	0.18	0.47	0.61	0.81	0.23	0.4	0.15	0.24	0.13	0.45	0.3	0.24	0.63	0.45	0.42	0.6	0.31	0.79	1.0
PTI_21G00170.1	0.12	0.15	0.12	0.17	0.36	0.17	0.31	0.14	0.23	0.24	0.35	0.28	0.28	0.37	0.74	0.92	0.78	0.61	0.66	0.94	0.33	0.31	0.25	0.24	0.18	0.46	0.48	0.06	0.77	0.31	0.45	0.35	0.24	0.79	1.0
PTI_21G00180.1	0.25	0.4	0.27	0.38	0.57	0.27	0.35	0.3	0.23	0.33	0.36	0.46	0.32	0.85	0.21	0.23	0.34	0.34	0.48	0.56	0.52	0.83	0.32	0.22	0.06	0.48	0.33	0.22	0.41	0.4	0.48	0.51	0.45	0.81	1.0
PTI_21G00680.1	0.34	0.28	0.17	0.2	0.28	0.29	0.24	0.13	0.22	0.28	0.33	0.43	0.04	0.15	0.15	0.17	0.1	0.32	0.54	0.45	0.54	1.0	0.8	0.15	0.01	0.03	0.03	0.29	0.12	0.1	0.03	0.12	0.41	0.33	0.14
PTI_22G01780.1	0.48	0.54	0.39	0.56	0.4	0.54	0.61	0.39	0.6	0.58	0.75	0.87	0.45	1.0	0.23	0.22	0.12	0.44	0.48	0.28	0.17	0.36	0.3	0.52	0.48	0.37	0.4	0.87	0.43	0.81	0.72	0.76	0.87	0.55	0.67
PTI_23G00280.1	0.18	0.29	0.18	0.36	0.25	0.18	0.43	0.13	0.28	0.28	0.26	0.45	0.33	1.0	0.16	0.17	0.14	0.32	0.36	0.4	0.05	0.13	0.11	0.23	0.25	0.3	0.21	0.28	0.32	0.24	0.17	0.39	0.35	0.35	0.24
PTI_23G00310.1	0.17	0.33	0.21	0.3	0.47	0.25	0.35	0.2	0.39	0.36	0.68	0.92	0.64	0.7	0.29	0.47	0.43	0.5	0.72	0.93	0.58	0.79	0.68	0.4	0.17	0.54	0.47	0.11	0.46	0.41	0.36	0.48	0.85	0.97	1.0
PTI_24G00070.1	0.52	1.0	0.53	0.88	0.62	0.6	0.93	0.9	0.63	0.75	0.39	0.37	0.18	0.67	0.26	0.27	0.05	0.51	0.96	0.39	0.61	0.93	0.39	0.39	0.59	0.08	0.04	0.38	0.25	0.26	0.28	0.32	0.58	0.19	0.18
PTI_24G00590.1	0.01	0.02	0.01	0.02	0.28	0.01	0.02	0.03	0.04	0.02	0.68	0.48	0.36	0.2	0.01	0.01	0.0	0.07	0.14	0.54	0.93	0.28	0.28	0.33	1.0	0.1	0.07	0.15	0.15	0.49	0.09	0.94	0.53	0.01	0.07
PTI_24G01330.1	0.18	0.27	0.17	0.35	0.13	0.17	0.32	0.4	0.17	0.2	0.2	0.31	0.66	1.0	0.09	0.22	0.07	0.34	0.4	0.25	0.1	0.3	0.12	0.15	0.11	0.17	0.15	0.17	0.41	0.19	0.19	0.2	0.29	0.21	0.1
PTI_25G00980.1	0.2	0.24	0.08	0.19	0.18	0.26	0.33	0.11	0.29	0.29	0.46	0.55	0.17	0.15	0.18	0.11	0.18	0.18	0.36	0.08	0.02	0.08	0.04	0.12	0.1	0.29	1.0	0.15	0.1	0.17	0.18	0.12	0.54	0.26	0.57
PTI_27G00900.1	0.34	0.61	0.38	0.73	0.35	0.45	0.78	0.53	0.39	0.49	0.57	0.25	0.33	0.65	0.31	0.32	0.38	0.51	0.72	0.32	0.5	0.55	0.29	0.34	0.14	0.27	0.14	0.46	0.35	0.44	0.28	0.67	0.34	0.59	1.0
PTI_27G01240.1	0.58	0.72	0.42	0.66	0.36	0.72	0.8	0.55	0.69	0.63	0.33	0.59	0.42	0.24	0.24	0.18	0.22	0.54	0.94	0.18	0.28	0.28	0.17	0.15	0.02	0.15	0.16	0.72	0.22	0.16	0.08	0.25	0.53	1.0	0.43
PTI_28G00820.1	0.23	0.26	0.36	0.11	0.18	0.17	0.08	0.35	0.05	0.08	0.03	0.03	0.0	0.0	0.1	0.0	0.03	0.15	0.04	0.04	0.02	0.03	0.0	0.19	0.02	0.02	0.04	0.04	0.01	0.47	1.0	0.2	0.03	0.03	0.1
PTI_32G00290.1	0.15	0.23	0.16	0.3	0.1	0.24	0.28	0.21	0.31	0.28	0.03	0.04	1.0	0.7	0.04	0.11	0.02	0.12	0.3	0.27	0.21	0.23	0.25	0.12	0.06	0.17	0.02	0.39	0.16	0.17	0.1	0.37	0.04	0.05	0.03

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)