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Heatmap: Cluster_116 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
4h after treatment
4h after treatment,No nitrate
8h after treatment
8h after treatment,No nitrate
20C
20h after treatment
20h after treatment,No nitrate
20h after treatment,Nocodazole added
36h after treatment
36h after treatment,No phosphate
Blue light,10min after light change
Blue light,60min after light change
Bohlin
CCAP1055/1,20C
CCAP1055/1,20C,High CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Low CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Normal CO2,OligoDT primed
CCMP2561
CCMP2561 Nitrase Reductase Knockout
CCMP632
CCMP632,24h
CCMP632,48h
CCMP632,72h
CCMP632,High light acclimated WT
CCMP632,Low light acclimated WT
NEPCC640,8h,1000ppmv CO2
NEPCC640,8h,390 ppmv CO2
No light,8h after treatment
Pt-1
Pt-1 8.6
Pt-1 8.6,With nitrogen
Pt-1 8.6,Without nitrogen
Red light,0min before light change
UTEX 646,Blue light
UTEX 646,No light
-0.16 0.35 -0.52 0.04 -0.22 0.1 0.06 -0.4 0.15 0.44 0.79 1.11 - 0.85 -1.08 -0.59 -2.65 0.31 0.03 -1.12 1.41 1.64 0.79 -0.4 -2.31 -10.98 - 0.37 -1.21 -0.03 -0.07 -0.57 1.09 -3.54 -2.56
-0.4 0.16 -1.43 -0.37 0.43 -0.57 0.14 -1.56 -0.38 0.05 1.34 1.56 0.18 0.45 -2.84 -2.48 -3.73 -0.85 -0.44 -0.8 0.85 2.2 1.22 -2.17 -3.17 -1.29 -1.65 -0.81 -2.91 -2.26 -3.29 -2.7 1.62 0.18 0.38
-1.4 -0.74 -1.55 -0.33 -0.91 -1.59 0.17 -1.41 -0.69 -0.79 1.56 2.11 -4.2 2.49 -2.98 -1.8 -3.62 -1.22 -0.85 -1.41 -3.44 -0.6 -2.71 -1.16 -2.13 -1.03 -1.44 0.29 -2.09 -0.08 -0.57 -0.2 1.9 1.6 0.48
- - - - - - -1.36 - - - 1.9 2.46 - 2.82 -3.02 - -1.27 -3.84 -5.56 - - - -21.09 - - - - - -6.02 -0.3 0.44 -0.03 2.21 3.05 0.65
-0.85 0.23 -0.88 0.1 -0.27 -0.42 0.18 -0.56 0.06 0.41 0.86 0.8 -1.09 0.86 -1.11 -0.74 -1.97 0.36 0.15 0.88 0.78 1.57 1.18 -0.53 -1.39 -0.72 -1.11 -0.78 -0.5 -1.13 -0.56 -1.36 0.66 -1.07 -0.85
0.02 0.64 -0.08 0.51 0.06 0.32 0.33 -0.23 0.24 0.62 0.87 1.05 -1.73 0.24 -1.13 -0.87 -2.57 0.43 -0.02 -1.14 0.66 1.42 0.54 -0.69 -2.05 -1.38 -1.67 -0.66 -0.63 -0.54 0.08 -0.72 1.03 -1.6 -1.62
-0.53 0.04 -0.48 0.2 -0.66 -0.16 0.21 -0.4 0.0 0.2 1.04 1.17 -1.19 0.8 -1.21 -0.7 -2.0 0.11 0.48 -1.24 -0.94 -0.07 -0.92 -0.51 -2.02 -1.64 -1.59 -0.33 -0.72 0.03 -0.19 0.16 1.14 1.17 1.41
0.05 0.47 -0.31 0.08 -0.19 0.4 0.27 -0.67 0.7 0.58 0.57 0.98 -0.5 -0.79 0.1 -0.41 0.18 -0.06 0.31 -1.4 0.54 0.54 -0.43 -1.65 -3.37 -2.84 -2.82 0.45 -2.34 -1.15 -1.75 -0.6 1.06 0.88 1.03
-0.43 -0.04 -0.9 -0.12 -0.21 -0.04 0.3 -0.76 0.26 0.28 0.54 0.63 -0.43 0.73 -1.69 -1.26 -3.2 -0.07 -0.11 -0.97 0.76 0.61 0.99 -0.94 -1.53 -2.41 -2.38 0.78 0.01 -0.36 -1.45 0.32 0.41 0.51 1.49
-0.15 0.23 -0.46 0.14 -0.85 0.05 0.31 -0.58 0.2 0.21 0.77 0.65 -0.54 -0.16 0.12 -0.14 -0.95 0.19 0.68 -0.99 0.05 1.27 -0.22 -0.91 -3.19 -1.04 -2.01 0.14 -2.06 -1.33 -1.29 -1.52 0.38 1.55 1.18
-0.22 0.19 -0.69 0.14 0.17 0.18 0.52 -0.78 0.45 0.2 0.33 0.28 -1.32 -0.27 -0.66 -0.69 -2.13 0.04 0.21 -1.63 0.52 0.09 0.53 -0.04 -0.59 -0.91 -0.37 0.25 -1.48 -0.51 -0.46 -0.22 0.38 1.22 1.29
0.64 0.64 0.15 0.34 -0.44 0.5 0.43 -0.09 0.47 0.63 0.47 0.52 -1.0 -0.31 -1.02 -0.72 -2.21 -0.11 0.09 -1.07 0.19 0.91 -0.37 -0.62 -2.98 -1.6 -1.9 0.64 -0.57 -0.17 -0.52 0.09 0.31 0.72 0.36
0.43 0.27 0.37 0.26 -1.0 0.26 0.17 0.24 0.3 0.37 0.17 0.69 -0.31 -1.2 0.09 -0.24 -1.67 0.29 0.26 -1.9 0.7 1.24 -0.04 -0.75 -2.78 -0.72 -1.91 0.63 -1.93 -0.57 -0.7 -0.49 0.82 0.7 -0.42
-0.1 0.05 -0.47 0.06 0.12 -0.06 0.33 -0.67 0.32 0.33 0.69 1.01 -1.6 0.64 -2.04 -1.37 -4.04 -0.26 -0.41 0.07 0.66 0.87 1.29 -0.8 -1.79 -3.32 -3.6 1.07 -0.02 -0.72 -0.7 -0.56 0.98 -0.68 0.6
-0.16 0.06 -0.35 0.06 -0.45 -0.25 0.26 -0.61 0.24 0.28 0.44 0.81 -0.18 0.33 -0.73 -0.74 -1.64 -0.19 0.16 -0.43 -0.02 0.4 -0.47 0.19 -0.7 -0.52 -0.65 0.08 -0.42 -0.05 0.12 -0.3 0.77 0.63 0.9
0.42 0.72 0.09 0.72 -0.47 0.14 0.75 -0.3 0.32 0.46 -0.01 0.21 -0.16 -0.11 -0.82 -0.93 -2.68 0.21 0.47 -0.45 -0.59 0.14 -0.51 -0.06 -1.28 -1.54 -1.97 0.64 -0.83 -0.53 -0.79 -0.24 0.39 1.02 0.9
0.13 0.52 0.08 0.58 -0.5 0.07 0.58 -0.59 0.2 0.69 0.7 1.12 -0.66 -0.52 -0.28 -0.08 -1.82 0.19 0.62 -2.3 0.39 0.77 -0.43 -1.02 -3.05 -2.25 -3.34 0.42 -1.33 -0.51 -1.95 0.14 0.93 0.73 0.2
-0.78 -0.14 -0.76 0.02 -0.68 -0.96 0.19 -0.87 0.07 -0.12 1.79 1.19 -2.91 0.81 -0.94 0.13 -1.22 0.28 0.64 -2.05 0.23 0.87 0.34 -0.38 -1.74 -1.97 -2.45 0.72 -1.53 -0.5 -1.08 -0.18 1.02 0.9 -0.45
-0.33 0.1 -0.69 0.3 -0.67 -0.03 0.74 -0.58 0.5 0.52 -0.02 0.19 -0.84 1.03 -0.93 -0.98 -1.81 0.18 0.3 -0.82 1.17 1.43 0.76 -0.66 -1.87 -2.23 -2.9 0.01 -1.03 -0.47 -1.64 0.22 0.32 0.38 0.46
0.51 0.49 0.1 0.13 -0.15 0.94 0.35 -0.26 0.46 0.65 1.43 0.53 -1.97 -0.53 -0.21 0.05 -0.98 0.43 0.55 -1.4 0.01 1.18 0.21 -0.88 -2.69 -1.19 -2.37 -0.65 -1.66 -1.09 -0.33 -2.57 0.75 0.3 -1.32
0.1 0.51 -0.12 0.39 -0.41 0.4 0.55 -0.18 0.33 0.72 0.9 0.73 -1.91 0.16 -0.92 -0.75 -1.9 0.2 0.35 -0.78 -0.33 0.54 -0.27 -1.1 -2.11 -1.49 -1.91 1.0 -1.03 -0.25 -0.69 0.04 0.71 0.12 0.64
0.3 0.62 -0.3 0.57 -0.35 0.54 0.92 -0.47 0.93 0.8 0.69 0.59 -1.58 0.19 -1.24 -1.01 -1.89 0.0 0.18 -2.03 0.23 0.9 -0.1 0.24 -1.8 -2.56 -2.17 0.62 -1.4 -0.39 -1.07 0.01 0.6 0.21 -0.73
-0.35 0.19 -0.39 0.21 -0.08 0.36 0.51 -0.42 0.45 0.33 0.42 0.52 -1.15 -0.64 -0.52 -0.6 -2.39 0.17 0.35 -0.79 0.96 1.25 0.24 -0.36 -1.13 -0.54 -1.34 -0.32 -1.64 -0.4 -0.76 -0.15 0.57 0.29 0.89
0.11 0.19 0.08 0.28 -0.23 0.27 0.39 -0.01 0.34 0.52 0.49 0.5 -0.4 -0.18 -0.57 -0.77 -2.16 -0.06 0.27 -0.61 0.59 1.04 0.6 -0.06 -1.14 -1.46 -1.26 0.4 -0.72 -0.07 -0.44 0.2 0.3 -0.22 -0.86
0.15 0.55 0.28 0.71 -0.4 0.38 0.54 0.1 0.55 0.71 -0.09 0.06 -0.62 -1.26 -1.62 -0.88 -3.43 0.24 0.48 -0.41 0.16 0.29 -0.5 -0.04 -1.48 -1.02 -0.91 -0.1 0.11 0.63 0.77 0.14 0.12 -0.38 -0.1
0.3 0.46 -0.22 0.22 0.05 0.38 0.18 -0.25 0.36 0.32 0.41 0.71 -1.8 -0.5 -1.35 -0.84 -3.98 0.22 0.05 -1.15 0.76 0.84 0.69 -0.59 -1.09 -0.84 -1.03 0.82 -0.67 -0.66 -0.17 -0.28 0.54 -0.11 0.58
-0.13 0.24 -0.3 0.35 0.06 0.2 0.58 -0.05 0.36 0.42 -0.06 0.28 -0.59 -0.44 -0.46 -0.84 -0.29 0.12 0.02 -0.21 0.2 0.2 0.03 0.01 -0.59 -0.62 -0.9 0.38 -0.84 -0.17 -0.1 0.43 0.3 0.17 0.44
0.25 0.75 -0.07 0.66 -0.21 0.6 1.01 -0.23 0.7 0.9 0.0 0.3 -0.51 -1.25 -1.82 -1.25 -3.47 0.15 0.13 -1.7 0.84 0.98 0.6 -0.71 -1.55 -2.51 -2.77 0.95 -0.71 -0.79 -1.08 -0.06 0.29 -0.29 0.11
0.25 0.33 -0.31 0.16 -0.14 0.37 0.46 -0.16 0.57 0.61 0.12 0.3 -0.56 -0.41 -0.79 -0.73 -1.3 0.36 0.5 -1.71 -0.23 0.36 -0.37 -0.06 -2.04 -1.15 -1.21 0.05 -0.38 -0.03 0.34 -0.07 0.53 0.71 0.78
-1.03 -0.15 -0.69 -0.03 0.44 -0.6 0.45 -0.38 -0.01 -0.2 1.19 0.88 -1.39 0.89 -2.73 -1.65 -2.42 -1.0 -0.74 -1.4 0.24 1.9 -0.06 -1.12 -2.77 -1.64 -2.53 -1.25 -0.59 0.12 -1.37 0.63 1.16 1.74 -0.24
0.18 0.24 -0.02 0.26 -0.16 0.14 0.11 -0.19 -0.02 0.17 0.4 0.66 -0.24 -0.08 -1.85 -1.37 -4.09 -0.03 0.07 -0.99 0.73 0.99 0.56 -0.38 -1.3 -1.18 -1.27 -0.36 -0.6 0.2 0.0 0.38 0.47 0.47 0.73
-0.2 0.1 -0.26 0.42 -0.55 0.02 0.83 -0.14 0.24 0.39 0.76 0.68 -0.21 -0.3 -0.73 -0.4 -2.53 0.42 0.53 -0.59 0.36 0.79 0.14 0.16 -1.76 -1.47 -2.24 -0.92 -1.22 0.24 -0.29 0.53 0.25 0.8 -0.65
-0.33 -0.38 -0.79 -0.61 -0.33 0.1 -0.37 -0.15 0.38 -0.2 1.08 0.11 -0.6 0.14 -0.8 -0.3 -3.31 -0.05 0.46 -1.21 0.37 0.69 0.29 0.84 0.5 -0.42 -0.25 0.66 -1.08 -0.06 0.26 -1.15 -0.01 -0.41 0.96
-0.38 0.4 -0.58 -0.01 -0.16 0.52 0.49 -0.66 0.44 0.32 1.55 0.86 -0.62 -1.07 0.22 -1.55 0.12 0.25 0.75 -1.46 0.44 0.92 0.11 -0.48 -2.17 -1.87 -3.07 -0.78 -1.68 -1.1 -0.46 -1.82 0.98 0.52 0.2
-0.02 0.28 -0.23 0.11 0.1 0.41 0.43 -0.64 0.67 0.49 0.12 0.35 -0.34 -0.43 -0.57 -1.07 -2.61 -0.28 0.17 -1.6 0.67 1.24 0.17 -0.62 -1.99 -0.59 -1.07 -0.14 -0.45 -0.67 -1.21 -0.0 0.5 0.85 0.97
0.35 0.28 0.05 0.05 -0.2 0.59 0.2 -0.02 0.61 0.46 0.18 0.48 -0.84 -0.24 -1.37 -1.11 -2.37 0.29 0.51 -1.75 -0.08 0.63 -0.52 -0.39 -1.57 -0.34 0.3 0.01 -0.11 0.16 -0.16 0.38 0.44 0.22 0.02
-0.26 0.35 -0.47 0.02 -0.17 0.08 0.43 -0.35 0.42 0.51 0.36 0.74 -0.96 0.33 -0.73 -1.57 -1.41 -0.71 -0.64 -1.33 0.55 1.46 0.55 0.24 -1.87 -2.67 -2.46 0.64 -1.07 -0.04 -0.87 -0.31 0.74 0.68 0.6
0.03 0.27 -0.17 0.08 -0.19 -0.18 0.23 -0.55 0.24 0.38 0.7 1.16 -1.25 -0.4 -0.06 -0.44 -0.59 0.07 0.12 -0.97 0.17 1.31 -0.27 -0.33 -2.61 -1.28 -1.72 0.07 -1.66 -0.16 -0.5 0.1 1.24 0.72 -0.93
-0.78 -0.25 -0.99 -0.17 -0.5 -0.37 0.14 -1.06 0.01 -0.05 1.3 1.51 -0.14 1.15 -1.53 -1.02 -2.82 -0.14 0.25 -1.47 0.09 0.35 -0.16 -0.72 -0.62 -1.65 -0.24 0.17 -0.82 -0.7 -1.09 -0.25 1.5 -0.19 1.2
-0.17 -0.15 -0.42 0.1 -0.35 -0.13 0.64 -0.64 0.25 0.46 0.23 0.19 -0.18 0.71 -1.16 -0.87 -1.83 -0.06 -0.17 -0.37 1.09 1.4 0.55 -0.1 -2.02 -1.47 -1.89 0.52 -0.43 -0.57 -0.69 -0.47 0.23 0.01 0.84
-0.17 0.2 -0.41 0.05 0.0 -0.03 0.2 -0.81 0.15 0.18 0.16 0.5 -0.73 0.02 -0.62 -0.78 -0.72 0.1 0.44 -1.43 1.0 0.97 0.37 -0.02 -1.39 -1.27 -1.79 0.28 -1.19 0.12 -0.77 0.62 0.57 0.0 0.81
0.23 0.13 0.29 0.21 -0.21 0.33 0.3 0.19 0.42 0.61 0.47 0.56 -1.69 -1.78 -0.16 -0.9 -0.81 0.19 0.46 -1.22 -0.89 0.42 -0.9 0.02 -1.92 -0.85 -1.18 0.88 -0.13 0.09 -0.19 0.1 0.71 0.32 0.33
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-0.15 0.0 -0.41 0.1 0.08 0.0 0.17 -0.31 0.08 0.11 0.2 0.52 -0.81 0.55 -0.5 -1.23 -0.91 -0.47 -0.06 -1.46 0.77 1.48 0.8 -0.31 -1.67 -1.55 -2.02 0.09 -1.3 0.2 -0.34 0.78 0.35 0.85 -0.61
0.7 0.48 0.49 0.25 0.18 0.54 0.17 0.04 0.56 0.73 -0.06 0.33 -1.43 -0.98 -0.63 -0.5 -1.13 -0.11 -0.22 -1.53 0.82 0.86 0.57 0.5 -1.94 -2.41 -3.13 0.34 -1.86 -0.33 -0.53 -0.42 0.09 0.67 -0.01
-0.17 -0.01 -0.26 -0.07 -0.31 -0.13 0.25 -0.8 -0.01 0.27 0.8 1.0 -1.73 -0.58 -0.07 -0.67 -0.07 0.29 0.45 -0.92 0.29 1.25 0.2 -0.09 -1.4 -2.95 -3.23 0.38 -0.58 -0.09 -0.68 0.33 0.93 0.61 -0.41
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-0.05 0.09 0.07 0.31 -0.79 -0.29 0.34 -0.43 0.12 0.4 0.72 1.15 -1.36 0.13 -0.73 -0.77 -1.21 0.28 0.07 -0.78 0.08 0.69 -0.08 -0.32 -1.52 -0.89 -1.9 0.64 -1.77 -0.14 -0.7 0.25 1.25 0.35 0.32
0.21 0.02 0.03 0.07 0.12 0.44 0.23 -0.48 0.59 0.33 1.18 0.85 -0.49 -0.84 -0.68 -1.38 -0.31 0.37 0.36 -1.57 0.72 0.53 0.18 -0.76 -1.71 -2.35 -2.75 0.5 -1.46 -1.05 -0.92 -1.0 0.87 0.77 0.4
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-0.24 0.11 -0.46 0.03 -0.2 -0.34 0.28 -0.97 -0.15 0.11 1.13 1.05 -0.94 0.37 -1.06 -1.11 -3.66 0.13 -0.1 -0.76 0.49 1.33 0.67 -1.01 -0.49 -0.23 -0.64 0.96 -1.6 -0.3 -0.33 0.03 0.79 -0.59 -0.39
0.16 0.07 -0.34 0.06 -0.34 0.24 0.37 -0.45 0.21 0.32 0.43 0.72 -0.69 -0.63 -0.93 -1.24 -3.15 -0.12 0.06 -0.77 0.46 1.43 0.25 0.9 -1.28 -1.88 -1.61 0.07 -0.91 0.05 -0.75 0.42 0.49 0.57 0.21
0.15 0.24 -0.14 0.05 -0.23 0.27 0.38 -0.84 0.48 0.61 0.58 0.4 -1.34 -2.09 0.18 0.06 -2.07 0.32 1.13 -0.59 -0.11 0.44 0.05 -0.73 -2.7 -1.17 -1.56 0.92 -1.44 -1.23 -1.59 -0.68 0.55 1.57 0.05
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0.22 0.39 -0.07 0.17 -0.47 0.13 0.35 -0.17 0.09 0.26 0.55 0.78 -0.76 0.01 -0.78 -0.94 -1.56 -0.17 -0.34 -1.16 0.46 0.65 0.17 0.29 -0.59 -2.2 -2.61 -0.36 -0.77 0.61 -0.18 0.71 0.65 0.4 0.3
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.