Heatmap: Cluster_82 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4h after treatment
4h after treatment,No nitrate
8h after treatment
8h after treatment,No nitrate
20C
20h after treatment
20h after treatment,No nitrate
20h after treatment,Nocodazole added
36h after treatment
36h after treatment,No phosphate
Blue light,10min after light change
Blue light,60min after light change
Bohlin
CCAP1055/1,20C
CCAP1055/1,20C,High CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Low CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Normal CO2,OligoDT primed
CCMP2561
CCMP2561 Nitrase Reductase Knockout
CCMP632
CCMP632,24h
CCMP632,48h
CCMP632,72h
CCMP632,High light acclimated WT
CCMP632,Low light acclimated WT
NEPCC640,8h,1000ppmv CO2
NEPCC640,8h,390 ppmv CO2
No light,8h after treatment
Pt-1
Pt-1 8.6
Pt-1 8.6,With nitrogen
Pt-1 8.6,Without nitrogen
Red light,0min before light change
UTEX 646,Blue light
UTEX 646,No light
-1.89 -0.58 -2.55 -1.9 -1.85 -1.8 -1.46 -1.57 -1.77 -2.14 -0.79 -0.03 -0.09 - -0.71 -4.2 -2.75 0.56 2.31 -4.88 1.34 2.05 0.37 -0.51 -2.68 -2.55 -3.39 -3.23 -0.57 1.65 1.23 1.74 -1.33 1.55 -
1.35 0.76 0.24 -0.09 -0.37 0.97 -0.04 0.78 0.54 0.49 -1.0 -1.12 -2.0 -2.89 0.33 -1.2 -0.5 -0.48 0.43 -1.06 -1.62 -0.58 -2.75 0.34 -2.74 0.65 0.82 -1.76 -0.94 0.84 0.96 0.09 -0.93 0.64 -1.09
-0.39 0.25 -0.29 0.66 -0.39 0.16 1.23 -0.17 0.79 0.73 -0.73 -0.47 -1.08 0.06 -1.33 -1.08 -1.47 -0.08 0.46 -0.61 -1.48 -0.31 -1.34 1.02 -1.55 -0.48 0.06 -0.27 -0.23 1.01 0.75 0.94 -0.38 -0.31 -0.86
-0.17 0.65 0.23 0.99 -0.24 0.28 0.84 2.17 0.21 0.46 -1.94 -1.57 -1.12 -0.87 -0.95 -0.46 -0.61 -0.16 0.78 -0.72 -0.13 0.34 -0.12 -0.04 -1.08 -0.87 -1.48 -0.45 -0.61 0.21 0.19 0.16 -1.64 -0.36 -1.29
0.58 -0.1 -0.1 -0.37 -0.73 0.84 0.36 0.13 0.14 0.34 -0.72 -0.54 -1.2 -1.07 0.29 -1.12 0.05 0.18 0.31 -1.71 -0.47 0.6 -0.67 -0.1 -1.66 -0.76 -0.87 -0.5 -1.92 1.29 0.65 1.43 -0.57 1.08 -1.2
-0.27 0.38 -0.2 0.68 -0.32 0.53 0.87 -0.16 0.42 0.5 -0.84 -0.9 -0.01 0.58 -1.02 -1.17 -2.07 -0.09 0.21 -0.12 -0.51 0.01 -0.77 -0.05 -0.97 1.09 0.23 -0.98 -0.96 1.06 0.26 1.1 -1.04 -0.67 -1.93
0.38 0.6 0.37 0.79 -0.61 0.38 0.63 1.07 0.38 0.5 -1.18 -1.04 0.06 -1.59 -0.2 -0.2 -0.88 -0.0 0.4 -0.36 -0.29 -0.44 -0.93 0.61 -1.29 0.53 -0.38 -0.57 -0.51 0.2 0.47 -0.15 -0.8 -0.23 -0.51
0.37 0.18 -0.01 0.05 -0.37 0.82 0.17 0.43 0.41 0.55 -0.55 -0.39 -2.71 -1.81 -0.02 -2.71 -0.49 0.06 0.83 -1.63 -0.91 -0.03 -1.65 0.01 -1.03 -0.65 -0.28 -1.78 -1.12 1.47 1.21 1.31 -0.57 0.75 -1.3
0.7 0.78 0.03 0.64 -0.64 -0.2 0.66 -0.36 -0.45 -0.17 0.14 0.42 -0.77 -1.47 -0.1 -1.07 0.08 0.15 0.39 -1.13 -0.72 -0.07 -1.0 -0.88 -2.31 -2.21 -2.3 0.62 -0.55 0.23 -0.78 0.79 0.22 1.22 1.28
-0.2 -0.26 -1.02 -0.18 -0.08 -0.47 0.15 -0.28 -0.42 -0.12 0.2 0.52 0.4 0.76 -0.68 -1.27 -0.39 0.18 0.78 0.06 -0.69 -0.26 -0.32 -0.47 -1.95 -0.75 -0.85 0.14 0.08 0.16 -1.1 0.59 0.42 1.65 0.33
0.09 0.63 0.07 0.29 -0.48 0.13 0.15 0.11 0.09 0.29 -0.24 0.07 -0.42 -1.54 -1.58 -1.33 -3.25 -0.15 0.45 -0.61 -0.03 0.64 -0.72 -0.23 -1.34 -0.51 1.25 0.32 0.23 0.5 0.42 0.3 0.1 0.41 -0.29
-0.44 0.07 -0.98 -0.08 -0.46 -0.38 0.55 -0.67 0.03 0.02 0.19 0.36 -1.22 -0.17 -1.59 -1.72 -1.49 -0.16 0.53 -0.57 -1.17 0.27 -1.92 1.17 -0.78 -0.53 -0.18 -0.71 -0.37 1.42 0.93 1.45 0.17 0.36 -0.1
0.89 0.17 0.19 -0.2 -0.93 0.47 -0.02 1.07 -0.11 -0.14 -0.89 -1.16 0.2 -1.3 -0.04 -0.46 -0.9 0.2 0.29 -1.98 -1.82 -1.14 -2.36 1.29 -1.24 0.37 0.0 -2.18 -0.91 1.09 1.26 0.26 -0.85 1.16 -1.25
0.1 0.35 -0.39 -0.17 -0.88 0.11 0.06 0.43 -0.21 0.06 0.01 0.62 0.36 0.46 -1.37 -1.05 -2.7 0.65 0.69 -1.89 -1.82 -0.24 -2.01 -0.98 -2.98 -1.35 -0.84 0.55 0.32 0.65 0.19 0.92 0.24 1.88 -1.87
-0.48 0.08 -0.68 0.13 -0.0 0.0 1.05 -0.36 0.34 0.17 -0.39 0.14 0.37 0.69 -0.56 -0.78 0.21 0.23 0.33 -1.11 -2.36 -1.28 -2.08 -0.19 -1.96 -1.02 -0.81 -0.03 -0.3 0.93 -0.54 1.51 0.15 0.81 0.11
0.63 0.11 0.18 -0.2 -0.19 0.61 0.14 0.23 0.14 0.21 -1.17 0.15 -1.49 -0.27 -1.34 -1.31 -1.69 0.3 0.47 -0.58 -1.39 -0.46 -1.32 -0.87 -2.02 -0.79 0.11 -2.31 1.14 0.78 0.29 1.5 -0.6 1.72 -2.23
-0.03 0.22 -0.21 0.23 -0.06 0.3 0.55 0.28 0.53 0.5 -0.56 0.01 -0.61 -0.48 -1.25 -1.23 -1.54 -0.34 0.24 -1.29 0.4 0.68 -0.53 0.03 -1.02 -1.28 -1.25 0.22 0.67 0.23 0.02 0.86 -0.09 0.28 0.66
0.07 -0.35 -0.68 -0.34 0.15 0.24 0.11 -0.56 0.31 0.05 -0.51 -0.39 0.14 -0.49 -0.52 -1.3 -0.77 -0.17 0.15 -0.99 -0.72 0.42 -1.13 1.59 -0.57 -0.05 -0.11 -0.67 -0.97 0.97 0.67 0.35 -0.19 0.74 0.55
0.43 0.23 0.3 0.07 -0.35 0.53 -0.06 -0.06 0.32 0.22 -0.57 -0.26 -0.63 -1.84 0.22 -0.89 0.07 -0.3 0.18 -0.3 -0.34 0.03 -0.97 1.06 -1.08 -1.1 -1.42 -0.46 -1.07 0.44 0.03 0.38 -0.19 0.77 1.32
0.8 0.61 0.85 0.25 0.14 0.7 0.89 -0.19 0.64 0.55 -0.65 -0.06 0.01 -0.4 -1.93 -2.51 -2.01 0.35 0.19 -2.86 -0.83 0.23 -0.83 -0.04 -2.07 -2.32 -1.52 0.16 -1.68 0.75 -0.26 1.5 -0.62 0.89 -1.74
0.4 0.34 0.01 0.21 -0.0 0.47 0.15 1.09 0.13 0.17 -1.19 -0.83 -0.34 -1.24 -0.6 -0.79 -2.26 0.04 0.23 -0.66 0.07 -0.03 -0.63 0.26 -0.37 -0.42 -0.41 0.2 -0.15 0.61 0.59 0.63 -0.88 0.27 0.48
1.27 1.06 0.69 0.62 -0.88 0.88 0.74 2.74 -0.48 -0.28 -2.97 -0.96 -3.25 -0.21 -1.08 -2.02 -1.93 0.49 0.79 -3.56 -1.04 -0.33 -2.32 -1.23 -2.45 -2.95 -2.66 -4.21 -2.07 0.7 -0.35 1.41 -2.6 0.44 -6.74
-0.14 0.02 -0.53 -0.1 -0.64 -0.12 -0.02 -0.43 -0.03 -0.05 0.1 0.45 1.25 0.08 -0.84 -1.15 -1.25 0.22 0.37 -0.54 -0.16 0.36 -0.45 -0.05 -0.94 -1.1 -1.2 0.04 0.1 0.24 -0.42 0.66 0.29 1.24 0.33
0.63 0.63 0.13 0.44 -0.09 0.59 0.42 0.32 0.49 0.39 -0.73 -0.28 -1.73 -0.52 -1.44 -1.45 -2.13 -0.22 0.31 -1.27 -1.12 -0.1 -1.17 0.6 -1.72 -0.13 0.5 -0.72 -0.67 1.0 0.99 0.8 -0.38 1.0 -3.64
0.32 0.57 0.0 0.47 -0.4 0.67 0.75 -0.05 0.53 0.6 0.33 0.62 -0.26 -0.24 -0.71 -1.26 -0.8 0.19 0.41 -1.38 -2.36 -0.64 -1.86 -0.56 -3.46 -1.14 -0.95 -0.82 -0.38 0.53 -0.48 1.2 0.45 1.54 -3.98
0.43 -0.22 -0.04 -0.51 -0.46 0.21 -0.25 0.38 0.24 -0.15 0.29 0.07 0.28 -1.29 -1.15 -0.67 -2.67 -0.03 -0.16 -1.77 0.22 0.27 0.04 0.09 -0.77 -0.23 -0.13 0.76 -0.63 0.77 0.68 0.58 0.16 0.73 -0.04
-0.08 -0.41 -1.09 -0.99 -1.0 -0.1 -0.02 -0.42 -0.11 0.11 -0.16 0.03 0.48 -0.02 -1.41 -1.72 -1.25 -0.38 0.01 -0.78 -1.84 -0.41 -1.63 0.85 -1.39 -1.38 -1.17 -0.46 0.43 1.11 0.67 1.08 0.29 1.69 1.4
-0.25 -0.6 -0.81 -0.31 0.09 0.1 -0.01 -0.02 0.24 0.2 -0.8 -0.0 -0.81 -0.28 -1.72 -0.45 -1.51 -0.11 -0.56 -0.16 -2.43 -0.65 -2.62 -0.22 -2.42 0.28 0.53 -1.21 1.0 1.53 0.33 2.02 -0.5 1.35 -1.85
0.22 0.33 0.3 0.17 -0.16 0.34 0.13 0.24 0.09 0.13 -1.22 -0.93 -0.81 -1.53 0.61 -0.0 0.52 0.0 0.28 -0.09 -0.65 0.13 -0.98 1.19 -1.75 -0.09 -0.25 -1.78 -1.33 1.05 0.91 0.3 -0.96 0.38 -1.58
0.23 0.45 -0.14 0.39 0.29 0.42 0.77 -0.19 0.46 0.46 -1.36 -0.88 -0.02 0.05 -1.43 -1.59 -3.03 0.1 -0.2 -0.76 0.12 0.36 -0.22 0.07 -1.68 -0.59 -0.71 -0.23 -0.17 1.04 -0.13 1.64 -1.2 0.58 -1.23
0.15 0.33 -0.24 0.23 0.09 0.42 0.45 -0.25 0.21 0.31 -0.1 0.26 -0.17 -0.26 -1.37 -1.65 -0.81 0.19 0.35 -1.1 -0.05 0.49 -0.67 -0.43 -1.68 -1.74 -1.55 -0.42 -0.64 0.93 -0.37 1.62 0.06 0.99 -0.43
0.18 0.24 -0.25 -0.03 -0.46 0.2 0.04 0.28 -0.06 0.18 -0.8 -0.44 -0.52 -1.21 -0.91 -1.29 -1.34 -0.08 0.54 -0.97 -2.01 -0.84 -2.3 0.86 -1.89 -0.0 0.29 -0.28 -0.04 1.61 0.88 1.67 -0.33 0.3 -0.39
-0.34 -0.3 -0.5 -0.38 0.17 -0.09 0.13 -0.05 0.26 0.16 -0.34 0.49 0.15 0.44 -0.01 -1.4 0.44 0.09 0.37 -1.43 -4.1 -1.47 -3.26 0.25 -1.09 -0.07 -0.14 -1.62 -0.76 1.13 0.58 1.31 0.01 1.49 -1.28
0.95 0.06 0.41 -0.3 -0.36 1.12 -0.4 0.38 0.65 0.43 -2.16 -1.81 -2.93 -1.93 0.82 -0.49 0.8 0.3 0.73 -2.69 -0.48 -0.34 -1.05 0.71 -1.2 -0.59 -0.81 -1.84 -1.19 0.97 0.69 1.22 -2.38 0.64 -3.13
-0.13 -0.38 -0.86 -0.59 -0.66 -0.19 -0.17 -0.13 -0.2 -0.18 -0.19 0.06 -0.56 -1.43 -1.4 -1.53 -1.43 -0.36 0.28 -1.32 -1.31 0.02 -1.52 1.17 -1.23 -0.96 -0.42 -0.73 -0.04 1.42 1.11 1.15 0.08 1.04 1.66
0.81 0.48 0.75 0.08 -1.0 0.23 -0.71 1.38 -1.06 -0.41 -0.85 -0.65 -1.94 -0.92 -0.85 -1.17 -1.85 -0.0 0.09 -1.26 -0.29 0.49 -1.47 1.29 -1.69 -0.65 -0.47 -3.36 -0.26 1.24 1.32 0.79 -0.48 0.86 -1.02
0.51 0.24 0.33 0.15 -0.74 0.02 -0.32 0.39 0.04 -0.03 -0.18 0.12 -1.51 -1.28 -0.15 0.04 -1.58 0.35 0.6 -1.6 -0.39 -0.19 -1.02 0.13 -1.7 0.21 -0.29 0.6 -0.57 0.45 0.24 0.55 0.26 0.97 0.4
-0.74 0.06 -0.47 0.16 -0.18 -0.36 0.26 -0.15 0.06 -0.03 -0.67 -0.21 -0.39 -0.34 -1.67 -1.47 -1.11 -0.45 1.04 -0.32 -0.12 0.35 -1.31 0.87 -0.83 -0.93 -1.01 -0.6 0.36 0.96 0.28 1.3 -0.15 0.19 1.22
0.05 -0.09 -0.25 -0.2 -0.28 0.4 -0.18 -0.08 0.32 0.31 -0.15 -0.09 -0.86 -0.49 -1.13 -0.93 -3.19 0.09 0.1 -1.07 -0.15 0.18 -0.67 0.62 -1.07 -0.04 0.46 -0.83 -1.03 1.1 0.81 1.25 -0.16 0.82 0.06
-0.06 0.19 -0.29 0.26 -1.13 0.3 0.44 0.54 -0.02 0.17 -1.21 -0.44 -3.4 -0.46 -0.86 -1.72 -2.3 0.08 0.33 -1.68 0.29 0.8 -0.83 0.36 -2.56 -0.72 1.21 -2.36 -0.3 1.15 1.03 0.94 -1.0 1.34 -0.96
-0.34 -0.39 -0.72 -0.3 -0.86 0.09 0.28 0.05 0.09 -0.02 -1.56 -1.68 -0.93 -1.92 0.09 -0.5 0.09 0.31 0.78 -0.53 -1.32 -0.41 -2.45 1.02 -1.56 -1.56 -0.71 -1.38 -0.53 1.6 1.06 1.67 -0.87 0.56 1.08
0.16 -0.18 -0.28 -0.45 -0.03 0.46 -0.5 -0.48 0.52 0.32 -0.5 -0.27 -0.67 -1.16 -0.69 -1.36 -0.14 -0.23 0.62 -1.01 -2.05 -1.09 -2.37 0.62 -0.17 -0.3 1.1 -0.4 -0.14 0.9 0.55 0.95 -0.39 1.02 0.66
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-0.24 -0.46 -0.16 -0.42 0.08 -0.21 -0.24 -0.01 0.02 -0.06 -0.78 -0.53 -2.33 -0.66 -0.22 -1.11 0.41 -0.16 0.25 -0.46 -0.86 0.13 -2.28 1.01 -1.19 -0.01 -0.1 -1.18 -0.72 1.16 0.84 1.09 -0.4 1.02 1.18
0.15 0.2 0.23 -0.0 -0.36 0.11 -0.13 0.14 -0.47 -0.13 -0.13 0.08 -0.85 0.59 -1.29 -1.25 -0.78 0.18 0.51 -0.27 -0.37 0.35 -0.87 0.03 -1.62 -1.43 -1.32 -0.5 -0.01 0.7 -0.26 1.21 -0.27 1.54 0.4
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0.52 0.55 0.07 -0.11 -0.16 0.44 -0.17 -0.33 -0.27 0.14 -0.37 -0.11 -0.82 -1.52 0.1 -0.34 0.1 -0.06 0.08 -0.88 -0.0 0.29 -0.76 1.16 -0.38 -0.29 -0.48 -0.25 -0.54 0.87 0.86 0.49 -0.27 -0.11 -1.09
0.37 0.31 -0.18 0.11 -0.32 0.42 0.17 0.18 0.55 0.55 -0.66 0.08 -0.96 -1.79 -0.12 0.07 0.2 0.19 0.37 -1.26 -0.12 -0.08 -0.49 0.0 -1.11 -0.1 -0.26 0.73 0.02 0.2 -0.08 0.19 -0.4 0.94 -1.76
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0.46 -0.21 -0.11 -0.33 0.5 0.89 0.59 0.11 0.9 0.6 -2.27 -3.27 -2.23 -1.88 0.24 -0.85 -1.24 -0.24 0.39 0.4 -0.08 0.33 -0.65 1.0 -0.32 0.49 0.48 -1.25 -0.7 0.9 1.14 0.3 -2.61 -2.42 -2.05
-0.62 0.8 -0.63 1.0 -0.51 -0.14 1.68 -0.16 0.35 0.49 -2.5 -2.15 0.64 -1.28 -1.65 -1.41 -0.65 -0.14 -0.08 0.43 -2.18 -2.06 -2.64 0.06 -0.35 -2.49 -2.05 -0.29 -0.02 1.48 0.05 2.02 -2.06 -0.34 0.13
-0.11 0.24 -0.11 0.34 -0.55 -0.1 0.43 0.53 0.04 0.17 -0.17 0.15 0.34 -0.26 -0.89 -0.94 -1.05 0.23 0.88 -0.3 -3.22 -1.41 -3.4 -0.11 -0.99 -0.15 0.2 -0.02 0.34 0.59 0.18 0.69 0.45 0.78 0.03
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-0.45 0.1 -0.35 -0.14 -0.24 -0.1 0.06 -0.46 -0.2 -0.15 -1.46 -0.98 -1.02 0.15 0.64 -0.16 0.97 0.16 1.31 -0.83 -0.07 0.3 -0.34 0.19 -0.76 -0.7 -1.22 -0.88 -1.05 1.28 0.92 1.15 -1.34 0.07 -1.4
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0.44 0.56 0.41 0.5 -0.24 0.48 0.32 0.01 0.56 0.6 -0.85 -0.64 -0.94 -2.52 -0.5 -0.47 -2.16 0.06 0.52 -0.55 -1.12 -0.37 -1.57 0.83 -0.54 0.05 0.29 -0.21 -0.79 0.41 0.91 -0.52 -0.36 0.6 0.38
0.14 0.97 0.0 0.95 -0.57 0.78 1.36 0.76 0.93 1.02 -0.54 -0.39 -0.48 -0.73 -2.37 -0.99 -3.21 -0.07 0.55 -1.06 -1.15 -0.02 -1.11 -0.02 -1.04 -2.35 -4.45 0.55 0.6 -0.06 -0.55 0.75 0.05 -0.27 -2.49
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0.22 0.31 0.01 0.1 -0.35 0.37 0.29 -0.08 0.39 0.29 0.11 0.54 0.68 -0.34 -0.39 -1.33 -0.08 0.34 0.45 -0.8 -3.4 -1.51 -3.95 0.1 -1.65 -1.2 -0.99 -0.67 -0.43 0.57 0.01 0.71 0.57 1.37 0.11
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-0.24 -0.27 -0.47 -0.34 0.0 0.03 0.18 -0.65 0.37 0.12 -0.84 -0.28 -1.19 -1.43 0.07 -0.48 0.19 -0.26 0.31 0.54 -0.79 -0.35 -0.11 0.51 -1.45 -0.2 0.12 -0.27 0.24 1.04 0.41 1.41 -0.4 0.59 -0.57
-0.53 0.27 -0.68 0.64 -0.57 0.0 1.09 -0.05 0.31 0.21 -0.31 -0.14 -1.28 -0.16 -1.52 -1.55 -2.32 -0.26 0.37 -1.36 -1.15 -0.12 -1.83 -0.16 -1.67 0.26 0.47 -0.15 -1.6 1.3 0.74 0.93 0.11 1.03 0.57

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.