1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_89 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
4h after treatment
4h after treatment,No nitrate
8h after treatment
8h after treatment,No nitrate
20C
20h after treatment
20h after treatment,No nitrate
20h after treatment,Nocodazole added
36h after treatment
36h after treatment,No phosphate
Blue light,10min after light change
Blue light,60min after light change
Bohlin
CCAP1055/1,20C
CCAP1055/1,20C,High CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Low CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Normal CO2,OligoDT primed
CCMP2561
CCMP2561 Nitrase Reductase Knockout
CCMP632
CCMP632,24h
CCMP632,48h
CCMP632,72h
CCMP632,High light acclimated WT
CCMP632,Low light acclimated WT
NEPCC640,8h,1000ppmv CO2
NEPCC640,8h,390 ppmv CO2
No light,8h after treatment
Pt-1
Pt-1 8.6
Pt-1 8.6,With nitrogen
Pt-1 8.6,Without nitrogen
Red light,0min before light change
UTEX 646,Blue light
UTEX 646,No light
0.42 0.54 0.32 0.53 0.4 0.49 0.73 0.32 0.46 0.55 0.35 0.4 0.17 0.31 0.1 0.14 0.05 0.34 0.4 0.2 0.45 1.0 0.59 0.4 0.24 0.23 0.36 0.24 0.36 0.84 0.4 0.77 0.43 0.43 0.13
0.27 0.7 0.31 0.57 0.2 0.34 0.44 0.44 0.28 0.58 0.38 0.51 0.19 0.2 0.09 0.16 0.06 0.17 0.25 0.19 0.55 0.88 0.13 0.26 0.02 0.2 1.0 0.22 0.28 0.55 0.43 0.31 0.5 0.43 0.26
0.26 0.37 0.28 0.52 0.29 0.36 0.38 0.57 0.35 0.37 0.27 0.33 0.25 0.33 0.12 0.2 0.07 0.21 0.23 0.2 0.41 0.57 0.45 0.32 0.16 0.48 1.0 0.39 0.26 0.48 0.6 0.34 0.33 0.21 0.23
0.48 0.85 0.4 0.77 0.56 0.82 0.96 0.41 0.86 1.0 0.6 0.62 0.44 0.24 0.39 0.3 0.55 0.46 0.45 0.5 0.64 0.53 0.5 0.32 0.14 0.72 0.39 0.36 0.27 0.39 0.45 0.39 0.78 0.35 0.22
0.35 0.64 0.42 0.64 0.36 0.5 0.55 1.0 0.41 0.56 0.35 0.44 0.09 0.41 0.12 0.22 0.04 0.45 0.44 0.24 0.51 0.67 0.57 0.31 0.26 0.21 0.53 0.27 0.31 0.63 0.59 0.52 0.41 0.23 0.21
0.15 0.32 0.23 0.27 0.1 0.11 0.2 0.25 0.09 0.21 0.48 0.42 1.0 0.24 0.03 0.05 0.04 0.15 0.25 0.27 0.1 0.18 0.04 0.25 0.08 0.09 0.11 0.01 0.41 0.22 0.2 0.32 0.25 0.4 0.47
0.24 0.53 0.28 0.66 0.5 0.53 1.0 0.3 0.78 0.72 0.5 0.52 0.73 0.92 0.19 0.18 0.32 0.36 0.46 0.73 0.22 0.29 0.33 0.48 0.25 0.3 0.18 0.33 0.41 0.34 0.23 0.42 0.58 0.67 0.5
0.64 0.76 0.55 0.81 0.5 0.71 0.85 0.36 0.67 0.82 0.39 0.51 0.57 0.35 0.34 0.24 0.28 0.38 0.5 0.74 0.16 0.26 0.11 0.61 0.22 0.47 0.31 1.0 0.4 0.31 0.29 0.42 0.62 0.59 0.64
0.3 0.3 0.29 0.33 0.4 0.42 0.39 0.32 0.5 0.47 0.6 0.81 0.94 0.5 0.22 0.24 0.14 0.5 0.51 0.53 0.43 0.47 0.4 0.44 0.41 0.16 0.21 0.49 0.33 0.67 0.35 0.9 0.61 0.58 1.0
0.11 0.16 0.12 0.24 0.19 0.21 0.21 0.24 0.27 0.24 0.17 0.22 0.3 0.21 0.09 0.15 0.06 0.22 0.23 0.16 0.45 0.42 0.33 0.22 0.08 0.32 1.0 0.22 0.13 0.25 0.28 0.19 0.22 0.24 0.12
0.4 0.4 0.35 0.42 0.45 0.47 0.52 0.53 0.53 0.59 0.47 0.56 0.5 0.64 0.19 0.17 0.17 0.34 0.5 0.5 0.46 1.0 0.33 0.38 0.15 0.11 0.11 0.44 0.38 0.65 0.54 0.48 0.52 0.36 0.47
0.2 0.3 0.25 0.51 0.26 0.34 0.69 0.24 0.45 0.47 0.24 0.27 0.46 1.0 0.18 0.12 0.21 0.42 0.51 0.49 0.08 0.15 0.08 0.26 0.16 0.15 0.09 0.63 0.42 0.23 0.11 0.38 0.25 0.33 0.59
0.1 0.24 0.27 0.42 0.08 0.16 0.36 0.24 0.29 0.27 0.37 0.15 0.29 0.3 0.05 0.18 0.03 0.22 0.39 0.23 0.56 0.29 0.18 0.15 0.07 0.04 0.06 0.24 0.33 0.16 0.08 0.26 0.09 0.31 1.0
0.16 0.28 0.19 0.26 0.15 0.2 0.23 1.0 0.16 0.26 0.24 0.27 0.05 0.12 0.1 0.22 0.06 0.18 0.25 0.17 0.26 0.59 0.16 0.24 0.08 0.39 0.62 0.06 0.09 0.25 0.47 0.14 0.22 0.22 0.27
0.25 0.21 0.31 0.2 0.21 0.25 0.12 0.59 0.19 0.22 0.42 0.26 0.07 0.24 0.23 0.16 0.27 0.16 0.25 0.07 0.29 0.32 0.19 0.5 0.37 0.4 1.0 0.29 0.32 0.45 0.6 0.25 0.26 0.4 0.32
0.23 0.22 0.18 0.18 0.48 0.33 0.17 0.13 0.35 0.21 0.51 0.5 0.07 0.09 0.38 0.26 0.57 0.21 0.35 0.09 1.0 0.66 0.85 0.12 0.13 0.14 0.09 0.64 0.1 0.06 0.06 0.08 0.52 0.33 0.3
0.22 0.36 0.13 0.33 0.84 0.29 0.47 0.11 0.43 0.43 0.75 0.8 0.65 0.59 0.58 0.48 0.93 0.38 0.48 0.49 0.33 0.83 0.37 0.16 0.15 0.16 0.11 0.59 0.22 0.23 0.21 0.27 0.84 0.28 1.0
0.0 0.0 0.01 0.01 0.14 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.25 0.15 0.4 0.37 0.01 0.12 0.0 0.07 0.07 0.12 0.28 0.22 1.0 0.03 0.08 0.03 0.01 0.02 0.33 0.02 0.02 0.02 0.0 0.11 0.01
0.22 0.27 0.26 0.31 0.26 0.3 0.37 0.39 0.33 0.35 0.56 0.82 0.38 0.43 0.12 0.08 0.13 0.17 0.32 0.29 0.03 0.11 0.03 0.41 0.07 0.44 1.0 0.13 0.46 0.31 0.4 0.19 0.67 0.21 0.33
0.29 0.39 0.33 0.38 0.7 0.47 0.44 0.35 0.29 0.41 0.59 0.99 0.42 0.91 0.28 0.15 0.6 0.31 0.38 0.46 0.15 0.23 0.14 0.63 0.78 0.57 0.57 0.24 0.69 0.87 0.55 1.0 0.67 0.89 0.6
0.17 0.68 0.07 0.43 0.08 0.42 0.64 0.16 1.0 0.24 0.07 0.06 0.03 0.2 0.03 0.07 0.01 0.53 0.15 0.55 0.16 0.13 0.1 0.04 0.04 0.07 0.06 0.06 0.88 0.24 0.07 0.49 0.07 0.1 0.01
0.4 0.42 0.31 0.36 0.86 0.46 0.37 0.32 0.59 0.54 0.57 0.53 0.12 0.29 0.41 0.14 0.38 0.14 0.24 0.31 0.16 0.91 0.26 0.25 0.18 0.1 0.14 1.0 0.38 0.29 0.32 0.3 0.59 0.27 0.31
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 1.0 0.0 0.01 0.02 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0
0.15 0.08 0.04 0.11 0.16 0.12 0.13 0.09 0.12 0.17 0.66 0.73 0.02 0.28 0.0 0.07 0.01 0.16 0.15 0.14 0.23 1.0 0.24 0.1 0.0 0.01 0.01 0.15 0.24 0.04 0.0 0.08 0.67 0.24 0.2
0.38 0.58 0.36 0.55 0.63 0.6 0.63 0.29 0.62 0.59 0.31 0.36 0.67 0.47 0.73 0.52 0.79 0.59 0.63 1.0 0.51 0.73 0.5 0.66 0.31 0.37 0.22 0.49 0.39 0.59 0.74 0.35 0.38 0.35 0.54
0.59 0.42 0.48 0.35 0.38 0.59 0.57 0.34 0.51 0.51 0.76 0.63 0.14 0.39 0.58 0.3 0.9 0.41 0.67 0.24 0.12 0.17 0.04 0.22 0.07 0.3 0.26 0.15 0.35 0.25 0.12 0.33 0.98 1.0 0.76
0.07 0.12 0.21 0.41 0.23 0.09 0.12 0.85 0.07 0.09 0.46 0.41 0.08 0.11 0.02 0.02 0.0 0.16 0.14 0.11 1.0 0.48 0.14 0.13 0.03 0.06 0.02 0.25 0.12 0.07 0.08 0.07 0.29 0.04 0.26
0.01 0.0 0.0 0.01 0.12 0.0 0.03 0.02 0.04 0.0 0.33 0.45 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.03 0.0 0.01 0.0 0.17 0.17 0.01 0.01 0.01 0.02 0.03 0.47 0.03 0.04
0.18 0.2 0.16 0.23 0.27 0.25 0.26 0.25 0.28 0.27 0.43 0.38 0.87 0.37 0.09 0.17 0.02 0.3 0.32 0.24 0.46 0.37 0.36 0.25 0.19 0.11 0.07 0.3 0.16 0.4 0.21 0.44 0.32 0.37 1.0
0.05 0.13 0.17 0.24 0.56 0.18 0.52 0.21 0.15 0.16 0.59 0.82 0.34 0.66 0.03 0.06 0.08 0.16 0.27 0.0 0.01 0.01 0.0 0.58 1.0 0.5 0.38 0.07 0.48 0.39 0.13 0.2 0.64 0.16 0.25
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.23 0.01 0.46 0.07 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.38 0.16 1.0 0.36 0.0 0.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0
0.23 0.34 0.23 0.37 0.56 0.28 0.41 0.25 0.32 0.34 0.5 0.74 0.96 1.0 0.07 0.13 0.03 0.19 0.24 0.32 0.48 0.43 0.35 0.23 0.12 0.22 0.25 0.43 0.39 0.2 0.2 0.23 0.46 0.52 0.53
0.38 0.32 0.27 0.32 0.34 0.34 0.24 0.29 0.29 0.35 0.4 0.43 0.15 0.02 0.01 0.04 0.02 0.15 0.1 0.06 0.05 0.07 0.03 0.02 0.04 0.2 1.0 0.22 0.02 0.28 0.09 0.08 0.37 0.03 0.02
0.15 0.41 0.19 0.46 0.43 0.22 0.65 0.12 0.32 0.35 0.42 0.4 1.0 0.92 0.18 0.38 0.35 0.29 0.45 0.47 0.16 0.2 0.28 0.36 0.36 0.19 0.08 0.32 0.47 0.23 0.21 0.37 0.37 0.29 0.98
0.18 0.15 0.17 0.14 0.19 0.37 0.23 0.27 0.22 0.31 0.17 0.25 0.42 1.0 0.09 0.05 0.06 0.27 0.24 0.17 0.15 0.18 0.1 0.34 0.14 0.07 0.06 0.0 0.28 0.32 0.19 0.42 0.15 0.21 0.01
0.22 0.51 0.26 0.52 0.54 0.56 0.72 0.42 0.66 0.64 0.43 0.48 0.94 0.92 0.21 0.24 0.19 0.34 0.42 0.6 0.2 0.25 0.32 0.88 0.48 0.49 0.59 0.35 0.69 0.88 1.0 0.53 0.51 0.35 0.7
0.07 0.02 0.07 0.12 0.4 0.16 0.04 0.41 0.15 0.18 0.88 0.85 0.8 0.7 0.15 0.06 0.09 0.12 0.09 0.1 0.22 0.78 0.0 0.08 0.07 0.12 0.19 0.14 0.09 0.46 0.27 0.32 1.0 0.22 0.69
0.31 0.27 0.27 0.29 0.63 0.48 0.31 0.36 0.48 0.41 0.55 0.66 0.2 0.44 0.27 0.21 0.17 0.45 0.42 0.32 0.87 0.76 1.0 0.66 0.55 0.15 0.13 0.24 0.32 0.4 0.4 0.31 0.44 0.3 0.37
0.04 0.06 0.05 0.06 0.19 0.07 0.05 0.18 0.08 0.09 0.17 0.33 0.07 0.05 0.05 0.08 0.03 0.45 0.4 0.52 1.0 0.33 0.15 0.56 0.5 0.1 0.05 0.11 0.37 0.41 0.38 0.24 0.2 0.14 0.27
0.25 0.16 0.28 0.19 0.37 0.53 0.29 0.38 1.0 0.71 0.22 0.25 0.6 0.34 0.18 0.15 0.27 0.31 0.55 0.43 0.36 0.23 0.22 0.29 0.05 0.16 0.13 0.13 0.98 0.12 0.1 0.07 0.24 0.38 0.8
0.32 0.48 0.34 0.42 0.62 0.34 0.4 0.47 0.32 0.37 0.58 0.55 1.0 0.55 0.18 0.18 0.12 0.44 0.32 0.74 0.26 0.3 0.93 0.54 0.73 0.78 0.64 0.41 0.73 0.78 0.78 0.73 0.46 0.39 0.51
0.15 0.09 0.12 0.1 0.34 0.14 0.14 0.09 0.19 0.21 0.21 0.3 0.35 0.07 0.02 0.07 0.0 0.12 0.05 0.35 0.01 0.02 0.02 0.14 0.26 1.0 0.96 0.35 0.18 0.18 0.23 0.18 0.21 0.0 0.0
0.02 0.18 0.15 0.31 0.02 0.21 0.16 0.3 0.14 0.28 0.79 0.68 0.54 0.13 0.0 0.0 0.0 0.05 0.09 0.05 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.61 0.24 0.17 0.14 0.01 0.0 0.0 1.0 0.29 0.11
0.13 0.15 0.13 0.15 0.11 0.16 0.14 0.31 0.17 0.18 0.48 0.37 0.09 0.3 0.06 0.1 0.01 0.19 0.21 0.14 0.34 0.34 0.36 0.24 0.16 0.25 1.0 0.22 0.24 0.35 0.5 0.15 0.35 0.24 0.22
0.48 0.55 0.39 0.57 0.29 0.43 0.57 0.34 0.56 0.54 0.52 0.53 1.0 0.9 0.28 0.29 0.23 0.47 0.38 0.61 0.66 0.47 0.97 0.6 0.31 0.37 0.15 0.36 0.27 0.36 0.3 0.44 0.53 0.97 0.65
0.26 0.45 0.29 0.57 0.84 0.55 0.77 0.6 0.95 0.99 0.75 0.89 0.54 0.35 0.17 0.36 0.22 0.32 0.37 0.76 0.05 0.2 0.06 0.52 0.19 0.62 0.49 0.54 0.79 0.52 0.36 0.46 1.0 0.83 0.79
0.2 0.41 0.2 0.46 0.52 0.41 0.77 0.13 0.73 0.7 0.9 0.74 0.24 0.77 0.25 0.24 0.32 0.14 0.04 0.14 0.13 0.36 0.26 0.05 0.01 0.02 0.01 0.32 0.11 0.04 0.04 0.03 1.0 0.04 0.02
0.25 0.21 0.2 0.2 0.17 0.26 0.21 0.21 0.25 0.24 0.94 0.84 1.0 0.48 0.17 0.24 0.07 0.17 0.48 0.13 0.99 0.84 0.29 0.6 0.39 0.16 0.15 0.35 0.19 0.3 0.13 0.37 0.78 0.68 0.83
0.47 0.63 0.44 0.58 0.72 0.62 0.57 0.34 0.71 0.64 0.78 0.84 0.77 0.62 0.46 0.33 0.3 0.47 0.39 0.9 0.61 0.66 0.7 0.65 0.48 0.49 0.27 0.94 0.42 0.35 0.49 0.23 0.81 0.81 1.0
0.28 0.54 0.36 0.59 0.27 0.4 0.71 0.39 0.75 0.79 0.48 0.5 0.5 1.0 0.11 0.13 0.12 0.2 0.28 0.31 0.62 0.51 0.35 0.23 0.04 0.06 0.02 0.47 0.54 0.29 0.26 0.33 0.58 0.3 0.31
0.51 0.5 0.46 0.57 0.55 0.57 0.61 0.34 0.7 0.67 0.93 1.0 0.36 0.5 0.34 0.34 0.47 0.55 0.51 0.91 0.35 0.34 0.39 0.35 0.24 0.39 0.18 0.47 0.45 0.38 0.3 0.54 0.99 0.81 0.43
0.52 0.68 0.29 0.71 0.56 0.39 0.75 0.19 0.48 0.41 0.8 0.82 0.42 0.44 0.69 0.37 1.0 0.47 0.47 0.15 0.17 0.33 0.3 0.19 0.13 0.21 0.13 0.35 0.22 0.14 0.11 0.18 0.98 0.35 0.38
0.05 0.06 0.04 0.02 0.04 0.03 0.03 0.05 0.03 0.02 0.18 0.31 0.03 0.07 0.02 0.05 0.01 0.1 0.05 0.01 0.0 0.01 0.0 0.04 0.07 0.92 1.0 0.12 0.05 0.06 0.09 0.02 0.26 0.01 0.02
0.27 0.29 0.21 0.25 0.46 0.29 0.25 0.18 0.45 0.39 0.53 0.6 0.21 0.78 0.1 0.1 0.08 0.16 0.23 0.11 0.41 0.5 0.66 0.18 0.18 0.34 0.28 1.0 0.14 0.18 0.15 0.12 0.61 0.21 0.68
0.4 0.79 0.38 0.74 0.41 0.49 1.0 0.45 0.52 0.59 0.23 0.23 0.5 0.83 0.32 0.31 0.66 0.51 0.72 0.64 0.19 0.35 0.15 0.45 0.13 0.45 0.28 0.45 0.48 0.29 0.29 0.26 0.31 0.28 0.13
0.22 0.6 0.27 0.53 0.22 0.34 0.55 0.46 0.27 0.54 0.43 0.54 0.14 0.09 0.14 0.27 0.11 0.19 0.29 0.29 0.66 1.0 0.24 0.35 0.05 0.0 0.0 0.33 0.3 0.57 0.41 0.43 0.6 0.49 0.52
0.27 0.5 0.3 0.47 0.3 0.58 0.63 0.34 0.6 0.59 0.39 0.39 1.0 0.35 0.37 0.31 0.82 0.45 0.49 0.85 0.09 0.24 0.1 0.49 0.09 0.31 0.16 0.03 0.19 0.39 0.48 0.17 0.51 0.34 0.13
0.04 0.04 0.03 0.05 0.19 0.06 0.06 0.16 0.07 0.06 0.46 0.39 0.08 0.25 0.06 0.04 0.08 0.12 0.12 0.07 0.61 0.47 1.0 0.04 0.09 0.06 0.07 0.2 0.43 0.0 0.0 0.0 0.46 0.14 0.91
0.21 0.52 0.36 0.6 0.23 0.26 0.51 0.38 0.37 0.38 0.24 0.19 0.36 0.12 0.19 0.39 0.13 0.58 0.62 0.79 0.33 0.5 0.42 1.0 0.45 0.14 0.24 0.03 0.5 0.65 0.7 0.55 0.22 0.37 0.48

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)