1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_65 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
4h after treatment
4h after treatment,No nitrate
8h after treatment
8h after treatment,No nitrate
20C
20h after treatment
20h after treatment,No nitrate
20h after treatment,Nocodazole added
36h after treatment
36h after treatment,No phosphate
Blue light,10min after light change
Blue light,60min after light change
Bohlin
CCAP1055/1,20C
CCAP1055/1,20C,High CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Low CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Normal CO2,OligoDT primed
CCMP2561
CCMP2561 Nitrase Reductase Knockout
CCMP632
CCMP632,24h
CCMP632,48h
CCMP632,72h
CCMP632,High light acclimated WT
CCMP632,Low light acclimated WT
NEPCC640,8h,1000ppmv CO2
NEPCC640,8h,390 ppmv CO2
No light,8h after treatment
Pt-1
Pt-1 8.6
Pt-1 8.6,With nitrogen
Pt-1 8.6,Without nitrogen
Red light,0min before light change
UTEX 646,Blue light
UTEX 646,No light
0.15 0.19 0.22 0.29 0.22 0.39 0.43 0.08 0.53 1.0 0.3 0.53 0.06 0.37 0.09 0.1 0.15 0.3 0.16 0.34 0.15 0.26 0.25 0.03 0.05 0.03 0.01 0.22 0.12 0.03 0.03 0.02 0.58 0.1 0.24
0.3 0.35 0.23 0.33 0.45 0.33 0.41 0.23 0.37 0.4 0.57 0.67 0.74 0.85 0.25 0.21 0.14 0.41 0.36 0.33 0.82 0.69 0.91 0.5 0.52 0.23 0.22 0.57 0.39 0.58 0.34 0.76 0.58 0.56 1.0
0.14 0.12 0.1 0.11 0.19 0.17 0.16 0.17 0.19 0.2 0.34 0.39 0.36 0.46 0.06 0.08 0.02 0.14 0.12 0.28 0.49 0.45 1.0 0.27 0.3 0.19 0.48 0.15 0.27 0.29 0.35 0.19 0.33 0.1 0.2
0.16 0.27 0.12 0.26 0.22 0.19 0.3 0.14 0.23 0.25 0.43 0.53 0.82 0.45 0.1 0.15 0.03 0.31 0.39 0.26 0.74 0.87 0.7 0.22 0.18 0.05 0.02 0.18 0.22 0.22 0.13 0.35 0.46 0.49 1.0
0.4 0.51 0.3 0.51 0.41 0.59 0.52 0.46 0.77 0.66 0.71 0.86 1.0 0.32 0.32 0.31 0.14 0.58 0.71 0.41 0.92 0.87 0.54 0.46 0.4 0.22 0.16 0.48 0.39 0.35 0.36 0.25 0.91 0.49 0.92
0.03 0.03 0.11 0.07 0.07 0.03 0.06 0.09 0.03 0.04 0.14 0.21 0.02 1.0 0.01 0.03 0.01 0.03 0.16 0.38 0.08 0.18 0.04 0.08 0.02 0.01 0.01 0.15 0.07 0.02 0.01 0.03 0.16 0.02 0.28
0.08 0.16 0.09 0.25 0.13 0.12 0.42 0.35 0.29 0.24 0.35 0.46 1.0 0.55 0.04 0.18 0.03 0.14 0.16 0.29 0.08 0.17 0.09 0.16 0.09 0.14 0.14 0.16 0.49 0.19 0.11 0.22 0.4 0.33 0.99
0.48 0.59 0.76 0.58 0.29 0.71 0.71 0.3 0.56 0.89 0.55 0.99 0.18 0.66 0.06 0.23 0.6 0.49 0.22 0.95 0.24 0.79 0.34 0.12 0.01 0.02 0.01 0.05 0.36 0.04 0.05 0.03 0.72 1.0 0.08
0.07 0.2 0.06 0.21 0.12 0.11 0.32 0.06 0.16 0.14 0.35 0.4 0.41 0.69 0.1 0.09 0.11 0.18 0.2 0.11 0.67 0.37 1.0 0.13 0.11 0.06 0.04 0.31 0.07 0.18 0.06 0.25 0.33 0.28 0.81
0.27 0.44 0.23 0.55 0.41 0.45 0.78 0.26 0.64 0.62 0.77 1.0 0.62 0.75 0.11 0.15 0.05 0.38 0.36 0.48 0.55 0.37 0.7 0.53 0.57 0.11 0.09 0.52 0.65 0.45 0.29 0.58 0.93 0.65 0.91
0.25 0.26 0.22 0.24 0.33 0.25 0.21 0.15 0.22 0.27 0.6 0.64 0.8 0.81 0.24 0.13 0.07 0.23 0.24 0.32 0.8 0.7 0.56 0.36 0.35 0.33 0.21 0.34 0.43 0.34 0.23 0.46 0.69 0.9 1.0
0.02 0.01 0.02 0.0 0.06 0.02 0.01 0.04 0.04 0.01 0.62 0.61 0.1 0.93 0.02 0.01 0.01 0.03 0.03 0.01 0.02 0.04 0.02 0.47 0.24 0.17 0.29 0.01 0.06 0.09 0.07 0.09 0.62 1.0 0.37
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.49 0.31 0.06 0.58 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.11 0.34 0.22 1.0 0.24 0.47 0.09 0.2 0.0 0.01 0.12 0.12 0.08 0.24 0.14 0.4
0.13 0.1 0.09 0.08 0.04 0.14 0.1 0.09 0.14 0.18 0.36 0.46 0.13 0.33 0.02 0.07 0.03 0.21 0.09 0.68 0.19 0.31 0.27 0.1 0.05 0.06 0.04 0.48 1.0 0.15 0.15 0.16 0.22 0.15 0.02
0.25 0.26 0.28 0.38 0.15 0.5 0.48 0.15 0.45 1.0 0.3 0.56 0.03 0.29 0.03 0.1 0.1 0.39 0.23 0.15 0.21 0.48 0.2 0.03 0.01 0.03 0.04 0.05 0.13 0.04 0.06 0.03 0.49 0.11 0.0
0.33 0.34 0.35 0.42 0.25 0.34 0.44 0.36 0.38 0.43 0.64 0.74 0.39 0.93 0.1 0.07 0.09 0.18 0.27 0.22 0.86 1.0 0.67 0.61 0.14 0.22 0.18 0.34 0.22 0.64 0.4 0.68 0.67 0.54 0.89
0.13 0.17 0.32 0.43 0.09 0.18 0.34 0.1 0.2 0.36 0.24 0.61 0.34 1.0 0.02 0.14 0.09 0.35 0.28 0.22 0.12 0.22 0.35 0.03 0.01 0.06 0.14 0.13 0.3 0.01 0.02 0.01 0.44 0.2 0.05
0.19 0.24 0.19 0.23 0.31 0.22 0.24 0.17 0.31 0.3 0.58 0.75 0.68 0.81 0.17 0.14 0.12 0.2 0.3 0.1 0.36 0.46 0.56 0.49 0.4 0.33 0.53 0.22 0.28 0.33 0.24 0.28 0.71 1.0 0.74
0.09 0.11 0.08 0.14 0.29 0.11 0.14 0.12 0.16 0.17 0.51 0.63 0.53 0.67 0.14 0.11 0.17 0.11 0.19 0.22 0.83 0.62 1.0 0.51 0.44 0.24 0.41 0.34 0.31 0.35 0.26 0.27 0.59 0.38 0.79
0.2 0.24 0.18 0.27 0.3 0.24 0.31 0.17 0.29 0.29 0.54 0.65 0.45 1.0 0.14 0.13 0.09 0.28 0.33 0.75 0.63 0.52 0.97 0.45 0.86 0.08 0.05 0.29 0.36 0.34 0.18 0.51 0.7 0.35 0.78
0.43 0.43 0.38 0.42 0.3 0.53 0.56 0.19 0.57 0.51 0.35 0.61 0.36 1.0 0.31 0.45 0.67 0.46 0.6 0.49 0.47 0.72 0.47 0.49 0.13 0.24 0.25 0.29 0.37 0.29 0.23 0.25 0.42 0.48 0.27
0.11 0.12 0.14 0.18 0.08 0.21 0.25 0.14 0.21 0.44 0.52 0.8 0.24 1.0 0.02 0.1 0.02 0.21 0.07 0.69 0.27 0.36 0.26 0.05 0.01 0.0 0.0 0.03 0.47 0.02 0.02 0.03 0.63 0.15 0.08
0.21 0.16 0.22 0.24 0.09 0.35 0.34 0.09 0.43 0.68 0.56 0.82 0.23 1.0 0.02 0.14 0.14 0.51 0.12 0.51 0.17 0.55 0.35 0.03 0.0 0.0 0.0 0.21 0.39 0.01 0.01 0.01 0.75 0.09 0.05
0.22 0.39 0.25 0.47 0.19 0.46 0.55 0.14 0.43 1.0 0.47 0.94 0.21 0.51 0.04 0.15 0.11 0.32 0.22 0.47 0.15 0.37 0.16 0.04 0.01 0.02 0.01 0.15 0.2 0.05 0.02 0.07 0.87 0.27 0.03
0.31 0.25 0.32 0.26 0.18 0.42 0.35 0.12 0.45 0.73 0.33 0.71 0.17 1.0 0.19 0.23 0.55 0.48 0.27 0.42 0.55 0.88 0.69 0.14 0.02 0.1 0.05 0.15 0.28 0.05 0.06 0.05 0.51 0.24 0.1
0.49 0.52 0.31 0.47 0.24 0.61 0.7 0.64 0.61 0.64 0.26 0.77 0.37 0.59 0.21 0.19 0.28 0.57 0.5 0.54 0.44 1.0 0.34 0.06 0.05 0.02 0.02 0.27 0.28 0.32 0.12 0.51 0.43 0.52 0.1
0.18 0.35 0.25 0.53 0.36 0.33 0.8 0.21 0.52 0.46 0.48 0.47 0.17 0.86 0.1 0.13 0.07 0.28 0.28 0.3 0.61 0.65 1.0 0.27 0.33 0.18 0.17 0.21 0.16 0.32 0.18 0.45 0.48 0.38 0.98
0.39 0.72 0.31 0.48 0.25 0.42 0.58 0.25 0.45 0.87 0.5 0.85 0.3 0.66 0.19 0.2 0.21 0.36 0.29 0.48 0.31 1.0 0.24 0.32 0.07 0.08 0.03 0.36 0.32 0.14 0.14 0.16 0.65 0.18 0.18
0.2 0.28 0.21 0.29 0.2 0.24 0.31 0.16 0.23 0.42 0.61 0.94 0.27 0.7 0.13 0.19 0.05 0.42 0.33 0.3 0.25 0.36 0.18 0.1 0.03 0.04 0.02 0.19 0.69 0.1 0.09 0.11 1.0 0.28 0.2
0.13 0.23 0.15 0.23 0.24 0.15 0.21 0.19 0.18 0.26 0.37 0.48 0.89 0.26 0.05 0.04 0.03 0.11 0.14 0.49 0.53 0.44 1.0 0.16 0.06 0.05 0.07 0.08 0.41 0.22 0.31 0.17 0.46 0.24 0.23
0.14 0.19 0.17 0.19 0.23 0.17 0.24 0.1 0.2 0.33 0.54 0.76 0.27 0.85 0.16 0.14 0.2 0.11 0.11 0.87 0.35 0.66 1.0 0.3 0.27 0.04 0.04 0.25 0.41 0.05 0.04 0.07 0.71 0.13 0.1
0.07 0.09 0.07 0.11 0.08 0.11 0.14 0.07 0.17 0.39 0.38 0.54 0.2 1.0 0.03 0.04 0.02 0.17 0.14 0.47 0.25 0.23 0.53 0.14 0.15 0.03 0.02 0.17 0.49 0.08 0.05 0.15 0.43 0.08 0.22
0.23 0.37 0.25 0.43 0.4 0.29 0.43 0.26 0.36 0.43 0.52 0.6 1.0 0.4 0.16 0.18 0.12 0.33 0.3 0.54 0.55 0.55 0.79 0.49 0.3 0.2 0.17 0.32 0.6 0.57 0.31 0.88 0.59 0.76 0.73
0.24 0.05 0.17 0.05 0.25 0.48 0.08 0.04 0.4 0.81 0.58 1.0 0.03 0.49 0.0 0.01 0.4 0.1 0.02 0.82 0.1 0.27 0.27 0.01 0.0 0.01 0.01 0.02 0.45 0.02 0.01 0.02 0.87 0.01 0.01
0.11 0.15 0.12 0.13 0.36 0.15 0.17 0.27 0.2 0.2 0.35 0.35 0.77 0.63 0.15 0.15 0.08 0.12 0.14 0.41 0.36 0.43 0.17 0.45 0.14 0.32 0.85 0.2 0.28 0.5 0.38 0.38 0.28 0.89 1.0
0.11 0.15 0.12 0.13 0.36 0.15 0.17 0.27 0.2 0.2 0.35 0.35 0.77 0.63 0.15 0.15 0.08 0.12 0.14 0.41 0.36 0.43 0.17 0.45 0.14 0.32 0.85 0.2 0.28 0.5 0.38 0.38 0.28 0.89 1.0
0.08 0.18 0.17 0.24 0.24 0.22 0.22 0.26 0.25 0.27 0.37 0.47 0.74 0.76 0.08 0.14 0.02 0.16 0.35 0.67 0.66 1.0 0.42 0.11 0.06 0.13 0.09 0.13 0.47 0.24 0.27 0.17 0.47 0.26 0.59
0.13 0.15 0.11 0.18 0.37 0.21 0.21 0.12 0.24 0.2 0.35 0.41 1.0 0.51 0.07 0.11 0.03 0.23 0.27 0.31 0.95 0.65 0.94 0.13 0.14 0.16 0.1 0.17 0.49 0.1 0.13 0.13 0.34 0.28 0.69
0.11 0.07 0.13 0.1 0.69 0.2 0.06 0.24 0.24 0.75 0.8 0.78 0.31 0.4 0.08 0.02 0.04 0.16 0.3 1.0 0.42 0.36 0.67 0.46 0.62 0.23 0.28 0.51 0.39 0.49 0.55 0.42 0.81 0.59 0.61
0.26 0.38 0.37 0.44 0.22 0.49 0.68 0.37 0.55 0.8 0.77 0.85 0.02 0.35 0.18 0.22 0.07 0.21 0.35 1.0 0.55 0.65 0.29 0.19 0.04 0.11 0.17 0.14 0.11 0.12 0.1 0.1 0.91 0.26 0.19
0.18 0.27 0.18 0.3 0.34 0.24 0.39 0.17 0.34 0.35 0.52 0.59 0.7 0.85 0.12 0.12 0.11 0.26 0.21 0.37 0.48 0.53 1.0 0.44 0.46 0.14 0.13 0.25 0.55 0.43 0.28 0.58 0.48 0.37 0.36
0.12 0.3 0.16 0.35 0.33 0.34 0.45 0.35 0.44 0.54 0.46 0.5 1.0 0.36 0.16 0.16 0.16 0.28 0.36 0.56 0.54 0.6 0.57 0.32 0.19 0.24 0.03 0.08 0.44 0.28 0.24 0.33 0.49 0.25 0.46
0.1 0.14 0.12 0.15 0.12 0.15 0.17 0.16 0.23 0.21 0.56 0.62 0.08 0.66 0.09 0.07 0.05 0.15 0.25 0.33 0.59 0.43 0.23 0.3 0.14 0.24 0.33 0.14 0.28 0.32 0.27 0.26 0.57 0.33 1.0
0.42 0.32 0.41 0.36 0.25 0.51 0.44 0.17 0.49 0.66 0.48 1.0 0.36 0.95 0.21 0.18 0.76 0.34 0.43 0.99 0.6 0.67 0.76 0.15 0.06 0.25 0.35 0.24 0.75 0.13 0.09 0.18 0.74 0.41 0.27
0.02 0.05 0.04 0.1 0.31 0.04 0.11 0.05 0.05 0.07 0.72 1.0 0.6 0.79 0.02 0.02 0.02 0.17 0.12 0.64 0.03 0.05 0.11 0.21 0.34 0.02 0.01 0.13 0.89 0.22 0.06 0.4 0.77 0.2 0.55
0.01 0.01 0.02 0.01 1.0 0.01 0.0 0.02 0.02 0.01 0.51 0.59 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.05 0.42 0.11 0.03 0.18 0.0 0.03 0.04 0.01 0.06 0.43 0.01 0.02 0.0 0.56 0.0 0.02
0.17 0.14 0.26 0.15 0.17 0.26 0.15 0.13 0.3 0.74 0.72 0.94 0.05 0.8 0.06 0.06 0.07 0.12 0.15 0.54 0.28 0.4 0.34 0.15 0.02 0.06 0.05 0.05 1.0 0.13 0.11 0.11 0.5 0.12 0.06
0.02 0.02 0.01 0.02 0.24 0.02 0.02 0.02 0.03 0.03 0.61 0.74 0.17 0.4 0.13 0.19 0.03 0.2 0.29 0.95 0.68 1.0 0.55 0.14 0.07 0.13 0.17 0.03 0.29 0.14 0.18 0.16 0.78 0.7 0.25
0.22 0.23 0.22 0.31 0.33 0.25 0.39 0.16 0.45 0.46 0.4 0.39 0.1 0.62 0.18 0.26 0.12 0.32 0.2 0.33 0.71 0.59 1.0 0.24 0.21 0.25 0.11 0.28 0.17 0.17 0.26 0.09 0.5 0.34 0.56
0.22 0.36 0.3 0.58 0.36 0.34 0.47 0.47 0.49 0.54 0.38 0.48 0.65 0.27 0.28 0.31 0.14 0.44 0.55 0.31 0.74 0.64 0.5 0.33 0.11 0.17 0.03 0.35 0.2 0.2 0.27 0.17 0.54 0.57 1.0
0.35 0.5 0.33 0.57 0.52 0.47 0.62 0.33 0.7 0.9 0.84 0.95 0.28 0.62 0.06 0.15 0.04 0.53 0.43 0.97 0.26 0.46 0.69 0.3 0.34 0.32 0.27 1.0 0.64 0.39 0.44 0.42 1.0 0.13 0.66
0.08 0.11 0.07 0.12 0.31 0.12 0.17 0.1 0.14 0.17 0.6 0.68 0.2 1.0 0.03 0.06 0.01 0.2 0.21 0.36 0.22 0.34 0.78 0.24 0.37 0.12 0.13 0.17 0.36 0.29 0.25 0.32 0.57 0.12 0.35
0.28 0.31 0.16 0.31 0.45 0.31 0.36 0.18 0.4 0.37 0.58 0.72 0.53 1.0 0.13 0.09 0.12 0.22 0.2 0.2 0.42 0.42 0.35 0.36 0.32 0.1 0.07 0.27 0.35 0.37 0.15 0.69 0.62 0.49 0.26
0.25 0.23 0.2 0.2 0.4 0.26 0.24 0.17 0.3 0.24 0.93 0.96 0.2 0.75 0.18 0.14 0.12 0.25 0.24 0.25 0.57 0.57 1.0 0.31 0.6 0.17 0.2 0.45 0.37 0.31 0.23 0.46 0.76 0.49 0.95
0.14 0.15 0.16 0.18 0.32 0.43 0.32 0.14 0.53 0.57 0.44 1.0 0.27 0.54 0.12 0.17 0.29 0.24 0.21 0.65 0.12 0.19 0.44 0.12 0.23 0.05 0.04 0.36 0.45 0.12 0.16 0.08 0.69 0.55 0.74
0.26 0.31 0.31 0.39 0.18 0.38 0.45 0.3 0.32 0.67 0.48 0.82 0.39 1.0 0.04 0.13 0.17 0.28 0.16 0.57 0.16 0.36 0.18 0.13 0.02 0.01 0.0 0.11 0.57 0.04 0.05 0.04 0.67 0.2 0.09
0.08 0.12 0.1 0.17 0.15 0.12 0.14 0.23 0.12 0.14 0.45 0.49 0.64 0.94 0.03 0.03 0.01 0.08 0.07 0.18 0.39 0.32 1.0 0.24 0.33 0.02 0.02 0.49 0.23 0.19 0.09 0.27 0.35 0.11 0.42
0.34 0.49 0.29 0.54 0.35 0.37 0.59 0.33 0.43 0.47 0.58 0.75 1.0 0.66 0.23 0.24 0.09 0.41 0.53 0.19 0.78 0.53 0.8 0.43 0.38 0.08 0.04 0.63 0.19 0.51 0.43 0.66 0.63 0.63 0.87
0.24 0.3 0.2 0.31 0.37 0.32 0.45 0.2 0.4 0.3 0.58 0.63 1.0 0.74 0.21 0.15 0.15 0.28 0.23 0.15 0.43 0.45 0.48 0.39 0.23 0.23 0.15 0.29 0.11 0.44 0.23 0.64 0.53 0.99 0.37
0.15 0.24 0.13 0.25 0.34 0.21 0.36 0.24 0.32 0.35 0.54 0.55 0.26 1.0 0.06 0.1 0.03 0.23 0.26 0.24 0.2 0.36 0.57 0.18 0.16 0.12 0.14 0.46 0.48 0.29 0.24 0.35 0.53 0.13 0.47
0.05 0.09 0.04 0.09 0.12 0.04 0.13 0.14 0.06 0.09 0.59 0.66 0.17 1.0 0.01 0.03 0.02 0.1 0.11 0.6 0.71 0.59 0.19 0.42 0.05 0.15 0.07 0.04 0.3 0.26 0.24 0.37 0.62 0.24 0.35

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)