1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_41 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
4h after treatment
4h after treatment,No nitrate
8h after treatment
8h after treatment,No nitrate
20C
20h after treatment
20h after treatment,No nitrate
20h after treatment,Nocodazole added
36h after treatment
36h after treatment,No phosphate
Blue light,10min after light change
Blue light,60min after light change
Bohlin
CCAP1055/1,20C
CCAP1055/1,20C,High CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Low CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Normal CO2,OligoDT primed
CCMP2561
CCMP2561 Nitrase Reductase Knockout
CCMP632
CCMP632,24h
CCMP632,48h
CCMP632,72h
CCMP632,High light acclimated WT
CCMP632,Low light acclimated WT
NEPCC640,8h,1000ppmv CO2
NEPCC640,8h,390 ppmv CO2
No light,8h after treatment
Pt-1
Pt-1 8.6
Pt-1 8.6,With nitrogen
Pt-1 8.6,Without nitrogen
Red light,0min before light change
UTEX 646,Blue light
UTEX 646,No light
0.21 0.18 0.18 0.19 0.38 0.32 0.23 0.18 0.48 0.39 0.29 0.31 0.24 0.19 0.15 0.13 0.14 0.17 0.2 0.33 0.38 0.29 0.49 0.25 0.3 0.33 0.38 0.36 0.33 0.16 0.17 0.14 0.31 0.16 1.0
0.07 0.03 0.07 0.04 0.41 0.16 0.06 0.06 0.31 0.24 0.18 0.09 0.33 0.19 0.37 0.25 0.31 0.09 0.08 0.62 0.1 0.07 0.18 0.25 0.69 0.55 1.0 0.27 0.5 0.27 0.3 0.25 0.12 0.2 0.36
0.17 0.22 0.15 0.21 0.25 0.25 0.24 0.15 0.27 0.23 0.19 0.23 0.15 0.18 0.15 0.16 0.05 0.26 0.24 0.27 0.25 0.21 0.2 1.0 0.95 0.22 0.21 0.22 0.4 0.37 0.47 0.2 0.23 0.27 0.3
0.16 0.18 0.12 0.17 0.15 0.18 0.22 0.11 0.2 0.17 0.23 0.25 0.31 0.1 0.1 0.1 0.02 0.23 0.33 0.11 0.34 0.25 0.31 1.0 0.81 0.09 0.13 0.24 0.12 0.18 0.15 0.23 0.22 0.32 0.55
0.5 0.34 0.31 0.26 0.25 0.41 0.27 0.22 0.45 0.43 0.61 0.28 0.57 0.06 0.35 0.38 0.17 0.29 0.3 0.39 0.27 0.24 0.24 0.36 0.54 0.47 0.53 1.0 0.4 0.26 0.36 0.17 0.2 0.43 0.52
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 1.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0
0.32 0.13 0.22 0.08 0.45 0.42 0.07 0.12 0.4 0.31 0.18 0.18 0.48 0.02 0.66 0.2 0.96 0.13 0.1 0.34 0.17 0.08 0.21 0.47 0.55 0.69 0.34 0.27 0.37 0.16 0.32 0.06 0.24 0.02 1.0
0.27 0.25 0.2 0.22 0.69 0.33 0.27 0.21 0.37 0.34 0.17 0.22 0.56 0.41 0.38 0.25 0.05 0.42 0.32 0.52 0.49 0.35 0.52 0.58 1.0 0.43 0.48 0.56 0.43 0.3 0.41 0.36 0.19 0.36 0.79
0.04 0.06 0.04 0.05 0.03 0.04 0.04 0.03 0.04 0.05 0.07 0.08 0.01 0.05 0.02 0.01 0.01 0.03 0.03 0.01 0.11 0.18 0.08 0.21 1.0 0.02 0.08 0.02 0.02 0.03 0.03 0.04 0.07 0.05 0.03
0.27 0.12 0.16 0.08 0.27 0.2 0.1 0.12 0.17 0.15 0.38 0.39 0.1 0.19 0.37 0.21 0.2 0.16 0.15 0.46 0.29 0.26 0.34 0.8 1.0 0.2 0.25 0.33 0.23 0.15 0.15 0.23 0.34 0.35 0.1
0.15 0.13 0.13 0.12 0.22 0.17 0.15 0.16 0.19 0.18 1.0 0.53 0.24 0.46 0.23 0.17 0.3 0.14 0.17 0.42 0.09 0.08 0.23 0.29 0.83 0.34 0.37 0.35 0.5 0.37 0.46 0.26 0.45 0.2 0.4
0.43 0.55 0.32 0.36 0.99 0.66 0.26 0.2 0.79 0.52 0.6 0.55 0.51 0.32 0.35 0.36 0.64 0.23 0.29 0.31 0.21 0.33 0.46 0.17 0.6 0.77 0.77 0.78 0.21 0.16 0.29 0.1 0.51 0.45 1.0
0.2 0.22 0.15 0.22 0.18 0.23 0.28 0.15 0.25 0.28 0.21 0.27 0.19 0.3 0.09 0.14 0.07 0.19 0.34 0.33 0.34 0.25 0.3 0.31 1.0 0.36 0.41 0.25 0.31 0.25 0.26 0.21 0.26 0.32 0.56
0.19 0.22 0.14 0.18 0.15 0.24 0.2 0.1 0.25 0.31 0.23 0.24 0.03 0.06 0.13 0.15 0.05 0.2 0.23 0.06 0.28 0.36 0.25 0.91 1.0 0.03 0.02 0.36 0.04 0.09 0.09 0.09 0.3 0.19 0.01
0.72 0.18 0.45 0.08 0.19 0.77 0.13 0.33 0.35 0.4 0.04 0.03 0.02 0.02 0.37 0.04 0.42 0.11 0.04 0.07 0.04 0.07 0.02 0.81 1.0 0.23 0.36 0.09 0.1 0.33 0.54 0.17 0.05 0.04 0.0
0.12 0.07 0.06 0.06 0.28 0.17 0.06 0.11 0.23 0.16 0.52 0.17 0.19 0.04 0.08 0.04 0.05 0.05 0.05 0.23 0.12 0.27 0.12 0.18 0.26 0.16 0.26 0.39 0.18 0.17 0.18 0.08 0.17 0.17 1.0
0.27 0.07 0.14 0.01 0.34 0.25 0.0 0.1 0.14 0.11 0.82 0.4 0.87 0.04 0.46 0.17 0.28 0.09 0.08 0.36 0.26 0.16 0.39 0.33 0.95 0.37 0.25 0.52 0.28 0.19 0.32 0.06 0.46 0.05 1.0
0.04 0.08 0.06 0.08 0.08 0.04 0.03 0.13 0.04 0.05 0.17 0.15 0.08 0.11 0.18 0.1 0.2 0.08 0.08 0.06 0.18 0.11 0.26 1.0 0.7 0.32 0.18 0.04 0.04 0.2 0.45 0.05 0.19 0.18 0.85
0.11 0.28 0.12 0.32 0.24 0.19 0.37 0.09 0.34 0.28 0.09 0.1 0.23 0.08 0.11 0.13 0.13 0.16 0.18 0.4 0.13 0.1 0.13 0.7 1.0 0.13 0.06 0.19 0.29 0.14 0.11 0.22 0.11 0.12 0.22
0.11 0.21 0.17 0.15 0.13 0.2 0.12 0.15 0.18 0.19 0.04 0.05 0.12 0.05 0.06 0.04 0.02 0.05 0.02 0.01 0.06 0.08 0.01 1.0 0.25 0.18 0.12 0.08 0.04 0.14 0.18 0.09 0.05 0.25 0.01
0.02 0.01 0.03 0.02 0.3 0.08 0.01 0.04 0.1 0.07 0.65 0.34 0.5 0.38 0.07 0.03 0.07 0.03 0.02 0.29 0.14 0.22 0.31 0.39 1.0 0.43 0.96 0.06 0.12 0.25 0.28 0.14 0.33 0.26 0.8
0.33 0.29 0.27 0.24 1.0 0.37 0.25 0.16 0.35 0.31 0.48 0.43 0.41 0.17 0.27 0.16 0.57 0.19 0.19 0.24 0.29 0.3 0.39 0.57 0.89 0.5 0.24 0.71 0.34 0.3 0.44 0.26 0.5 0.28 0.24
0.28 0.25 0.21 0.2 0.36 0.3 0.23 0.21 0.49 0.34 0.26 0.34 0.44 0.13 0.38 0.31 0.44 0.18 0.28 0.41 0.18 0.17 0.16 0.65 0.66 0.69 0.65 1.0 0.38 0.61 0.86 0.18 0.27 0.43 0.77
0.24 0.08 0.06 0.02 0.19 0.12 0.05 0.06 0.1 0.07 0.3 0.24 0.18 0.03 0.1 0.04 0.02 0.05 0.18 0.02 0.3 0.23 0.22 0.14 0.21 0.07 0.11 0.55 0.1 0.21 0.18 0.1 0.16 0.05 1.0
0.05 0.08 0.05 0.09 0.07 0.09 0.18 0.11 0.12 0.13 0.17 0.17 0.21 0.14 0.05 0.04 0.06 0.09 0.17 0.17 0.09 0.11 0.05 1.0 0.43 0.03 0.02 0.07 0.12 0.32 0.15 0.34 0.18 0.22 0.22
0.17 0.1 0.14 0.08 0.39 0.2 0.12 0.16 0.28 0.21 0.53 0.26 0.12 0.13 0.08 0.11 0.04 0.14 0.17 0.08 0.02 0.05 0.02 0.15 0.15 0.25 0.66 0.62 0.24 0.22 0.17 0.21 0.24 0.63 1.0
0.31 0.17 0.23 0.09 0.38 0.28 0.04 0.18 0.25 0.19 0.5 0.58 0.05 0.06 0.6 0.31 0.52 0.16 0.13 0.18 0.29 0.35 0.21 0.48 0.35 0.3 0.41 1.0 0.11 0.53 0.61 0.13 0.51 0.53 0.97
0.24 0.18 0.16 0.15 0.31 0.36 0.15 0.24 0.38 0.27 0.08 0.07 0.56 0.03 0.42 0.24 0.24 0.22 0.19 0.29 0.53 0.2 0.54 0.3 1.0 0.47 0.22 0.77 0.27 0.12 0.21 0.09 0.08 0.14 0.58
0.15 0.22 0.13 0.22 0.15 0.19 0.25 0.11 0.23 0.24 0.2 0.26 0.13 0.17 0.12 0.15 0.04 0.23 0.24 0.05 0.25 0.28 0.23 1.0 0.27 0.04 0.01 0.29 0.08 0.2 0.14 0.24 0.26 0.36 0.29
0.31 0.34 0.3 0.37 0.41 0.41 0.42 0.37 0.62 0.63 0.42 0.52 0.4 0.48 0.26 0.2 0.24 0.27 0.3 0.26 0.31 0.28 0.43 0.45 0.74 0.48 1.0 0.4 0.52 0.79 0.9 0.51 0.49 0.68 0.85
0.23 0.33 0.2 0.35 0.18 0.23 0.45 0.27 0.28 0.36 0.14 0.16 0.1 0.08 0.09 0.11 0.11 0.17 0.28 0.05 0.04 0.16 0.04 1.0 0.84 0.36 0.68 0.27 0.2 0.57 0.28 0.39 0.18 0.26 0.29
0.11 0.17 0.12 0.16 0.17 0.13 0.21 0.22 0.14 0.17 0.18 0.2 0.19 0.16 0.05 0.04 0.05 0.07 0.07 0.13 0.04 0.11 0.04 1.0 0.43 0.22 0.29 0.08 0.12 0.26 0.24 0.19 0.19 0.23 0.23
0.19 0.13 0.14 0.1 0.56 0.23 0.12 0.13 0.25 0.21 0.62 0.21 0.09 0.04 0.1 0.09 0.04 0.08 0.07 0.27 0.46 0.52 0.65 0.19 0.48 0.31 0.54 0.38 0.12 0.18 0.25 0.08 0.22 0.24 1.0
0.22 0.13 0.18 0.11 0.2 0.26 0.1 0.17 0.23 0.21 0.09 0.07 0.18 0.03 0.4 0.22 0.63 0.1 0.12 0.28 0.04 0.07 0.03 0.61 0.56 0.44 0.63 0.14 0.31 0.73 1.0 0.27 0.16 0.15 0.16
0.61 0.34 0.56 0.27 0.38 0.43 0.29 0.36 0.32 0.36 0.39 0.36 0.31 0.31 0.34 0.16 0.62 0.19 0.21 0.17 0.38 0.58 0.27 1.0 0.33 0.28 0.23 0.27 0.2 0.36 0.53 0.18 0.4 0.31 0.29
0.27 0.13 0.17 0.1 0.17 0.26 0.11 0.14 0.17 0.14 0.11 0.09 0.15 0.06 0.09 0.05 0.06 0.08 0.05 0.06 0.09 0.15 0.09 1.0 0.35 0.1 0.13 0.05 0.09 0.24 0.26 0.19 0.11 0.13 0.06
0.21 0.15 0.17 0.16 0.19 0.26 0.22 0.25 0.3 0.24 0.37 0.26 0.28 0.33 0.88 0.83 1.0 0.25 0.35 0.42 0.25 0.25 0.25 0.49 0.85 0.19 0.36 0.51 0.67 0.53 0.34 0.4 0.35 0.43 0.55
0.39 0.28 0.34 0.26 0.29 0.45 0.24 0.39 0.43 0.37 0.41 0.31 0.2 0.17 0.32 0.08 0.22 0.25 0.27 0.13 0.41 0.36 0.23 0.86 0.28 0.47 1.0 0.2 0.29 0.43 0.53 0.28 0.36 0.6 0.57
0.5 0.27 0.25 0.16 0.34 0.41 0.17 0.16 0.35 0.29 0.31 0.21 0.22 0.04 0.47 0.25 0.33 0.18 0.17 0.11 0.27 0.23 0.27 0.59 0.61 0.24 0.27 1.0 0.16 0.2 0.26 0.12 0.21 0.28 0.6
0.07 0.09 0.07 0.13 0.11 0.09 0.18 0.06 0.13 0.12 0.1 0.13 0.18 0.22 0.05 0.05 0.08 0.11 0.13 0.29 0.02 0.05 0.05 0.55 1.0 0.1 0.05 0.12 0.22 0.15 0.13 0.19 0.13 0.17 0.23
0.2 0.18 0.17 0.16 0.35 0.2 0.13 0.13 0.27 0.24 0.23 0.21 0.33 0.23 0.23 0.13 0.31 0.12 0.13 0.21 0.23 0.25 0.24 0.28 0.4 0.36 0.63 0.37 0.23 0.24 0.27 0.19 0.26 0.32 1.0
0.28 0.3 0.28 0.44 0.41 0.33 0.4 0.3 0.41 0.32 0.28 0.32 0.66 0.2 0.17 0.13 0.27 0.16 0.22 0.3 0.17 0.29 0.2 0.5 0.22 0.47 1.0 0.48 0.46 0.46 0.45 0.36 0.31 0.46 0.99
0.19 0.15 0.16 0.1 0.09 0.18 0.09 0.22 0.1 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.06 0.05 0.14 0.09 0.14 0.01 0.03 0.01 0.21 1.0 0.0 0.0 0.06 0.07 0.13 0.09 0.16 0.0 0.0 0.0
0.32 0.18 0.2 0.14 0.09 0.22 0.07 0.33 0.08 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.16 0.11 0.13 0.0 0.05 0.01 0.04 0.01 0.16 1.0 0.0 0.01 0.07 0.0 0.19 0.18 0.26 0.0 0.0 0.0
0.03 0.03 0.09 0.16 0.22 0.09 0.16 0.02 0.18 0.1 0.05 0.04 0.1 0.11 0.04 0.04 0.02 0.03 0.03 0.14 0.11 0.02 0.26 0.07 0.61 0.52 0.75 0.16 0.26 0.04 0.05 0.04 0.04 0.22 1.0
0.28 0.25 0.27 0.23 0.51 0.35 0.27 0.23 0.49 0.43 0.66 0.56 0.13 0.13 0.23 0.12 0.27 0.12 0.13 0.27 0.05 0.13 0.07 0.41 0.35 0.31 0.48 0.78 0.28 0.39 0.36 0.3 0.53 0.62 1.0
0.29 0.29 0.26 0.29 0.47 0.36 0.26 0.33 0.45 0.35 0.23 0.27 0.5 0.19 0.28 0.21 0.33 0.22 0.28 0.3 0.26 0.4 0.3 0.75 0.55 0.87 1.0 0.34 0.35 0.78 0.75 0.58 0.26 0.52 0.93
0.22 0.24 0.22 0.23 0.29 0.26 0.24 0.17 0.35 0.29 0.19 0.23 0.28 0.34 0.29 0.15 0.26 0.17 0.21 0.43 0.15 0.23 0.14 0.5 0.32 0.48 0.37 0.37 0.22 0.41 0.38 0.4 0.22 0.38 1.0
0.18 0.16 0.14 0.13 0.15 0.19 0.13 0.12 0.2 0.2 0.16 0.15 0.17 0.07 0.12 0.12 0.17 0.13 0.14 0.22 0.05 0.09 0.04 1.0 0.97 0.22 0.27 0.12 0.13 0.25 0.26 0.17 0.16 0.26 0.59
0.05 0.09 0.03 0.1 0.55 0.12 0.13 0.03 0.19 0.11 0.53 0.43 0.3 0.11 0.11 0.1 0.11 0.08 0.1 0.17 0.12 0.11 0.26 0.11 0.85 0.46 0.32 1.0 0.4 0.08 0.11 0.1 0.54 0.13 0.84
0.18 0.11 0.1 0.07 0.18 0.16 0.06 0.1 0.16 0.12 0.44 0.07 0.1 0.05 0.33 0.14 0.2 0.12 0.23 0.08 0.17 0.17 0.15 0.24 0.33 0.33 0.32 0.44 0.08 0.16 0.2 0.11 0.1 0.24 1.0
0.7 0.41 0.6 0.33 0.51 0.85 0.21 0.58 0.63 0.57 0.0 0.0 0.45 0.0 0.94 0.57 0.26 0.43 0.41 0.26 1.0 0.7 0.74 0.6 0.96 0.71 0.57 0.81 0.27 0.3 0.7 0.11 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44
0.41 0.26 0.33 0.3 0.35 0.41 0.26 0.29 0.5 0.39 0.44 0.33 0.4 0.2 0.62 0.36 0.8 0.31 0.33 0.34 0.15 0.22 0.13 0.95 0.65 0.45 0.61 0.48 0.5 0.77 1.0 0.37 0.4 0.58 0.85
0.27 0.45 0.18 0.35 0.54 0.24 0.28 0.16 0.28 0.3 0.06 0.08 1.0 0.05 0.15 0.32 0.22 0.22 0.2 0.31 0.07 0.11 0.18 0.4 0.75 0.62 0.34 0.61 0.89 0.08 0.06 0.17 0.05 0.15 0.04
0.14 0.01 0.06 0.0 0.46 0.54 0.0 0.04 0.65 0.26 0.14 0.12 0.34 0.0 0.6 0.43 0.74 0.06 0.02 0.61 0.07 0.05 0.05 0.19 0.66 1.0 0.4 0.45 0.42 0.12 0.39 0.01 0.2 0.13 0.07
0.13 0.08 0.1 0.08 0.41 0.13 0.08 0.11 0.17 0.15 0.38 0.18 0.29 0.09 0.14 0.07 0.19 0.1 0.12 0.33 0.11 0.15 0.17 0.21 0.45 0.46 0.88 0.15 0.31 0.26 0.34 0.17 0.22 0.16 1.0
0.19 0.07 0.16 0.07 0.38 0.28 0.1 0.11 0.41 0.33 0.32 0.27 0.22 0.03 0.19 0.18 0.15 0.08 0.07 0.21 0.19 0.13 0.29 0.27 0.37 0.65 0.49 1.0 0.29 0.11 0.21 0.03 0.37 0.14 0.72
0.17 0.13 0.15 0.16 0.19 0.21 0.15 0.19 0.29 0.23 0.35 0.24 0.1 0.13 0.08 0.06 0.06 0.06 0.07 0.12 0.03 0.06 0.05 0.24 0.21 0.35 1.0 0.06 0.13 0.15 0.18 0.1 0.27 0.21 0.48
0.42 0.29 0.4 0.28 0.34 0.4 0.23 0.35 0.5 0.42 0.59 0.44 0.3 0.1 0.44 0.37 0.83 0.31 0.37 0.3 0.05 0.15 0.06 0.52 0.38 0.39 0.69 0.84 0.52 0.58 0.65 0.37 0.33 0.72 1.0
0.3 0.14 0.24 0.07 0.48 0.32 0.04 0.19 0.21 0.2 0.61 0.35 0.3 0.09 0.87 0.25 1.0 0.22 0.27 0.36 0.07 0.12 0.1 0.71 0.82 0.78 0.71 0.36 0.24 0.45 0.57 0.35 0.29 0.46 0.47
0.03 0.04 0.03 0.04 0.21 0.04 0.06 0.04 0.07 0.04 0.08 0.08 0.15 0.1 0.08 0.05 0.04 0.06 0.1 0.04 0.07 0.08 0.15 0.08 1.0 0.17 0.71 0.13 0.12 0.05 0.06 0.06 0.08 0.15 0.54
0.14 0.05 0.11 0.08 0.43 0.06 0.02 0.02 0.34 0.16 0.35 0.08 0.1 0.02 0.21 0.32 0.13 0.08 0.11 0.21 0.2 0.07 0.35 0.09 1.0 0.45 0.58 0.33 0.16 0.1 0.24 0.03 0.13 0.11 0.52
0.07 0.08 0.1 0.08 0.08 0.25 0.11 0.12 0.24 0.13 0.05 0.05 0.11 0.1 0.03 0.01 0.04 0.01 0.01 0.02 0.07 0.05 0.08 0.43 1.0 0.23 0.15 0.1 0.06 0.02 0.02 0.01 0.05 0.02 0.27
0.24 0.18 0.16 0.15 0.31 0.36 0.15 0.24 0.38 0.27 0.08 0.07 0.56 0.03 0.42 0.24 0.24 0.22 0.19 0.29 0.53 0.2 0.54 0.3 1.0 0.47 0.22 0.77 0.27 0.12 0.21 0.09 0.08 0.14 0.58
0.28 0.15 0.25 0.09 0.3 0.32 0.09 0.51 0.26 0.23 0.61 0.39 0.19 0.17 0.23 0.14 0.44 0.12 0.24 0.13 0.29 0.46 0.14 0.46 0.19 0.29 0.25 0.25 0.23 0.31 0.34 0.18 0.36 0.48 1.0
0.18 0.25 0.18 0.25 0.3 0.39 0.31 0.24 0.5 0.42 0.28 0.38 0.85 0.34 0.26 0.16 0.4 0.22 0.2 0.25 0.08 0.13 0.17 0.83 0.72 0.49 0.45 0.32 0.28 0.89 0.75 0.81 0.33 0.2 1.0
0.0 0.0 0.0 0.62 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)