1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_79 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
4h after treatment
4h after treatment,No nitrate
8h after treatment
8h after treatment,No nitrate
20C
20h after treatment
20h after treatment,No nitrate
20h after treatment,Nocodazole added
36h after treatment
36h after treatment,No phosphate
Blue light,10min after light change
Blue light,60min after light change
Bohlin
CCAP1055/1,20C
CCAP1055/1,20C,High CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Low CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Normal CO2,OligoDT primed
CCMP2561
CCMP2561 Nitrase Reductase Knockout
CCMP632
CCMP632,24h
CCMP632,48h
CCMP632,72h
CCMP632,High light acclimated WT
CCMP632,Low light acclimated WT
NEPCC640,8h,1000ppmv CO2
NEPCC640,8h,390 ppmv CO2
No light,8h after treatment
Pt-1
Pt-1 8.6
Pt-1 8.6,With nitrogen
Pt-1 8.6,Without nitrogen
Red light,0min before light change
UTEX 646,Blue light
UTEX 646,No light
0.17 0.35 0.15 0.32 0.19 0.29 0.47 0.23 0.26 0.34 0.0 0.0 0.05 0.02 0.1 0.13 0.08 0.17 0.17 0.31 0.48 1.0 0.56 0.07 0.08 0.0 0.01 0.26 0.03 0.34 0.14 0.37 0.0 0.01 0.0
0.17 0.16 0.17 0.21 0.27 0.24 0.25 0.17 0.35 0.3 0.46 0.49 0.02 0.46 0.13 0.11 0.06 0.18 0.17 0.25 1.0 0.78 0.81 0.39 0.39 0.09 0.08 0.22 0.27 0.29 0.22 0.36 0.43 0.88 0.98
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.39 0.39 0.02 0.26 0.27 0.48 0.08 0.09 0.02 0.33 0.59 1.0 0.37 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.08 0.07 0.12 0.39 0.26 0.01
0.33 0.35 0.32 0.31 0.91 0.37 0.17 0.21 0.38 0.28 0.06 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.17 0.87 1.0 0.72 0.06 0.0 0.03 0.06 0.28 0.03 0.18 0.08 0.19 0.04 0.12 0.14
0.03 0.03 0.03 0.06 0.29 0.05 0.07 0.48 0.08 0.03 0.08 0.05 0.06 0.0 0.0 0.0 0.06 0.03 0.03 0.01 0.49 0.16 0.07 0.2 0.0 0.25 1.0 0.02 0.02 0.35 0.39 0.1 0.08 0.01 0.0
0.01 0.01 0.01 0.01 0.44 0.01 0.01 0.04 0.01 0.01 0.05 0.07 0.03 0.04 0.02 0.02 0.01 0.14 0.15 0.19 0.63 1.0 0.68 0.17 0.13 0.2 0.85 0.01 0.04 0.15 0.22 0.07 0.07 0.03 0.09
0.26 0.19 0.24 0.17 0.3 0.35 0.19 0.24 0.35 0.34 0.34 0.26 0.13 0.11 0.11 0.06 0.1 0.13 0.1 0.33 0.72 0.61 1.0 0.42 0.38 0.07 0.06 0.14 0.2 0.35 0.28 0.44 0.26 0.33 0.3
0.33 0.24 0.1 0.13 0.47 0.18 0.03 0.66 0.04 0.05 0.09 0.1 0.03 0.07 0.18 0.02 0.09 0.05 0.11 0.05 0.65 1.0 0.13 0.32 0.11 0.34 0.18 0.13 0.02 0.47 0.55 0.04 0.1 0.04 0.01
0.96 0.49 0.73 0.32 0.33 1.0 0.28 0.49 0.58 0.54 0.4 0.45 0.14 0.2 0.5 0.17 0.16 0.42 0.64 0.44 0.9 0.7 0.22 0.64 0.21 0.18 0.14 0.22 0.32 0.42 0.47 0.5 0.54 0.92 0.62
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.07 0.04 0.0 0.08 0.07 0.0 0.68 0.95 0.6 1.0 0.37 0.0 0.01 0.0 0.0 0.39 0.16 0.59 0.0 0.01 0.0
0.33 0.28 0.37 0.23 0.36 0.43 0.24 0.33 0.45 0.48 0.28 0.27 0.12 0.29 0.4 0.23 0.24 0.38 0.49 0.29 0.85 0.96 0.55 0.58 0.1 0.15 0.2 0.02 0.26 0.38 0.36 0.43 0.3 0.88 1.0
0.58 0.47 0.44 0.37 0.45 0.59 0.43 0.34 0.57 0.55 0.39 0.43 0.48 0.31 0.41 0.3 0.41 0.44 0.49 0.29 0.82 1.0 0.66 0.87 0.18 0.21 0.17 0.48 0.28 0.53 0.57 0.37 0.45 0.47 0.37
0.23 0.33 0.21 0.42 0.51 0.28 0.48 0.24 0.34 0.29 0.28 0.32 0.0 0.68 0.05 0.04 0.04 0.16 0.13 0.14 0.91 0.98 1.0 0.3 0.16 0.17 0.2 0.21 0.19 0.3 0.16 0.5 0.33 0.43 0.2
0.24 0.27 0.23 0.22 0.3 0.28 0.24 0.21 0.29 0.31 0.35 0.44 0.13 0.15 0.17 0.14 0.09 0.21 0.18 0.45 0.58 0.87 1.0 0.37 0.26 0.1 0.11 0.26 0.18 0.23 0.21 0.27 0.42 0.51 0.18
0.85 0.57 0.73 0.48 0.63 0.68 0.42 0.6 0.59 0.56 0.38 0.32 0.34 0.15 0.7 0.31 0.69 0.39 0.51 0.4 1.0 0.73 0.93 0.74 0.46 0.48 0.24 0.48 0.25 0.53 0.59 0.44 0.3 0.2 0.07
0.21 0.07 0.21 0.08 0.15 0.21 0.11 0.14 0.19 0.15 0.61 0.38 0.04 0.14 0.24 0.1 0.28 0.08 0.1 0.22 0.72 1.0 0.38 0.12 0.14 0.01 0.04 0.36 0.1 0.16 0.12 0.14 0.46 0.64 0.38
0.63 0.48 0.4 0.41 0.42 0.56 0.59 0.28 0.57 0.61 0.71 0.53 0.33 0.47 0.24 0.16 0.3 0.26 0.27 0.16 1.0 0.91 0.78 0.6 0.35 0.23 0.26 0.62 0.24 0.52 0.49 0.54 0.49 0.93 0.46
0.22 0.17 0.17 0.14 0.52 0.25 0.09 0.17 0.29 0.18 0.27 0.13 0.03 0.1 0.15 0.04 0.11 0.06 0.13 0.13 0.63 1.0 0.67 0.19 0.09 0.08 0.11 0.52 0.09 0.1 0.16 0.07 0.2 0.07 0.03
0.88 0.57 0.47 0.33 0.55 0.93 0.47 0.43 0.5 0.54 0.43 0.32 0.11 0.15 0.56 0.24 0.29 0.4 0.43 0.17 0.68 1.0 0.49 0.46 0.08 0.17 0.16 0.09 0.12 0.42 0.39 0.43 0.42 0.33 0.53
0.5 0.53 0.44 0.44 0.28 0.55 0.49 0.31 0.43 0.55 0.36 0.4 0.24 0.5 0.35 0.23 0.58 0.29 0.28 0.28 0.88 1.0 0.57 0.42 0.17 0.22 0.21 0.37 0.16 0.41 0.28 0.61 0.37 0.44 0.25
0.52 0.55 0.39 0.47 0.47 0.63 0.63 0.39 0.63 0.54 0.6 0.44 0.17 0.2 0.09 0.11 0.05 0.17 0.11 0.24 0.66 0.89 0.64 0.2 0.07 0.13 0.11 0.26 0.25 0.29 0.18 0.43 0.4 1.0 0.47
0.38 0.47 0.41 0.43 0.36 0.54 0.56 0.47 0.5 0.51 0.37 0.32 0.3 0.25 0.16 0.07 0.2 0.22 0.23 0.18 0.9 1.0 0.95 0.52 0.17 0.33 0.21 0.12 0.21 0.57 0.39 0.55 0.28 0.7 0.1
0.3 0.35 0.37 0.4 0.28 0.35 0.38 1.0 0.37 0.38 0.44 0.49 0.28 0.11 0.08 0.12 0.02 0.13 0.13 0.16 0.57 0.56 0.36 0.4 0.21 0.19 0.22 0.43 0.19 0.42 0.42 0.29 0.48 0.57 0.49
0.32 0.22 0.29 0.24 0.36 0.35 0.26 0.33 0.39 0.39 0.51 0.62 0.2 0.75 0.44 0.34 0.55 0.24 0.42 0.24 0.43 1.0 0.32 0.45 0.12 0.13 0.09 0.28 0.19 0.21 0.24 0.12 0.6 0.42 0.44
0.32 0.66 0.32 0.52 0.39 0.41 0.52 0.6 0.37 0.49 0.31 0.29 0.09 0.21 0.19 0.13 0.36 0.15 0.15 0.26 0.52 1.0 0.44 0.2 0.08 0.15 0.12 0.15 0.1 0.25 0.35 0.23 0.32 0.11 0.08
0.37 0.46 0.37 0.42 0.4 0.41 0.41 0.42 0.41 0.42 0.01 0.0 0.63 0.0 0.42 0.47 0.4 0.21 0.19 0.42 0.91 1.0 0.67 0.65 0.36 0.15 0.13 0.52 0.3 0.52 0.56 0.59 0.01 0.0 0.0
0.87 0.59 0.64 0.44 0.65 1.0 0.45 0.59 0.8 0.76 0.3 0.31 0.17 0.09 0.73 0.34 0.35 0.48 0.55 0.29 0.96 0.82 0.58 0.48 0.22 0.3 0.28 0.67 0.2 0.45 0.48 0.4 0.32 0.55 0.75
0.19 0.19 0.17 0.19 0.28 0.2 0.16 0.18 0.22 0.24 0.56 0.53 0.05 0.28 0.11 0.07 0.06 0.15 0.19 0.15 0.7 0.87 0.61 0.24 0.07 0.09 0.08 0.41 0.13 0.13 0.08 0.12 0.53 0.62 1.0
0.65 0.63 0.43 0.52 0.6 0.52 0.44 0.23 0.64 0.43 0.07 0.06 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.01 0.14 1.0 0.99 0.51 0.06 0.01 0.01 0.04 0.49 0.04 0.23 0.11 0.16 0.08 0.02 0.06
0.07 0.1 0.09 0.09 0.26 0.1 0.11 0.34 0.1 0.12 0.06 0.04 0.01 0.01 0.04 0.01 0.03 0.05 0.07 0.1 1.0 0.79 0.25 0.39 0.2 0.1 0.34 0.13 0.05 0.75 0.39 0.3 0.04 0.01 0.01
0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.39 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.02 0.5 1.0 0.11 0.02 0.07 0.02 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.21 0.2 0.0
0.77 0.64 0.63 0.58 0.58 0.87 0.65 0.56 0.88 0.82 0.45 0.44 0.44 0.38 0.7 0.49 0.21 0.64 0.64 0.39 0.82 0.87 0.67 0.93 0.4 0.34 0.35 0.55 0.41 0.65 0.59 0.65 0.49 0.47 1.0
0.25 0.26 0.18 0.26 0.29 0.43 0.37 0.21 0.77 0.63 0.48 0.54 0.39 0.31 0.13 0.15 0.04 0.21 0.21 0.94 0.85 0.89 0.55 0.5 0.16 0.11 0.18 0.23 0.54 0.44 0.38 0.34 0.65 0.42 1.0
0.25 0.31 0.2 0.27 0.32 0.35 0.35 0.19 0.4 0.39 0.52 0.48 0.24 0.16 0.12 0.13 0.04 0.18 0.16 0.29 0.73 0.68 1.0 0.16 0.24 0.08 0.1 0.45 0.16 0.16 0.13 0.22 0.43 0.47 0.81
0.35 0.37 0.28 0.35 0.44 0.44 0.46 0.24 0.56 0.48 0.42 0.56 0.24 0.31 0.28 0.23 0.09 0.36 0.34 0.43 0.94 1.0 0.92 0.49 0.39 0.34 0.3 0.7 0.22 0.46 0.39 0.55 0.57 0.97 0.96
0.29 0.37 0.33 0.38 0.41 0.31 0.36 0.35 0.31 0.38 0.3 0.36 0.28 0.49 0.14 0.11 0.13 0.25 0.31 0.31 0.82 1.0 0.83 0.38 0.14 0.18 0.1 0.12 0.2 0.54 0.36 0.77 0.3 0.35 0.32
0.35 0.19 0.27 0.16 0.67 0.3 0.18 0.25 0.22 0.27 0.05 0.06 0.0 0.2 0.21 0.07 0.27 0.08 0.11 0.27 0.73 1.0 0.8 0.34 0.03 0.0 0.0 0.49 0.14 0.3 0.36 0.17 0.06 0.34 0.32
0.23 0.3 0.19 0.28 0.29 0.29 0.37 0.23 0.3 0.4 0.4 0.47 0.21 0.38 0.17 0.11 0.17 0.14 0.16 0.46 0.67 1.0 0.5 0.32 0.15 0.11 0.1 0.2 0.15 0.35 0.32 0.29 0.45 0.6 0.39
0.02 0.0 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.01 0.03 0.15 0.19 0.22 0.09 0.41 0.36 0.27 0.04 0.0 0.23 0.98 1.0 0.34 0.81 0.44 0.0 0.0 0.0 0.07 0.37 0.32 0.31 0.21 0.32 0.55
0.43 0.44 0.47 0.47 0.37 0.44 0.63 0.38 0.58 0.49 0.15 0.07 0.75 0.05 0.0 0.07 0.0 0.11 0.04 0.14 1.0 0.67 0.83 0.12 0.44 0.1 0.27 0.53 0.09 0.31 0.48 0.14 0.07 0.04 0.06
0.53 0.32 0.46 0.34 0.69 0.56 0.23 0.4 0.53 0.42 0.31 0.35 0.25 0.23 0.39 0.19 0.3 0.32 0.41 0.25 1.0 0.75 1.0 0.69 0.29 0.29 0.4 0.33 0.16 0.3 0.26 0.3 0.35 0.63 0.25
0.47 0.45 0.39 0.44 0.56 0.46 0.44 0.3 0.54 0.58 0.47 0.51 0.34 0.64 0.27 0.29 0.21 0.31 0.25 0.41 0.71 0.9 1.0 0.91 0.79 0.19 0.15 0.44 0.43 0.46 0.4 0.46 0.46 0.74 0.56
0.14 0.2 0.12 0.17 0.3 0.12 0.19 0.17 0.23 0.23 0.6 0.72 0.47 0.18 0.13 0.16 0.16 0.13 0.34 0.14 0.5 0.98 0.32 0.21 0.08 0.12 0.07 0.35 0.12 0.12 0.19 0.08 0.7 0.43 1.0
0.35 0.36 0.27 0.3 0.46 0.4 0.28 0.24 0.42 0.42 0.23 0.22 0.17 0.12 0.21 0.16 0.16 0.28 0.29 0.34 0.71 0.57 0.78 0.26 0.26 0.09 0.08 0.24 0.23 0.33 0.26 0.3 0.26 0.48 1.0
0.22 0.18 0.14 0.14 0.15 0.18 0.19 0.2 0.17 0.2 0.17 0.19 0.05 0.16 0.06 0.07 0.07 0.12 0.11 0.08 0.45 0.79 0.27 1.0 0.26 0.03 0.03 0.07 0.07 0.27 0.16 0.31 0.15 0.21 0.1
0.35 0.35 0.28 0.29 0.4 0.3 0.24 0.27 0.36 0.36 0.08 0.1 0.13 0.12 0.26 0.19 0.17 0.36 0.34 0.47 1.0 0.97 0.65 0.38 0.26 0.21 0.29 0.24 0.13 0.73 0.35 0.55 0.09 0.17 0.1
0.64 0.51 0.52 0.51 0.62 0.69 0.45 0.43 0.73 0.61 0.32 0.4 0.3 0.24 0.47 0.52 0.31 0.49 0.67 0.46 0.94 1.0 0.73 0.93 0.33 0.3 0.22 0.76 0.34 0.59 0.54 0.57 0.37 0.53 0.88
0.37 0.36 0.3 0.27 0.67 0.48 0.31 0.26 0.62 0.54 0.46 0.44 0.11 0.21 0.25 0.19 0.05 0.31 0.33 0.26 0.8 0.77 0.91 0.41 0.36 0.16 0.27 0.39 0.18 0.28 0.26 0.29 0.41 0.67 1.0
0.24 0.3 0.42 0.34 0.38 0.24 0.27 1.0 0.23 0.33 0.34 0.4 0.97 0.08 0.08 0.16 0.14 0.26 0.21 0.12 0.85 0.96 0.51 0.78 0.38 0.03 0.03 0.24 0.07 0.57 0.48 0.71 0.32 0.37 0.39
0.42 0.38 0.32 0.33 0.45 0.51 0.4 0.47 0.48 0.51 0.42 0.43 0.2 0.27 0.27 0.22 0.21 0.28 0.35 0.25 0.83 1.0 0.95 0.64 0.35 0.38 0.38 0.38 0.3 0.49 0.42 0.28 0.34 0.48 0.25
0.68 0.61 0.53 0.7 0.52 0.65 0.71 0.74 0.79 0.78 0.59 0.57 0.29 0.49 0.11 0.16 0.02 0.36 0.3 0.3 0.78 0.88 0.78 0.77 0.33 0.14 0.12 1.0 0.31 0.79 0.87 0.65 0.5 0.48 0.66
0.33 0.33 0.39 0.34 0.2 0.37 0.4 0.5 0.43 0.42 0.25 0.28 0.13 0.19 0.09 0.09 0.03 0.14 0.16 0.19 0.59 0.68 0.23 1.0 0.17 0.4 0.87 0.43 0.19 0.86 0.86 0.51 0.23 0.32 0.13
0.17 0.27 0.19 0.26 0.55 0.27 0.36 0.23 0.36 0.45 0.99 0.79 0.07 0.39 0.32 0.2 0.28 0.28 0.38 0.28 0.87 1.0 0.94 0.29 0.06 0.29 0.19 0.12 0.3 0.13 0.13 0.12 0.67 0.43 0.34
0.34 0.4 0.31 0.36 0.31 0.41 0.41 0.37 0.39 0.38 0.37 0.33 0.22 0.33 0.18 0.16 0.14 0.2 0.2 0.14 1.0 0.64 0.59 0.39 0.25 0.13 0.07 0.33 0.28 0.43 0.3 0.55 0.33 0.77 0.69
0.66 0.85 0.56 0.85 0.57 0.85 0.99 0.47 0.84 0.85 0.59 0.6 0.24 0.74 0.27 0.2 0.31 0.27 0.4 0.66 0.66 1.0 0.62 0.58 0.15 0.43 0.33 0.73 0.31 0.59 0.39 0.72 0.6 0.89 0.67
0.33 0.36 0.27 0.32 0.1 0.34 0.36 0.21 0.43 0.51 0.04 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.92 1.0 0.63 0.21 0.07 0.0 0.0 0.55 0.0 0.21 0.06 0.21 0.04 0.03 0.03
0.66 0.7 0.59 0.65 0.51 0.79 0.69 0.44 0.74 0.73 0.38 0.39 0.39 0.6 0.38 0.3 0.27 0.47 0.47 0.27 1.0 0.84 0.8 0.72 0.39 0.28 0.21 0.64 0.3 0.6 0.51 0.61 0.35 0.33 0.49
0.24 0.23 0.2 0.18 0.24 0.27 0.26 0.18 0.3 0.29 0.17 0.26 0.14 0.53 0.22 0.19 0.12 0.21 0.22 0.09 0.72 1.0 0.57 0.3 0.23 0.03 0.02 0.23 0.12 0.19 0.14 0.17 0.24 0.18 0.15
0.65 0.62 0.64 0.79 0.63 0.72 0.74 0.55 0.85 0.78 0.52 0.48 0.29 0.3 0.36 0.43 0.29 0.54 0.6 0.37 0.99 1.0 0.86 0.56 0.15 0.31 0.67 0.45 0.19 0.65 0.85 0.49 0.55 0.61 0.48
0.22 0.38 0.49 0.56 0.21 0.24 0.42 0.59 0.31 0.35 0.22 0.21 0.25 0.11 0.11 0.15 0.15 0.27 0.27 0.28 0.31 0.93 0.06 0.74 0.25 0.28 0.34 0.17 0.19 0.84 1.0 0.63 0.21 0.43 0.6
0.16 0.15 0.15 0.12 0.4 0.22 0.14 0.12 0.21 0.19 0.53 0.45 0.42 0.3 0.24 0.12 0.24 0.25 0.49 0.24 0.96 1.0 0.62 0.43 0.09 0.27 0.26 0.1 0.17 0.22 0.2 0.24 0.45 0.22 0.13
0.1 0.27 0.18 0.22 0.12 0.15 0.23 0.23 0.12 0.21 0.23 0.24 0.3 0.2 0.09 0.07 0.19 0.14 0.12 0.22 0.76 1.0 0.64 0.25 0.17 0.04 0.01 0.05 0.04 0.5 0.38 0.5 0.24 0.02 0.05
0.27 0.29 0.33 0.56 0.57 0.26 0.32 0.65 0.3 0.34 0.09 0.14 0.12 0.01 0.07 0.11 0.14 0.26 0.16 0.08 0.81 1.0 0.73 0.42 0.11 0.11 0.11 0.37 0.16 0.65 0.39 0.41 0.09 0.02 0.01
0.7 0.46 0.5 0.32 0.87 0.76 0.32 0.35 0.48 0.39 0.25 0.32 0.32 0.13 0.49 0.22 0.28 0.29 0.22 0.27 0.98 1.0 0.86 0.76 0.39 0.25 0.24 0.53 0.21 0.47 0.62 0.32 0.29 0.73 0.26
0.4 0.69 0.49 0.97 0.53 0.59 1.0 0.43 0.78 0.86 0.23 0.31 0.09 0.21 0.17 0.19 0.23 0.2 0.2 0.37 0.44 0.67 0.35 0.25 0.07 0.18 0.14 0.34 0.32 0.22 0.36 0.22 0.31 0.07 0.06
0.36 0.4 0.41 0.41 0.99 0.3 0.61 0.33 0.34 0.44 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.05 0.0 0.09 0.07 0.21 0.92 0.46 1.0 0.0 0.0 0.13 0.08 0.41 0.25 0.07 0.1 0.0 0.02 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)