Heatmap: Cluster_23 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
4h after treatment
4h after treatment,No nitrate
8h after treatment
8h after treatment,No nitrate
20C
20h after treatment
20h after treatment,No nitrate
20h after treatment,Nocodazole added
36h after treatment
36h after treatment,No phosphate
Blue light,10min after light change
Blue light,60min after light change
Bohlin
CCAP1055/1,20C
CCAP1055/1,20C,High CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Low CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Normal CO2,OligoDT primed
CCMP2561
CCMP2561 Nitrase Reductase Knockout
CCMP632
CCMP632,24h
CCMP632,48h
CCMP632,72h
CCMP632,High light acclimated WT
CCMP632,Low light acclimated WT
NEPCC640,8h,1000ppmv CO2
NEPCC640,8h,390 ppmv CO2
No light,8h after treatment
Pt-1
Pt-1 8.6
Pt-1 8.6,With nitrogen
Pt-1 8.6,Without nitrogen
Red light,0min before light change
UTEX 646,Blue light
UTEX 646,No light
0.18 0.09 0.14 0.09 0.0 0.24 0.09 0.06 0.35 0.21 0.13 0.04 0.04 0.06 0.0 0.19 0.0 0.06 0.08 0.01 0.04 0.0 0.14 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.22 0.01 0.0 0.01 0.02 0.25 0.03
0.31 0.22 0.24 0.14 0.1 0.22 0.1 0.14 0.19 0.16 0.19 0.07 0.01 0.02 0.16 0.14 0.18 0.13 0.14 0.02 0.07 0.14 0.08 0.1 0.04 0.16 0.11 1.0 0.09 0.1 0.18 0.01 0.07 0.15 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 1.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.21
0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.13 0.05 0.0 0.12 0.01 0.01 0.01 0.03 0.02 0.0 0.01 0.02 0.01 0.0 0.01 0.02 0.03 1.0 0.09 0.02 0.01 0.03 0.03 0.02 0.06
0.12 0.1 0.08 0.06 0.09 0.07 0.05 0.03 0.12 0.11 0.49 0.31 0.08 0.06 0.06 0.09 0.03 0.07 0.03 0.09 0.09 0.14 0.11 0.04 0.1 0.19 0.22 1.0 0.19 0.07 0.12 0.05 0.28 0.11 0.08
0.51 0.28 0.52 0.23 0.05 0.65 0.11 0.63 0.69 0.39 0.48 0.31 0.04 0.05 0.1 0.84 0.16 0.23 0.15 0.11 0.1 0.09 0.31 0.16 0.09 0.79 0.29 1.0 0.25 0.07 0.21 0.0 0.33 0.64 0.03
0.04 0.05 0.04 0.07 0.18 0.04 0.09 0.03 0.09 0.08 0.06 0.07 0.16 0.11 0.03 0.04 0.02 0.13 0.08 0.05 0.03 0.04 0.05 0.03 0.03 0.07 0.04 1.0 0.11 0.07 0.07 0.06 0.08 0.07 0.11
0.12 0.1 0.09 0.09 0.1 0.07 0.1 0.07 0.05 0.09 1.0 0.37 0.16 0.43 0.09 0.07 0.06 0.13 0.17 0.1 0.04 0.12 0.06 0.13 0.17 0.03 0.06 0.33 0.48 0.19 0.14 0.26 0.25 0.39 0.23
0.1 0.03 0.12 0.02 0.01 0.05 0.01 0.09 0.07 0.05 1.0 0.18 0.0 0.0 0.09 0.55 0.12 0.08 0.07 0.0 0.09 0.13 0.19 0.01 0.0 0.05 0.01 0.61 0.03 0.0 0.01 0.0 0.31 0.06 0.0
0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.06 0.01 0.01 1.0 0.1 0.01 0.02 0.01 0.06 0.01 0.02 0.03 0.0 0.01 0.02 0.05 0.0 0.01 0.02 0.01 0.95 0.05 0.01 0.01 0.01 0.19 0.21 0.01
0.01 0.01 0.02 0.01 0.07 0.02 0.01 0.06 0.01 0.01 0.59 0.08 0.01 0.03 0.06 0.05 0.03 0.04 0.05 0.0 0.02 0.04 0.03 0.01 0.06 0.02 0.01 1.0 0.07 0.02 0.03 0.03 0.11 0.15 0.02
0.08 0.06 0.05 0.06 0.05 0.08 0.07 0.05 0.07 0.06 0.17 0.07 0.13 0.04 0.04 0.03 0.04 0.11 0.1 0.02 0.04 0.04 0.05 0.03 0.02 0.02 0.03 1.0 0.19 0.09 0.06 0.11 0.04 0.32 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 1.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01
0.08 0.07 0.08 0.08 0.04 0.06 0.07 0.09 0.06 0.08 1.0 0.18 0.08 0.04 0.17 0.08 0.21 0.09 0.16 0.04 0.05 0.21 0.04 0.1 0.07 0.19 0.4 0.55 0.11 0.19 0.27 0.1 0.3 0.27 0.14
0.03 0.03 0.04 0.05 0.01 0.02 0.07 0.05 0.04 0.04 0.08 0.01 0.07 0.02 0.01 0.01 0.02 0.05 0.06 0.07 0.02 0.04 0.02 0.15 0.09 0.1 0.07 1.0 0.09 0.05 0.07 0.05 0.07 0.06 0.01
0.03 0.05 0.06 0.08 0.02 0.04 0.12 0.05 0.07 0.08 0.65 0.1 0.28 0.07 0.04 0.03 0.05 0.13 0.13 0.06 0.04 0.06 0.07 0.24 0.22 0.19 0.17 1.0 0.32 0.19 0.25 0.19 0.29 0.32 0.03
0.06 0.1 0.04 0.06 0.12 0.02 0.05 0.04 0.03 0.04 0.19 0.14 0.08 0.33 0.04 0.08 0.03 0.18 0.22 0.05 0.04 0.06 0.07 0.04 0.07 0.06 0.05 1.0 0.34 0.09 0.05 0.16 0.08 0.36 0.31
0.1 0.1 0.05 0.07 0.19 0.09 0.13 0.06 0.12 0.12 0.03 0.02 0.03 0.0 0.05 0.01 0.01 0.04 0.05 0.06 0.18 0.24 0.19 0.02 0.05 0.05 0.05 1.0 0.07 0.05 0.02 0.07 0.03 0.02 0.0
0.19 0.12 0.18 0.07 0.23 0.17 0.05 0.24 0.2 0.19 0.81 0.5 0.04 0.07 0.14 0.08 0.21 0.08 0.08 0.04 0.19 0.35 0.32 0.06 0.06 0.22 0.15 1.0 0.22 0.11 0.17 0.07 0.53 0.42 0.19
0.03 0.04 0.04 0.05 0.16 0.02 0.02 0.02 0.06 0.05 0.26 0.28 0.02 0.01 0.04 0.08 0.01 0.07 0.04 0.06 0.03 0.08 0.09 0.01 0.03 0.0 0.0 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.24 0.02 0.01
0.07 0.1 0.08 0.1 0.03 0.07 0.14 0.09 0.23 0.16 0.36 0.04 0.0 0.02 0.02 0.06 0.01 0.1 0.11 0.01 0.04 0.04 0.04 0.01 0.01 0.01 0.0 1.0 0.18 0.01 0.02 0.01 0.04 0.18 0.04
0.2 0.15 0.19 0.1 0.12 0.18 0.05 0.56 0.1 0.11 0.7 0.22 0.03 0.1 0.19 0.48 0.16 0.17 0.2 0.08 0.26 0.5 0.33 0.09 0.05 0.16 0.06 1.0 0.32 0.12 0.16 0.09 0.35 0.22 0.24
0.11 0.11 0.11 0.09 0.09 0.1 0.09 0.07 0.12 0.15 0.5 0.17 0.02 0.05 0.21 0.1 0.18 0.06 0.08 0.06 0.07 0.11 0.08 0.1 0.04 0.23 0.11 1.0 0.12 0.08 0.14 0.01 0.22 0.05 0.3
0.11 0.38 0.16 0.41 0.1 0.11 0.57 0.06 0.21 0.28 0.48 0.12 0.13 0.08 0.16 0.22 0.3 0.22 0.2 0.13 0.03 0.06 0.06 0.08 0.06 0.2 0.07 1.0 0.19 0.09 0.13 0.07 0.18 0.21 0.19
0.03 0.04 0.02 0.03 0.09 0.04 0.04 0.03 0.06 0.04 0.52 0.38 0.07 0.06 0.06 0.04 0.05 0.1 0.11 0.02 0.02 0.09 0.05 0.02 0.01 0.03 0.02 1.0 0.1 0.03 0.04 0.03 0.35 0.41 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.14 0.12 0.13 0.01 0.05 0.02 0.02 0.03 0.06 0.0 0.05 0.42 0.09 0.02 0.01 0.03 0.04 1.0 0.02 0.06 0.1 0.0 0.05 0.06 0.0
0.13 0.07 0.11 0.05 0.16 0.07 0.03 0.15 0.15 0.1 0.54 0.55 0.1 0.4 0.11 0.08 0.04 0.1 0.05 0.16 0.22 0.24 0.37 0.06 0.09 0.17 0.11 1.0 0.17 0.06 0.09 0.03 0.61 0.22 0.02
0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.3 0.12 0.0 0.0 0.05 0.01 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.06 0.02 0.0 0.01 0.02 0.02 1.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.28 0.06 0.0
0.09 0.1 0.07 0.1 0.1 0.12 0.14 0.06 0.18 0.09 0.1 0.07 0.02 0.05 0.05 0.1 0.02 0.09 0.16 0.04 0.12 0.17 0.13 0.05 0.07 0.08 0.19 1.0 0.12 0.07 0.09 0.07 0.07 0.06 0.06
0.07 0.06 0.04 0.05 0.09 0.06 0.05 0.03 0.07 0.06 0.13 0.08 0.02 0.03 0.04 0.04 0.02 0.07 0.07 0.01 0.13 0.14 0.16 0.05 0.04 0.03 0.02 1.0 0.12 0.06 0.05 0.08 0.08 0.09 0.09
0.2 0.06 0.08 0.01 0.11 0.07 0.0 0.02 0.07 0.05 0.32 0.19 0.0 0.09 0.3 0.06 0.27 0.06 0.04 0.01 0.12 0.33 0.11 0.05 0.04 0.0 0.0 1.0 0.02 0.04 0.07 0.01 0.12 0.09 0.06
0.03 0.02 0.03 0.02 0.05 0.01 0.01 0.04 0.02 0.02 0.4 0.24 0.06 0.08 0.09 0.08 0.04 0.1 0.09 0.04 0.13 0.16 0.1 0.03 0.05 0.12 0.1 1.0 0.14 0.05 0.06 0.05 0.16 0.18 0.24
0.05 0.06 0.08 0.05 0.11 0.05 0.03 0.07 0.04 0.05 0.69 0.29 0.2 0.02 0.28 0.41 0.15 0.15 0.17 0.27 0.15 0.23 0.18 0.03 0.17 0.12 0.03 1.0 0.03 0.08 0.08 0.06 0.2 0.1 0.02
0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.02 0.02 0.02 0.05 0.18 0.1 0.01 0.02 0.0 0.04 0.01 0.04 0.03 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 0.0 0.01 0.01 1.0 0.04 0.0 0.01 0.0 0.11 0.01 0.01
0.52 0.17 0.57 0.1 0.22 0.57 0.01 0.35 0.31 0.13 0.96 0.6 0.02 0.03 0.38 0.42 0.52 0.18 0.25 0.04 0.08 0.2 0.12 0.1 0.07 0.56 0.3 1.0 0.14 0.06 0.13 0.0 0.45 0.7 0.08
0.42 0.33 0.43 0.35 0.06 0.31 0.2 0.16 0.45 0.37 0.31 0.13 0.07 0.02 0.09 0.43 0.09 0.21 0.2 0.06 0.03 0.07 0.06 0.07 0.05 0.22 0.09 1.0 0.25 0.03 0.07 0.0 0.13 0.19 0.04
0.14 0.14 0.1 0.11 0.1 0.09 0.12 0.06 0.14 0.17 0.11 0.13 0.07 0.08 0.05 0.08 0.02 0.09 0.07 0.07 0.21 0.42 0.25 0.05 0.05 0.02 0.02 1.0 0.09 0.04 0.04 0.04 0.14 0.13 0.18
0.15 0.06 0.06 0.02 0.03 0.04 0.0 0.05 0.06 0.04 0.86 0.27 0.04 0.01 0.31 0.57 0.15 0.06 0.11 0.04 0.2 0.29 0.19 0.17 0.2 0.2 0.16 1.0 0.12 0.04 0.08 0.01 0.27 0.28 0.45
0.04 0.05 0.05 0.07 0.04 0.04 0.08 0.04 0.06 0.08 0.35 0.16 0.03 0.04 0.03 0.05 0.01 0.13 0.07 0.05 0.05 0.09 0.03 0.05 0.01 0.03 0.02 1.0 0.03 0.03 0.02 0.02 0.26 0.06 0.22
0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.3 0.07 0.0 0.0 0.03 0.03 0.01 0.01 0.05 0.0 0.03 0.07 0.04 0.0 0.05 0.0 0.0 1.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.05 0.14 0.11
0.13 0.08 0.07 0.03 0.16 0.1 0.02 0.12 0.08 0.09 1.0 0.4 0.56 0.5 0.15 0.18 0.19 0.17 0.18 0.11 0.06 0.18 0.09 0.21 0.2 0.12 0.37 0.91 0.36 0.36 0.37 0.28 0.25 0.38 0.67
0.05 0.02 0.09 0.02 0.03 0.01 0.0 0.04 0.05 0.02 0.43 0.24 0.02 0.0 0.34 0.17 0.04 0.08 0.07 0.05 0.1 0.35 0.1 0.04 0.03 0.24 0.11 1.0 0.02 0.04 0.08 0.01 0.18 0.39 0.03
0.48 0.32 0.42 0.24 0.14 0.3 0.11 0.22 0.33 0.39 0.42 0.19 0.03 0.14 0.29 0.69 0.15 0.23 0.31 0.07 0.15 0.21 0.18 0.2 0.09 0.23 0.15 1.0 0.34 0.15 0.23 0.1 0.18 0.34 0.02
0.21 0.25 0.16 0.2 0.13 0.1 0.18 0.32 0.18 0.24 0.54 0.22 0.07 0.1 0.29 0.34 0.5 0.2 0.25 0.12 0.06 0.11 0.05 0.08 0.05 0.18 0.14 1.0 0.24 0.13 0.18 0.04 0.27 0.44 0.23
0.15 0.15 0.26 0.19 0.09 0.09 0.07 0.34 0.17 0.07 0.44 0.07 0.03 0.04 0.38 0.44 0.34 0.11 0.2 0.01 0.05 0.15 0.07 0.04 0.03 0.28 0.12 1.0 0.06 0.06 0.1 0.03 0.11 0.31 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.02 0.0 0.0 0.05 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.01 0.0 0.0 0.08 0.08 1.0 0.01 0.01 0.02 0.0 0.11 0.03 0.03
0.02 0.02 0.02 0.02 0.05 0.02 0.03 0.03 0.04 0.02 0.24 0.12 0.04 0.06 0.09 0.04 0.07 0.03 0.03 0.05 0.04 0.1 0.05 0.04 0.09 0.3 0.41 1.0 0.14 0.1 0.19 0.05 0.21 0.15 0.41
0.11 0.15 0.13 0.17 0.14 0.1 0.19 0.11 0.17 0.13 0.94 0.4 0.01 0.08 0.14 0.19 0.15 0.13 0.21 0.05 0.14 0.5 0.16 0.12 0.06 0.49 1.0 0.85 0.09 0.25 0.31 0.24 0.3 0.36 0.04
0.13 0.04 0.16 0.03 0.07 0.07 0.01 0.2 0.03 0.05 0.82 0.29 0.02 0.01 0.1 0.06 0.04 0.06 0.12 0.05 0.23 0.61 0.1 0.19 0.1 0.25 0.48 1.0 0.08 0.17 0.14 0.19 0.27 0.66 0.03
0.06 0.05 0.05 0.05 0.08 0.03 0.01 0.08 0.05 0.05 0.93 0.23 0.23 0.05 0.09 0.14 0.03 0.12 0.21 0.12 0.1 0.2 0.11 0.17 0.31 0.11 0.39 1.0 0.34 0.15 0.21 0.08 0.27 0.19 0.49
0.03 0.04 0.06 0.07 0.13 0.03 0.05 0.01 0.12 0.06 0.14 0.1 0.25 0.03 0.08 0.08 0.05 0.1 0.05 0.13 0.12 0.19 0.23 0.05 0.09 0.12 0.04 1.0 0.07 0.03 0.05 0.02 0.15 0.05 0.03
0.11 0.1 0.06 0.07 0.17 0.11 0.1 0.05 0.15 0.13 0.18 0.11 0.01 0.04 0.09 0.05 0.07 0.1 0.13 0.09 0.21 0.3 0.33 0.04 0.02 0.01 0.01 1.0 0.05 0.03 0.04 0.03 0.11 0.07 0.01
0.03 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.02 0.04 0.03 0.02 0.11 0.12 0.06 0.07 0.01 0.03 0.01 0.03 0.08 0.0 0.03 0.15 0.06 0.01 0.01 0.1 0.08 1.0 0.04 0.01 0.0 0.01 0.1 0.04 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.05 0.14 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.01 0.01 0.01 0.04 0.01 0.03 0.01 0.01 0.01 0.14 0.06 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.05 0.02 0.0 0.07 0.08 0.08 0.01 0.01 0.0 0.01 1.0 0.09 0.01 0.0 0.03 0.03 0.01 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.47 0.13 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 1.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.02 0.08 0.01
0.36 0.14 0.5 0.22 0.01 0.16 0.17 0.3 0.22 0.12 0.32 0.2 0.03 0.04 0.01 0.21 0.0 0.09 0.08 0.01 0.03 0.03 0.06 0.02 0.01 0.1 0.06 1.0 0.24 0.02 0.02 0.03 0.07 0.36 0.0
0.18 0.2 0.12 0.12 0.18 0.2 0.17 0.09 0.36 0.34 0.32 0.35 0.18 0.35 0.1 0.16 0.07 0.19 0.16 0.04 0.07 0.13 0.14 0.09 0.09 0.06 0.04 1.0 0.14 0.05 0.07 0.04 0.37 0.27 0.1
0.07 0.08 0.05 0.03 0.02 0.03 0.01 0.08 0.03 0.03 0.41 0.11 0.02 0.0 0.02 0.09 0.03 0.03 0.05 0.01 0.01 0.07 0.03 0.01 0.01 0.05 0.03 1.0 0.04 0.01 0.02 0.0 0.09 0.13 0.02
0.09 0.09 0.08 0.1 0.14 0.08 0.1 0.06 0.16 0.13 0.26 0.15 0.12 0.14 0.09 0.13 0.1 0.19 0.17 0.09 0.03 0.16 0.05 0.06 0.08 0.15 0.14 1.0 0.21 0.08 0.1 0.08 0.15 0.24 0.06
0.06 0.08 0.05 0.07 0.11 0.1 0.08 0.11 0.09 0.09 0.42 0.2 0.04 0.11 0.05 0.07 0.05 0.12 0.11 0.03 0.09 0.23 0.13 0.05 0.03 0.02 0.03 1.0 0.12 0.12 0.06 0.17 0.11 0.1 0.08
0.2 0.13 0.11 0.06 0.05 0.07 0.01 0.07 0.07 0.06 0.92 0.56 0.05 0.01 0.16 0.2 0.08 0.06 0.08 0.02 0.13 0.19 0.1 0.03 0.02 0.09 0.07 1.0 0.04 0.04 0.08 0.01 0.3 0.47 0.09
0.01 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.69 0.16 0.0 0.02 0.06 0.03 0.05 0.01 0.03 0.01 0.14 0.39 0.18 0.02 0.05 0.03 0.02 1.0 0.06 0.02 0.05 0.01 0.2 0.14 0.05
0.19 0.14 0.17 0.13 0.14 0.15 0.11 0.09 0.2 0.22 0.51 0.38 0.04 0.18 0.16 0.25 0.06 0.36 0.34 0.17 0.21 0.29 0.23 0.24 0.21 0.17 0.25 1.0 0.44 0.31 0.27 0.32 0.37 0.16 0.22
0.16 0.15 0.19 0.19 0.11 0.09 0.1 0.13 0.14 0.14 0.53 0.12 0.45 0.2 0.07 0.18 0.08 0.18 0.18 0.08 0.09 0.16 0.09 0.16 0.18 0.07 0.1 1.0 0.43 0.29 0.18 0.36 0.06 0.2 0.03

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)