Heatmap: Cluster_72 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	4h after treatment	4h after treatment,No nitrate	8h after treatment	8h after treatment,No nitrate	20C	20h after treatment	20h after treatment,No nitrate	20h after treatment,Nocodazole added	36h after treatment	36h after treatment,No phosphate	Blue light,10min after light change	Blue light,60min after light change	Bohlin	CCAP1055/1,20C	CCAP1055/1,20C,High CO2,OligoDT primed	CCAP1055/1,20C,Low CO2,OligoDT primed	CCAP1055/1,20C,Normal CO2,OligoDT primed	CCMP2561	CCMP2561 Nitrase Reductase Knockout	CCMP632	CCMP632,24h	CCMP632,48h	CCMP632,72h	CCMP632,High light acclimated WT	CCMP632,Low light acclimated WT	NEPCC640,8h,1000ppmv CO2	NEPCC640,8h,390 ppmv CO2	No light,8h after treatment	Pt-1	Pt-1 8.6	Pt-1 8.6,With nitrogen	Pt-1 8.6,Without nitrogen	Red light,0min before light change	UTEX 646,Blue light	UTEX 646,No light
PTI_00G04370.1	0.02	0.05	0.02	0.06	0.05	0.03	0.1	0.04	0.04	0.05	0.07	0.07	0.05	0.19	0.01	0.02	0.01	0.06	0.11	0.03	0.07	0.12	0.11	0.05	0.03	0.97	1.0	0.05	0.05	0.04	0.02	0.06	0.07	0.01	0.02
PTI_01G01760.1	0.45	0.27	0.35	0.17	0.14	0.42	0.14	0.28	0.21	0.24	0.05	0.11	0.02	0.04	0.21	0.06	0.08	0.2	0.22	0.02	0.09	0.15	0.05	0.13	0.03	0.23	1.0	0.03	0.06	0.17	0.17	0.19	0.06	0.33	0.01
PTI_01G04340.1	0.15	0.21	0.11	0.2	0.1	0.17	0.24	0.09	0.18	0.17	0.06	0.07	0.07	0.03	0.05	0.06	0.03	0.14	0.16	0.07	0.07	0.11	0.05	0.1	0.07	1.0	0.96	0.14	0.05	0.09	0.12	0.08	0.09	0.11	0.1
PTI_01G04940.1	0.19	0.27	0.19	0.28	0.11	0.18	0.26	0.52	0.19	0.25	0.27	0.21	0.15	0.1	0.12	0.19	0.04	0.24	0.39	0.09	0.36	0.3	0.18	0.19	0.13	0.52	1.0	0.41	0.23	0.25	0.29	0.26	0.2	0.25	0.3
PTI_01G05550.1	0.12	0.08	0.06	0.06	0.11	0.17	0.08	0.06	0.19	0.14	0.06	0.03	0.03	0.01	0.15	0.07	0.24	0.09	0.12	0.03	0.1	0.08	0.1	0.11	0.06	1.0	0.84	0.01	0.03	0.04	0.05	0.02	0.04	0.11	0.02
PTI_01G06550.1	0.05	0.07	0.05	0.08	0.06	0.07	0.1	0.05	0.1	0.11	0.05	0.05	0.02	0.06	0.04	0.04	0.02	0.05	0.05	0.08	0.03	0.08	0.02	0.05	0.02	1.0	0.57	0.05	0.05	0.07	0.04	0.11	0.06	0.08	0.03
PTI_01G10280.1	0.17	0.13	0.13	0.1	0.18	0.16	0.08	0.07	0.16	0.14	0.18	0.17	0.02	0.04	0.13	0.08	0.11	0.07	0.07	0.08	0.13	0.17	0.11	0.18	0.1	0.67	1.0	0.23	0.05	0.09	0.28	0.03	0.16	0.13	0.08
PTI_02G01800.1	0.09	0.14	0.13	0.22	0.11	0.13	0.23	0.22	0.17	0.21	0.08	0.11	0.13	0.09	0.09	0.18	0.03	0.31	0.36	0.25	0.32	0.41	0.12	0.21	0.09	0.51	1.0	0.17	0.16	0.33	0.3	0.35	0.11	0.22	0.35
PTI_02G03590.1	0.18	0.24	0.18	0.24	0.13	0.24	0.24	0.36	0.24	0.24	0.19	0.23	0.07	0.25	0.11	0.12	0.03	0.26	0.39	0.07	0.24	0.31	0.15	0.19	0.05	0.21	1.0	0.1	0.13	0.29	0.31	0.21	0.22	0.34	0.1
PTI_02G06780.1	0.15	0.14	0.1	0.12	0.08	0.14	0.16	0.1	0.15	0.14	0.05	0.07	0.03	0.05	0.1	0.06	0.12	0.17	0.28	0.03	0.12	0.13	0.1	0.11	0.06	0.31	1.0	0.14	0.04	0.13	0.11	0.15	0.06	0.17	0.05
PTI_03G01350.1	0.14	0.11	0.08	0.09	0.01	0.11	0.09	0.03	0.07	0.09	0.19	0.14	0.0	0.06	0.01	0.0	0.02	0.02	0.04	0.0	0.12	0.13	0.16	0.07	0.05	0.73	1.0	0.03	0.06	0.02	0.02	0.0	0.12	0.08	0.05
PTI_03G02740.1	0.21	0.31	0.17	0.29	0.12	0.25	0.31	0.16	0.28	0.3	0.16	0.18	0.09	0.05	0.07	0.14	0.01	0.27	0.3	0.07	0.12	0.18	0.08	0.11	0.03	0.38	1.0	0.25	0.11	0.23	0.25	0.11	0.2	0.16	0.23
PTI_03G03280.1	0.09	0.06	0.02	0.07	0.04	0.09	0.02	0.03	0.06	0.08	0.22	0.31	0.0	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.0	0.04	0.06	0.12	0.07	0.02	0.0	0.72	1.0	0.02	0.01	0.05	0.17	0.02	0.27	0.02	0.0
PTI_03G03290.1	0.21	0.23	0.16	0.16	0.16	0.31	0.18	0.13	0.22	0.26	0.42	0.46	0.0	0.04	0.07	0.04	0.06	0.07	0.11	0.05	0.14	0.34	0.14	0.06	0.01	0.6	1.0	0.1	0.04	0.1	0.16	0.05	0.42	0.12	0.03
PTI_03G06060.1	0.36	0.48	0.25	0.56	0.16	0.38	0.65	0.22	0.43	0.4	0.23	0.23	0.04	0.03	0.21	0.22	0.14	0.36	0.5	0.11	0.17	0.41	0.11	0.1	0.04	0.34	1.0	0.39	0.03	0.06	0.08	0.03	0.39	0.12	0.04
PTI_03G06550.1	0.15	0.22	0.16	0.27	0.19	0.21	0.33	0.21	0.27	0.25	0.07	0.07	0.05	0.17	0.09	0.08	0.04	0.12	0.26	0.11	0.14	0.15	0.11	0.13	0.14	0.58	1.0	0.1	0.1	0.24	0.3	0.15	0.09	0.19	0.05
PTI_04G05880.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.09	0.01	0.0	0.0	0.02	1.0	0.38	0.02	0.04	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
PTI_05G02630.1	0.35	0.41	0.31	0.39	0.26	0.44	0.45	0.25	0.49	0.45	0.33	0.37	0.23	0.15	0.25	0.2	0.16	0.24	0.3	0.27	0.45	0.47	0.29	0.68	0.22	1.0	0.84	0.4	0.16	0.43	0.5	0.21	0.43	0.36	0.5
PTI_05G04300.1	0.37	0.44	0.36	0.59	0.14	0.42	0.74	0.42	0.58	0.56	0.02	0.03	0.01	0.03	0.3	0.32	0.26	0.28	0.25	0.47	0.37	0.21	0.38	0.21	0.13	0.59	1.0	0.72	0.19	0.37	0.49	0.4	0.02	0.0	0.02
PTI_06G04610.1	0.31	0.29	0.24	0.29	0.35	0.39	0.39	0.18	0.47	0.42	0.24	0.23	0.11	0.1	0.27	0.21	0.28	0.26	0.33	0.2	0.12	0.21	0.12	0.4	0.18	0.26	1.0	0.33	0.19	0.34	0.38	0.2	0.28	0.44	0.25
PTI_06G05050.1	0.18	0.41	0.11	0.21	0.08	0.16	0.14	0.08	0.06	0.2	0.27	0.22	0.01	0.05	0.06	0.08	0.02	0.11	0.07	0.05	0.06	0.18	0.04	0.04	0.05	0.23	1.0	0.05	0.02	0.14	0.16	0.11	0.21	0.12	0.28
PTI_08G00040.1	0.17	0.17	0.12	0.13	0.11	0.2	0.17	0.12	0.18	0.18	0.0	0.0	0.27	0.01	0.17	0.09	0.04	0.24	0.23	0.09	0.21	0.21	0.15	0.17	0.08	0.24	1.0	0.05	0.07	0.16	0.2	0.1	0.0	0.01	0.03
PTI_08G01220.1	0.09	0.06	0.06	0.05	0.07	0.08	0.05	0.1	0.08	0.09	0.29	0.26	0.11	0.03	0.1	0.09	0.06	0.08	0.11	0.04	0.12	0.2	0.09	0.09	0.05	0.24	1.0	0.2	0.09	0.15	0.21	0.07	0.13	0.3	0.13
PTI_08G03770.1	0.06	0.06	0.06	0.09	0.02	0.05	0.14	0.03	0.11	0.1	0.04	0.05	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.05	0.04	0.01	0.05	0.04	0.04	0.03	0.01	1.0	0.56	0.09	0.06	0.05	0.03	0.08	0.05	0.03	0.01
PTI_08G03780.1	0.25	0.24	0.17	0.23	0.15	0.34	0.38	0.2	0.33	0.3	0.09	0.12	0.17	0.08	0.21	0.12	0.03	0.39	0.45	0.14	0.32	0.23	0.15	0.19	0.05	1.0	0.89	0.26	0.15	0.12	0.1	0.12	0.12	0.19	0.09
PTI_09G01920.1	0.14	0.19	0.22	0.3	0.14	0.13	0.22	0.78	0.16	0.11	0.28	0.21	0.51	0.11	0.24	0.21	0.28	0.21	0.38	0.09	0.66	0.92	0.25	0.15	0.12	1.0	0.89	0.74	0.25	0.31	0.51	0.27	0.22	0.25	0.14
PTI_09G02330.1	0.26	0.28	0.23	0.22	0.2	0.36	0.25	0.22	0.36	0.31	0.12	0.12	0.03	0.08	0.2	0.11	0.05	0.23	0.27	0.09	0.31	0.49	0.2	0.19	0.07	0.52	1.0	0.04	0.06	0.34	0.48	0.18	0.12	0.49	0.15
PTI_09G03470.1	0.4	0.45	0.4	0.44	0.18	0.4	0.61	0.51	0.34	0.32	0.78	0.89	0.06	0.16	0.07	0.12	0.03	0.12	0.25	0.07	0.26	0.52	0.07	0.15	0.1	1.0	0.85	0.4	0.15	0.48	0.62	0.3	0.83	0.18	0.41
PTI_09G03660.1	0.07	0.04	0.05	0.02	0.06	0.04	0.02	0.07	0.05	0.03	0.25	0.1	0.03	0.04	0.08	0.03	0.11	0.03	0.04	0.02	0.19	0.15	0.05	0.07	0.05	0.3	1.0	0.29	0.04	0.07	0.09	0.03	0.05	0.12	0.06
PTI_10G02700.1	0.24	0.2	0.23	0.21	0.12	0.2	0.22	0.1	0.31	0.32	0.17	0.25	0.09	0.08	0.27	0.26	0.09	0.19	0.2	0.24	0.18	0.29	0.14	0.22	0.12	1.0	0.68	0.39	0.1	0.15	0.18	0.1	0.36	0.26	0.27
PTI_11G00270.1	0.2	0.21	0.26	0.28	0.15	0.21	0.25	0.18	0.29	0.29	0.25	0.32	0.07	0.23	0.11	0.16	0.08	0.25	0.35	0.28	0.11	0.25	0.12	0.26	0.06	0.31	1.0	0.21	0.09	0.28	0.21	0.3	0.33	0.3	0.09
PTI_12G02090.1	0.0	0.03	0.02	0.0	0.01	0.01	0.02	0.06	0.02	0.01	0.28	0.21	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.13	1.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.19	0.01	0.0
PTI_12G03080.1	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.05	0.0	0.0	0.0	1.0	0.6	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
PTI_12G03090.1	0.0	0.0	0.01	0.0	0.07	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	1.0	0.61	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
PTI_13G00840.1	0.33	0.3	0.19	0.27	0.26	0.44	0.43	0.32	0.54	0.46	0.11	0.18	0.27	0.09	0.75	0.38	0.63	0.41	0.57	0.22	0.44	0.21	0.22	0.57	0.23	0.62	1.0	0.45	0.17	0.4	0.28	0.31	0.15	0.63	0.34
PTI_13G01950.1	0.18	0.21	0.13	0.19	0.12	0.23	0.24	0.13	0.23	0.22	0.15	0.2	0.04	0.04	0.17	0.12	0.06	0.24	0.28	0.04	0.23	0.24	0.19	0.19	0.08	0.22	1.0	0.07	0.07	0.22	0.25	0.14	0.13	0.16	0.05
PTI_13G02720.1	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.05	0.01	0.04	0.0	0.0	0.01	0.0	0.05	0.01	0.02	0.04	0.04	0.01	0.4	0.28	0.05	0.11	0.04	1.0	0.53	0.0	0.06	0.15	0.13	0.18	0.0	0.0	0.0
PTI_14G01800.1	0.04	0.06	0.04	0.05	0.07	0.05	0.06	0.32	0.07	0.08	0.37	0.02	0.1	0.02	0.07	0.03	0.03	0.04	0.07	0.05	0.55	0.68	0.04	0.15	0.14	0.48	1.0	0.06	0.08	0.14	0.16	0.13	0.02	0.17	0.11
PTI_15G02730.1	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.05	0.09	0.04	0.03	0.01	0.01	0.07	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.22	0.13	0.04	0.02	0.09	0.05	1.0	0.97	0.03	0.12	0.17	0.24	0.05	0.01	0.03	0.05
PTI_17G01220.1	0.28	0.22	0.25	0.18	0.26	0.25	0.13	0.72	0.18	0.21	0.18	0.25	0.06	0.12	0.44	0.32	0.27	0.32	0.27	0.12	0.24	0.4	0.18	0.37	0.17	0.33	1.0	0.23	0.09	0.37	0.38	0.21	0.24	0.34	0.12
PTI_17G02190.1	0.25	0.34	0.21	0.41	0.08	0.18	0.47	0.08	0.19	0.18	0.01	0.02	0.08	0.0	0.13	0.1	0.06	0.06	0.14	0.1	0.02	0.13	0.07	0.01	0.01	1.0	0.48	0.25	0.04	0.06	0.02	0.07	0.02	0.01	0.01
PTI_18G00460.1	0.27	0.43	0.21	0.42	0.21	0.36	0.52	0.39	0.32	0.43	0.14	0.17	0.11	0.16	0.03	0.04	0.01	0.07	0.08	0.03	0.06	0.15	0.04	0.03	0.0	0.9	1.0	0.12	0.14	0.11	0.12	0.16	0.18	0.14	0.07
PTI_19G01380.1	0.57	0.41	0.65	0.44	0.64	0.56	0.28	0.41	0.6	0.63	0.3	0.38	0.22	0.08	0.55	0.41	0.36	0.31	0.54	0.36	0.61	0.96	0.48	0.76	0.27	0.89	1.0	0.84	0.31	0.53	0.57	0.4	0.46	0.21	0.57
PTI_20G00850.1	0.39	0.18	0.26	0.11	0.34	0.38	0.09	0.48	0.26	0.23	0.54	0.3	0.08	0.06	0.34	0.12	0.45	0.2	0.18	0.25	0.7	1.0	0.27	0.27	0.14	0.42	0.9	0.32	0.2	0.69	0.67	0.42	0.24	0.42	0.18
PTI_22G01040.1	0.2	0.25	0.2	0.25	0.2	0.29	0.29	0.52	0.31	0.27	0.15	0.18	0.09	0.2	0.3	0.19	0.39	0.31	0.38	0.08	0.27	0.36	0.28	0.2	0.14	0.41	1.0	0.2	0.11	0.2	0.23	0.15	0.15	0.29	0.05
PTI_23G00850.1	0.04	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.02	0.03	0.0	0.03	0.22	0.13	0.01	0.03	0.03	0.0	0.01	0.06	0.07	0.07	0.13	0.25	0.01	0.07	0.39	0.62	1.0	0.06	0.06	0.13	0.29	0.04	0.04	0.14	0.04
PTI_23G01030.1	0.05	0.03	0.05	0.03	0.05	0.05	0.03	0.1	0.06	0.04	0.33	0.3	0.18	0.04	0.11	0.05	0.07	0.06	0.06	0.09	0.19	0.13	0.16	0.08	0.18	0.92	1.0	0.13	0.21	0.23	0.51	0.05	0.35	0.1	0.28
PTI_25G00310.1	0.09	0.04	0.07	0.03	0.09	0.08	0.01	0.05	0.06	0.04	0.06	0.06	0.01	0.0	0.14	0.05	0.12	0.05	0.08	0.09	0.02	0.03	0.02	0.08	0.07	1.0	0.94	0.08	0.04	0.05	0.07	0.03	0.09	0.12	0.12
PTI_25G00330.1	0.05	0.09	0.05	0.16	0.06	0.1	0.2	0.05	0.19	0.14	0.07	0.06	0.01	0.04	0.11	0.14	0.05	0.13	0.31	0.03	0.1	0.08	0.09	0.06	0.03	0.58	1.0	0.04	0.02	0.03	0.04	0.04	0.08	0.19	0.16
PTI_25G00340.1	0.09	0.14	0.08	0.18	0.09	0.11	0.22	0.1	0.12	0.15	0.34	0.43	0.09	0.43	0.08	0.12	0.06	0.14	0.25	0.07	0.21	0.2	0.29	0.08	0.07	0.34	1.0	0.05	0.06	0.13	0.1	0.18	0.39	0.14	0.03
PTI_25G00350.1	0.13	0.23	0.12	0.25	0.09	0.17	0.3	0.1	0.17	0.23	0.09	0.13	0.06	0.08	0.03	0.07	0.02	0.14	0.2	0.02	0.06	0.04	0.06	0.03	0.02	0.33	1.0	0.08	0.07	0.09	0.08	0.09	0.16	0.12	0.02
PTI_25G01370.1	0.16	0.28	0.16	0.28	0.12	0.18	0.35	0.15	0.21	0.22	0.14	0.15	0.13	0.18	0.15	0.14	0.11	0.25	0.53	0.07	0.05	0.09	0.07	0.12	0.41	0.15	1.0	0.14	0.16	0.11	0.12	0.09	0.18	0.35	0.24
PTI_27G01040.1	0.15	0.14	0.1	0.11	0.15	0.17	0.11	0.16	0.15	0.16	0.11	0.19	0.02	0.06	0.1	0.05	0.04	0.13	0.19	0.03	0.31	0.38	0.23	0.12	0.05	0.22	1.0	0.03	0.06	0.22	0.23	0.12	0.1	0.35	0.03
PTI_27G01090.1	0.14	0.18	0.16	0.21	0.25	0.19	0.26	0.17	0.26	0.22	0.12	0.12	0.22	0.19	0.13	0.14	0.07	0.3	0.53	0.22	0.28	0.26	0.24	0.33	0.25	0.25	1.0	0.2	0.28	0.31	0.33	0.27	0.12	0.3	0.87
PTI_29G01100.1	0.11	0.14	0.21	0.27	0.03	0.27	0.21	0.33	0.23	0.14	0.09	0.05	0.08	0.03	0.0	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.06	0.03	0.08	0.02	0.63	1.0	0.06	0.05	0.18	0.25	0.03	0.05	0.08	0.04
PTI_32G00440.1	0.16	0.5	0.12	0.4	0.08	0.15	0.25	0.29	0.23	0.21	0.16	0.17	0.08	0.14	0.11	0.2	0.03	0.4	0.58	0.14	0.29	0.26	0.05	0.19	0.05	0.32	0.81	0.11	0.07	0.15	0.14	0.15	0.17	0.33	1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)