1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_63 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
4h after treatment
4h after treatment,No nitrate
8h after treatment
8h after treatment,No nitrate
20C
20h after treatment
20h after treatment,No nitrate
20h after treatment,Nocodazole added
36h after treatment
36h after treatment,No phosphate
Blue light,10min after light change
Blue light,60min after light change
Bohlin
CCAP1055/1,20C
CCAP1055/1,20C,High CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Low CO2,OligoDT primed
CCAP1055/1,20C,Normal CO2,OligoDT primed
CCMP2561
CCMP2561 Nitrase Reductase Knockout
CCMP632
CCMP632,24h
CCMP632,48h
CCMP632,72h
CCMP632,High light acclimated WT
CCMP632,Low light acclimated WT
NEPCC640,8h,1000ppmv CO2
NEPCC640,8h,390 ppmv CO2
No light,8h after treatment
Pt-1
Pt-1 8.6
Pt-1 8.6,With nitrogen
Pt-1 8.6,Without nitrogen
Red light,0min before light change
UTEX 646,Blue light
UTEX 646,No light
0.06 0.1 0.07 0.12 0.46 0.21 0.2 0.22 0.17 0.19 0.19 0.22 0.1 0.66 0.06 0.03 0.01 0.66 0.34 1.0 0.72 0.42 0.62 0.17 0.35 0.12 0.12 0.31 0.23 0.31 0.36 0.2 0.21 0.2 0.13
0.08 0.12 0.07 0.11 0.13 0.12 0.15 0.12 0.14 0.12 0.09 0.16 0.66 0.38 0.07 0.11 0.05 0.19 0.19 0.21 0.47 0.18 1.0 0.27 0.37 0.03 0.04 0.28 0.23 0.34 0.28 0.2 0.1 0.06 0.26
0.08 0.18 0.11 0.19 0.19 0.12 0.22 0.14 0.08 0.17 0.29 0.44 0.49 0.91 0.1 0.12 0.11 0.42 0.33 0.28 0.11 0.13 0.23 0.33 0.34 0.07 0.15 0.07 1.0 0.31 0.24 0.31 0.41 0.15 0.1
0.0 0.02 0.01 0.05 0.26 0.02 0.06 0.03 0.03 0.04 0.46 0.09 0.49 1.0 0.01 0.01 0.0 0.56 0.28 0.16 0.15 0.1 0.08 0.09 0.24 0.36 0.18 0.01 0.86 0.25 0.03 0.45 0.07 0.01 0.09
0.06 0.11 0.09 0.2 0.54 0.05 0.28 0.03 0.24 0.26 0.44 0.43 0.52 0.64 0.06 0.09 0.07 0.54 0.35 0.22 0.1 0.04 0.21 0.11 0.45 0.01 0.01 0.52 1.0 0.16 0.05 0.31 0.58 0.15 0.52
0.04 0.06 0.05 0.04 0.27 0.02 0.05 0.15 0.02 0.03 0.44 0.14 0.21 0.52 0.13 0.05 0.17 0.46 0.62 0.17 0.02 0.04 0.01 0.21 0.42 0.21 0.15 0.1 1.0 0.26 0.18 0.32 0.09 0.38 0.12
0.31 0.33 0.23 0.22 0.48 0.52 0.3 0.23 0.55 0.55 0.2 0.21 1.0 0.33 0.46 0.43 0.21 0.56 0.46 0.63 0.88 0.48 0.57 0.54 0.7 0.31 0.28 0.13 0.68 0.56 0.41 0.83 0.2 0.77 0.26
0.17 0.35 0.18 0.42 0.33 0.23 0.46 0.14 0.4 0.38 0.3 0.34 0.44 0.71 0.07 0.16 0.02 0.45 0.44 0.39 0.35 0.35 0.85 0.17 0.31 0.12 0.09 0.94 0.3 0.16 0.17 0.18 0.32 0.18 1.0
0.16 0.21 0.14 0.22 0.24 0.19 0.28 0.13 0.23 0.27 0.36 0.47 0.53 0.89 0.27 0.25 0.24 0.46 0.51 0.45 0.63 0.5 1.0 0.32 0.54 0.07 0.05 0.35 0.34 0.21 0.15 0.3 0.35 0.12 0.35
0.23 0.29 0.26 0.28 0.42 0.28 0.29 0.22 0.29 0.36 0.23 0.34 0.58 0.39 0.35 0.26 0.26 0.41 0.46 0.47 1.0 0.62 0.82 0.59 0.53 0.09 0.07 0.3 0.51 0.35 0.36 0.36 0.26 0.43 0.72
0.08 0.17 0.11 0.29 0.13 0.18 0.44 0.17 0.28 0.31 0.17 0.2 0.57 0.6 0.05 0.1 0.04 0.43 0.28 0.37 0.18 0.2 0.4 0.33 0.83 0.13 0.17 0.21 0.58 0.7 0.34 1.0 0.22 0.15 0.33
0.1 0.11 0.09 0.15 0.36 0.15 0.26 0.08 0.2 0.21 0.24 0.28 0.73 0.84 0.08 0.08 0.06 0.36 0.4 0.36 0.58 0.38 1.0 0.16 0.12 0.09 0.08 0.27 0.25 0.16 0.08 0.25 0.24 0.22 0.61
0.07 0.12 0.13 0.21 0.32 0.03 0.15 0.02 0.27 0.17 0.18 0.11 1.0 0.31 0.12 0.22 0.11 0.82 0.43 0.48 0.48 0.08 0.5 0.09 0.38 0.17 0.08 0.56 0.83 0.15 0.1 0.26 0.14 0.29 0.38
0.17 0.47 0.18 0.74 0.3 0.31 1.0 0.2 0.44 0.46 0.37 0.43 0.83 0.75 0.22 0.24 0.25 0.7 0.84 0.32 0.53 0.4 0.7 0.41 0.52 0.13 0.04 0.32 0.59 0.41 0.18 0.8 0.41 0.19 0.68
0.23 0.39 0.25 0.39 0.35 0.34 0.63 0.28 0.44 0.44 0.24 0.33 0.92 0.96 0.21 0.22 0.25 0.55 0.52 0.44 1.0 0.49 0.7 0.79 0.6 0.14 0.1 0.45 0.47 0.77 0.45 0.94 0.26 0.31 0.68
0.05 0.08 0.05 0.11 0.11 0.05 0.18 0.03 0.12 0.11 0.12 0.17 1.0 0.5 0.04 0.08 0.01 0.25 0.21 0.17 0.24 0.08 0.23 0.07 0.07 0.04 0.02 0.23 0.32 0.11 0.05 0.19 0.14 0.27 0.49
0.35 0.5 0.35 0.5 0.45 0.46 0.48 0.4 0.54 0.61 0.75 1.0 0.73 0.69 0.12 0.23 0.03 0.63 0.63 0.53 0.7 0.64 0.93 0.41 0.33 0.2 0.16 0.49 0.83 0.46 0.39 0.58 0.96 0.42 0.33
0.05 0.29 0.08 0.56 0.15 0.11 0.68 0.23 0.16 0.15 0.05 0.07 1.0 0.4 0.04 0.18 0.02 0.5 0.86 0.55 0.36 0.23 0.47 0.71 0.45 0.14 0.13 0.06 0.17 0.31 0.23 0.4 0.04 0.03 0.9
0.31 0.39 0.28 0.43 0.32 0.38 0.5 0.22 0.47 0.44 0.29 0.42 1.0 0.53 0.28 0.27 0.1 0.96 0.95 0.54 0.35 0.3 0.47 0.61 0.57 0.06 0.04 0.22 0.46 0.43 0.25 0.6 0.34 0.64 0.24
0.0 0.01 0.0 0.01 0.03 0.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.08 0.13 1.0 0.1 0.0 0.01 0.0 0.04 0.18 0.13 0.41 0.07 0.12 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.04 0.0 0.07 0.09 0.06 0.08
0.32 0.45 0.31 0.55 0.57 0.55 0.74 0.37 0.69 0.72 0.46 0.46 0.83 0.48 0.11 0.13 0.02 0.55 0.51 0.39 0.64 0.57 1.0 0.41 0.42 0.16 0.19 0.58 0.4 0.36 0.31 0.44 0.52 0.26 0.79
0.1 0.3 0.13 0.43 0.27 0.16 0.7 0.11 0.44 0.37 0.2 0.12 0.29 0.79 0.04 0.11 0.04 0.33 0.28 0.23 0.59 0.37 1.0 0.09 0.12 0.05 0.01 0.18 0.37 0.1 0.04 0.22 0.09 0.06 0.11
0.06 0.09 0.11 0.17 0.17 0.18 0.31 0.12 0.28 0.28 0.07 0.07 0.17 0.81 0.01 0.02 0.0 0.29 0.14 0.11 0.45 0.21 1.0 0.16 0.2 0.0 0.0 0.06 0.34 0.15 0.08 0.26 0.06 0.07 0.12
0.17 0.19 0.24 0.46 0.1 0.2 0.81 0.22 0.23 0.31 0.25 0.13 0.58 1.0 0.11 0.13 0.06 0.66 0.39 0.52 0.35 0.2 0.19 0.22 0.12 0.69 0.22 0.16 0.3 0.53 0.35 0.78 0.16 0.27 0.45
0.1 0.1 0.06 0.12 0.28 0.14 0.19 0.17 0.16 0.18 0.54 0.34 1.0 0.44 0.19 0.07 0.12 0.44 0.4 0.38 0.53 0.34 0.7 0.24 0.27 0.09 0.18 0.57 0.72 0.19 0.11 0.25 0.3 0.28 0.59
0.17 0.18 0.13 0.26 0.19 0.21 0.34 0.09 0.31 0.39 0.27 0.19 0.13 1.0 0.05 0.03 0.04 0.12 0.1 0.27 0.1 0.14 0.09 0.11 0.03 0.08 0.05 0.03 0.09 0.16 0.05 0.25 0.25 0.32 0.03
0.2 0.41 0.2 0.56 0.4 0.39 1.0 0.21 0.63 0.47 0.06 0.07 0.8 0.19 0.18 0.18 0.17 0.44 0.6 0.3 0.21 0.14 0.18 0.34 0.51 0.17 0.15 0.43 0.15 0.44 0.22 0.72 0.07 0.04 0.51
0.3 0.29 0.17 0.46 0.67 0.5 1.0 0.2 0.77 0.67 0.56 0.4 0.98 0.63 0.17 0.08 0.08 0.47 0.44 0.43 0.5 0.41 0.71 0.3 0.35 0.1 0.07 0.94 0.29 0.41 0.25 0.62 0.43 0.13 0.35
0.32 0.5 0.28 0.56 0.71 0.37 0.64 0.3 0.38 0.29 0.32 0.36 1.0 0.19 0.09 0.1 0.05 0.32 0.33 0.09 0.51 0.62 0.45 0.22 0.11 0.33 0.41 0.26 0.24 0.43 0.33 0.61 0.29 0.06 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.65 1.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.8 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12
0.01 0.02 0.01 0.02 0.18 0.02 0.02 0.03 0.02 0.02 0.05 0.05 1.0 0.06 0.01 0.01 0.0 0.03 0.08 0.02 0.31 0.22 0.47 0.02 0.02 0.01 0.01 0.04 0.03 0.02 0.01 0.03 0.04 0.07 0.02
0.55 0.79 0.46 0.8 0.5 0.62 0.88 0.37 0.8 0.71 0.48 0.57 0.72 0.44 0.14 0.32 0.05 0.54 0.63 0.62 0.67 0.69 0.54 0.19 0.16 0.28 0.12 1.0 0.26 0.23 0.15 0.4 0.52 0.4 0.38
0.51 0.78 0.44 0.9 0.74 0.54 1.0 0.25 0.74 0.83 0.22 0.29 0.14 0.19 0.22 0.49 0.22 0.67 0.51 0.38 0.53 0.77 0.48 0.51 0.38 0.03 0.03 0.87 0.57 0.63 0.44 0.94 0.34 0.1 0.12
0.27 0.32 0.24 0.29 0.37 0.37 0.36 0.22 0.41 0.52 0.61 0.78 0.75 0.68 0.25 0.35 0.06 0.56 0.56 0.5 0.81 0.58 1.0 0.39 0.44 0.1 0.07 0.7 0.82 0.29 0.2 0.39 0.68 0.29 0.8
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.24 0.32 0.31 0.7 0.2 0.23 0.96 0.23 0.39 0.48 0.36 0.39 0.89 1.0 0.23 0.21 0.19 0.82 0.54 0.82 0.51 0.19 0.27 0.25 0.22 0.38 0.07 0.44 0.31 0.48 0.4 0.74 0.35 0.34 0.41
0.44 0.52 0.42 0.7 0.36 0.49 1.0 0.21 0.77 0.73 0.34 0.42 0.71 0.58 0.73 0.55 0.39 0.75 0.51 0.71 0.79 0.58 0.76 0.39 0.28 0.23 0.12 0.35 0.42 0.46 0.34 0.77 0.44 0.63 0.24
0.08 0.09 0.12 0.09 0.46 0.21 0.12 0.11 0.2 0.22 0.23 0.28 0.46 1.0 0.11 0.06 0.04 0.42 0.3 0.24 0.13 0.07 0.47 0.46 0.87 0.07 0.06 0.14 0.48 0.29 0.17 0.45 0.25 0.07 0.3
0.01 0.01 0.01 0.02 0.14 0.01 0.05 0.01 0.02 0.01 0.53 0.82 0.86 0.72 0.01 0.01 0.01 0.75 0.56 1.0 0.07 0.04 0.25 0.48 0.71 0.01 0.0 0.01 0.53 0.22 0.09 0.32 0.52 0.11 0.14
0.02 0.03 0.02 0.03 0.19 0.02 0.02 0.03 0.05 0.03 0.02 0.03 1.0 0.21 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.04 0.13 0.03 0.22 0.1 0.06 0.02 0.01 0.04 0.05 0.03 0.02 0.03 0.03 0.04 0.25
0.42 0.58 0.34 0.45 0.51 0.57 0.44 0.4 0.51 0.48 0.35 0.43 0.61 0.87 0.33 0.25 0.33 0.88 0.4 0.44 0.91 0.58 1.0 0.56 0.48 0.06 0.06 0.55 0.58 0.44 0.21 0.61 0.43 0.44 0.39
0.05 0.08 0.05 0.08 0.58 0.06 0.08 0.1 0.07 0.08 0.14 0.18 1.0 0.04 0.03 0.04 0.02 0.08 0.23 0.1 0.59 0.24 0.6 0.07 0.02 0.03 0.01 0.14 0.06 0.11 0.03 0.18 0.22 0.1 0.12
0.16 0.31 0.23 0.38 0.19 0.21 0.33 0.43 0.18 0.24 0.23 0.33 0.34 1.0 0.15 0.2 0.07 0.52 0.36 0.2 0.23 0.44 0.29 0.28 0.24 0.11 0.04 0.11 0.22 0.24 0.25 0.27 0.3 0.38 0.16
0.06 0.07 0.05 0.06 0.15 0.08 0.06 0.05 0.07 0.08 0.23 0.24 0.15 1.0 0.07 0.03 0.08 0.15 0.12 0.05 0.06 0.07 0.14 0.13 0.24 0.01 0.02 0.04 0.06 0.14 0.05 0.22 0.19 0.03 0.01
0.18 0.25 0.21 0.34 0.33 0.25 0.39 0.26 0.35 0.33 0.37 0.47 0.94 0.94 0.29 0.26 0.21 0.77 1.0 0.64 0.51 0.55 0.75 0.97 0.73 0.16 0.2 0.21 0.92 0.63 0.41 0.78 0.44 0.4 0.26
0.03 0.08 0.06 0.1 0.24 0.04 0.12 0.04 0.09 0.11 0.35 0.26 1.0 0.64 0.05 0.15 0.03 0.37 0.29 0.15 0.51 0.2 0.78 0.15 0.33 0.06 0.01 0.09 0.59 0.22 0.04 0.39 0.13 0.39 0.22
0.05 0.06 0.09 0.11 0.27 0.02 0.06 0.01 0.23 0.11 0.12 0.09 0.18 0.05 0.04 0.13 0.01 0.45 0.21 0.37 0.4 0.03 0.53 0.05 0.35 0.09 0.04 0.07 1.0 0.04 0.04 0.08 0.14 0.23 0.65
0.36 0.37 0.28 0.33 0.53 0.43 0.36 0.29 0.45 0.47 0.7 0.56 0.71 0.49 0.49 0.42 0.18 0.88 0.55 0.53 0.83 0.88 0.89 0.54 0.48 0.18 0.09 0.8 0.36 0.41 0.37 0.53 0.55 0.75 1.0
0.2 0.48 0.2 0.62 0.52 0.4 1.0 0.22 0.58 0.54 0.16 0.18 0.97 0.97 0.24 0.26 0.08 0.86 0.93 0.66 0.5 0.33 0.46 0.31 0.27 0.19 0.08 0.49 0.35 0.5 0.15 0.94 0.19 0.29 0.88
0.01 0.05 0.03 0.11 0.1 0.07 0.27 0.08 0.09 0.14 0.02 0.02 0.51 1.0 0.01 0.02 0.01 0.4 0.25 0.19 0.08 0.03 0.15 0.25 0.21 0.03 0.09 0.0 0.4 0.32 0.09 0.57 0.02 0.03 0.05
0.17 0.23 0.14 0.22 0.17 0.16 0.31 0.13 0.19 0.23 0.19 0.23 0.3 1.0 0.02 0.04 0.01 0.19 0.27 0.09 0.26 0.38 0.16 0.05 0.01 0.03 0.02 0.27 0.11 0.23 0.05 0.36 0.22 0.22 0.22
0.15 0.26 0.15 0.33 0.44 0.21 0.44 0.16 0.31 0.3 0.76 0.45 0.7 0.59 0.19 0.17 0.11 0.72 0.52 0.54 0.51 0.32 0.8 0.48 1.0 0.18 0.1 0.29 0.81 0.54 0.28 0.9 0.4 0.38 0.64
0.25 0.44 0.2 0.47 0.34 0.31 0.62 0.26 0.38 0.43 0.41 0.47 0.41 1.0 0.08 0.15 0.11 0.36 0.4 0.08 0.2 0.37 0.22 0.17 0.09 0.03 0.05 0.34 0.27 0.36 0.06 0.63 0.54 0.23 0.36
0.23 0.3 0.21 0.32 0.34 0.35 0.31 0.19 0.57 0.45 0.27 0.28 0.72 0.11 0.39 0.52 0.16 1.0 0.6 0.22 0.43 0.7 0.26 0.23 0.05 0.17 0.17 0.8 0.15 0.14 0.15 0.1 0.29 0.42 0.46
0.05 0.09 0.08 0.14 0.32 0.07 0.19 0.07 0.14 0.13 0.76 0.51 1.0 0.86 0.11 0.12 0.04 0.7 0.36 0.57 0.44 0.33 0.38 0.19 0.27 0.23 0.14 0.23 0.51 0.24 0.18 0.38 0.5 0.13 0.47
0.2 0.27 0.21 0.3 0.32 0.26 0.22 0.22 0.28 0.29 0.34 0.42 0.18 1.0 0.12 0.11 0.08 0.23 0.2 0.09 0.08 0.1 0.12 0.22 0.17 0.09 0.07 0.1 0.13 0.29 0.24 0.43 0.31 0.2 0.05
0.03 0.16 0.05 0.25 0.17 0.13 0.42 0.17 0.19 0.22 0.17 0.21 0.57 1.0 0.01 0.03 0.01 0.37 0.46 0.18 0.24 0.19 0.35 0.15 0.09 0.02 0.01 0.02 0.19 0.28 0.03 0.58 0.17 0.11 0.33
0.05 0.08 0.05 0.08 0.58 0.06 0.08 0.1 0.07 0.08 0.14 0.18 1.0 0.04 0.03 0.04 0.02 0.08 0.23 0.1 0.59 0.24 0.6 0.07 0.02 0.03 0.01 0.14 0.06 0.11 0.03 0.18 0.22 0.1 0.12
0.15 0.27 0.18 0.41 0.12 0.18 0.69 0.15 0.33 0.31 0.4 0.35 0.0 1.0 0.06 0.09 0.02 0.53 0.23 0.15 0.28 0.3 0.26 0.31 0.64 0.01 0.01 0.23 0.11 0.3 0.2 0.41 0.38 0.28 0.37
0.02 0.05 0.07 0.13 0.37 0.14 0.29 0.23 0.19 0.2 0.1 0.1 0.87 1.0 0.01 0.02 0.0 0.5 0.24 0.39 0.33 0.18 0.64 0.25 0.57 0.03 0.09 0.22 0.7 0.25 0.16 0.36 0.09 0.03 0.75
0.05 0.08 0.09 0.15 0.33 0.12 0.18 0.1 0.24 0.21 0.34 0.15 1.0 0.79 0.05 0.04 0.03 0.36 0.24 0.52 0.22 0.15 0.51 0.21 0.53 0.04 0.02 0.15 0.62 0.27 0.15 0.44 0.11 0.08 0.16
0.06 0.09 0.11 0.17 0.17 0.18 0.31 0.12 0.28 0.28 0.07 0.07 0.17 0.81 0.01 0.02 0.0 0.29 0.14 0.11 0.45 0.21 1.0 0.16 0.2 0.0 0.0 0.06 0.34 0.15 0.08 0.26 0.06 0.07 0.12
0.29 0.43 0.25 0.48 0.63 0.35 0.58 0.29 0.37 0.42 0.24 0.29 0.67 0.3 0.2 0.24 0.09 0.9 0.75 0.66 0.81 0.57 0.72 0.75 0.87 0.17 0.12 0.44 1.0 0.54 0.29 0.92 0.31 0.37 0.18
0.03 0.04 0.05 0.12 0.26 0.08 0.18 0.06 0.43 0.2 0.16 0.11 0.86 1.0 0.3 0.55 0.19 0.51 0.93 0.13 0.61 0.14 0.77 0.26 0.95 0.54 0.91 0.3 0.31 0.28 0.2 0.36 0.09 0.24 0.28
0.15 0.18 0.24 0.25 0.39 0.15 0.16 0.14 0.42 0.31 0.67 0.34 0.67 0.38 0.2 0.46 0.08 0.77 0.51 0.31 0.76 0.27 0.64 0.2 0.41 0.74 0.78 0.7 1.0 0.42 0.45 0.53 0.52 0.74 0.39
0.06 0.11 0.06 0.13 0.25 0.08 0.16 0.06 0.11 0.13 0.38 0.43 0.22 0.65 0.22 0.21 0.12 0.47 0.4 0.34 0.19 0.14 0.43 0.33 1.0 0.1 0.07 0.3 0.32 0.32 0.2 0.54 0.4 0.24 0.39
0.17 0.18 0.14 0.19 0.24 0.18 0.2 0.16 0.17 0.19 0.65 0.48 0.32 1.0 0.11 0.11 0.05 0.58 0.7 0.21 0.13 0.31 0.16 0.24 0.31 0.1 0.09 0.08 0.36 0.25 0.18 0.28 0.34 0.3 0.1

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)