Heatmap: Cluster_71 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	4h after treatment	4h after treatment,No nitrate	8h after treatment	8h after treatment,No nitrate	20C	20h after treatment	20h after treatment,No nitrate	20h after treatment,Nocodazole added	36h after treatment	36h after treatment,No phosphate	Blue light,10min after light change	Blue light,60min after light change	Bohlin	CCAP1055/1,20C	CCAP1055/1,20C,High CO2,OligoDT primed	CCAP1055/1,20C,Low CO2,OligoDT primed	CCAP1055/1,20C,Normal CO2,OligoDT primed	CCMP2561	CCMP2561 Nitrase Reductase Knockout	CCMP632	CCMP632,24h	CCMP632,48h	CCMP632,72h	CCMP632,High light acclimated WT	CCMP632,Low light acclimated WT	NEPCC640,8h,1000ppmv CO2	NEPCC640,8h,390 ppmv CO2	No light,8h after treatment	Pt-1	Pt-1 8.6	Pt-1 8.6,With nitrogen	Pt-1 8.6,Without nitrogen	Red light,0min before light change	UTEX 646,Blue light	UTEX 646,No light
PTI_00G00540.1	0.56	0.74	0.58	0.77	0.5	0.71	0.89	0.44	0.67	0.68	0.0	0.0	0.0	0.0	0.67	0.36	0.67	0.58	0.66	0.2	0.36	0.68	0.25	0.74	0.21	0.0	0.0	0.8	0.36	1.0	0.96	0.65	0.0	0.0	0.0
PTI_00G02640.1	0.31	0.98	0.24	0.75	0.25	0.38	1.0	0.32	0.4	0.5	0.31	0.41	0.18	0.42	0.19	0.12	0.27	0.41	0.44	0.36	0.07	0.14	0.07	0.09	0.06	0.15	0.18	0.29	0.28	0.27	0.3	0.33	0.26	0.65	0.03
PTI_00G04100.1	0.29	0.3	0.33	0.32	0.42	0.39	0.51	0.33	0.42	0.42	0.11	0.07	0.37	0.36	0.42	0.42	0.5	0.73	0.91	0.52	0.14	0.39	0.15	0.64	0.35	0.3	0.29	0.33	0.42	1.0	0.93	0.92	0.09	0.2	0.2
PTI_00G04320.1	0.6	0.88	0.58	0.86	0.42	0.69	0.88	0.6	0.62	0.68	0.18	0.19	0.25	0.31	0.3	0.38	0.12	0.9	0.85	0.25	0.52	0.56	0.33	0.45	0.22	0.37	0.34	0.38	0.42	0.75	0.64	1.0	0.19	0.36	0.17
PTI_01G00150.1	0.21	0.37	0.31	0.66	0.39	0.3	0.47	0.45	0.24	0.36	0.27	0.35	0.24	1.0	0.33	0.4	0.42	0.73	0.73	0.26	0.13	0.4	0.13	0.44	0.19	0.32	0.12	0.18	0.46	0.62	0.76	0.59	0.37	0.41	0.3
PTI_01G00160.1	0.28	0.48	0.41	1.0	0.48	0.4	0.66	0.69	0.32	0.46	0.23	0.29	0.13	0.53	0.31	0.37	0.32	0.64	0.52	0.28	0.19	0.54	0.21	0.45	0.24	0.47	0.12	0.26	0.37	0.55	0.87	0.4	0.32	0.3	0.09
PTI_01G01140.1	0.29	0.58	0.4	0.63	0.17	0.39	0.64	1.0	0.39	0.47	0.25	0.3	0.11	0.11	0.23	0.37	0.16	0.29	0.28	0.3	0.23	0.5	0.25	0.16	0.06	0.12	0.06	0.47	0.19	0.27	0.2	0.43	0.33	0.44	0.34
PTI_01G03620.1	0.31	0.47	0.38	0.71	0.49	0.41	0.46	0.85	0.49	0.45	0.12	0.13	0.0	0.16	0.17	0.21	0.24	0.75	0.79	0.09	0.4	1.0	0.26	0.18	0.04	0.0	0.01	0.36	0.27	0.07	0.11	0.09	0.14	0.49	0.07
PTI_01G03900.1	0.41	0.44	0.62	0.52	0.37	0.93	0.44	0.63	1.0	0.92	0.1	0.05	0.07	0.06	0.32	0.32	0.07	0.35	0.44	0.17	0.87	0.65	0.46	0.52	0.31	0.05	0.02	0.06	0.27	0.63	0.78	0.46	0.09	0.3	0.03
PTI_01G07520.1	0.81	1.0	0.7	0.9	0.7	0.85	0.88	0.86	0.78	0.76	0.41	0.46	0.38	0.47	0.91	0.64	0.7	1.0	0.77	0.56	0.52	0.58	0.59	0.54	0.25	0.64	0.59	0.55	0.44	0.79	0.85	0.76	0.44	0.81	0.35
PTI_02G05530.1	0.39	0.89	0.47	0.83	0.35	0.46	1.0	0.3	0.41	0.54	0.38	0.52	0.75	0.38	0.47	0.44	0.69	0.6	0.89	0.33	0.09	0.21	0.08	0.31	0.13	0.59	0.35	0.25	0.1	0.52	0.58	0.45	0.53	0.71	0.69
PTI_03G00230.1	0.41	0.61	0.27	0.85	0.59	0.46	1.0	0.32	0.51	0.63	0.42	0.6	0.63	0.64	0.26	0.26	0.28	0.9	0.9	0.52	0.12	0.26	0.17	0.41	0.26	0.23	0.17	0.66	0.47	0.45	0.34	0.74	0.61	0.6	0.37
PTI_03G03900.1	0.27	0.96	0.37	0.84	0.33	0.53	1.0	0.78	0.47	0.54	0.16	0.18	0.4	0.39	0.27	0.2	0.39	0.64	0.49	0.21	0.03	0.09	0.03	0.35	0.16	0.24	0.11	0.13	0.13	0.59	0.47	0.82	0.19	0.2	0.01
PTI_04G02950.1	0.34	0.62	0.44	0.75	0.36	0.5	0.68	1.0	0.3	0.48	0.17	0.19	0.2	0.1	0.15	0.19	0.13	0.33	0.32	0.12	0.17	0.21	0.16	0.32	0.24	0.1	0.05	0.16	0.22	0.15	0.12	0.18	0.24	0.24	0.05
PTI_06G01580.1	0.42	0.56	0.48	0.64	0.18	0.39	0.55	0.46	0.24	0.34	0.34	0.44	0.36	0.58	0.58	0.42	0.54	0.77	0.98	1.0	0.04	0.23	0.04	0.37	0.08	0.31	0.22	0.25	0.5	0.64	0.45	0.86	0.49	0.69	0.12
PTI_07G00010.1	0.5	0.57	0.36	0.51	0.26	0.33	0.42	0.28	0.35	0.42	0.0	0.0	0.08	0.0	0.39	0.23	0.66	0.43	0.62	0.21	0.04	0.11	0.02	0.38	0.14	0.01	0.01	0.41	0.31	0.75	0.43	1.0	0.0	0.0	0.0
PTI_07G00080.1	0.33	0.4	0.33	0.48	0.37	0.34	0.59	0.31	0.41	0.56	0.17	0.19	0.1	0.23	0.45	0.36	0.51	0.64	0.96	1.0	0.26	0.44	0.39	0.35	0.36	0.01	0.0	0.47	0.53	0.7	0.57	0.59	0.19	0.2	0.49
PTI_07G01880.1	0.31	0.57	0.38	0.68	0.35	0.41	0.7	0.89	0.42	0.48	0.52	0.5	0.51	0.33	0.44	0.48	0.27	0.85	0.99	0.65	0.22	0.55	0.18	0.49	0.4	1.0	0.98	0.43	0.42	0.7	0.61	0.71	0.55	0.4	0.51
PTI_07G04450.1	0.27	0.5	0.47	0.93	0.34	0.29	0.55	0.7	0.23	0.34	0.23	0.32	0.34	0.25	0.21	0.34	0.42	0.46	0.55	0.25	0.02	0.12	0.03	0.2	0.07	0.2	0.03	0.14	0.31	0.36	0.43	0.45	0.31	1.0	0.7
PTI_08G00260.1	0.2	0.46	0.36	1.0	0.24	0.4	0.72	0.42	0.45	0.46	0.08	0.13	0.21	0.26	0.09	0.16	0.03	0.2	0.19	0.22	0.14	0.26	0.1	0.23	0.08	0.16	0.07	0.31	0.16	0.33	0.28	0.37	0.13	0.25	0.12
PTI_08G00820.1	0.17	1.0	0.3	0.88	0.09	0.07	0.74	0.51	0.09	0.21	0.11	0.13	0.33	0.54	0.11	0.08	0.16	0.53	0.54	0.23	0.1	0.14	0.07	0.15	0.11	0.14	0.08	0.12	0.07	0.47	0.22	0.77	0.06	0.58	0.05
PTI_08G02840.1	0.25	0.38	0.25	0.4	0.4	0.31	0.4	0.2	0.33	0.31	0.2	0.3	0.54	0.6	0.47	0.56	0.16	0.8	0.9	1.0	0.11	0.19	0.2	0.38	0.3	0.2	0.12	0.34	0.39	0.44	0.38	0.57	0.32	0.5	0.74
PTI_08G04260.1	0.42	1.0	0.48	0.76	0.38	0.45	0.68	0.43	0.26	0.56	0.02	0.04	0.21	0.01	0.21	0.39	0.19	0.36	0.41	0.51	0.06	0.18	0.06	0.29	0.14	0.0	0.0	0.02	0.06	0.69	0.63	0.52	0.03	0.03	0.0
PTI_10G03100.1	0.13	0.25	0.24	0.39	0.25	0.2	0.53	0.28	0.32	0.31	0.14	0.16	0.79	0.31	0.45	0.49	0.54	0.71	1.0	0.69	0.33	0.37	0.17	0.41	0.12	0.1	0.04	0.29	0.37	0.34	0.24	0.51	0.2	0.28	0.29
PTI_11G00550.1	0.18	0.19	0.12	0.2	0.01	0.23	0.43	0.07	0.12	0.17	0.01	0.03	0.07	0.04	0.03	0.3	0.0	0.79	0.68	1.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.09	0.0	0.25	0.09	0.0	0.0	0.0	0.03	0.06	0.06
PTI_11G01000.1	0.66	0.78	0.59	0.79	0.53	0.7	0.9	0.48	0.72	0.7	0.41	0.49	0.28	0.37	0.3	0.24	0.15	0.58	0.49	0.34	0.6	0.81	0.47	0.36	0.12	0.22	0.16	0.92	0.23	0.67	0.41	0.95	0.52	1.0	0.82
PTI_11G03040.1	0.4	0.63	0.37	0.61	0.33	0.34	0.55	0.47	0.25	0.36	0.65	0.76	0.13	0.23	0.45	0.4	0.12	0.71	0.6	0.51	0.27	0.66	0.11	0.57	0.32	0.83	0.83	0.32	0.34	1.0	0.95	0.99	0.61	0.99	0.23
PTI_11G04330.1	0.49	0.97	0.44	0.95	0.52	0.6	1.0	0.49	0.5	0.65	0.54	0.7	0.33	0.24	0.43	0.56	0.58	0.72	0.82	0.32	0.25	0.67	0.17	0.31	0.14	0.43	0.19	0.52	0.27	0.42	0.5	0.45	0.68	0.63	0.87
PTI_13G00020.1	0.28	0.55	0.51	1.0	0.3	0.31	0.58	0.76	0.23	0.33	0.14	0.18	0.48	0.09	0.15	0.22	0.3	0.35	0.4	0.27	0.06	0.18	0.05	0.19	0.07	0.4	0.06	0.15	0.35	0.25	0.3	0.3	0.16	0.28	0.18
PTI_13G01470.1	0.36	0.5	0.47	0.78	0.18	0.39	0.49	1.0	0.32	0.4	0.16	0.14	0.06	0.05	0.05	0.15	0.04	0.22	0.31	0.04	0.04	0.12	0.02	0.12	0.04	0.39	0.22	0.59	0.28	0.22	0.29	0.15	0.14	0.29	0.22
PTI_13G02710.1	0.47	0.6	0.39	0.57	0.37	0.6	0.69	0.4	0.49	0.55	0.22	0.25	0.15	0.32	0.4	0.23	0.44	0.61	0.47	0.33	0.13	0.18	0.14	0.69	0.33	0.98	0.79	0.3	0.3	0.75	0.58	1.0	0.27	0.52	0.2
PTI_14G00460.1	0.3	0.55	0.36	1.0	0.53	0.33	0.9	0.4	0.3	0.44	0.48	0.7	0.25	0.41	0.36	0.4	0.22	0.86	0.95	0.22	0.05	0.26	0.09	0.34	0.23	0.15	0.05	0.4	0.41	0.51	0.38	0.88	0.77	0.76	0.22
PTI_14G01770.1	0.29	0.58	0.31	0.81	0.34	0.36	1.0	0.52	0.38	0.53	0.44	0.56	0.59	0.28	0.24	0.36	0.32	0.78	0.93	0.19	0.1	0.31	0.1	0.21	0.09	0.39	0.36	0.24	0.51	0.32	0.37	0.42	0.62	0.68	0.19
PTI_14G02000.1	0.4	0.59	0.35	0.55	0.25	0.41	0.55	0.28	0.36	0.47	0.19	0.23	1.0	0.41	0.18	0.18	0.19	0.39	0.4	0.27	0.27	0.29	0.16	0.15	0.08	0.18	0.12	0.37	0.24	0.46	0.28	0.59	0.24	0.45	0.52
PTI_14G03000.1	0.43	0.96	0.48	0.87	0.45	0.53	1.0	0.68	0.53	0.61	0.14	0.17	0.32	0.54	0.2	0.21	0.35	0.28	0.25	0.14	0.29	0.34	0.24	0.41	0.17	0.19	0.14	0.2	0.27	0.26	0.39	0.32	0.15	0.29	0.15
PTI_14G03100.1	0.18	0.62	0.25	0.63	0.28	0.26	1.0	0.33	0.27	0.46	0.49	0.58	0.93	0.78	0.22	0.21	0.3	0.66	0.68	0.68	0.03	0.12	0.03	0.34	0.09	0.25	0.14	0.01	0.12	0.41	0.54	0.57	0.41	1.0	0.01
PTI_15G01980.1	0.4	1.0	0.61	0.73	0.3	0.56	0.54	0.75	0.38	0.7	0.17	0.15	0.2	0.19	0.27	0.42	0.15	0.55	0.36	0.34	0.41	0.7	0.22	0.24	0.12	0.59	0.26	0.04	0.15	0.26	0.46	0.14	0.19	0.07	0.02
PTI_15G03120.1	0.41	0.56	0.52	0.64	0.41	0.49	0.59	1.0	0.5	0.52	0.23	0.28	0.8	0.36	0.26	0.21	0.35	0.54	0.67	0.38	0.27	0.32	0.24	0.57	0.22	0.18	0.14	0.5	0.35	0.65	0.55	0.72	0.3	0.37	0.5
PTI_16G02180.1	0.37	0.47	0.33	0.53	0.32	0.38	0.61	0.26	0.42	0.39	0.37	0.35	0.21	0.28	0.35	0.29	0.31	0.61	0.63	0.57	0.15	0.28	0.13	0.51	0.63	1.0	0.88	0.42	0.3	0.64	0.82	0.52	0.42	0.65	0.46
PTI_16G03080.1	0.65	0.87	0.58	0.94	0.39	0.68	0.87	0.67	0.52	0.65	0.2	0.27	0.29	0.55	0.29	0.31	0.12	0.75	0.93	0.48	0.24	0.42	0.16	0.59	0.26	0.43	0.34	0.24	0.38	0.73	0.6	1.0	0.24	0.87	0.15
PTI_17G01880.1	0.25	0.72	0.32	0.85	0.24	0.34	1.0	0.32	0.32	0.47	0.32	0.38	0.16	0.2	0.19	0.35	0.23	0.43	0.54	0.24	0.04	0.12	0.06	0.26	0.21	0.36	0.41	0.17	0.32	0.29	0.3	0.41	0.43	0.38	0.23
PTI_18G00550.1	0.21	0.36	0.35	0.48	0.3	0.27	0.31	1.0	0.23	0.32	0.12	0.14	0.09	0.26	0.46	0.56	0.56	0.36	0.38	0.18	0.08	0.22	0.08	0.19	0.06	0.22	0.1	0.15	0.17	0.26	0.38	0.13	0.14	0.28	0.19
PTI_18G01360.1	0.5	1.0	0.49	0.87	0.34	0.51	0.96	0.34	0.48	0.79	0.4	0.51	0.29	0.07	0.4	0.47	0.38	0.54	0.7	0.28	0.27	0.55	0.2	0.33	0.12	0.49	0.3	0.5	0.22	0.39	0.52	0.35	0.61	0.43	0.23
PTI_18G02260.1	0.46	0.51	0.4	0.53	0.35	1.0	0.79	0.7	0.64	0.61	0.39	0.16	0.19	0.2	0.46	0.29	0.5	0.72	0.98	0.39	0.12	0.42	0.1	0.68	0.34	0.3	0.53	0.07	0.35	0.73	0.76	0.92	0.12	0.67	0.11
PTI_18G02460.1	0.53	0.68	0.59	0.81	0.61	0.71	0.79	0.69	0.82	0.81	0.3	0.31	0.82	0.28	0.51	0.6	0.5	0.79	0.91	0.79	0.36	0.35	0.42	0.76	0.54	0.39	0.2	0.88	0.58	0.89	0.79	1.0	0.33	0.4	0.44
PTI_19G00520.1	0.11	0.26	0.21	0.25	0.13	0.13	0.15	1.0	0.06	0.1	0.07	0.06	0.02	0.03	0.15	0.14	0.09	0.29	0.27	0.09	0.11	0.15	0.07	0.08	0.05	0.15	0.08	0.02	0.07	0.11	0.18	0.05	0.07	0.04	0.0
PTI_19G00530.1	0.11	0.26	0.21	0.25	0.13	0.13	0.15	1.0	0.06	0.1	0.07	0.06	0.02	0.03	0.15	0.14	0.09	0.29	0.27	0.09	0.11	0.15	0.07	0.08	0.05	0.15	0.08	0.02	0.07	0.11	0.18	0.05	0.07	0.04	0.0
PTI_19G02650.1	0.95	0.91	0.8	0.75	0.43	0.81	0.63	0.88	0.5	0.64	0.12	0.2	0.32	0.21	0.66	0.43	0.3	0.74	0.5	0.52	0.33	0.38	0.19	0.43	0.12	0.67	0.79	0.42	0.47	0.92	0.76	1.0	0.17	0.79	0.17
PTI_20G02580.1	0.58	0.97	0.44	0.77	0.33	0.51	0.64	0.48	0.33	0.44	0.29	0.36	0.06	0.43	0.16	0.11	0.16	0.48	0.77	0.13	0.06	0.23	0.09	0.08	0.06	0.19	0.19	0.16	0.18	0.76	0.43	1.0	0.12	0.63	0.03
PTI_23G01450.1	0.33	0.39	0.25	0.52	0.14	0.44	0.58	0.23	0.29	0.27	0.15	0.16	0.01	0.14	0.18	0.08	0.16	0.36	0.68	0.01	0.04	0.06	0.0	0.11	0.04	0.46	1.0	0.07	0.05	0.31	0.3	0.33	0.11	0.22	0.03
PTI_23G01750.1	0.12	0.23	0.15	0.24	0.22	0.18	0.3	0.17	0.26	0.3	0.77	0.82	0.44	0.59	0.15	0.18	0.14	1.0	0.93	0.13	0.11	0.18	0.16	0.32	0.15	0.06	0.01	0.1	0.05	0.56	0.25	1.0	0.86	0.26	0.22
PTI_24G01500.1	0.25	0.39	0.18	0.45	0.37	0.52	0.58	0.33	0.64	0.7	0.2	0.2	0.34	0.17	0.17	1.0	0.14	0.66	0.56	0.42	0.28	0.27	0.33	0.44	0.4	0.31	0.4	0.44	0.42	0.75	0.49	0.75	0.24	0.24	0.43
PTI_25G01070.1	0.39	0.57	0.41	0.57	0.48	0.55	0.64	0.7	0.59	0.68	0.32	0.3	0.29	0.24	0.27	0.72	0.33	0.47	0.76	0.52	0.1	0.29	0.12	0.48	0.1	0.16	0.09	0.27	0.37	0.78	0.48	1.0	0.3	0.81	0.52
PTI_27G00410.1	0.4	0.8	0.51	0.56	0.43	0.53	0.5	1.0	0.4	0.56	0.22	0.21	0.16	0.28	0.36	0.24	0.56	0.45	0.43	0.32	0.51	0.43	0.26	0.47	0.23	0.2	0.12	0.13	0.21	0.32	0.46	0.31	0.25	0.24	0.05
PTI_29G00310.1	0.24	0.37	0.13	0.28	0.31	0.24	0.35	0.25	0.2	0.36	0.37	0.43	0.18	0.16	0.16	0.23	0.04	1.0	0.8	0.12	0.36	0.48	0.29	0.08	0.08	0.16	0.07	0.36	0.23	0.18	0.14	0.32	0.47	0.32	0.29
PTI_29G00520.1	0.36	0.41	0.13	0.33	0.0	0.35	0.0	0.32	0.46	0.43	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.0	0.86	0.87	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.4	1.0	0.0	0.03	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0
PTI_29G00860.1	0.61	0.92	0.69	0.96	0.48	0.62	0.74	0.62	0.42	0.6	0.2	0.23	0.34	0.43	0.46	0.54	0.55	0.69	0.68	0.52	0.16	0.34	0.12	0.61	0.3	0.34	0.18	0.48	0.38	0.79	0.69	1.0	0.24	0.6	0.47
PTI_32G00260.1	0.4	0.47	0.29	0.42	0.36	0.47	0.52	0.3	0.54	0.62	0.32	0.28	0.21	0.13	0.32	0.6	0.16	0.62	0.62	0.4	0.25	0.31	0.3	0.54	0.4	0.24	0.18	0.89	0.48	0.74	0.49	1.0	0.33	0.31	0.24

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)