Heatmap: Cluster_44 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	OTH95	RCC4221	RCC745,25uM Cu,1h	RCC745,25uM Cu,4h	RCC745,25uM Cu,12h	RCC745,250uM Cu,1h	RCC745,250uM Cu,4h	RCC745,250uM Cu,12h	RCC745,Control,0h	RCC745,Control,1h	RCC745,Control,4h	RCC745,Control,12h
OT_01G00120.1	-0.77	-0.28	0.29	0.12	-0.02	-0.07	0.06	0.01	0.14	0.18	0.06	0.02
OT_01G00780.1	-0.52	-0.43	0.26	0.13	-0.06	-0.11	0.05	-0.03	0.15	0.21	0.11	0.03
OT_01G02120.1	0.45	0.75	0.14	-0.24	-0.31	-0.14	-0.73	-0.15	-0.31	0.48	-0.48	-0.2
OT_01G02640.1	-0.58	-0.42	0.06	0.12	0.14	-0.26	0.32	-0.06	0.23	-0.02	0.07	0.15
OT_01G03310.1	-0.82	-0.77	0.02	0.29	0.05	-0.02	0.43	0.06	0.28	-0.32	-0.03	0.27
OT_01G04310.1	-0.58	-0.52	0.17	0.22	0.01	0.04	0.18	-0.05	0.27	-0.06	-0.01	0.07
OT_01G04870.1	0.79	1.1	-0.09	-0.61	-0.31	-0.38	-1.54	-0.21	-0.68	0.53	-0.16	-0.36
OT_01G05150.1	0.22	0.63	-0.18	-0.26	-0.32	0.09	-0.06	-0.38	-0.26	0.42	-0.07	-0.24
OT_01G06060.1	0.31	1.03	-0.14	-0.35	-0.21	-0.48	-0.57	-0.22	-0.32	0.48	-0.13	-0.28
OT_01G06210.1	0.27	0.4	-0.01	-0.25	-0.37	0.07	-0.24	-0.06	-0.16	0.26	-0.06	-0.05
OT_01G06520.1	-0.74	-0.61	0.24	0.18	0.07	-0.16	0.12	0.04	0.2	0.04	0.18	0.09
OT_01G06710.1	-0.35	-0.54	0.01	0.27	-0.02	-0.02	0.24	0.11	0.14	-0.17	-0.01	0.13
OT_02G00300.1	-0.25	-0.68	-0.09	0.15	0.0	-0.0	0.4	0.06	0.01	-0.42	0.01	0.45
OT_02G00380.1	-0.42	-0.11	-0.32	0.0	0.3	-0.17	0.45	0.02	0.16	-0.49	0.05	0.21
OT_02G00390.1	-0.47	-0.51	-0.34	-0.01	0.29	-0.29	0.66	0.24	0.12	-0.51	-0.03	0.27
OT_02G00520.1	0.03	-0.38	-0.2	0.18	0.04	-0.06	0.44	0.1	0.06	-0.36	-0.15	0.09
OT_02G00590.1	-0.59	-0.21	-0.23	-0.07	0.25	-0.17	0.55	-0.02	0.08	-0.12	-0.02	0.24
OT_02G01000.1	-0.47	-0.37	-0.13	0.3	-0.02	-0.22	0.49	-0.01	0.22	-0.45	-0.05	0.34
OT_02G01040.1	-0.27	-0.49	-0.25	0.15	0.15	-0.15	0.46	0.06	0.17	-0.22	0.01	0.11
OT_02G01380.1	-0.11	-0.44	-0.38	0.24	0.13	-0.19	0.56	0.06	0.16	-0.54	-0.05	0.16
OT_02G01390.1	-0.03	-0.31	-0.52	0.01	0.23	-0.05	0.67	0.05	0.15	-0.99	0.01	0.17
OT_02G01450.1	-0.78	-0.48	-0.17	0.35	0.12	-0.04	0.53	0.22	0.04	-0.54	-0.04	0.24
OT_02G01520.1	-0.44	-0.66	-0.13	0.17	0.14	-0.14	0.6	0.22	0.09	-0.52	0.0	0.18
OT_02G01590.1	-0.46	-0.44	-0.02	0.24	0.08	-0.28	0.43	0.01	0.14	-0.11	-0.01	0.16
OT_02G01630.1	-0.54	-0.39	-0.16	0.24	0.11	-0.14	0.47	0.01	0.12	-0.33	0.02	0.26
OT_02G02120.1	-0.21	-0.48	-0.11	0.29	0.03	-0.09	0.47	0.04	0.1	-0.49	0.03	0.13
OT_02G02140.1	-0.92	-0.81	-0.02	0.31	0.1	0.01	0.52	0.08	0.27	-0.4	0.02	0.17
OT_02G02870.1	-0.51	-0.54	0.31	-0.1	0.35	-0.1	0.08	0.32	0.03	-0.26	0.11	-0.02
OT_02G03080.1	0.95	1.02	0.15	-0.85	-0.38	-0.34	-1.74	-0.01	-0.82	0.55	-0.21	-0.71
OT_02G03300.1	1.25	1.4	-0.11	-0.89	-0.72	-0.62	-2.2	-0.66	-1.27	0.61	-0.22	-0.73
OT_02G05170.1	-1.24	-0.21	0.29	0.12	-0.06	-0.26	0.26	0.08	0.18	0.09	0.18	0.02
OT_03G00080.1	-0.18	-0.33	-0.32	0.09	0.32	-0.03	0.45	0.05	0.09	-0.48	-0.05	0.13
OT_03G00770.1	0.05	-0.43	-0.2	-0.16	0.29	-0.01	0.3	0.16	0.02	-0.35	0.17	-0.04
OT_03G01990.1	-1.07	-0.53	0.25	0.45	-0.08	-0.18	0.31	-0.11	0.27	-0.06	-0.09	0.24
OT_03G02040.1	-0.33	-0.45	-0.06	0.01	0.08	-0.48	0.56	0.22	0.06	-0.27	0.07	0.22
OT_03G02550.1	-0.41	-0.27	-0.08	0.11	0.22	-0.1	0.31	0.15	0.1	-0.27	0.04	0.01
OT_03G02950.1	-0.07	0.2	-0.09	0.11	0.13	-0.41	-0.09	-0.14	0.14	-0.01	0.0	0.12
OT_03G03020.1	0.19	0.87	-0.09	0.01	-0.29	-0.6	0.04	-0.13	-0.11	-0.03	-0.32	-0.06
OT_03G04420.1	0.26	0.1	0.22	-0.18	-0.09	-0.16	-0.17	0.1	-0.17	-0.0	0.12	-0.13
OT_03G04430.1	0.71	0.37	0.19	-0.6	-0.33	0.33	-1.82	-0.21	-0.6	0.16	0.36	0.02
OT_04G01660.1	0.11	0.17	-0.09	-0.31	0.16	-0.22	0.09	0.12	-0.27	-0.14	0.16	0.11
OT_04G02420.1	-0.75	-0.1	-0.01	0.12	0.37	0.01	0.01	0.05	0.23	-0.36	0.14	-0.02
OT_04G02660.1	0.52	1.21	-0.2	-0.36	-0.74	-0.4	-1.13	-0.21	-0.68	0.78	-0.05	-0.67
OT_04G02870.1	0.83	1.38	-0.62	-0.52	-0.34	-0.66	-0.78	-0.53	-0.57	0.63	-0.56	-0.55
OT_04G03150.1	1.9	1.79	0.07	-3.73	-3.71	-1.39	-	-2.97	-	0.94	-0.87	-0.69
OT_04G03160.1	0.21	0.27	-0.38	-0.14	-0.14	-0.4	0.09	0.22	-0.32	0.11	-0.05	0.28
OT_04G04210.1	0.34	0.69	0.06	-0.55	-0.12	-0.36	-0.31	-0.09	-0.28	0.22	-0.05	-0.0
OT_04G05310.1	-0.37	-0.43	-0.2	0.06	0.26	-0.07	0.32	-0.0	0.25	-0.23	0.1	0.07
OT_05G03160.1	0.4	-0.03	-0.19	-0.53	0.28	-0.16	0.09	0.24	-0.05	-0.2	0.01	-0.11
OT_05G03230.1	0.62	0.66	-0.31	-0.3	-0.07	-0.48	-0.35	-0.14	-0.34	0.34	-0.08	-0.17
OT_05G03310.1	-0.27	-0.28	0.07	0.18	0.06	-0.16	0.15	0.19	0.18	-0.41	0.04	0.08
OT_05G03610.1	0.18	0.22	0.06	0.04	-0.3	-0.21	0.13	-0.0	-0.14	0.06	-0.24	0.08
OT_06G00170.1	-0.47	2.79	-1.06	-1.36	-0.73	-1.41	-1.65	-0.76	-1.13	-1.5	-1.01	-1.76
OT_06G01330.1	-1.19	-0.86	0.16	0.3	0.02	-0.02	0.26	0.23	0.19	-0.02	0.16	0.05
OT_06G03160.1	-0.29	0.12	-0.08	0.19	-0.08	0.01	-0.06	-0.42	0.16	0.11	-0.02	0.22
OT_07G00070.1	-0.26	-0.13	0.06	-0.19	0.3	-0.07	-0.07	0.19	0.06	-0.1	0.09	0.0
OT_07G01700.1	-0.66	-0.13	0.01	0.12	-0.04	-0.04	0.16	0.16	0.01	0.14	-0.01	0.12
OT_07G02890.1	-0.05	0.33	-0.07	-0.38	0.1	-0.34	-0.07	0.16	0.05	-0.19	-0.01	0.3
OT_07G03170.1	0.69	1.23	-0.55	-0.29	-0.56	-0.37	-0.39	-0.35	-0.49	0.5	-0.71	-0.35
OT_07G03490.1	0.38	-0.05	-0.05	-0.19	0.19	-0.08	-0.2	-0.11	-0.13	-0.29	0.28	0.06
OT_07G03610.1	0.21	0.04	-0.11	-0.31	-0.09	-0.11	0.05	-0.12	0.02	0.34	-0.04	0.0
OT_07G03720.1	-0.49	-0.47	0.15	0.27	0.1	-0.1	0.1	-0.12	0.29	-0.1	0.04	0.11
OT_07G03790.1	-0.54	-0.46	-0.26	0.09	0.27	-0.27	0.53	0.1	0.13	-0.39	0.11	0.25
OT_08G02490.1	-0.12	-0.25	0.03	-0.02	0.09	-0.14	0.23	0.07	0.12	-0.21	0.17	-0.04
OT_08G02800.1	0.44	0.66	0.11	-0.42	-0.07	-0.39	-0.49	-0.16	-0.25	0.36	-0.12	-0.22
OT_09G00220.1	-0.66	-0.22	0.04	0.03	0.02	0.0	0.07	0.18	0.24	-0.02	0.04	0.07
OT_09G00350.1	-0.3	-0.44	0.21	-0.15	0.1	-0.36	0.24	0.24	0.07	-0.02	0.31	-0.16
OT_09G00510.1	0.21	1.15	-0.04	-0.43	-0.2	-0.61	-1.04	-0.11	-0.56	0.67	-0.16	-0.32
OT_09G01260.1	0.35	1.18	-0.02	-0.75	-0.24	-0.53	-0.73	-0.15	-0.35	0.44	-0.01	-0.5
OT_09G01660.1	-0.25	-0.1	0.04	0.08	0.13	-0.26	0.13	0.05	0.2	-0.06	0.01	-0.06
OT_09G01780.1	0.16	0.6	-0.34	-0.35	-0.0	-0.02	-0.02	-0.08	-0.33	0.17	0.04	-0.11
OT_09G02130.1	0.91	1.68	-0.96	-0.76	-0.36	-0.5	-0.34	-1.24	-0.9	-0.3	-0.36	-0.02
OT_09G02140.1	-0.2	0.72	-0.17	0.07	-0.04	-0.28	0.03	-0.15	-0.06	0.03	-0.26	0.03
OT_09G02300.1	-0.3	-0.24	-0.3	0.06	0.08	-0.08	0.36	0.18	-0.05	-0.19	0.03	0.27
OT_09G02580.1	-0.5	-0.18	-0.2	0.04	-0.05	0.25	0.19	-0.23	-0.06	0.4	0.02	0.09
OT_09G02960.1	-0.24	-0.23	0.0	0.05	0.04	0.01	0.16	-0.02	0.16	-0.07	0.04	0.03
OT_09G03060.1	-0.07	0.52	0.1	-0.18	-0.37	-0.27	-0.5	0.18	-0.25	0.67	-0.02	-0.32
OT_09G03170.1	-0.37	-0.65	0.12	-0.07	0.19	0.07	0.09	0.08	0.13	0.05	0.2	-0.05
OT_09G03200.1	-0.14	0.74	-0.28	-0.21	-0.25	-0.03	-0.04	-0.46	-0.16	0.44	-0.0	-0.05
OT_09G03280.1	2.09	2.55	-3.14	-4.48	-4.66	-6.46	-	-4.89	-5.58	0.59	-3.69	-4.44
OT_09G03290.1	-0.99	-0.46	0.09	0.25	0.03	-0.34	0.28	-0.2	0.36	0.07	0.13	0.26
OT_09G03310.1	1.1	1.6	0.08	-0.41	-0.36	-0.58	-1.04	-1.02	-1.1	0.02	-0.34	-1.69
OT_09G04310.1	-0.17	-0.24	0.13	-0.0	0.12	-0.18	-0.14	0.02	0.04	0.21	0.18	-0.06
OT_10G01550.1	-0.03	0.71	-0.02	-0.37	-0.06	-0.2	-0.34	0.0	-0.16	0.33	0.05	-0.3
OT_10G01620.1	0.52	0.12	0.01	-0.2	-0.31	-0.6	0.17	0.21	-0.73	0.41	0.05	-0.16
OT_10G03420.1	-0.72	-0.17	0.26	0.26	-0.18	-0.07	0.26	-0.07	0.14	0.25	-0.17	-0.08
OT_12G00230.1	-0.33	-0.78	-0.24	0.09	0.33	-0.04	0.53	0.07	0.19	-0.43	0.07	0.07
OT_12G00340.1	-0.29	0.51	-0.11	-0.03	0.08	-0.29	-0.16	0.09	0.21	-0.12	0.07	-0.16
OT_12G01310.1	0.52	0.57	-0.2	-0.26	-0.08	-0.38	-0.11	-0.05	-0.35	0.25	-0.05	-0.26
OT_12G01990.1	0.51	1.13	-0.37	-0.63	-0.03	0.25	-0.83	-1.14	-0.82	0.37	0.01	-0.12
OT_13G00360.1	0.24	-0.08	0.2	-0.22	0.16	-0.16	-0.25	-0.01	-0.08	0.18	0.14	-0.25
OT_13G00860.1	-1.27	-0.68	0.05	-0.08	0.21	0.42	0.36	0.12	0.01	0.07	-0.0	0.09
OT_13G01010.1	0.18	0.08	0.22	-0.24	0.2	-0.36	-0.4	0.14	0.01	0.17	0.12	-0.35
OT_13G01570.1	-0.7	-0.28	0.3	0.35	-0.13	-0.13	0.13	0.07	0.13	-0.01	-0.07	0.06
OT_14G00760.1	-0.33	0.03	0.07	0.06	0.1	-0.31	-0.07	0.08	0.14	0.07	0.08	-0.0
OT_14G02350.1	-0.4	-0.39	-0.04	0.09	-0.13	-0.15	0.48	-0.09	0.16	-0.05	-0.01	0.29
OT_14G02420.1	-0.4	-0.07	0.08	0.19	0.09	-0.29	0.09	0.15	0.11	-0.06	-0.05	0.04
OT_14G02550.1	-0.48	-0.53	-0.27	0.05	0.07	0.13	0.41	-0.02	-0.06	0.15	0.03	0.24
OT_14G02720.1	0.87	1.85	-0.59	-1.17	-1.17	-1.01	-1.64	-1.09	-1.16	1.13	-0.71	-1.1
OT_14G03120.1	0.74	0.74	0.12	-0.56	-0.19	-0.64	-0.41	-0.16	-0.43	0.23	-0.06	-0.21
OT_14G03420.1	0.56	0.85	-0.43	-0.32	0.14	-0.03	-0.32	-0.03	-0.46	-0.44	-0.09	-0.14
OT_16G00450.1	-0.73	-0.45	-0.02	0.01	0.34	-0.12	0.2	0.34	0.06	-0.24	0.22	0.03
OT_16G01330.1	-0.52	-0.28	0.44	0.07	-0.21	-0.2	-0.18	0.16	0.21	0.37	-0.06	-0.11
OT_16G01660.1	-1.07	-1.14	0.26	0.47	-0.02	-0.2	0.26	0.01	0.32	-0.02	-0.03	0.28
OT_16G02550.1	-0.42	-0.61	0.04	-0.16	0.28	0.02	0.0	0.24	0.12	0.02	0.13	0.09
OT_17G02530.1	0.33	0.22	-0.04	-0.33	0.06	0.06	-0.3	0.01	-0.3	0.03	0.27	-0.2
OT_18G01040.1	0.0	-0.08	0.21	-0.29	0.0	-0.33	0.08	-0.01	0.01	0.15	0.16	-0.0

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.