Heatmap: Cluster_4 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	OTH95	RCC4221	RCC745,25uM Cu,1h	RCC745,25uM Cu,4h	RCC745,25uM Cu,12h	RCC745,250uM Cu,1h	RCC745,250uM Cu,4h	RCC745,250uM Cu,12h	RCC745,Control,0h	RCC745,Control,1h	RCC745,Control,4h	RCC745,Control,12h
OT_01G00540.1	0.74	1.0	0.11	0.32	0.21	0.35	0.16	0.29	0.15	0.69	0.2	0.38
OT_01G01550.1	0.77	1.0	0.67	0.67	0.89	0.75	0.81	0.83	0.7	0.72	0.79	0.92
OT_01G03980.1	0.65	1.0	0.48	0.74	0.83	0.69	0.89	0.62	0.62	0.8	0.68	0.94
OT_01G04460.1	0.8	1.0	0.46	0.32	0.44	0.38	0.3	0.41	0.36	0.88	0.45	0.33
OT_01G05240.1	0.5	0.89	0.59	0.59	0.53	0.63	0.63	0.4	0.56	1.0	0.63	0.68
OT_01G05620.1	0.75	0.81	0.66	0.71	0.72	0.75	0.79	0.61	0.63	1.0	0.81	0.76
OT_01G05650.1	0.69	0.83	0.72	0.68	0.73	0.67	0.63	0.7	0.6	1.0	0.79	0.67
OT_01G05740.1	0.67	1.0	0.58	0.33	0.29	0.37	0.2	0.31	0.34	0.93	0.46	0.35
OT_01G06430.1	0.99	1.0	0.52	0.43	0.32	0.41	0.35	0.32	0.33	0.86	0.41	0.54
OT_02G01130.1	0.85	1.0	0.36	0.35	0.69	0.46	0.37	0.51	0.39	0.74	0.58	0.44
OT_02G01160.1	0.55	1.0	0.45	0.23	0.28	0.24	0.11	0.27	0.22	1.0	0.44	0.3
OT_02G04800.1	0.72	1.0	0.11	0.07	0.06	0.07	0.06	0.05	0.07	0.47	0.09	0.14
OT_02G04810.1	0.64	0.88	0.64	0.58	0.49	0.55	0.53	0.52	0.58	1.0	0.7	0.61
OT_03G00340.1	1.0	0.84	0.16	0.12	0.29	0.26	0.15	0.37	0.24	0.34	0.26	0.17
OT_03G01390.1	0.69	1.0	0.02	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.08	0.02	0.0
OT_03G02400.1	0.59	1.0	0.25	0.28	0.36	0.29	0.27	0.24	0.24	0.61	0.36	0.35
OT_03G02690.1	0.8	1.0	0.15	0.08	0.08	0.07	0.03	0.06	0.06	0.31	0.12	0.08
OT_03G03030.1	1.0	1.0	0.71	0.76	0.97	0.7	0.94	0.93	0.78	0.92	0.91	1.0
OT_03G03140.1	0.81	1.0	0.5	0.55	0.43	0.5	0.42	0.38	0.47	0.85	0.5	0.53
OT_03G03770.1	1.0	0.96	0.02	0.06	0.04	0.05	0.03	0.05	0.02	0.27	0.0	0.03
OT_03G05010.1	0.8	1.0	0.47	0.45	0.55	0.58	0.48	0.4	0.41	0.96	0.56	0.55
OT_03G05170.1	0.9	1.0	0.48	0.63	0.81	0.6	0.66	0.7	0.64	0.64	0.68	0.7
OT_04G02500.1	0.55	1.0	0.25	0.12	0.13	0.15	0.06	0.16	0.09	0.7	0.22	0.14
OT_04G03050.1	0.9	1.0	0.53	0.4	0.57	0.42	0.49	0.52	0.4	0.84	0.55	0.55
OT_04G03140.1	0.83	1.0	0.28	0.2	0.33	0.31	0.15	0.38	0.27	0.53	0.37	0.3
OT_04G03970.1	0.78	1.0	0.51	0.41	0.48	0.43	0.33	0.5	0.41	0.77	0.53	0.43
OT_05G00100.1	0.79	1.0	0.36	0.23	0.37	0.32	0.18	0.31	0.26	0.64	0.39	0.3
OT_05G00180.1	0.38	1.0	0.26	0.28	0.4	0.32	0.35	0.31	0.28	0.75	0.36	0.33
OT_05G01030.1	0.52	0.92	0.32	0.31	0.27	0.29	0.3	0.26	0.21	1.0	0.35	0.41
OT_05G02250.1	0.45	1.0	0.23	0.13	0.21	0.13	0.13	0.11	0.09	0.63	0.24	0.21
OT_05G03110.1	0.7	0.85	0.56	0.57	0.73	0.63	0.76	0.64	0.58	1.0	0.75	0.8
OT_05G03800.1	0.72	1.0	0.36	0.43	0.58	0.37	0.46	0.54	0.44	0.54	0.44	0.42
OT_05G05030.1	0.72	0.83	0.83	0.94	0.88	0.81	0.91	0.82	0.89	0.92	1.0	0.87
OT_06G00130.1	0.62	1.0	0.5	0.53	0.54	0.5	0.65	0.41	0.47	0.82	0.51	0.64
OT_06G00140.1	0.77	1.0	0.43	0.29	0.38	0.38	0.28	0.3	0.35	0.96	0.52	0.37
OT_06G01080.1	0.68	1.0	0.57	0.66	0.91	0.7	0.79	0.77	0.71	0.57	0.85	0.85
OT_07G00050.1	1.0	0.81	0.1	0.08	0.14	0.09	0.08	0.09	0.06	0.28	0.12	0.12
OT_07G03120.1	1.0	0.78	0.03	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.0	0.28	0.04	0.03
OT_07G03850.1	0.74	1.0	0.23	0.29	0.29	0.33	0.26	0.35	0.23	0.71	0.39	0.34
OT_07G03930.1	0.62	1.0	0.29	0.31	0.4	0.36	0.3	0.27	0.29	0.81	0.39	0.47
OT_08G00360.1	0.68	1.0	0.7	0.76	0.68	0.51	0.85	0.66	0.69	0.96	0.7	0.72
OT_08G01720.1	0.37	1.0	0.34	0.44	0.49	0.33	0.43	0.42	0.42	0.46	0.42	0.44
OT_08G01890.1	0.73	0.99	0.48	0.37	0.42	0.41	0.28	0.44	0.33	1.0	0.52	0.39
OT_08G03070.1	1.0	0.95	0.46	0.57	0.66	0.58	0.56	0.63	0.44	0.8	0.64	0.78
OT_08G03300.1	0.51	1.0	0.22	0.22	0.18	0.15	0.18	0.18	0.17	0.32	0.21	0.23
OT_08G03580.1	0.49	0.96	0.34	0.22	0.25	0.25	0.14	0.28	0.24	1.0	0.32	0.24
OT_09G00400.1	0.61	1.0	0.4	0.27	0.42	0.41	0.48	0.49	0.4	0.8	0.49	0.52
OT_09G00410.1	0.73	1.0	0.61	0.39	0.48	0.45	0.5	0.54	0.47	0.7	0.49	0.59
OT_09G00740.1	0.95	1.0	0.13	0.13	0.19	0.16	0.1	0.15	0.11	0.38	0.17	0.15
OT_09G02310.1	0.78	1.0	0.65	0.68	0.67	0.59	0.59	0.64	0.6	0.98	0.69	0.68
OT_09G03110.1	0.97	1.0	0.18	0.28	0.31	0.27	0.28	0.27	0.18	0.51	0.33	0.43
OT_09G03610.1	1.0	0.88	0.64	0.62	0.69	0.71	0.57	0.61	0.52	0.94	0.72	0.72
OT_09G04330.1	0.74	1.0	0.46	0.28	0.45	0.3	0.36	0.35	0.46	0.67	0.49	0.42
OT_10G01280.1	0.55	1.0	0.07	0.01	0.01	0.03	0.0	0.05	0.02	0.54	0.05	0.03
OT_10G01610.1	0.65	1.0	0.21	0.24	0.19	0.23	0.23	0.22	0.15	0.88	0.22	0.32
OT_10G02790.1	0.76	1.0	0.68	0.48	0.66	0.54	0.5	0.68	0.59	0.91	0.74	0.64
OT_11G01000.1	0.56	1.0	0.12	0.07	0.11	0.09	0.04	0.11	0.06	0.47	0.1	0.08
OT_11G01620.1	0.71	1.0	0.64	0.65	0.53	0.58	0.44	0.51	0.49	0.82	0.78	0.68
OT_13G00110.1	0.59	1.0	0.14	0.15	0.17	0.18	0.14	0.15	0.14	0.21	0.18	0.19
OT_13G00370.1	0.93	1.0	0.21	0.2	0.44	0.22	0.5	0.38	0.27	0.59	0.23	0.44
OT_13G02490.1	0.73	1.0	0.16	0.1	0.15	0.15	0.11	0.14	0.09	0.39	0.2	0.18
OT_13G02750.1	0.62	1.0	0.41	0.44	0.48	0.43	0.48	0.46	0.35	0.97	0.54	0.6
OT_14G00430.1	0.5	1.0	0.14	0.07	0.02	0.04	0.0	0.04	0.03	0.67	0.1	0.06
OT_14G02440.1	0.76	1.0	0.4	0.36	0.38	0.35	0.32	0.42	0.32	0.83	0.39	0.34
OT_14G02620.1	0.73	1.0	0.21	0.12	0.1	0.12	0.04	0.08	0.07	0.85	0.16	0.13
OT_14G02950.1	0.65	1.0	0.82	0.62	0.71	0.6	0.52	0.7	0.69	0.92	0.82	0.56
OT_15G01960.1	0.65	1.0	0.19	0.25	0.23	0.25	0.21	0.21	0.13	0.89	0.28	0.35
OT_17G00550.1	0.61	0.96	0.69	0.66	0.57	0.54	0.55	0.56	0.68	1.0	0.69	0.66
OT_17G01330.1	0.68	1.0	0.12	0.09	0.06	0.09	0.0	0.11	0.06	0.76	0.17	0.08
OT_17G01380.1	0.39	1.0	0.36	0.29	0.25	0.24	0.33	0.24	0.25	0.83	0.37	0.3
OT_17G01610.1	0.75	1.0	0.09	0.05	0.05	0.04	0.03	0.03	0.01	0.48	0.08	0.08
OT_18G01100.1	0.57	0.9	0.49	0.45	0.39	0.42	0.43	0.39	0.39	1.0	0.49	0.51
OT_18G01210.1	0.76	1.0	0.27	0.29	0.35	0.25	0.27	0.29	0.25	0.91	0.31	0.27
OT_18G01330.1	0.55	1.0	0.4	0.25	0.48	0.34	0.29	0.38	0.3	0.95	0.44	0.35
OT_18G01410.1	0.81	1.0	0.49	0.43	0.47	0.42	0.37	0.4	0.44	0.69	0.52	0.48
OT_18G01580.1	0.92	1.0	0.5	0.37	0.62	0.46	0.33	0.57	0.44	0.65	0.63	0.45
OT_20G00520.1	0.62	1.0	0.58	0.37	0.3	0.35	0.25	0.33	0.34	0.98	0.47	0.39

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)