Heatmap: Cluster_13 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
OTH95
RCC4221
RCC745,25uM Cu,1h
RCC745,25uM Cu,4h
RCC745,25uM Cu,12h
RCC745,250uM Cu,1h
RCC745,250uM Cu,4h
RCC745,250uM Cu,12h
RCC745,Control,0h
RCC745,Control,1h
RCC745,Control,4h
RCC745,Control,12h
0.43 0.44 0.35 -0.25 -0.48 -0.03 -0.68 -0.3 -0.26 0.47 0.06 -0.34
2.12 2.02 -1.4 -2.35 -3.83 -2.95 - -4.67 -3.52 1.28 -2.91 -3.02
1.44 1.13 -0.6 -0.48 -0.45 -0.69 -1.32 -0.46 -0.86 0.71 -0.45 -1.66
0.04 0.02 -0.05 -0.23 0.22 -0.35 0.07 -0.05 0.03 0.04 0.03 0.13
1.15 1.76 -0.09 -1.18 -1.54 -0.85 -3.06 -0.52 -1.01 0.57 -0.22 -1.07
0.19 0.08 0.32 -0.1 -0.03 -0.36 -0.06 -0.04 -0.08 0.11 0.06 -0.22
0.76 -0.03 0.01 -0.13 -0.27 -0.09 -0.28 -0.16 -0.16 0.25 -0.05 -0.19
1.16 0.76 -0.09 -0.5 -0.25 -0.35 -0.93 -0.11 -0.31 -0.16 -0.14 -0.46
0.64 0.41 -0.03 0.01 -0.28 -0.47 -0.19 -0.06 -0.14 0.06 -0.13 -0.18
0.49 0.66 0.31 -0.31 -0.31 -0.19 -1.16 -0.35 -0.14 0.41 -0.08 -0.2
0.68 0.11 0.12 0.01 -0.3 -0.41 -0.43 -0.17 -0.04 0.29 -0.0 -0.26
1.79 2.12 -0.26 -1.54 -3.21 -3.5 -4.01 -3.14 -1.31 0.78 -2.06 -1.93
0.56 -0.02 0.01 -0.1 -0.09 -0.06 -0.26 0.04 -0.11 0.02 0.05 -0.21
0.64 1.41 -0.2 -0.67 -0.45 -0.61 -1.14 -0.47 -0.64 0.67 -0.27 -0.61
0.29 -0.06 0.15 -0.16 0.07 -0.33 -0.14 0.13 0.03 0.06 -0.08 -0.07
1.9 1.06 -0.01 -0.85 -1.36 -0.89 -2.1 -1.01 -0.8 0.16 -0.54 -0.78
0.7 0.15 -0.06 -0.07 -0.14 -0.13 -0.28 -0.19 -0.0 -0.08 -0.06 -0.12
0.5 0.05 0.13 -0.05 -0.24 -0.29 -0.36 -0.11 -0.0 0.28 0.0 -0.13
0.45 0.17 0.04 -0.29 0.2 -0.24 -0.14 0.01 0.01 0.12 0.05 -0.66
0.07 0.72 -0.12 -0.24 -0.05 -0.17 -0.43 -0.1 -0.12 0.41 -0.06 -0.31
0.82 0.91 -0.11 -0.41 -0.53 -0.18 -0.52 -0.65 -0.41 0.19 -0.14 -0.05
0.3 0.21 0.21 -0.28 0.04 -0.23 -0.29 -0.04 0.01 0.06 -0.02 -0.12
2.27 1.97 -1.73 -1.9 -1.88 -2.62 - - -1.89 -0.65 -1.18 -0.14
1.01 0.65 0.11 -0.26 -0.39 -0.39 -0.66 -0.44 -0.33 0.29 -0.14 -0.55
0.57 0.43 0.05 -0.05 -0.16 -0.31 -0.35 -0.16 -0.13 0.12 -0.18 -0.14
0.45 0.52 0.12 -0.23 -0.18 -0.26 -0.79 -0.13 -0.19 0.4 0.0 -0.23
0.67 0.61 0.09 0.05 -0.47 -0.33 -0.49 -0.45 0.0 0.12 -0.26 -0.16
0.48 0.71 0.07 -0.26 -0.28 -0.42 -0.38 -0.11 -0.11 0.1 -0.01 -0.27
0.8 0.64 0.24 -0.43 -0.35 -0.43 -1.13 -0.09 -0.35 0.37 0.08 -0.46
0.57 0.16 0.03 -0.03 -0.38 -0.37 -0.3 -0.11 -0.2 0.37 -0.05 -0.01
0.85 0.41 -0.03 -0.08 -0.43 -0.07 -0.25 -0.12 -0.04 -0.34 -0.4 -0.05
0.61 0.44 0.24 -0.23 -0.14 -0.21 -0.69 -0.29 -0.37 0.33 -0.05 -0.17
0.76 1.02 -0.13 -0.6 -0.46 -0.46 -0.89 -0.2 -0.69 0.77 -0.14 -0.72
0.29 -0.23 0.16 0.03 -0.06 -0.14 -0.13 0.07 0.04 -0.05 0.07 -0.12
1.42 1.15 0.1 -0.77 -0.95 -0.75 -1.12 -0.8 -1.06 0.47 -0.3 -0.7
0.19 0.04 0.4 0.04 -0.24 0.04 -0.32 -0.19 0.12 -0.04 -0.03 -0.17
0.0 -0.13 0.62 0.26 -0.55 -0.05 -0.58 -0.21 0.43 0.08 -0.13 -0.22
0.48 0.33 0.6 0.18 -1.02 -0.16 -0.87 -0.38 0.45 0.14 -0.28 -0.51
0.72 0.91 0.17 -0.47 -0.54 -0.29 -0.78 -0.16 -0.0 -0.13 -0.35 -0.09
0.61 0.3 0.34 -0.12 -0.52 -0.1 -0.46 -0.74 -0.07 0.17 0.1 -0.09
0.09 -0.19 0.3 0.22 -0.17 0.14 -0.18 -0.23 0.25 -0.04 -0.13 -0.22
0.45 -0.03 -0.12 -0.24 0.17 -0.12 -0.52 0.12 -0.11 -0.09 0.06 0.2
0.61 0.43 -0.49 0.07 -0.32 -0.07 -0.83 -0.31 -0.57 0.63 -0.05 0.1
1.25 1.07 0.16 -0.37 -0.19 -0.9 -1.46 -0.63 -0.97 0.0 -0.28 -0.21
0.49 0.02 -0.06 -0.36 0.04 -0.08 -0.25 0.05 -0.11 0.01 0.13 -0.07
0.81 0.36 0.28 -0.24 -0.49 -0.25 -1.11 0.0 -0.39 0.35 0.14 -0.45
1.06 0.5 -0.16 -0.35 0.17 -0.48 -0.92 -0.22 -0.36 -0.12 0.18 -0.4
0.64 0.27 0.02 -0.22 -0.01 -0.3 -0.3 -0.22 0.07 -0.02 -0.1 -0.11
1.04 1.19 -0.24 -0.53 -0.58 -0.32 -0.53 -0.32 -0.43 -0.48 -0.39 -0.09
1.19 0.63 0.13 -0.49 -0.32 -0.51 -1.11 -0.27 -0.44 0.17 -0.02 -0.48
0.83 0.83 0.06 -0.29 -0.53 -0.56 -0.53 -0.47 -0.39 0.6 -0.29 -0.49
0.26 0.33 0.52 -0.02 -0.39 -0.23 -0.85 -0.22 0.08 0.4 -0.17 -0.26
2.59 2.16 - -2.27 - - - - - -0.17 - -1.23
0.34 -0.12 0.15 -0.32 0.14 -0.15 -0.51 0.28 -0.07 -0.04 0.18 -0.15
0.07 -0.0 0.15 -0.04 -0.07 -0.18 -0.14 0.08 0.11 -0.05 -0.0 0.05
0.85 0.73 -0.04 -0.42 0.02 -0.06 -1.45 -0.5 -0.52 0.4 -0.02 -0.38
0.44 0.4 0.32 -0.43 -0.11 -0.33 -0.33 0.04 -0.04 0.29 -0.09 -0.6
0.74 0.64 0.13 -0.51 -0.13 -0.1 -0.9 0.06 -0.34 0.19 -0.16 -0.48
0.45 0.24 0.07 -0.28 0.0 -0.37 -0.49 0.07 -0.07 0.15 0.13 -0.16
0.8 1.07 -0.26 -0.48 -0.12 -0.33 -0.75 -0.41 -0.4 0.31 -0.5 -0.24
0.31 -0.11 0.03 -0.06 0.01 -0.05 -0.2 -0.0 0.1 -0.03 0.02 -0.07
0.43 0.13 -0.07 -0.15 0.05 -0.15 -0.07 -0.12 -0.11 0.04 -0.16 0.08
0.49 0.28 0.22 -0.22 -0.16 -0.0 -0.68 -0.11 -0.22 0.25 0.09 -0.31
0.57 1.02 0.02 -0.51 -0.18 -0.37 -1.05 -0.19 -0.35 0.37 -0.03 -0.52
0.55 0.72 -0.25 -0.24 -0.02 -0.27 -0.26 -0.0 -0.16 -0.02 -0.19 -0.32
0.57 0.42 0.44 0.0 -0.49 -0.25 -0.63 -0.19 0.01 -0.04 -0.32 -0.07
1.4 0.64 0.1 -0.28 -0.66 -0.4 -0.87 -0.71 -0.45 0.24 -0.34 -0.64
1.76 1.37 -0.51 -1.48 -1.52 -0.93 -1.57 -1.31 -1.03 0.5 -0.25 -0.67
1.09 1.03 -0.15 -0.34 -0.45 -0.39 -0.58 -0.65 -0.37 0.0 -0.42 -0.3
-0.13 0.06 0.12 0.21 -0.13 -0.21 -0.05 -0.52 0.13 0.42 -0.1 -0.0
-0.14 -0.01 0.3 -0.18 -0.25 -0.15 -0.36 -0.06 0.08 0.47 0.16 -0.07
0.52 0.17 -0.0 -0.21 -0.04 -0.3 -0.25 -0.17 -0.06 0.23 -0.05 -0.06
0.84 1.75 -0.61 -0.58 -1.01 -0.96 -0.9 -0.99 -1.22 1.06 -0.74 -1.49
0.17 -0.07 0.11 0.23 -0.21 -0.02 -0.04 -0.1 0.23 -0.03 -0.19 -0.19
0.71 0.62 0.64 -0.21 -0.54 -0.47 -1.07 -0.13 -0.26 0.12 -0.1 -0.42
0.76 0.78 0.07 -0.34 -0.19 -0.34 -0.63 -0.26 -0.11 -0.15 -0.04 -0.3
0.36 0.54 -0.14 -0.28 -0.04 -0.16 -0.44 -0.15 0.0 0.37 0.04 -0.51
0.58 0.71 0.62 -0.27 -0.77 -0.64 -0.95 -0.48 -0.03 0.25 0.05 -0.26
0.35 0.2 0.23 0.08 -0.27 0.02 -0.31 -0.17 0.07 -0.07 -0.09 -0.21
0.87 0.65 0.02 -0.33 -0.55 -0.28 -0.5 -0.82 0.0 0.02 0.23 -0.27
0.43 -0.16 0.32 0.16 -0.33 -0.12 -0.33 -0.19 -0.03 0.05 0.12 -0.13
1.18 0.85 0.29 -0.85 -0.18 -0.68 -1.21 -0.51 -0.54 0.49 -0.17 -0.92
0.38 0.18 0.23 -0.24 -0.09 0.05 -0.81 -0.05 -0.02 0.2 0.12 -0.28
1.93 1.69 -0.38 -1.2 -1.19 -2.45 -3.13 -0.77 -0.76 0.24 -1.16 -2.16
0.89 0.16 0.3 -0.55 -0.12 -0.52 -0.72 -0.02 -0.27 0.44 -0.1 -0.33
0.33 -0.28 0.12 -0.19 -0.04 0.13 -0.23 -0.55 -0.19 0.13 0.24 0.27
1.05 0.87 0.39 -0.45 -0.11 -0.44 -1.48 -0.95 -0.38 0.21 -0.19 -0.46
0.33 -0.03 -0.03 -0.01 0.09 -0.06 -0.12 -0.1 -0.05 -0.08 0.06 -0.07
0.0 0.18 0.04 -0.03 -0.01 0.03 -0.3 -0.14 -0.09 0.28 0.01 -0.05
0.5 0.18 0.32 -0.2 -0.18 -0.54 -0.24 -0.55 -0.05 0.2 -0.13 0.27
0.4 0.14 -0.07 -0.09 -0.07 -0.07 -0.15 -0.09 -0.06 -0.11 -0.13 0.18
1.36 1.47 -0.07 -0.94 -1.25 -0.8 -2.3 -1.13 -1.13 0.84 -0.47 -0.8
0.41 0.14 0.36 -0.22 -0.13 -0.16 -0.65 0.16 -0.06 0.01 0.02 -0.18
0.89 1.18 0.21 -0.59 -0.16 -0.09 -1.7 -0.58 -0.49 0.29 -0.45 -0.78
0.61 0.09 0.15 -0.28 -0.06 -0.11 -0.9 0.3 -0.17 0.11 0.03 -0.26
0.11 -0.2 0.6 -0.17 -0.26 -0.15 -0.48 0.03 -0.03 0.13 -0.04 0.17
1.03 0.43 -0.25 -0.28 -0.18 -0.34 -0.35 -0.0 -0.21 -0.06 -0.05 -0.52
0.39 -0.28 0.17 -0.07 -0.06 -0.13 -0.4 -0.09 -0.0 0.35 0.06 -0.14
0.42 0.2 -0.04 -0.11 -0.16 -0.03 -0.32 -0.07 -0.01 0.26 -0.02 -0.29
0.15 0.34 0.16 -0.09 -0.14 -0.13 -0.3 -0.17 -0.06 0.33 -0.1 -0.14
0.36 0.42 -0.06 -0.66 -0.04 0.31 -0.3 -0.09 -0.07 0.01 0.08 -0.32
0.95 0.64 0.25 -0.55 -0.15 -0.24 -1.12 -0.3 -0.23 0.4 -0.07 -1.04
0.58 0.11 -0.09 -0.11 -0.06 0.1 -0.27 -0.3 -0.2 0.04 0.14 -0.17
0.75 1.09 0.41 -0.45 -0.55 -0.26 -2.11 -0.72 -0.63 0.51 -0.09 -0.4
0.63 0.41 0.24 -0.18 -0.26 0.05 -0.78 -0.42 -0.16 0.29 -0.0 -0.43
0.49 0.1 0.08 -0.04 -0.14 -0.02 -0.47 -0.19 0.02 0.19 -0.06 -0.17
0.88 0.76 0.22 -0.38 -0.43 -0.37 -1.32 -0.38 -0.15 0.46 -0.06 -0.71
1.08 0.48 0.07 -0.36 -0.59 -0.44 -1.3 -0.67 -0.39 0.48 0.34 -0.33
1.61 1.28 -0.03 -0.31 -1.61 -1.23 -1.26 -1.3 -0.95 0.2 -0.28 -0.61
0.73 0.7 0.23 -0.32 -0.22 -0.23 -0.95 -0.2 -0.24 0.1 -0.01 -0.45
0.31 0.46 0.11 0.04 -0.2 -0.34 -0.42 -0.32 0.0 0.25 0.01 -0.19
0.22 -0.23 -0.06 -0.04 0.22 -0.17 0.1 0.25 -0.07 -0.26 -0.12 0.04
2.08 2.19 -0.82 - -2.27 -1.13 - -1.38 -2.26 0.45 - -
0.49 -0.02 0.34 -0.04 -0.02 -0.21 -0.33 -0.03 -0.2 0.15 0.02 -0.43
1.59 1.62 -0.38 -0.97 -1.27 -1.03 -1.52 -1.1 -1.39 0.39 -0.84 -0.61
0.15 -0.04 0.15 -0.07 0.17 -0.05 -0.23 0.0 0.19 -0.1 -0.0 -0.26
1.45 0.99 -0.29 -0.47 -0.51 -0.75 -1.26 -0.4 -0.55 0.21 -0.25 -0.8
0.2 -0.1 0.12 0.13 -0.3 -0.04 0.06 -0.28 0.08 0.01 0.08 -0.06
1.54 2.63 -3.59 -3.45 -2.43 - - - -3.52 1.28 - -
2.31 1.75 -1.46 -1.43 -1.75 -2.46 -3.47 -3.11 -2.53 0.68 -1.65 -2.83
1.7 1.41 -0.21 -0.45 -1.43 -1.18 -2.17 -0.78 -1.02 0.33 -0.37 -1.52
1.13 1.13 0.29 -0.61 -0.87 -0.56 -1.85 -0.6 -1.0 0.58 -0.09 -0.6
0.68 0.1 0.28 -0.22 -0.17 -0.19 -0.63 -0.2 -0.05 0.1 0.12 -0.23
2.26 1.53 -0.3 -1.17 -1.17 -1.54 -1.83 -2.02 -1.27 -0.68 -1.59 -1.35
0.37 0.37 -0.18 -0.16 -0.06 -0.13 -0.06 -0.02 -0.05 0.01 -0.07 -0.16
0.25 0.2 0.15 -0.06 -0.1 -0.0 -0.64 0.01 0.06 0.19 -0.0 -0.25
0.28 -0.01 0.13 -0.1 -0.14 0.02 -0.35 0.04 0.01 0.18 -0.01 -0.17
0.86 1.07 -0.01 -0.26 -0.1 -0.59 -1.03 -0.53 0.05 -0.41 -0.07 -0.43
0.9 0.63 0.2 -0.35 -0.69 -0.21 -0.79 -0.55 -0.12 0.41 -0.14 -0.42
1.47 1.31 -0.09 -1.16 -0.73 -0.81 -1.58 -1.1 -1.05 0.6 -0.33 -0.73
1.02 0.51 -0.0 -0.37 -0.24 -0.42 -0.81 -0.46 -0.25 0.35 0.13 -0.55
0.83 0.89 -0.43 -0.64 0.23 -0.45 -0.81 -0.32 -0.5 0.19 0.07 -0.29
1.2 1.16 -0.03 -0.67 -0.45 -0.61 -1.43 -0.58 -0.71 0.38 -0.45 -0.36
0.45 0.35 0.42 -0.13 -0.42 -0.21 -0.62 -0.1 -0.06 0.38 -0.11 -0.46
1.26 0.72 0.03 -0.75 -0.11 -0.69 -2.02 -0.25 -0.59 -0.02 0.38 -0.4
1.06 0.82 0.13 -0.29 -0.53 -0.27 -1.24 -0.63 -0.31 0.3 -0.24 -0.39
0.4 0.16 0.3 -0.22 -0.15 -0.4 -0.6 -0.27 -0.12 0.6 0.07 -0.26
0.64 0.44 0.09 -0.19 -0.23 -0.37 -0.59 -0.16 -0.07 0.39 0.02 -0.56
1.35 1.08 -0.01 -0.41 -0.89 -0.53 -1.2 -0.71 -0.44 0.22 -0.42 -0.6
1.22 0.64 0.04 -0.3 -0.85 -0.21 -1.88 -0.36 -0.43 0.57 -0.15 -0.56
0.92 1.0 0.09 -0.41 -0.52 -0.35 -1.23 -0.27 -0.17 0.23 -0.22 -0.65
0.83 0.88 0.16 -0.58 -0.2 -0.7 -1.2 -0.52 -0.43 0.65 -0.0 -0.59

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.