Heatmap: Cluster_128 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000042.237 (tig00000042_g15639.t1)	0.09	0.05	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.02	0.06	0.09	0.16	0.05	0.05	0.01	0.02	0.03	0.08	0.17	0.08	0.01	0.77	0.66	0.55	0.68	1.0	0.51
Cpa\|evm.model.tig00000057.55 (tig00000057_g77.t1)	0.22	0.1	0.19	0.23	0.1	0.03	0.07	0.14	0.05	0.06	0.07	0.07	0.13	0.18	0.15	0.13	0.1	0.14	0.1	0.09	1.0	0.33	0.32	0.46	0.6	0.55
Cpa\|evm.model.tig00000073.15 (tig00000073_g1698.t1)	0.42	0.16	0.14	0.17	0.11	0.06	0.05	0.07	0.05	0.09	0.22	0.37	0.49	0.06	0.04	0.04	0.07	0.07	0.04	0.08	1.0	0.64	0.57	0.44	0.26	0.34
Cpa\|evm.model.tig00000093.248 (tig00000093_g3670.t1)	0.14	0.16	0.15	0.19	0.12	0.06	0.04	0.07	0.08	0.12	0.15	0.26	0.07	0.16	0.08	0.18	0.08	0.13	0.21	0.1	0.67	0.25	0.65	1.0	0.6	0.45
Cpa\|evm.model.tig00000113.26 (tig00000113_g5594.t1)	0.14	0.14	0.15	0.15	0.13	0.11	0.11	0.11	0.14	0.18	0.17	0.18	0.14	0.29	0.2	0.36	0.17	0.22	0.15	0.15	1.0	0.88	0.83	0.64	0.58	0.66
Cpa\|evm.model.tig00000144.98 (tig00000144_g9091.t1)	0.3	0.16	0.12	0.16	0.11	0.09	0.12	0.15	0.18	0.21	0.27	0.26	0.21	0.16	0.1	0.09	0.09	0.13	0.07	0.1	1.0	0.79	0.72	0.67	0.51	0.53
Cpa\|evm.model.tig00000204.112	0.09	0.16	0.13	0.08	0.13	0.11	0.1	0.13	0.16	0.16	0.08	0.1	0.06	0.09	0.1	0.13	0.1	0.21	0.2	0.15	1.0	0.21	0.6	0.24	0.42	0.32
Cpa\|evm.model.tig00000227.27 (tig00000227_g19812.t1)	0.69	0.51	0.38	0.42	0.43	0.47	0.35	0.36	0.42	0.4	0.49	0.57	0.66	0.18	0.16	0.26	0.27	0.35	0.43	0.32	0.77	0.53	1.0	0.99	0.55	0.42
Cpa\|evm.model.tig00000241.18 (tig00000241_g20876.t1)	0.41	0.28	0.29	0.25	0.15	0.13	0.14	0.17	0.13	0.14	0.19	0.26	0.39	0.16	0.16	0.16	0.12	0.17	0.13	0.14	0.77	0.47	1.0	0.61	0.74	0.4
Cpa\|evm.model.tig00000282.6 (tig00000282_g23840.t1)	0.23	0.12	0.09	0.19	0.22	0.25	0.28	0.27	0.27	0.35	0.4	0.32	0.24	0.15	0.05	0.18	0.09	0.14	0.07	0.06	1.0	0.64	0.98	0.71	0.68	0.42
Cpa\|evm.model.tig00000342.4 (tig00000342_g24192.t1)	0.3	0.28	0.16	0.32	0.29	0.23	0.32	0.31	0.3	0.29	0.31	0.24	0.25	0.35	0.28	0.3	0.3	0.46	0.65	0.29	1.0	0.48	0.62	0.79	0.47	0.76
Cpa\|evm.model.tig00000350.22 (tig00000350_g24323.t1)	0.01	0.01	0.02	0.09	0.11	0.07	0.13	0.1	0.16	0.14	0.15	0.1	0.02	0.12	0.03	0.09	0.05	0.06	0.04	0.04	1.0	0.16	0.5	0.41	0.2	0.21
Cpa\|evm.model.tig00000383.23 (tig00000383_g24634.t1)	0.28	0.16	0.15	0.15	0.18	0.23	0.31	0.31	0.3	0.21	0.18	0.18	0.34	0.28	0.3	0.68	0.22	0.39	0.3	0.16	0.55	1.0	0.42	0.23	0.56	0.29
Cpa\|evm.model.tig00000391.26 (tig00000391_g24858.t2)	0.21	0.14	0.11	0.14	0.12	0.07	0.1	0.11	0.1	0.1	0.15	0.14	0.18	0.11	0.11	0.12	0.07	0.1	0.08	0.06	1.0	0.65	0.99	0.8	0.43	0.36
Cpa\|evm.model.tig00000405.1 (tig00021501_g21964.t1)	0.07	0.05	0.03	0.06	0.04	0.02	0.06	0.04	0.08	0.1	0.09	0.11	0.04	0.19	0.09	0.09	0.08	0.15	0.09	0.07	0.96	0.52	0.31	1.0	0.6	0.43
Cpa\|evm.model.tig00000430.10 (tig00000430_g594.t1)	0.11	0.06	0.06	0.07	0.09	0.07	0.07	0.07	0.08	0.14	0.19	0.19	0.12	0.05	0.2	0.11	0.27	0.34	0.11	0.12	1.0	0.39	0.43	0.65	0.63	0.41
Cpa\|evm.model.tig00000448.36 (tig00000448_g865.t1)	0.63	0.42	0.39	0.59	0.54	0.46	0.61	0.61	0.53	0.52	0.47	0.44	0.65	0.43	0.33	0.41	0.45	0.57	0.37	0.37	1.0	0.71	0.57	0.53	0.72	0.72
Cpa\|evm.model.tig00000448.38 (tig00000448_g867.t1)	0.02	0.05	0.06	0.11	0.11	0.13	0.08	0.1	0.13	0.12	0.17	0.12	0.03	0.17	0.11	0.22	0.1	0.16	0.13	0.08	1.0	0.24	0.65	0.57	0.25	0.25
Cpa\|evm.model.tig00000459.19 (tig00000459_g1083.t1)	0.31	0.27	0.19	0.28	0.11	0.11	0.25	0.37	0.36	0.35	0.51	0.47	0.29	0.2	0.16	0.28	0.13	0.23	0.21	0.12	1.0	0.72	0.46	0.59	0.75	0.48
Cpa\|evm.model.tig00000478.1	0.34	0.36	0.35	0.3	0.21	0.19	0.26	0.27	0.15	0.18	0.17	0.16	0.31	0.61	0.36	0.47	0.27	0.29	0.28	0.28	1.0	0.78	0.56	0.3	0.52	0.52
Cpa\|evm.model.tig00000480.40 (tig00000480_g1308.t1)	0.16	0.15	0.16	0.18	0.15	0.12	0.15	0.15	0.12	0.12	0.15	0.16	0.14	0.16	0.13	0.18	0.16	0.15	0.14	0.11	1.0	0.2	0.74	0.36	0.65	0.27
Cpa\|evm.model.tig00000498.97	0.34	0.34	0.29	0.35	0.35	0.4	0.35	0.35	0.44	0.39	0.44	0.45	0.38	0.29	0.25	0.31	0.28	0.5	0.37	0.29	1.0	0.57	0.7	0.53	0.56	0.46
Cpa\|evm.model.tig00000555.8 (tig00000555_g2135.t1)	0.36	0.32	0.28	0.32	0.19	0.14	0.18	0.2	0.18	0.21	0.24	0.31	0.39	0.26	0.38	0.21	0.12	0.19	0.15	0.1	1.0	0.81	0.99	0.67	0.52	0.4
Cpa\|evm.model.tig00000655.3 (tig00000655_g2831.t1)	0.28	0.17	0.14	0.29	0.25	0.19	0.23	0.28	0.3	0.29	0.36	0.28	0.24	0.11	0.07	0.07	0.07	0.21	0.1	0.06	1.0	0.89	0.86	0.65	0.79	0.46
Cpa\|evm.model.tig00000792.42 (tig00000792_g4193.t1)	0.39	0.28	0.24	0.34	0.28	0.18	0.27	0.31	0.26	0.29	0.35	0.35	0.43	0.35	0.24	0.29	0.3	0.31	0.21	0.21	0.55	1.0	0.74	0.41	0.72	0.57
Cpa\|evm.model.tig00000821.64 (tig00000821_g4523.t1)	0.55	0.35	0.27	0.3	0.36	0.32	0.3	0.28	0.23	0.19	0.2	0.24	0.52	0.3	0.3	0.42	0.2	0.4	0.33	0.16	0.49	1.0	0.39	0.32	0.57	0.34
Cpa\|evm.model.tig00000842.63 (tig00000842_g4884.t1)	0.26	0.12	0.12	0.25	0.32	0.12	0.23	0.21	0.21	0.24	0.4	0.3	0.26	0.12	0.12	0.13	0.09	0.17	0.1	0.09	0.84	0.6	0.94	0.7	1.0	0.53
Cpa\|evm.model.tig00000912.26 (tig00000912_g5431.t1)	0.22	0.17	0.19	0.21	0.22	0.15	0.24	0.2	0.2	0.2	0.23	0.18	0.15	0.21	0.24	0.23	0.19	0.37	0.17	0.16	0.93	0.8	1.0	0.68	0.65	0.42
Cpa\|evm.model.tig00000939.10 (tig00000939_g5488.t1)	0.2	0.24	0.26	0.35	0.3	0.22	0.24	0.26	0.13	0.12	0.13	0.12	0.26	0.25	0.34	0.31	0.15	0.35	0.31	0.11	0.53	1.0	0.3	0.2	0.5	0.38
Cpa\|evm.model.tig00000939.11 (tig00000939_g5488.t1)	0.18	0.22	0.27	0.27	0.21	0.11	0.21	0.2	0.1	0.12	0.1	0.07	0.15	0.34	0.47	0.5	0.23	0.47	0.34	0.14	0.61	1.0	0.32	0.28	0.51	0.46
Cpa\|evm.model.tig00000944.29 (tig00000944_g5953.t1)	0.57	0.34	0.23	0.46	0.3	0.31	0.28	0.25	0.25	0.23	0.44	0.43	0.31	0.43	0.12	0.31	0.05	0.39	0.25	0.17	0.78	0.63	0.51	1.0	0.62	0.58
Cpa\|evm.model.tig00000944.37	0.21	0.23	0.3	0.29	0.32	0.28	0.31	0.31	0.25	0.39	0.39	0.48	0.26	0.37	0.41	0.4	0.18	0.48	0.37	0.21	0.89	0.15	0.86	1.0	0.64	0.86
Cpa\|evm.model.tig00000955.3 (tig00000955_g5774.t1)	0.13	0.15	0.11	0.1	0.11	0.11	0.13	0.12	0.1	0.13	0.13	0.16	0.13	0.43	0.23	0.34	0.2	0.35	0.28	0.19	1.0	0.53	0.57	0.68	0.47	0.58
Cpa\|evm.model.tig00000955.4 (tig00000955_g5777.t1)	0.27	0.25	0.25	0.27	0.44	0.34	0.27	0.22	0.25	0.38	0.46	0.49	0.41	0.66	0.45	0.57	0.34	0.51	0.55	0.32	1.0	0.63	0.84	0.97	0.58	0.94
Cpa\|evm.model.tig00001086.33 (tig00001086_g6868.t1)	0.24	0.25	0.21	0.18	0.1	0.05	0.07	0.13	0.18	0.26	0.43	0.58	0.25	0.34	0.1	0.36	0.26	0.13	0.1	0.14	0.91	0.59	0.86	1.0	0.38	0.26
Cpa\|evm.model.tig00001095.3 (tig00001095_g7017.t1)	0.47	0.3	0.32	0.37	0.33	0.27	0.37	0.41	0.34	0.39	0.42	0.48	0.56	0.48	0.34	0.62	0.31	0.4	0.32	0.28	0.57	1.0	0.66	0.48	0.6	0.56
Cpa\|evm.model.tig00001229.3 (tig00001229_g7836.t1)	0.38	0.22	0.2	0.25	0.15	0.09	0.14	0.22	0.24	0.27	0.42	0.45	0.31	0.1	0.08	0.12	0.11	0.16	0.11	0.11	0.99	0.44	1.0	0.93	0.56	0.49
Cpa\|evm.model.tig00001409.1 (tig00001409_g8619.t1)	0.18	0.05	0.03	0.21	0.14	0.05	0.16	0.18	0.23	0.14	0.29	0.15	0.11	0.07	0.06	0.07	0.05	0.1	0.05	0.06	0.91	0.46	1.0	0.44	0.77	0.58
Cpa\|evm.model.tig00001409.14 (tig00001409_g8633.t1)	0.46	0.5	0.5	0.51	0.51	0.38	0.39	0.37	0.34	0.34	0.4	0.5	0.47	0.23	0.17	0.31	0.34	0.32	0.21	0.34	0.81	0.67	0.88	1.0	0.55	0.47
Cpa\|evm.model.tig00001472.6 (tig00001472_g8885.t1)	0.33	0.21	0.21	0.38	0.35	0.16	0.3	0.31	0.31	0.27	0.31	0.22	0.14	0.18	0.16	0.2	0.19	0.33	0.31	0.17	0.91	0.82	0.62	1.0	0.56	0.53
Cpa\|evm.model.tig00001486.9 (tig00001486_g8926.t1)	0.64	0.52	0.45	0.61	0.58	0.51	0.58	0.59	0.64	0.63	0.68	0.55	0.53	0.76	0.67	0.71	0.68	0.59	0.81	0.57	0.98	0.64	0.75	1.0	0.61	0.82
Cpa\|evm.model.tig00001490.4 (tig00001490_g8967.t1)	0.24	0.18	0.17	0.32	0.3	0.35	0.44	0.45	0.47	0.31	0.26	0.24	0.2	0.47	0.32	0.74	0.22	0.52	0.51	0.16	1.0	0.8	0.5	0.35	0.58	0.39
Cpa\|evm.model.tig00001490.8 (tig00001490_g8967.t1)	0.14	0.13	0.07	0.17	0.25	0.23	0.32	0.29	0.24	0.22	0.2	0.13	0.18	0.37	0.28	0.59	0.13	0.41	0.37	0.11	1.0	0.52	0.54	0.43	0.7	0.44
Cpa\|evm.model.tig00001527.1 (tig00001527_g9251.t2)	0.04	0.19	0.37	0.4	0.34	0.27	0.23	0.26	0.15	0.16	0.19	0.19	0.06	0.25	0.18	0.26	0.12	0.14	0.19	0.2	1.0	0.18	0.28	0.44	0.37	0.84
Cpa\|evm.model.tig00001527.6 (tig00001527_g9256.t1)	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.03	0.03	0.01	0.02	0.06	0.01	0.2	0.15	0.04	0.03	0.94	0.52	0.4	1.0	0.61	0.58
Cpa\|evm.model.tig00020610.45 (tig00020610_g11984.t1)	0.24	0.21	0.18	0.22	0.23	0.28	0.22	0.22	0.23	0.22	0.25	0.29	0.24	0.19	0.19	0.44	0.17	0.25	0.25	0.15	1.0	0.59	0.72	0.57	0.5	0.59
Cpa\|evm.model.tig00020610.46 (tig00020610_g11985.t1)	0.41	0.34	0.34	0.38	0.41	0.42	0.39	0.4	0.42	0.42	0.43	0.44	0.38	0.56	0.53	1.0	0.44	0.36	0.41	0.38	0.81	0.78	0.66	0.57	0.63	0.61
Cpa\|evm.model.tig00020629.128 (tig00020629_g12457.t1)	0.43	0.29	0.3	0.38	0.27	0.15	0.16	0.2	0.14	0.2	0.25	0.27	0.65	0.06	0.39	0.07	0.34	0.14	0.07	0.11	1.0	0.53	0.82	0.47	0.19	0.31
Cpa\|evm.model.tig00020675.41 (tig00020675_g12625.t1)	0.44	0.3	0.27	0.28	0.18	0.13	0.23	0.29	0.17	0.19	0.22	0.24	0.44	0.26	0.38	0.38	0.26	0.5	0.29	0.23	0.81	1.0	0.63	0.41	0.87	0.67
Cpa\|evm.model.tig00020710.57 (tig00020710_g13307.t1)	0.24	0.25	0.38	0.34	0.16	0.08	0.16	0.22	0.16	0.21	0.25	0.29	0.33	0.73	0.63	0.72	0.24	0.33	0.22	0.18	1.0	0.36	0.51	0.48	0.49	0.49
Cpa\|evm.model.tig00020830.75 (tig00020830_g14458.t1)	0.2	0.19	0.17	0.2	0.19	0.21	0.18	0.17	0.19	0.2	0.2	0.18	0.15	0.3	0.25	0.24	0.24	0.34	0.32	0.2	1.0	0.55	0.78	0.62	0.52	0.54
Cpa\|evm.model.tig00020848.51 (tig00020848_g14582.t1)	0.23	0.15	0.12	0.16	0.13	0.15	0.19	0.28	0.21	0.21	0.21	0.17	0.29	0.27	0.28	0.27	0.11	0.33	0.19	0.16	1.0	0.47	0.61	0.48	0.78	0.55
Cpa\|evm.model.tig00020892.13 (tig00020892_g14915.t1)	0.18	0.12	0.07	0.07	0.11	0.05	0.06	0.16	0.1	0.16	0.22	0.16	0.17	0.18	0.12	0.05	0.04	0.08	0.05	0.03	1.0	0.46	0.31	0.83	0.42	0.43
Cpa\|evm.model.tig00020904.21 (tig00020904_g15154.t1)	0.33	0.37	0.25	0.41	0.29	0.17	0.24	0.3	0.31	0.36	0.45	0.39	0.28	0.15	0.19	0.21	0.15	0.39	0.3	0.13	1.0	0.6	0.72	0.6	0.69	0.46
Cpa\|evm.model.tig00020961.94 (tig00020961_g16712.t1)	0.29	0.29	0.25	0.33	0.32	0.23	0.26	0.31	0.4	0.34	0.33	0.33	0.27	0.38	0.45	0.38	0.24	0.69	0.41	0.2	0.48	1.0	0.41	0.34	0.5	0.36
Cpa\|evm.model.tig00021108.24 (tig00021108_g18313.t1)	0.53	0.41	0.38	0.38	0.32	0.21	0.26	0.26	0.26	0.28	0.32	0.35	0.51	0.61	0.48	0.63	0.4	0.46	0.45	0.29	0.75	1.0	0.58	0.55	0.64	0.55
Cpa\|evm.model.tig00021127.77 (tig00021127_g18754.t1)	0.5	0.61	0.57	0.52	0.42	0.35	0.37	0.44	0.41	0.41	0.45	0.53	0.5	0.23	0.21	0.23	0.31	0.36	0.31	0.36	1.0	0.45	0.94	0.8	0.77	0.44
Cpa\|evm.model.tig00021281.26 (tig00021281_g19923.t1)	0.61	0.42	0.38	0.48	0.46	0.33	0.35	0.44	0.35	0.37	0.41	0.38	0.54	0.36	0.45	0.47	0.3	0.56	0.51	0.26	1.0	0.81	0.68	0.72	0.57	0.47
Cpa\|evm.model.tig00021319.58 (tig00021319_g20251.t1)	0.53	0.49	0.39	0.32	0.23	0.2	0.22	0.25	0.22	0.21	0.27	0.34	0.46	0.21	0.19	0.37	0.28	0.34	0.25	0.28	1.0	0.63	0.96	0.89	0.84	0.41
Cpa\|evm.model.tig00021326.30 (tig00021326_g20296.t2)	0.32	0.23	0.17	0.29	0.24	0.17	0.19	0.24	0.25	0.21	0.35	0.34	0.3	0.37	0.21	0.2	0.16	0.19	0.19	0.1	0.96	0.65	1.0	0.65	0.65	0.61
Cpa\|evm.model.tig00021365.7 (tig00021365_g20821.t1)	0.2	0.04	0.04	0.06	0.1	0.12	0.24	0.17	0.12	0.13	0.21	0.23	0.17	0.36	0.42	0.53	0.39	0.25	0.38	0.47	0.85	0.21	0.83	1.0	0.44	0.53
Cpa\|evm.model.tig00021365.8 (tig00021365_g20821.t1)	0.29	0.14	0.07	0.13	0.17	0.22	0.28	0.25	0.2	0.3	0.27	0.4	0.25	0.33	0.22	0.43	0.28	0.24	0.35	0.34	1.0	0.17	0.99	0.78	0.39	0.57
Cpa\|evm.model.tig00021501.27 (tig00021518_g22032.t1)	0.08	0.1	0.06	0.1	0.12	0.05	0.09	0.08	0.11	0.18	0.15	0.13	0.1	0.23	0.1	0.09	0.08	0.24	0.23	0.08	1.0	0.51	0.39	0.76	0.76	0.66
Cpa\|evm.model.tig00021535.8 (tig00021535_g22215.t1)	0.22	0.08	0.03	0.1	0.07	0.01	0.01	0.06	0.03	0.04	0.06	0.05	0.09	0.04	0.0	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.79	0.2	1.0	0.46	0.38	0.3
Cpa\|evm.model.tig00021537.18 (tig00021537_g22274.t1)	0.21	0.19	0.23	0.25	0.34	0.35	0.37	0.37	0.23	0.19	0.18	0.18	0.2	0.4	0.41	0.48	0.32	0.42	0.4	0.28	0.4	1.0	0.27	0.18	0.37	0.27
Cpa\|evm.model.tig00021537.71 (tig00021537_g22322.t1)	0.24	0.19	0.2	0.23	0.13	0.09	0.13	0.19	0.13	0.17	0.23	0.22	0.27	0.23	0.18	0.19	0.13	0.18	0.16	0.08	0.98	0.72	0.57	0.43	1.0	0.88
Cpa\|evm.model.tig00021719.3 (tig00021719_g23148.t1)	0.31	0.26	0.24	0.36	0.31	0.24	0.28	0.25	0.22	0.27	0.35	0.3	0.26	0.11	0.11	0.12	0.19	0.21	0.17	0.18	0.93	0.87	0.8	1.0	0.55	0.29

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)