Heatmap: Cluster_123 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000042.102 (tig00000042_g15497.t1)	0.22	0.44	0.34	0.37	0.58	0.61	0.66	0.66	1.0	0.56	0.48	0.42	0.12	0.11	0.19	0.14	0.19	0.53	0.44	0.33	0.03	0.11	0.45	0.51	0.46	0.36
Cpa\|evm.model.tig00000073.4 (tig00000073_g1684.t1)	0.44	0.51	0.29	0.47	0.52	0.46	0.58	0.71	0.85	0.65	0.88	0.55	0.16	0.2	0.22	0.13	0.16	0.47	0.4	0.22	0.08	0.23	1.0	0.35	0.49	0.31
Cpa\|evm.model.tig00000093.117 (tig00000093_g3548.t1)	0.1	0.58	0.58	0.73	0.89	0.88	1.0	0.89	1.0	0.91	0.81	0.58	0.05	0.28	0.37	0.25	0.42	0.66	0.61	0.43	0.03	0.31	0.79	0.6	0.86	0.59
Cpa\|evm.model.tig00000113.25 (tig00000113_g5593.t1)	0.07	0.04	0.15	0.34	0.35	0.52	1.0	0.96	0.91	0.5	0.28	0.22	0.05	0.35	0.2	0.49	0.38	0.42	0.3	0.41	0.07	0.19	0.41	0.34	0.36	0.26
Cpa\|evm.model.tig00000114.34 (tig00000114_g6042.t1)	0.1	0.36	0.34	0.6	0.85	0.86	0.71	0.84	0.94	0.79	1.0	0.61	0.03	0.4	0.45	0.77	0.55	0.63	0.69	0.63	0.02	0.29	0.85	0.65	0.51	0.52
Cpa\|evm.model.tig00000133.38 (tig00000133_g7699.t1)	0.13	0.27	0.28	0.46	0.68	1.0	0.66	0.66	0.65	0.67	0.61	0.55	0.17	0.27	0.27	0.29	0.4	0.54	0.58	0.59	0.15	0.18	0.86	0.7	0.43	0.49
Cpa\|evm.model.tig00000158.67 (tig00000158_g10173.t1)	0.24	0.49	0.64	0.73	0.8	0.69	0.51	0.6	0.68	0.49	0.6	0.58	0.2	0.31	0.26	0.35	0.31	0.32	0.31	0.4	0.2	0.21	1.0	0.62	0.49	0.45
Cpa\|evm.model.tig00000237.48 (tig00000237_g20497.t1)	0.29	0.5	0.46	0.55	0.75	0.98	1.0	0.86	0.8	0.57	0.57	0.42	0.22	0.32	0.5	0.51	0.45	0.54	0.6	0.47	0.07	0.35	0.54	0.46	0.49	0.26
Cpa\|evm.model.tig00000383.85 (tig00000383_g24696.t1)	0.04	0.16	0.26	0.48	0.79	0.99	0.96	0.79	1.0	0.61	0.6	0.49	0.03	0.28	0.3	0.25	0.33	0.51	0.48	0.33	0.02	0.42	0.72	0.24	0.46	0.22
Cpa\|evm.model.tig00000473.11 (tig00000473_g1210.t1)	0.59	0.51	0.59	0.9	0.91	0.75	0.74	0.71	0.85	0.86	0.8	0.88	0.49	0.35	0.26	0.32	0.34	0.64	0.57	0.4	0.08	0.45	1.0	0.35	0.44	0.28
Cpa\|evm.model.tig00000480.67 (tig00000480_g1335.t1)	0.08	0.11	0.21	0.24	0.41	0.95	1.0	0.67	0.6	0.31	0.23	0.25	0.07	0.14	0.19	0.23	0.24	0.29	0.32	0.26	0.05	0.02	0.34	0.1	0.23	0.11
Cpa\|evm.model.tig00000605.9 (tig00000605_g2474.t1)	0.58	0.58	0.65	0.77	0.86	0.9	0.92	0.93	1.0	0.75	0.79	0.72	0.56	0.3	0.34	0.36	0.44	0.53	0.43	0.48	0.2	0.58	0.91	0.54	0.47	0.36
Cpa\|evm.model.tig00000615.47 (tig00000615_g2576.t1)	0.06	0.26	0.39	0.47	0.63	1.0	0.85	0.77	0.66	0.44	0.4	0.36	0.09	0.35	0.38	0.54	0.43	0.43	0.51	0.51	0.04	0.31	0.56	0.32	0.39	0.31
Cpa\|evm.model.tig00000692.8 (tig00000692_g3201.t1)	0.46	0.72	0.79	0.98	0.81	0.73	0.8	0.94	0.87	0.87	0.87	0.76	0.48	0.41	0.36	0.47	0.43	0.59	0.47	0.45	0.26	0.48	0.98	0.54	1.0	0.49
Cpa\|evm.model.tig00000737.28 (tig00000737_g3808.t1)	0.04	0.19	0.37	0.56	0.84	0.95	0.98	0.82	0.99	0.79	0.74	0.47	0.04	0.26	0.47	0.57	0.42	0.45	0.43	0.41	0.08	0.25	1.0	0.41	0.32	0.27
Cpa\|evm.model.tig00000741.1 (tig00000741_g3822.t1)	0.33	0.55	0.66	0.77	0.85	1.0	0.99	0.89	0.9	0.79	0.79	0.76	0.38	0.46	0.43	0.47	0.45	0.56	0.54	0.46	0.07	0.39	0.66	0.45	0.48	0.45
Cpa\|evm.model.tig00000741.2 (tig00000741_g3822.t1)	0.26	0.4	0.41	0.57	0.79	1.0	0.78	0.81	0.79	0.56	0.58	0.48	0.32	0.34	0.38	0.32	0.31	0.46	0.48	0.36	0.05	0.43	0.65	0.28	0.54	0.57
Cpa\|evm.model.tig00000741.30 (tig00000741_g3847.t1)	0.3	0.34	0.59	0.59	0.67	0.63	0.88	1.0	0.8	0.79	0.85	0.62	0.48	0.53	0.49	0.38	0.62	0.65	0.73	0.58	0.11	0.35	0.95	0.35	0.7	0.49
Cpa\|evm.model.tig00000754.17 (tig00000754_g3900.t1)	0.15	0.17	0.2	0.34	0.6	0.81	1.0	0.93	0.9	0.8	0.71	0.49	0.12	0.31	0.3	0.29	0.41	0.5	0.55	0.5	0.03	0.35	0.77	0.48	0.48	0.39
Cpa\|evm.model.tig00000828.32 (tig00000828_g4636.t1)	0.19	0.68	0.61	1.0	1.0	0.76	0.71	0.83	0.76	0.66	0.66	0.54	0.06	0.19	0.32	0.23	0.42	0.47	0.45	0.59	0.02	0.19	0.75	0.56	0.86	0.51
Cpa\|evm.model.tig00000903.3 (tig00000903_g5500.t1)	0.31	0.49	0.43	0.65	0.66	0.48	0.37	0.35	0.36	0.3	0.38	0.36	0.2	0.1	0.09	0.13	0.12	0.14	0.21	0.12	0.03	0.15	1.0	0.18	0.28	0.14
Cpa\|evm.model.tig00000989.1 (tig00000989_g6078.t1)	0.1	0.34	0.39	0.52	0.86	0.65	0.69	0.79	1.0	0.73	0.72	0.59	0.05	0.35	0.47	0.37	0.45	0.53	0.73	0.52	0.02	0.19	0.57	0.48	0.86	0.44
Cpa\|evm.model.tig00001021.10 (tig00001021_g6308.t1)	0.04	0.08	0.19	0.34	0.64	0.91	1.0	0.68	0.73	0.56	0.42	0.29	0.05	0.15	0.22	0.2	0.29	0.39	0.36	0.47	0.03	0.22	0.71	0.33	0.42	0.28
Cpa\|evm.model.tig00001406.3 (tig00001406_g8593.t1)	0.31	0.55	0.51	0.73	0.9	1.0	0.83	0.79	0.86	0.72	0.72	0.67	0.14	0.4	0.43	0.47	0.34	0.56	0.45	0.39	0.09	0.34	0.7	0.41	0.5	0.45
Cpa\|evm.model.tig00001537.4 (tig00001537_g9298.t1)	0.03	0.11	0.26	0.37	0.55	0.72	1.0	0.82	0.84	0.45	0.32	0.2	0.04	0.25	0.27	0.42	0.31	0.45	0.43	0.39	0.07	0.27	0.65	0.14	0.39	0.23
Cpa\|evm.model.tig00001574.7 (tig00001574_g9354.t1)	0.29	0.61	0.72	0.8	0.87	1.0	0.76	0.7	0.78	0.64	0.64	0.66	0.27	0.46	0.43	0.43	0.41	0.48	0.68	0.48	0.01	0.39	0.92	0.39	0.52	0.43
Cpa\|evm.model.tig00001636.7 (tig00001636_g9530.t1)	0.51	0.43	0.45	0.57	0.83	1.0	0.84	0.7	0.64	0.61	0.57	0.64	0.54	0.31	0.36	0.31	0.39	0.43	0.26	0.45	0.23	0.9	0.89	0.63	0.83	0.89
Cpa\|evm.model.tig00020554.88 (tig00020554_g10867.t1)	0.45	0.58	0.47	0.59	0.63	0.6	0.64	0.7	0.62	0.63	0.94	0.81	0.47	0.23	0.41	0.37	0.3	0.47	0.47	0.34	0.03	0.75	1.0	0.51	0.69	0.43
Cpa\|evm.model.tig00020563.166 (tig00020563_g11368.t1)	0.54	0.58	0.46	0.71	0.79	0.65	0.66	0.77	0.96	0.9	0.94	0.76	0.49	0.21	0.3	0.24	0.22	0.58	0.54	0.41	0.03	0.25	1.0	0.39	0.55	0.3
Cpa\|evm.model.tig00020592.8 (tig00020592_g11638.t1)	0.23	0.36	0.41	0.56	0.77	0.88	0.96	0.78	0.78	0.74	0.79	0.67	0.27	0.17	0.29	0.25	0.35	0.48	0.43	0.44	0.06	0.35	1.0	0.5	0.31	0.27
Cpa\|evm.model.tig00020610.82 (tig00020610_g12029.t1)	0.06	0.31	0.41	0.71	0.94	1.0	0.94	0.85	0.53	0.59	0.51	0.41	0.05	0.14	0.25	0.12	0.54	0.85	0.69	0.67	0.06	0.24	0.82	0.4	0.83	0.73
Cpa\|evm.model.tig00020610.93 (tig00020610_g12039.t1)	0.18	0.26	0.15	0.52	0.7	0.69	1.0	0.94	0.25	0.24	0.17	0.06	0.02	0.18	0.22	0.31	0.25	0.64	0.57	0.3	0.04	0.11	0.61	0.13	0.66	0.38
Cpa\|evm.model.tig00020704.20 (tig00020704_g13162.t1)	0.3	0.54	0.62	0.68	0.63	0.67	0.62	0.7	0.62	0.42	0.45	0.37	0.2	0.2	0.17	0.31	0.36	0.43	0.37	0.48	0.05	0.33	1.0	0.25	0.6	0.46
Cpa\|evm.model.tig00020704.39 (tig00020704_g13181.t1)	0.42	0.37	0.48	0.66	0.84	0.94	0.8	0.79	0.8	0.8	0.84	0.73	0.42	0.44	0.38	0.38	0.37	0.39	0.35	0.37	0.09	0.89	1.0	0.63	0.9	0.66
Cpa\|evm.model.tig00020734.19 (tig00020734_g13575.t1)	0.05	0.29	0.39	0.55	0.73	0.92	1.0	0.95	0.73	0.57	0.53	0.54	0.03	0.28	0.38	0.33	0.47	0.59	0.56	0.52	0.03	0.1	0.81	0.4	0.87	0.32
Cpa\|evm.model.tig00020830.71 (tig00020830_g14455.t1)	0.29	0.6	0.67	0.69	0.7	0.7	0.61	0.68	0.53	0.53	0.53	0.51	0.2	0.28	0.38	0.35	0.37	0.46	0.44	0.43	0.19	0.4	1.0	0.37	0.41	0.34
Cpa\|evm.model.tig00020892.9 (tig00020892_g14911.t1)	0.52	0.94	0.89	0.97	0.89	0.75	0.92	1.0	0.83	0.89	0.78	0.73	0.5	0.24	0.3	0.23	0.37	0.62	0.62	0.59	0.1	0.34	1.0	0.3	0.68	0.4
Cpa\|evm.model.tig00020934.51 (tig00020934_g16119.t1)	0.06	0.07	0.21	0.37	0.64	0.72	0.61	0.43	0.49	0.49	0.47	0.35	0.07	0.46	0.29	0.36	0.23	0.5	0.39	0.54	0.01	0.07	1.0	0.35	0.21	0.27
Cpa\|evm.model.tig00020943.50 (tig00020943_g16293.t1)	0.05	0.3	0.79	0.95	0.91	0.93	0.95	0.89	0.96	1.0	0.99	0.78	0.14	0.18	0.37	0.24	0.29	0.43	0.47	0.52	0.05	0.71	0.81	0.33	0.49	0.52
Cpa\|evm.model.tig00020960.61 (tig00020960_g16587.t1)	0.48	0.66	0.63	0.69	0.88	0.81	0.92	0.92	1.0	0.78	0.63	0.53	0.36	0.28	0.37	0.34	0.44	0.6	0.47	0.51	0.06	0.3	0.72	0.34	0.56	0.6
Cpa\|evm.model.tig00020961.29 (tig00020961_g16649.t1)	0.18	0.65	0.57	0.84	0.91	0.86	0.89	0.91	0.85	0.97	0.83	0.6	0.18	0.18	0.3	0.18	0.32	0.45	0.51	0.44	0.03	0.26	1.0	0.52	0.45	0.33
Cpa\|evm.model.tig00020965.23 (tig00020965_g16839.t1)	0.11	0.4	0.57	0.76	1.0	0.97	0.89	0.75	0.67	0.6	0.62	0.56	0.14	0.17	0.26	0.22	0.32	0.62	0.46	0.5	0.03	0.23	0.96	0.4	0.65	0.53
Cpa\|evm.model.tig00021017.21 (tig00021017_g17196.t1)	0.35	0.37	0.31	0.51	0.61	0.63	0.55	0.57	0.67	0.53	0.54	0.52	0.31	0.49	0.36	0.35	0.34	0.39	0.4	0.31	0.05	1.0	0.65	0.5	0.69	0.64
Cpa\|evm.model.tig00021038.47 (tig00021038_g17537.t1)	0.31	0.52	0.65	0.74	0.86	0.96	1.0	0.82	0.9	0.62	0.61	0.66	0.41	0.48	0.61	0.48	0.7	0.6	0.55	0.58	0.13	0.21	0.92	0.45	0.6	0.43
Cpa\|evm.model.tig00021073.15 (tig00021073_g18018.t1)	0.22	0.42	0.57	0.74	1.0	0.93	0.95	0.8	0.59	0.66	0.66	0.51	0.25	0.16	0.23	0.14	0.36	0.42	0.43	0.48	0.04	0.64	0.99	0.49	0.62	0.55
Cpa\|evm.model.tig00021073.17 (tig00021073_g18020.t1)	0.48	0.64	0.62	0.78	0.88	0.91	0.76	0.76	0.64	0.67	0.68	0.62	0.53	0.26	0.3	0.24	0.54	0.51	0.59	0.5	0.06	0.57	1.0	0.7	0.93	0.58
Cpa\|evm.model.tig00021168.49 (tig00021168_g19118.t1)	0.56	0.68	0.61	0.81	0.85	0.96	0.81	0.95	1.0	0.89	0.71	0.7	0.59	0.48	0.46	0.38	0.42	0.77	0.64	0.47	0.04	0.54	0.88	0.44	0.9	0.8
Cpa\|evm.model.tig00021221.8 (tig00021221_g19349.t1)	0.23	0.27	0.22	0.4	0.81	0.9	1.0	0.68	0.62	0.59	0.49	0.37	0.14	0.26	0.07	0.14	0.25	0.47	0.41	0.47	0.06	0.33	0.85	0.53	0.7	0.7
Cpa\|evm.model.tig00021348.34 (tig00021348_g20537.t1)	0.11	0.14	0.2	0.31	0.43	0.67	1.0	0.81	0.8	0.38	0.33	0.21	0.11	0.12	0.32	0.41	0.38	0.44	0.44	0.4	0.11	0.19	0.87	0.35	0.47	0.23
Cpa\|evm.model.tig00021493.14 (tig00021493_g21857.t1)	0.07	0.17	0.33	0.53	0.77	1.0	0.96	0.79	0.68	0.44	0.35	0.22	0.08	0.09	0.18	0.28	0.33	0.46	0.49	0.31	0.02	0.23	0.49	0.45	0.44	0.22
Cpa\|evm.model.tig00021521.26 (tig00021521_g22092.t1)	0.34	0.67	0.74	0.76	0.67	0.7	0.7	0.78	0.93	0.86	0.88	0.86	0.49	0.28	0.3	0.31	0.4	0.51	0.57	0.42	0.12	0.65	1.0	0.53	0.43	0.41

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)