Heatmap: Cluster_268 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000030.1_cds_GFH06271.1_748 (GFH06271)	0.84	0.31	0.37	0.16	0.23	0.2	0.14	0.16	0.23	0.25	0.31	0.23	0.21	0.15	0.13	0.94	1.0	0.51	0.31	0.26	0.5	0.55	0.65	0.22	0.31	0.2
lcl\|BLLF01000053.1_cds_GFH06739.1_1216 (GFH06739)	0.31	0.05	0.0	0.01	0.18	0.18	0.21	0.19	0.22	1.0	0.13	0.15	0.2	0.13	0.2	0.32	0.35	0.35	0.57	0.2	0.38	0.37	0.32	0.26	0.33	0.25
lcl\|BLLF01000075.1_cds_GFH07124.1_1601 (GFH07124)	0.62	0.15	0.0	0.0	0.03	0.02	0.05	0.06	0.04	1.0	0.06	0.03	0.04	0.06	0.06	0.51	0.3	0.2	0.51	0.17	0.22	0.06	0.2	0.14	0.04	0.04
lcl\|BLLF01000103.1_cds_GFH07566.1_2043 (GFH07566)	1.0	0.21	0.26	0.02	0.26	0.29	0.25	0.4	0.33	0.64	0.3	0.25	0.28	0.31	0.37	0.47	0.59	0.45	0.71	0.6	0.4	0.23	0.43	0.28	0.53	0.8
lcl\|BLLF01000163.1_cds_GFH08467.1_2944 (GFH08467)	0.63	0.11	0.0	0.01	0.32	0.39	0.41	0.26	0.32	1.0	0.3	0.27	0.25	0.24	0.19	0.69	0.43	0.69	0.3	0.39	0.76	0.75	0.59	0.11	0.34	0.22
lcl\|BLLF01000171.1_cds_GFH08595.1_3072 (GFH08595)	0.3	0.0	0.15	0.12	0.14	0.11	0.15	0.21	0.25	1.0	0.18	0.15	0.19	0.15	0.17	0.4	0.26	0.34	0.34	0.43	0.46	0.19	0.33	0.32	0.05	0.09
lcl\|BLLF01000179.1_cds_GFH08709.1_3186 (GFH08709)	0.87	0.49	0.36	0.18	0.64	0.49	0.29	0.52	0.3	0.43	0.61	0.49	0.4	0.52	0.26	0.64	1.0	0.89	0.33	0.39	0.82	0.5	0.71	0.38	0.34	0.34
lcl\|BLLF01000200.1_cds_GFH08990.1_3467 (GFH08990)	1.0	0.24	0.19	0.12	0.41	0.27	0.24	0.33	0.28	0.65	0.38	0.26	0.35	0.29	0.29	0.55	0.71	0.76	0.6	0.51	0.68	0.33	0.61	0.15	0.27	0.22
lcl\|BLLF01000247.1_cds_GFH09603.1_4080 (GFH09603)	1.0	0.29	0.4	0.27	0.54	0.43	0.27	0.31	0.33	0.25	0.46	0.34	0.38	0.31	0.3	0.8	0.96	0.7	0.31	0.28	0.59	0.37	0.53	0.22	0.17	0.18
lcl\|BLLF01000255.1_cds_GFH09696.1_4173 (GFH09696)	0.95	0.26	0.26	0.36	0.46	0.34	0.3	0.24	0.27	0.5	0.42	0.26	0.22	0.23	0.26	0.54	0.54	0.86	0.28	0.42	1.0	0.44	0.68	0.14	0.22	0.22
lcl\|BLLF01000470.1_cds_GFH12124.1_6601 (GFH12124)	1.0	0.11	0.21	0.13	0.41	0.15	0.09	0.13	0.07	0.15	0.32	0.13	0.1	0.09	0.07	0.25	0.93	0.79	0.2	0.4	0.61	0.45	0.4	0.13	0.06	0.08
lcl\|BLLF01000596.1_cds_GFH13302.1_7779 (GFH13302)	0.87	0.71	0.0	0.52	0.01	0.09	0.0	0.04	0.02	0.35	0.04	0.01	0.08	0.12	0.0	1.0	0.96	0.83	0.91	0.29	0.93	0.37	0.46	0.04	0.2	0.12
lcl\|BLLF01000703.1_cds_GFH14233.1_8710 (GFH14233)	0.55	0.26	0.3	0.11	0.36	0.26	0.15	0.29	0.15	0.17	0.33	0.24	0.21	0.27	0.13	0.62	1.0	0.54	0.39	0.3	0.51	0.39	0.51	0.21	0.12	0.14
lcl\|BLLF01000735.1_cds_GFH14512.1_8989 (GFH14512)	1.0	0.09	0.11	0.07	0.27	0.28	0.32	0.28	0.36	0.52	0.3	0.31	0.32	0.25	0.36	0.78	0.67	0.66	0.35	0.41	0.42	0.35	0.53	0.22	0.39	0.65
lcl\|BLLF01000753.1_cds_GFH14671.1_9148 (GFH14671)	1.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	0.03	0.02	0.05	0.85	0.02	0.02	0.03	0.02	0.05	0.39	0.25	0.01	0.48	0.47	0.02	0.17	0.03	0.14	0.03	0.03
lcl\|BLLF01000878.1_cds_GFH15639.1_10116 (GFH15639)	0.84	0.56	0.21	0.36	0.51	0.57	0.49	0.35	0.47	0.77	0.53	0.51	0.58	0.37	0.51	0.94	1.0	0.59	0.75	0.89	0.75	0.68	0.6	0.13	0.46	0.64
lcl\|BLLF01001003.1_cds_GFH16474.1_10951 (GFH16474)	0.97	0.0	0.0	0.04	0.15	0.24	0.1	0.12	0.19	1.0	0.21	0.23	0.22	0.15	0.1	0.17	0.21	0.05	0.32	0.22	0.12	0.0	0.05	0.0	0.1	0.14
lcl\|BLLF01001266.1_cds_GFH18221.1_12698 (GFH18221)	0.23	0.0	0.0	0.0	0.04	0.03	0.14	0.03	0.14	0.43	0.01	0.13	0.1	0.0	0.08	1.0	0.78	0.32	0.95	0.35	0.26	0.0	0.0	0.04	0.0	0.08
lcl\|BLLF01001535.1_cds_GFH19879.1_14356 (GFH19879)	1.0	0.02	0.0	0.44	0.21	0.13	0.07	0.09	0.09	0.13	0.17	0.05	0.12	0.08	0.03	0.58	0.84	0.28	0.52	0.35	0.39	0.13	0.29	0.11	0.03	0.11
lcl\|BLLF01001678.1_cds_GFH20675.1_15152 (GFH20675)	0.77	0.01	0.0	0.02	0.08	0.1	0.06	0.07	0.06	0.43	0.07	0.08	0.06	0.05	0.06	0.35	1.0	0.34	0.66	0.75	0.36	0.21	0.23	0.06	0.17	0.26
lcl\|BLLF01001785.1_cds_GFH21233.1_15710 (GFH21233)	0.58	0.35	0.43	0.22	0.44	0.45	0.37	0.25	0.31	0.4	0.34	0.35	0.31	0.26	0.32	0.83	1.0	0.62	0.47	0.44	0.75	0.51	0.57	0.34	0.27	0.19
lcl\|BLLF01001893.1_cds_GFH21727.1_16204 (GFH21727)	0.97	0.0	0.0	0.0	0.03	0.03	0.0	0.12	0.05	1.0	0.08	0.03	0.05	0.0	0.0	0.71	0.72	0.37	0.83	0.0	0.76	0.58	0.73	0.09	0.09	0.04
lcl\|BLLF01001930.1_cds_GFH21915.1_16392 (GFH21915)	0.93	0.13	0.09	0.19	0.36	0.3	0.18	0.37	0.28	1.0	0.33	0.28	0.28	0.27	0.25	0.61	0.9	0.56	0.43	0.57	0.62	0.26	0.58	0.15	0.24	0.33
lcl\|BLLF01001942.1_cds_GFH21975.1_16452 (GFH21975)	0.77	0.0	0.0	0.41	0.08	0.04	0.06	0.16	0.17	1.0	0.1	0.12	0.19	0.23	0.15	0.35	0.79	0.41	0.62	0.82	0.76	0.0	0.14	0.21	0.13	0.19
lcl\|BLLF01002121.1_cds_GFH22778.1_17255 (GFH22778)	0.8	0.24	0.08	0.12	0.36	0.35	0.39	0.35	0.46	0.99	0.33	0.3	0.35	0.31	0.36	0.72	0.62	0.76	0.42	0.53	1.0	0.94	0.74	0.35	0.23	0.33
lcl\|BLLF01002121.1_cds_GFH22779.1_17256 (GFH22779)	0.7	0.18	0.38	0.12	0.26	0.28	0.32	0.33	0.35	1.0	0.24	0.26	0.3	0.29	0.24	0.73	0.5	0.84	0.31	0.43	0.95	0.77	0.67	0.18	0.16	0.33
lcl\|BLLF01002195.1_cds_GFH23112.1_17589 (GFH23112)	0.48	0.05	0.0	0.07	0.25	0.09	0.11	0.04	0.08	0.59	0.13	0.12	0.06	0.05	0.06	0.33	1.0	0.22	0.0	0.7	0.24	0.07	0.13	0.04	0.06	0.12
lcl\|BLLF01002245.1_cds_GFH23316.1_17793 (GFH23316)	0.37	0.19	0.24	0.14	0.42	0.27	0.2	0.24	0.17	0.15	0.35	0.25	0.2	0.24	0.16	0.53	1.0	0.46	0.45	0.38	0.42	0.38	0.36	0.23	0.2	0.2
lcl\|BLLF01002358.1_cds_GFH23769.1_18246 (GFH23769)	1.0	0.5	0.33	0.58	0.31	0.34	0.24	0.16	0.2	0.49	0.34	0.26	0.28	0.29	0.16	0.53	0.6	0.86	0.66	0.44	0.78	0.25	0.73	0.1	0.22	0.38
lcl\|BLLF01002397.1_cds_GFH23924.1_18401 (GFH23924)	0.84	0.16	0.0	0.62	0.33	0.14	0.08	0.02	0.14	0.8	0.17	0.29	0.27	0.2	0.1	0.19	0.84	0.44	0.0	1.0	0.81	0.23	0.15	0.2	0.07	0.34
lcl\|BLLF01002555.1_cds_GFH24517.1_18994 (GFH24517)	0.45	0.31	0.0	0.0	0.09	0.15	0.18	0.15	0.21	0.37	0.1	0.14	0.23	0.2	0.16	0.42	0.35	0.5	0.06	0.2	1.0	0.99	0.52	0.1	0.09	0.05
lcl\|BLLF01002621.1_cds_GFH24741.1_19218 (GFH24741)	1.0	0.03	0.0	0.57	0.31	0.12	0.35	0.16	0.37	0.88	0.21	0.1	0.19	0.21	0.25	0.48	0.31	0.32	0.08	0.14	0.22	0.26	0.11	0.07	0.15	0.22
lcl\|BLLF01002682.1_cds_GFH24973.1_19450 (GFH24973)	0.35	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01003046.1_cds_GFH26177.1_20654 (GFH26177)	0.68	0.43	0.16	0.57	0.2	0.27	0.36	0.11	0.32	0.38	0.2	0.25	0.29	0.24	0.25	0.3	0.57	0.89	1.0	0.45	0.7	0.4	0.62	0.21	0.37	0.31
lcl\|BLLF01003075.1_cds_GFH26263.1_20740 (GFH26263)	1.0	0.25	0.27	0.05	0.11	0.09	0.11	0.06	0.09	0.38	0.08	0.04	0.06	0.06	0.05	0.62	1.0	0.63	0.47	0.36	0.95	0.08	0.52	0.11	0.04	0.04
lcl\|BLLF01003128.1_cds_GFH26440.1_20917 (GFH26440)	0.76	0.0	0.0	0.0	0.24	0.06	0.22	0.12	0.23	0.6	0.17	0.09	0.12	0.12	0.18	0.17	0.38	0.27	1.0	0.34	0.55	0.0	0.13	0.07	0.43	0.34
lcl\|BLLF01003372.1_cds_GFH27162.1_21639 (GFH27162)	0.96	0.34	0.59	0.13	0.61	0.55	0.45	0.47	0.46	0.35	0.52	0.43	0.38	0.35	0.37	1.0	0.93	0.8	0.54	0.7	0.84	0.46	0.9	0.25	0.34	0.38
lcl\|BLLF01003617.1_cds_GFH27783.1_22260 (GFH27783)	0.84	0.25	0.34	0.1	0.32	0.32	0.28	0.17	0.27	0.38	0.36	0.27	0.33	0.25	0.21	0.96	1.0	0.78	0.24	0.22	0.87	0.4	0.71	0.15	0.06	0.05
lcl\|BLLF01003645.1_cds_GFH27848.1_22325 (GFH27848)	0.93	0.64	0.36	0.22	0.48	0.3	0.16	0.3	0.21	0.19	0.41	0.18	0.26	0.25	0.14	0.32	0.45	0.86	0.37	0.23	1.0	0.32	0.75	0.1	0.15	0.2
lcl\|BLLF01003674.1_cds_GFH27928.1_22405 (GFH27928)	0.57	0.0	0.0	0.13	0.14	0.06	0.21	0.24	0.25	1.0	0.13	0.05	0.22	0.1	0.2	0.41	0.56	0.21	0.41	0.33	0.3	0.11	0.16	0.18	0.02	0.0
lcl\|BLLF01004068.1_cds_GFH28853.1_23330 (GFH28853)	0.37	0.01	0.0	0.47	0.21	0.17	0.22	0.27	0.38	1.0	0.27	0.22	0.27	0.24	0.38	0.28	0.28	0.47	0.75	0.32	0.45	0.44	0.54	0.33	0.16	0.14
lcl\|BLLF01004349.1_cds_GFH29451.1_23928 (GFH29451)	1.0	0.31	0.21	0.74	0.39	0.27	0.4	0.38	0.43	0.45	0.33	0.29	0.39	0.33	0.51	0.4	0.53	0.45	0.51	0.45	0.47	0.37	0.41	0.22	0.32	0.23
lcl\|BLLF01004605.1_cds_GFH29939.1_24416 (GFH29939)	0.85	0.28	0.39	0.25	0.39	0.35	0.35	0.31	0.26	0.58	0.47	0.4	0.35	0.38	0.33	0.67	1.0	0.7	0.68	0.59	0.78	0.55	0.67	0.12	0.37	0.4
lcl\|BLLF01004625.1_cds_GFH29972.1_24449 (GFH29972)	1.0	0.41	0.18	0.13	0.36	0.31	0.32	0.42	0.34	0.82	0.31	0.34	0.4	0.33	0.32	0.55	0.58	0.68	0.23	0.32	0.73	0.6	0.74	0.34	0.22	0.2
lcl\|BLLF01004990.1_cds_GFH30566.1_25043 (GFH30566)	1.0	0.34	0.47	0.37	0.59	0.42	0.27	0.31	0.36	0.31	0.5	0.31	0.35	0.31	0.26	0.66	0.77	0.87	0.53	0.36	0.95	0.49	0.73	0.16	0.21	0.29
lcl\|BLLF01005182.1_cds_GFH30845.1_25322 (GFH30845)	0.62	0.05	0.22	0.0	0.24	0.09	0.06	0.11	0.1	0.25	0.15	0.09	0.05	0.06	0.05	0.19	1.0	0.12	0.32	0.45	0.44	0.25	0.11	0.01	0.16	0.12
lcl\|BLLF01005530.1_cds_GFH31320.1_25797 (GFH31320)	0.89	0.43	0.25	0.59	0.36	0.33	0.29	0.21	0.32	0.62	0.36	0.22	0.3	0.26	0.27	0.59	0.58	1.0	0.48	0.38	0.99	0.27	0.89	0.08	0.19	0.22
lcl\|BLLF01006034.1_cds_GFH31887.1_26364 (GFH31887)	1.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.14	0.01	0.16	0.77	0.04	0.0	0.19	0.03	0.18	0.4	0.84	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
lcl\|BLLF01006333.1_cds_GFH32163.1_26640 (GFH32163)	0.34	0.0	0.0	0.17	0.24	0.22	0.33	0.28	0.36	0.97	0.44	0.13	0.22	0.24	0.27	0.17	0.38	0.4	1.0	0.23	0.37	0.84	0.93	0.49	0.31	0.16
lcl\|BLLF01007028.1_cds_GFH32720.1_27197 (GFH32720)	0.44	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.99	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.74	0.0	0.7	0.27	0.0	0.0	0.16	0.09	0.04	0.04
lcl\|BLLF01007227.1_cds_GFH32839.1_27316 (GFH32839)	1.0	0.0	0.0	0.34	0.34	0.03	0.2	0.19	0.2	0.62	0.11	0.04	0.1	0.28	0.11	0.24	0.53	0.12	0.19	0.11	0.17	0.2	0.19	0.12	0.27	0.06
lcl\|BLLF01008467.1_cds_GFH33389.1_27866 (GFH33389)	0.46	0.0	0.0	0.15	0.02	0.0	0.1	0.02	0.13	0.53	0.09	0.0	0.13	0.08	0.13	0.3	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.08

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)