Heatmap: Cluster_215 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000012.1_cds_GFH05871.1_348 (GFH05871)	0.89	0.2	0.0	0.18	0.37	0.68	0.49	0.25	0.66	0.65	0.52	0.43	0.68	0.34	0.74	1.0	0.74	0.6	0.09	0.31	0.5	0.48	0.54	0.22	0.54	0.81
lcl\|BLLF01000100.1_cds_GFH07523.1_2000 (GFH07523)	0.28	0.28	0.46	0.36	0.45	0.39	0.73	0.19	0.81	0.6	0.49	0.36	0.42	0.28	0.6	0.72	1.0	0.53	0.3	0.2	0.43	0.42	0.31	0.27	0.39	0.4
lcl\|BLLF01000122.1_cds_GFH07887.1_2364 (GFH07887)	0.88	0.28	0.61	0.14	0.36	0.32	0.36	0.18	0.38	0.66	0.3	0.25	0.31	0.39	0.16	0.54	0.13	0.72	0.49	0.34	1.0	0.42	0.39	0.12	0.64	0.71
lcl\|BLLF01000229.1_cds_GFH09382.1_3859 (GFH09382)	0.45	0.24	0.4	0.1	0.45	0.32	0.34	0.33	0.3	0.43	0.5	0.29	0.29	0.36	0.25	0.87	0.51	0.57	0.21	0.54	0.59	0.56	0.72	0.18	0.68	1.0
lcl\|BLLF01000230.1_cds_GFH09386.1_3863 (GFH09386)	0.41	0.05	0.33	0.09	0.41	0.63	0.58	0.27	0.32	0.37	0.53	0.45	0.39	0.66	0.3	0.24	0.35	1.0	0.19	0.22	0.78	0.35	0.96	0.11	0.28	0.27
lcl\|BLLF01000233.1_cds_GFH09421.1_3898 (GFH09421)	0.0	0.49	0.0	0.0	0.52	0.34	0.86	0.16	1.0	0.56	0.09	0.34	0.47	0.09	0.41	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.29	0.58
lcl\|BLLF01000254.1_cds_GFH09690.1_4167 (GFH09690)	0.45	0.21	0.31	0.2	0.38	0.41	0.22	0.2	0.31	0.51	0.38	0.25	0.16	0.19	0.16	1.0	0.55	0.62	0.09	0.2	0.66	0.19	0.44	0.1	0.25	0.5
lcl\|BLLF01000312.1_cds_GFH10401.1_4878 (GFH10401)	1.0	0.39	0.96	0.47	0.61	0.61	0.49	0.32	0.45	0.14	0.64	0.51	0.57	0.43	0.36	0.21	0.35	0.63	0.54	0.31	0.5	0.25	0.62	0.13	0.19	0.26
lcl\|BLLF01000344.1_cds_GFH10755.1_5232 (GFH10755)	0.23	0.03	0.68	0.06	0.32	0.46	0.45	0.15	0.48	0.19	0.29	0.33	0.3	0.23	0.33	0.33	0.43	1.0	0.61	0.34	0.78	0.56	0.73	0.22	0.2	0.25
lcl\|BLLF01000372.1_cds_GFH11077.1_5554 (GFH11077)	1.0	0.18	0.0	0.41	0.66	0.79	0.67	0.56	0.68	0.55	0.58	0.58	0.58	0.64	0.52	0.66	0.53	0.84	0.28	0.36	0.45	0.37	0.79	0.16	0.59	0.64
lcl\|BLLF01000425.1_cds_GFH11682.1_6159 (GFH11682)	0.75	0.44	0.54	0.11	0.97	0.83	0.72	0.42	0.6	0.58	0.89	0.57	0.55	0.62	0.56	1.0	0.81	0.59	0.23	0.25	0.8	0.39	0.45	0.4	0.79	0.49
lcl\|BLLF01000438.1_cds_GFH11816.1_6293 (GFH11816)	0.15	0.03	0.5	0.0	0.31	0.24	0.33	0.51	0.29	0.99	0.5	0.21	0.34	0.52	0.28	0.93	0.43	0.82	0.14	0.46	1.0	0.57	0.81	0.17	0.58	0.85
lcl\|BLLF01000444.1_cds_GFH11877.1_6354 (GFH11877)	0.6	0.13	1.0	0.31	0.35	0.34	0.37	0.4	0.45	0.65	0.38	0.3	0.39	0.48	0.38	0.21	0.43	1.0	0.27	0.35	0.74	0.35	0.61	0.36	0.46	0.53
lcl\|BLLF01000481.1_cds_GFH12238.1_6715 (GFH12238)	0.26	0.1	0.53	0.15	0.56	0.6	0.49	0.27	0.35	0.22	0.49	0.42	0.44	0.25	0.34	0.51	0.69	0.67	0.17	0.41	1.0	0.76	0.57	0.07	0.39	0.15
lcl\|BLLF01000651.1_cds_GFH13780.1_8257 (GFH13780)	1.0	0.36	0.48	0.21	0.48	0.33	0.36	0.37	0.39	0.47	0.47	0.36	0.34	0.32	0.43	0.21	0.31	0.45	0.19	0.23	0.51	0.23	0.54	0.29	0.48	0.25
lcl\|BLLF01000667.1_cds_GFH13918.1_8395 (GFH13918)	0.93	0.28	0.67	1.0	0.59	0.51	0.35	0.43	0.4	0.83	0.43	0.28	0.24	0.17	0.31	0.44	0.49	0.47	0.76	0.19	0.26	0.74	0.5	0.23	0.7	0.44
lcl\|BLLF01000719.1_cds_GFH14380.1_8857 (GFH14380)	0.47	0.5	0.48	0.43	0.63	0.57	0.78	0.3	0.81	1.0	0.52	0.47	0.52	0.39	0.63	0.2	0.18	0.35	0.35	0.54	0.54	0.41	0.55	0.35	0.55	0.41
lcl\|BLLF01000737.1_cds_GFH14529.1_9006 (GFH14529)	0.75	0.08	1.0	0.35	0.53	0.79	0.91	0.27	0.84	0.36	0.59	0.48	0.59	0.45	0.87	0.58	0.53	0.72	0.44	0.27	0.53	0.25	0.71	0.23	0.67	0.56
lcl\|BLLF01000859.1_cds_GFH15497.1_9974 (GFH15497)	0.68	0.0	0.74	0.48	0.3	0.29	0.6	0.31	0.53	0.51	0.46	0.3	0.6	0.45	0.57	0.61	1.0	0.62	0.16	0.14	0.36	0.34	0.51	0.14	0.54	0.33
lcl\|BLLF01000918.1_cds_GFH15904.1_10381 (GFH15904)	1.0	0.26	0.6	0.43	0.65	0.82	0.57	0.5	0.58	0.5	0.6	0.53	0.55	0.54	0.44	0.46	0.61	0.8	0.26	0.56	0.68	0.43	0.71	0.27	0.52	0.61
lcl\|BLLF01000932.1_cds_GFH16008.1_10485 (GFH16008)	0.88	0.45	0.64	0.32	0.82	0.77	0.8	0.72	0.84	0.99	0.86	0.72	0.76	0.66	0.82	0.56	1.0	0.99	0.33	0.54	0.97	0.5	0.81	0.53	0.62	0.68
lcl\|BLLF01000963.1_cds_GFH16222.1_10699 (GFH16222)	0.88	0.1	0.55	0.78	0.42	0.53	0.56	0.3	0.74	0.18	0.61	0.4	0.43	0.37	0.6	0.38	1.0	0.82	0.09	0.16	0.52	0.25	0.53	0.38	0.39	0.35
lcl\|BLLF01001002.1_cds_GFH16470.1_10947 (GFH16470)	0.21	0.2	0.5	0.56	0.85	0.63	0.62	0.42	0.61	0.29	0.84	0.58	0.53	0.47	0.54	0.63	0.83	0.64	0.29	0.43	1.0	0.54	0.74	0.41	0.58	0.39
lcl\|BLLF01001148.1_cds_GFH17446.1_11923 (GFH17446)	0.27	0.0	0.42	0.85	0.34	0.5	0.37	0.15	0.38	0.07	0.68	0.34	0.32	0.34	0.32	0.73	0.47	0.76	0.33	0.16	0.9	0.43	1.0	0.19	0.14	0.24
lcl\|BLLF01001199.1_cds_GFH17777.1_12254 (GFH17777)	1.0	0.24	0.81	0.04	0.37	0.26	0.26	0.24	0.31	0.46	0.34	0.24	0.3	0.23	0.33	0.17	0.23	0.17	0.22	0.33	0.19	0.27	0.12	0.05	0.45	0.33
lcl\|BLLF01001279.1_cds_GFH18295.1_12772 (GFH18295)	0.51	0.1	0.42	0.15	0.3	0.34	0.32	0.19	0.27	0.73	0.5	0.26	0.37	0.28	0.23	1.0	0.4	0.66	0.13	0.59	0.9	0.34	0.73	0.11	0.44	0.6
lcl\|BLLF01001329.1_cds_GFH18620.1_13097 (GFH18620)	0.48	0.02	0.71	0.24	0.54	0.6	0.88	0.22	0.82	0.3	0.57	0.54	0.55	0.28	0.85	0.52	0.64	0.74	0.3	0.17	0.56	0.59	1.0	0.23	0.45	0.38
lcl\|BLLF01001395.1_cds_GFH19030.1_13507 (GFH19030)	0.64	0.31	0.43	0.27	0.51	0.62	0.66	0.25	0.72	0.32	0.47	0.44	0.52	0.26	0.79	0.93	0.47	0.42	0.33	0.44	0.38	0.61	1.0	0.22	0.81	0.71
lcl\|BLLF01001416.1_cds_GFH19161.1_13638 (GFH19161)	0.58	0.28	0.45	0.1	0.44	0.32	0.41	0.46	0.4	1.0	0.49	0.38	0.36	0.3	0.34	0.47	0.84	0.86	0.37	0.46	0.74	0.85	0.51	0.32	0.6	0.44
lcl\|BLLF01001485.1_cds_GFH19569.1_14046 (GFH19569)	0.27	0.13	0.47	0.0	0.21	0.63	0.66	0.25	0.76	1.0	0.33	0.77	0.61	0.31	0.99	0.07	0.3	0.42	0.27	0.33	0.35	0.5	0.31	0.08	0.36	0.47
lcl\|BLLF01001485.1_cds_GFH19571.1_14048 (GFH19571)	0.29	0.37	0.68	0.11	0.28	0.94	0.67	0.19	1.0	0.94	0.42	0.49	0.6	0.24	0.92	0.16	0.32	0.16	0.19	0.25	0.36	0.17	0.21	0.02	0.31	0.4
lcl\|BLLF01001764.1_cds_GFH21109.1_15586 (GFH21109)	0.67	0.09	0.45	0.24	0.48	0.54	0.54	0.3	0.49	0.89	0.5	0.35	0.39	0.42	0.38	0.67	0.5	1.0	0.25	0.36	0.89	0.43	0.5	0.2	0.49	0.75
lcl\|BLLF01001811.1_cds_GFH21348.1_15825 (GFH21348)	0.63	0.37	0.6	0.37	0.55	0.46	0.3	0.52	0.36	0.4	0.51	0.33	0.46	0.47	0.29	0.35	0.37	1.0	0.44	0.47	0.99	0.3	0.9	0.15	0.19	0.36
lcl\|BLLF01001856.1_cds_GFH21569.1_16046 (GFH21569)	0.73	0.47	1.0	0.35	0.56	0.71	0.46	0.45	0.5	0.12	0.64	0.57	0.57	0.68	0.4	0.27	0.41	0.68	0.3	0.41	0.45	0.45	0.55	0.38	0.19	0.24
lcl\|BLLF01001934.1_cds_GFH21936.1_16413 (GFH21936)	0.92	0.14	1.0	0.34	0.74	0.61	0.38	0.31	0.34	0.48	0.69	0.34	0.26	0.34	0.26	0.33	0.34	0.98	0.56	0.39	0.97	0.54	0.74	0.02	0.36	0.24
lcl\|BLLF01001947.1_cds_GFH22000.1_16477 (GFH22000)	0.8	0.11	0.86	1.0	0.49	0.42	0.34	0.25	0.37	0.36	0.55	0.17	0.38	0.3	0.36	0.26	0.05	0.1	0.19	0.02	0.1	0.24	0.2	0.02	0.25	0.45
lcl\|BLLF01002216.1_cds_GFH23203.1_17680 (GFH23203)	0.5	0.0	1.0	0.07	0.3	0.34	0.24	0.42	0.29	0.52	0.33	0.2	0.16	0.3	0.12	0.21	0.15	0.73	0.0	0.48	0.67	0.13	0.16	0.05	0.04	0.3
lcl\|BLLF01002443.1_cds_GFH24098.1_18575 (GFH24098)	0.36	0.38	0.58	0.27	0.84	0.61	0.94	0.63	0.91	0.64	0.84	0.66	0.66	0.55	1.0	0.07	0.5	0.72	0.25	0.32	0.75	0.32	0.61	0.47	0.75	0.76
lcl\|BLLF01002525.1_cds_GFH24392.1_18869 (GFH24392)	0.31	0.0	0.56	0.55	0.05	0.08	0.46	0.02	0.45	0.3	0.08	0.12	0.15	0.08	0.27	1.0	0.67	0.07	0.06	0.0	0.31	0.06	0.11	0.12	0.13	0.23
lcl\|BLLF01002815.1_cds_GFH25441.1_19918 (GFH25441)	0.05	0.39	0.79	0.16	0.5	0.7	0.79	0.62	0.9	0.85	0.45	0.49	0.53	0.57	1.0	0.12	0.06	0.14	0.27	0.39	0.5	0.07	0.45	0.24	0.55	0.42
lcl\|BLLF01002994.1_cds_GFH26026.1_20503 (GFH26026)	0.26	0.04	0.44	0.25	0.59	0.68	0.51	0.43	0.45	0.56	0.64	0.52	0.5	0.41	0.45	0.99	0.44	0.67	0.23	0.24	1.0	0.7	0.46	0.28	0.52	0.68
lcl\|BLLF01003103.1_cds_GFH26357.1_20834 (GFH26357)	1.0	0.37	0.44	0.1	0.24	0.29	0.17	0.13	0.15	0.26	0.23	0.21	0.19	0.13	0.13	0.04	0.06	0.23	0.16	0.25	0.35	0.23	0.22	0.08	0.24	0.31
lcl\|BLLF01003222.1_cds_GFH26736.1_21213 (GFH26736)	0.44	0.12	0.47	0.18	0.5	1.0	0.78	0.31	0.57	0.1	0.6	0.88	0.69	0.34	0.78	0.75	0.76	0.64	0.24	0.54	0.52	0.85	0.79	0.13	0.91	0.77
lcl\|BLLF01003261.1_cds_GFH26848.1_21325 (GFH26848)	0.67	0.29	0.59	0.35	0.6	0.49	0.53	0.3	0.6	0.43	0.54	0.4	0.38	0.36	0.49	0.33	0.53	1.0	0.23	0.3	0.68	0.48	0.78	0.24	0.42	0.42
lcl\|BLLF01003482.1_cds_GFH27456.1_21933 (GFH27456)	0.88	0.22	0.7	0.13	0.63	0.66	0.67	0.34	0.44	0.62	0.72	0.49	0.53	0.61	0.47	0.41	0.49	1.0	0.27	0.31	0.8	0.46	0.73	0.17	0.84	0.5
lcl\|BLLF01003573.1_cds_GFH27681.1_22158 (GFH27681)	0.81	0.51	0.6	0.32	0.73	0.5	0.49	0.55	0.54	0.7	0.58	0.42	0.53	0.53	0.41	0.66	0.53	1.0	0.19	0.34	0.9	0.47	0.8	0.45	0.67	0.72
lcl\|BLLF01004695.1_cds_GFH30084.1_24561 (GFH30084)	0.67	0.27	0.58	1.0	0.52	0.31	0.34	0.42	0.47	0.19	0.39	0.32	0.37	0.22	0.57	0.06	0.38	0.49	0.12	0.46	0.66	0.4	0.71	0.27	0.45	0.33
lcl\|BLLF01004789.1_cds_GFH30248.1_24725 (GFH30248)	0.57	0.19	0.67	0.68	0.63	0.41	0.58	0.42	0.63	0.85	0.59	0.44	0.49	0.41	0.59	0.59	0.86	0.98	0.63	0.48	0.74	0.5	1.0	0.32	0.42	0.47
lcl\|BLLF01005750.1_cds_GFH31589.1_26066 (GFH31589)	1.0	0.09	0.59	0.24	0.58	0.37	0.33	0.3	0.2	0.35	0.49	0.18	0.18	0.2	0.17	0.31	0.09	0.43	0.36	0.2	0.53	0.15	0.19	0.05	0.43	0.38
lcl\|BLLF01006127.1_cds_GFH31979.1_26456 (GFH31979)	0.16	0.22	0.38	0.31	0.52	0.95	0.56	0.5	0.36	0.07	0.64	0.59	0.6	0.69	0.22	0.35	0.33	0.89	0.35	0.16	0.96	0.18	1.0	0.17	0.46	0.24
lcl\|BLLF01006216.1_cds_GFH32065.1_26542 (GFH32065)	0.88	0.0	1.0	0.51	0.19	0.46	0.47	0.17	0.61	0.0	0.42	0.16	0.39	0.29	0.12	0.0	0.56	0.3	0.0	0.22	0.0	0.0	0.25	0.09	0.2	0.56
lcl\|BLLF01006562.1_cds_GFH32360.1_26837 (GFH32360)	0.03	0.52	0.31	0.0	0.52	0.58	0.82	0.22	0.81	1.0	0.42	0.62	0.56	0.19	0.48	0.35	0.54	0.31	0.0	0.08	0.24	0.14	0.19	0.16	0.48	0.35
lcl\|BLLF01007679.1_cds_GFH33063.1_27540 (GFH33063)	0.31	0.58	1.0	0.09	0.65	0.35	0.24	0.29	0.48	0.06	0.44	0.25	0.2	0.17	0.15	0.37	0.41	0.78	0.32	0.3	0.69	0.23	0.71	0.03	0.31	0.18
lcl\|BLLF01008394.1_cds_GFH33358.1_27835 (GFH33358)	0.1	0.04	0.62	0.8	0.71	0.55	0.93	0.28	0.71	0.14	0.71	0.37	0.6	0.33	0.78	0.46	0.55	0.67	0.22	0.31	1.0	0.0	0.58	0.02	0.28	0.22

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)