Heatmap: Cluster_50 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
CCAC0055
CCAP34/8,15mM NO3
CCAP34/8,2mM NO3
JNU35
NIES-144,High light 12h
NIES-144,High light 24h
NIES-144,High light 48h
NIES-144,High light 6h
NIES-144,High light 72h
NIES-144,Homothallic
NIES-144,Low light 12h
NIES-144,Low light 24h
NIES-144,Low light 48h
NIES-144,Low light 6h
NIES-144,Low light 72h
Strain 121
Strain 712
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h
Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h
Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h
Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h
Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid
Vegetative
ZY-18,Motile
ZY-18,Motile to non-motile
0.24 0.03 1.0 0.0 0.03 0.03 0.05 0.09 0.04 0.85 0.03 0.02 0.09 0.06 0.11 0.39 0.33 0.09 0.0 0.08 0.07 0.0 0.14 0.03 0.28 0.15
0.07 0.15 1.0 0.09 0.16 0.01 0.0 0.01 0.06 0.19 0.05 0.03 0.03 0.07 0.01 0.0 0.31 0.62 0.0 0.0 0.58 0.49 0.31 0.15 0.0 0.05
0.33 0.16 1.0 0.05 0.29 0.33 0.21 0.18 0.21 0.88 0.16 0.24 0.21 0.18 0.21 0.47 0.32 0.49 0.06 0.34 0.5 0.12 0.78 0.18 0.17 0.21
0.52 0.4 1.0 0.12 0.51 0.5 0.42 0.19 0.31 0.51 0.46 0.43 0.3 0.29 0.26 0.86 0.92 0.51 0.33 0.29 0.39 0.28 0.68 0.31 0.35 0.37
0.19 0.12 1.0 0.04 0.25 0.17 0.14 0.09 0.27 0.27 0.15 0.15 0.21 0.13 0.12 0.13 0.56 0.59 0.15 0.34 0.41 0.16 0.29 0.16 0.14 0.17
0.25 0.03 1.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.52 0.39 0.05 0.1 0.0 0.08 0.0 0.11 0.05 0.02 0.03
0.29 0.0 1.0 0.13 0.02 0.06 0.03 0.02 0.05 0.14 0.02 0.03 0.02 0.03 0.08 0.0 0.71 0.4 0.0 0.11 0.53 0.1 0.35 0.08 0.07 0.07
0.23 0.06 1.0 0.19 0.14 0.08 0.17 0.14 0.17 0.29 0.15 0.11 0.09 0.11 0.18 0.22 0.14 0.58 0.15 0.14 0.38 0.05 0.36 0.13 0.03 0.02
0.06 0.0 1.0 0.02 0.18 0.05 0.06 0.05 0.1 0.3 0.07 0.03 0.07 0.01 0.1 0.72 0.6 0.41 0.11 0.19 0.41 0.06 0.33 0.05 0.03 0.08
0.06 0.02 1.0 0.18 0.09 0.06 0.05 0.05 0.05 0.28 0.25 0.13 0.15 0.16 0.13 0.0 0.06 0.24 0.09 0.0 0.31 0.07 0.16 0.03 0.17 0.19
0.09 0.01 0.76 0.02 0.12 0.13 0.11 0.03 0.15 0.25 0.11 0.22 0.12 0.04 0.1 0.27 0.57 0.72 0.21 0.2 1.0 0.29 0.49 0.12 0.09 0.12
0.22 0.69 1.0 0.1 0.62 0.47 0.51 0.39 0.43 0.43 0.52 0.34 0.38 0.39 0.37 0.48 0.58 0.52 0.24 0.21 0.65 0.23 0.48 0.33 0.36 0.39
0.0 0.18 1.0 0.07 0.04 0.08 0.07 0.06 0.12 0.25 0.05 0.04 0.08 0.05 0.09 0.05 0.08 0.28 0.22 0.12 0.46 0.13 0.35 0.1 0.05 0.1
0.05 0.43 1.0 0.03 0.11 0.13 0.12 0.02 0.12 0.99 0.09 0.07 0.13 0.08 0.11 0.51 0.44 0.53 0.12 0.14 0.93 0.13 0.62 0.15 0.06 0.18
0.18 0.21 1.0 0.0 0.02 0.02 0.01 0.02 0.03 0.49 0.02 0.01 0.02 0.01 0.04 0.71 0.19 0.09 0.1 0.06 0.09 0.2 0.15 0.05 0.02 0.03
0.13 0.0 1.0 0.05 0.17 0.09 0.05 0.02 0.02 0.33 0.1 0.05 0.03 0.02 0.06 1.0 0.39 0.21 0.0 0.37 0.16 0.34 0.11 0.07 0.04 0.12
0.19 0.66 1.0 0.42 0.14 0.25 0.25 0.09 0.29 0.4 0.17 0.18 0.24 0.16 0.28 0.18 0.32 0.76 0.27 0.27 0.6 0.25 0.66 0.12 0.25 0.16
0.03 0.18 1.0 0.46 0.14 0.11 0.12 0.1 0.16 0.69 0.11 0.11 0.21 0.15 0.14 0.31 0.4 0.38 0.09 0.03 0.54 0.18 0.31 0.06 0.18 0.17
0.34 0.19 1.0 0.17 0.12 0.21 0.2 0.08 0.16 0.52 0.21 0.11 0.26 0.16 0.08 0.55 0.72 0.67 0.19 0.23 0.84 0.12 0.55 0.08 0.18 0.28
0.4 0.04 1.0 0.19 0.21 0.29 0.35 0.13 0.34 0.12 0.25 0.26 0.3 0.21 0.26 0.36 0.36 0.81 0.72 0.58 0.74 0.32 0.66 0.14 0.22 0.17
0.03 0.25 1.0 0.03 0.13 0.39 0.33 0.25 0.24 0.37 0.24 0.21 0.41 0.31 0.12 0.78 0.35 0.69 0.06 0.0 0.68 0.13 0.73 0.25 0.28 0.48
0.45 0.38 1.0 0.04 0.18 0.36 0.19 0.14 0.27 0.68 0.26 0.22 0.26 0.19 0.18 0.75 0.39 0.88 0.81 0.55 0.79 0.36 0.91 0.12 0.29 0.34
0.11 0.1 1.0 0.11 0.08 0.19 0.05 0.07 0.01 0.17 0.11 0.14 0.15 0.14 0.02 0.24 0.53 0.53 0.24 0.22 0.7 0.46 0.68 0.07 0.1 0.15
0.11 0.02 1.0 0.06 0.25 0.58 0.54 0.31 0.39 0.19 0.47 0.31 0.42 0.24 0.42 0.55 0.61 0.57 0.11 0.06 0.59 0.57 0.5 0.23 0.33 0.47
0.19 0.0 1.0 0.1 0.0 0.02 0.03 0.01 0.01 0.26 0.02 0.03 0.05 0.02 0.02 0.22 0.19 0.0 0.0 0.33 0.14 0.0 0.21 0.11 0.04 0.02
0.0 0.03 1.0 0.0 0.09 0.08 0.16 0.06 0.08 0.6 0.0 0.1 0.02 0.01 0.04 0.0 0.09 0.1 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.07 0.19 0.07
0.35 0.56 1.0 0.09 0.0 0.01 0.03 0.01 0.06 0.53 0.02 0.0 0.08 0.07 0.04 0.12 0.0 0.09 0.01 0.0 0.56 0.0 0.47 0.02 0.04 0.06
0.13 0.28 0.86 0.14 0.35 0.33 0.31 0.28 0.35 0.66 0.33 0.25 0.19 0.3 0.28 0.59 0.31 0.76 0.34 0.26 1.0 0.3 0.51 0.23 0.38 0.4
0.0 0.47 1.0 0.09 0.09 0.13 0.15 0.12 0.02 0.0 0.15 0.17 0.03 0.02 0.06 0.22 0.46 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.12 0.27 1.0 0.37 0.05 0.02 0.04 0.02 0.04 0.05 0.04 0.03 0.04 0.01 0.04 0.45 0.44 0.39 0.06 0.03 0.36 0.12 0.44 0.05 0.01 0.03
0.32 0.21 1.0 0.28 0.2 0.26 0.17 0.11 0.17 0.3 0.29 0.14 0.17 0.17 0.1 0.21 0.58 0.56 0.34 0.71 0.54 0.09 0.61 0.07 0.19 0.42
0.28 0.08 1.0 0.16 0.23 0.19 0.17 0.14 0.15 0.13 0.24 0.18 0.25 0.22 0.17 0.49 0.32 0.81 0.36 0.24 0.59 0.38 0.24 0.27 0.18 0.2
0.12 0.11 0.97 0.21 0.2 0.21 0.25 0.27 0.32 0.72 0.29 0.23 0.29 0.34 0.24 1.0 0.73 0.69 0.28 0.63 0.63 0.22 0.87 0.24 0.14 0.18
0.04 0.0 1.0 0.0 0.06 0.07 0.01 0.06 0.02 0.15 0.05 0.04 0.02 0.04 0.03 0.42 0.36 0.24 0.0 0.11 0.43 0.07 0.06 0.03 0.05 0.07
0.19 0.03 1.0 0.1 0.2 0.24 0.34 0.12 0.31 0.68 0.28 0.23 0.26 0.24 0.32 0.19 0.11 0.3 0.09 0.21 0.25 0.24 0.24 0.35 0.3 0.35
0.0 0.0 1.0 0.36 0.08 0.06 0.13 0.0 0.07 0.0 0.0 0.06 0.04 0.06 0.0 0.35 0.39 0.41 0.0 0.0 0.19 0.21 0.27 0.04 0.47 0.41
0.21 0.61 1.0 0.13 0.31 0.28 0.28 0.25 0.28 0.74 0.26 0.21 0.23 0.31 0.31 0.37 0.31 0.13 0.04 0.04 0.03 0.07 0.0 0.03 0.33 0.32
0.19 1.0 0.97 0.39 0.42 0.36 0.27 0.49 0.26 0.15 0.41 0.39 0.29 0.35 0.2 0.23 0.66 0.59 0.41 0.43 1.0 0.14 0.67 0.46 0.49 0.51
0.24 0.51 1.0 0.07 0.07 0.06 0.34 0.04 0.27 0.34 0.05 0.05 0.09 0.03 0.35 0.19 0.27 0.19 0.04 0.05 0.04 0.15 0.22 0.08 0.32 0.13
0.07 0.5 0.88 0.08 0.17 0.3 0.23 0.08 0.27 0.32 0.15 0.08 0.19 0.19 0.18 0.45 0.53 0.35 0.0 0.47 0.56 0.24 1.0 0.1 0.15 0.34
0.65 0.4 1.0 0.36 0.16 0.27 0.25 0.11 0.22 0.92 0.12 0.11 0.2 0.14 0.2 0.42 0.38 0.2 0.1 0.24 0.17 0.36 0.13 0.13 0.15 0.12
0.23 0.0 1.0 0.02 0.05 0.02 0.03 0.02 0.04 0.02 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.31 0.27 0.06 0.11 0.1 0.08 0.07 0.2 0.06 0.06 0.0
0.0 0.02 1.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.05 0.02 0.13 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.31 0.31 0.17 0.14 0.05 0.37 0.67 0.34 0.14 0.18 0.15
0.28 0.22 1.0 0.34 0.21 0.21 0.17 0.1 0.17 0.43 0.27 0.17 0.18 0.1 0.07 0.68 0.84 0.23 0.14 0.26 0.25 0.26 0.39 0.06 0.19 0.21
0.22 0.05 1.0 0.05 0.33 0.34 0.37 0.13 0.24 0.47 0.25 0.3 0.24 0.19 0.21 0.17 0.49 0.26 0.1 0.14 0.04 0.05 0.19 0.34 0.4 0.36
0.16 0.49 1.0 0.07 0.19 0.25 0.27 0.11 0.21 0.32 0.15 0.16 0.21 0.13 0.17 0.91 0.39 0.48 0.32 0.32 0.46 0.22 0.71 0.27 0.18 0.09
0.18 0.09 1.0 0.26 0.25 0.28 0.25 0.21 0.22 0.42 0.33 0.22 0.21 0.22 0.18 0.1 0.15 0.66 0.12 0.07 0.27 0.31 0.23 0.24 0.18 0.09
0.12 0.24 1.0 0.17 0.16 0.19 0.22 0.11 0.12 0.44 0.16 0.12 0.18 0.15 0.12 0.12 0.59 0.1 0.1 0.08 0.13 0.05 0.19 0.03 0.1 0.09
0.05 0.0 1.0 0.06 0.03 0.01 0.04 0.06 0.04 0.34 0.05 0.06 0.06 0.07 0.01 0.43 0.17 0.74 0.43 0.38 0.81 0.19 0.82 0.1 0.01 0.04
0.08 0.03 1.0 0.0 0.29 0.16 0.15 0.05 0.13 0.0 0.22 0.07 0.12 0.16 0.03 0.0 0.12 0.37 0.11 0.29 0.2 0.07 0.07 0.03 0.03 0.05
0.04 0.05 1.0 0.28 0.48 0.13 0.06 0.06 0.08 0.35 0.3 0.12 0.14 0.08 0.07 0.43 0.16 0.34 0.0 0.14 0.23 0.0 0.39 0.17 0.01 0.14
0.33 0.34 1.0 0.2 0.33 0.35 0.21 0.19 0.12 0.46 0.45 0.37 0.24 0.4 0.13 0.35 0.52 0.67 0.43 0.21 0.45 0.3 0.63 0.15 0.1 0.12
0.17 0.01 0.91 0.11 0.02 0.03 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.03 0.02 0.01 0.0 0.5 1.0 0.83 0.17 0.09 0.69 0.0 0.25 0.02 0.0 0.0
0.13 0.03 1.0 0.05 0.02 0.02 0.03 0.01 0.01 0.1 0.13 0.02 0.04 0.07 0.05 0.15 0.11 0.35 0.0 0.0 0.55 0.0 0.28 0.06 0.09 0.09
0.17 0.08 1.0 0.12 0.25 0.16 0.15 0.1 0.32 0.47 0.17 0.19 0.21 0.22 0.19 0.61 0.12 0.92 0.94 0.15 1.0 0.0 0.12 0.08 0.32 0.24
0.01 0.42 1.0 0.03 0.32 0.25 0.23 0.34 0.17 0.23 0.33 0.19 0.18 0.26 0.11 0.45 0.64 0.06 0.0 0.08 0.21 0.06 0.15 0.08 0.22 0.11
0.11 0.37 1.0 0.0 0.19 0.09 0.14 0.03 0.16 0.35 0.1 0.05 0.18 0.1 0.14 0.71 0.32 0.0 0.0 0.14 0.0 0.07 0.05 0.03 0.22 0.25
0.26 0.07 0.92 0.24 0.14 0.19 0.17 0.1 0.17 0.96 0.21 0.13 0.27 0.22 0.18 0.12 0.59 0.62 0.43 0.29 0.46 0.23 1.0 0.04 0.11 0.03
0.33 0.25 1.0 0.47 0.03 0.05 0.03 0.03 0.03 0.13 0.02 0.04 0.06 0.03 0.04 0.16 0.23 0.37 0.33 0.1 0.14 0.31 0.39 0.05 0.05 0.06
0.14 0.0 1.0 0.0 0.06 0.08 0.06 0.06 0.09 0.31 0.08 0.08 0.12 0.08 0.15 0.0 0.0 0.51 0.13 0.07 0.0 0.0 0.51 0.01 0.02 0.1
0.39 0.28 1.0 0.23 0.22 0.26 0.26 0.14 0.3 0.24 0.25 0.13 0.28 0.2 0.24 0.71 0.68 0.48 0.27 0.19 0.38 0.13 0.46 0.25 0.34 0.31
0.0 0.09 1.0 0.0 0.02 0.05 0.04 0.11 0.09 0.17 0.08 0.06 0.08 0.04 0.1 0.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01
0.44 0.7 0.99 0.43 0.31 0.25 0.36 0.28 0.34 1.0 0.32 0.2 0.35 0.26 0.31 0.38 0.35 0.88 0.39 0.56 0.66 0.17 0.58 0.18 0.31 0.23
0.07 0.2 1.0 0.1 0.37 0.27 0.25 0.42 0.28 0.88 0.35 0.22 0.25 0.3 0.17 0.34 0.29 0.63 0.11 0.1 0.66 0.33 0.66 0.1 0.25 0.24
0.12 0.26 1.0 0.29 0.06 0.03 0.05 0.06 0.1 0.2 0.05 0.03 0.05 0.05 0.06 0.06 0.26 0.57 0.33 0.11 0.18 0.07 0.39 0.07 0.01 0.02
0.4 0.0 1.0 0.4 0.17 0.15 0.28 0.24 0.16 0.7 0.13 0.14 0.26 0.18 0.13 0.59 0.44 0.65 0.69 0.55 0.53 0.24 0.53 0.33 0.14 0.09
0.12 0.17 1.0 0.17 0.22 0.26 0.36 0.16 0.18 0.87 0.13 0.3 0.2 0.19 0.12 0.61 0.28 0.23 0.09 0.25 0.81 0.28 0.41 0.32 0.12 0.26
0.25 0.25 1.0 0.51 0.08 0.12 0.18 0.14 0.27 0.24 0.06 0.06 0.07 0.07 0.23 0.86 0.97 0.43 0.32 0.52 0.52 0.38 0.37 0.23 0.07 0.1
0.37 0.78 1.0 0.5 0.54 0.45 0.48 0.28 0.34 0.12 0.38 0.4 0.4 0.23 0.21 0.3 0.51 0.51 0.15 0.18 0.95 0.56 0.66 0.27 0.13 0.13
0.18 0.0 1.0 0.0 0.04 0.04 0.02 0.05 0.06 0.0 0.12 0.01 0.02 0.03 0.01 0.27 0.15 0.18 0.18 0.21 0.31 0.0 0.13 0.05 0.04 0.04
0.26 0.1 1.0 0.04 0.01 0.05 0.03 0.03 0.04 0.29 0.02 0.02 0.03 0.01 0.05 0.24 0.26 0.09 0.11 0.15 0.24 0.21 0.11 0.07 0.07 0.05
0.3 0.66 0.85 0.22 0.59 0.31 0.47 0.26 0.43 0.38 0.57 0.45 0.4 0.31 0.31 0.53 0.39 0.65 0.53 0.45 0.74 0.19 1.0 0.49 0.36 0.22
0.38 0.04 1.0 0.67 0.21 0.08 0.24 0.06 0.12 0.21 0.14 0.05 0.14 0.12 0.11 0.0 0.07 0.45 0.0 0.0 0.21 0.0 0.75 0.05 0.33 0.37
0.25 0.39 1.0 0.15 0.15 0.25 0.19 0.1 0.16 0.17 0.26 0.16 0.24 0.18 0.11 0.34 0.15 0.72 0.69 0.13 0.53 0.27 0.69 0.08 0.16 0.23
0.08 0.28 1.0 0.18 0.14 0.09 0.09 0.06 0.08 0.22 0.08 0.07 0.07 0.06 0.13 0.57 0.25 0.65 0.15 0.11 0.41 0.24 0.54 0.19 0.08 0.06
0.08 0.05 1.0 0.01 0.35 0.13 0.19 0.16 0.19 0.35 0.28 0.06 0.09 0.07 0.1 0.29 0.66 0.46 0.09 0.23 0.11 0.0 0.15 0.02 0.13 0.06
0.39 0.14 1.0 0.0 0.25 0.19 0.17 0.2 0.21 0.32 0.23 0.11 0.07 0.12 0.2 0.35 0.95 0.32 0.0 0.18 0.23 0.13 0.29 0.05 0.2 0.17
0.08 0.76 0.89 0.17 0.17 0.16 0.18 0.31 0.19 0.53 0.21 0.15 0.18 0.3 0.19 0.39 0.47 0.59 0.48 0.39 1.0 0.14 0.76 0.19 0.25 0.26
0.08 0.35 1.0 0.28 0.26 0.18 0.19 0.15 0.19 0.52 0.2 0.12 0.17 0.15 0.07 0.65 0.33 0.25 0.03 0.47 0.22 0.18 0.23 0.16 0.26 0.49
0.08 0.3 0.88 0.03 0.01 0.03 0.04 0.02 0.06 0.08 0.01 0.03 0.02 0.02 0.04 1.0 0.22 0.39 0.06 0.07 0.33 0.03 0.26 0.05 0.05 0.02
0.08 0.0 1.0 0.06 0.06 0.0 0.02 0.06 0.02 0.06 0.01 0.0 0.01 0.02 0.06 0.42 0.44 0.26 0.1 0.11 0.27 0.1 0.2 0.09 0.26 0.17
0.03 0.16 1.0 0.15 0.41 0.12 0.09 0.11 0.07 0.13 0.31 0.1 0.08 0.1 0.04 0.08 0.35 0.21 0.0 0.17 0.2 0.09 0.07 0.05 0.0 0.16
0.14 0.08 1.0 0.16 0.2 0.16 0.09 0.11 0.1 0.27 0.21 0.15 0.16 0.17 0.14 0.14 0.22 0.4 0.08 0.12 0.51 0.16 0.39 0.03 0.07 0.07
0.0 0.01 1.0 0.24 0.09 0.06 0.11 0.05 0.1 0.58 0.1 0.09 0.08 0.06 0.12 0.0 0.0 0.51 0.23 0.17 0.39 0.12 0.48 0.17 0.23 0.22
0.02 0.25 1.0 0.02 0.03 0.02 0.14 0.02 0.31 0.16 0.01 0.02 0.03 0.01 0.38 0.0 0.0 0.09 0.29 0.22 0.28 0.05 0.25 0.0 0.11 0.03
0.07 0.03 1.0 0.0 0.03 0.06 0.08 0.02 0.15 0.78 0.05 0.02 0.07 0.01 0.13 0.23 0.0 0.04 0.0 0.0 0.06 0.0 0.09 0.0 0.11 0.01
0.37 0.93 1.0 0.1 0.14 0.21 0.17 0.11 0.26 0.78 0.12 0.26 0.17 0.13 0.15 0.16 0.47 0.61 0.92 0.31 0.68 0.0 0.49 0.21 0.51 0.29
0.21 0.06 1.0 0.25 0.15 0.17 0.23 0.16 0.18 0.33 0.18 0.15 0.18 0.22 0.16 0.23 0.15 0.49 0.3 0.2 0.41 0.45 0.5 0.2 0.2 0.14
0.28 0.01 1.0 0.13 0.12 0.09 0.17 0.09 0.14 0.1 0.21 0.17 0.11 0.18 0.11 0.65 0.43 0.27 0.32 0.13 0.3 0.28 0.43 0.38 0.15 0.14
0.17 0.0 1.0 0.03 0.02 0.01 0.02 0.02 0.04 0.14 0.01 0.0 0.01 0.0 0.02 0.25 0.18 0.08 0.12 0.16 0.11 0.06 0.04 0.07 0.04 0.04
0.02 0.0 1.0 0.09 0.02 0.06 0.01 0.04 0.0 0.06 0.03 0.01 0.03 0.05 0.0 0.26 0.39 0.34 0.0 0.06 0.09 0.32 0.34 0.02 0.02 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)