Heatmap: Cluster_200 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000009.1_cds_GFH05811.1_288 (GFH05811)	0.09	0.06	0.11	0.09	0.08	0.11	0.11	0.07	0.08	0.12	0.09	0.08	0.08	0.09	0.05	1.0	0.44	0.27	0.28	0.2	0.42	0.34	0.39	0.29	0.19	0.19
lcl\|BLLF01000071.1_cds_GFH07057.1_1534 (GFH07057)	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.04	0.03	0.02	0.05	0.07	0.11	0.15	0.07	0.09	1.0	0.59	0.28	0.4	0.36	0.38	0.27	0.45	0.09	0.05	0.04
lcl\|BLLF01000202.1_cds_GFH09009.1_3486 (GFH09009)	0.1	0.0	0.15	0.12	0.12	0.11	0.11	0.04	0.09	0.08	0.12	0.09	0.08	0.08	0.05	1.0	0.65	0.2	0.24	0.27	0.35	0.15	0.24	0.21	0.09	0.12
lcl\|BLLF01000304.1_cds_GFH10300.1_4777 (GFH10300)	0.15	0.11	0.0	0.05	0.09	0.09	0.08	0.03	0.07	0.33	0.06	0.06	0.07	0.06	0.04	1.0	0.59	0.22	0.3	0.31	0.4	0.46	0.37	0.26	0.07	0.06
lcl\|BLLF01000304.1_cds_GFH10301.1_4778 (GFH10301)	0.27	0.08	0.04	0.09	0.18	0.19	0.23	0.13	0.19	0.18	0.19	0.18	0.15	0.17	0.2	1.0	0.74	0.28	0.4	0.48	0.22	0.55	0.2	0.32	0.3	0.31
lcl\|BLLF01000489.1_cds_GFH12306.1_6783 (GFH12306)	0.06	0.11	0.0	0.0	0.06	0.15	0.11	0.03	0.07	0.21	0.07	0.11	0.08	0.05	0.06	1.0	0.27	0.38	0.24	0.24	0.36	0.26	0.45	0.2	0.11	0.16
lcl\|BLLF01000606.1_cds_GFH13384.1_7861 (GFH13384)	0.2	0.2	0.02	0.25	0.07	0.08	0.06	0.05	0.06	0.13	0.08	0.07	0.08	0.06	0.05	1.0	0.9	0.34	0.3	0.42	0.4	0.58	0.34	0.19	0.1	0.13
lcl\|BLLF01000750.1_cds_GFH14647.1_9124 (GFH14647)	0.07	0.01	0.0	0.02	0.05	0.07	0.09	0.08	0.07	0.37	0.02	0.05	0.06	0.03	0.05	1.0	0.42	0.48	0.11	0.32	0.56	0.53	0.44	0.14	0.03	0.05
lcl\|BLLF01000827.1_cds_GFH15269.1_9746 (GFH15269)	0.22	0.0	0.0	0.05	0.07	0.1	0.07	0.03	0.07	0.09	0.05	0.06	0.07	0.05	0.03	1.0	0.9	0.28	0.19	0.17	0.24	0.43	0.27	0.37	0.21	0.21
lcl\|BLLF01000829.1_cds_GFH15282.1_9759 (GFH15282)	0.07	0.1	0.0	0.06	0.01	0.04	0.03	0.01	0.01	0.04	0.03	0.04	0.04	0.03	0.0	1.0	0.53	0.28	0.31	0.23	0.5	0.14	0.26	0.08	0.0	0.0
lcl\|BLLF01000885.1_cds_GFH15694.1_10171 (GFH15694)	0.01	0.17	0.0	0.28	0.09	0.05	0.08	0.05	0.08	0.38	0.05	0.04	0.08	0.03	0.05	1.0	0.48	0.51	0.16	0.3	0.44	0.23	0.52	0.21	0.04	0.05
lcl\|BLLF01000975.1_cds_GFH16284.1_10761 (GFH16284)	0.08	0.2	0.0	0.07	0.05	0.14	0.09	0.04	0.08	0.02	0.08	0.08	0.09	0.06	0.07	1.0	0.48	0.18	0.23	0.27	0.43	0.12	0.35	0.19	0.06	0.09
lcl\|BLLF01000985.1_cds_GFH16365.1_10842 (GFH16365)	0.11	0.0	0.0	0.02	0.04	0.05	0.05	0.04	0.02	0.32	0.09	0.02	0.03	0.04	0.02	1.0	0.57	0.33	0.24	0.23	0.47	0.39	0.09	0.08	0.01	0.03
lcl\|BLLF01001068.1_cds_GFH16900.1_11377 (GFH16900)	0.09	0.14	0.07	0.11	0.03	0.06	0.05	0.02	0.04	0.06	0.04	0.04	0.03	0.03	0.03	1.0	0.67	0.23	0.14	0.24	0.25	0.2	0.26	0.17	0.03	0.04
lcl\|BLLF01001321.1_cds_GFH18568.1_13045 (GFH18568)	0.31	0.16	0.0	0.16	0.14	0.17	0.18	0.12	0.17	0.26	0.09	0.14	0.13	0.09	0.13	1.0	0.8	0.11	0.18	0.41	0.2	0.39	0.33	0.39	0.26	0.17
lcl\|BLLF01001409.1_cds_GFH19118.1_13595 (GFH19118)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01	0.16	0.0	0.01	0.0	0.0	0.02	1.0	0.51	0.17	0.29	0.0	0.47	0.29	0.39	0.05	0.02	0.03
lcl\|BLLF01001506.1_cds_GFH19704.1_14181 (GFH19704)	0.11	0.02	0.0	0.1	0.03	0.1	0.16	0.11	0.07	0.19	0.15	0.09	0.14	0.12	0.11	1.0	0.27	0.21	0.25	0.21	0.4	0.07	0.45	0.19	0.08	0.08
lcl\|BLLF01001519.1_cds_GFH19776.1_14253 (GFH19776)	0.05	0.09	0.0	0.04	0.05	0.06	0.06	0.04	0.07	0.29	0.06	0.05	0.05	0.06	0.04	1.0	0.35	0.56	0.17	0.13	0.47	0.27	0.46	0.17	0.02	0.03
lcl\|BLLF01001732.1_cds_GFH20951.1_15428 (GFH20951)	0.11	0.02	0.0	0.04	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.03	0.01	0.03	1.0	0.39	0.07	0.24	0.33	0.06	0.18	0.07	0.22	0.12	0.07
lcl\|BLLF01001798.1_cds_GFH21286.1_15763 (GFH21286)	0.23	0.0	0.0	0.04	0.08	0.07	0.07	0.13	0.08	0.51	0.06	0.04	0.05	0.08	0.07	1.0	0.57	0.44	0.12	0.3	0.62	0.33	0.25	0.17	0.07	0.12
lcl\|BLLF01001819.1_cds_GFH21387.1_15864 (GFH21387)	0.19	0.23	0.03	0.0	0.02	0.03	0.04	0.04	0.02	0.12	0.03	0.06	0.06	0.04	0.03	1.0	0.6	0.12	0.18	0.2	0.19	0.42	0.16	0.14	0.03	0.01
lcl\|BLLF01002112.1_cds_GFH22732.1_17209 (GFH22732)	0.2	0.16	0.0	0.21	0.2	0.13	0.13	0.08	0.18	0.23	0.17	0.11	0.16	0.13	0.13	1.0	0.61	0.55	0.37	0.25	0.29	0.32	0.44	0.27	0.24	0.24
lcl\|BLLF01002278.1_cds_GFH23462.1_17939 (GFH23462)	0.11	0.0	0.0	0.04	0.02	0.04	0.04	0.02	0.03	0.04	0.02	0.04	0.05	0.0	0.04	1.0	0.51	0.18	0.38	0.36	0.27	0.21	0.2	0.17	0.07	0.06
lcl\|BLLF01002350.1_cds_GFH23742.1_18219 (GFH23742)	0.11	0.02	0.0	0.02	0.03	0.09	0.03	0.03	0.02	0.28	0.08	0.06	0.07	0.08	0.02	1.0	0.37	0.61	0.17	0.26	0.63	0.36	0.39	0.07	0.02	0.04
lcl\|BLLF01002391.1_cds_GFH23896.1_18373 (GFH23896)	0.14	0.21	0.04	0.04	0.08	0.04	0.02	0.08	0.06	0.44	0.1	0.03	0.07	0.1	0.04	1.0	0.65	0.46	0.21	0.23	0.54	0.29	0.48	0.25	0.04	0.05
lcl\|BLLF01002500.1_cds_GFH24314.1_18791 (GFH24314)	0.19	0.0	0.0	0.11	0.1	0.18	0.22	0.06	0.19	0.11	0.21	0.2	0.21	0.18	0.18	1.0	0.49	0.27	0.43	0.24	0.28	0.39	0.18	0.16	0.28	0.11
lcl\|BLLF01002626.1_cds_GFH24765.1_19242 (GFH24765)	0.15	0.04	0.0	0.09	0.02	0.11	0.05	0.02	0.03	0.15	0.05	0.09	0.11	0.06	0.02	1.0	0.56	0.37	0.24	0.15	0.49	0.5	0.52	0.15	0.16	0.11
lcl\|BLLF01002626.1_cds_GFH24766.1_19243 (GFH24766)	0.14	0.03	0.01	0.05	0.02	0.07	0.04	0.02	0.02	0.19	0.03	0.05	0.08	0.05	0.02	1.0	0.6	0.32	0.22	0.15	0.4	0.38	0.4	0.13	0.12	0.09
lcl\|BLLF01002668.1_cds_GFH24920.1_19397 (GFH24920)	0.24	0.11	0.03	0.04	0.11	0.21	0.26	0.12	0.22	0.43	0.13	0.15	0.2	0.13	0.15	1.0	0.41	0.37	0.21	0.16	0.56	0.52	0.53	0.25	0.14	0.24
lcl\|BLLF01002744.1_cds_GFH25185.1_19662 (GFH25185)	0.14	0.0	0.0	0.05	0.03	0.02	0.03	0.03	0.02	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.06	1.0	0.35	0.37	0.43	0.19	0.53	0.22	0.13	0.11	0.03	0.03
lcl\|BLLF01002900.1_cds_GFH25724.1_20201 (GFH25724)	0.12	0.04	0.0	0.1	0.04	0.08	0.08	0.03	0.05	0.19	0.08	0.06	0.08	0.04	0.03	1.0	0.47	0.34	0.43	0.42	0.39	0.49	0.28	0.2	0.14	0.07
lcl\|BLLF01003097.1_cds_GFH26339.1_20816 (GFH26339)	0.13	0.12	0.0	0.32	0.2	0.15	0.14	0.14	0.14	0.02	0.18	0.14	0.13	0.13	0.13	1.0	0.78	0.37	0.38	0.58	0.38	0.44	0.36	0.24	0.02	0.01
lcl\|BLLF01003188.1_cds_GFH26642.1_21119 (GFH26642)	0.06	0.02	0.0	0.03	0.05	0.1	0.07	0.03	0.03	0.08	0.08	0.11	0.08	0.08	0.02	1.0	0.59	0.38	0.18	0.2	0.37	0.23	0.47	0.12	0.07	0.05
lcl\|BLLF01003432.1_cds_GFH27317.1_21794 (GFH27317)	0.1	0.13	0.0	0.0	0.02	0.03	0.04	0.02	0.01	0.06	0.05	0.05	0.01	0.04	0.01	1.0	0.36	0.41	0.0	0.0	0.49	0.53	0.33	0.13	0.04	0.04
lcl\|BLLF01003569.1_cds_GFH27669.1_22146 (GFH27669)	0.21	0.1	0.0	0.11	0.06	0.12	0.08	0.07	0.06	0.09	0.14	0.07	0.12	0.18	0.06	1.0	0.45	0.31	0.32	0.16	0.37	0.36	0.41	0.22	0.12	0.06
lcl\|BLLF01003672.1_cds_GFH27922.1_22399 (GFH27922)	0.27	0.04	0.0	0.0	0.07	0.09	0.08	0.07	0.07	0.26	0.06	0.07	0.06	0.07	0.07	1.0	0.49	0.39	0.43	0.31	0.39	0.45	0.58	0.24	0.13	0.2
lcl\|BLLF01003702.1_cds_GFH27996.1_22473 (GFH27996)	0.19	0.15	0.0	0.13	0.06	0.13	0.13	0.07	0.07	0.14	0.11	0.14	0.16	0.19	0.08	1.0	0.47	0.37	0.16	0.06	0.32	0.23	0.5	0.23	0.11	0.12
lcl\|BLLF01004042.1_cds_GFH28799.1_23276 (GFH28799)	0.17	0.15	0.03	0.13	0.13	0.08	0.1	0.08	0.08	0.04	0.11	0.1	0.08	0.1	0.07	1.0	0.57	0.06	0.26	0.21	0.07	0.27	0.12	0.37	0.17	0.12
lcl\|BLLF01004406.1_cds_GFH29544.1_24021 (GFH29544)	0.09	0.0	0.0	0.01	0.06	0.07	0.08	0.03	0.05	0.04	0.07	0.05	0.05	0.07	0.03	1.0	0.39	0.3	0.13	0.03	0.34	0.3	0.32	0.05	0.05	0.04
lcl\|BLLF01004465.1_cds_GFH29668.1_24145 (GFH29668)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.04	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	1.0	0.56	0.29	0.0	0.0	0.32	0.18	0.45	0.09	0.03	0.08
lcl\|BLLF01004859.1_cds_GFH30369.1_24846 (GFH30369)	0.05	0.0	0.0	0.03	0.02	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	1.0	0.65	0.21	0.0	0.08	0.3	0.45	0.2	0.13	0.05	0.27
lcl\|BLLF01005607.1_cds_GFH31414.1_25891 (GFH31414)	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.02	0.03	0.03	0.02	0.31	0.03	0.04	0.02	0.01	0.01	1.0	0.52	0.24	0.11	0.21	0.29	0.18	0.33	0.04	0.07	0.09
lcl\|BLLF01007962.1_cds_GFH33192.1_27669 (GFH33192)	0.2	0.0	0.0	0.02	0.1	0.07	0.09	0.08	0.09	0.16	0.12	0.06	0.06	0.04	0.08	1.0	0.38	0.47	0.23	0.17	0.34	0.4	0.37	0.14	0.06	0.11
lcl\|BLLF01009013.1_cds_GFH33589.1_28066 (GFH33589)	0.13	0.0	0.0	0.05	0.12	0.15	0.17	0.06	0.11	0.15	0.11	0.15	0.1	0.12	0.16	1.0	0.41	0.53	0.22	0.26	0.37	0.46	0.22	0.16	0.2	0.21

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)