Heatmap: Cluster_196 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000014.1_cds_GFH05936.1_413 (GFH05936)	0.37	0.1	0.57	0.47	1.0	0.28	0.12	0.21	0.16	0.47	0.69	0.17	0.11	0.18	0.13	0.69	0.72	0.51	0.2	0.4	0.5	0.27	0.3	0.05	0.11	0.35
lcl\|BLLF01000047.1_cds_GFH06614.1_1091 (GFH06614)	1.0	0.3	0.68	0.8	0.9	0.36	0.16	0.25	0.25	0.86	0.7	0.17	0.12	0.15	0.18	0.32	0.82	0.39	0.2	0.77	0.39	0.28	0.13	0.01	0.38	0.46
lcl\|BLLF01000055.1_cds_GFH06775.1_1252 (GFH06775)	0.15	0.54	0.0	0.91	0.69	0.37	0.18	0.13	0.22	1.0	0.38	0.08	0.27	0.14	0.24	0.24	0.22	0.13	0.28	0.71	0.37	0.0	0.13	0.02	0.28	0.61
lcl\|BLLF01000082.1_cds_GFH07235.1_1712 (GFH07235)	1.0	0.31	0.59	0.22	0.68	0.54	0.51	0.25	0.59	0.61	0.55	0.52	0.49	0.24	0.44	0.51	0.42	0.36	0.12	0.07	0.22	0.19	0.12	0.18	0.44	0.64
lcl\|BLLF01000133.1_cds_GFH08038.1_2515 (GFH08038)	0.12	0.0	0.0	0.46	0.62	0.15	0.08	0.17	0.05	1.0	0.45	0.15	0.16	0.18	0.07	0.0	0.2	0.0	0.0	0.63	0.25	0.0	0.0	0.01	0.21	0.26
lcl\|BLLF01000138.1_cds_GFH08120.1_2597 (GFH08120)	0.69	0.25	0.6	0.07	1.0	0.61	0.29	0.77	0.28	0.34	0.91	0.59	0.64	0.65	0.24	0.25	0.62	0.36	0.18	0.26	0.34	0.35	0.3	0.23	0.47	0.52
lcl\|BLLF01000173.1_cds_GFH08625.1_3102 (GFH08625)	0.19	0.34	1.0	0.62	0.94	0.49	0.38	0.55	0.46	0.51	0.86	0.44	0.46	0.43	0.35	0.44	0.89	0.49	0.18	0.55	0.28	0.19	0.27	0.1	0.2	0.49
lcl\|BLLF01000192.1_cds_GFH08890.1_3367 (GFH08890)	0.82	0.71	0.27	1.0	0.76	0.49	0.44	0.32	0.2	0.1	0.58	0.29	0.33	0.38	0.19	0.55	0.9	0.49	0.39	0.62	0.36	0.21	0.3	0.11	0.43	0.39
lcl\|BLLF01000223.1_cds_GFH09297.1_3774 (GFH09297)	0.79	0.72	0.82	0.47	1.0	0.64	0.54	0.7	0.53	0.47	0.71	0.52	0.48	0.52	0.45	0.52	0.94	0.56	0.56	0.52	0.5	0.65	0.44	0.27	0.5	0.29
lcl\|BLLF01000226.1_cds_GFH09346.1_3823 (GFH09346)	0.68	0.31	0.52	0.47	1.0	0.6	0.48	0.53	0.45	0.21	0.95	0.51	0.45	0.5	0.28	0.46	0.64	0.25	0.46	0.48	0.25	0.75	0.31	0.44	0.45	0.41
lcl\|BLLF01000259.1_cds_GFH09746.1_4223 (GFH09746)	0.69	0.04	0.59	0.26	1.0	0.43	0.28	0.09	0.27	0.65	0.89	0.39	0.19	0.16	0.26	0.99	0.4	0.0	0.0	0.4	0.08	0.0	0.11	0.06	0.31	0.64
lcl\|BLLF01000259.1_cds_GFH09747.1_4224 (GFH09747)	0.68	0.0	0.62	0.37	1.0	0.3	0.15	0.06	0.2	0.58	0.87	0.17	0.13	0.12	0.13	0.82	0.79	0.08	0.0	0.35	0.12	0.16	0.11	0.05	0.11	0.49
lcl\|BLLF01000259.1_cds_GFH09749.1_4226 (GFH09749)	0.57	0.0	0.0	0.0	1.0	0.22	0.35	0.02	0.02	0.29	0.56	0.15	0.14	0.12	0.17	0.2	0.65	0.0	0.0	0.13	0.22	0.0	0.0	0.0	0.07	0.48
lcl\|BLLF01000315.1_cds_GFH10441.1_4918 (GFH10441)	1.0	0.2	0.57	0.29	0.71	0.54	0.34	0.46	0.34	0.34	0.7	0.46	0.41	0.4	0.3	0.3	0.45	0.53	0.39	0.42	0.58	0.39	0.43	0.2	0.19	0.2
lcl\|BLLF01000388.1_cds_GFH11263.1_5740 (GFH11263)	0.11	0.02	0.0	0.62	0.5	0.04	0.03	0.04	0.03	1.0	0.39	0.06	0.03	0.05	0.05	0.05	0.06	0.22	0.03	0.57	0.23	0.03	0.04	0.03	0.06	0.42
lcl\|BLLF01000516.1_cds_GFH12563.1_7040 (GFH12563)	1.0	0.13	0.23	0.1	0.97	0.73	0.34	0.72	0.21	0.08	0.82	0.69	0.34	0.56	0.16	0.16	0.72	0.24	0.15	0.11	0.21	0.3	0.23	0.27	0.17	0.21
lcl\|BLLF01000545.1_cds_GFH12834.1_7311 (GFH12834)	0.42	0.07	0.2	1.0	0.98	0.37	0.18	0.15	0.26	0.34	0.73	0.15	0.12	0.15	0.12	0.28	0.68	0.62	0.13	0.35	0.61	0.07	0.21	0.04	0.15	0.39
lcl\|BLLF01000580.1_cds_GFH13136.1_7613 (GFH13136)	0.6	0.4	0.13	0.29	0.79	0.45	0.35	0.22	0.25	0.13	0.57	0.4	0.26	0.23	0.25	0.64	1.0	0.5	0.39	0.47	0.56	0.82	0.64	0.38	0.46	0.24
lcl\|BLLF01000593.1_cds_GFH13281.1_7758 (GFH13281)	0.27	0.08	0.81	0.06	1.0	0.37	0.23	0.39	0.45	0.19	0.61	0.23	0.16	0.23	0.19	0.64	0.4	0.18	0.08	0.31	0.23	0.08	0.03	0.02	0.17	0.53
lcl\|BLLF01000645.1_cds_GFH13728.1_8205 (GFH13728)	0.42	0.28	0.78	0.82	1.0	0.6	0.52	0.67	0.76	0.87	0.79	0.47	0.56	0.48	0.57	0.64	0.64	0.68	0.27	0.81	0.57	0.2	0.52	0.29	0.43	0.56
lcl\|BLLF01000757.1_cds_GFH14709.1_9186 (GFH14709)	0.62	0.57	0.33	0.29	1.0	0.74	0.57	0.45	0.49	0.44	0.72	0.47	0.39	0.41	0.32	0.29	0.5	0.67	0.27	0.69	0.48	0.48	0.7	0.47	0.72	0.48
lcl\|BLLF01000787.1_cds_GFH14954.1_9431 (GFH14954)	0.22	0.0	0.0	0.0	1.0	0.27	0.0	0.03	0.1	0.0	0.47	0.05	0.03	0.03	0.0	0.49	0.0	0.0	0.0	0.98	0.8	0.0	0.19	0.16	0.48	0.58
lcl\|BLLF01000824.1_cds_GFH15245.1_9722 (GFH15245)	1.0	0.05	0.0	0.1	0.76	0.57	0.35	0.53	0.37	0.16	0.82	0.56	0.39	0.6	0.27	0.17	0.8	0.4	0.13	0.32	0.52	0.33	0.41	0.25	0.62	0.62
lcl\|BLLF01000871.1_cds_GFH15587.1_10064 (GFH15587)	0.26	0.13	0.0	0.94	0.83	0.38	0.26	0.23	0.19	1.0	0.67	0.4	0.24	0.23	0.14	0.2	0.26	0.28	0.37	0.83	0.55	0.68	0.67	0.18	0.44	0.64
lcl\|BLLF01000890.1_cds_GFH15724.1_10201 (GFH15724)	0.06	0.0	0.0	0.08	0.54	0.18	0.1	0.12	0.12	1.0	0.19	0.08	0.06	0.1	0.1	0.47	0.36	0.18	0.0	0.0	0.25	0.0	0.0	0.07	0.08	0.13
lcl\|BLLF01000959.1_cds_GFH16198.1_10675 (GFH16198)	0.14	0.5	0.88	0.53	0.68	0.39	0.3	0.35	0.35	0.39	0.55	0.29	0.27	0.3	0.22	0.42	1.0	0.39	0.13	0.15	0.47	0.07	0.23	0.04	0.1	0.27
lcl\|BLLF01000981.1_cds_GFH16330.1_10807 (GFH16330)	1.0	0.0	0.0	0.25	0.79	0.4	0.37	0.53	0.24	0.23	0.96	0.45	0.33	0.42	0.17	0.4	0.34	0.18	0.35	0.24	0.11	0.08	0.05	0.05	0.45	0.46
lcl\|BLLF01000981.1_cds_GFH16331.1_10808 (GFH16331)	1.0	0.03	0.0	0.45	0.9	0.31	0.16	0.43	0.2	0.57	0.93	0.37	0.33	0.51	0.1	0.47	0.32	0.32	0.08	0.28	0.22	0.06	0.12	0.05	0.43	0.42
lcl\|BLLF01001170.1_cds_GFH17580.1_12057 (GFH17580)	0.11	0.01	0.35	0.38	1.0	0.26	0.13	0.09	0.14	0.17	0.67	0.19	0.08	0.16	0.09	0.17	0.23	0.3	0.04	0.57	0.26	0.04	0.24	0.07	0.15	0.37
lcl\|BLLF01001226.1_cds_GFH17945.1_12422 (GFH17945)	0.43	0.15	0.0	0.7	1.0	0.31	0.28	0.23	0.34	0.61	0.67	0.22	0.22	0.18	0.25	0.49	0.52	0.22	0.19	0.38	0.27	0.25	0.16	0.31	0.11	0.34
lcl\|BLLF01001249.1_cds_GFH18117.1_12594 (GFH18117)	0.76	0.04	0.28	0.11	1.0	0.31	0.14	0.24	0.16	0.49	0.59	0.19	0.09	0.15	0.1	0.53	0.64	0.37	0.08	0.39	0.36	0.2	0.2	0.04	0.09	0.33
lcl\|BLLF01001249.1_cds_GFH18118.1_12595 (GFH18118)	0.26	0.01	0.0	0.02	1.0	0.41	0.14	0.18	0.12	0.3	0.63	0.2	0.09	0.12	0.07	0.15	0.22	0.28	0.17	0.22	0.39	0.5	0.12	0.04	0.08	0.35
lcl\|BLLF01001421.1_cds_GFH19192.1_13669 (GFH19192)	0.51	0.04	0.22	1.0	0.83	0.35	0.26	0.26	0.41	0.59	0.64	0.2	0.2	0.22	0.18	0.51	0.57	0.61	0.28	0.63	0.56	0.08	0.29	0.14	0.17	0.42
lcl\|BLLF01001430.1_cds_GFH19250.1_13727 (GFH19250)	0.7	0.66	0.4	0.33	0.9	0.74	0.52	0.32	0.37	0.22	0.81	0.49	0.3	0.34	0.29	0.74	1.0	0.73	0.15	0.51	0.6	0.56	0.69	0.25	0.41	0.34
lcl\|BLLF01001485.1_cds_GFH19570.1_14047 (GFH19570)	0.6	0.33	0.39	1.0	0.7	0.32	0.25	0.26	0.31	0.76	0.41	0.14	0.09	0.11	0.16	0.64	0.66	0.49	0.3	0.43	0.37	0.17	0.39	0.15	0.58	0.42
lcl\|BLLF01001581.1_cds_GFH20135.1_14612 (GFH20135)	0.3	0.64	1.0	0.7	0.68	0.69	0.45	0.65	0.53	0.93	0.59	0.48	0.44	0.46	0.38	0.59	0.91	0.45	0.34	0.24	0.42	0.18	0.45	0.19	0.41	0.62
lcl\|BLLF01001590.1_cds_GFH20181.1_14658 (GFH20181)	1.0	0.39	0.51	0.19	0.71	0.49	0.47	0.55	0.42	0.45	0.62	0.43	0.5	0.47	0.41	0.46	0.39	0.5	0.3	0.25	0.41	0.36	0.41	0.08	0.25	0.19
lcl\|BLLF01001650.1_cds_GFH20512.1_14989 (GFH20512)	0.83	0.55	0.83	0.42	0.84	0.53	0.36	0.5	0.42	0.45	0.77	0.46	0.44	0.39	0.4	0.85	1.0	0.42	0.32	0.49	0.4	0.49	0.33	0.3	0.38	0.56
lcl\|BLLF01001742.1_cds_GFH21005.1_15482 (GFH21005)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.31	0.03	0.08	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.0	0.0	0.47	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.26
lcl\|BLLF01001759.1_cds_GFH21084.1_15561 (GFH21084)	1.0	0.58	0.88	0.71	1.0	0.8	0.46	0.59	0.4	0.26	0.84	0.59	0.48	0.53	0.41	0.84	0.98	0.46	0.41	0.28	0.57	0.42	0.48	0.41	0.46	0.36
lcl\|BLLF01001777.1_cds_GFH21195.1_15672 (GFH21195)	0.1	0.35	0.82	0.53	1.0	0.34	0.23	0.35	0.19	0.93	0.62	0.28	0.2	0.3	0.15	0.47	0.89	0.42	0.31	0.65	0.34	0.06	0.36	0.07	0.12	0.53
lcl\|BLLF01001905.1_cds_GFH21788.1_16265 (GFH21788)	0.12	0.01	0.71	0.63	1.0	0.24	0.16	0.14	0.17	0.61	0.95	0.18	0.06	0.2	0.08	0.87	0.46	0.53	0.0	0.29	0.53	0.08	0.19	0.01	0.01	0.23
lcl\|BLLF01001984.1_cds_GFH22178.1_16655 (GFH22178)	0.48	0.34	0.49	0.99	0.37	0.19	0.19	0.28	0.27	0.87	0.37	0.15	0.16	0.21	0.19	0.36	1.0	0.39	0.39	0.41	0.5	0.5	0.33	0.13	0.4	0.42
lcl\|BLLF01002005.1_cds_GFH22273.1_16750 (GFH22273)	0.26	0.29	0.28	0.38	1.0	0.19	0.16	0.03	0.19	0.79	0.56	0.2	0.12	0.08	0.11	0.43	0.54	0.04	0.03	0.4	0.09	0.03	0.02	0.03	0.16	0.45
lcl\|BLLF01002372.1_cds_GFH23823.1_18300 (GFH23823)	0.35	0.07	0.0	0.25	1.0	0.17	0.12	0.1	0.08	0.58	0.7	0.11	0.13	0.1	0.12	0.0	0.53	0.36	0.11	0.35	0.97	0.0	0.19	0.02	0.0	0.02
lcl\|BLLF01002389.1_cds_GFH23890.1_18367 (GFH23890)	0.01	0.06	0.2	0.21	0.55	0.12	0.07	0.09	0.08	1.0	0.32	0.08	0.03	0.06	0.03	0.19	0.29	0.18	0.04	0.33	0.06	0.03	0.11	0.08	0.12	0.29
lcl\|BLLF01002397.1_cds_GFH23925.1_18402 (GFH23925)	0.09	0.0	0.0	0.46	0.35	0.19	0.08	0.0	0.0	1.0	0.44	0.27	0.17	0.19	0.04	0.0	0.26	0.0	0.41	0.47	0.38	0.0	0.0	0.12	0.0	0.13
lcl\|BLLF01002444.1_cds_GFH24102.1_18579 (GFH24102)	0.52	0.08	0.57	0.78	1.0	0.36	0.2	0.14	0.14	0.48	0.74	0.21	0.09	0.18	0.13	0.9	0.7	0.66	0.1	0.36	0.56	0.23	0.31	0.19	0.1	0.42
lcl\|BLLF01002444.1_cds_GFH24103.1_18580 (GFH24103)	0.0	0.1	0.0	0.56	1.0	0.24	0.13	0.04	0.03	0.0	0.41	0.11	0.02	0.09	0.05	0.62	0.89	0.51	0.36	0.0	0.5	0.0	0.12	0.08	0.03	0.22
lcl\|BLLF01002740.1_cds_GFH25171.1_19648 (GFH25171)	0.56	0.59	0.69	0.76	1.0	0.59	0.35	0.27	0.35	0.32	0.9	0.43	0.3	0.25	0.18	0.69	0.91	0.78	0.21	0.7	0.55	0.6	0.42	0.21	0.17	0.34
lcl\|BLLF01002886.1_cds_GFH25677.1_20154 (GFH25677)	0.78	0.27	0.42	0.47	1.0	0.56	0.46	0.74	0.42	0.35	0.89	0.6	0.55	0.63	0.41	0.46	0.77	0.66	0.49	0.36	0.54	0.28	0.55	0.47	0.81	0.6
lcl\|BLLF01002925.1_cds_GFH25804.1_20281 (GFH25804)	0.09	0.01	0.22	0.57	0.41	0.24	0.12	0.21	0.15	1.0	0.31	0.11	0.12	0.18	0.11	0.17	0.3	0.03	0.04	0.38	0.09	0.0	0.11	0.03	0.08	0.33
lcl\|BLLF01002925.1_cds_GFH25805.1_20282 (GFH25805)	0.92	0.5	0.67	0.28	0.74	0.54	0.38	0.5	0.4	0.25	0.63	0.38	0.38	0.39	0.41	0.73	1.0	0.62	0.51	0.38	0.47	0.59	0.47	0.24	0.43	0.31
lcl\|BLLF01003148.1_cds_GFH26501.1_20978 (GFH26501)	1.0	0.39	0.45	0.34	0.89	0.6	0.51	0.82	0.51	0.59	0.92	0.63	0.6	0.82	0.49	0.34	0.69	0.7	0.56	0.44	0.66	0.39	0.54	0.41	0.45	0.42
lcl\|BLLF01003181.1_cds_GFH26618.1_21095 (GFH26618)	0.0	0.0	0.0	0.23	1.0	0.08	0.0	0.03	0.07	0.0	0.76	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.67	0.0	0.0	0.0	0.19	0.26
lcl\|BLLF01003473.1_cds_GFH27435.1_21912 (GFH27435)	0.79	0.14	0.27	0.35	1.0	0.42	0.26	0.29	0.26	0.38	0.83	0.32	0.28	0.36	0.2	0.24	0.33	0.62	0.31	0.4	0.65	0.26	0.35	0.14	0.18	0.42
lcl\|BLLF01003784.1_cds_GFH28210.1_22687 (GFH28210)	0.56	0.35	0.29	0.98	0.67	0.57	0.45	0.4	0.42	0.28	0.6	0.33	0.32	0.34	0.23	0.65	1.0	0.53	0.25	0.42	0.6	0.58	0.56	0.2	0.26	0.36
lcl\|BLLF01004324.1_cds_GFH29390.1_23867 (GFH29390)	1.0	0.25	0.35	0.13	0.74	0.43	0.3	0.7	0.34	0.27	0.62	0.33	0.37	0.49	0.3	0.46	0.57	0.65	0.42	0.37	0.68	0.4	0.42	0.15	0.15	0.16
lcl\|BLLF01005244.1_cds_GFH30940.1_25417 (GFH30940)	0.74	0.33	0.42	1.0	0.82	0.62	0.34	0.42	0.28	0.23	0.73	0.44	0.25	0.33	0.35	0.42	0.91	0.6	0.24	0.84	0.59	0.45	0.45	0.12	0.33	0.3
lcl\|BLLF01005372.1_cds_GFH31100.1_25577 (GFH31100)	0.41	0.28	0.37	0.43	0.29	0.21	0.14	0.18	0.18	1.0	0.3	0.2	0.16	0.17	0.2	0.52	0.65	0.29	0.13	0.64	0.14	0.24	0.19	0.14	0.3	0.4
lcl\|BLLF01006015.1_cds_GFH31867.1_26344 (GFH31867)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.33	0.1	0.12	0.2	1.0	0.49	0.38	0.33	0.06	0.22	0.0	0.0	0.0	0.28	0.47	0.25	0.29	0.0	0.06	0.13	0.09

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)