Heatmap: Cluster_241 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAC0055	CCAP34/8,15mM NO3	CCAP34/8,2mM NO3	JNU35	NIES-144,High light 12h	NIES-144,High light 24h	NIES-144,High light 48h	NIES-144,High light 6h	NIES-144,High light 72h	NIES-144,Homothallic	NIES-144,Low light 12h	NIES-144,Low light 24h	NIES-144,Low light 48h	NIES-144,Low light 6h	NIES-144,Low light 72h	Strain 121	Strain 712	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 1h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 24h	Strain 712,25mg/L Jasmonic acid 6h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 1h	Strain 712,25mg/L Salicyclic acid 24h	Strain 712,No jasmonic and salicyclic acid	Vegetative	ZY-18,Motile	ZY-18,Motile to non-motile
lcl\|BLLF01000033.1_cds_GFH06320.1_797 (GFH06320)	0.15	0.0	0.0	0.19	0.34	0.06	0.24	0.14	0.09	1.0	0.1	0.0	0.07	0.22	0.21	0.57	0.0	0.0	0.0	0.19	0.3	0.0	0.0	0.04	0.36	0.1
lcl\|BLLF01000038.1_cds_GFH06421.1_898 (GFH06421)	0.79	0.42	0.48	0.63	0.58	0.44	0.46	0.98	0.67	0.97	0.6	0.57	0.89	0.8	0.87	0.38	0.39	1.0	0.81	0.66	0.99	0.81	0.87	0.69	0.5	0.49
lcl\|BLLF01000040.1_cds_GFH06464.1_941 (GFH06464)	0.32	0.0	0.0	0.0	0.28	0.4	0.36	0.2	0.41	1.0	0.32	0.15	0.24	0.22	0.12	0.23	0.85	0.63	0.0	0.0	0.12	0.14	0.27	0.16	0.17	0.15
lcl\|BLLF01000051.1_cds_GFH06683.1_1160 (GFH06683)	0.46	0.5	0.43	0.06	0.63	0.5	0.32	0.52	0.33	0.64	0.5	0.47	0.45	0.36	0.39	0.39	0.38	0.54	0.21	1.0	0.66	0.32	0.51	0.25	0.52	0.52
lcl\|BLLF01000089.1_cds_GFH07353.1_1830 (GFH07353)	0.18	0.0	0.0	0.0	0.16	0.08	0.3	0.07	0.3	1.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.37	0.71	0.0	0.0	0.0	0.0	0.76	0.0	0.0	0.0	0.25	0.13
lcl\|BLLF01000090.1_cds_GFH07366.1_1843 (GFH07366)	0.85	0.59	0.43	0.22	0.75	0.67	0.46	0.7	0.71	0.26	0.64	0.57	0.52	0.41	0.68	0.21	0.28	0.58	0.19	1.0	0.49	0.69	0.38	0.3	0.86	0.7
lcl\|BLLF01000106.1_cds_GFH07625.1_2102 (GFH07625)	0.81	0.11	0.19	0.09	0.6	0.39	0.42	0.6	0.48	1.0	0.51	0.36	0.52	0.34	0.46	0.27	0.46	0.55	0.33	0.69	0.53	0.19	0.46	0.13	0.5	0.79
lcl\|BLLF01000131.1_cds_GFH08004.1_2481 (GFH08004)	0.28	0.46	0.47	0.43	0.86	0.58	0.31	0.75	0.46	0.43	0.68	0.4	0.49	0.46	0.42	0.17	0.34	0.38	0.27	1.0	0.39	0.22	0.27	0.14	0.32	0.59
lcl\|BLLF01000149.1_cds_GFH08266.1_2743 (GFH08266)	0.4	0.19	0.59	1.0	0.83	0.43	0.24	0.67	0.35	0.13	0.81	0.52	0.44	0.62	0.58	0.39	0.48	0.82	0.43	0.47	0.6	0.59	0.72	0.39	0.25	0.15
lcl\|BLLF01000171.1_cds_GFH08605.1_3082 (GFH08605)	0.38	0.32	0.0	0.04	0.32	0.33	0.25	0.44	0.4	1.0	0.28	0.2	0.22	0.26	0.32	0.66	0.51	0.42	0.31	0.26	0.45	0.37	0.27	0.22	0.35	0.34
lcl\|BLLF01000237.1_cds_GFH09478.1_3955 (GFH09478)	0.61	0.14	0.05	0.01	0.5	0.58	0.36	0.42	0.32	0.24	0.32	0.33	0.33	0.2	0.31	0.13	0.12	0.46	0.45	1.0	0.46	0.28	0.36	0.19	0.6	0.61
lcl\|BLLF01000271.1_cds_GFH09877.1_4354 (GFH09877)	0.58	0.4	0.11	0.13	0.47	0.47	0.46	0.43	0.52	1.0	0.5	0.5	0.46	0.39	0.5	0.85	0.55	0.46	0.3	0.53	0.55	0.56	0.42	0.32	0.64	0.57
lcl\|BLLF01000379.1_cds_GFH11159.1_5636 (GFH11159)	0.1	0.01	0.0	0.13	0.49	0.27	0.31	0.88	0.2	1.0	0.7	0.15	0.17	0.79	0.34	0.22	0.24	0.46	0.1	0.2	0.8	0.15	0.34	0.05	0.31	0.38
lcl\|BLLF01000389.1_cds_GFH11275.1_5752 (GFH11275)	0.58	0.36	0.33	0.49	0.66	0.49	0.44	0.93	0.51	0.99	0.66	0.58	0.65	0.75	0.6	0.43	0.35	0.79	0.49	0.71	1.0	0.78	0.73	0.26	0.35	0.37
lcl\|BLLF01000389.1_cds_GFH11286.1_5763 (GFH11286)	0.51	0.5	0.36	0.2	0.6	0.53	0.5	0.63	0.49	0.88	0.59	0.51	0.56	0.51	0.55	0.28	0.23	0.38	0.32	1.0	0.54	0.44	0.26	0.33	0.41	0.61
lcl\|BLLF01000413.1_cds_GFH11542.1_6019 (GFH11542)	0.51	0.37	0.42	0.08	0.3	0.26	0.27	0.54	0.48	1.0	0.33	0.21	0.4	0.36	0.51	0.33	0.28	0.51	0.35	0.45	0.55	0.49	0.44	0.11	0.41	0.62
lcl\|BLLF01000438.1_cds_GFH11813.1_6290 (GFH11813)	0.07	0.21	0.0	0.21	0.48	0.42	0.42	0.7	0.57	0.89	0.48	0.35	0.56	0.61	0.39	0.65	0.31	0.47	0.11	0.22	1.0	0.11	0.47	0.17	0.28	0.46
lcl\|BLLF01000458.1_cds_GFH12007.1_6484 (GFH12007)	0.5	0.12	0.04	0.07	1.0	0.8	0.63	0.93	0.7	0.8	0.83	0.58	0.56	0.71	0.56	0.79	0.78	0.67	0.98	0.7	0.84	0.32	0.67	0.53	0.5	0.79
lcl\|BLLF01000499.1_cds_GFH12392.1_6869 (GFH12392)	0.7	0.31	0.34	0.27	0.49	0.42	0.42	0.6	0.49	0.23	0.37	0.31	0.35	0.36	0.46	0.16	0.26	0.31	0.38	1.0	0.28	0.25	0.24	0.35	0.36	0.31
lcl\|BLLF01000526.1_cds_GFH12646.1_7123 (GFH12646)	0.23	0.64	0.0	0.23	0.58	0.68	0.68	0.67	1.0	0.98	0.8	0.59	0.73	0.9	0.5	0.65	0.23	0.84	0.21	0.54	0.87	0.56	0.91	0.2	0.47	0.6
lcl\|BLLF01000539.1_cds_GFH12785.1_7262 (GFH12785)	0.8	0.46	0.63	0.01	0.56	0.5	0.45	0.67	0.51	0.87	0.6	0.58	0.52	0.46	0.56	0.06	0.12	0.69	0.37	0.85	0.7	1.0	0.67	0.44	0.98	0.55
lcl\|BLLF01000638.1_cds_GFH13661.1_8138 (GFH13661)	0.41	0.11	0.06	0.29	0.64	0.34	0.22	0.83	0.31	0.7	0.57	0.32	0.49	0.51	0.43	0.12	0.26	0.55	0.22	1.0	0.54	0.22	0.41	0.06	0.18	0.46
lcl\|BLLF01000730.1_cds_GFH14476.1_8953 (GFH14476)	0.82	0.18	0.0	0.14	0.54	0.42	0.47	0.44	0.55	1.0	0.52	0.51	0.56	0.33	0.57	0.51	0.43	0.43	0.72	0.48	0.31	0.3	0.55	0.23	0.78	1.0
lcl\|BLLF01000743.1_cds_GFH14573.1_9050 (GFH14573)	0.51	0.32	0.14	0.6	0.97	0.67	0.57	0.78	0.67	0.55	0.8	0.59	0.57	0.53	0.65	0.42	0.78	0.92	0.39	0.43	0.83	0.49	0.67	0.45	1.0	0.64
lcl\|BLLF01000756.1_cds_GFH14705.1_9182 (GFH14705)	0.75	0.18	0.0	0.68	0.56	0.48	0.46	0.76	0.54	1.0	0.49	0.46	0.5	0.45	0.55	0.41	0.68	0.61	0.29	0.42	0.48	0.36	0.46	0.36	0.77	0.65
lcl\|BLLF01000757.1_cds_GFH14714.1_9191 (GFH14714)	0.09	0.18	0.02	0.17	0.68	0.25	0.28	1.0	0.12	0.44	0.47	0.07	0.36	0.56	0.2	0.0	0.0	0.35	0.1	0.12	0.38	0.0	0.55	0.04	0.13	0.06
lcl\|BLLF01000858.1_cds_GFH15494.1_9971 (GFH15494)	0.69	0.34	0.52	0.16	0.8	0.6	0.41	0.62	0.42	1.0	0.59	0.44	0.71	0.53	0.48	0.3	0.49	0.12	0.22	0.93	0.43	0.43	0.37	0.15	0.48	0.39
lcl\|BLLF01000966.1_cds_GFH16235.1_10712 (GFH16235)	1.0	0.07	0.0	0.26	0.33	0.38	0.43	0.6	0.54	0.33	0.46	0.41	0.41	0.76	0.52	0.33	0.3	0.47	0.16	0.88	0.36	0.25	0.15	0.39	0.41	0.46
lcl\|BLLF01000966.1_cds_GFH16240.1_10717 (GFH16240)	0.85	0.32	0.28	0.44	0.44	0.43	0.43	0.43	0.47	0.79	0.46	0.37	0.42	0.47	0.47	0.39	0.38	0.49	0.23	0.37	0.49	0.26	0.58	0.24	0.55	1.0
lcl\|BLLF01001005.1_cds_GFH16491.1_10968 (GFH16491)	0.0	0.44	0.0	0.23	0.42	0.44	0.49	0.58	0.83	1.0	0.68	0.48	0.69	0.79	0.54	0.0	0.39	0.83	0.0	0.0	0.95	0.0	0.41	0.06	0.44	0.42
lcl\|BLLF01001011.1_cds_GFH16534.1_11011 (GFH16534)	0.13	0.03	0.0	0.01	0.76	0.34	0.34	0.83	0.25	0.72	0.45	0.46	0.33	0.54	0.19	0.42	0.33	0.74	0.34	0.43	1.0	0.52	0.41	0.13	0.21	0.2
lcl\|BLLF01001060.1_cds_GFH16852.1_11329 (GFH16852)	0.1	0.0	0.0	0.33	0.3	0.49	0.19	0.11	0.21	0.61	0.72	0.34	0.23	0.34	0.08	0.47	0.23	0.0	0.09	0.52	0.0	0.1	0.18	0.07	0.51	1.0
lcl\|BLLF01001103.1_cds_GFH17143.1_11620 (GFH17143)	0.4	0.03	0.18	0.03	0.26	0.13	0.06	0.22	0.08	0.35	0.3	0.16	0.21	0.19	0.09	0.23	0.56	0.37	0.22	1.0	0.31	0.16	0.23	0.04	0.18	0.37
lcl\|BLLF01001172.1_cds_GFH17589.1_12066 (GFH17589)	0.87	0.35	0.48	0.04	0.59	0.54	0.43	0.43	0.47	0.78	0.63	0.6	0.47	0.39	0.24	0.41	0.45	0.46	0.64	1.0	0.59	0.34	0.39	0.08	0.35	0.68
lcl\|BLLF01001187.1_cds_GFH17696.1_12173 (GFH17696)	0.1	0.0	0.0	0.08	0.43	0.08	0.23	0.51	0.22	0.99	0.03	0.08	0.36	0.43	0.15	0.23	0.17	0.54	0.0	0.15	1.0	0.29	0.54	0.0	0.0	0.0
lcl\|BLLF01001204.1_cds_GFH17808.1_12285 (GFH17808)	0.09	0.32	0.76	0.36	0.42	0.29	0.16	0.49	0.18	0.01	0.69	0.54	0.3	0.72	0.29	0.39	0.33	1.0	0.11	0.35	0.67	0.16	0.65	0.17	0.2	0.34
lcl\|BLLF01001322.1_cds_GFH18575.1_13052 (GFH18575)	0.39	0.21	0.0	0.05	0.99	0.79	0.37	0.98	0.42	0.49	0.83	0.53	0.54	0.71	0.3	0.42	0.28	0.53	1.0	0.45	0.52	0.53	0.73	0.15	0.38	0.82
lcl\|BLLF01001567.1_cds_GFH20066.1_14543 (GFH20066)	0.61	0.0	0.0	0.0	0.45	0.42	0.34	0.76	0.49	1.0	0.42	0.32	0.52	0.53	0.46	0.46	0.84	0.83	0.32	0.25	0.76	0.18	0.62	0.21	0.54	0.72
lcl\|BLLF01001615.1_cds_GFH20329.1_14806 (GFH20329)	0.62	0.12	0.01	0.08	0.45	0.37	0.41	0.33	0.43	0.73	0.47	0.36	0.47	0.51	0.42	0.61	0.5	0.46	0.31	0.29	0.43	0.24	0.38	0.1	0.77	1.0
lcl\|BLLF01001870.1_cds_GFH21632.1_16109 (GFH21632)	1.0	0.55	0.79	0.32	0.75	0.76	0.57	0.98	0.67	0.38	0.71	0.72	0.76	0.83	0.64	0.14	0.15	0.39	0.99	0.61	0.45	0.7	0.56	0.54	0.37	0.38
lcl\|BLLF01001903.1_cds_GFH21776.1_16253 (GFH21776)	0.45	0.21	0.37	0.17	0.26	0.24	0.27	0.47	0.52	1.0	0.28	0.14	0.2	0.41	0.29	0.01	0.33	0.32	0.05	0.04	0.23	0.01	0.25	0.02	0.61	0.93
lcl\|BLLF01001941.1_cds_GFH21970.1_16447 (GFH21970)	0.0	0.02	0.0	0.02	1.0	0.4	0.16	0.76	0.25	0.63	0.71	0.25	0.25	0.41	0.19	0.35	0.24	0.55	0.27	0.74	0.56	0.24	0.35	0.11	0.17	0.54
lcl\|BLLF01002371.1_cds_GFH23818.1_18295 (GFH23818)	0.47	0.29	0.17	0.05	0.5	0.39	0.38	0.6	0.45	1.0	0.5	0.45	0.4	0.45	0.44	0.65	0.6	0.43	0.38	0.48	0.43	0.4	0.41	0.38	0.73	0.6
lcl\|BLLF01002488.1_cds_GFH24268.1_18745 (GFH24268)	0.71	0.27	0.6	0.72	0.71	0.56	0.45	0.85	0.53	0.17	0.64	0.49	0.6	0.66	0.55	0.2	0.52	0.76	0.5	0.4	0.79	1.0	0.65	0.51	0.29	0.4
lcl\|BLLF01002660.1_cds_GFH24892.1_19369 (GFH24892)	0.86	0.04	0.0	0.32	0.36	0.46	0.43	0.29	0.44	1.0	0.41	0.36	0.32	0.36	0.36	0.65	0.42	0.26	0.22	0.03	0.05	0.0	0.27	0.09	0.55	0.85
lcl\|BLLF01002665.1_cds_GFH24908.1_19385 (GFH24908)	1.0	0.76	0.83	0.58	0.68	0.72	0.57	0.72	0.66	0.65	0.59	0.63	0.63	0.53	0.61	0.38	0.52	0.47	0.68	0.97	0.41	0.5	0.39	0.69	0.72	0.63
lcl\|BLLF01002705.1_cds_GFH25062.1_19539 (GFH25062)	0.78	0.0	0.0	0.39	0.31	0.38	0.21	0.11	0.3	1.0	0.35	0.36	0.33	0.24	0.21	0.27	0.68	0.14	0.0	0.03	0.29	0.0	0.14	0.02	0.36	0.41
lcl\|BLLF01002773.1_cds_GFH25286.1_19763 (GFH25286)	0.72	0.2	0.21	0.05	0.5	0.34	0.25	0.52	0.34	0.27	0.41	0.3	0.38	0.36	0.36	0.34	0.4	0.45	0.32	1.0	0.59	0.43	0.49	0.13	0.5	0.58
lcl\|BLLF01002806.1_cds_GFH25407.1_19884 (GFH25407)	1.0	0.2	0.31	0.1	0.34	0.3	0.31	0.55	0.54	0.87	0.36	0.18	0.24	0.5	0.31	0.02	0.19	0.76	0.18	0.13	0.64	0.02	0.59	0.03	0.36	0.57
lcl\|BLLF01003066.1_cds_GFH26240.1_20717 (GFH26240)	1.0	0.55	0.45	0.26	0.77	0.99	0.62	0.81	0.7	0.26	0.61	0.67	0.52	0.57	0.51	0.27	0.35	0.38	0.74	0.57	0.35	0.43	0.35	0.65	0.64	0.68
lcl\|BLLF01003083.1_cds_GFH26290.1_20767 (GFH26290)	0.64	0.22	0.23	0.19	0.57	0.6	0.62	0.66	0.57	0.8	0.43	0.45	0.45	0.51	0.45	0.43	1.0	0.58	0.26	0.33	0.58	0.26	0.57	0.39	0.4	0.66
lcl\|BLLF01003605.1_cds_GFH27757.1_22234 (GFH27757)	0.24	0.08	0.0	0.22	0.45	0.41	0.35	0.54	0.42	1.0	0.48	0.42	0.36	0.34	0.32	0.73	0.59	0.26	0.07	0.26	0.67	0.0	0.44	0.16	0.07	0.17
lcl\|BLLF01003830.1_cds_GFH28324.1_22801 (GFH28324)	0.88	0.18	0.43	0.3	0.42	0.3	0.25	0.65	0.42	0.93	0.4	0.35	0.43	0.45	0.46	0.31	0.42	0.92	0.57	0.66	1.0	0.49	0.85	0.45	0.29	0.19
lcl\|BLLF01004115.1_cds_GFH28947.1_23424 (GFH28947)	0.4	0.0	0.0	0.25	1.0	0.26	0.29	0.63	0.36	0.18	0.8	0.2	0.16	0.36	0.29	0.13	0.29	0.7	0.24	0.68	0.4	0.18	0.22	0.03	0.53	0.45
lcl\|BLLF01004415.1_cds_GFH29561.1_24038 (GFH29561)	0.0	0.0	0.0	0.13	1.0	0.37	0.1	0.58	0.23	0.57	0.3	0.26	0.09	0.28	0.06	0.55	0.41	0.16	0.23	0.13	0.43	0.0	0.0	0.02	0.14	0.0
lcl\|BLLF01004827.1_cds_GFH30314.1_24791 (GFH30314)	0.42	0.45	0.18	0.1	0.34	0.24	0.18	0.31	0.19	0.59	0.29	0.29	0.44	0.22	0.33	0.4	0.32	0.52	0.3	1.0	0.51	0.3	0.44	0.18	0.41	0.3
lcl\|BLLF01005463.1_cds_GFH31229.1_25706 (GFH31229)	0.64	0.0	0.0	0.24	0.44	0.48	0.38	0.32	0.36	0.76	0.61	0.3	0.3	0.37	0.25	0.21	0.29	0.33	0.05	0.26	0.09	0.27	0.4	0.08	0.52	1.0
lcl\|BLLF01005651.1_cds_GFH31468.1_25945 (GFH31468)	0.14	0.34	0.0	0.24	1.0	0.56	0.48	0.84	0.31	0.68	0.78	0.42	0.47	0.4	0.35	0.5	0.75	0.39	0.16	0.4	0.59	0.17	0.25	0.26	0.73	0.63
lcl\|BLLF01006190.1_cds_GFH32044.1_26521 (GFH32044)	0.37	0.0	0.0	0.0	0.15	0.06	0.31	0.2	0.09	1.0	0.03	0.03	0.21	0.17	0.12	0.28	0.21	0.22	0.0	0.19	0.61	0.0	0.22	0.06	0.31	0.0
lcl\|BLLF01006264.1_cds_GFH32106.1_26583 (GFH32106)	0.37	0.0	0.0	0.0	0.3	0.22	0.25	0.47	0.22	1.0	0.17	0.22	0.19	0.36	0.23	0.23	0.09	0.36	0.13	0.53	0.49	0.43	0.44	0.03	0.1	0.1
lcl\|BLLF01006483.1_cds_GFH32291.1_26768 (GFH32291)	0.62	0.01	0.0	0.11	0.33	0.3	0.25	0.41	0.36	1.0	0.32	0.32	0.27	0.25	0.32	0.15	0.1	0.44	0.52	0.67	0.35	0.18	0.39	0.12	0.34	0.46
lcl\|BLLF01006905.1_cds_GFH32641.1_27118 (GFH32641)	0.59	0.07	0.07	0.12	0.42	0.36	0.34	0.53	0.45	1.0	0.38	0.35	0.36	0.39	0.39	0.63	0.57	0.46	0.3	0.64	0.48	0.25	0.41	0.14	0.58	0.47
lcl\|BLLF01007839.1_cds_GFH33138.1_27615 (GFH33138)	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.17	0.44	0.75	0.17	0.0	0.48	0.12	0.25	0.73	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.29	0.1
lcl\|BLLF01008118.1_cds_GFH33259.1_27736 (GFH33259)	0.0	0.24	0.0	0.42	0.61	0.66	0.28	0.66	0.24	1.0	0.38	0.39	0.18	0.28	0.23	0.26	0.38	0.0	0.15	0.34	0.42	0.0	0.3	0.05	0.69	0.54
lcl\|BLLF01008296.1_cds_GFH33320.1_27797 (GFH33320)	0.24	0.0	0.0	0.0	0.9	0.4	0.21	1.0	0.15	0.49	0.56	0.16	0.29	0.35	0.11	0.22	0.16	0.27	0.2	0.34	0.37	0.21	0.27	0.01	0.03	0.03

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)